src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.68 2001/01/20 08:10:33 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
  29 #include "wx/wxprec.h"
  30
  31 #ifdef __BORLANDC__
  32 #pragma hdrstop
  33 #endif
  34
  35 #ifndef WX_PRECOMP
  36 #include "wx/wx.h"
  37 #endif
  38
  39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  41 #endif
  42
  43 #include "wx/image.h"
  44 #include "wx/progdlg.h"
  45
  46 #include "ct.h"
  47 #include "ctsim.h"
  48 #include "docs.h"
  49 #include "views.h"
  50 #include "dialogs.h"
  51 #include "dlgprojections.h"
  52 #include "dlgreconstruct.h"
  53 #include "backprojectors.h"
  54 #include "reconstruct.h"
  55 #include "timer.h"
  56
  57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  58 #include <sstream>
  59 #else
  60 #include <sstream_subst>
  61 #endif
  62
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 END_EVENT_TABLE()
  69
  70
  71 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  72 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
  73 {
  74   m_pView = v;
  75   m_xCursor = -1;
  76   m_yCursor = -1;
  77 }
  78
  79 void
  80 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  81 {
  82   if (m_pView)
  83     m_pView->OnDraw(& dc);
  84 }
  85
  86 void
  87 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  88 {
  89   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  90   int nx = rIF.nx();
  91   int ny = rIF.ny();
  92
  93   int yPt = ny - y - 1;
  94   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  95   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  96   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  97   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  98   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
  99 }
 100
 101 bool
 102 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 103 {
 104   x = m_xCursor;
 105   y = m_yCursor;
 106
 107   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 108     return true;
 109   else
 110     return false;
 111 }
 112
 113 void
 114 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 115 {
 116   if (! m_pView)
 117     return;
 118
 119   wxClientDC dc(this);
 120   PrepareDC(dc);
 121
 122   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 123
 124   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 125   if (! pIFDoc)
 126     return;
 127   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 128   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 129   int nx = rIF.nx();
 130   int ny = rIF.ny();
 131   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 132   if (event.RightIsDown()) {
 133     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 134       std::ostringstream os;
 135       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 136       if (rIF.isComplex()) {
 137         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 138         if (dImag < 0)
 139           os << " - " << -dImag;
 140         else
 141           os << " + " << dImag;
 142         os << "i\n";
 143       } else
 144         os << "\n";
 145       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 146     } else
 147       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 148   }
 149   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 150     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 151       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 152         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 153       }
 154       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 155       m_xCursor = pt.x;
 156       m_yCursor = yPt;
 157     } else
 158       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 159   }
 160   if (event.LeftUp()) {
 161     std::ostringstream os;
 162     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 163     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 164   }
 165 }
 166
 167 wxSize
 168 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 169 {
 170   if (! m_pView)
 171     return wxSize(0,0);
 172
 173   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 174   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
 175 }
 176
 177
 178 // ImageFileView
 179
 180 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 181
 182 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 183 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 184 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 185 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 186 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 187 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 188 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 189 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 190 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 191 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 192 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 193 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 194 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 195 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 196 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 197 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 198 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 199 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 200 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 201 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 202 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 203 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 204 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 205 #ifdef HAVE_FFT
 206 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 207 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 208 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 209 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 210 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 211 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 212 #endif
 213 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 214 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 215 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 216 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 217 #ifdef HAVE_FFT
 218 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 219 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 220 #endif
 221 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 222 END_EVENT_TABLE()
 223
 224 ImageFileView::ImageFileView(void)
 225 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 226 {
 227   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 228 }
 229
 230 ImageFileView::~ImageFileView(void)
 231 {
 232 }
 233
 234 void
 235 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 236 {
 237   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 238   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 239     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 240   else {
 241     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
 242     std::ostringstream os;
 243     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 244     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 245     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 246     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 247     os << "Data type: ";
 248     if (rIF.isComplex())
 249       os << "Complex\n";
 250     else
 251       os << "Real\n";
 252     os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 253     if (rIF.isComplex()) {
 254       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 255       os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 256     }
 257     if (rIF.nLabels() > 0) {
 258       os << "\n";
 259       rIF.printLabelsBrief (os);
 260     }
 261     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 262     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 263     dialogMsg.ShowModal();
 264   }
 265 }
 266
 267 void
 268 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 269 {
 270   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 271   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 272   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 273   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 274   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 275   if (iRetVal == wxID_OK) {
 276     m_bMinSpecified = true;
 277     m_bMaxSpecified = true;
 278     double dMin, dMax;
 279     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 280       m_dMinPixel = dMin;
 281       m_dMaxPixel = dMax;
 282       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 283       OnUpdate (this, NULL);
 284     }
 285   }
 286 }
 287
 288 void
 289 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 290 {
 291   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 292   double min, max;
 293   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 294     rIF.getMinMax (min, max);
 295
 296   if (m_bMinSpecified)
 297     min = m_dMinPixel;
 298   if (m_bMaxSpecified)
 299     max = m_dMaxPixel;
 300
 301   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 302   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 303   if (retVal == wxID_OK) {
 304     m_bMinSpecified = true;
 305     m_bMaxSpecified = true;
 306     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 307     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 308     OnUpdate (this, NULL);
 309   }
 310 }
 311
 312 void
 313 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 314 {
 315   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 316     m_bMinSpecified = false;
 317     m_bMaxSpecified = false;
 318     OnUpdate (this, NULL);
 319   }
 320 }
 321
 322 void
 323 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 324 {
 325   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 326   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 327
 328   if (vecIF.size() == 0) {
 329     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 330   } else {
 331     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
 332
 333     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 334       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 335       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 336       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 337       std::ostringstream os;
 338       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 339       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 340       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 341       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 342       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 343       os << "\n";
 344       double d, r, e;
 345       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 346       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 347       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 348       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 349         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 350         if (! pDifferenceDoc) {
 351           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 352           return;
 353         }
 354         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();
 355
 356         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 357         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {
 358           pDifferenceDoc->DeleteAllViews();
 359           return;
 360         }
 361
 362         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 363         differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 364         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 365         differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 366         std::ostringstream osLabel;
