ChangeLog

   1 3.0.0alpha5 - Released
   2
   3         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines
   4
   5         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
   6
   7         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
   8
   9 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  10
  11         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  12
  13         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  14         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  15
  16         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  17         for math tips]
  18
  19         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  20
  21         * ctsim: Added more analyze menuitems
  22
  23         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  24         through this master shell. Has both command-line and interactive
  25         interface
  26
  27         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  28
  29         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  30
  31         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  32
  33 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  34
  35         * ctsim: Added plotting of histograms
  36
  37         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  38
  39         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  40
  41 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  42
  43         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  44
  45         * ctsim: added generation of filter images
  46
  47         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  48
  49         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  50
  51         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  52
  53         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  54         text files suitable for reading.
  55
  56         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  57         when performing properties of images.
  58
  59         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  60         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  61         fourier.cpp
  62
  63         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  64         image math functions to complex-valued math.
  65
  66         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  67
  68 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  69
  70         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  71         and column plots and comparison plots
  72
  73         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  74
  75         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  76
  77         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  78         files.
  79
  80         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  81         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  82         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  83
  84         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  85         imagefile and plotfile classes.
  86
  87         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  88         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  89         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  90         images.
  91
  92         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  93         images.
  94
  95         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  96         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  97
  98         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  99         math functions
 100
 101         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 102
 103         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 104         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 105         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 106
 107         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 108         class.
 109
 110         * sgp: Added linestyle settings
 111
 112 2.5.0 - 12/18/00
 113    First Microsoft Windows GUI version
 114    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 115    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 116         when manually compiling phantoms that vary during projection
 117         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 118    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 119    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 120    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 121    Fixed display of plotting in Projection views
 122    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 123    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 124         "namespace using std" statements
 125    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 126    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 127
 128 2.0.6 - 12/03/00
 129    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 130    Updated README file
 131    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 132    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 133
 134 2.0.5 - 12/01/00
 135    Improved compilation on RedHat 7
 136    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 137    Removed README.RedHat7
 138
 139 2.0.4 - 11/25/00
 140    Added documentation for --geometry setting
 141    Added README.RedHat7 document
 142
 143 2.0.3 - 11/20/00
 144    Fixed bug in generation of binary PGM files
 145    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 146    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 147
 148 2.0.2 - 11/8/00
 149    Additions to man pages (Ian Kay)
 150    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 151
 152 2.0.1 - 10/1/00
 153    Fixed syntax error in fftw configuration
 154    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 155
 156 2.0.0 - 9/7/00
 157    Version 2.0.0 released!
 158    ctsim: Added Window menu to Main frame
 159    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 160    Fixed obscure bug in sys_error
 161    Fixed compilation in mingw environment not present
 162    Fixed compilation in non-graphical environments
 163
 164 2.0.0-b12 - 9/4/00
 165    ctsim: Added animation of reconstruction
 166    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 167    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 168    ctsim: used setpriority to set lower priority
 169    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 170    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 171
 172 2.0.0-b11 - 9/1/00
 173    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 174    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 175    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 176    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 177    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 178    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 179    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 180    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 181    Separated reconstruction into Reconstructor class
 182    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 183    Added --enable-static to generate statically linked programs
 184
 185 2.0.0-b10 - 8/25/00
 186    ctsim: Added animation of projection collection processs
 187    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 188    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 189    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 190    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 191    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 192    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 193    Fixed bug in backprojection selection
 194
 195 2.0.0-b9 - 8/22/00
 196    Added RCS Id strings to executable files
 197    Added RPM Spec file for RPM package creation
 198    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 199    Fixed compilation for non-SGP architectures
 200    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 201    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 202         inverse_fourier construction of filters
 203    Added median to statistics and to auto-windowing
 204
 205 2.0.0-b8 - 8/1/00
 206    Added line color support to SGP
 207    Fixed lineAbs bug
 208
 209 2.0.0-b7 - 7/25/00
 210    Finished support for dmallocxx library
 211    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 212    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 213         G2 windows and well as WXWindows.
