ChangeLog

   1 3.0.2 - Released 2/20/01
   2
   3         * scanner.cpp: Fixed bug when number of detectors was even.
   4
   5         * ctsim: Improved error handling when trying to convert
   6         divergent projections into polar form.
   7
   8 3.0.1 - Released 2/19/01
   9
  10         * ctsim: Fixed dialog box for reconstruction so that
  11         rotation angle setting will stay fixed in-between use
  12         of the dialog box.
  13
  14         * syserror: Fixed display bug for trace messages
  15
  16         * ctsim: MSVC optimization bug work-around, compiler
  17         options changed.
  18
  19 3.0.0 - Released 2/19/01
  20
  21         * ctsim: Massive update/fix to online help and print manual.
  22
  23         * ctsim: Added context-sensitive help to dialog boxes
  24
  25         * ctsim: Reformated all dialog boxes, much nicer now.
  26
  27         * ctsim: Improved accelerator key handling
  28
  29         * global: Added Hanning filter.
  30
  31         * global: Improved default parameters to that all defaults give
  32         sensible output.
  33
  34 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
  35
  36         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  37         registry storage between executions.
  38
  39         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  40
  41         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  42
  43         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  44
  45         * ctsim: Added graphical About box
  46
  47         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  48
  49         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  50
  51         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  52
  53         * ctsim: Online help added!
  54
  55         * backprojector: Added cubic interpolation
  56
  57         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  58
  59         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  60         reconstruction dialogs.
  61
  62         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  63
  64         * global: Projection files are not compatible with previous version
  65         due to new scanner definitions.
  66
  67         * global: deleted concept of field-of-view and added
  68           view ratio and scan ratio concepts.
  69
  70         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  71
  72         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  73
  74         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  75
  76         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  77
  78
  79 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  80
  81         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  82         procsignal.cpp
  83
  84         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  85         bug in parsing command-line parameters.
  86
  87         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  88         plotfiles
  89
  90         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  91
  92         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  93
  94         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  95         for frequency/inverse-fourier filtering
  96
  97 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  98
  99         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
 100
 101         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
 102         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
 103
 104         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
 105         for math tips]
 106
 107         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
 108
 109         * ctsim: Added more analyze menuitems
 110
 111         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
 112         through this master shell. Has both command-line and interactive
 113         interface
 114
 115         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
 116
 117         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
 118
 119         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
 120
 121 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
 122
 123         * ctsim: Added plotting of histograms
 124
 125         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
 126
 127         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 128
 129 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 130
 131         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 132
 133         * ctsim: added generation of filter images
 134
 135         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 136
 137         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 138
 139         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 140
 141         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 142         text files suitable for reading.
 143
 144         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 145         when performing properties of images.
 146
 147         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 148         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 149         fourier.cpp
 150
 151         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 152         image math functions to complex-valued math.
 153
 154         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 155
 156 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 157
 158         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 159         and column plots and comparison plots
 160
 161         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 162
 163         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 164
 165         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 166         files.
 167
 168         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 169         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 170         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 171
 172         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 173         imagefile and plotfile classes.
 174
 175         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 176         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 177         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 178         images.
 179
 180         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 181         images.
 182
 183         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 184         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 185
 186         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 187         math functions
 188
 189         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 190
 191         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 192         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 193         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 194
 195         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 196         class.
 197
 198         * sgp: Added linestyle settings
 199
 200 2.5.0 - 12/18/00
 201    First Microsoft Windows GUI version
 202    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 203    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 204         when manually compiling phantoms that vary during projection
 205         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 206    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 207    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 208    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 209    Fixed display of plotting in Projection views
 210    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 211    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 212         "namespace using std" statements
 213    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 214    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 215
 216 2.0.6 - 12/03/00
 217    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 218    Updated README file
 219    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 220    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 221
 222 2.0.5 - 12/01/00
 223    Improved compilation on RedHat 7
 224    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 225    Removed README.RedHat7
 226
 227 2.0.4 - 11/25/00
 228    Added documentation for --geometry setting
 229    Added README.RedHat7 document
 230
 231 2.0.3 - 11/20/00
 232    Fixed bug in generation of binary PGM files
 233    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 234    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 235
 236 2.0.2 - 11/8/00
 237    Additions to man pages (Ian Kay)
 238    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 239
 240 2.0.1 - 10/1/00
 241    Fixed syntax error in fftw configuration
 242    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 243
 244 2.0.0 - 9/7/00
 245    Version 2.0.0 released!
 246    ctsim: Added Window menu to Main frame
 247    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 248    Fixed obscure bug in sys_error
 249    Fixed compilation in mingw environment not present
 250    Fixed compilation in non-graphical environments
 251
 252 2.0.0-b12 - 9/4/00
 253    ctsim: Added animation of reconstruction
 254    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 255    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 256    ctsim: used setpriority to set lower priority
 257    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 258    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 259
 260 2.0.0-b11 - 9/1/00
 261    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 262    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 263    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 264    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 265    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 266    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 267    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 268    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 269    Separated reconstruction into Reconstructor class
 270    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 271    Added --enable-static to generate statically linked programs
 272
 273 2.0.0-b10 - 8/25/00
 274    ctsim: Added animation of projection collection processs
 275    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 276    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 277    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 278    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 279    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 280    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 281    Fixed bug in backprojection selection
 282
 283 2.0.0-b9 - 8/22/00
 284    Added RCS Id strings to executable files
 285    Added RPM Spec file for RPM package creation
 286    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 287    Fixed compilation for non-SGP architectures
 288    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 289    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 290         inverse_fourier construction of filters
 291    Added median to statistics and to auto-windowing
 292
 293 2.0.0-b8 - 8/1/00
 294    Added line color support to SGP
 295    Fixed lineAbs bug
 296
 297 2.0.0-b7 - 7/25/00
 298    Finished support for dmallocxx library
 299    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 300    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 301         G2 windows and well as WXWindows.
