ChangeLog

   1 3.0.0beta2 - Release 2//01
   2
   3         * ctsim: Massive update/fix to online help, new manual
   4
   5         * ctsim: Reformated dialog boxes, much nicer now
   6
   7 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
   8
   9         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  10         registry storage between executions.
  11
  12         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  13
  14         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  15
  16         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  17
  18         * ctsim: Added graphical About box
  19
  20         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  21
  22         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  23
  24         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  25
  26         * ctsim: Online help added!
  27
  28         * backprojector: Added cubic interpolation
  29
  30         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  31
  32         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  33         reconstruction dialogs.
  34
  35         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  36
  37         * global: Projection files are not compatible with previous version
  38         due to new scanner definitions.
  39
  40         * global: deleted concept of field-of-view and added
  41           view ratio and scan ratio concepts.
  42
  43         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  44
  45         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  46
  47         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  48
  49         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  50
  51
  52 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  53
  54         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  55         procsignal.cpp
  56
  57         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  58         bug in parsing command-line parameters.
  59
  60         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  61         plotfiles
  62
  63         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  64
  65         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  66
  67         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  68         for frequency/inverse-fourier filtering
  69
  70 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  71
  72         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  73
  74         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  75         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  76
  77         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  78         for math tips]
  79
  80         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  81
  82         * ctsim: Added more analyze menuitems
  83
  84         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  85         through this master shell. Has both command-line and interactive
  86         interface
  87
  88         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  89
  90         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  91
  92         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  93
  94 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  95
  96         * ctsim: Added plotting of histograms
  97
  98         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  99
 100         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 101
 102 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 103
 104         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 105
 106         * ctsim: added generation of filter images
 107
 108         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 109
 110         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 111
 112         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 113
 114         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 115         text files suitable for reading.
 116
 117         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 118         when performing properties of images.
 119
 120         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 121         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 122         fourier.cpp
 123
 124         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 125         image math functions to complex-valued math.
 126
 127         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 128
 129 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 130
 131         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 132         and column plots and comparison plots
 133
 134         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 135
 136         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 137
 138         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 139         files.
 140
 141         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 142         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 143         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 144
 145         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 146         imagefile and plotfile classes.
 147
 148         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 149         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 150         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 151         images.
 152
 153         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 154         images.
 155
 156         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 157         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 158
 159         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 160         math functions
 161
 162         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 163
 164         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 165         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 166         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 167
 168         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 169         class.
 170
 171         * sgp: Added linestyle settings
 172
 173 2.5.0 - 12/18/00
 174    First Microsoft Windows GUI version
 175    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 176    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 177         when manually compiling phantoms that vary during projection
 178         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 179    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 180    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 181    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 182    Fixed display of plotting in Projection views
 183    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 184    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 185         "namespace using std" statements
 186    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 187    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 188
 189 2.0.6 - 12/03/00
 190    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 191    Updated README file
 192    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 193    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 194
 195 2.0.5 - 12/01/00
 196    Improved compilation on RedHat 7
 197    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 198    Removed README.RedHat7
 199
 200 2.0.4 - 11/25/00
 201    Added documentation for --geometry setting
 202    Added README.RedHat7 document
 203
 204 2.0.3 - 11/20/00
 205    Fixed bug in generation of binary PGM files
 206    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 207    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 208
 209 2.0.2 - 11/8/00
 210    Additions to man pages (Ian Kay)
 211    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 212
 213 2.0.1 - 10/1/00
 214    Fixed syntax error in fftw configuration
 215    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 216
 217 2.0.0 - 9/7/00
 218    Version 2.0.0 released!
 219    ctsim: Added Window menu to Main frame
 220    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 221    Fixed obscure bug in sys_error
 222    Fixed compilation in mingw environment not present
 223    Fixed compilation in non-graphical environments
 224
 225 2.0.0-b12 - 9/4/00
 226    ctsim: Added animation of reconstruction
 227    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 228    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 229    ctsim: used setpriority to set lower priority
 230    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 231    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 232
 233 2.0.0-b11 - 9/1/00
 234    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 235    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 236    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 237    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 238    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 239    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 240    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 241    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 242    Separated reconstruction into Reconstructor class
 243    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 244    Added --enable-static to generate statically linked programs
 245
 246 2.0.0-b10 - 8/25/00
 247    ctsim: Added animation of projection collection processs
 248    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 249    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 250    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 251    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 252    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 253    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 254    Fixed bug in backprojection selection
 255
 256 2.0.0-b9 - 8/22/00
 257    Added RCS Id strings to executable files
 258    Added RPM Spec file for RPM package creation
 259    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 260    Fixed compilation for non-SGP architectures
 261    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 262    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 263         inverse_fourier construction of filters
 264    Added median to statistics and to auto-windowing
 265
 266 2.0.0-b8 - 8/1/00
 267    Added line color support to SGP
 268    Fixed lineAbs bug
 269
 270 2.0.0-b7 - 7/25/00
 271    Finished support for dmallocxx library
 272    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 273    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 274         G2 windows and well as WXWindows.