 214    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 215    Fixed row-plot bug in if-2
 216    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 217
 218 2.0.0-b6 - 7/22/00
 219    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 220         and projection files
 221    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 222         and reconstruction parameters dialogs
 223    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 224    Completely reorganized option processing in classes to improve
 225         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 226
 227 2.0.0-b5 - 7/17/00
 228    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 229    Started ctsim.tex document file
 230
 231 2.0.0-b4 - 7/13/00
 232    Fixed compiler warnings at -Wall level
 233    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 234    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 235    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 236
 237 2.0.0-b3 - 7/10/00
 238    Added highly optimized backprojection method idiff3
 239    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 240    Fixed image display in if2img using G2 library
 241    Added column-plot and row-plot options to if-2
 242    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 243    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 244         backprojection method. Currently, this technique is still under
 245         development and debugging
 246    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 247
 248 2.0.0-b2 - 7/07/00
 249    Cleaned up SignalFilter class
 250    Added zeropad option to pjrec
 251    Added zeropad options to html and cgi files
 252    Added fourier_table and rfttw filter methods
 253    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 254
 255 2.0.0-b1 - 7/05/00
 256    Updated trace level processing
 257    Added trace level to SignalFilter
 258    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 259
 260 1.9.9 - 7/04/00
 261    Fixed const issue with ImageFileArray
 262    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 263    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 264    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 265    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 266    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 267         between convolution, dft, & fft filtering
 268    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 269    Added support for FFTW library
 270
 271 1.9.8 - 6/27/2000
 272    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 273    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 274    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 275    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 276    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 277    Added signature tag and creation date/time to projection files
 278
 279 1.9.7 - 6/25/2000
 280    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 281         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 282         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 283    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 284    Rewrote ImageFile class
 285    Started support for dmallocxx library, not finished
 286    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 287    Updated ifinfo to show comparative statistics
 288    Added printLabels() to Array2dFile class
 289    Added printStatistics() to ImageFile class
 290
 291 1.9.6 - 6/22/2000
 292    Moved conversion filter name/id to Filter class
 293    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 294    Added MPI broadcasting of strings
 295
 296 1.9.5 - 6/21/2000
 297    Merged proj_reconstr into class Projections
 298    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 299    Code cleanup in projections.cpp
 300    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 301
 302 1.9.4 - 6/20/2000
 303    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 304    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 305    Converted filter and convolution to object-oriented code
 306    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 307    Optimized image file writing on little-endian architectures
 308    Updated README and INSTALL
 309
 310 1.9.3 - 6/19/2000
 311    Reorganized source files
 312    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 313
 314 1.9.2 - 6/18/2000
 315    Reorganized include files
 316    Fixed const pointers in strfuncs
 317
 318 1.9.1 - 6/16/2000
 319    Renamed directories, moved source files, combined source files
 320    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 321    and libctgraphics)
 322
 323 1.9.0 - 6/15/2000
 324    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 325    Renamed Raysums to Projections throughout files
 326    Renamed Detector to Scanner
 327    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 328
 329 0.6.1 - 6/12/2000
 330    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 331    Converted Detector to Object-Oriented
 332
 333 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 334    Improved Integer backprojection method
 335         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 336         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 337    Finished converting all C files to C++
 338    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 339    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 340
 341 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 342    Converted MPI data structures to C++ object
 343    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 344
 345 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 346    First C++ conversions
 347    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 348         - Now all data files are cross-platform compatible
 349    Converted from MPI to MPI++
 350    Converted backprojection to object-oriented
 351    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 352
 353 0.5.4 - 6/4/2000
 354    Simpilifed endian handling
 355
 356 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 357    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 358    Removed broken B-spline interpolation
 359    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 360    Added support for 16-bit PNG graphics
 361
 362 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 363    Added compile-time configuration of endian order
 364
 365 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 366    Modified the raysum file format to be platform independent
 367
 368 0.5.3 - 5/11/2000
 369    Added Microsoft VC compatibility
 370    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 371
 372 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 373    Continued conversion to ANSI C
 374    Removed old CRT routines
 375
 376 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 377    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 378    Continued code cleanup
 379
 380 0.5.2-b3 - 4/30/200
 381     More code cleanup with reorganizing libraries
 382     Added --log and --exp to sdf-1
 383     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 384
 385 0.5.2-b2 - 4/30/200
 386     Continued code cleanup
 387
 388 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 389     Fixed a few MPI bugs
 390     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 391
 392 0.5.1 - 4/28/2000
 393     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 394     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 395
 396 0.5.0 - 4/27/2000
 397     First open source distribution for GNU/Linux
 398
 399 6/1999
 400   Converted to GNU/Linux
 401   added MPI support via LAM library
 402
 403 1983-84
 404   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 405