ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Added MDI interface for Windows version
   4
   5         * ctsim: Added graphical About box
   6
   7         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to windows
   8
   9         * ctsim: Online help added as well as HTML help
  10
  11         * ctsim: Added icons to Frames on Windows versions
  12
  13         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  14
  15         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  16
  17 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  18
  19         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  20         procsignal.cpp
  21
  22         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  23         bug in parsing command-line parameters.
  24
  25         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  26         plotfiles
  27
  28         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  29
  30         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  31
  32         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  33         for frequency/inverse-fourier filtering
  34
  35 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  36
  37         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  38
  39         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  40         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  41
  42         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  43         for math tips]
  44
  45         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  46
  47         * ctsim: Added more analyze menuitems
  48
  49         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  50         through this master shell. Has both command-line and interactive
  51         interface
  52
  53         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  54
  55         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  56
  57         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  58
  59 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  60
  61         * ctsim: Added plotting of histograms
  62
  63         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  64
  65         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  66
  67 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  68
  69         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  70
  71         * ctsim: added generation of filter images
  72
  73         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  74
  75         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  76
  77         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  78
  79         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  80         text files suitable for reading.
  81
  82         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  83         when performing properties of images.
  84
  85         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  86         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  87         fourier.cpp
  88
  89         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  90         image math functions to complex-valued math.
  91
  92         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  93
  94 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  95
  96         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  97         and column plots and comparison plots
  98
  99         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 100
 101         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 102
 103         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 104         files.
 105
 106         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 107         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 108         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 109
 110         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 111         imagefile and plotfile classes.
 112
 113         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 114         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 115         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 116         images.
 117
 118         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 119         images.
 120
 121         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 122         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 123
 124         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 125         math functions
 126
 127         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 128
 129         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 130         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 131         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 132
 133         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 134         class.
 135
 136         * sgp: Added linestyle settings
 137
 138 2.5.0 - 12/18/00
 139    First Microsoft Windows GUI version
 140    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 141    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 142         when manually compiling phantoms that vary during projection
 143         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 144    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 145    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 146    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 147    Fixed display of plotting in Projection views
 148    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 149    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 150         "namespace using std" statements
 151    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 152    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 153
 154 2.0.6 - 12/03/00
 155    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 156    Updated README file
 157    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 158    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 159
 160 2.0.5 - 12/01/00
 161    Improved compilation on RedHat 7
 162    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 163    Removed README.RedHat7
 164
 165 2.0.4 - 11/25/00
 166    Added documentation for --geometry setting
 167    Added README.RedHat7 document
 168
 169 2.0.3 - 11/20/00
 170    Fixed bug in generation of binary PGM files
 171    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 172    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 173
 174 2.0.2 - 11/8/00
 175    Additions to man pages (Ian Kay)
 176    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 177
 178 2.0.1 - 10/1/00
 179    Fixed syntax error in fftw configuration
 180    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 181
 182 2.0.0 - 9/7/00
 183    Version 2.0.0 released!
 184    ctsim: Added Window menu to Main frame
 185    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 186    Fixed obscure bug in sys_error
 187    Fixed compilation in mingw environment not present
 188    Fixed compilation in non-graphical environments
 189
 190 2.0.0-b12 - 9/4/00
 191    ctsim: Added animation of reconstruction
 192    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 193    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 194    ctsim: used setpriority to set lower priority
 195    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 196    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 197
 198 2.0.0-b11 - 9/1/00
 199    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 200    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 201    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 202    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 203    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 204    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 205    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 206    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 207    Separated reconstruction into Reconstructor class
 208    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 209    Added --enable-static to generate statically linked programs
 210
 211 2.0.0-b10 - 8/25/00
 212    ctsim: Added animation of projection collection processs
 213    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 214    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 215    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 216    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 217    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 218    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 219    Fixed bug in backprojection selection
 220
 221 2.0.0-b9 - 8/22/00
 222    Added RCS Id strings to executable files
 223    Added RPM Spec file for RPM package creation
 224    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 225    Fixed compilation for non-SGP architectures
 226    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 227    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 228         inverse_fourier construction of filters
 229    Added median to statistics and to auto-windowing
 230
 231 2.0.0-b8 - 8/1/00
 232    Added line color support to SGP
 233    Fixed lineAbs bug
 234
 235 2.0.0-b7 - 7/25/00
 236    Finished support for dmallocxx library
 237    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 238    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 239         G2 windows and well as WXWindows.
