4d2cc28fbbc03896eaed2f6bfbcb72e331640dc8
[ctsim.git] / libctsim / phantom.cpp
1 /*****************************************************************************
2 ** FILE IDENTIFICATION
3 ** 
4 **     Name:                   phm.cpp
5 **     Purpose:                Routines for phantom objects
6 **     Progammer:              Kevin Rosenberg
7 **     Date Started:           Aug 1984
8 **
9 **  This is part of the CTSim program
10 **  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
11 **
12 **  $Id: phantom.cpp,v 1.31 2001/03/24 05:28:28 kevin Exp $
13 **
14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
16 **  published by the Free Software Foundation.
17 **
18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
21 **  GNU General Public License for more details.
22 **
23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
26 ******************************************************************************/
27
28 #include "ct.h"
29
30 const int PhantomElement::POINTS_PER_CIRCLE = 360;
31 const double PhantomElement::SCALE_PELEM_EXTENT=0.000;  // increase pelem limits by 0.5% 
32 //const double PhantomElement::SCALE_PELEM_EXTENT=0.005;  // increase pelem limits by 0.5% 
33
34 const int Phantom::PHM_INVALID = -1;
35 const int Phantom::PHM_HERMAN = 0;
36 const int Phantom::PHM_SHEPP_LOGAN = 1;
37 const int Phantom::PHM_UNITPULSE = 2;
38
39 const char* Phantom::s_aszPhantomName[] = 
40 {
41   {"herman"},
42   {"shepp-logan"},
43   {"unit-pulse"},
44 };
45
46 const char* Phantom::s_aszPhantomTitle[] = 
47 {
48   {"Herman Head"},
49   {"Shepp-Logan"},
50   {"Unit Pulse"},
51 };
52
53 const int Phantom::s_iPhantomCount = sizeof(s_aszPhantomName) / sizeof(const char*);
54
55
56 // CLASS IDENTIFICATION
57 //   Phantom
58 //
59
60 Phantom::Phantom ()
61 {
62   init ();
63 }
64
65
66 Phantom::Phantom (const char* const phmName)
67 {
68   init ();
69   createFromPhantom (phmName);
70 }
71
72 void 
73 Phantom::init ()
74 {
75   m_nPElem = 0;
76   m_xmin = 1E30;
77   m_xmax = -1E30;
78   m_ymin = 1E30;
79   m_ymax = -1E30;
80   m_composition = P_PELEMS;
81   m_fail = false;
82   m_id = PHM_INVALID;
83 }
84
85 Phantom::~Phantom ()
86 {
87   for (PElemIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++) {
88     delete *i;
89   }
90 }
91
92
93 const char*
94 Phantom::convertPhantomIDToName (int phmID)
95 {
96   static const char *name = "";
97   
98   if (phmID >= 0 && phmID < s_iPhantomCount)
99     return (s_aszPhantomName[phmID]);
100   
101   return (name);
102 }
103
104 const char*
105 Phantom::convertPhantomIDToTitle (int phmID)
106 {
107   static const char *title = "";
108   
109   if (phmID >= 0 && phmID < s_iPhantomCount)
110     return (s_aszPhantomName[phmID]);
111   
112   return (title);
113 }
114
115 int
116 Phantom::convertNameToPhantomID (const char* const phmName) 
117 {
118   int id = PHM_INVALID;
119   
120   for (int i = 0; i < s_iPhantomCount; i++)
121     if (strcasecmp (phmName, s_aszPhantomName[i]) == 0) {
122       id = i;
123       break;
124     }
125     
126     return (id);
127 }
128
129
130 bool
131 Phantom::createFromPhantom (const char* const phmName)
132 {
133   int phmid = convertNameToPhantomID (phmName);
134   if (phmid == PHM_INVALID) {
135     m_fail = true;
136     m_failMessage = "Invalid phantom name ";
137     m_failMessage += phmName;
138     return false;
139   }
140   
141   m_name = phmName;
142   createFromPhantom (phmid);
143   return true;
144 }
145
146 bool
147 Phantom::createFromPhantom (const int phmid)
148 {
149   switch (phmid) 
150   {
151   case PHM_HERMAN:
152     addStdHerman();
153     break;
154   case PHM_SHEPP_LOGAN:
155     addStdSheppLogan();
156     break;
157   case PHM_UNITPULSE:
158     m_composition = P_UNIT_PULSE;
159     addPElem ("rectangle", 0., 0., 100., 100., 0., 0.);     // outline 
160     addPElem ("ellipse", 0., 0., 1., 1., 0., 1.);             // pulse 
