libctsim/phantom.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **     Name:                   phm.cpp
   5 **     Purpose:                Routines for phantom objects
   6 **     Progammer:              Kevin Rosenberg
   7 **     Date Started:           Aug 1984
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: phantom.cpp,v 1.23 2000/12/21 03:40:58 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 #include "ct.h"
  29
  30 const int PhantomElement::POINTS_PER_CIRCLE = 360;\r
  31 const double PhantomElement::SCALE_PELEM_EXTENT=0.005;  // increase pelem limits by 0.5% \r
  32
  33 const int Phantom::PHM_INVALID = -1;
  34 const int Phantom::PHM_HERMAN = 0;
  35 const int Phantom::PHM_B_HERMAN = 1;
  36 const int Phantom::PHM_SHEPP_LOGAN = 2;
  37 const int Phantom::PHM_B_SHEPP_LOGAN = 3;
  38 const int Phantom::PHM_UNITPULSE = 4;
  39
  40 const char* Phantom::s_aszPhantomName[] =
  41 {
  42   {"herman"},
  43   {"herman-b"},
  44   {"shepp-logan"},
  45   {"shepp-logan-b"},
  46   {"unitpulse"},
  47 };
  48
  49 const char* Phantom::s_aszPhantomTitle[] =
  50 {
  51   {"Herman Head"},
  52   {"Herman Head (Bordered)"},
  53   {"Shepp-Logan"},
  54   {"Shepp-Logan (Bordered)"},
  55   {"Unit Pulse"},
  56 };
  57
  58 const int Phantom::s_iPhantomCount = sizeof(s_aszPhantomName) / sizeof(const char*);
  59
  60
  61 // CLASS IDENTIFICATION
  62 //   Phantom
  63 //
  64
  65 Phantom::Phantom ()
  66 {
  67   init ();
  68 }
  69
  70
  71 Phantom::Phantom (const char* const phmName)
  72 {
  73   init ();
  74   createFromPhantom (phmName);
  75 }
  76
  77 void
  78 Phantom::init ()
  79 {
  80   m_nPElem = 0;
  81   m_xmin = 1E30;
  82   m_xmax = -1E30;
  83   m_ymin = 1E30;
  84   m_ymax = -1E30;
  85   m_diameter = 0;
  86   m_composition = P_PELEMS;
  87   m_fail = false;
  88   m_id = PHM_INVALID;
  89 }
  90
  91 Phantom::~Phantom ()
  92 {
  93   for (PElemIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++) {
  94     delete *i;
  95   }
  96 }
  97
  98
  99 const char*
 100 Phantom::convertPhantomIDToName (int phmID)
 101 {
 102   static const char *name = "";
 103
 104   if (phmID >= 0 && phmID < s_iPhantomCount)
 105       return (s_aszPhantomName[phmID]);
 106
 107   return (name);
 108 }
 109
 110 const char*
 111 Phantom::convertPhantomIDToTitle (int phmID)
 112 {
 113   static const char *title = "";
 114
 115   if (phmID >= 0 && phmID < s_iPhantomCount)
 116       return (s_aszPhantomName[phmID]);
 117
 118   return (title);
 119 }
 120
 121 int
 122 Phantom::convertNameToPhantomID (const char* const phmName)
 123 {
 124   int id = PHM_INVALID;
 125
 126   for (int i = 0; i < s_iPhantomCount; i++)
 127       if (strcasecmp (phmName, s_aszPhantomName[i]) == 0) {
 128           id = i;
 129           break;
 130       }
 131
 132   return (id);
 133 }
 134
 135
 136 bool
 137 Phantom::createFromPhantom (const char* const phmName)
 138 {
 139   int phmid = convertNameToPhantomID (phmName);
 140   if (phmid == PHM_INVALID) {
 141     m_fail = true;
 142     m_failMessage = "Invalid phantom name ";
 143     m_failMessage += phmName;
 144     return false;
 145   }
 146
 147   m_name = phmName;
 148   createFromPhantom (phmid);
 149   return true;
 150 }
 151
 152 bool
 153 Phantom::createFromPhantom (const int phmid)
 154 {
 155   switch (phmid)
 156     {
 157     case PHM_HERMAN:
 158       addStdHerman();
 159       break;
 160     case PHM_B_HERMAN:
 161       addStdHermanBordered();
 162       break;
 163     case PHM_SHEPP_LOGAN:
 164       addStdSheppLogan();
