ChangeLog

   1 3.0.0alpha5 - Released
   2
   3         * ctsim: Changed default reconstruction filter generation
   4
   5         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines
   6
   7         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to plotfiles
   8
   9         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  10
  11         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  12
  13 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  14
  15         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  16
  17         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  18         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  19
  20         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  21         for math tips]
  22
  23         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  24
  25         * ctsim: Added more analyze menuitems
  26
  27         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  28         through this master shell. Has both command-line and interactive
  29         interface
  30
  31         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  32
  33         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  34
  35         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  36
  37 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  38
  39         * ctsim: Added plotting of histograms
  40
  41         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  42
  43         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  44
  45 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  46
  47         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  48
  49         * ctsim: added generation of filter images
  50
  51         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  52
  53         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  54
  55         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  56
  57         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  58         text files suitable for reading.
  59
  60         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  61         when performing properties of images.
  62
  63         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  64         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  65         fourier.cpp
  66
  67         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  68         image math functions to complex-valued math.
  69
  70         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  71
  72 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  73
  74         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  75         and column plots and comparison plots
  76
  77         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  78
  79         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  80
  81         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  82         files.
  83
  84         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  85         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  86         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  87
  88         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  89         imagefile and plotfile classes.
  90
  91         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  92         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  93         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  94         images.
  95
  96         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  97         images.
  98
  99         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 100         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 101
 102         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 103         math functions
 104
 105         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 106
 107         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 108         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 109         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 110
 111         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 112         class.
 113
 114         * sgp: Added linestyle settings
 115
 116 2.5.0 - 12/18/00
 117    First Microsoft Windows GUI version
 118    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 119    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 120         when manually compiling phantoms that vary during projection
 121         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 122    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 123    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 124    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 125    Fixed display of plotting in Projection views
 126    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 127    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 128         "namespace using std" statements
 129    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 130    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 131
 132 2.0.6 - 12/03/00
 133    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 134    Updated README file
 135    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 136    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 137
 138 2.0.5 - 12/01/00
 139    Improved compilation on RedHat 7
 140    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 141    Removed README.RedHat7
 142
 143 2.0.4 - 11/25/00
 144    Added documentation for --geometry setting
 145    Added README.RedHat7 document
 146
 147 2.0.3 - 11/20/00
 148    Fixed bug in generation of binary PGM files
 149    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 150    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 151
 152 2.0.2 - 11/8/00
 153    Additions to man pages (Ian Kay)
 154    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 155
 156 2.0.1 - 10/1/00
 157    Fixed syntax error in fftw configuration
 158    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 159
 160 2.0.0 - 9/7/00
 161    Version 2.0.0 released!
 162    ctsim: Added Window menu to Main frame
 163    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 164    Fixed obscure bug in sys_error
 165    Fixed compilation in mingw environment not present
 166    Fixed compilation in non-graphical environments
 167
 168 2.0.0-b12 - 9/4/00
 169    ctsim: Added animation of reconstruction
 170    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 171    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 172    ctsim: used setpriority to set lower priority
 173    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 174    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 175
 176 2.0.0-b11 - 9/1/00
 177    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 178    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 179    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 180    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 181    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 182    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 183    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 184    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 185    Separated reconstruction into Reconstructor class
 186    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 187    Added --enable-static to generate statically linked programs
 188
 189 2.0.0-b10 - 8/25/00
 190    ctsim: Added animation of projection collection processs
 191    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 192    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 193    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 194    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 195    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 196    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 197    Fixed bug in backprojection selection
 198
 199 2.0.0-b9 - 8/22/00
 200    Added RCS Id strings to executable files
 201    Added RPM Spec file for RPM package creation
 202    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 203    Fixed compilation for non-SGP architectures
 204    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 205    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 206         inverse_fourier construction of filters
 207    Added median to statistics and to auto-windowing
 208
 209 2.0.0-b8 - 8/1/00
 210    Added line color support to SGP
 211    Fixed lineAbs bug
 212
 213 2.0.0-b7 - 7/25/00
 214    Finished support for dmallocxx library
 215    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 216    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 217         G2 windows and well as WXWindows.