 240    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 241    Fixed row-plot bug in if-2
 242    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 243
 244 2.0.0-b6 - 7/22/00
 245    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 246         and projection files
 247    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 248         and reconstruction parameters dialogs
 249    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 250    Completely reorganized option processing in classes to improve
 251         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 252
 253 2.0.0-b5 - 7/17/00
 254    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 255    Started ctsim.tex document file
 256
 257 2.0.0-b4 - 7/13/00
 258    Fixed compiler warnings at -Wall level
 259    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 260    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 261    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 262
 263 2.0.0-b3 - 7/10/00
 264    Added highly optimized backprojection method idiff3
 265    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 266    Fixed image display in if2img using G2 library
 267    Added column-plot and row-plot options to if-2
 268    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 269    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 270         backprojection method. Currently, this technique is still under
 271         development and debugging
 272    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 273
 274 2.0.0-b2 - 7/07/00
 275    Cleaned up SignalFilter class
 276    Added zeropad option to pjrec
 277    Added zeropad options to html and cgi files
 278    Added fourier_table and rfttw filter methods
 279    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 280
 281 2.0.0-b1 - 7/05/00
 282    Updated trace level processing
 283    Added trace level to SignalFilter
 284    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 285
 286 1.9.9 - 7/04/00
 287    Fixed const issue with ImageFileArray
 288    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 289    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 290    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 291    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 292    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 293         between convolution, dft, & fft filtering
 294    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 295    Added support for FFTW library
 296
 297 1.9.8 - 6/27/2000
 298    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 299    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 300    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 301    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 302    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 303    Added signature tag and creation date/time to projection files
 304
 305 1.9.7 - 6/25/2000
 306    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 307         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 308         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 309    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 310    Rewrote ImageFile class
 311    Started support for dmallocxx library, not finished
 312    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 313    Updated ifinfo to show comparative statistics
 314    Added printLabels() to Array2dFile class
 315    Added printStatistics() to ImageFile class
 316
 317 1.9.6 - 6/22/2000
 318    Moved conversion filter name/id to Filter class
 319    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 320    Added MPI broadcasting of strings
 321
 322 1.9.5 - 6/21/2000
 323    Merged proj_reconstr into class Projections
 324    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 325    Code cleanup in projections.cpp
 326    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 327
 328 1.9.4 - 6/20/2000
 329    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 330    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 331    Converted filter and convolution to object-oriented code
 332    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 333    Optimized image file writing on little-endian architectures
 334    Updated README and INSTALL
 335
 336 1.9.3 - 6/19/2000
 337    Reorganized source files
 338    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 339
 340 1.9.2 - 6/18/2000
 341    Reorganized include files
 342    Fixed const pointers in strfuncs
 343
 344 1.9.1 - 6/16/2000
 345    Renamed directories, moved source files, combined source files
 346    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 347    and libctgraphics)
 348
 349 1.9.0 - 6/15/2000
 350    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 351    Renamed Raysums to Projections throughout files
 352    Renamed Detector to Scanner
 353    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 354
 355 0.6.1 - 6/12/2000
 356    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 357    Converted Detector to Object-Oriented
 358
 359 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 360    Improved Integer backprojection method
 361         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 362         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 363    Finished converting all C files to C++
 364    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 365    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 366
 367 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 368    Converted MPI data structures to C++ object
 369    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 370
 371 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 372    First C++ conversions
 373    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 374         - Now all data files are cross-platform compatible
 375    Converted from MPI to MPI++
 376    Converted backprojection to object-oriented
 377    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 378
 379 0.5.4 - 6/4/2000
 380    Simpilifed endian handling
 381
 382 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 383    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 384    Removed broken B-spline interpolation
 385    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 386    Added support for 16-bit PNG graphics
 387
 388 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 389    Added compile-time configuration of endian order
 390
 391 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 392    Modified the raysum file format to be platform independent
 393
 394 0.5.3 - 5/11/2000
 395    Added Microsoft VC compatibility
 396    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 397
 398 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 399    Continued conversion to ANSI C
 400    Removed old CRT routines
 401
 402 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 403    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 404    Continued code cleanup
 405
 406 0.5.2-b3 - 4/30/200
 407     More code cleanup with reorganizing libraries
 408     Added --log and --exp to sdf-1
 409     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 410
 411 0.5.2-b2 - 4/30/200
 412     Continued code cleanup
 413
 414 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 415     Fixed a few MPI bugs
 416     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 417
 418 0.5.1 - 4/28/2000
 419     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 420     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 421
 422 0.5.0 - 4/27/2000
 423     First open source distribution for GNU/Linux
 424
 425 6/1999
 426   Converted to GNU/Linux
 427   added MPI support via LAM library
 428
 429 1983-84
 430   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 431