 165       break;
 166     case PHM_B_SHEPP_LOGAN:
 167       addStdSheppLoganBordered();
 168       break;
 169     case PHM_UNITPULSE:
 170       m_composition = P_UNIT_PULSE;
 171       addPElem ("rectangle", 0., 0., 100., 100., 0., 0.);     // outline
 172       addPElem ("ellipse", 0., 0., 1., 1., 0., 1.);           // pulse
 173       break;
 174     default:
 175       m_fail = true;
 176       m_failMessage = "Illegal phantom id ";
 177       m_failMessage += phmid;
 178       return false;
 179     }
 180
 181   m_id = phmid;
 182
 183   return true;
 184 }
 185
 186
 187 /* METHOD IDENTIFICATION
 188  *   createFromFile          Add PhantomElements from file
 189  *
 190  * SYNOPSIS
 191  *   createFromFile (filename)
 192  *
 193  * RETURNS
 194  *   true if pelem were added
 195  *   false if an pelem not added
 196  */
 197
 198 bool
 199 Phantom::createFromFile (const char* const fname)
 200 {
 201   bool bGoodFile = true;
 202   FILE *fp;
 203
 204   if ((fp = fopen (fname, "r")) == NULL)
 205     return (false);
 206
 207   m_name = fname;
 208
 209   while (1) {
 210     double cx, cy, u, v, rot, dens;
 211     char pelemtype[80];
 212
 213     int status = fscanf (fp, "%79s %lf %lf %lf %lf %lf %lf", pelemtype, &cx, &cy, &u, &v, &rot, &dens);
 214
 215     if (status == static_cast<int>(EOF))
 216       break;
 217     else if (status != 7) {
 218       sys_error (ERR_WARNING, "Insufficient fields reading phantom file %s [Phantom::createFromFile]", fname);
 219       bGoodFile = false;
 220     }
 221     addPElem (pelemtype, cx, cy, u, v, rot, dens);
 222   }
 223
 224   fclose (fp);
 225
 226   return (bGoodFile);
 227 }
 228
 229
 230 /* NAME
 231  *   addPElem           Add pelem
 232  *
 233  * SYNOPSIS
 234  *   addPElem (type, cx, cy, u, v, rot, atten)
 235  *   char *type         type of pelem (box, ellipse, etc)
 236  *   double cx, cy      pelem center
 237  *   double u,v         pelem size
 238  *   double rot         rotation angle of pelem (in degrees)
 239  *   double atten       x-ray attenuation cooefficient
 240  */
 241
 242 void
 243 Phantom::addPElem (const char *type, const double cx, const double cy, const double u, const double v, const double rot, const double atten)
 244 {
 245   PhantomElement *pelem = new PhantomElement (type, cx, cy, u, v, rot, atten);
 246
 247   m_listPElem.push_front (pelem);
 248
 249   // update phantom limits
 250   if (m_xmin > pelem->xmin())    m_xmin = pelem->xmin();
 251   if (m_xmax < pelem->xmax())    m_xmax = pelem->xmax();
 252   if (m_ymin > pelem->ymin())    m_ymin = pelem->ymin();
 253   if (m_ymax < pelem->ymax())    m_ymax = pelem->ymax();
 254
 255   if (m_diameter < pelem->diameter())
 256     m_diameter = pelem->diameter();
 257
 258   //  m_diameter = lineLength(m_xmin, m_ymin, m_xmax, m_ymax);
 259
 260   m_nPElem++;
 261 }
 262
 263
 264 /*----------------------------------------------------------------------*/
 265 /*                      Input-Output Routines                           */
 266 /*----------------------------------------------------------------------*/
 267
 268
 269 /* NAME
 270  *   print                              Print vertices of Phantom pelems
 271  *
 272  * SYNOPSIS
 273  *   print (phm)
 274  */
 275
 276 void
 277 Phantom::print () const
 278 {
 279   printf("PRINTING Phantom\n\n");
 280   printf("number of pelems in Phantom = %d\n", m_nPElem);
 281   printf("limits: xmin=%8.2g  ymin=%8.2g  xmax=%8.2g  ymax=%8.2g\n",
 282          m_xmin, m_ymin, m_xmax, m_ymax);
