ChangeLog

   1 3.1.0 - Released 2//01
   2
   3         * ctsim: Added tips to be displayed at startup and via the help menu.
   4
   5         * ctsim: Added center-detector concept. Allow for detector array
   6         to be any arbitrary distance from center of scanner. As a result,
   7         projection files are not incompatible with previous version of
   8         CTSim.
   9
  10         * ctsim: Added generic threaded tasks and background manager for
  11         background processing as well as taking advantage of multiple-CPU's
  12         on SMP systems.
  13
  14         * ctsim: Added background and SMP processing for reconstructions.
  15
  16         * ctsim: Added background and SMP processing for scanning.
  17
  18         * ctsim: Added background and SMP processing for rasterization.
  19
  20         * ctsim: Added "Verbose Logging", "Startup Tips", and
  21         "Background processes" options  to Preferences dialog.
  22
  23         * ctsim: Added accelerator key for File-Properties
  24
  25         * views.cpp: Added out of memory checks to display for huge
  26         image and projection files.
  27
  28         * distribution: fixed problem with documentation files not
  29         being included with the distribution [Reported by Ian Kay].
  30
  31 3.0.3 - Released 2/20/01
  32
  33         * ctsim: Fixed core dump on Linux with OpenGL
  34
  35         * ctsim: Fixed context-sensitive help on Linux
  36
  37         * ctsim: Fixed About box on Linux
  38
  39 3.0.2 - Released 2/20/01
  40
  41         * scanner.cpp: Fixed bug when number of detectors was even.
  42
  43         * ctsim: Improved error handling when trying to convert
  44         divergent projections into polar form.
  45
  46 3.0.1 - Released 2/19/01
  47
  48         * ctsim: Fixed dialog box for reconstruction so that
  49         rotation angle setting will stay fixed in-between use
  50         of the dialog box.
  51
  52         * syserror: Fixed display bug for trace messages
  53
  54         * ctsim: MSVC optimization bug work-around, compiler
  55         options changed.
  56
  57 3.0.0 - Released 2/19/01
  58
  59         * ctsim: Massive update/fix to online help and print manual.
  60
  61         * ctsim: Added context-sensitive help to dialog boxes
  62
  63         * ctsim: Reformated all dialog boxes, much nicer now.
  64
  65         * ctsim: Improved accelerator key handling
  66
  67         * global: Added Hanning filter.
  68
  69         * global: Improved default parameters to that all defaults give
  70         sensible output.
  71
  72 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
  73
  74         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  75         registry storage between executions.
  76
  77         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  78
  79         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  80
  81         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  82
  83         * ctsim: Added graphical About box
  84
  85         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  86
  87         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  88
  89         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  90
  91         * ctsim: Online help added!
  92
  93         * backprojector: Added cubic interpolation
  94
  95         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  96
  97         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  98         reconstruction dialogs.
  99
 100         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
 101
 102         * global: Projection files are not compatible with previous version
 103         due to new scanner definitions.
 104
 105         * global: deleted concept of field-of-view and added
 106           view ratio and scan ratio concepts.
 107
 108         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
 109
 110         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
 111
 112         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
 113
 114         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
 115
 116
 117 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
 118
 119         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
 120         procsignal.cpp
 121
 122         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
 123         bug in parsing command-line parameters.
 124
 125         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
 126         plotfiles
 127
 128         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
 129
 130         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
 131
 132         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
 133         for frequency/inverse-fourier filtering
 134
 135 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
 136
 137         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
 138
 139         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
 140         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
 141
 142         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
 143         for math tips]
 144
 145         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
 146
 147         * ctsim: Added more analyze menuitems
 148
 149         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
 150         through this master shell. Has both command-line and interactive
 151         interface
 152
 153         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
 154
 155         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
 156
 157         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
 158
 159 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
 160
 161         * ctsim: Added plotting of histograms
 162
 163         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
 164
 165         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 166
 167 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 168
 169         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 170
 171         * ctsim: added generation of filter images
 172
 173         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 174
 175         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 176
 177         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 178
 179         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 180         text files suitable for reading.
