ChangeLog

   1 3.0.0 - Release 2/19/01
   2
   3         * ctsim: Massive update/fix to online help and print manual.
   4
   5         * ctsim: Added context-sensitive help to dialog boxes
   6
   7         * ctsim: Reformated all dialog boxes, much nicer now.
   8
   9         * ctsim: Improved accelerator key handling
  10
  11         * global: Added Hanning filter.
  12
  13         * global: Improved default parameters to that all defaults give
  14         sensible output.
  15
  16 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
  17
  18         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  19         registry storage between executions.
  20
  21         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  22
  23         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  24
  25         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  26
  27         * ctsim: Added graphical About box
  28
  29         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  30
  31         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  32
  33         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  34
  35         * ctsim: Online help added!
  36
  37         * backprojector: Added cubic interpolation
  38
  39         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  40
  41         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  42         reconstruction dialogs.
  43
  44         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  45
  46         * global: Projection files are not compatible with previous version
  47         due to new scanner definitions.
  48
  49         * global: deleted concept of field-of-view and added
  50           view ratio and scan ratio concepts.
  51
  52         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  53
  54         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  55
  56         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  57
  58         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  59
  60
  61 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  62
  63         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  64         procsignal.cpp
  65
  66         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  67         bug in parsing command-line parameters.
  68
  69         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  70         plotfiles
  71
  72         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  73
  74         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  75
  76         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  77         for frequency/inverse-fourier filtering
  78
  79 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  80
  81         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  82
  83         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  84         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  85
  86         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  87         for math tips]
  88
  89         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  90
  91         * ctsim: Added more analyze menuitems
  92
  93         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  94         through this master shell. Has both command-line and interactive
  95         interface
  96
  97         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  98
  99         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
 100
 101         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
 102
 103 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
 104
 105         * ctsim: Added plotting of histograms
 106
 107         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
 108
 109         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 110
 111 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 112
 113         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 114
 115         * ctsim: added generation of filter images
 116
 117         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 118
 119         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 120
 121         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 122
 123         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 124         text files suitable for reading.
 125
 126         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 127         when performing properties of images.
 128
 129         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 130         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 131         fourier.cpp
 132
 133         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 134         image math functions to complex-valued math.
 135
 136         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 137
 138 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 139
 140         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 141         and column plots and comparison plots
 142
 143         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 144
 145         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 146
 147         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 148         files.
 149
 150         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 151         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 152         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 153
 154         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 155         imagefile and plotfile classes.
 156
 157         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 158         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 159         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 160         images.
 161
 162         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 163         images.
 164
 165         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 166         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 167
 168         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 169         math functions
 170
 171         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 172
 173         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 174         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 175         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 176
 177         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 178         class.
 179
 180         * sgp: Added linestyle settings
 181
 182 2.5.0 - 12/18/00
 183    First Microsoft Windows GUI version
 184    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 185    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 186         when manually compiling phantoms that vary during projection
 187         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 188    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 189    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 190    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 191    Fixed display of plotting in Projection views
 192    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 193    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 194         "namespace using std" statements
 195    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 196    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 197
 198 2.0.6 - 12/03/00
 199    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 200    Updated README file
 201    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 202    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 203
 204 2.0.5 - 12/01/00
 205    Improved compilation on RedHat 7
 206    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 207    Removed README.RedHat7
 208
 209 2.0.4 - 11/25/00
 210    Added documentation for --geometry setting
 211    Added README.RedHat7 document
 212
 213 2.0.3 - 11/20/00
 214    Fixed bug in generation of binary PGM files
 215    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 216    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 217
 218 2.0.2 - 11/8/00
 219    Additions to man pages (Ian Kay)
 220    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 221
 222 2.0.1 - 10/1/00
 223    Fixed syntax error in fftw configuration
 224    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 225
 226 2.0.0 - 9/7/00
 227    Version 2.0.0 released!
 228    ctsim: Added Window menu to Main frame
 229    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 230    Fixed obscure bug in sys_error
 231    Fixed compilation in mingw environment not present
 232    Fixed compilation in non-graphical environments
 233
 234 2.0.0-b12 - 9/4/00
 235    ctsim: Added animation of reconstruction
 236    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 237    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 238    ctsim: used setpriority to set lower priority
 239    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 240    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 241
 242 2.0.0-b11 - 9/1/00
 243    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 244    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 245    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 246    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 247    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 248    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 249    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 250    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 251    Separated reconstruction into Reconstructor class
 252    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 253    Added --enable-static to generate statically linked programs
 254
 255 2.0.0-b10 - 8/25/00
 256    ctsim: Added animation of projection collection processs
 257    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 258    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 259    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 260    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 261    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 262    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 263    Fixed bug in backprojection selection
 264
 265 2.0.0-b9 - 8/22/00
 266    Added RCS Id strings to executable files
 267    Added RPM Spec file for RPM package creation
 268    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 269    Fixed compilation for non-SGP architectures
 270    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 271    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 272         inverse_fourier construction of filters
 273    Added median to statistics and to auto-windowing
 274
 275 2.0.0-b8 - 8/1/00
 276    Added line color support to SGP
 277    Fixed lineAbs bug
 278
 279 2.0.0-b7 - 7/25/00
 280    Finished support for dmallocxx library
 281    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 282    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 283         G2 windows and well as WXWindows.