 283
 284   for (PElemIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++) {
 285       printf("PELEM:\n");
 286       printf("# pts=%3d atten = %7.4f   rot = %7.2f (deg)\n",
 287              (*i)->nOutlinePoints(), (*i)->atten(), convertRadiansToDegrees ((*i)->rot()));
 288
 289     printf("xmin=%7.3g  ymin=%7.3g  xmax=%7.3g  ymax=%7.3g\n",
 290            (*i)->xmin(), (*i)->ymin(), (*i)->xmax(), (*i)->ymax());
 291
 292     //    for (int i = 0; i < m_nPoints; i++)
 293     //      printf("\t%8.3g    %8.3g\n", i->xOutline()[i], i->yOutline()[i]);
 294   }
 295 }
 296
 297
 298 /* NAME
 299  *   show               Show vector outline of Phantom to user
 300  *
 301  * SYNOPSIS
 302  *   show (pic)
 303  */
 304
 305 #ifdef HAVE_SGP
 306 void
 307 Phantom::show () const
 308 {
 309   SGPDriver driverSGP ("Phantom Show");
 310   SGP sgp (driverSGP);
 311
 312   show (sgp);
 313
 314   std::cout << "Press return to continue";
 315   cio_kb_getc();
 316 }
 317
 318 void
 319 Phantom::show (SGP& sgp) const
 320 {
 321   double wsize = m_xmax - m_xmin;
 322   if ((m_ymax - m_ymin) > wsize)
 323       wsize = m_ymax - m_ymin;
 324   wsize *= 1.01;
 325   double halfWindow = wsize / 2;
 326
 327   double xcent = m_xmin + (m_xmax - m_xmin) / 2;
 328   double ycent = m_ymin + (m_ymax - m_ymin) / 2;
 329
 330   sgp.setWindow (xcent - halfWindow, ycent - halfWindow, xcent + halfWindow, ycent + halfWindow);
 331
 332   draw (sgp);
 333 }
 334 #endif
 335
 336
 337 /* NAME
 338  *   draw               Draw vector outline of Phantom
 339  *
 340  * SYNOPSIS
 341  *   draw ()
 342  */
 343
 344 #ifdef HAVE_SGP
 345 void
 346 Phantom::draw (SGP& sgp) const
 347 {
 348   for (PElemIterator i = m_listPElem.begin(); i != m_listPElem.end(); i++)
 349     sgp.polylineAbs ((*i)->xOutline(), (*i)->yOutline(), (*i)->nOutlinePoints());
 350 }
 351 #endif
 352
 353
 354 /* NAME
 355  *   addStdSheppLogan   Make head phantom of Shepp-Logan
 356  *
 357  * REFERENCES
 358  *   S. W. Rowland, "Computer Implementation of Image Reconstruction
 359  *      Formulas", in "Image Reconstruction from Projections: Implementation
 360  *      and Applications", edited by G. T. Herman, 1978.
 361  */
 362
 363 void
 364 Phantom::addStdSheppLogan ()
 365 {
 366   addPElem ("ellipse",  0.0000,  0.0000, 0.6900,  0.9200,   0.0,  1.00);
 367   addPElem ("ellipse",  0.0000, -0.0184, 0.6624,  0.8740,   0.0, -0.98);
 368   addPElem ("ellipse",  0.2200,  0.0000, 0.1100,  0.3100, -18.0, -0.02);
 369   addPElem ("ellipse", -0.2200,  0.0000, 0.1600,  0.4100,  18.0, -0.02);
 370   addPElem ("ellipse",  0.0000,  0.3500, 0.2100,  0.2500,   0.0,  0.01);
 371   addPElem ("ellipse",  0.0000,  0.1000, 0.0460,  0.0460,   0.0,  0.01);
 372   addPElem ("ellipse",  0.0000, -0.1000, 0.0460,  0.0460,   0.0,  0.01);
 373   addPElem ("ellipse", -0.0800, -0.6050, 0.0460,  0.0230,   0.0,  0.01);
 374   addPElem ("ellipse",  0.0000, -0.6050, 0.0230,  0.0230,   0.0,  0.01);
 375   addPElem ("ellipse",  0.0600, -0.6050, 0.0230,  0.0230,   0.0,  0.01);
 376   addPElem ("ellipse",  0.5538, -0.3858, 0.0330,  0.2060, -18.0,  0.03);
 377 }
 378
 379 void
 380 Phantom::addStdSheppLoganBordered ()
 381 {
 382   addStdSheppLogan ();
 383   addPElem ("rectangle", 0.000, 0.0000, 0.8600, 1.150, 0.0, 0.00);
 384 }
 385
 386 /* NAME
 387  *   addStdHerman                       Standard head phantom of G. T. Herman
 388  *
 389  * REFERENCES
 390  *   G. T. Herman, "Image Reconstructions from Projections:  The Fundementals
 391  *      of Computed Tomography", 1979.