 302    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 303    Fixed row-plot bug in if-2
 304    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 305
 306 2.0.0-b6 - 7/22/00
 307    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 308         and projection files
 309    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 310         and reconstruction parameters dialogs
 311    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 312    Completely reorganized option processing in classes to improve
 313         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 314
 315 2.0.0-b5 - 7/17/00
 316    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 317    Started ctsim.tex document file
 318
 319 2.0.0-b4 - 7/13/00
 320    Fixed compiler warnings at -Wall level
 321    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 322    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 323    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 324
 325 2.0.0-b3 - 7/10/00
 326    Added highly optimized backprojection method idiff3
 327    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 328    Fixed image display in if2img using G2 library
 329    Added column-plot and row-plot options to if-2
 330    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 331    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 332         backprojection method. Currently, this technique is still under
 333         development and debugging
 334    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 335
 336 2.0.0-b2 - 7/07/00
 337    Cleaned up SignalFilter class
 338    Added zeropad option to pjrec
 339    Added zeropad options to html and cgi files
 340    Added fourier_table and rfttw filter methods
 341    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 342
 343 2.0.0-b1 - 7/05/00
 344    Updated trace level processing
 345    Added trace level to SignalFilter
 346    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 347
 348 1.9.9 - 7/04/00
 349    Fixed const issue with ImageFileArray
 350    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 351    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 352    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 353    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 354    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 355         between convolution, dft, & fft filtering
 356    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 357    Added support for FFTW library
 358
 359 1.9.8 - 6/27/2000
 360    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 361    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 362    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 363    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 364    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 365    Added signature tag and creation date/time to projection files
 366
 367 1.9.7 - 6/25/2000
 368    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 369         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 370         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 371    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 372    Rewrote ImageFile class
 373    Started support for dmallocxx library, not finished
 374    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 375    Updated ifinfo to show comparative statistics
 376    Added printLabels() to Array2dFile class
 377    Added printStatistics() to ImageFile class
 378
 379 1.9.6 - 6/22/2000
 380    Moved conversion filter name/id to Filter class
 381    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 382    Added MPI broadcasting of strings
 383
 384 1.9.5 - 6/21/2000
 385    Merged proj_reconstr into class Projections
 386    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 387    Code cleanup in projections.cpp
 388    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 389
 390 1.9.4 - 6/20/2000
 391    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 392    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 393    Converted filter and convolution to object-oriented code
 394    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 395    Optimized image file writing on little-endian architectures
 396    Updated README and INSTALL
 397
 398 1.9.3 - 6/19/2000
 399    Reorganized source files
 400    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 401
 402 1.9.2 - 6/18/2000
 403    Reorganized include files
 404    Fixed const pointers in strfuncs
 405
 406 1.9.1 - 6/16/2000
 407    Renamed directories, moved source files, combined source files
 408    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 409    and libctgraphics)
 410
 411 1.9.0 - 6/15/2000
 412    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 413    Renamed Raysums to Projections throughout files
 414    Renamed Detector to Scanner
 415    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 416
 417 0.6.1 - 6/12/2000
 418    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 419    Converted Detector to Object-Oriented
 420
 421 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 422    Improved Integer backprojection method
 423         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 424         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 425    Finished converting all C files to C++
 426    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 427    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 428
 429 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 430    Converted MPI data structures to C++ object
 431    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 432
 433 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 434    First C++ conversions
 435    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 436         - Now all data files are cross-platform compatible
 437    Converted from MPI to MPI++
 438    Converted backprojection to object-oriented
 439    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 440
 441 0.5.4 - 6/4/2000
 442    Simpilifed endian handling
 443
 444 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 445    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 446    Removed broken B-spline interpolation
 447    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 448    Added support for 16-bit PNG graphics
 449
 450 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 451    Added compile-time configuration of endian order
 452
 453 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 454    Modified the raysum file format to be platform independent
 455
 456 0.5.3 - 5/11/2000
 457    Added Microsoft VC compatibility
 458    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 459
 460 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 461    Continued conversion to ANSI C
 462    Removed old CRT routines
 463
 464 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 465    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 466    Continued code cleanup
 467
 468 0.5.2-b3 - 4/30/200
 469     More code cleanup with reorganizing libraries
 470     Added --log and --exp to sdf-1
 471     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 472
 473 0.5.2-b2 - 4/30/200
 474     Continued code cleanup
 475
 476 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 477     Fixed a few MPI bugs
 478     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 479
 480 0.5.1 - 4/28/2000
 481     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 482     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 483
 484 0.5.0 - 4/27/2000
 485     First open source distribution for GNU/Linux
 486
 487 6/1999
 488   Converted to GNU/Linux
 489   added MPI support via LAM library
 490
 491 1983-84
 492   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 493