ChangeLog

   1 3.1.0 - Released 2//01
   2
   3         * ctsim: Added tips to be displayed at startup and via the help menu.
   4
   5         * ctsim: Added center-detector concept. Allow for detector array
   6         to be any arbitrary distance from center of scanner. As a result,
   7         projection files are not incompatible with previous version of
   8         CTSim.
   9
  10         * ctsim: Added generic threaded tasks and background manager for
  11         background processing as well as taking advantage of multiple-CPU's
  12         on SMP systems.
  13
  14         * ctsim: Added PPM/PGM and PNG file import to imagefile.
  15
  16         * ctsim: Added background and SMP processing for reconstructions.
  17
  18         * ctsim: Added background and SMP processing for scanning.
  19
  20         * ctsim: Added background and SMP processing for rasterization.
  21
  22         * ctsim: Added "Verbose Logging", "Startup Tips", and
  23         "Background processes" options  to Preferences dialog.
  24
  25         * ctsim: Added accelerator key for File-Properties
  26
  27         * views.cpp: Added out of memory checks to display for huge
  28         image and projection files.
  29
  30         * distribution: fixed problem with documentation files not
  31         being included with the distribution [Reported by Ian Kay].
  32
  33 3.0.3 - Released 2/20/01
  34
  35         * ctsim: Fixed core dump on Linux with OpenGL
  36
  37         * ctsim: Fixed context-sensitive help on Linux
  38
  39         * ctsim: Fixed About box on Linux
  40
  41 3.0.2 - Released 2/20/01
  42
  43         * scanner.cpp: Fixed bug when number of detectors was even.
  44
  45         * ctsim: Improved error handling when trying to convert
  46         divergent projections into polar form.
  47
  48 3.0.1 - Released 2/19/01
  49
  50         * ctsim: Fixed dialog box for reconstruction so that
  51         rotation angle setting will stay fixed in-between use
  52         of the dialog box.
  53
  54         * syserror: Fixed display bug for trace messages
  55
  56         * ctsim: MSVC optimization bug work-around, compiler
  57         options changed.
  58
  59 3.0.0 - Released 2/19/01
  60
  61         * ctsim: Massive update/fix to online help and print manual.
  62
  63         * ctsim: Added context-sensitive help to dialog boxes
  64
  65         * ctsim: Reformated all dialog boxes, much nicer now.
  66
  67         * ctsim: Improved accelerator key handling
  68
  69         * global: Added Hanning filter.
  70
  71         * global: Improved default parameters to that all defaults give
  72         sensible output.
  73
  74 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
  75
  76         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  77         registry storage between executions.
  78
  79         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  80
  81         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  82
  83         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  84
  85         * ctsim: Added graphical About box
  86
  87         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  88
  89         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  90
  91         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  92
  93         * ctsim: Online help added!
  94
  95         * backprojector: Added cubic interpolation
  96
  97         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  98
  99         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
 100         reconstruction dialogs.
 101
 102         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
 103
 104         * global: Projection files are not compatible with previous version
 105         due to new scanner definitions.
 106
 107         * global: deleted concept of field-of-view and added
 108           view ratio and scan ratio concepts.
 109
 110         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
 111
 112         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
 113
 114         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
 115
 116         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
 117
 118
 119 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
 120
 121         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
 122         procsignal.cpp
 123
 124         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
 125         bug in parsing command-line parameters.
 126
 127         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
 128         plotfiles
 129
 130         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
 131
 132         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
 133
 134         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
 135         for frequency/inverse-fourier filtering
 136
 137 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
 138
 139         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
 140
 141         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
 142         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
 143
 144         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
 145         for math tips]
 146
 147         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
 148
 149         * ctsim: Added more analyze menuitems
 150
 151         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
 152         through this master shell. Has both command-line and interactive
 153         interface
 154
 155         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
 156
 157         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
 158
 159         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
 160
 161 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
 162
 163         * ctsim: Added plotting of histograms
 164
 165         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
 166
 167         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 168
 169 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 170
 171         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 172
 173         * ctsim: added generation of filter images
 174
 175         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 176
 177         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 178
 179         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 180
 181         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 182         text files suitable for reading.