 392  */
 393
 394 void
 395 Phantom::addStdHerman ()
 396 {
 397   addPElem ("ellipse",  0.000,  1.50,  0.375, 0.3000,  90.00, -0.003);
 398   addPElem ("ellipse",  0.675, -0.75,  0.225, 0.1500, 140.00,  0.010);
 399   addPElem ("ellipse",  0.750,  1.50,  0.375, 0.2250,  50.00,  0.003);
 400   addPElem ("segment",  1.375, -7.50,  1.100, 0.6250,  19.20, -0.204);
 401   addPElem ("segment",  1.375, -7.50,  1.100, 4.3200,  19.21,  0.204);
 402   addPElem ("segment",  0.000, -2.25,  1.125, 0.3750,   0.00, -0.003);
 403   addPElem ("segment",  0.000, -2.25,  1.125, 3.0000,   0.00,  0.003);
 404   addPElem ("segment", -1.000,  3.75,  1.000, 0.5000, 135.00, -0.003);
 405   addPElem ("segment", -1.000,  3.75,  1.000, 3.0000, 135.00,  0.003);
 406   addPElem ("segment",  1.000,  3.75,  1.000, 0.5000, 225.00, -0.003);
 407   addPElem ("segment",  1.000,  3.75,  1.000, 3.0000, 225.00,  0.003);
 408   addPElem ("triangle", 5.025,  3.75,  1.125, 0.5000, 110.75,  0.206);
 409   addPElem ("triangle",-5.025,  3.75,  1.125, 0.9000,-110.75,  0.206);
 410   addPElem ("ellipse",  0.000,  0.00,  8.625, 6.4687,  90.00,  0.416);
 411   addPElem ("ellipse",  0.000,  0.00,  7.875, 5.7187,  90.00, -0.206);
 412 }
 413
 414 void
 415 Phantom::addStdHermanBordered ()
 416 {
 417   addStdHerman();
 418   addPElem ("rectangle",  0.000, 0.00, 10.780, 8.110,  90.00, 0.000);
 419 }
 420
 421
 422 /* NAME
 423  *    convertToImagefile                Make image array from Phantom
 424  *
 425  * SYNOPSIS
 426  *    pic_to_imagefile (pic, im, nsample)
 427  *    Phantom& pic              Phantom definitions
 428  *    ImageFile  *im            Computed pixel array
 429  *    int nsample               Number of samples along each axis for each pixel
 430  *                              (total samples per pixel = nsample * nsample)
 431  */
 432
 433 void
 434 Phantom::convertToImagefile (ImageFile& im, const int in_nsample, const int trace) const
 435 {
 436   convertToImagefile (im, in_nsample, trace, 0, im.nx(), true);
 437 }
 438
 439 void
 440 Phantom::convertToImagefile (ImageFile& im, const int in_nsample, const int trace, const int colStart, const int colCount, bool bStoreAtColumnPos) const
 441 {
 442   int nx = im.nx();
 443   int ny = im.ny();
 444   if (nx < 2 || ny < 2)
 445       return;
 446
 447   int nsample = in_nsample;
 448   if (nsample < 1)
 449     nsample = 1;
 450
 451   double dx = m_xmax - m_xmin;
 452   double dy = m_ymax - m_ymin;
 453   double xcent = m_xmin + dx / 2;
 454   double ycent = m_ymin + dy / 2;
 455   double phmlen = (dx > dy ? dx : dy);
 456
 457   double phmradius = phmlen / 2;
 458
 459   double xmin = xcent - phmradius;
 460   double xmax = xcent + phmradius;
 461   double ymin = ycent - phmradius;
 462   double ymax = ycent + phmradius;
 463
 464   // Each pixel holds the average of the intensity of the cell with (ix,iy) at the center of the pixel
 465   // Set major increments so that the last cell v[nx-1][ny-1] will start at xmax - xinc, ymax - yinc).
