ChangeLog

   1 3.0.1 - Released 2/19/01
   2
   3         * ctsim: Fixed dialog box for reconstruction so that
   4         rotation angle setting will stay fixed in-between use
   5         of the dialog box.
   6
   7         * syserror: Fixed display bug for trace messages
   8
   9         * ctsim: MSVC optimization bug work-around, compiler
  10         options changed.
  11
  12 3.0.0 - Released 2/19/01
  13
  14         * ctsim: Massive update/fix to online help and print manual.
  15
  16         * ctsim: Added context-sensitive help to dialog boxes
  17
  18         * ctsim: Reformated all dialog boxes, much nicer now.
  19
  20         * ctsim: Improved accelerator key handling
  21
  22         * global: Added Hanning filter.
  23
  24         * global: Improved default parameters to that all defaults give
  25         sensible output.
  26
  27 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
  28
  29         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  30         registry storage between executions.
  31
  32         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  33
  34         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  35
  36         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  37
  38         * ctsim: Added graphical About box
  39
  40         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  41
  42         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  43
  44         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  45
  46         * ctsim: Online help added!
  47
  48         * backprojector: Added cubic interpolation
  49
  50         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  51
  52         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  53         reconstruction dialogs.
  54
  55         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  56
  57         * global: Projection files are not compatible with previous version
  58         due to new scanner definitions.
  59
  60         * global: deleted concept of field-of-view and added
  61           view ratio and scan ratio concepts.
  62
  63         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  64
  65         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  66
  67         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  68
  69         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  70
  71
  72 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  73
  74         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  75         procsignal.cpp
  76
  77         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  78         bug in parsing command-line parameters.
  79
  80         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  81         plotfiles
  82
  83         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  84
  85         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  86
  87         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  88         for frequency/inverse-fourier filtering
  89
  90 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  91
  92         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  93
  94         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  95         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  96
  97         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  98         for math tips]
  99
 100         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
 101
 102         * ctsim: Added more analyze menuitems
 103
 104         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
 105         through this master shell. Has both command-line and interactive
 106         interface
 107
 108         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
 109
 110         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
 111
 112         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
 113
 114 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
 115
 116         * ctsim: Added plotting of histograms
 117
 118         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
 119
 120         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 121
 122 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 123
 124         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 125
 126         * ctsim: added generation of filter images
 127
 128         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 129
 130         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 131
 132         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 133
 134         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 135         text files suitable for reading.
 136
 137         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 138         when performing properties of images.
 139
 140         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 141         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 142         fourier.cpp
 143
 144         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 145         image math functions to complex-valued math.
 146
 147         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 148
 149 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 150
 151         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 152         and column plots and comparison plots
 153
 154         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 155
 156         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 157
 158         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 159         files.
 160
 161         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 162         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 163         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 164
 165         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 166         imagefile and plotfile classes.
 167
 168         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 169         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 170         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 171         images.
 172
 173         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 174         images.
 175
 176         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 177         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 178
 179         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 180         math functions
 181
 182         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 183
 184         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 185         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 186         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 187
 188         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 189         class.
 190
 191         * sgp: Added linestyle settings
 192
 193 2.5.0 - 12/18/00
 194    First Microsoft Windows GUI version
 195    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 196    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 197         when manually compiling phantoms that vary during projection
 198         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 199    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 200    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 201    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 202    Fixed display of plotting in Projection views
 203    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 204    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 205         "namespace using std" statements
 206    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 207    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 208
 209 2.0.6 - 12/03/00
 210    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 211    Updated README file
 212    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 213    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 214
 215 2.0.5 - 12/01/00
 216    Improved compilation on RedHat 7
 217    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 218    Removed README.RedHat7
 219
 220 2.0.4 - 11/25/00
 221    Added documentation for --geometry setting
 222    Added README.RedHat7 document
 223
 224 2.0.3 - 11/20/00
 225    Fixed bug in generation of binary PGM files
 226    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 227    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 228
 229 2.0.2 - 11/8/00
 230    Additions to man pages (Ian Kay)
 231    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 232
 233 2.0.1 - 10/1/00
 234    Fixed syntax error in fftw configuration
 235    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 236
 237 2.0.0 - 9/7/00
 238    Version 2.0.0 released!
 239    ctsim: Added Window menu to Main frame
 240    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 241    Fixed obscure bug in sys_error
 242    Fixed compilation in mingw environment not present
 243    Fixed compilation in non-graphical environments
 244
 245 2.0.0-b12 - 9/4/00
 246    ctsim: Added animation of reconstruction
 247    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 248    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 249    ctsim: used setpriority to set lower priority
 250    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 251    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 252
 253 2.0.0-b11 - 9/1/00
 254    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 255    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 256    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 257    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 258    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 259    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 260    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 261    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 262    Separated reconstruction into Reconstructor class
 263    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 264    Added --enable-static to generate statically linked programs
 265
 266 2.0.0-b10 - 8/25/00
 267    ctsim: Added animation of projection collection processs
 268    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 269    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 270    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 271    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 272    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 273    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 274    Fixed bug in backprojection selection
 275
 276 2.0.0-b9 - 8/22/00
 277    Added RCS Id strings to executable files
 278    Added RPM Spec file for RPM package creation
 279    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 280    Fixed compilation for non-SGP architectures
 281    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 282    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 283         inverse_fourier construction of filters
 284    Added median to statistics and to auto-windowing
 285
 286 2.0.0-b8 - 8/1/00
 287    Added line color support to SGP
 288    Fixed lineAbs bug
 289
 290 2.0.0-b7 - 7/25/00
 291    Finished support for dmallocxx library
 292    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 293    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 294         G2 windows and well as WXWindows.