161     break;
162   default:
163     m_fail = true;
164     m_failMessage = "Illegal phantom id ";
165     m_failMessage += phmid;
166     return false;
167   }
168   
169   m_id = phmid;
170   
171   return true;
172 }
173
174
175 /* METHOD IDENTIFICATION
176 *   createFromFile          Add PhantomElements from file
177 *
178 * SYNOPSIS
179 *   createFromFile (filename)
180 *
181 * RETURNS
182 *   true if pelem were added
183 *   false if an pelem not added
184 */
185
186 bool
187 Phantom::createFromFile (const char* const fname)
188 {
189   bool bGoodFile = true;
190   FILE *fp;
191   
192   if ((fp = fopen (fname, "r")) == NULL)
193     return (false);
194   
195   m_name = fname;
196   
197   while (1) {
198     double cx, cy, u, v, rot, dens;
199     char pelemtype[80];
200     
201     int status = fscanf (fp, "%79s %lf %lf %lf %lf %lf %lf", pelemtype, &cx, &cy, &u, &v, &rot, &dens);
202     
203     if (status == static_cast<int>(EOF)) 
204       break;
205     else if (status != 7) {
206       sys_error (ERR_WARNING, "Insufficient fields reading phantom file %s [Phantom::createFromFile]", fname);
207       bGoodFile = false;
208     }
209     addPElem (pelemtype, cx, cy, u, v, rot, dens);
210   }
211   
212   fclose (fp);
213   
214   return (bGoodFile);
215 }
216
217 bool
218 Phantom::fileWrite (const char* const fname)
219 {
220   fstream file (fname, ios::out);
221   
222   if (! file.fail())
223     printDefinitions (file);
224   return ! file.fail();
225 }
226
227 /* NAME
228 *   addPElem            Add pelem
229 *
230 * SYNOPSIS
231 *   addPElem (type, cx, cy, u, v, rot, atten)
232 *   char *type          type of pelem (box, ellipse, etc)
233 *   double cx, cy       pelem center
234 *   double u,v          pelem size
235 *   double rot          rotation angle of pelem (in degrees)
236 *   double atten        x-ray attenuation cooefficient
237 */
238
239 void 
240 Phantom::addPElem (const char *type, const double cx, const double cy, const double u, const double v, const double rot, const double atten)
241 {
242   PhantomElement *pelem = new PhantomElement (type, cx, cy, u, v, rot, atten);
243   
244   m_listPElem.push_front (pelem);
245   
246   // update phantom limits
247   if (m_xmin > pelem->xmin())    m_xmin = pelem->xmin();
248   if (m_xmax < pelem->xmax())    m_xmax = pelem->xmax();
249   if (m_ymin > pelem->ymin())    m_ymin = pelem->ymin();
250   if (m_ymax < pelem->ymax())    m_ymax = pelem->ymax();
251   
252   m_nPElem++;
253 }
254
255
256 /*----------------------------------------------------------------------*/
257 /*                      Input-Output Routines                           */
258 /*----------------------------------------------------------------------*/
259
260
261 /* NAME
262 *   print                               Print vertices of Phantom pelems
263 *
264 * SYNOPSIS
265 *   print (phm)
266 */
267
268 void 
269 Phantom::print (std::ostream& os) const
270 {
271   os << "Number of PElements: " << m_nPElem << "\n";
272   os << "Limits: xmin=" << m_xmin << ", ymin=" << m_ymin << ", xmax=" << m_xmax << ", ymax=" << m_ymax << "\n";
273   
274   for (PElemConstIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++) {
275     const PhantomElement& rPE = **i;
276     os << "PhantomElement: nPoints=" << rPE.nOutlinePoints();
277     os << ", atten=" << rPE.atten() << " rot=" << convertRadiansToDegrees (rPE.rot()) << "\n";
278     os << "xmin=" << rPE.xmin() << ", ymin=" << rPE.ymin() << ", xmax=" << rPE.xmax() << ", ymax=" << rPE.ymax() << "\n";
279     
280     if (false)
281       for (int i = 0; i < rPE.nOutlinePoints(); i++)
282         os << rPE.xOutline()[i] << "," << rPE.yOutline()[i] << "\n";
283   }
284 }
285 void 
286 Phantom::print (std::ostringstream& os) const
287 {
288   os << "Number of PElements: " << m_nPElem << "\n";