 466   // Set minor increments so that sample points are centered in cell
 467
 468   double xinc = (xmax - xmin) / nx;
 469   double yinc = (ymax - ymin) / ny;
 470
 471   double kxinc = xinc / nsample;                /* interval between samples */
 472   double kyinc = yinc / nsample;
 473   double kxofs = kxinc / 2;             /* offset of 1st point */
 474   double kyofs = kyinc / 2;
 475
 476   im.setAxisExtent (xmin, xmax, ymin, ymax);
 477   im.setAxisIncrement (xinc, yinc);
 478
 479   ImageFileArray v = im.getArray();
 480
 481   for (int ix = 0; ix < colCount; ix++)
 482     for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
 483       int iColStore = ix;
 484       if (bStoreAtColumnPos)
 485                 iColStore += colStart;
 486       v[iColStore][iy] = 0;
 487     }
 488
 489   double x_start = xmin + (colStart * xinc);
 490   for (PElemConstIterator pelem = m_listPElem.begin(); pelem != m_listPElem.end(); pelem++) {
 491       const PhantomElement& rPElem = **pelem;
 492       double x, y, xi, yi;
 493       int ix, iy, kx, ky;
 494       for (ix = 0, x = x_start; ix < colCount; ix++, x += xinc) {
 495         int iColStore = ix;
 496         if (bStoreAtColumnPos)
 497           iColStore += colStart;
 498         for (iy = 0, y = ymin; iy < ny; iy++, y += yinc) {
 499           for (kx = 0, xi = x + kxofs; kx < nsample; kx++, xi += kxinc) {
 500             for (ky = 0, yi = y + kyofs; ky < nsample; ky++, yi += kyinc)
 501               if (rPElem.isPointInside (xi, yi, PHM_COORD) == TRUE)
 502                         v[iColStore][iy] += rPElem.atten();
 503               } // for kx
 504           } /* for iy */
 505       }  /* for ix */
 506   }  /* for pelem */
 507
 508
 509   if (nsample > 1) {
 510     double factor = 1.0 / static_cast<double>(nsample * nsample);
 511
 512 \r
 513     for (int ix = 0; ix < colCount; ix++) {
 514                 int iColStore = ix;\r
 515                 if (bStoreAtColumnPos)\r
 516                         iColStore += colStart;\r
 517                 for (int iy = 0; iy < ny; iy++)
 518                         v[iColStore][iy] *= factor;\r
 519         }
 520   }
 521 }
 522
 523 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 524 // CLASS IDENTIFICATION
 525 //
 526 //      PhantomElement
 527 //
 528 // PURPOSE
 529 //
 530 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 531
 532
 533 PhantomElement::PhantomElement (const char *type, const double cx, const double cy, const double u, const double v, const double rot, const double atten)
 534     : m_cx(cx), m_cy(cy), m_u(u), m_v(v), m_atten(atten), m_nPoints(0), m_xOutline(0), m_yOutline(0)
 535 {
 536   m_rot = convertDegreesToRadians (rot);   // convert angle to radians
 537
 538   m_type = convertNameToType (type);
 539
 540   makeTransformMatrices ();     // calc transform matrices between phantom and normalized phantomelement
 541   makeVectorOutline ();         // calculate vector outline of pelem
 542
 543   // Find maximum diameter of Object
 544   double r2Max = 0;
 545   for (int i = 0; i < m_nPoints; i++) {
 546     double r2 = (m_xOutline[i] * m_xOutline[i]) + (m_yOutline[i] * m_yOutline[i]);
 547     if (r2 > r2Max)
 548       r2Max = r2;
 549   }
 550   m_diameter = 2 * sqrt( r2Max );
 551
 552   m_rectLimits[0] = m_xmin;   m_rectLimits[1] = m_ymin;
 553   m_rectLimits[2] = m_xmax;   m_rectLimits[3] = m_ymax;
 554 }
 555
 556
 557 PhantomElement::~PhantomElement ()
 558 {
 559     delete m_xOutline;
 560     delete m_yOutline;
 561 }
 562
 563 PhmElemType
 564 PhantomElement::convertNameToType (const char* const typeName)
 565 {
 566     PhmElemType type = PELEM_INVALID;
 567
 568     if (strcasecmp (typeName, "rectangle") == 0)
 569         type = PELEM_RECTANGLE;
 570     else if (strcasecmp (typeName, "triangle") == 0)
 571         type = PELEM_TRIANGLE;
 572     else if (strcasecmp (typeName, "ellipse") == 0)
 573         type = PELEM_ELLIPSE;
 574     else if (strcasecmp (typeName, "sector") == 0)
 575         type = PELEM_SECTOR;
