ChangeLog

   1 TODO
   2         Read PlotFile's.
   3         Add to ctsim export of imagefiles to standard graphic formats.
   4         Use FFTW library in imagefile.cpp
   5
   6 3.0alpha1 - Released 12/30/00
   7
   8         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
   9         and column plots and comparison plots
  10
  11         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  12
  13         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  14
  15         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  16         files.
  17
  18         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  19         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  20         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  21
  22         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  23         imagefile and plotfile classes.
  24
  25         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  26         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  27         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  28         images.
  29
  30         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  31         images.
  32
  33         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  34         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  35
  36         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  37         math functions
  38
  39         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  40
  41         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  42         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  43         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  44
  45         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  46         class.
  47
  48         * sgp: Added linestyle settings
  49
  50 2.5.0 - 12/18/00
  51    First Microsoft Windows GUI version
  52    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  53    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  54         when manually compiling phantoms that vary during projection
  55         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  56    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  57    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  58    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  59    Fixed display of plotting in Projection views
  60    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  61    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  62         "namespace using std" statements
  63    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  64    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  65
  66 2.0.6 - 12/03/00
  67    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
  68    Updated README file
  69    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
  70    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
  71
  72 2.0.5 - 12/01/00
  73    Improved compilation on RedHat 7
  74    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
  75    Removed README.RedHat7
  76
  77 2.0.4 - 11/25/00
  78    Added documentation for --geometry setting
  79    Added README.RedHat7 document
  80
  81 2.0.3 - 11/20/00
  82    Fixed bug in generation of binary PGM files
  83    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
  84    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
  85
  86 2.0.2 - 11/8/00
  87    Additions to man pages (Ian Kay)
  88    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
  89
  90 2.0.1 - 10/1/00
  91    Fixed syntax error in fftw configuration
  92    Slight modifications to support gcc v2.9.6
  93
  94 2.0.0 - 9/7/00
  95    Version 2.0.0 released!
  96    ctsim: Added Window menu to Main frame
  97    ctsim: Disabled not support reconstruction method
  98    Fixed obscure bug in sys_error
  99    Fixed compilation in mingw environment not present
 100    Fixed compilation in non-graphical environments
 101
 102 2.0.0-b12 - 9/4/00
 103    ctsim: Added animation of reconstruction
 104    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 105    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 106    ctsim: used setpriority to set lower priority
 107    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 108    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 109
 110 2.0.0-b11 - 9/1/00
 111    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 112    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 113    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 114    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 115    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 116    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 117    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 118    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 119    Separated reconstruction into Reconstructor class
 120    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 121    Added --enable-static to generate statically linked programs
 122
 123 2.0.0-b10 - 8/25/00
 124    ctsim: Added animation of projection collection processs
 125    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 126    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 127    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 128    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 129    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 130    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 131    Fixed bug in backprojection selection
 132
 133 2.0.0-b9 - 8/22/00
 134    Added RCS Id strings to executable files
 135    Added RPM Spec file for RPM package creation
 136    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 137    Fixed compilation for non-SGP architectures
 138    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 139    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 140         inverse_fourier construction of filters
 141    Added median to statistics and to auto-windowing
 142
 143 2.0.0-b8 - 8/1/00
 144    Added line color support to SGP
 145    Fixed lineAbs bug
 146
 147 2.0.0-b7 - 7/25/00
 148    Finished support for dmallocxx library
 149    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 150    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 151         G2 windows and well as WXWindows.