 295    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 296    Fixed row-plot bug in if-2
 297    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 298
 299 2.0.0-b6 - 7/22/00
 300    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 301         and projection files
 302    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 303         and reconstruction parameters dialogs
 304    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 305    Completely reorganized option processing in classes to improve
 306         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 307
 308 2.0.0-b5 - 7/17/00
 309    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 310    Started ctsim.tex document file
 311
 312 2.0.0-b4 - 7/13/00
 313    Fixed compiler warnings at -Wall level
 314    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 315    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 316    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 317
 318 2.0.0-b3 - 7/10/00
 319    Added highly optimized backprojection method idiff3
 320    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 321    Fixed image display in if2img using G2 library
 322    Added column-plot and row-plot options to if-2
 323    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 324    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 325         backprojection method. Currently, this technique is still under
 326         development and debugging
 327    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 328
 329 2.0.0-b2 - 7/07/00
 330    Cleaned up SignalFilter class
 331    Added zeropad option to pjrec
 332    Added zeropad options to html and cgi files
 333    Added fourier_table and rfttw filter methods
 334    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 335
 336 2.0.0-b1 - 7/05/00
 337    Updated trace level processing
 338    Added trace level to SignalFilter
 339    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 340
 341 1.9.9 - 7/04/00
 342    Fixed const issue with ImageFileArray
 343    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 344    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 345    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 346    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 347    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 348         between convolution, dft, & fft filtering
 349    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 350    Added support for FFTW library
 351
 352 1.9.8 - 6/27/2000
 353    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 354    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 355    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 356    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 357    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 358    Added signature tag and creation date/time to projection files
 359
 360 1.9.7 - 6/25/2000
 361    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 362         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 363         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 364    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 365    Rewrote ImageFile class
 366    Started support for dmallocxx library, not finished
 367    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 368    Updated ifinfo to show comparative statistics
 369    Added printLabels() to Array2dFile class
 370    Added printStatistics() to ImageFile class
 371
 372 1.9.6 - 6/22/2000
 373    Moved conversion filter name/id to Filter class
 374    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 375    Added MPI broadcasting of strings
 376
 377 1.9.5 - 6/21/2000
 378    Merged proj_reconstr into class Projections
 379    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 380    Code cleanup in projections.cpp
 381    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 382
 383 1.9.4 - 6/20/2000
 384    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 385    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 386    Converted filter and convolution to object-oriented code
 387    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 388    Optimized image file writing on little-endian architectures
 389    Updated README and INSTALL
 390
 391 1.9.3 - 6/19/2000
 392    Reorganized source files
 393    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 394
 395 1.9.2 - 6/18/2000
 396    Reorganized include files
 397    Fixed const pointers in strfuncs
 398
 399 1.9.1 - 6/16/2000
 400    Renamed directories, moved source files, combined source files
 401    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 402    and libctgraphics)
 403
 404 1.9.0 - 6/15/2000
 405    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 406    Renamed Raysums to Projections throughout files
 407    Renamed Detector to Scanner
 408    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 409
 410 0.6.1 - 6/12/2000
 411    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 412    Converted Detector to Object-Oriented
 413
 414 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 415    Improved Integer backprojection method
 416         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 417         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 418    Finished converting all C files to C++
 419    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 420    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 421
 422 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 423    Converted MPI data structures to C++ object
 424    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 425
 426 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 427    First C++ conversions
 428    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 429         - Now all data files are cross-platform compatible
 430    Converted from MPI to MPI++
 431    Converted backprojection to object-oriented
 432    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 433
 434 0.5.4 - 6/4/2000
 435    Simpilifed endian handling
 436
 437 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 438    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 439    Removed broken B-spline interpolation
 440    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 441    Added support for 16-bit PNG graphics
 442
 443 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 444    Added compile-time configuration of endian order
 445
 446 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 447    Modified the raysum file format to be platform independent
 448
 449 0.5.3 - 5/11/2000
 450    Added Microsoft VC compatibility
 451    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 452
 453 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 454    Continued conversion to ANSI C
 455    Removed old CRT routines
 456
 457 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 458    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 459    Continued code cleanup
 460
 461 0.5.2-b3 - 4/30/200
 462     More code cleanup with reorganizing libraries
 463     Added --log and --exp to sdf-1
 464     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 465
 466 0.5.2-b2 - 4/30/200
 467     Continued code cleanup
 468
 469 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 470     Fixed a few MPI bugs
 471     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 472
 473 0.5.1 - 4/28/2000
 474     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 475     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 476
 477 0.5.0 - 4/27/2000
 478     First open source distribution for GNU/Linux
 479
 480 6/1999
 481   Converted to GNU/Linux
 482   added MPI support via LAM library
 483
 484 1983-84
 485   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 486