 183
 184         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 185         when performing properties of images.
 186
 187         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 188         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 189         fourier.cpp
 190
 191         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 192         image math functions to complex-valued math.
 193
 194         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 195
 196 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 197
 198         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 199         and column plots and comparison plots
 200
 201         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 202
 203         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 204
 205         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 206         files.
 207
 208         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 209         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 210         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 211
 212         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 213         imagefile and plotfile classes.
 214
 215         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 216         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 217         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 218         images.
 219
 220         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 221         images.
 222
 223         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 224         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 225
 226         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 227         math functions
 228
 229         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 230
 231         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 232         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 233         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 234
 235         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 236         class.
 237
 238         * sgp: Added linestyle settings
 239
 240 2.5.0 - 12/18/00
 241    First Microsoft Windows GUI version
 242    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 243    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 244         when manually compiling phantoms that vary during projection
 245         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 246    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 247    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 248    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 249    Fixed display of plotting in Projection views
 250    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 251    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 252         "namespace using std" statements
 253    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 254    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 255
 256 2.0.6 - 12/03/00
 257    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 258    Updated README file
 259    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 260    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 261
 262 2.0.5 - 12/01/00
 263    Improved compilation on RedHat 7
 264    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 265    Removed README.RedHat7
 266
 267 2.0.4 - 11/25/00
 268    Added documentation for --geometry setting
 269    Added README.RedHat7 document
 270
 271 2.0.3 - 11/20/00
 272    Fixed bug in generation of binary PGM files
 273    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 274    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 275
 276 2.0.2 - 11/8/00
 277    Additions to man pages (Ian Kay)
 278    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 279
 280 2.0.1 - 10/1/00
 281    Fixed syntax error in fftw configuration
 282    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 283
 284 2.0.0 - 9/7/00
 285    Version 2.0.0 released!
 286    ctsim: Added Window menu to Main frame
 287    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 288    Fixed obscure bug in sys_error
 289    Fixed compilation in mingw environment not present
 290    Fixed compilation in non-graphical environments
 291
 292 2.0.0-b12 - 9/4/00
 293    ctsim: Added animation of reconstruction
 294    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 295    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 296    ctsim: used setpriority to set lower priority
 297    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 298    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 299
 300 2.0.0-b11 - 9/1/00
 301    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 302    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 303    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 304    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 305    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 306    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 307    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 308    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 309    Separated reconstruction into Reconstructor class
 310    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 311    Added --enable-static to generate statically linked programs
 312
 313 2.0.0-b10 - 8/25/00
 314    ctsim: Added animation of projection collection processs
 315    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 316    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 317    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 318    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 319    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 320    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 321    Fixed bug in backprojection selection
 322
 323 2.0.0-b9 - 8/22/00
 324    Added RCS Id strings to executable files
 325    Added RPM Spec file for RPM package creation
 326    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 327    Fixed compilation for non-SGP architectures
 328    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 329    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 330         inverse_fourier construction of filters
 331    Added median to statistics and to auto-windowing
 332
 333 2.0.0-b8 - 8/1/00
 334    Added line color support to SGP
 335    Fixed lineAbs bug
 336
 337 2.0.0-b7 - 7/25/00
 338    Finished support for dmallocxx library
 339    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 340    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 341         G2 windows and well as WXWindows.