289   os << "Limits: xmin=" << m_xmin << ", ymin=" << m_ymin << ", xmax=" << m_xmax << ", ymax=" << m_ymax << "\n";
290   
291   for (PElemConstIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++) {
292     const PhantomElement& rPE = **i;
293     os << "PhantomElement: nPoints=" << rPE.nOutlinePoints();
294     os << ", atten=" << rPE.atten() << " rot=" << convertRadiansToDegrees (rPE.rot()) << "\n";
295     os << "xmin=" << rPE.xmin() << ", ymin=" << rPE.ymin() << ", xmax=" << rPE.xmax() << ", ymax=" << rPE.ymax() << "\n";
296     
297     if (false)
298       for (int i = 0; i < rPE.nOutlinePoints(); i++)
299         os << rPE.xOutline()[i] << "," << rPE.yOutline()[i] << "\n";
300   }
301 }
302
303 void
304 Phantom::printDefinitions (std::ostream& os) const
305 {
306   for (PElemConstIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++) {
307     const PhantomElement& rPE = **i;
308     rPE.printDefinition (os);
309   }
310 }
311
312 void
313 Phantom::printDefinitions (std::ostringstream& os) const
314 {
315   for (PElemConstIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++) {
316     const PhantomElement& rPE = **i;
317     rPE.printDefinition (os);
318   }
319 }
320
321
322 /* NAME
323 *   show                Show vector outline of Phantom to user
324 *
325 * SYNOPSIS
326 *   show (pic)
327 */
328
329 #ifdef HAVE_SGP
330 void 
331 Phantom::show () const
332 {
333   SGPDriver driverSGP ("Phantom Show");
334   SGP sgp (driverSGP);
335   
336   show (sgp);
337   
338   std::cout << "Press return to continue";
339   cio_kb_getc();
340 }
341
342 void 
343 Phantom::show (SGP& sgp) const
344 {
345   double wsize = m_xmax - m_xmin;
346   if ((m_ymax - m_ymin) > wsize) 
347     wsize = m_ymax - m_ymin;
348   wsize *= 1.01;
349   double halfWindow = wsize / 2;
350   
351   double xcent = m_xmin + (m_xmax - m_xmin) / 2;
352   double ycent = m_ymin + (m_ymax - m_ymin) / 2;
353   
354   sgp.setWindow (xcent - halfWindow, ycent - halfWindow, xcent + halfWindow, ycent + halfWindow);
355   
356   draw (sgp);
357 }
358 #endif
359
360
361 /* NAME
362 *   draw                Draw vector outline of Phantom
363 *
364 * SYNOPSIS
365 *   draw ()
366 */
367
368 #ifdef HAVE_SGP
369 void 
370 Phantom::draw (SGP& sgp) const
371 {
372   for (PElemIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++)
373     sgp.polylineAbs ((*i)->xOutline(), (*i)->yOutline(), (*i)->nOutlinePoints());
374 }
375 #endif
376
377
378 /* NAME
379 *   addStdSheppLogan    Make head phantom of Shepp-Logan
380 *
381 * REFERENCES
382 *   S. W. Rowland, "Computer Implementation of Image Reconstruction
383 *       Formulas", in "Image Reconstruction from Projections: Implementation
384 *       and Applications", edited by G. T. Herman, 1978.
385 */
386
387 void 
388 Phantom::addStdSheppLogan ()
389 {
390   addPElem ("ellipse",  0.0000,  0.0000, 0.6900,  0.9200,   0.0,  1.00);
391   addPElem ("ellipse",  0.0000, -0.0184, 0.6624,  0.8740,   0.0, -0.98);
392   addPElem ("ellipse",  0.2200,  0.0000, 0.1100,  0.3100, -18.0, -0.02);
393   addPElem ("ellipse", -0.2200,  0.0000, 0.1600,  0.4100,  18.0, -0.02);
394   addPElem ("ellipse",  0.0000,  0.3500, 0.2100,  0.2500,   0.0,  0.01);
395   addPElem ("ellipse",  0.0000,  0.1000, 0.0460,  0.0460,   0.0,  0.01);
396   addPElem ("ellipse",  0.0000, -0.1000, 0.0460,  0.0460,   0.0,  0.01);
397   addPElem ("ellipse", -0.0800, -0.6050, 0.0460,  0.0230,   0.0,  0.01);
398   addPElem ("ellipse",  0.0000, -0.6050, 0.0230,  0.0230,   0.0,  0.01);
399   addPElem ("ellipse",  0.0600, -0.6050, 0.0230,  0.0230,   0.0,  0.01);
400   addPElem ("ellipse",  0.5538, -0.3858, 0.0330,  0.2060, -18.0,  0.03);
401 }
402
403
404 /* NAME
405 *   addStdHerman                        Standard head phantom of G. T. Herman
406 *
407 * REFERENCES
408 *   G. T. Herman, "Image Reconstructions from Projections:  The Fundementals
409 *       of Computed Tomography", 1979.