 576     else if (strcasecmp (typeName, "segment") == 0)
 577       type = PELEM_SEGMENT;
 578     else
 579         sys_error (ERR_WARNING, "Unknown PhantomElement type %s [PhantomElement::PhantomElement]", type);
 580
 581     return (type);
 582 }
 583
 584 void
 585 PhantomElement::makeTransformMatrices ()
 586 {
 587   GRFMTX_2D temp;
 588
 589   // To map normalized Pelem coords to world Phantom
 590   //     scale by (u, v)
 591   //     rotate by rot
 592   //     translate by (cx, cy)
 593
 594   scale_mtx2 (m_xformObjToPhm, m_u, m_v);
 595   rot_mtx2  (temp, m_rot);
 596   mult_mtx2 (m_xformObjToPhm, temp, m_xformObjToPhm);
 597   xlat_mtx2 (temp, m_cx, m_cy);
 598   mult_mtx2 (m_xformObjToPhm, temp, m_xformObjToPhm);
 599
 600   // to map world Phantom coodinates to normalized PElem coords
 601   //     translate by (-cx, -cy)
 602   //     rotate by -rot
 603   //     scale by (1/u, 1/v)
 604
 605   xlat_mtx2 (m_xformPhmToObj, -m_cx, -m_cy);
 606   rot_mtx2  (temp, -m_rot);
 607   mult_mtx2 (m_xformPhmToObj, temp, m_xformPhmToObj);
 608   scale_mtx2 (temp, 1 / m_u, 1 / m_v);
 609   mult_mtx2 (m_xformPhmToObj, temp, m_xformPhmToObj);
 610 }
 611
 612
 613 /* NAME
 614  *   pelem_make_points          INTERNAL routine to calculate point array for an pelem
 615  *
 616  * SYNOPSIS
 617  *   makepelempts (pelem)
 618  *   PELEM *pelem       pelem whose points we are calculating
 619  *
 620  * NOTES
 621  *   Called by phm_add_pelem()
 622  */
 623
 624 void
 625 PhantomElement::makeVectorOutline ()
 626 {
 627   double radius, theta, start, stop;
 628   double xfact, yfact;
 629   int cpts;
 630
 631   m_nPoints = 0;
 632   switch (m_type) {
 633   case PELEM_RECTANGLE:
 634     m_nPoints = 5;
 635     m_xOutline = new double [m_nPoints];
 636     m_yOutline = new double [m_nPoints];
 637     m_xOutline[0] =-m_u;        m_yOutline[0] =-m_v;
 638     m_xOutline[1] = m_u;        m_yOutline[1] =-m_v;
 639     m_xOutline[2] = m_u;        m_yOutline[2] = m_v;
 640     m_xOutline[3] =-m_u;        m_yOutline[3] = m_v;
 641     m_xOutline[4] =-m_u;        m_yOutline[4] =-m_v;
 642     break;
 643   case PELEM_TRIANGLE:
 644     m_nPoints = 4;
 645     m_xOutline = new double [m_nPoints];
 646     m_yOutline = new double [m_nPoints];
 647     m_xOutline[0] =-m_u;        m_yOutline[0] = 0.0;
 648     m_xOutline[1] = m_u;        m_yOutline[1] = 0.0;
 649     m_xOutline[2] = 0.0;        m_yOutline[2] = m_v;
 650     m_xOutline[3] =-m_u;        m_yOutline[3] = 0.0;
 651     break;
 652   case PELEM_ELLIPSE:
 653     cpts = numCirclePoints (TWOPI);
 654     m_nPoints = cpts;
 655     m_xOutline = new double [m_nPoints];
 656     m_yOutline = new double [m_nPoints];
 657     calcEllipsePoints (m_xOutline, m_yOutline, cpts, m_u, m_v);
 658     break;
 659   case PELEM_SECTOR:
 660     radius = sqrt(m_u * m_u + m_v * m_v);
 661     theta = atan(m_u / m_v);            // angle with y-axis
 662     start = 3.0 * HALFPI - theta;
 663     stop  = 3.0 * HALFPI + theta;
 664     cpts = numCirclePoints (stop - start);
 665     m_nPoints = 3 + cpts;
 666     m_xOutline = new double [m_nPoints];
 667     m_yOutline = new double [m_nPoints];
 668
 669     m_xOutline[0] = 0.0;                m_yOutline[0] = m_v;
 670     m_xOutline[1] =-m_u;                m_yOutline[1] = 0.0;
 671     calcArcPoints (&m_xOutline[2], &m_yOutline[2], cpts, 0.0, m_v, radius, start, stop);
 672     m_xOutline[cpts + 2] = 0.0;
 673     m_yOutline[cpts + 2] = m_v;
 674     break;
 675   case PELEM_SEGMENT:
 676     radius = sqrt(m_u * m_u + m_v * m_v);
 677     theta = atan (m_u / m_v);           // angle with y-axis
 678     start = 3.0 * HALFPI - theta;
 679     stop  = 3.0 * HALFPI + theta;
 680
 681     cpts = numCirclePoints (stop - start);
 682     m_nPoints = cpts + 1;
 683     m_xOutline = new double [m_nPoints];
 684     m_yOutline = new double [m_nPoints];
 685
 686     calcArcPoints (m_xOutline, m_yOutline, cpts, 0.0, m_v, radius, start, stop);
 687     m_xOutline[cpts] = -m_u;