 218    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 219    Fixed row-plot bug in if-2
 220    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 221
 222 2.0.0-b6 - 7/22/00
 223    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 224         and projection files
 225    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 226         and reconstruction parameters dialogs
 227    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 228    Completely reorganized option processing in classes to improve
 229         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 230
 231 2.0.0-b5 - 7/17/00
 232    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 233    Started ctsim.tex document file
 234
 235 2.0.0-b4 - 7/13/00
 236    Fixed compiler warnings at -Wall level
 237    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 238    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 239    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 240
 241 2.0.0-b3 - 7/10/00
 242    Added highly optimized backprojection method idiff3
 243    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 244    Fixed image display in if2img using G2 library
 245    Added column-plot and row-plot options to if-2
 246    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 247    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 248         backprojection method. Currently, this technique is still under
 249         development and debugging
 250    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 251
 252 2.0.0-b2 - 7/07/00
 253    Cleaned up SignalFilter class
 254    Added zeropad option to pjrec
 255    Added zeropad options to html and cgi files
 256    Added fourier_table and rfttw filter methods
 257    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 258
 259 2.0.0-b1 - 7/05/00
 260    Updated trace level processing
 261    Added trace level to SignalFilter
 262    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 263
 264 1.9.9 - 7/04/00
 265    Fixed const issue with ImageFileArray
 266    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 267    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 268    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 269    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 270    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 271         between convolution, dft, & fft filtering
 272    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 273    Added support for FFTW library
 274
 275 1.9.8 - 6/27/2000
 276    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 277    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 278    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 279    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 280    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 281    Added signature tag and creation date/time to projection files
 282
 283 1.9.7 - 6/25/2000
 284    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 285         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 286         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 287    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 288    Rewrote ImageFile class
 289    Started support for dmallocxx library, not finished
 290    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 291    Updated ifinfo to show comparative statistics
 292    Added printLabels() to Array2dFile class
 293    Added printStatistics() to ImageFile class
 294
 295 1.9.6 - 6/22/2000
 296    Moved conversion filter name/id to Filter class
 297    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 298    Added MPI broadcasting of strings
 299
 300 1.9.5 - 6/21/2000
 301    Merged proj_reconstr into class Projections
 302    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 303    Code cleanup in projections.cpp
 304    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 305
 306 1.9.4 - 6/20/2000
 307    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 308    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 309    Converted filter and convolution to object-oriented code
 310    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 311    Optimized image file writing on little-endian architectures
 312    Updated README and INSTALL
 313
 314 1.9.3 - 6/19/2000
 315    Reorganized source files
 316    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 317
 318 1.9.2 - 6/18/2000
 319    Reorganized include files
 320    Fixed const pointers in strfuncs
 321
 322 1.9.1 - 6/16/2000
 323    Renamed directories, moved source files, combined source files
 324    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 325    and libctgraphics)
 326
 327 1.9.0 - 6/15/2000
 328    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 329    Renamed Raysums to Projections throughout files
 330    Renamed Detector to Scanner
 331    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 332
 333 0.6.1 - 6/12/2000
 334    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 335    Converted Detector to Object-Oriented
 336
 337 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 338    Improved Integer backprojection method
 339         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 340         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 341    Finished converting all C files to C++
 342    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 343    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 344
 345 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 346    Converted MPI data structures to C++ object
 347    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 348
 349 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 350    First C++ conversions
 351    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 352         - Now all data files are cross-platform compatible
 353    Converted from MPI to MPI++
 354    Converted backprojection to object-oriented
 355    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 356
 357 0.5.4 - 6/4/2000
 358    Simpilifed endian handling
 359
 360 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 361    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 362    Removed broken B-spline interpolation
 363    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 364    Added support for 16-bit PNG graphics
 365
 366 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 367    Added compile-time configuration of endian order
 368
 369 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 370    Modified the raysum file format to be platform independent
 371
 372 0.5.3 - 5/11/2000
 373    Added Microsoft VC compatibility
 374    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 375
 376 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 377    Continued conversion to ANSI C
 378    Removed old CRT routines
 379
 380 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 381    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 382    Continued code cleanup
 383
 384 0.5.2-b3 - 4/30/200
 385     More code cleanup with reorganizing libraries
 386     Added --log and --exp to sdf-1
 387     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 388
 389 0.5.2-b2 - 4/30/200
 390     Continued code cleanup
 391
 392 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 393     Fixed a few MPI bugs
 394     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 395
 396 0.5.1 - 4/28/2000
 397     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 398     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 399
 400 0.5.0 - 4/27/2000
 401     First open source distribution for GNU/Linux
 402
 403 6/1999
 404   Converted to GNU/Linux
 405   added MPI support via LAM library
 406
 407 1983-84
 408   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 409