 284    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 285    Fixed row-plot bug in if-2
 286    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 287
 288 2.0.0-b6 - 7/22/00
 289    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 290         and projection files
 291    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 292         and reconstruction parameters dialogs
 293    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 294    Completely reorganized option processing in classes to improve
 295         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 296
 297 2.0.0-b5 - 7/17/00
 298    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 299    Started ctsim.tex document file
 300
 301 2.0.0-b4 - 7/13/00
 302    Fixed compiler warnings at -Wall level
 303    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 304    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 305    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 306
 307 2.0.0-b3 - 7/10/00
 308    Added highly optimized backprojection method idiff3
 309    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 310    Fixed image display in if2img using G2 library
 311    Added column-plot and row-plot options to if-2
 312    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 313    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 314         backprojection method. Currently, this technique is still under
 315         development and debugging
 316    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 317
 318 2.0.0-b2 - 7/07/00
 319    Cleaned up SignalFilter class
 320    Added zeropad option to pjrec
 321    Added zeropad options to html and cgi files
 322    Added fourier_table and rfttw filter methods
 323    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 324
 325 2.0.0-b1 - 7/05/00
 326    Updated trace level processing
 327    Added trace level to SignalFilter
 328    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 329
 330 1.9.9 - 7/04/00
 331    Fixed const issue with ImageFileArray
 332    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 333    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 334    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 335    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 336    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 337         between convolution, dft, & fft filtering
 338    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 339    Added support for FFTW library
 340
 341 1.9.8 - 6/27/2000
 342    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 343    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 344    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 345    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 346    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 347    Added signature tag and creation date/time to projection files
 348
 349 1.9.7 - 6/25/2000
 350    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 351         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 352         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 353    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 354    Rewrote ImageFile class
 355    Started support for dmallocxx library, not finished
 356    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 357    Updated ifinfo to show comparative statistics
 358    Added printLabels() to Array2dFile class
 359    Added printStatistics() to ImageFile class
 360
 361 1.9.6 - 6/22/2000
 362    Moved conversion filter name/id to Filter class
 363    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 364    Added MPI broadcasting of strings
 365
 366 1.9.5 - 6/21/2000
 367    Merged proj_reconstr into class Projections
 368    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 369    Code cleanup in projections.cpp
 370    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 371
 372 1.9.4 - 6/20/2000
 373    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 374    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 375    Converted filter and convolution to object-oriented code
 376    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 377    Optimized image file writing on little-endian architectures
 378    Updated README and INSTALL
 379
 380 1.9.3 - 6/19/2000
 381    Reorganized source files
 382    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 383
 384 1.9.2 - 6/18/2000
 385    Reorganized include files
 386    Fixed const pointers in strfuncs
 387
 388 1.9.1 - 6/16/2000
 389    Renamed directories, moved source files, combined source files
 390    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 391    and libctgraphics)
 392
 393 1.9.0 - 6/15/2000
 394    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 395    Renamed Raysums to Projections throughout files
 396    Renamed Detector to Scanner
 397    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 398
 399 0.6.1 - 6/12/2000
 400    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 401    Converted Detector to Object-Oriented
 402
 403 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 404    Improved Integer backprojection method
 405         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 406         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 407    Finished converting all C files to C++
 408    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 409    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 410
 411 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 412    Converted MPI data structures to C++ object
 413    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 414
 415 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 416    First C++ conversions
 417    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 418         - Now all data files are cross-platform compatible
 419    Converted from MPI to MPI++
 420    Converted backprojection to object-oriented
 421    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 422
 423 0.5.4 - 6/4/2000
 424    Simpilifed endian handling
 425
 426 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 427    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 428    Removed broken B-spline interpolation
 429    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 430    Added support for 16-bit PNG graphics
 431
 432 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 433    Added compile-time configuration of endian order
 434
 435 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 436    Modified the raysum file format to be platform independent
 437
 438 0.5.3 - 5/11/2000
 439    Added Microsoft VC compatibility
 440    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 441
 442 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 443    Continued conversion to ANSI C
 444    Removed old CRT routines
 445
 446 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 447    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 448    Continued code cleanup
 449
 450 0.5.2-b3 - 4/30/200
 451     More code cleanup with reorganizing libraries
 452     Added --log and --exp to sdf-1
 453     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 454
 455 0.5.2-b2 - 4/30/200
 456     Continued code cleanup
 457
 458 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 459     Fixed a few MPI bugs
 460     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 461
 462 0.5.1 - 4/28/2000
 463     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 464     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 465
 466 0.5.0 - 4/27/2000
 467     First open source distribution for GNU/Linux
 468
 469 6/1999
 470   Converted to GNU/Linux
 471   added MPI support via LAM library
 472
 473 1983-84
 474   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 475