 367         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 368           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 369           << os.str().c_str();
 370         differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());
 371         if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 372           pDifferenceDoc->Modify(true);
 373         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
 374         pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 375       }
 376       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 377     }
 378   }
 379 }
 380
 381 void
 382 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 383 {
 384   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 385   rIF.invertPixelValues (rIF);
 386   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 387   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 388     GetDocument()->Modify(TRUE);
 389   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 390 }
 391
 392 void
 393 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 394 {
 395   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 396   rIF.square (rIF);
 397   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 398   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 399     GetDocument()->Modify(TRUE);
 400   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 401 }
 402
 403 void
 404 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 405 {
 406   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 407   rIF.sqrt (rIF);
 408   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 409   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 410     GetDocument()->Modify(TRUE);
 411   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 412 }
 413
 414 void
 415 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 416 {
 417   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 418   rIF.log (rIF);
 419   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 420   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 421     GetDocument()->Modify(TRUE);
 422   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 423 }
 424
 425 void
 426 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 427 {
 428   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 429   rIF.exp (rIF);
 430   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 431   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 432     GetDocument()->Modify(TRUE);
 433   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 434 }
 435
 436 void
 437 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 438 {
 439   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 440   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 441
 442   if (vecIF.size() == 0) {
 443     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 444   } else {
 445     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
 446
 447     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 448       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 449       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 450       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 451       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 452         if (! pNewDoc) {
 453           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 454           return;
 455         }
 456       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 457       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 458       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 459       std::ostringstream os;
 460       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 461         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 462       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 463       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 464       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 465       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 466       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 467       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 468       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 469         pNewDoc->Modify(TRUE);
 470       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 471       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 472     }
 473   }
 474 }
 475
 476 void
 477 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 478 {
 479   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 480   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 481
 482   if (vecIF.size() == 0) {
 483     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 484   } else {
 485     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 486
 487     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 488       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 489       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 490       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 491       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 492         if (! pNewDoc) {
 493           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 494           return;
 495         }
 496       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 497       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 498       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 499       std::ostringstream os;
 500       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 501         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 502       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 503       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 504       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 505       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 506       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 507       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 508       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 509         pNewDoc->Modify(TRUE);
 510       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 511       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 512     }
 513   }
 514 }
 515
 516 void
 517 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 518 {
 519   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 520   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 521
 522   if (vecIF.size() == 0) {
 523     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 524   } else {
 525     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 526
 527     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 528       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 529       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 530       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 531       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 532         if (! pNewDoc) {
 533           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 534           return;
 535         }
 536       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 537       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 538       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 539       std::ostringstream os;
 540       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 541         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 542       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 543       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 544       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 545       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 546       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 547       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 548       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 549         pNewDoc->Modify(TRUE);
 550       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 551       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 552     }
 553   }
 554 }
 555
 556 void
 557 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 558 {
 559   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 560   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 561
 562   if (vecIF.size() == 0) {
 563     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 564   } else {
 565     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
 566
 567     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 568       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 569       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 570       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 571       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 572         if (! pNewDoc) {
 573           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 574           return;
 575         }
 576       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 577       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 578       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 579       std::ostringstream os;
 580       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 581         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 582       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 583       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 584       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 585       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 586       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 587       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 588       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 589         pNewDoc->Modify(TRUE);
 590       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 591       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 592     }
 593   }
 594 }
 595
 596
 597 #ifdef HAVE_FFT
 598 void
 599 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 600 {
 601   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 602   rIF.fft (rIF);
 603   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 604   m_bMinSpecified = false;
 605   m_bMaxSpecified = false;
 606   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 607     GetDocument()->Modify(TRUE);
 608   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 609 }
 610
 611 void
 612 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 613 {
 614   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 615   rIF.ifft (rIF);
 616   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 617   m_bMinSpecified = false;
 618   m_bMaxSpecified = false;
 619   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 620     GetDocument()->Modify(TRUE);
 621   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 622 }
 623
 624 void
 625 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 626 {
 627   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 628   rIF.fftRows (rIF);
 629   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 630   m_bMinSpecified = false;
 631   m_bMaxSpecified = false;
 632   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 633     GetDocument()->Modify(TRUE);
 634   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 635 }
 636
 637 void
 638 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 639 {
 640   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 641   rIF.ifftRows (rIF);
 642   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 643   m_bMinSpecified = false;
 644   m_bMaxSpecified = false;
 645   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 646     GetDocument()->Modify(TRUE);
 647   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 648 }
 649
 650 void
 651 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 652 {
 653   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 654   rIF.fftCols (rIF);
 655   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 656   m_bMinSpecified = false;
 657   m_bMaxSpecified = false;