 181
 182         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 183         when performing properties of images.
 184
 185         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 186         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 187         fourier.cpp
 188
 189         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 190         image math functions to complex-valued math.
 191
 192         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 193
 194 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 195
 196         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 197         and column plots and comparison plots
 198
 199         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 200
 201         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 202
 203         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 204         files.
 205
 206         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 207         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 208         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 209
 210         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 211         imagefile and plotfile classes.
 212
 213         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 214         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 215         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 216         images.
 217
 218         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 219         images.
 220
 221         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 222         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 223
 224         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 225         math functions
 226
 227         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 228
 229         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 230         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 231         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 232
 233         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 234         class.
 235
 236         * sgp: Added linestyle settings
 237
 238 2.5.0 - 12/18/00
 239    First Microsoft Windows GUI version
 240    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 241    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 242         when manually compiling phantoms that vary during projection
 243         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 244    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 245    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 246    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 247    Fixed display of plotting in Projection views
 248    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 249    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 250         "namespace using std" statements
 251    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 252    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 253
 254 2.0.6 - 12/03/00
 255    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 256    Updated README file
 257    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 258    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 259
 260 2.0.5 - 12/01/00
 261    Improved compilation on RedHat 7
 262    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 263    Removed README.RedHat7
 264
 265 2.0.4 - 11/25/00
 266    Added documentation for --geometry setting
 267    Added README.RedHat7 document
 268
 269 2.0.3 - 11/20/00
 270    Fixed bug in generation of binary PGM files
 271    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 272    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 273
 274 2.0.2 - 11/8/00
 275    Additions to man pages (Ian Kay)
 276    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 277
 278 2.0.1 - 10/1/00
 279    Fixed syntax error in fftw configuration
 280    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 281
 282 2.0.0 - 9/7/00
 283    Version 2.0.0 released!
 284    ctsim: Added Window menu to Main frame
 285    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 286    Fixed obscure bug in sys_error
 287    Fixed compilation in mingw environment not present
 288    Fixed compilation in non-graphical environments
 289
 290 2.0.0-b12 - 9/4/00
 291    ctsim: Added animation of reconstruction
 292    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 293    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 294    ctsim: used setpriority to set lower priority
 295    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 296    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 297
 298 2.0.0-b11 - 9/1/00
 299    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 300    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 301    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 302    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 303    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 304    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 305    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 306    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 307    Separated reconstruction into Reconstructor class
 308    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 309    Added --enable-static to generate statically linked programs
 310
 311 2.0.0-b10 - 8/25/00
 312    ctsim: Added animation of projection collection processs
 313    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 314    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 315    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 316    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 317    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 318    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 319    Fixed bug in backprojection selection
 320
 321 2.0.0-b9 - 8/22/00
 322    Added RCS Id strings to executable files
 323    Added RPM Spec file for RPM package creation
 324    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 325    Fixed compilation for non-SGP architectures
 326    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 327    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 328         inverse_fourier construction of filters
 329    Added median to statistics and to auto-windowing
 330
 331 2.0.0-b8 - 8/1/00
 332    Added line color support to SGP
 333    Fixed lineAbs bug
 334
 335 2.0.0-b7 - 7/25/00
 336    Finished support for dmallocxx library
 337    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 338    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 339         G2 windows and well as WXWindows.