 688     m_yOutline[cpts] = 0.0;
 689     break;
 690   default:
 691     sys_error(ERR_WARNING, "illegal pelem type %d [makeVectorOutline]", m_type);
 692     return;
 693   }
 694
 695   rotate2d (m_xOutline, m_yOutline, m_nPoints, m_rot);
 696   xlat2d (m_xOutline, m_yOutline, m_nPoints, m_cx, m_cy);
 697
 698   minmax_array (m_xOutline, m_nPoints, m_xmin, m_xmax);
 699   minmax_array (m_yOutline, m_nPoints, m_ymin, m_ymax);
 700
 701   // increase pelem extent by SCALE_PELEM_EXTENT to eliminate chance of
 702   //   missing actual pelem maximum due to polygonal sampling
 703
 704   xfact = (m_xmax - m_xmin) * SCALE_PELEM_EXTENT;
 705   yfact = (m_ymax - m_ymin) * SCALE_PELEM_EXTENT;
 706
 707   m_xmin -= xfact;
 708   m_ymin -= yfact;
 709   m_xmax += xfact;
 710   m_ymax += yfact;
 711 }
 712
 713
 714 /* NAME
 715  *   calc_arc                   Calculate outline of a arc of a circle
 716  *
 717  * SYNOPSIS
 718  *   calc_arc (x, y, xcent, ycent, pts, r, start, stop)
 719  *   double x[], y[];           Array of points
 720  *   int pts                    Number of points in array
 721  *   double xcent, ycent        Center of cirlce
 722  *   double r                   Radius of circle
 723  *   double start, stop         Beginning & ending angles
 724  */
 725
 726 void
 727 PhantomElement::calcArcPoints (double x[], double y[], const int pts, const double xcent, const double ycent, const double r, const double start, const double stop)
 728 {
 729     if (r <= 0.0)
 730         sys_error (ERR_WARNING, "negative or zero radius in calc_arc()");
 731
 732     double theta = (stop - start) / (pts - 1);  // angle incr. between points
 733     double c = cos(theta);
 734     double s = sin(theta);
 735
 736     x[0] = r * cos (start) + xcent;
 737     y[0] = r * sin (start) + ycent;
 738
 739     double xp = x[0] - xcent;
 740     double yp = y[0] - ycent;
 741     for (int i = 1; i < pts; i++) {
 742         double xc = c * xp - s * yp;
 743         double yc = s * xp + c * yp;
 744         x[i] = xc + xcent;
 745         y[i] = yc + ycent;
 746         xp = xc;  yp = yc;
 747     }
 748 }
 749
 750
 751 // NAME
 752 //   PhantomElement::calcEllipsePoints    Calculate outline of a ellipse
 753 //
 754 // SYNOPSIS
 755 //   calcEllipsePoints ()
 756 //
 757
 758
 759 void
 760 PhantomElement::calcEllipsePoints (double x[], double y[], const int pts, const double u, const double v)
 761 {
 762     calcArcPoints (x, y, m_nPoints, 0.0, 0.0, 1.0, 0.0, TWOPI);   // make a unit circle
 763     scale2d (x, y, m_nPoints, m_u, m_v);                             // scale to ellipse
 764 }
 765
 766
 767 /* NAME
 768  *   circle_pts         Calculate number of points to use for circle segment
 769  *
 770  * SYNOPSIS
 771  *   n = circle_pts (theta)
 772  *   int n              Number of points to use for arc
 773  *   double theta       Length of arc in radians
 774  */
 775
 776 int
 777 PhantomElement::numCirclePoints (double theta)
 778 {
 779     theta = clamp (theta, 0., TWOPI);
 780
 781     return static_cast<int> (POINTS_PER_CIRCLE * theta / TWOPI + 1.5);
 782 }
 783
 784
 785 bool
 786 PhantomElement::clipLineWorldCoords (double& x1, double& y1, double& x2, double &y2) const
 787 {
 788   /* check if ray is outside of pelem extents */
 789   double cx1 = x1, cy1 = y1, cx2 = x2, cy2 = y2;
 790   if (! clip_rect (cx1, cy1, cx2, cy2, m_rectLimits))
 791     return false;
 792
 793   // convert phantom coordinates to pelem coordinates
 794   xform_mtx2 (m_xformPhmToObj, x1, y1);
 795   xform_mtx2 (m_xformPhmToObj, x2, y2);
 796
 797   if (! clipLineNormalizedCoords (x1, y1, x2, y2))
 798     return false;
 799
 800   // convert standard pelem coordinates back to phantom coordinates
 801   xform_mtx2 (m_xformObjToPhm, x1, y1);
 802   xform_mtx2 (m_xformObjToPhm, x2, y2);
 803
 804   return true;
 805 }
 806
 807
 808 /* NAME
 809  *   pelem_clip_line                    Clip pelem against an arbitrary line
 810  *
 811  * SYNOPSIS
 812  *   pelem_clip_line (pelem, x1, y1, x2, y2)