410 */
411
412 void 
413 Phantom::addStdHerman ()
414 {
415   addPElem ("ellipse",  0.000,  1.50,  0.375, 0.3000,  90.00, -0.003);
416   addPElem ("ellipse",  0.675, -0.75,  0.225, 0.1500, 140.00,  0.010);
417   addPElem ("ellipse",  0.750,  1.50,  0.375, 0.2250,  50.00,  0.003);
418   addPElem ("segment",  1.375, -7.50,  1.100, 0.6250,  19.20, -0.204);
419   addPElem ("segment",  1.375, -7.50,  1.100, 4.3200,  19.21,  0.204);
420   addPElem ("segment",  0.000, -2.25,  1.125, 0.3750,   0.00, -0.003);
421   addPElem ("segment",  0.000, -2.25,  1.125, 3.0000,   0.00,  0.003);
422   addPElem ("segment", -1.000,  3.75,  1.000, 0.5000, 135.00, -0.003);
423   addPElem ("segment", -1.000,  3.75,  1.000, 3.0000, 135.00,  0.003);
424   addPElem ("segment",  1.000,  3.75,  1.000, 0.5000, 225.00, -0.003);
425   addPElem ("segment",  1.000,  3.75,  1.000, 3.0000, 225.00,  0.003);
426   addPElem ("triangle", 5.025,  3.75,  1.125, 0.5000, 110.75,  0.206);
427   addPElem ("triangle",-5.025,  3.75,  1.125, 0.9000,-110.75,  0.206);
428   addPElem ("ellipse",  0.000,  0.00,  8.625, 6.4687,  90.00,  0.416);
429   addPElem ("ellipse",  0.000,  0.00,  7.875, 5.7187,  90.00, -0.206);
430 }
431
432
433
434 /* NAME
435 *    convertToImagefile         Make image array from Phantom
436 *
437 * SYNOPSIS
438 *    pic_to_imagefile (pic, im, nsample)
439 *    Phantom& pic               Phantom definitions
440 *    ImageFile  *im             Computed pixel array
441 *    int nsample                Number of samples along each axis for each pixel
442 *                               (total samples per pixel = nsample * nsample)
443 */
444
445 void
446 Phantom::convertToImagefile (ImageFile& im, double dViewRatio, const int in_nsample, const int trace) const
447 {
448   convertToImagefile (im, dViewRatio, in_nsample, trace, 0, im.nx(), true);
449 }
450
451 void 
452 Phantom::convertToImagefile (ImageFile& im, const double dViewRatio, const int in_nsample, const int trace, 
453                              const int colStart, const int colCount, bool bStoreAtColumnPos) const
454 {
455   int iStorageOffset = (bStoreAtColumnPos ? colStart : 0);
456   convertToImagefile (im, im.nx(), dViewRatio, in_nsample, trace, colStart, colCount, iStorageOffset);
457 }
458
459 void 
460 Phantom::convertToImagefile (ImageFile& im, const int iTotalRasterCols, const double dViewRatio, 
461             const int in_nsample, const int trace, const int colStart, const int colCount, int iStorageOffset) const
462 {
463   const int nx = im.nx();
464   const int ny = im.ny();
465   if (nx < 2 || ny < 2)
466     return;
467   
468   int nsample = in_nsample;
469   if (nsample < 1)  
470     nsample = 1;
471   
472   double dx = m_xmax - m_xmin;
473   double dy = m_ymax - m_ymin;
474   double xcent = m_xmin + dx / 2;
475   double ycent = m_ymin + dy / 2;
476   double dHalflen = dViewRatio * (getDiameterBoundaryCircle() / SQRT2 / 2);
477   
478   double xmin = xcent - dHalflen;
479   double xmax = xcent + dHalflen;
480   double ymin = ycent - dHalflen;
481   double ymax = ycent + dHalflen;
482   
483   // Each pixel holds the average of the intensity of the cell with (ix,iy) at the center of the pixel
484   // Set major increments so that the last cell v[nx-1][ny-1] will start at xmax - xinc, ymax - yinc).