 658   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 659     GetDocument()->Modify(TRUE);
 660   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 661 }
 662
 663 void
 664 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 665 {
 666   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 667   rIF.ifftCols (rIF);
 668   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 669   m_bMinSpecified = false;
 670   m_bMaxSpecified = false;
 671   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 672     GetDocument()->Modify(TRUE);
 673   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 674 }
 675 #endif
 676
 677 void
 678 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 679 {
 680   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 681   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 682   rIF.fourier (rIF);
 683   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 684   m_bMinSpecified = false;
 685   m_bMaxSpecified = false;
 686   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 687     GetDocument()->Modify(TRUE);
 688   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 689 }
 690
 691 void
 692 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 693 {
 694   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 695   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 696   rIF.inverseFourier (rIF);
 697   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 698   m_bMinSpecified = false;
 699   m_bMaxSpecified = false;
 700   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 701     GetDocument()->Modify(TRUE);
 702   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 703 }
 704
 705 void
 706 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 707 {
 708   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 709   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 710   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 711   m_bMinSpecified = false;
 712   m_bMaxSpecified = false;
 713   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 714     GetDocument()->Modify(TRUE);
 715   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 716 }
 717
 718 void
 719 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 720 {
 721   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 722   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 723   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 724   m_bMinSpecified = false;
 725   m_bMaxSpecified = false;
 726   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 727     GetDocument()->Modify(TRUE);
 728   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 729 }
 730
 731 void
 732 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 733 {
 734   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 735   if (rIF.isComplex()) {
 736     rIF.magnitude (rIF);
 737     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 738   m_bMinSpecified = false;
 739   m_bMaxSpecified = false;
 740   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 741     GetDocument()->Modify(TRUE);
 742   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 743   }
 744 }
 745
 746 void
 747 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 748 {
 749   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 750   if (rIF.isComplex()) {
 751     rIF.phase (rIF);
 752     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 753   m_bMinSpecified = false;
 754   m_bMaxSpecified = false;
 755   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 756     GetDocument()->Modify(TRUE);
 757   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 758   }
 759 }
 760
 761
 762 ImageFileCanvas*
 763 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 764 {
 765   ImageFileCanvas* pCanvas;
 766   int width, height;
 767   parent->GetClientSize(&width, &height);
 768
 769   pCanvas = new ImageFileCanvas (dynamic_cast<ImageFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 770
 771   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 772   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 773   pCanvas->Clear();
 774
 775   return pCanvas;
 776 }
 777
 778 wxFrame*
 779 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 780 {
 781 #if CTSIM_MDI
 782   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 783 #else
 784   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 785 #endif
 786   theApp->setIconForFrame (subframe);
 787
 788   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
 789
 790   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
 791   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
 792   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
 793   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
 794   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 795   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
 796
 797   file_menu->AppendSeparator();
 798   file_menu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
 799   file_menu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 800
 801   file_menu->AppendSeparator();
 802   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 803   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 804   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
 805
 806   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 807   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
 808   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
 809   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
 810
 811   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 812   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 813   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 814   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 815   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 816   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 817   filter_menu->AppendSeparator();
 818 #ifdef HAVE_FFT
 819   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2D &FFT");
 820   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2D &IFFT");
 821   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 822   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 823   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 824   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 825   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");
 826   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");
 827 #else
 828   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 829   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 830 #endif
 831   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 832   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 833   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 834   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 835
 836   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 837   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 838   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 839   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 840   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 841   image_menu->AppendSeparator();
 842   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 843
 844   wxMenu *analyze_menu = new wxMenu;
 845   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 846   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 847   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 848   analyze_menu->AppendSeparator();
 849   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
 850   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
 851   analyze_menu->AppendSeparator();
 852   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 853   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
 854   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
 855
 856   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 857   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
 858   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
 859   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 860
 861   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 862
 863   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
 864   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 865   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 866   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 867   menu_bar->Append(analyze_menu, "&Analyze");
 868   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 869
 870   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 871
 872   subframe->Centre(wxBOTH);
 873
 874   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
 875   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
 876   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
 877   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
 878   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
 879   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
 880   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
 881   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
 882   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
 883   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
 884   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
 885   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
 886   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
 887
 888   return subframe;
 889 }
 890
 891
 892 bool
 893 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 894 {
 895   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
 896   SetFrame (m_frame);
 897
 898   m_bMinSpecified = false;
 899   m_bMaxSpecified = false;
 900   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 901
 902   int width, height;
 903   m_frame->GetClientSize (&width, &height);
 904   m_frame->SetTitle("ImageFileView");
 905   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
 906
 907   int x, y;  // X requires a forced resize
 908   m_frame->GetSize(&x, &y);
 909   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
 910   m_frame->SetFocus();
 911   m_frame->Show(true);
 912   Activate(true);
 913
 914   return true;
 915 }
 916
 917 void
 918 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 919 {
 920   wxSize sizeWindow = m_frame->GetClientSize();
 921   wxSize sizeBest = m_canvas->GetBestSize();
 922   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
 923     m_frame->SetClientSize (sizeBest);
 924
 925   if (m_bitmap.Ok())
 926     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 927
 928   int xCursor, yCursor;
 929   if (m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 930     m_canvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 931 }
 932
 933
 934 void
 935 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 936 {
 937   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
 938   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 939   int nx = rIF.nx();
 940   int ny = rIF.ny();
 941   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 942     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 943       double min, max;
 944       rIF.getMinMax (min, max);
 945       if (! m_bMinSpecified)
 946         m_dMinPixel = min;
 947       if (! m_bMaxSpecified)
 948         m_dMaxPixel = max;
 949     }
 950     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
 951
 952     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
 953     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
 954       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
 955         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
 956         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
 957         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
 958         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
 959         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
 960       }
 961     }