 342    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 343    Fixed row-plot bug in if-2
 344    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 345
 346 2.0.0-b6 - 7/22/00
 347    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 348         and projection files
 349    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 350         and reconstruction parameters dialogs
 351    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 352    Completely reorganized option processing in classes to improve
 353         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 354
 355 2.0.0-b5 - 7/17/00
 356    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 357    Started ctsim.tex document file
 358
 359 2.0.0-b4 - 7/13/00
 360    Fixed compiler warnings at -Wall level
 361    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 362    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 363    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 364
 365 2.0.0-b3 - 7/10/00
 366    Added highly optimized backprojection method idiff3
 367    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 368    Fixed image display in if2img using G2 library
 369    Added column-plot and row-plot options to if-2
 370    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 371    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 372         backprojection method. Currently, this technique is still under
 373         development and debugging
 374    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 375
 376 2.0.0-b2 - 7/07/00
 377    Cleaned up SignalFilter class
 378    Added zeropad option to pjrec
 379    Added zeropad options to html and cgi files
 380    Added fourier_table and rfttw filter methods
 381    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 382
 383 2.0.0-b1 - 7/05/00
 384    Updated trace level processing
 385    Added trace level to SignalFilter
 386    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 387
 388 1.9.9 - 7/04/00
 389    Fixed const issue with ImageFileArray
 390    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 391    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 392    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 393    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 394    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 395         between convolution, dft, & fft filtering
 396    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 397    Added support for FFTW library
 398
 399 1.9.8 - 6/27/2000
 400    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 401    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 402    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 403    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 404    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 405    Added signature tag and creation date/time to projection files
 406
 407 1.9.7 - 6/25/2000
 408    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 409         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 410         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 411    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 412    Rewrote ImageFile class
 413    Started support for dmallocxx library, not finished
 414    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 415    Updated ifinfo to show comparative statistics
 416    Added printLabels() to Array2dFile class
 417    Added printStatistics() to ImageFile class
 418
 419 1.9.6 - 6/22/2000
 420    Moved conversion filter name/id to Filter class
 421    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 422    Added MPI broadcasting of strings
 423
 424 1.9.5 - 6/21/2000
 425    Merged proj_reconstr into class Projections
 426    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 427    Code cleanup in projections.cpp
 428    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 429
 430 1.9.4 - 6/20/2000
 431    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 432    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 433    Converted filter and convolution to object-oriented code
 434    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 435    Optimized image file writing on little-endian architectures
 436    Updated README and INSTALL
 437
 438 1.9.3 - 6/19/2000
 439    Reorganized source files
 440    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 441
 442 1.9.2 - 6/18/2000
 443    Reorganized include files
 444    Fixed const pointers in strfuncs
 445
 446 1.9.1 - 6/16/2000
 447    Renamed directories, moved source files, combined source files
 448    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 449    and libctgraphics)
 450
 451 1.9.0 - 6/15/2000
 452    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 453    Renamed Raysums to Projections throughout files
 454    Renamed Detector to Scanner
 455    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 456
 457 0.6.1 - 6/12/2000
 458    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 459    Converted Detector to Object-Oriented
 460
 461 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 462    Improved Integer backprojection method
 463         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 464         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 465    Finished converting all C files to C++
 466    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 467    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 468
 469 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 470    Converted MPI data structures to C++ object
 471    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 472
 473 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 474    First C++ conversions
 475    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 476         - Now all data files are cross-platform compatible
 477    Converted from MPI to MPI++
 478    Converted backprojection to object-oriented
 479    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 480
 481 0.5.4 - 6/4/2000
 482    Simpilifed endian handling
 483
 484 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 485    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 486    Removed broken B-spline interpolation
 487    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 488    Added support for 16-bit PNG graphics
 489
 490 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 491    Added compile-time configuration of endian order
 492
 493 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 494    Modified the raysum file format to be platform independent
 495
 496 0.5.3 - 5/11/2000
 497    Added Microsoft VC compatibility
 498    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 499
 500 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 501    Continued conversion to ANSI C
 502    Removed old CRT routines
 503
 504 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 505    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 506    Continued code cleanup
 507
 508 0.5.2-b3 - 4/30/200
 509     More code cleanup with reorganizing libraries
 510     Added --log and --exp to sdf-1
 511     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 512
 513 0.5.2-b2 - 4/30/200
 514     Continued code cleanup
 515
 516 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 517     Fixed a few MPI bugs
 518     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 519
 520 0.5.1 - 4/28/2000
 521     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 522     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 523
 524 0.5.0 - 4/27/2000
 525     First open source distribution for GNU/Linux
 526
 527 6/1999
 528   Converted to GNU/Linux
 529   added MPI support via LAM library
 530
 531 1983-84
 532   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 533