 152    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 153    Fixed row-plot bug in if-2
 154    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 155
 156 2.0.0-b6 - 7/22/00
 157    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 158         and projection files
 159    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 160         and reconstruction parameters dialogs
 161    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 162    Completely reorganized option processing in classes to improve
 163         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 164
 165 2.0.0-b5 - 7/17/00
 166    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 167    Started ctsim.tex document file
 168
 169 2.0.0-b4 - 7/13/00
 170    Fixed compiler warnings at -Wall level
 171    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 172    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 173    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 174
 175 2.0.0-b3 - 7/10/00
 176    Added highly optimized backprojection method idiff3
 177    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 178    Fixed image display in if2img using G2 library
 179    Added column-plot and row-plot options to if-2
 180    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 181    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 182         backprojection method. Currently, this technique is still under
 183         development and debugging
 184    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 185
 186 2.0.0-b2 - 7/07/00
 187    Cleaned up SignalFilter class
 188    Added zeropad option to pjrec
 189    Added zeropad options to html and cgi files
 190    Added fourier_table and rfttw filter methods
 191    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 192
 193 2.0.0-b1 - 7/05/00
 194    Updated trace level processing
 195    Added trace level to SignalFilter
 196    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 197
 198 1.9.9 - 7/04/00
 199    Fixed const issue with ImageFileArray
 200    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 201    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 202    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 203    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 204    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 205         between convolution, dft, & fft filtering
 206    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 207    Added support for FFTW library
 208
 209 1.9.8 - 6/27/2000
 210    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 211    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 212    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 213    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 214    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 215    Added signature tag and creation date/time to projection files
 216
 217 1.9.7 - 6/25/2000
 218    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 219         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 220         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 221    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 222    Rewrote ImageFile class
 223    Started support for dmallocxx library, not finished
 224    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 225    Updated ifinfo to show comparative statistics
 226    Added printLabels() to Array2dFile class
 227    Added printStatistics() to ImageFile class
 228
 229 1.9.6 - 6/22/2000
 230    Moved conversion filter name/id to Filter class
 231    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 232    Added MPI broadcasting of strings
 233
 234 1.9.5 - 6/21/2000
 235    Merged proj_reconstr into class Projections
 236    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 237    Code cleanup in projections.cpp
 238    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 239
 240 1.9.4 - 6/20/2000
 241    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 242    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 243    Converted filter and convolution to object-oriented code
 244    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 245    Optimized image file writing on little-endian architectures
 246    Updated README and INSTALL
 247
 248 1.9.3 - 6/19/2000
 249    Reorganized source files
 250    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 251
 252 1.9.2 - 6/18/2000
 253    Reorganized include files
 254    Fixed const pointers in strfuncs
 255
 256 1.9.1 - 6/16/2000
 257    Renamed directories, moved source files, combined source files
 258    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 259    and libctgraphics)
 260
 261 1.9.0 - 6/15/2000
 262    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 263    Renamed Raysums to Projections throughout files
 264    Renamed Detector to Scanner
 265    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 266
 267 0.6.1 - 6/12/2000
 268    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 269    Converted Detector to Object-Oriented
 270
 271 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 272    Improved Integer backprojection method
 273         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 274         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 275    Finished converting all C files to C++
 276    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 277    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 278
 279 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 280    Converted MPI data structures to C++ object
 281    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 282
 283 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 284    First C++ conversions
 285    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 286         - Now all data files are cross-platform compatible
 287    Converted from MPI to MPI++
 288    Converted backprojection to object-oriented
 289    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 290
 291 0.5.4 - 6/4/2000
 292    Simpilifed endian handling
 293
 294 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 295    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 296    Removed broken B-spline interpolation
 297    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 298    Added support for 16-bit PNG graphics
 299
 300 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 301    Added compile-time configuration of endian order
 302
 303 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 304    Modified the raysum file format to be platform independent
 305
 306 0.5.3 - 5/11/2000
 307    Added Microsoft VC compatibility
 308    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 309
 310 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 311    Continued conversion to ANSI C
 312    Removed old CRT routines
 313
 314 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 315    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 316    Continued code cleanup
 317
 318 0.5.2-b3 - 4/30/200
 319     More code cleanup with reorganizing libraries
 320     Added --log and --exp to sdf-1
 321     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 322
 323 0.5.2-b2 - 4/30/200
 324     Continued code cleanup
 325
 326 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 327     Fixed a few MPI bugs
 328     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 329
 330 0.5.1 - 4/28/2000
 331     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 332     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 333
 334 0.5.0 - 4/27/2000
 335     First open source distribution for GNU/Linux
 336
 337 6/1999
 338   Converted to GNU/Linux
 339   added MPI support via LAM library
 340
 341 1983-84
 342   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 343