ChangeLog

   1 3.0.0alpha5 - Released
   2
   3         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
   4         procsignal.cpp
   5
   6         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines
   7
   8         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
   9         plotfiles
  10
  11         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  12
  13         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  14
  15         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  16         for frequency/inverse-fourier filtering
  17
  18 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  19
  20         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  21
  22         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  23         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  24
  25         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  26         for math tips]
  27
  28         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  29
  30         * ctsim: Added more analyze menuitems
  31
  32         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  33         through this master shell. Has both command-line and interactive
  34         interface
  35
  36         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  37
  38         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  39
  40         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  41
  42 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  43
  44         * ctsim: Added plotting of histograms
  45
  46         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  47
  48         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  49
  50 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  51
  52         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  53
  54         * ctsim: added generation of filter images
  55
  56         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  57
  58         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  59
  60         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  61
  62         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  63         text files suitable for reading.
  64
  65         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  66         when performing properties of images.
  67
  68         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  69         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  70         fourier.cpp
  71
  72         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  73         image math functions to complex-valued math.
  74
  75         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  76
  77 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  78
  79         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  80         and column plots and comparison plots
  81
  82         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  83
  84         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  85
  86         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  87         files.
  88
  89         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  90         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  91         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  92
  93         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  94         imagefile and plotfile classes.
  95
  96         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  97         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  98         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  99         images.
 100
 101         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 102         images.
 103
 104         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 105         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 106
 107         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 108         math functions
 109
 110         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 111
 112         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 113         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 114         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 115
 116         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 117         class.
 118
 119         * sgp: Added linestyle settings
 120
 121 2.5.0 - 12/18/00
 122    First Microsoft Windows GUI version
 123    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 124    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 125         when manually compiling phantoms that vary during projection
 126         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 127    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 128    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 129    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 130    Fixed display of plotting in Projection views
 131    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 132    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 133         "namespace using std" statements
 134    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 135    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 136
 137 2.0.6 - 12/03/00
 138    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 139    Updated README file
 140    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 141    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 142
 143 2.0.5 - 12/01/00
 144    Improved compilation on RedHat 7
 145    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 146    Removed README.RedHat7
 147
 148 2.0.4 - 11/25/00
 149    Added documentation for --geometry setting
 150    Added README.RedHat7 document
 151
 152 2.0.3 - 11/20/00
 153    Fixed bug in generation of binary PGM files
 154    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 155    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 156
 157 2.0.2 - 11/8/00
 158    Additions to man pages (Ian Kay)
 159    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 160
 161 2.0.1 - 10/1/00
 162    Fixed syntax error in fftw configuration
 163    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 164
 165 2.0.0 - 9/7/00
 166    Version 2.0.0 released!
 167    ctsim: Added Window menu to Main frame
 168    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 169    Fixed obscure bug in sys_error
 170    Fixed compilation in mingw environment not present
 171    Fixed compilation in non-graphical environments
 172
 173 2.0.0-b12 - 9/4/00
 174    ctsim: Added animation of reconstruction
 175    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 176    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 177    ctsim: used setpriority to set lower priority
 178    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 179    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 180
 181 2.0.0-b11 - 9/1/00
 182    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 183    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 184    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 185    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 186    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 187    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 188    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 189    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 190    Separated reconstruction into Reconstructor class
 191    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 192    Added --enable-static to generate statically linked programs
 193
 194 2.0.0-b10 - 8/25/00
 195    ctsim: Added animation of projection collection processs
 196    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 197    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 198    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 199    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 200    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 201    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 202    Fixed bug in backprojection selection
 203
 204 2.0.0-b9 - 8/22/00
 205    Added RCS Id strings to executable files
 206    Added RPM Spec file for RPM package creation
 207    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 208    Fixed compilation for non-SGP architectures
 209    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 210    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 211         inverse_fourier construction of filters
 212    Added median to statistics and to auto-windowing
 213
 214 2.0.0-b8 - 8/1/00
 215    Added line color support to SGP
 216    Fixed lineAbs bug
 217
 218 2.0.0-b7 - 7/25/00
 219    Finished support for dmallocxx library
 220    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 221    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 222         G2 windows and well as WXWindows.