 340    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 341    Fixed row-plot bug in if-2
 342    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 343
 344 2.0.0-b6 - 7/22/00
 345    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 346         and projection files
 347    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 348         and reconstruction parameters dialogs
 349    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 350    Completely reorganized option processing in classes to improve
 351         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 352
 353 2.0.0-b5 - 7/17/00
 354    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 355    Started ctsim.tex document file
 356
 357 2.0.0-b4 - 7/13/00
 358    Fixed compiler warnings at -Wall level
 359    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 360    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 361    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 362
 363 2.0.0-b3 - 7/10/00
 364    Added highly optimized backprojection method idiff3
 365    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 366    Fixed image display in if2img using G2 library
 367    Added column-plot and row-plot options to if-2
 368    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 369    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 370         backprojection method. Currently, this technique is still under
 371         development and debugging
 372    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 373
 374 2.0.0-b2 - 7/07/00
 375    Cleaned up SignalFilter class
 376    Added zeropad option to pjrec
 377    Added zeropad options to html and cgi files
 378    Added fourier_table and rfttw filter methods
 379    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 380
 381 2.0.0-b1 - 7/05/00
 382    Updated trace level processing
 383    Added trace level to SignalFilter
 384    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 385
 386 1.9.9 - 7/04/00
 387    Fixed const issue with ImageFileArray
 388    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 389    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 390    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 391    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 392    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 393         between convolution, dft, & fft filtering
 394    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 395    Added support for FFTW library
 396
 397 1.9.8 - 6/27/2000
 398    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 399    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 400    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 401    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 402    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 403    Added signature tag and creation date/time to projection files
 404
 405 1.9.7 - 6/25/2000
 406    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 407         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 408         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 409    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 410    Rewrote ImageFile class
 411    Started support for dmallocxx library, not finished
 412    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 413    Updated ifinfo to show comparative statistics
 414    Added printLabels() to Array2dFile class
 415    Added printStatistics() to ImageFile class
 416
 417 1.9.6 - 6/22/2000
 418    Moved conversion filter name/id to Filter class
 419    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 420    Added MPI broadcasting of strings
 421
 422 1.9.5 - 6/21/2000
 423    Merged proj_reconstr into class Projections
 424    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 425    Code cleanup in projections.cpp
 426    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 427
 428 1.9.4 - 6/20/2000
 429    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 430    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 431    Converted filter and convolution to object-oriented code
 432    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 433    Optimized image file writing on little-endian architectures
 434    Updated README and INSTALL
 435
 436 1.9.3 - 6/19/2000
 437    Reorganized source files
 438    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 439
 440 1.9.2 - 6/18/2000
 441    Reorganized include files
 442    Fixed const pointers in strfuncs
 443
 444 1.9.1 - 6/16/2000
 445    Renamed directories, moved source files, combined source files
 446    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 447    and libctgraphics)
 448
 449 1.9.0 - 6/15/2000
 450    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 451    Renamed Raysums to Projections throughout files
 452    Renamed Detector to Scanner
 453    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 454
 455 0.6.1 - 6/12/2000
 456    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 457    Converted Detector to Object-Oriented
 458
 459 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 460    Improved Integer backprojection method
 461         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 462         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 463    Finished converting all C files to C++
 464    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 465    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 466
 467 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 468    Converted MPI data structures to C++ object
 469    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 470
 471 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 472    First C++ conversions
 473    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 474         - Now all data files are cross-platform compatible
 475    Converted from MPI to MPI++
 476    Converted backprojection to object-oriented
 477    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 478
 479 0.5.4 - 6/4/2000
 480    Simpilifed endian handling
 481
 482 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 483    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 484    Removed broken B-spline interpolation
 485    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 486    Added support for 16-bit PNG graphics
 487
 488 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 489    Added compile-time configuration of endian order
 490
 491 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 492    Modified the raysum file format to be platform independent
 493
 494 0.5.3 - 5/11/2000
 495    Added Microsoft VC compatibility
 496    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 497
 498 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 499    Continued conversion to ANSI C
 500    Removed old CRT routines
 501
 502 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 503    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 504    Continued code cleanup
 505
 506 0.5.2-b3 - 4/30/200
 507     More code cleanup with reorganizing libraries
 508     Added --log and --exp to sdf-1
 509     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 510
 511 0.5.2-b2 - 4/30/200
 512     Continued code cleanup
 513
 514 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 515     Fixed a few MPI bugs
 516     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 517
 518 0.5.1 - 4/28/2000
 519     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 520     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 521
 522 0.5.0 - 4/27/2000
 523     First open source distribution for GNU/Linux
 524
 525 6/1999
 526   Converted to GNU/Linux
 527   added MPI support via LAM library
 528
 529 1983-84
 530   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 531