ChangeLog

   1 3.0alpha2 - Released 1/01/01
   2
   3         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
   4
   5         * ctsim: added generation of filter images
   6
   7         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
   8
   9         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  10
  11         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  12
  13         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  14         text files suitable for reading.
  15
  16         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  17         when performing properties of images.
  18
  19         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  20         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  21         fourier.cpp
  22
  23         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  24         image math functions to complex-valued math.
  25
  26         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  27
  28 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  29
  30         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  31         and column plots and comparison plots
  32
  33         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  34
  35         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  36
  37         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  38         files.
  39
  40         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  41         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  42         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  43
  44         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  45         imagefile and plotfile classes.
  46
  47         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  48         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  49         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  50         images.
  51
  52         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  53         images.
  54
  55         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  56         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  57
  58         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  59         math functions
  60
  61         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  62
  63         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  64         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  65         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  66
  67         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  68         class.
  69
  70         * sgp: Added linestyle settings
  71
  72 2.5.0 - 12/18/00
  73    First Microsoft Windows GUI version
  74    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  75    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  76         when manually compiling phantoms that vary during projection
  77         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  78    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  79    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  80    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  81    Fixed display of plotting in Projection views
  82    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  83    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  84         "namespace using std" statements
  85    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  86    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  87
  88 2.0.6 - 12/03/00
  89    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
  90    Updated README file
  91    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
  92    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
  93
  94 2.0.5 - 12/01/00
  95    Improved compilation on RedHat 7
  96    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
  97    Removed README.RedHat7
  98
  99 2.0.4 - 11/25/00
 100    Added documentation for --geometry setting
 101    Added README.RedHat7 document
 102
 103 2.0.3 - 11/20/00
 104    Fixed bug in generation of binary PGM files
 105    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 106    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 107
 108 2.0.2 - 11/8/00
 109    Additions to man pages (Ian Kay)
 110    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 111
 112 2.0.1 - 10/1/00
 113    Fixed syntax error in fftw configuration
 114    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 115
 116 2.0.0 - 9/7/00
 117    Version 2.0.0 released!
 118    ctsim: Added Window menu to Main frame
 119    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 120    Fixed obscure bug in sys_error
 121    Fixed compilation in mingw environment not present
 122    Fixed compilation in non-graphical environments
 123
 124 2.0.0-b12 - 9/4/00
 125    ctsim: Added animation of reconstruction
 126    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 127    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 128    ctsim: used setpriority to set lower priority
 129    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 130    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 131
 132 2.0.0-b11 - 9/1/00
 133    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 134    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 135    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 136    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 137    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 138    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 139    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 140    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 141    Separated reconstruction into Reconstructor class
 142    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 143    Added --enable-static to generate statically linked programs
 144
 145 2.0.0-b10 - 8/25/00
 146    ctsim: Added animation of projection collection processs
 147    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 148    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 149    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 150    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 151    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 152    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 153    Fixed bug in backprojection selection
 154
 155 2.0.0-b9 - 8/22/00
 156    Added RCS Id strings to executable files
 157    Added RPM Spec file for RPM package creation
 158    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 159    Fixed compilation for non-SGP architectures
 160    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 161    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 162         inverse_fourier construction of filters
 163    Added median to statistics and to auto-windowing
 164
 165 2.0.0-b8 - 8/1/00
 166    Added line color support to SGP
 167    Fixed lineAbs bug
 168
 169 2.0.0-b7 - 7/25/00
 170    Finished support for dmallocxx library
 171    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 172    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 173         G2 windows and well as WXWindows.