 223    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 224    Fixed row-plot bug in if-2
 225    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 226
 227 2.0.0-b6 - 7/22/00
 228    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 229         and projection files
 230    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 231         and reconstruction parameters dialogs
 232    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 233    Completely reorganized option processing in classes to improve
 234         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 235
 236 2.0.0-b5 - 7/17/00
 237    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 238    Started ctsim.tex document file
 239
 240 2.0.0-b4 - 7/13/00
 241    Fixed compiler warnings at -Wall level
 242    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 243    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 244    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 245
 246 2.0.0-b3 - 7/10/00
 247    Added highly optimized backprojection method idiff3
 248    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 249    Fixed image display in if2img using G2 library
 250    Added column-plot and row-plot options to if-2
 251    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 252    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 253         backprojection method. Currently, this technique is still under
 254         development and debugging
 255    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 256
 257 2.0.0-b2 - 7/07/00
 258    Cleaned up SignalFilter class
 259    Added zeropad option to pjrec
 260    Added zeropad options to html and cgi files
 261    Added fourier_table and rfttw filter methods
 262    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 263
 264 2.0.0-b1 - 7/05/00
 265    Updated trace level processing
 266    Added trace level to SignalFilter
 267    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 268
 269 1.9.9 - 7/04/00
 270    Fixed const issue with ImageFileArray
 271    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 272    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 273    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 274    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 275    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 276         between convolution, dft, & fft filtering
 277    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 278    Added support for FFTW library
 279
 280 1.9.8 - 6/27/2000
 281    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 282    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 283    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 284    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 285    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 286    Added signature tag and creation date/time to projection files
 287
 288 1.9.7 - 6/25/2000
 289    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 290         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 291         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 292    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 293    Rewrote ImageFile class
 294    Started support for dmallocxx library, not finished
 295    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 296    Updated ifinfo to show comparative statistics
 297    Added printLabels() to Array2dFile class
 298    Added printStatistics() to ImageFile class
 299
 300 1.9.6 - 6/22/2000
 301    Moved conversion filter name/id to Filter class
 302    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 303    Added MPI broadcasting of strings
 304
 305 1.9.5 - 6/21/2000
 306    Merged proj_reconstr into class Projections
 307    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 308    Code cleanup in projections.cpp
 309    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 310
 311 1.9.4 - 6/20/2000
 312    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 313    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 314    Converted filter and convolution to object-oriented code
 315    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 316    Optimized image file writing on little-endian architectures
 317    Updated README and INSTALL
 318
 319 1.9.3 - 6/19/2000
 320    Reorganized source files
 321    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 322
 323 1.9.2 - 6/18/2000
 324    Reorganized include files
 325    Fixed const pointers in strfuncs
 326
 327 1.9.1 - 6/16/2000
 328    Renamed directories, moved source files, combined source files
 329    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 330    and libctgraphics)
 331
 332 1.9.0 - 6/15/2000
 333    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 334    Renamed Raysums to Projections throughout files
 335    Renamed Detector to Scanner
 336    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 337
 338 0.6.1 - 6/12/2000
 339    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 340    Converted Detector to Object-Oriented
 341
 342 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 343    Improved Integer backprojection method
 344         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 345         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 346    Finished converting all C files to C++
 347    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 348    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 349
 350 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 351    Converted MPI data structures to C++ object
 352    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 353
 354 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 355    First C++ conversions
 356    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 357         - Now all data files are cross-platform compatible
 358    Converted from MPI to MPI++
 359    Converted backprojection to object-oriented
 360    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 361
 362 0.5.4 - 6/4/2000
 363    Simpilifed endian handling
 364
 365 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 366    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 367    Removed broken B-spline interpolation
 368    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 369    Added support for 16-bit PNG graphics
 370
 371 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 372    Added compile-time configuration of endian order
 373
 374 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 375    Modified the raysum file format to be platform independent
 376
 377 0.5.3 - 5/11/2000
 378    Added Microsoft VC compatibility
 379    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 380
 381 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 382    Continued conversion to ANSI C
 383    Removed old CRT routines
 384
 385 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 386    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 387    Continued code cleanup
 388
 389 0.5.2-b3 - 4/30/200
 390     More code cleanup with reorganizing libraries
 391     Added --log and --exp to sdf-1
 392     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 393
 394 0.5.2-b2 - 4/30/200
 395     Continued code cleanup
 396
 397 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 398     Fixed a few MPI bugs
 399     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 400
 401 0.5.1 - 4/28/2000
 402     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 403     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 404
 405 0.5.0 - 4/27/2000
 406     First open source distribution for GNU/Linux
 407
 408 6/1999
 409   Converted to GNU/Linux
 410   added MPI support via LAM library
 411
 412 1983-84
 413   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 414