ChangeLog

   1 3.0.0alpha4
   2
   3         * ctsim: Fixed initialization of min/max for PlotFiles
   4
   5         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
   6
   7         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot
   8
   9         * ctsim: improve bilinear scaling of image size
  10
  11         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  12
  13         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  14
  15 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  16
  17         * ctsim: Added plotting of histograms
  18
  19         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  20
  21         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  22
  23 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  24
  25         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  26
  27         * ctsim: added generation of filter images
  28
  29         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  30
  31         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  32
  33         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  34
  35         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  36         text files suitable for reading.
  37
  38         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  39         when performing properties of images.
  40
  41         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  42         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  43         fourier.cpp
  44
  45         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  46         image math functions to complex-valued math.
  47
  48         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  49
  50 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  51
  52         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  53         and column plots and comparison plots
  54
  55         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  56
  57         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  58
  59         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  60         files.
  61
  62         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  63         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  64         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  65
  66         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  67         imagefile and plotfile classes.
  68
  69         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  70         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  71         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  72         images.
  73
  74         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  75         images.
  76
  77         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  78         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  79
  80         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  81         math functions
  82
  83         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  84
  85         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  86         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  87         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  88
  89         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  90         class.
  91
  92         * sgp: Added linestyle settings
  93
  94 2.5.0 - 12/18/00
  95    First Microsoft Windows GUI version
  96    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  97    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  98         when manually compiling phantoms that vary during projection
  99         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 100    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 101    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 102    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 103    Fixed display of plotting in Projection views
 104    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 105    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 106         "namespace using std" statements
 107    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 108    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 109
 110 2.0.6 - 12/03/00
 111    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 112    Updated README file
 113    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 114    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 115
 116 2.0.5 - 12/01/00
 117    Improved compilation on RedHat 7
 118    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 119    Removed README.RedHat7
 120
 121 2.0.4 - 11/25/00
 122    Added documentation for --geometry setting
 123    Added README.RedHat7 document
 124
 125 2.0.3 - 11/20/00
 126    Fixed bug in generation of binary PGM files
 127    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 128    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 129
 130 2.0.2 - 11/8/00
 131    Additions to man pages (Ian Kay)
 132    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 133
 134 2.0.1 - 10/1/00
 135    Fixed syntax error in fftw configuration
 136    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 137
 138 2.0.0 - 9/7/00
 139    Version 2.0.0 released!
 140    ctsim: Added Window menu to Main frame
 141    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 142    Fixed obscure bug in sys_error
 143    Fixed compilation in mingw environment not present
 144    Fixed compilation in non-graphical environments
 145
 146 2.0.0-b12 - 9/4/00
 147    ctsim: Added animation of reconstruction
 148    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 149    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 150    ctsim: used setpriority to set lower priority
 151    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 152    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 153
 154 2.0.0-b11 - 9/1/00
 155    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 156    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 157    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 158    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 159    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 160    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 161    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 162    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 163    Separated reconstruction into Reconstructor class
 164    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 165    Added --enable-static to generate statically linked programs
 166
 167 2.0.0-b10 - 8/25/00
 168    ctsim: Added animation of projection collection processs
 169    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 170    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 171    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 172    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 173    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 174    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 175    Fixed bug in backprojection selection
 176
 177 2.0.0-b9 - 8/22/00
 178    Added RCS Id strings to executable files
 179    Added RPM Spec file for RPM package creation
 180    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 181    Fixed compilation for non-SGP architectures
 182    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 183    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 184         inverse_fourier construction of filters
 185    Added median to statistics and to auto-windowing
 186
 187 2.0.0-b8 - 8/1/00
 188    Added line color support to SGP
 189    Fixed lineAbs bug
 190
 191 2.0.0-b7 - 7/25/00
 192    Finished support for dmallocxx library
 193    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 194    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 195         G2 windows and well as WXWindows.