 174    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 175    Fixed row-plot bug in if-2
 176    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 177
 178 2.0.0-b6 - 7/22/00
 179    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 180         and projection files
 181    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 182         and reconstruction parameters dialogs
 183    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 184    Completely reorganized option processing in classes to improve
 185         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 186
 187 2.0.0-b5 - 7/17/00
 188    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 189    Started ctsim.tex document file
 190
 191 2.0.0-b4 - 7/13/00
 192    Fixed compiler warnings at -Wall level
 193    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 194    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 195    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 196
 197 2.0.0-b3 - 7/10/00
 198    Added highly optimized backprojection method idiff3
 199    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 200    Fixed image display in if2img using G2 library
 201    Added column-plot and row-plot options to if-2
 202    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 203    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 204         backprojection method. Currently, this technique is still under
 205         development and debugging
 206    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 207
 208 2.0.0-b2 - 7/07/00
 209    Cleaned up SignalFilter class
 210    Added zeropad option to pjrec
 211    Added zeropad options to html and cgi files
 212    Added fourier_table and rfttw filter methods
 213    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 214
 215 2.0.0-b1 - 7/05/00
 216    Updated trace level processing
 217    Added trace level to SignalFilter
 218    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 219
 220 1.9.9 - 7/04/00
 221    Fixed const issue with ImageFileArray
 222    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 223    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 224    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 225    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 226    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 227         between convolution, dft, & fft filtering
 228    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 229    Added support for FFTW library
 230
 231 1.9.8 - 6/27/2000
 232    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 233    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 234    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 235    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 236    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 237    Added signature tag and creation date/time to projection files
 238
 239 1.9.7 - 6/25/2000
 240    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 241         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 242         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 243    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 244    Rewrote ImageFile class
 245    Started support for dmallocxx library, not finished
 246    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 247    Updated ifinfo to show comparative statistics
 248    Added printLabels() to Array2dFile class
 249    Added printStatistics() to ImageFile class
 250
 251 1.9.6 - 6/22/2000
 252    Moved conversion filter name/id to Filter class
 253    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 254    Added MPI broadcasting of strings
 255
 256 1.9.5 - 6/21/2000
 257    Merged proj_reconstr into class Projections
 258    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 259    Code cleanup in projections.cpp
 260    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 261
 262 1.9.4 - 6/20/2000
 263    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 264    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 265    Converted filter and convolution to object-oriented code
 266    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 267    Optimized image file writing on little-endian architectures
 268    Updated README and INSTALL
 269
 270 1.9.3 - 6/19/2000
 271    Reorganized source files
 272    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 273
 274 1.9.2 - 6/18/2000
 275    Reorganized include files
 276    Fixed const pointers in strfuncs
 277
 278 1.9.1 - 6/16/2000
 279    Renamed directories, moved source files, combined source files
 280    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 281    and libctgraphics)
 282
 283 1.9.0 - 6/15/2000
 284    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 285    Renamed Raysums to Projections throughout files
 286    Renamed Detector to Scanner
 287    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 288
 289 0.6.1 - 6/12/2000
 290    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 291    Converted Detector to Object-Oriented
 292
 293 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 294    Improved Integer backprojection method
 295         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 296         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 297    Finished converting all C files to C++
 298    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 299    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 300
 301 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 302    Converted MPI data structures to C++ object
 303    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 304
 305 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 306    First C++ conversions
 307    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 308         - Now all data files are cross-platform compatible
 309    Converted from MPI to MPI++
 310    Converted backprojection to object-oriented
 311    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 312
 313 0.5.4 - 6/4/2000
 314    Simpilifed endian handling
 315
 316 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 317    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 318    Removed broken B-spline interpolation
 319    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 320    Added support for 16-bit PNG graphics
 321
 322 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 323    Added compile-time configuration of endian order
 324
 325 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 326    Modified the raysum file format to be platform independent
 327
 328 0.5.3 - 5/11/2000
 329    Added Microsoft VC compatibility
 330    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 331
 332 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 333    Continued conversion to ANSI C
 334    Removed old CRT routines
 335
 336 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 337    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 338    Continued code cleanup
 339
 340 0.5.2-b3 - 4/30/200
 341     More code cleanup with reorganizing libraries
 342     Added --log and --exp to sdf-1
 343     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 344
 345 0.5.2-b2 - 4/30/200
 346     Continued code cleanup
 347
 348 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 349     Fixed a few MPI bugs
 350     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 351
 352 0.5.1 - 4/28/2000
 353     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 354     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 355
 356 0.5.0 - 4/27/2000
 357     First open source distribution for GNU/Linux
 358
 359 6/1999
 360   Converted to GNU/Linux
 361   added MPI support via LAM library
 362
 363 1983-84
 364   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 365