 962     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
 963     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
 964     delete imageData;
 965     int xSize = nx;
 966     int ySize = ny;
 967     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
 968     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
 969     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
 970     m_canvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
 971     m_canvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 972   }
 973
 974   if (m_canvas)
 975     m_canvas->Refresh();
 976 }
 977
 978 bool
 979 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
 980 {
 981   if (!GetDocument()->Close())
 982     return false;
 983
 984   m_canvas->Clear();
 985   //m_canvas->m_pView = NULL;
 986   m_canvas = NULL;
 987   wxString s(theApp->GetAppName());
 988   if (m_frame)
 989     m_frame->SetTitle(s);
 990   SetFrame(NULL);
 991
 992   Activate(false);
 993
 994   if (deleteWindow) {
 995     delete m_frame;
 996     return true;
 997   }
 998   return true;
 999 }
1000
1001 void
1002 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1003 {
1004   ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1005   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1006   int nx = rIF.nx();
1007   int ny = rIF.ny();
1008   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1009     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1010       double min, max;
1011       rIF.getMinMax (min, max);
1012       if (! m_bMinSpecified)
1013         m_dMinPixel = min;
1014       if (! m_bMaxSpecified)
1015         m_dMaxPixel = max;
1016     }
1017
1018     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1019     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1020       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1021       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1022
1023       wxString strExt;
1024       wxString strWildcard;
1025       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
1026         strExt = ".pgm";
1027         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1028       }
1029 #ifdef HAVE_PNG
1030       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
1031         strExt = ".png";
1032         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1033       }
1034 #endif
1035
1036       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1037         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1038       if (strFilename) {
1039         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1040         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1041       }
1042     }
1043   }
1044 }
1045
1046 void
1047 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1048 {
1049   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1050   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1051   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1052
1053   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1054   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1055     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1056     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1057     std::ostringstream os;
1058     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1059     ImageFileDocument* pScaledDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1060     if (! pScaledDoc) {
1061       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1062       return;
1063     }
1064     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1065     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1066     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1067     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1068     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1069     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1070     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1071       pScaledDoc->Modify(TRUE);
1072     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1073     pScaledDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
1074   }
1075 }
1076
1077 void
1078 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1079 {
1080   int xCursor, yCursor;
1081   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1082     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1083     return;
1084   }
1085
1086   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1087   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1088   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1089   int nx = rIF.nx();
1090   int ny = rIF.ny();
1091
1092   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1093     double* pX = new double [nx];
1094     double* pYReal = new double [nx];
1095     double *pYImag = NULL;
1096     double *pYMag = NULL;
1097     if (rIF.isComplex()) {
1098       pYImag = new double [nx];
1099       pYMag = new double [nx];
1100     }
1101     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1102       pX[i] = i;
1103       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1104       if (rIF.isComplex()) {
1105         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1106         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1107       }
1108     }
1109     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1110     if (! pPlotDoc) {
1111       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1112     } else {
1113       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1114       std::ostringstream os;
1115       os << "Row " << yCursor;
1116       std::string title("title ");
1117       title += os.str();
1118       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1119       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1120       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1121       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1122       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1123       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1124       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1125       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1126       if (rIF.isComplex()) {
1127         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1128         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1129         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1130         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1131         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1132         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1133         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1134         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1135       } else
1136         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1137       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1138       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1139       if (rIF.isComplex()) {
1140         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1141         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1142       }
1143       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1144         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1145       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1146       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1147       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1148     }
1149     delete pX;
1150     delete pYReal;
1151     if (rIF.isComplex()) {
1152       delete pYImag;
1153       delete pYMag;
1154     }
1155     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1156       pPlotDoc->Modify(true);
1157     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1158   }
1159 }
1160
1161 void
1162 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1163 {
1164   int xCursor, yCursor;
1165   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1166     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1167     return;
1168   }
1169
1170   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1171   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1172   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1173   int nx = rIF.nx();
1174   int ny = rIF.ny();
1175
1176   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1177     double* pX = new double [ny];
1178     double* pYReal = new double [ny];
1179     double* pYImag = NULL;
1180     double* pYMag = NULL;
1181     if (rIF.isComplex()) {
1182       pYImag = new double [ny];
1183       pYMag = new double [ny];
1184     }
1185     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1186       pX[i] = i;
1187       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1188       if (rIF.isComplex()) {
1189         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1190         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1191       }
1192     }
1193     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1194     if (! pPlotDoc) {
1195       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1196     } else {
1197       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1198       std::ostringstream os;
1199       os << "Column " << xCursor;
1200       std::string title("title ");
1201       title += os.str();
1202       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1203       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1204       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1205       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1206       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1207       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1208       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1209       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1210       if (rIF.isComplex()) {
1211         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1212         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1213         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1214         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1215         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1216         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1217         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1218         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1219       } else
1220         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1221       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1222       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1223       if (rIF.isComplex()) {
1224         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1225         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1226       }
1227       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1228         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1229       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1230       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1231       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1232     }
1233     delete pX;
1234     delete pYReal;
1235     if (rIF.isComplex()) {
1236       delete pYImag;
1237       delete pYMag;
1238     }
1239     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1240       pPlotDoc->Modify(true);
1241     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1242   }
1243 }
1244
1245 #ifdef HAVE_FFT
1246 void
1247 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1248 {
1249   int xCursor, yCursor;
1250   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1251     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1252     return;
1253   }
1254
1255   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1256   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1257   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1258   int nx = rIF.nx();
1259   int ny = rIF.ny();
1260
