ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Fixed initialization of min/max for PlotFiles
   4
   5 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
   6
   7         * ctsim: Added plotting of histograms
   8
   9         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  10
  11         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  12
  13 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  14
  15         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  16
  17         * ctsim: added generation of filter images
  18
  19         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  20
  21         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  22
  23         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  24
  25         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  26         text files suitable for reading.
  27
  28         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  29         when performing properties of images.
  30
  31         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  32         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  33         fourier.cpp
  34
  35         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  36         image math functions to complex-valued math.
  37
  38         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  39
  40 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  41
  42         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  43         and column plots and comparison plots
  44
  45         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  46
  47         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  48
  49         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  50         files.
  51
  52         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  53         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  54         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  55
  56         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  57         imagefile and plotfile classes.
  58
  59         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  60         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  61         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  62         images.
  63
  64         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  65         images.
  66
  67         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  68         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  69
  70         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  71         math functions
  72
  73         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  74
  75         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  76         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  77         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  78
  79         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  80         class.
  81
  82         * sgp: Added linestyle settings
  83
  84 2.5.0 - 12/18/00
  85    First Microsoft Windows GUI version
  86    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  87    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  88         when manually compiling phantoms that vary during projection
  89         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  90    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  91    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  92    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  93    Fixed display of plotting in Projection views
  94    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  95    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  96         "namespace using std" statements
  97    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  98    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  99
 100 2.0.6 - 12/03/00
 101    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 102    Updated README file
 103    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 104    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 105
 106 2.0.5 - 12/01/00
 107    Improved compilation on RedHat 7
 108    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 109    Removed README.RedHat7
 110
 111 2.0.4 - 11/25/00
 112    Added documentation for --geometry setting
 113    Added README.RedHat7 document
 114
 115 2.0.3 - 11/20/00
 116    Fixed bug in generation of binary PGM files
 117    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 118    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 119
 120 2.0.2 - 11/8/00
 121    Additions to man pages (Ian Kay)
 122    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 123
 124 2.0.1 - 10/1/00
 125    Fixed syntax error in fftw configuration
 126    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 127
 128 2.0.0 - 9/7/00
 129    Version 2.0.0 released!
 130    ctsim: Added Window menu to Main frame
 131    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 132    Fixed obscure bug in sys_error
 133    Fixed compilation in mingw environment not present
 134    Fixed compilation in non-graphical environments
 135
 136 2.0.0-b12 - 9/4/00
 137    ctsim: Added animation of reconstruction
 138    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 139    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 140    ctsim: used setpriority to set lower priority
 141    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 142    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 143
 144 2.0.0-b11 - 9/1/00
 145    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 146    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 147    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 148    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 149    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 150    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 151    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 152    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 153    Separated reconstruction into Reconstructor class
 154    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 155    Added --enable-static to generate statically linked programs
 156
 157 2.0.0-b10 - 8/25/00
 158    ctsim: Added animation of projection collection processs
 159    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 160    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 161    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 162    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 163    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 164    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 165    Fixed bug in backprojection selection
 166
 167 2.0.0-b9 - 8/22/00
 168    Added RCS Id strings to executable files
 169    Added RPM Spec file for RPM package creation
 170    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 171    Fixed compilation for non-SGP architectures
 172    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 173    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 174         inverse_fourier construction of filters
 175    Added median to statistics and to auto-windowing
 176
 177 2.0.0-b8 - 8/1/00
 178    Added line color support to SGP
 179    Fixed lineAbs bug
 180
 181 2.0.0-b7 - 7/25/00
 182    Finished support for dmallocxx library
 183    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 184    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 185         G2 windows and well as WXWindows.
