ChangeLog

   1 TODO
   2         Read PlotFile's.
   3
   4
   5 3.0alpha1 - Released 12/30/00
   6
   7         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
   8         and column plots and comparison plots
   9
  10         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  11
  12         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  13
  14         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  15         files.
  16
  17         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  18         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math functions.
  19
  20         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  21         imagefile and plotfile classes.
  22
  23         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  24         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  25         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp
  26
  27         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  28         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  29
  30         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  31         math functions
  32
  33         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  34
  35         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  36         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  37         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  38
  39         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  40         class.
  41
  42         * sgp: Added linestyle settings
  43
  44 2.5.0 - 12/18/00
  45    First Microsoft Windows GUI version
  46    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  47    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  48         when manually compiling phantoms that vary during projection
  49         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  50    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  51    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  52    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  53    Fixed display of plotting in Projection views
  54    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  55    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  56         "namespace using std" statements
  57    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  58    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  59
  60 2.0.6 - 12/03/00
  61    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
  62    Updated README file
  63    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
  64    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
  65
  66 2.0.5 - 12/01/00
  67    Improved compilation on RedHat 7
  68    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
  69    Removed README.RedHat7
  70
  71 2.0.4 - 11/25/00
  72    Added documentation for --geometry setting
  73    Added README.RedHat7 document
  74
  75 2.0.3 - 11/20/00
  76    Fixed bug in generation of binary PGM files
  77    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
  78    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
  79
  80 2.0.2 - 11/8/00
  81    Additions to man pages (Ian Kay)
  82    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
  83
  84 2.0.1 - 10/1/00
  85    Fixed syntax error in fftw configuration
  86    Slight modifications to support gcc v2.9.6
  87
  88 2.0.0 - 9/7/00
  89    Version 2.0.0 released!
  90    ctsim: Added Window menu to Main frame
  91    ctsim: Disabled not support reconstruction method
  92    Fixed obscure bug in sys_error
  93    Fixed compilation in mingw environment not present
  94    Fixed compilation in non-graphical environments
  95
  96 2.0.0-b12 - 9/4/00
  97    ctsim: Added animation of reconstruction
  98    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
  99    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 100    ctsim: used setpriority to set lower priority
 101    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 102    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 103
 104 2.0.0-b11 - 9/1/00
 105    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 106    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 107    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 108    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 109    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 110    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 111    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 112    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 113    Separated reconstruction into Reconstructor class
 114    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 115    Added --enable-static to generate statically linked programs
 116
 117 2.0.0-b10 - 8/25/00
 118    ctsim: Added animation of projection collection processs
 119    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 120    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 121    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 122    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 123    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 124    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 125    Fixed bug in backprojection selection
 126
 127 2.0.0-b9 - 8/22/00
 128    Added RCS Id strings to executable files
 129    Added RPM Spec file for RPM package creation
 130    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 131    Fixed compilation for non-SGP architectures
 132    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 133    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 134         inverse_fourier construction of filters
 135    Added median to statistics and to auto-windowing
 136
 137 2.0.0-b8 - 8/1/00
 138    Added line color support to SGP
 139    Fixed lineAbs bug
 140
 141 2.0.0-b7 - 7/25/00
 142    Finished support for dmallocxx library
 143    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 144    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 145         G2 windows and well as WXWindows.