1261   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1262     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1263
1264     int i;
1265     for (i = 0; i < nx; i++) {
1266       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1267       if (rIF.isComplex())
1268         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1269       else
1270         pcIn[i].im = 0;
1271     }
1272
1273     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1274     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1275     fftw_destroy_plan (plan);
1276
1277     double* pX = new double [nx];
1278     double* pYReal = new double [nx];
1279     double* pYImag = new double [nx];
1280     double* pYMag = new double [nx];
1281     for (i = 0; i < nx; i++) {
1282       pX[i] = i;
1283       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1284       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1285       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1286     }
1287     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1288     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1289     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1290
1291     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1292     if (! pPlotDoc) {
1293       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1294     } else {
1295       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1296       std::ostringstream os;
1297       os << "Row " << yCursor;
1298       std::string title("title ");
1299       title += os.str();
1300       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1301       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1302       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1303       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1304       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1305       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1306        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1307         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1308         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1309         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1310         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1311         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1312         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1313        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1314       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1315       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1316       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1317       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1318       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1319       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1320       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1321         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1322       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1323       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1324       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1325     }
1326     delete pX;
1327     delete pYReal;
1328     delete pYImag;
1329     delete pYMag;
1330     delete [] pcIn;
1331
1332     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1333       pPlotDoc->Modify(true);
1334     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1335   }
1336 }
1337
1338 void
1339 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1340 {
1341   int xCursor, yCursor;
1342   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1343     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1344     return;
1345   }
1346
1347   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1348   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1349   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1350   int nx = rIF.nx();
1351   int ny = rIF.ny();
1352
1353   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1354     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1355     double *pdTemp = new double [ny];
1356
1357     int i;
1358     for (i = 0; i < ny; i++)
1359       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1360     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1361     for (i = 0; i < ny; i++)
1362       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1363
1364     for (i = 0; i < ny; i++) {
1365       if (rIF.isComplex())
1366         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1367       else
1368       pdTemp[i] = 0;
1369     }
1370     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1371     for (i = 0; i < ny; i++)
1372       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1373
1374     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1375     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1376     fftw_destroy_plan (plan);
1377
1378     double* pX = new double [ny];
1379     double* pYReal = new double [ny];
1380     double* pYImag = new double [ny];
1381     double* pYMag = new double [ny];
1382     for (i = 0; i < ny; i++) {
1383       pX[i] = i;
1384       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1385       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1386       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1387     }
1388
1389     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1390     if (! pPlotDoc) {
1391       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1392     } else {
1393       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1394       std::ostringstream os;
1395       os << "Column " << xCursor;
1396       std::string title("title ");
1397       title += os.str();
1398       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1399       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1400       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1401       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1402       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1403       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1404        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1405         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1406         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1407         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1408         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1409         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1410         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1411        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1412       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1413       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1414       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1415       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1416       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1417       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1418       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1419         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1420       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1421       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1422       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1423     }
1424     delete pX;
1425     delete pYReal;
1426     delete pYImag;
1427     delete pYMag;
1428     delete pdTemp;
1429     delete [] pcIn;
1430
1431     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1432       pPlotDoc->Modify(true);
1433     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1434   }
1435 }
1436 #endif
1437
1438 void
1439 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1440 {
1441   int xCursor, yCursor;
1442   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1443     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1444     return;
1445   }
1446
1447   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1448   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1449   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1450     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1451     return;
1452   }
1453   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1454
1455   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1456     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1457     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1458     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1459
1460     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1461     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1462     int nx = rIF.nx();
1463     int ny = rIF.ny();
1464
1465     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1466       double* pX = new double [ny];
1467       double* pY1 = new double [ny];
1468       double* pY2 = new double [ny];
1469       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1470         pX[i] = i;
1471         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1472         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1473       }
1474       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1475       if (! pPlotDoc) {
1476         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1477       } else {
1478         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1479         std::ostringstream os;
1480         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1481         std::string title("title ");
1482         title += os.str();
1483         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1484         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1485         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1486         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1487         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1488         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1489         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1490         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1491         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1492         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1493         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1494         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1495         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1496         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1497         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1498
1499         unsigned int iL;
1500         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1501           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1502           s += ": ";
1503           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1504           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1505         }
1506         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1507           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1508           s += ": ";
1509           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1510           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1511         }
1512         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1513           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1514         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1515         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1516       }
1517       delete pX;
1518       delete pY1;
1519       delete pY2;
1520       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1521         pPlotDoc->Modify(true);
1522       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1523     }
1524   }
1525 }
1526
1527 void
1528 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1529 {
1530   int xCursor, yCursor;
1531   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1532     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1533     return;