 196    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 197    Fixed row-plot bug in if-2
 198    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 199
 200 2.0.0-b6 - 7/22/00
 201    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 202         and projection files
 203    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 204         and reconstruction parameters dialogs
 205    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 206    Completely reorganized option processing in classes to improve
 207         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 208
 209 2.0.0-b5 - 7/17/00
 210    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 211    Started ctsim.tex document file
 212
 213 2.0.0-b4 - 7/13/00
 214    Fixed compiler warnings at -Wall level
 215    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 216    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 217    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 218
 219 2.0.0-b3 - 7/10/00
 220    Added highly optimized backprojection method idiff3
 221    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 222    Fixed image display in if2img using G2 library
 223    Added column-plot and row-plot options to if-2
 224    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 225    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 226         backprojection method. Currently, this technique is still under
 227         development and debugging
 228    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 229
 230 2.0.0-b2 - 7/07/00
 231    Cleaned up SignalFilter class
 232    Added zeropad option to pjrec
 233    Added zeropad options to html and cgi files
 234    Added fourier_table and rfttw filter methods
 235    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 236
 237 2.0.0-b1 - 7/05/00
 238    Updated trace level processing
 239    Added trace level to SignalFilter
 240    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 241
 242 1.9.9 - 7/04/00
 243    Fixed const issue with ImageFileArray
 244    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 245    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 246    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 247    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 248    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 249         between convolution, dft, & fft filtering
 250    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 251    Added support for FFTW library
 252
 253 1.9.8 - 6/27/2000
 254    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 255    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 256    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 257    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 258    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 259    Added signature tag and creation date/time to projection files
 260
 261 1.9.7 - 6/25/2000
 262    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 263         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 264         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 265    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 266    Rewrote ImageFile class
 267    Started support for dmallocxx library, not finished
 268    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 269    Updated ifinfo to show comparative statistics
 270    Added printLabels() to Array2dFile class
 271    Added printStatistics() to ImageFile class
 272
 273 1.9.6 - 6/22/2000
 274    Moved conversion filter name/id to Filter class
 275    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 276    Added MPI broadcasting of strings
 277
 278 1.9.5 - 6/21/2000
 279    Merged proj_reconstr into class Projections
 280    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 281    Code cleanup in projections.cpp
 282    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 283
 284 1.9.4 - 6/20/2000
 285    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 286    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 287    Converted filter and convolution to object-oriented code
 288    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 289    Optimized image file writing on little-endian architectures
 290    Updated README and INSTALL
 291
 292 1.9.3 - 6/19/2000
 293    Reorganized source files
 294    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 295
 296 1.9.2 - 6/18/2000
 297    Reorganized include files
 298    Fixed const pointers in strfuncs
 299
 300 1.9.1 - 6/16/2000
 301    Renamed directories, moved source files, combined source files
 302    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 303    and libctgraphics)
 304
 305 1.9.0 - 6/15/2000
 306    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 307    Renamed Raysums to Projections throughout files
 308    Renamed Detector to Scanner
 309    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 310
 311 0.6.1 - 6/12/2000
 312    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 313    Converted Detector to Object-Oriented
 314
 315 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 316    Improved Integer backprojection method
 317         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 318         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 319    Finished converting all C files to C++
 320    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 321    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 322
 323 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 324    Converted MPI data structures to C++ object
 325    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 326
 327 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 328    First C++ conversions
 329    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 330         - Now all data files are cross-platform compatible
 331    Converted from MPI to MPI++
 332    Converted backprojection to object-oriented
 333    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 334
 335 0.5.4 - 6/4/2000
 336    Simpilifed endian handling
 337
 338 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 339    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 340    Removed broken B-spline interpolation
 341    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 342    Added support for 16-bit PNG graphics
 343
 344 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 345    Added compile-time configuration of endian order
 346
 347 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 348    Modified the raysum file format to be platform independent
 349
 350 0.5.3 - 5/11/2000
 351    Added Microsoft VC compatibility
 352    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 353
 354 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 355    Continued conversion to ANSI C
 356    Removed old CRT routines
 357
 358 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 359    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 360    Continued code cleanup
 361
 362 0.5.2-b3 - 4/30/200
 363     More code cleanup with reorganizing libraries
 364     Added --log and --exp to sdf-1
 365     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 366
 367 0.5.2-b2 - 4/30/200
 368     Continued code cleanup
 369
 370 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 371     Fixed a few MPI bugs
 372     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 373
 374 0.5.1 - 4/28/2000
 375     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 376     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 377
 378 0.5.0 - 4/27/2000
 379     First open source distribution for GNU/Linux
 380
 381 6/1999
 382   Converted to GNU/Linux
 383   added MPI support via LAM library
 384
 385 1983-84
 386   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 387