 146    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 147    Fixed row-plot bug in if-2
 148    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 149
 150 2.0.0-b6 - 7/22/00
 151    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 152         and projection files
 153    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 154         and reconstruction parameters dialogs
 155    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 156    Completely reorganized option processing in classes to improve
 157         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 158
 159 2.0.0-b5 - 7/17/00
 160    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 161    Started ctsim.tex document file
 162
 163 2.0.0-b4 - 7/13/00
 164    Fixed compiler warnings at -Wall level
 165    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 166    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 167    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 168
 169 2.0.0-b3 - 7/10/00
 170    Added highly optimized backprojection method idiff3
 171    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 172    Fixed image display in if2img using G2 library
 173    Added column-plot and row-plot options to if-2
 174    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 175    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 176         backprojection method. Currently, this technique is still under
 177         development and debugging
 178    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 179
 180 2.0.0-b2 - 7/07/00
 181    Cleaned up SignalFilter class
 182    Added zeropad option to pjrec
 183    Added zeropad options to html and cgi files
 184    Added fourier_table and rfttw filter methods
 185    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 186
 187 2.0.0-b1 - 7/05/00
 188    Updated trace level processing
 189    Added trace level to SignalFilter
 190    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 191
 192 1.9.9 - 7/04/00
 193    Fixed const issue with ImageFileArray
 194    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 195    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 196    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 197    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 198    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 199         between convolution, dft, & fft filtering
 200    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 201    Added support for FFTW library
 202
 203 1.9.8 - 6/27/2000
 204    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 205    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 206    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 207    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 208    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 209    Added signature tag and creation date/time to projection files
 210
 211 1.9.7 - 6/25/2000
 212    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 213         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 214         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 215    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 216    Rewrote ImageFile class
 217    Started support for dmallocxx library, not finished
 218    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 219    Updated ifinfo to show comparative statistics
 220    Added printLabels() to Array2dFile class
 221    Added printStatistics() to ImageFile class
 222
 223 1.9.6 - 6/22/2000
 224    Moved conversion filter name/id to Filter class
 225    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 226    Added MPI broadcasting of strings
 227
 228 1.9.5 - 6/21/2000
 229    Merged proj_reconstr into class Projections
 230    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 231    Code cleanup in projections.cpp
 232    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 233
 234 1.9.4 - 6/20/2000
 235    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 236    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 237    Converted filter and convolution to object-oriented code
 238    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 239    Optimized image file writing on little-endian architectures
 240    Updated README and INSTALL
 241
 242 1.9.3 - 6/19/2000
 243    Reorganized source files
 244    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 245
 246 1.9.2 - 6/18/2000
 247    Reorganized include files
 248    Fixed const pointers in strfuncs
 249
 250 1.9.1 - 6/16/2000
 251    Renamed directories, moved source files, combined source files
 252    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 253    and libctgraphics)
 254
 255 1.9.0 - 6/15/2000
 256    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 257    Renamed Raysums to Projections throughout files
 258    Renamed Detector to Scanner
 259    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 260
 261 0.6.1 - 6/12/2000
 262    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 263    Converted Detector to Object-Oriented
 264
 265 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 266    Improved Integer backprojection method
 267         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 268         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 269    Finished converting all C files to C++
 270    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 271    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 272
 273 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 274    Converted MPI data structures to C++ object
 275    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 276
 277 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 278    First C++ conversions
 279    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 280         - Now all data files are cross-platform compatible
 281    Converted from MPI to MPI++
 282    Converted backprojection to object-oriented
 283    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 284
 285 0.5.4 - 6/4/2000
 286    Simpilifed endian handling
 287
 288 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 289    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 290    Removed broken B-spline interpolation
 291    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 292    Added support for 16-bit PNG graphics
 293
 294 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 295    Added compile-time configuration of endian order
 296
 297 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 298    Modified the raysum file format to be platform independent
 299
 300 0.5.3 - 5/11/2000
 301    Added Microsoft VC compatibility
 302    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 303
 304 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 305    Continued conversion to ANSI C
 306    Removed old CRT routines
 307
 308 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 309    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 310    Continued code cleanup
 311
 312 0.5.2-b3 - 4/30/200
 313     More code cleanup with reorganizing libraries
 314     Added --log and --exp to sdf-1
 315     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 316
 317 0.5.2-b2 - 4/30/200
 318     Continued code cleanup
 319
 320 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 321     Fixed a few MPI bugs
 322     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 323
 324 0.5.1 - 4/28/2000
 325     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 326     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 327
 328 0.5.0 - 4/27/2000
 329     First open source distribution for GNU/Linux
 330
 331 6/1999
 332   Converted to GNU/Linux
 333   added MPI support via LAM library
 334
 335 1983-84
 336   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 337