 186    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 187    Fixed row-plot bug in if-2
 188    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 189
 190 2.0.0-b6 - 7/22/00
 191    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 192         and projection files
 193    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 194         and reconstruction parameters dialogs
 195    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 196    Completely reorganized option processing in classes to improve
 197         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 198
 199 2.0.0-b5 - 7/17/00
 200    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 201    Started ctsim.tex document file
 202
 203 2.0.0-b4 - 7/13/00
 204    Fixed compiler warnings at -Wall level
 205    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 206    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 207    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 208
 209 2.0.0-b3 - 7/10/00
 210    Added highly optimized backprojection method idiff3
 211    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 212    Fixed image display in if2img using G2 library
 213    Added column-plot and row-plot options to if-2
 214    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 215    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 216         backprojection method. Currently, this technique is still under
 217         development and debugging
 218    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 219
 220 2.0.0-b2 - 7/07/00
 221    Cleaned up SignalFilter class
 222    Added zeropad option to pjrec
 223    Added zeropad options to html and cgi files
 224    Added fourier_table and rfttw filter methods
 225    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 226
 227 2.0.0-b1 - 7/05/00
 228    Updated trace level processing
 229    Added trace level to SignalFilter
 230    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 231
 232 1.9.9 - 7/04/00
 233    Fixed const issue with ImageFileArray
 234    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 235    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 236    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 237    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 238    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 239         between convolution, dft, & fft filtering
 240    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 241    Added support for FFTW library
 242
 243 1.9.8 - 6/27/2000
 244    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 245    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 246    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 247    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 248    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 249    Added signature tag and creation date/time to projection files
 250
 251 1.9.7 - 6/25/2000
 252    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 253         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 254         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 255    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 256    Rewrote ImageFile class
 257    Started support for dmallocxx library, not finished
 258    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 259    Updated ifinfo to show comparative statistics
 260    Added printLabels() to Array2dFile class
 261    Added printStatistics() to ImageFile class
 262
 263 1.9.6 - 6/22/2000
 264    Moved conversion filter name/id to Filter class
 265    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 266    Added MPI broadcasting of strings
 267
 268 1.9.5 - 6/21/2000
 269    Merged proj_reconstr into class Projections
 270    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 271    Code cleanup in projections.cpp
 272    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 273
 274 1.9.4 - 6/20/2000
 275    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 276    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 277    Converted filter and convolution to object-oriented code
 278    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 279    Optimized image file writing on little-endian architectures
 280    Updated README and INSTALL
 281
 282 1.9.3 - 6/19/2000
 283    Reorganized source files
 284    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 285
 286 1.9.2 - 6/18/2000
 287    Reorganized include files
 288    Fixed const pointers in strfuncs
 289
 290 1.9.1 - 6/16/2000
 291    Renamed directories, moved source files, combined source files
 292    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 293    and libctgraphics)
 294
 295 1.9.0 - 6/15/2000
 296    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 297    Renamed Raysums to Projections throughout files
 298    Renamed Detector to Scanner
 299    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 300
 301 0.6.1 - 6/12/2000
 302    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 303    Converted Detector to Object-Oriented
 304
 305 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 306    Improved Integer backprojection method
 307         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 308         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 309    Finished converting all C files to C++
 310    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 311    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 312
 313 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 314    Converted MPI data structures to C++ object
 315    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 316
 317 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 318    First C++ conversions
 319    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 320         - Now all data files are cross-platform compatible
 321    Converted from MPI to MPI++
 322    Converted backprojection to object-oriented
 323    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 324
 325 0.5.4 - 6/4/2000
 326    Simpilifed endian handling
 327
 328 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 329    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 330    Removed broken B-spline interpolation
 331    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 332    Added support for 16-bit PNG graphics
 333
 334 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 335    Added compile-time configuration of endian order
 336
 337 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 338    Modified the raysum file format to be platform independent
 339
 340 0.5.3 - 5/11/2000
 341    Added Microsoft VC compatibility
 342    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 343
 344 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 345    Continued conversion to ANSI C
 346    Removed old CRT routines
 347
 348 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 349    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 350    Continued code cleanup
 351
 352 0.5.2-b3 - 4/30/200
 353     More code cleanup with reorganizing libraries
 354     Added --log and --exp to sdf-1
 355     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 356
 357 0.5.2-b2 - 4/30/200
 358     Continued code cleanup
 359
 360 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 361     Fixed a few MPI bugs
 362     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 363
 364 0.5.1 - 4/28/2000
 365     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 366     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 367
 368 0.5.0 - 4/27/2000
 369     First open source distribution for GNU/Linux
 370
 371 6/1999
 372   Converted to GNU/Linux
 373   added MPI support via LAM library
 374
 375 1983-84
 376   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 377