1534   }
1535
1536   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1537   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1538
1539   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1540     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1541     return;
1542   }
1543
1544   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1545
1546   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1547     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1548     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1549     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1550
1551     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1552     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1553     int nx = rIF.nx();
1554     int ny = rIF.ny();
1555
1556     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1557       double* pX = new double [nx];
1558       double* pY1 = new double [nx];
1559       double* pY2 = new double [nx];
1560       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1561         pX[i] = i;
1562         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1563         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1564       }
1565       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1566       if (! pPlotDoc) {
1567         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1568       } else {
1569         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1570         std::ostringstream os;
1571         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1572         std::string title("title ");
1573         title += os.str();
1574         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1575         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1576         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1577         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1578         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1579         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1580         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1581         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1582         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1583         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1584         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1585         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1586         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1587         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1588         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1589         unsigned int iL;
1590         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1591           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1592           s += ": ";
1593           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1594           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1595         }
1596         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1597           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1598           s += ": ";
1599           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1600           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1601         }
1602         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1603           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1604         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1605         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1606       }
1607       delete pX;
1608       delete pY1;
1609       delete pY2;
1610       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1611         pPlotDoc->Modify(true);
1612       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1613     }
1614   }
1615 }
1616
1617 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1618
1619 void
1620 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1621 {
1622   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1623   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1624   int nx = rIF.nx();
1625   int ny = rIF.ny();
1626
1627   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1628     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1629     if (! pPlotDoc) {
1630       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1631       return;
1632     }
1633
1634     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1635     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1636     double dMin, dMax;
1637     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1638     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1639
1640     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1641       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1642       pY[i] = 0;
1643     }
1644     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1645       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1646         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1647         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1648           pY[iBin] += 1;
1649       }
1650
1651     PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1652     std::ostringstream os;
1653     os << "Histogram";
1654     std::string title("title ");
1655     title += os.str();
1656     rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1657     rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1658     rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1659     rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1660     rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1661     rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1662     rPlotFile.addColumn (0, pX);
1663     rPlotFile.addColumn (1, pY);
1664     for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1665       std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1666       s += ": ";
1667       s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1668       rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1669     }
1670     os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1671     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1672     rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1673     delete pX;
1674     delete pY;
1675     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1676       pPlotDoc->Modify(true);
1677     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1678   }
1679 }
1680
1681
1682 // PhantomCanvas
1683
1684 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1685 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1686 {
1687   m_pView = v;
1688 }
1689
1690 void
1691 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1692 {
1693   if (m_pView)
1694     m_pView->OnDraw(& dc);
1695 }
1696
1697
1698 // PhantomView
1699
1700 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomView, wxView)
1701
1702 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomView, wxView)
1703 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomView::OnProperties)
1704 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomView::OnRasterize)
1705 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomView::OnProjections)
1706 END_EVENT_TABLE()
1707
1708 PhantomView::PhantomView(void)
1709 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
1710 {
1711   m_iDefaultNDet = 367;
1712   m_iDefaultNView = 320;
1713   m_iDefaultNSample = 2;
1714   m_dDefaultRotation = 1;
1715   m_dDefaultFocalLength = 2;
1716   m_dDefaultFieldOfView = 1;
1717   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1718   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1719
1720   m_iDefaultRasterNX = 256;
1721   m_iDefaultRasterNY = 256;
1722   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1723 }
1724
1725 PhantomView::~PhantomView(void)
1726 {
1727 }
1728
1729 void
1730 PhantomView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1731 {
1732   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1733   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1734   std::ostringstream os;
1735   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1736   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1737   rPhantom.printDefinitions (os);
1738 #if DEBUG
1739   rPhantom.print (os);
1740 #endif
1741   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1742   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1743 }
1744
1745
1746 void
1747 PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1748 {
1749   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView, m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
1750   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1751   if (retVal == wxID_OK) {
1752     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1753     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1754     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1755     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1756     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1757     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1758     m_dDefaultFieldOfView = dialogProjection.getFieldOfViewRatio();
1759     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1760     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1761
1762     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1763       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1764       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = dynamic_cast<ProjectionFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.pj", wxDOC_SILENT));
1765       if (! pProjectionDoc) {
1766         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1767         return;
1768       }
1769       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
1770       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
1771       if (theScanner.fail()) {
1772         *theApp->getLog() << "Failed making scanner: " << theScanner.failMessage().c_str() << "\n";
1773         return;
1774       }
1775       rProj.initFromScanner (theScanner);
1776       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
1777
1778       Timer timer;
1779       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1780         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1781         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1782           ::wxYield();
1783           ::wxYield();
1784           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1785             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1786             return;
1787           }
1788           ::wxYield();
1789           ::wxYield();
1790           while (dialogProjections.isPaused()) {
1791             ::wxYield();
1792             ::wxUsleep(50);
1793           }
1794         }
1795       } else {
1796         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1797         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
1798           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1799           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1800             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1801             return;
1802           }
1803         }
1804       }
1805
1806       std::ostringstream os;
1807       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
1808       rProj.setCalcTime (timer.timerEnd());
1809       rProj.setRemark (os.str());
1810       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1811
1812       m_frame->Lower();
1813       ::wxYield();
1814       ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());
1815       if (projView) {
1816         projView->getFrame()->SetFocus();
1817         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1818       }
1819       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
1820         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