485   // Set minor increments so that sample points are centered in cell
486   
487   double xinc = (xmax - xmin) / (iTotalRasterCols);
488   double yinc = (ymax - ymin) / ny;
489   
490   double kxinc = xinc / nsample;                /* interval between samples */
491   double kyinc = yinc / nsample;
492   double kxofs = kxinc / 2;             /* offset of 1st point */
493   double kyofs = kyinc / 2;
494   
495   im.setAxisExtent (xmin, xmax, ymin, ymax);
496   im.setAxisIncrement (xinc, yinc);
497   
498   ImageFileArray v = im.getArray();
499   
500   for (int ix = 0; ix < colCount; ix++) {
501     int iColStore = ix + iStorageOffset;
502     ImageFileColumn vCol = v[iColStore];
503     for (int iy = 0; iy < ny; iy++)
504       *vCol++ = 0;
505   }
506   
507   double x_start = xmin + (colStart * xinc);
508   for (PElemConstIterator pelem = m_listPElem.begin(); pelem != m_listPElem.end(); pelem++) {
509     const PhantomElement& rPElem = **pelem;
510     double x, y, xi, yi;
511     int ix, iy, kx, ky;
512     for (ix = 0, x = x_start; ix < colCount; ix++, x += xinc) {
513       int iColStore = ix + iStorageOffset;
514       ImageFileColumn vCol = v[iColStore];
515       for (iy = 0, y = ymin; iy < ny; iy++, y += yinc) {
516         double dAtten = 0;
517         for (kx = 0, xi = x + kxofs; kx < nsample; kx++, xi += kxinc) {
518           for (ky = 0, yi = y + kyofs; ky < nsample; ky++, yi += kyinc)
519             if (rPElem.isPointInside (xi, yi, PHM_COORD))
520               dAtten += rPElem.atten();
521         } // for kx
522         *vCol++ += dAtten;
523       } /* for iy */
524     }  /* for ix */
525   }  /* for pelem */
526   
527   
528   if (nsample > 1) {
529     double factor = 1.0 / static_cast<double>(nsample * nsample);
530     
531     
532     for (int ix = 0; ix < colCount; ix++) {
533       int iColStore = ix + iStorageOffset;
534       ImageFileColumn vCol = v[iColStore];
535       for (int iy = 0; iy < ny; iy++)
536         *vCol++ *= factor;
537     }
538   }
539 }
540
541 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
542 // CLASS IDENTIFICATION
543 //
544 //      PhantomElement
545 //
546 // PURPOSE
547 //
548 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
549
550
551 PhantomElement::PhantomElement (const char *type, const double cx, const double cy, const double u, const double v, const double rot, const double atten)
552 : m_cx(cx), m_cy(cy), m_u(u), m_v(v), m_atten(atten), m_nPoints(0), m_xOutline(0), m_yOutline(0)
553 {
554   m_rot = convertDegreesToRadians (rot);   // convert angle to radians
555   
556   m_type = convertNameToType (type);
557   
558   makeTransformMatrices ();     // calc transform matrices between phantom and normalized phantomelement
559   makeVectorOutline ();         // calculate vector outline of pelem 
560   
561   m_rectLimits[0] = m_xmin;   m_rectLimits[1] = m_ymin;
562   m_rectLimits[2] = m_xmax;   m_rectLimits[3] = m_ymax;
563 }
564
565
566
567 PhantomElement::~PhantomElement ()
568 {
569   delete m_xOutline;
570   delete m_yOutline;
571 }
572
573 void
574 PhantomElement::printDefinition (std::ostream& os) const
575 {
576   os << convertTypeToName (m_type) << " " << m_cx << " " << m_cy << " " << m_u << " "
577     << m_v << " " << convertRadiansToDegrees (m_rot) << " " << m_atten << "\n";
578 }
579
580 void
581 PhantomElement::printDefinition (std::ostringstream& os) const
582 {
583   os << convertTypeToName (m_type) << " " << m_cx << " " << m_cy << " " << m_u << " "
584     << m_v << " " << convertRadiansToDegrees (m_rot) << " " << m_atten << "\n";
585 }
586
587 PhmElemType
588 PhantomElement::convertNameToType (const char* const typeName)
589 {
590   PhmElemType type = PELEM_INVALID;
591   
592   if (strcasecmp (typeName, "rectangle") == 0)
593     type = PELEM_RECTANGLE;
594   else if (strcasecmp (typeName, "triangle") == 0)
595     type = PELEM_TRIANGLE;
596   else if (strcasecmp (typeName, "ellipse") == 0)
597     type = PELEM_ELLIPSE;
598   else if (strcasecmp (typeName, "sector") == 0)
599     type = PELEM_SECTOR;
600   else if (strcasecmp (typeName, "segment") == 0)
