894573e2ec55892cce0d498458d6326d231f82ff
[ctsim.git] / ChangeLog
1 TODO
2         Read PlotFile's.
3
4         Add help button onto dialog's for reconstruction & projections.
5         Consider use of wxWindows help file classes.
6
7         Consider changing POL to to read tag tokens.
8
9         Consider being able to write Phantom files as text and view as
10         text in ctsim.
11         
12 3.0alpha1 - Released 12/30/00
13
14         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
15         and column plots and comparison plots
16
17         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
18
19         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling 
20
21         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
22         files.
23
24         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
25         imagefile and plotfile classes.
26
27         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
28         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
29         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp
30
31         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
32         negative number.
33         
34         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
35         math functions
36
37         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
38
39         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
40         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
41         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
42
43         * pol: converted to C++ class
44         
45         * sgp: Added linestyle settings
46         
47 2.5.0 - 12/18/00 
48    First Microsoft Windows GUI version
49    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
50    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
51         when manually compiling phantoms that vary during projection
52         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
53    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
54    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay) 
55    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
56    Fixed display of plotting in Projection views
57    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
58    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than 
59         "namespace using std" statements
60    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
61    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
62         
63 2.0.6 - 12/03/00
64    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
65    Updated README file
66    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
67    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
68         
69 2.0.5 - 12/01/00
70    Improved compilation on RedHat 7
71    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
72    Removed README.RedHat7
73         
74 2.0.4 - 11/25/00
75    Added documentation for --geometry setting
76    Added README.RedHat7 document
77          
78 2.0.3 - 11/20/00
79    Fixed bug in generation of binary PGM files
80    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
81    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
82         
83 2.0.2 - 11/8/00
84    Additions to man pages (Ian Kay)
85    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
86
87 2.0.1 - 10/1/00
88    Fixed syntax error in fftw configuration
89    Slight modifications to support gcc v2.9.6
90         
91 2.0.0 - 9/7/00
92    Version 2.0.0 released!
93    ctsim: Added Window menu to Main frame
94    ctsim: Disabled not support reconstruction method
95    Fixed obscure bug in sys_error
96    Fixed compilation in mingw environment not present
97    Fixed compilation in non-graphical environments      
98         
99 2.0.0-b12 - 9/4/00
100    ctsim: Added animation of reconstruction
101    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
102    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
103    ctsim: used setpriority to set lower priority
104    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
105    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
106
107 2.0.0-b11 - 9/1/00
108    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection  
109    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
110    ctsim: improved File/Properties display for projection files
111    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
112    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
113    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
114    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
115    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
116    Separated reconstruction into Reconstructor class
117    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
118    Added --enable-static to generate statically linked programs
119         
120 2.0.0-b10 - 8/25/00
121    ctsim: Added animation of projection collection processs
122    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
123    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
124    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
125    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
126    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
127    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
128    Fixed bug in backprojection selection
129         
130 2.0.0-b9 - 8/22/00
131    Added RCS Id strings to executable files
132    Added RPM Spec file for RPM package creation
133    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
134    Fixed compilation for non-SGP architectures 
135    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
136    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or 
137         inverse_fourier construction of filters
138    Added median to statistics and to auto-windowing
139         
140 2.0.0-b8 - 8/1/00
141    Added line color support to SGP
142    Fixed lineAbs bug
143         
144 2.0.0-b7 - 7/25/00
145    Finished support for dmallocxx library
146    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
147    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to 
148         G2 windows and well as WXWindows.
149    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
150    Fixed row-plot bug in if-2
151    Reworked EZPlot's multiple plot operation
152         
153 2.0.0-b6 - 7/22/00
154    ctsim program: improved initial size and scroll area for image 
155         and projection files
156    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
157         and reconstruction parameters dialogs
158    Moved char[] static definition from header files to c++ files
159    Completely reorganized option processing in classes to improve
160         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
161         
162 2.0.0-b5 - 7/17/00
163    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels 
164    Started ctsim.tex document file
165         