1821           pFrame->SetFocus();
1822           pFrame->Raise();
1823         }
1824         theApp->getDocManager()->ActivateView (pView, true, false);
1825       }
1826       ::wxYield();
1827       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1828         pProjectionDoc->Modify(true);
1829       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
1830     }
1831   }
1832 }
1833
1834
1835 void
1836 PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1837 {
1838   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY, m_iDefaultRasterNSamples);
1839   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1840   if (retVal == wxID_OK) {
1841     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1842     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1843     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1844     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1845       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1846     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1847       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1848       ImageFileDocument* pRasterDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1849       if (! pRasterDoc) {
1850         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1851         return;
1852       }
1853       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
1854
1855       imageFile.setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNX);
1856       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1857       Timer timer;
1858       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
1859         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1860         if (! dlgProgress.Update(i+1)) {
1861           pRasterDoc->DeleteAllViews();
1862           return;
1863         }
1864       }
1865       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1866         pRasterDoc->Modify(true);
1867       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
1868       std::ostringstream os;
1869       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
1870         << m_iDefaultRasterNY << ", nSamples=" << m_iDefaultRasterNSamples;
1871       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1872       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
1873       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());
1874       if (rasterView) {
1875         rasterView->getFrame()->SetFocus();
1876         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
1877       }
1878
1879     }
1880   }
1881 }
1882
1883
1884 PhantomCanvas*
1885 PhantomView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1886 {
1887   PhantomCanvas* pCanvas;
1888   int width, height;
1889   parent->GetClientSize(&width, &height);
1890
1891   pCanvas = new PhantomCanvas (dynamic_cast<PhantomView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1892
1893   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1894   pCanvas->Clear();
1895
1896   return pCanvas;
1897 }
1898
1899 wxFrame*
1900 PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1901 {
1902 #if CTSIM_MDI
1903   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1904 #else
1905   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1906 #endif
1907   theApp->setIconForFrame (subframe);
1908
1909   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
1910
1911   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
1912   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
1913   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
1914   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1915   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1916
1917   file_menu->AppendSeparator();
1918   file_menu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1919
1920   file_menu->AppendSeparator();
1921   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1922   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1923   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1924
1925   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
1926   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
1927   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
1928
1929   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1930   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
1931   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
1932   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1933
1934   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1935
1936   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
1937   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
1938   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1939
1940   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1941   subframe->Centre(wxBOTH);
1942
1943   wxAcceleratorEntry accelEntries[8];
1944   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
1945   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
1946   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
1947   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
1948   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
1949   accelEntries[5].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
1950   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
1951   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
1952   wxAcceleratorTable accelTable (8, accelEntries);
1953   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
1954
1955   return subframe;
1956 }
1957
1958
1959 bool
1960 PhantomView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1961 {
1962   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
1963   SetFrame(m_frame);
1964
1965   int width, height;
1966   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
1967   m_frame->SetTitle("PhantomView");
1968   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
1969
1970 #ifdef __X__
1971   int x, y;  // X requires a forced resize
1972   m_frame->GetSize(&x, &y);
1973   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
1974 #endif
1975
1976   m_frame->Show(true);
1977   Activate(true);
1978
1979   return true;
1980 }
1981
1982 void
1983 PhantomView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
1984 {
1985   if (m_canvas)
1986     m_canvas->Refresh();
1987 }
1988
1989 bool
1990 PhantomView::OnClose (bool deleteWindow)
1991 {
1992   if (!GetDocument()->Close())
1993     return false;
1994
1995   m_canvas->Clear();
1996   //m_canvas->m_pView = NULL;
1997   m_canvas = NULL;
1998   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
1999   if (m_frame)
2000     m_frame->SetTitle(s);
2001   SetFrame(NULL);
2002
2003   Activate(false);
2004
2005   if (deleteWindow)
2006     delete m_frame;
2007
2008   return true;
2009 }
2010
2011 void
2012 PhantomView::OnDraw (wxDC* dc)
2013 {
2014   int xsize, ysize;
2015   m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2016   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2017   SGP sgp (driver);
2018   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2019   sgp.setColor (C_RED);
2020   rPhantom.show (sgp);
2021 }
2022
2023 // ProjectionCanvas
2024
2025 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2026 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2027 {
2028   m_pView = v;
2029 }
2030
2031 void
2032 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2033 {
2034   if (m_pView)
2035     m_pView->OnDraw(& dc);
2036 }
2037
2038 wxSize
2039 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2040 {
2041   wxSize best (0, 0);
2042   if (m_pView) {
2043     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2044     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2045   }
2046
2047   return best;
2048 }
2049
2050
2051 // ProjectionFileView
2052
2053 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2054
2055 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2056 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2057 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2058 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2059 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2060 END_EVENT_TABLE()
2061
2062 ProjectionFileView::ProjectionFileView(void)
2063 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
2064 {
2065   m_iDefaultNX = 256;
2066   m_iDefaultNY = 256;
2067   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2068   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2069 #if HAVE_FFTW
2070   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2071   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2072 #else
2073   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2074   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2075 #endif
2076   m_iDefaultZeropad = 1;
2077   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF3;
2078   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2079   m_iDefaultInterpParam = 1;
2080   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2081
2082   m_iDefaultPolarNX = 256;
2083   m_iDefaultPolarNY = 256;
2084   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2085   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2086 }
2087
2088 ProjectionFileView::~ProjectionFileView(void)
2089 {
2090 }
2091
2092 void
2093 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2094 {
2095   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2096   std::ostringstream os;
2097   rProj.printScanInfo(os);
2098   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2099   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2100   dialogMsg.ShowModal();
2101 }
2102
2103
2104 void
2105 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2106 {
2107   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2108   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2109     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2110   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2111     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2112     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2113     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2114     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2115     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2116     if (! pPolarDoc) {
2117       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2118       return;
2119     }
2120     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2121     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2122     rProj.convertPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation);
2123     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2124     std::ostringstream os;
2125     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2126       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2127       << strInterpolation.c_str();
2128     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2129     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2130     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2131       pPolarDoc->Modify(true);
2132     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2133     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
2134   }
2135 }
2136
2137 void
2138 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2139 {
2140   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2141   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2142     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2143   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2144     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2145     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2146     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2147     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2148     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2149     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2150     if (! pPolarDoc) {