601     type = PELEM_SEGMENT;
602   else
603     sys_error (ERR_WARNING, "Unknown PhantomElement type %s [PhantomElement::PhantomElement]", type);
604   
605   return (type);
606 }
607
608 const char* const
609 PhantomElement::convertTypeToName (PhmElemType iType)
610 {
611   static char* pszType = "Unknown";
612   
613   if (iType == PELEM_RECTANGLE)
614     pszType = "rectangle";
615   else if (iType == PELEM_TRIANGLE)
616     pszType = "triangle";
617   else if (iType == PELEM_ELLIPSE)
618     pszType = "ellipse";
619   else if (iType == PELEM_SECTOR)
620     pszType = "sector";
621   else if (iType == PELEM_SEGMENT)
622     pszType = "segment";
623   
624   return pszType;
625 }
626
627
628 void 
629 PhantomElement::makeTransformMatrices ()
630 {
631   GRFMTX_2D temp;
632   
633   // To map normalized Pelem coords to world Phantom 
634   //     scale by (u, v)                                       
635   //     rotate by rot                                  
636   //     translate by (cx, cy)                         
637   
638   scale_mtx2 (m_xformObjToPhm, m_u, m_v);
639   rot_mtx2  (temp, m_rot);
640   mult_mtx2 (m_xformObjToPhm, temp, m_xformObjToPhm);
641   xlat_mtx2 (temp, m_cx, m_cy);
642   mult_mtx2 (m_xformObjToPhm, temp, m_xformObjToPhm);
643   
644   // to map world Phantom coodinates to normalized PElem coords
645   //     translate by (-cx, -cy)
646   //     rotate by -rot
647   //     scale by (1/u, 1/v)
648   
649   xlat_mtx2 (m_xformPhmToObj, -m_cx, -m_cy);
650   rot_mtx2  (temp, -m_rot);
651   mult_mtx2 (m_xformPhmToObj, temp, m_xformPhmToObj);
652   scale_mtx2 (temp, 1 / m_u, 1 / m_v);
653   mult_mtx2 (m_xformPhmToObj, temp, m_xformPhmToObj);
654 }
655
656
657 /* NAME
658 *   pelem_make_points           INTERNAL routine to calculate point array for an pelem
659 *
660 * SYNOPSIS
661 *   makepelempts (pelem)
662 *   PELEM *pelem        pelem whose points we are calculating
663 *
664 * NOTES
665 *   Called by phm_add_pelem()
666 */
667
668 void
669 PhantomElement::makeVectorOutline ()
670 {
671   double radius, theta, start, stop;
672   double xfact, yfact;
673   int cpts;
674   
675   m_nPoints = 0;
676   switch (m_type) {
677   case PELEM_RECTANGLE:
678     m_nPoints = 5;
679     m_xOutline = new double [m_nPoints];
680     m_yOutline = new double [m_nPoints];
681     m_xOutline[0] =-m_u;        m_yOutline[0] =-m_v;
682     m_xOutline[1] = m_u;        m_yOutline[1] =-m_v;
683     m_xOutline[2] = m_u;        m_yOutline[2] = m_v;
684     m_xOutline[3] =-m_u;        m_yOutline[3] = m_v;
685     m_xOutline[4] =-m_u;        m_yOutline[4] =-m_v;
686     break;
687   case PELEM_TRIANGLE:
688     m_nPoints = 4;
689     m_xOutline = new double [m_nPoints];
690     m_yOutline = new double [m_nPoints];
691     m_xOutline[0] =-m_u;        m_yOutline[0] = 0.0;
692     m_xOutline[1] = m_u;        m_yOutline[1] = 0.0;
693     m_xOutline[2] = 0.0;        m_yOutline[2] = m_v;
694     m_xOutline[3] =-m_u;        m_yOutline[3] = 0.0;
695     break;
696   case PELEM_ELLIPSE:
697     cpts = numCirclePoints (TWOPI);
698     m_nPoints = cpts;
699     m_xOutline = new double [m_nPoints];
700     m_yOutline = new double [m_nPoints];
701     calcEllipsePoints (m_xOutline, m_yOutline, cpts, m_u, m_v);
702     break;
703   case PELEM_SECTOR:
704     radius = sqrt(m_u * m_u + m_v * m_v);
705     theta = atan(m_u / m_v);            // angle with y-axis 
706     start = 3.0 * HALFPI - theta;
707     stop  = 3.0 * HALFPI + theta;
708     cpts = numCirclePoints (stop - start);
709     m_nPoints = 3 + cpts;
710     m_xOutline = new double [m_nPoints];
711     m_yOutline = new double [m_nPoints];
712     
713     m_xOutline[0] = 0.0;                m_yOutline[0] = m_v;
714     m_xOutline[1] =-m_u;                m_yOutline[1] = 0.0;
715     calcArcPoints (&m_xOutline[2], &m_yOutline[2], cpts, 0.0, m_v, radius, start, stop);
716     m_xOutline[cpts + 2] = 0.0;
717     m_yOutline[cpts + 2] = m_v;
718     break;
719   case PELEM_SEGMENT:
720     radius = sqrt(m_u * m_u + m_v * m_v);
721     theta = atan (m_u / m_v);           // angle with y-axis 