166 2.0.0-b4 - 7/13/00
167    Fixed compiler warnings at -Wall level
168    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
169    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
170    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
171         
172 2.0.0-b3 - 7/10/00
173    Added highly optimized backprojection method idiff3
174    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
175    Fixed image display in if2img using G2 library
176    Added column-plot and row-plot options to if-2
177    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
178    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
179         backprojection method. Currently, this technique is still under
180         development and debugging
181    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
182
183 2.0.0-b2 - 7/07/00  
184    Cleaned up SignalFilter class
185    Added zeropad option to pjrec
186    Added zeropad options to html and cgi files
187    Added fourier_table and rfttw filter methods
188    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
189         
190 2.0.0-b1 - 7/05/00
191    Updated trace level processing
192    Added trace level to SignalFilter
193    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
194         
195 1.9.9 - 7/04/00
196    Fixed const issue with ImageFileArray
197    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
198    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
199    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
200    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
201    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
202         between convolution, dft, & fft filtering
203    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
204    Added support for FFTW library
205         
206 1.9.8 - 6/27/2000
207    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
208    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
209    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
210    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
211    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
212    Added signature tag and creation date/time to projection files
213         
214 1.9.7 - 6/25/2000
215    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
216         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
217         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
218    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
219    Rewrote ImageFile class
220    Started support for dmallocxx library, not finished
221    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
222    Updated ifinfo to show comparative statistics
223    Added printLabels() to Array2dFile class
224    Added printStatistics() to ImageFile class
225         
226 1.9.6 - 6/22/2000
227    Moved conversion filter name/id to Filter class
228    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
229    Added MPI broadcasting of strings
230         
231 1.9.5 - 6/21/2000
232    Merged proj_reconstr into class Projections
233    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
234    Code cleanup in projections.cpp
235    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
236         
237 1.9.4 - 6/20/2000
238    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
239    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
240    Converted filter and convolution to object-oriented code
241    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
242    Optimized image file writing on little-endian architectures
243    Updated README and INSTALL
244         
245 1.9.3 - 6/19/2000
246    Reorganized source files
247    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
248         
249 1.9.2 - 6/18/2000
250    Reorganized include files
251    Fixed const pointers in strfuncs
252         
253 1.9.1 - 6/16/2000
254    Renamed directories, moved source files, combined source files
255    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
256    and libctgraphics)
257         
258 1.9.0 - 6/15/2000
259    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
260    Renamed Raysums to Projections throughout files
261    Renamed Detector to Scanner
262    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
263         
264 0.6.1 - 6/12/2000
265    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
266    Converted Detector to Object-Oriented
267         
268 0.6.0-b3 - 6/10/2000
269    Improved Integer backprojection method
270         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
271         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
272    Finished converting all C files to C++
273    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
274    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
275         
276 0.6.0-b2 - 6/8/2000
277    Converted MPI data structures to C++ object
278    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
279         
280 0.6.0-b1 - 6/6/2000
281    First C++ conversions
282    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
283         - Now all data files are cross-platform compatible
284    Converted from MPI to MPI++
285    Converted backprojection to object-oriented
286    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices             
287         
288 0.5.4 - 6/4/2000
289    Simpilifed endian handling
290         
291 0.5.4-b3 - 6/1/2000
292    Added support for 64-bit (IA64) CPU
293    Removed broken B-spline interpolation
294    Added support for cygwin platform under Windows 2000
295    Added support for 16-bit PNG graphics
296         
297 0.5.4-b2 - 5/16/2000
298    Added compile-time configuration of endian order
299
300 0.5.4-b1 - 5/14/2000
301    Modified the raysum file format to be platform independent
302         
303 0.5.3 - 5/11/2000
304    Added Microsoft VC compatibility
305    Cleaned up compilation warnings in libgraph
306         
307 0.5.2-b5 - 5/7/2000
308    Continued conversion to ANSI C       
309    Removed old CRT routines
310         
311 0.5.2-b4 - 5/4/2000
312    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
313    Continued code cleanup
314         
315 0.5.2-b3 - 4/30/200
316     More code cleanup with reorganizing libraries
317     Added --log and --exp to sdf-1
318     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
319
320 0.5.2-b2 - 4/30/200
321     Continued code cleanup
322         
323 0.5.2-b1 - 4/29/2000
324     Fixed a few MPI bugs
325     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
326         
327 0.5.1 - 4/28/2000
328     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim  
329     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
330
331 0.5.0 - 4/27/2000 
332     First open source distribution for GNU/Linux
333         
334 6/1999 
335   Converted to GNU/Linux
336   added MPI support via LAM library
337         
338 1983-84 
339   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
340