 275    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 276    Fixed row-plot bug in if-2
 277    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 278
 279 2.0.0-b6 - 7/22/00
 280    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 281         and projection files
 282    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 283         and reconstruction parameters dialogs
 284    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 285    Completely reorganized option processing in classes to improve
 286         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 287
 288 2.0.0-b5 - 7/17/00
 289    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 290    Started ctsim.tex document file
 291
 292 2.0.0-b4 - 7/13/00
 293    Fixed compiler warnings at -Wall level
 294    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 295    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 296    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 297
 298 2.0.0-b3 - 7/10/00
 299    Added highly optimized backprojection method idiff3
 300    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 301    Fixed image display in if2img using G2 library
 302    Added column-plot and row-plot options to if-2
 303    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 304    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 305         backprojection method. Currently, this technique is still under
 306         development and debugging
 307    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 308
 309 2.0.0-b2 - 7/07/00
 310    Cleaned up SignalFilter class
 311    Added zeropad option to pjrec
 312    Added zeropad options to html and cgi files
 313    Added fourier_table and rfttw filter methods
 314    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 315
 316 2.0.0-b1 - 7/05/00
 317    Updated trace level processing
 318    Added trace level to SignalFilter
 319    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 320
 321 1.9.9 - 7/04/00
 322    Fixed const issue with ImageFileArray
 323    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 324    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 325    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 326    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 327    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 328         between convolution, dft, & fft filtering
 329    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 330    Added support for FFTW library
 331
 332 1.9.8 - 6/27/2000
 333    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 334    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 335    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 336    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 337    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 338    Added signature tag and creation date/time to projection files
 339
 340 1.9.7 - 6/25/2000
 341    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 342         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 343         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 344    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 345    Rewrote ImageFile class
 346    Started support for dmallocxx library, not finished
 347    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 348    Updated ifinfo to show comparative statistics
 349    Added printLabels() to Array2dFile class
 350    Added printStatistics() to ImageFile class
 351
 352 1.9.6 - 6/22/2000
 353    Moved conversion filter name/id to Filter class
 354    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 355    Added MPI broadcasting of strings
 356
 357 1.9.5 - 6/21/2000
 358    Merged proj_reconstr into class Projections
 359    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 360    Code cleanup in projections.cpp
 361    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 362
 363 1.9.4 - 6/20/2000
 364    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 365    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 366    Converted filter and convolution to object-oriented code
 367    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 368    Optimized image file writing on little-endian architectures
 369    Updated README and INSTALL
 370
 371 1.9.3 - 6/19/2000
 372    Reorganized source files
 373    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 374
 375 1.9.2 - 6/18/2000
 376    Reorganized include files
 377    Fixed const pointers in strfuncs
 378
 379 1.9.1 - 6/16/2000
 380    Renamed directories, moved source files, combined source files
 381    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 382    and libctgraphics)
 383
 384 1.9.0 - 6/15/2000
 385    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 386    Renamed Raysums to Projections throughout files
 387    Renamed Detector to Scanner
 388    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 389
 390 0.6.1 - 6/12/2000
 391    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 392    Converted Detector to Object-Oriented
 393
 394 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 395    Improved Integer backprojection method
 396         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 397         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 398    Finished converting all C files to C++
 399    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 400    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 401
 402 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 403    Converted MPI data structures to C++ object
 404    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 405
 406 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 407    First C++ conversions
 408    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 409         - Now all data files are cross-platform compatible
 410    Converted from MPI to MPI++
 411    Converted backprojection to object-oriented
 412    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 413
 414 0.5.4 - 6/4/2000
 415    Simpilifed endian handling
 416
 417 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 418    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 419    Removed broken B-spline interpolation
 420    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 421    Added support for 16-bit PNG graphics
 422
 423 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 424    Added compile-time configuration of endian order
 425
 426 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 427    Modified the raysum file format to be platform independent
 428
 429 0.5.3 - 5/11/2000
 430    Added Microsoft VC compatibility
 431    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 432
 433 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 434    Continued conversion to ANSI C
 435    Removed old CRT routines
 436
 437 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 438    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 439    Continued code cleanup
 440
 441 0.5.2-b3 - 4/30/200
 442     More code cleanup with reorganizing libraries
 443     Added --log and --exp to sdf-1
 444     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 445
 446 0.5.2-b2 - 4/30/200
 447     Continued code cleanup
 448
 449 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 450     Fixed a few MPI bugs
 451     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 452
 453 0.5.1 - 4/28/2000
 454     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 455     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 456
 457 0.5.0 - 4/27/2000
 458     First open source distribution for GNU/Linux
 459
 460 6/1999
 461   Converted to GNU/Linux
 462   added MPI support via LAM library
 463
 464 1983-84
 465   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 466