722     start = 3.0 * HALFPI - theta;
723     stop  = 3.0 * HALFPI + theta;
724     
725     cpts = numCirclePoints (stop - start);
726     m_nPoints = cpts + 1;
727     m_xOutline = new double [m_nPoints];
728     m_yOutline = new double [m_nPoints];
729     
730     calcArcPoints (m_xOutline, m_yOutline, cpts, 0.0, m_v, radius, start, stop);
731     m_xOutline[cpts] = -m_u;
732     m_yOutline[cpts] = 0.0;
733     break;
734   default:
735     sys_error(ERR_WARNING, "illegal pelem type %d [makeVectorOutline]", m_type);
736     return;
737   }
738   
739   rotate2d (m_xOutline, m_yOutline, m_nPoints, m_rot);
740   xlat2d (m_xOutline, m_yOutline, m_nPoints, m_cx, m_cy);
741   
742   minmax_array (m_xOutline, m_nPoints, m_xmin, m_xmax);
743   minmax_array (m_yOutline, m_nPoints, m_ymin, m_ymax);
744   
745   // increase pelem extent by SCALE_PELEM_EXTENT to eliminate chance of
746   //   missing actual pelem maximum due to polygonal sampling 
747   
748   xfact = (m_xmax - m_xmin) * SCALE_PELEM_EXTENT;
749   yfact = (m_ymax - m_ymin) * SCALE_PELEM_EXTENT;
750   
751   m_xmin -= xfact;
752   m_ymin -= yfact;
753   m_xmax += xfact;
754   m_ymax += yfact;
755 }
756
757
758 /* NAME
759 *   calc_arc                    Calculate outline of a arc of a circle
760 *
761 * SYNOPSIS
762 *   calc_arc (x, y, xcent, ycent, pts, r, start, stop)
763 *   double x[], y[];            Array of points
764 *   int pts                     Number of points in array
765 *   double xcent, ycent Center of cirlce
766 *   double r                    Radius of circle
767 *   double start, stop          Beginning & ending angles
768 */
769
770 void 
771 PhantomElement::calcArcPoints (double x[], double y[], const int pts, const double xcent, const double ycent, const double r, const double start, const double stop)
772 {
773   if (r <= 0.0)
774     sys_error (ERR_WARNING, "negative or zero radius in calc_arc()");
775   
776   double theta = (stop - start) / (pts - 1);    // angle incr. between points 
777   double c = cos(theta);
778   double s = sin(theta);
779   
780   x[0] = r * cos (start) + xcent;
781   y[0] = r * sin (start) + ycent;
782   
783   double xp = x[0] - xcent;
784   double yp = y[0] - ycent;
785   for (int i = 1; i < pts; i++) {
786     double xc = c * xp - s * yp;
787     double yc = s * xp + c * yp;
788     x[i] = xc + xcent;
789     y[i] = yc + ycent;
790     xp = xc;  yp = yc;
791   }
792 }
793
794
795 // NAME
796 //   PhantomElement::calcEllipsePoints    Calculate outline of a ellipse
797 //
798 // SYNOPSIS
799 //   calcEllipsePoints ()
800 //
801
802
803 void 
804 PhantomElement::calcEllipsePoints (double x[], double y[], const int pts, const double u, const double v)
805 {
806   calcArcPoints (x, y, m_nPoints, 0.0, 0.0, 1.0, 0.0, TWOPI);   // make a unit circle 
807   scale2d (x, y, m_nPoints, m_u, m_v);                       // scale to ellipse 
808 }
809
810
811 /* NAME
812 *   circle_pts          Calculate number of points to use for circle segment
813 *
814 * SYNOPSIS
815 *   n = circle_pts (theta)
816 *   int n               Number of points to use for arc
817 *   double theta        Length of arc in radians
818 */
819
820 int 
821 PhantomElement::numCirclePoints (double theta)
822 {
823   theta = clamp (theta, 0., TWOPI);
824   
825   return static_cast<int> (POINTS_PER_CIRCLE * theta / TWOPI + 1.5);
826 }
827
828
829 bool
830 PhantomElement::clipLineWorldCoords (double& x1, double& y1, double& x2, double &y2) const
831 {
832   /* check if ray is outside of pelem extents */
833   double cx1 = x1, cy1 = y1, cx2 = x2, cy2 = y2;
834   if (! clip_rect (cx1, cy1, cx2, cy2, m_rectLimits))
835     return false;
836   
837   // convert phantom coordinates to pelem coordinates 
838   xform_mtx2 (m_xformPhmToObj, x1, y1);
839   xform_mtx2 (m_xformPhmToObj, x2, y2);
840   
841   if (! clipLineNormalizedCoords (x1, y1, x2, y2))
842     return false;
843   
844   // convert standard pelem coordinates back to phantom coordinates 
845   xform_mtx2 (m_xformObjToPhm, x1, y1);
846   xform_mtx2 (m_xformObjToPhm, x2, y2);
847   
848   return true;
849 }