 813  *   PhantomElement& pelem;             Pelem to be clipped
 814  *   double *x1, *y1, *x2, *y2  Endpoints of line to be clipped
 815  *
 816  * RETURNS
 817  *   true   if line passes through pelem
 818  *              (x1, y1, x2, y2 hold coordinates of new line)
 819  *   false  if line do not pass through pelem
 820  *              (x1, y1, x2, y2 are undefined)
 821  */
 822
 823 bool
 824 PhantomElement::clipLineNormalizedCoords (double& x1, double& y1, double& x2, double& y2) const
 825 {
 826   bool accept = false;
 827
 828   switch (m_type) {
 829   case PELEM_RECTANGLE:
 830     double rect[4];
 831     rect[0] = -1.0;  rect[1] = -1.0;
 832     rect[2] = 1.0;  rect[3] = 1.0;
 833     accept = clip_rect (x1, y1, x2, y2, rect);
 834     break;
 835   case PELEM_ELLIPSE:
 836     accept = clip_circle (x1, y1, x2, y2, 0.0, 0.0, 1.0, 0.0, 0.0);
 837     break;
 838   case PELEM_TRIANGLE:
 839     accept = clip_triangle (x1, y1, x2, y2, 1.0, 1.0, true);
 840     break;
 841   case PELEM_SEGMENT:
 842     accept = clip_segment (x1, y1, x2, y2, m_u, m_v);
 843     break;
 844   case PELEM_SECTOR:
 845     accept = clip_sector (x1, y1, x2, y2, m_u, m_v);
 846     break;
 847   default:
 848     sys_error (ERR_WARNING, "Illegal pelem type %d [pelem_clip_line]", m_type);
 849     break;
 850   }
 851
 852   return(accept);
 853 }
 854
 855
 856 // METHOD IDENTIFICATION
 857 //    PhantomElement::isPointInside             Check if point is inside pelem
 858 //
 859 // SYNOPSIS
 860 //    is_point_inside (pelem, x, y, coord_type)
 861 //    double x, y               Point to see if lies in pelem
 862 //    int coord_type            Coordinate type (PELEM_COORD or PHM_COORD)
 863 //
 864 // RETURNS
 865 //    true if point lies within pelem
 866 //    false if point lies outside of pelem
 867
 868 bool
 869 PhantomElement::isPointInside (double x, double y, const CoordType coord_type) const
 870 {
 871   if (coord_type == PHM_COORD) {
 872     xform_mtx2 (m_xformPhmToObj, x, y);
 873   } else if (coord_type != PELEM_COORD) {
 874     sys_error(ERR_WARNING, "Illegal coordinate type in pelem_is_point_inside");
 875     return (false);
 876   }
 877
 878   switch (m_type) {
 879   case PELEM_RECTANGLE:
 880     if (x > 1. || x < -1. || y > 1. || y < -1.)
 881       return (false);
 882     else
 883       return (true);
 884     break;
 885   case PELEM_TRIANGLE:
 886     if (y < 0. || y > 1. - x || y > 1. + x)
 887       return (false);
 888     else
 889       return (true);
 890     break;
 891   case PELEM_ELLIPSE:
 892     if (x > 1. || x < -1. || y > 1. || y < -1.)
 893       return (false);
 894     if (x * x + y * y > 1.)             // check if inside unit circle
 895       return (false);
 896     else
 897       return (true);
 898     break;
 899
 900     // for clipping segments & sectors, must NOT scale by (1/u, 1/v)
 901     // because this destroys information about size of arc component
 902
 903   case PELEM_SEGMENT:
 904     if (x > 1. || x < -1. || y > 0.)
 905         return (false);         // clip against y > 0
 906     x *= m_u;                   // put back u & v scale
 907     y *= m_v;
 908     if (x * x + (y-m_v) * (y-m_v) > m_u * m_u + m_v * m_v)
 909       return (false);           // clip against circle, r = sqrt(@)
 910     else
 911       return (true);
 912     break;
 913   case PELEM_SECTOR:
 914       if (x > 1. || x < -1. || y > 1.)   // extent
 915       return (false);
 916       if (y > 1. - x || y > 1. + x)      // triangle
 917           return (false);                      // clip against triangle
 918       x *= m_u;                // circle: put back u & v scale
 919     y *= m_v;
 920     if (x * x + (y-m_v) * (y-m_v) > m_u * m_u + m_v * m_v)
 921         return (false);                // clip against circle
 922     else
 923       return (true);
 924   break;
 925   default:
 926     sys_error (ERR_WARNING, "Illegal pelem type in pelem_is_point_inside()");
 927     break;
 928   }
 929
 930   return (false);
 931 }
 932
 933