850
851
852 /* NAME
853 *   pelem_clip_line                     Clip pelem against an arbitrary line
854 *
855 * SYNOPSIS
856 *   pelem_clip_line (pelem, x1, y1, x2, y2)
857 *   PhantomElement& pelem;              Pelem to be clipped
858 *   double *x1, *y1, *x2, *y2   Endpoints of line to be clipped
859 *
860 * RETURNS
861 *   true   if line passes through pelem
862 *               (x1, y1, x2, y2 hold coordinates of new line)
863 *   false  if line do not pass through pelem
864 *               (x1, y1, x2, y2 are undefined)
865 */
866
867 bool
868 PhantomElement::clipLineNormalizedCoords (double& x1, double& y1, double& x2, double& y2) const
869 {
870   bool accept = false;
871   
872   switch (m_type) {
873   case PELEM_RECTANGLE:
874     double rect[4];
875     rect[0] = -1.0;  rect[1] = -1.0;
876     rect[2] = 1.0;  rect[3] = 1.0;
877     accept = clip_rect (x1, y1, x2, y2, rect);
878     break;
879   case PELEM_ELLIPSE:
880     accept = clip_circle (x1, y1, x2, y2, 0.0, 0.0, 1.0, 0.0, 0.0);
881     break;
882   case PELEM_TRIANGLE:
883     accept = clip_triangle (x1, y1, x2, y2, 1.0, 1.0, true);
884     break;
885   case PELEM_SEGMENT:
886     accept = clip_segment (x1, y1, x2, y2, m_u, m_v);
887     break;
888   case PELEM_SECTOR:
889     accept = clip_sector (x1, y1, x2, y2, m_u, m_v);
890     break;
891   default:
892     sys_error (ERR_WARNING, "Illegal pelem type %d [pelem_clip_line]", m_type);
893     break;
894   }
895   
896   return(accept);
897 }
898
899
900 // METHOD IDENTIFICATION 
901 //    PhantomElement::isPointInside             Check if point is inside pelem
902 //
903 // SYNOPSIS
904 //    is_point_inside (pelem, x, y, coord_type)
905 //    double x, y               Point to see if lies in pelem
906 //    int coord_type            Coordinate type (PELEM_COORD or PHM_COORD)
907 //
908 // RETURNS
909 //    true if point lies within pelem
910 //    false if point lies outside of pelem
911
912 bool
913 PhantomElement::isPointInside (double x, double y, const CoordType coord_type) const
914 {
915   if (coord_type == PHM_COORD) {
916     xform_mtx2 (m_xformPhmToObj, x, y);
917   } else if (coord_type != PELEM_COORD) {
918     sys_error(ERR_WARNING, "Illegal coordinate type in pelem_is_point_inside");
919     return (false);
920   }
921   
922   switch (m_type) {
923   case PELEM_RECTANGLE:
924     if (x > 1. || x < -1. || y > 1. || y < -1.)
925       return (false);
926     else
927       return (true);
928     break;
929   case PELEM_TRIANGLE:
930     if (y < 0. || y > 1. - x || y > 1. + x)
931       return (false);
932     else
933       return (true);
934     break;
935   case PELEM_ELLIPSE:
936     if (x > 1. || x < -1. || y > 1. || y < -1.)
937       return (false);
938     if (x * x + y * y > 1.)             // check if inside unit circle
939       return (false);
940     else
941       return (true);
942     break;
943     
944     // for clipping segments & sectors, must NOT scale by (1/u, 1/v)
945     // because this destroys information about size of arc component 
946     
947   case PELEM_SEGMENT:
948     if (x > 1. || x < -1. || y > 0.)
949       return (false);           // clip against y > 0 
950     x *= m_u;                   // put back u & v scale 
951     y *= m_v;
952     if (x * x + (y-m_v) * (y-m_v) > m_u * m_u + m_v * m_v)
953       return (false);           // clip against circle, r = sqrt(@)
954     else
955       return (true);
956     break;
957   case PELEM_SECTOR:
958     if (x > 1. || x < -1. || y > 1.)   // extent 
959       return (false);
960     if (y > 1. - x || y > 1. + x)      // triangle      
961       return (false);                  // clip against triangle 
962     x *= m_u;                  // circle: put back u & v scale 
963     y *= m_v;
964     if (x * x + (y-m_v) * (y-m_v) > m_u * m_u + m_v * m_v)
965       return (false);                  // clip against circle 
966     else
967       return (true);
968     break;
969   default:
970     sys_error (ERR_WARNING, "Illegal pelem type in pelem_is_point_inside()");
971     break;
972   }
973   
974   return (false);
975 }
976
977