2151       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2152       return;
2153     }
2154     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2155     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2156     rProj.convertFFTPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2157     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2158     std::ostringstream os;
2159     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2160       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2161       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2162     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2163     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2164     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2165       pPolarDoc->Modify(true);
2166     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2167     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
2168   }}
2169
2170 void
2171 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2172 {
2173   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2174 }
2175
2176 void
2177 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2178 {
2179   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration, m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector, m_iDefaultTrace);
2180
2181   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2182   if (retVal == wxID_OK) {
2183     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2184     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2185     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2186     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2187     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2188     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2189     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2190     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2191     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2192     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2193     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2194     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2195     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2196     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2197     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2198     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2199     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2200       ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2201       if (! pReconDoc) {
2202         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2203         return;
2204       }
2205       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
2206       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2207       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2208
2209       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2210
2211       Timer timerRecon;
2212       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2213         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2214         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2215           ::wxYield();
2216           ::wxYield();
2217           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView)) {
2218             delete pDlgReconstruct;
2219             delete pReconstruct;
2220             pReconDoc->DeleteAllViews();
2221             return;
2222           }
2223           ::wxYield();
2224           ::wxYield();
2225           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2226             ::wxYield();
2227             ::wxUsleep(50);
2228           }
2229         }
2230         delete pDlgReconstruct;
2231       } else {
2232         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
2233         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
2234           pReconstruct->reconstructView (i, 1);
2235           if (! dlgProgress.Update(i + 1)) {
2236             delete pReconstruct;
2237             pReconDoc->DeleteAllViews();
2238             return;
2239           }
2240         }
2241       }
2242       delete pReconstruct;
2243       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2244         pReconDoc->Modify(true);
2245       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
2246       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());
2247       if (rasterView) {
2248         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2249         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2250       }
2251       std::ostringstream os;
2252       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2253       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2254       imageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
2255       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2256     }
2257   }
2258 }
2259
2260
2261 ProjectionFileCanvas*
2262 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2263 {
2264   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2265   int width, height;
2266   parent->GetClientSize(&width, &height);
2267
2268   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (dynamic_cast<ProjectionFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2269
2270   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2271   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2272   pCanvas->Clear();
2273
2274   return pCanvas;
2275 }
2276
2277 wxFrame*
2278 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2279 {
2280 #ifdef CTSIM_MDI
2281   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2282 #else
2283   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2284 #endif
2285   theApp->setIconForFrame (subframe);
2286
2287   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
2288
2289   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2290   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2291   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2292   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2293   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2294   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2295
2296   file_menu->AppendSeparator();
2297   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2298
2299   file_menu->AppendSeparator();
2300   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2301   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2302   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2303
2304   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2305   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2306   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-I");
2307
2308   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2309   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R");
2310   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E");
2311
2312   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2313   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2314   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2315   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2316
2317   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2318
2319   menu_bar->Append (file_menu, "&File");
2320   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2321   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2322   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2323
2324   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2325   subframe->Centre(wxBOTH);
2326
2327   wxAcceleratorEntry accelEntries[11];
2328   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2329   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2330   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2331   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2332   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2333   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2334   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2335   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2336   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2337   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2338   accelEntries[10].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2339   wxAcceleratorTable accelTable (11, accelEntries);
2340   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2341
2342   return subframe;
2343 }
2344
2345
2346 bool
2347 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2348 {
2349   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2350   SetFrame(m_frame);
2351
2352   int width, height;
2353   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2354   m_frame->SetTitle("ProjectionFileView");
2355   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
2356
2357 #ifdef __X__
2358   int x, y;  // X requires a forced resize
2359   m_frame->GetSize(&x, &y);
2360   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2361 #endif
2362
2363   m_frame->Show(true);
2364   Activate(true);
2365
2366   return true;
2367 }
2368
2369 void
2370 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2371 {
2372   wxSize clientSize = m_frame->GetClientSize();
2373   wxSize bestSize = m_canvas->GetBestSize();
2374
2375   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2376     m_frame->SetClientSize (bestSize);
2377
2378   if (m_bitmap.Ok())
2379     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2380 }
2381
2382
2383 void
2384 ProjectionFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2385 {
2386   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2387   const int nDet = rProj.nDet();
2388   const int nView = rProj.nView();
2389   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2390     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2391     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2392     double min = detval[0];
2393     double max = detval[0];
2394     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2395       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2396       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2397       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2398         if (min > detval[ix])
2399           min = detval[ix];
2400         else if (max < detval[ix])
2401           max = detval[ix];
2402       }
2403     }
2404
2405     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2406     double scale = (max - min) / 255;
2407     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2408       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2409       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2410       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2411         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2412         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2413         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2414         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2415       }
2416     }
2417     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2418     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2419     delete imageData;
2420     int xSize = nDet;
2421     int ySize = nView;
2422     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2423     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2424     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
2425     m_canvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2426   }
2427
2428   if (m_canvas)
2429     m_canvas->Refresh();
2430 }
2431
2432 bool
2433 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2434 {
2435   if (!GetDocument()->Close())
2436     return false;
2437
2438   m_canvas->Clear();
2439   // m_canvas->m_pView = NULL;
2440   m_canvas = NULL;
2441   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2442   if (m_frame)
2443     m_frame->SetTitle(s);
2444   SetFrame(NULL);
2445
2446   Activate(false);
2447
2448   if (deleteWindow) {
2449     delete m_frame;
2450     return true;
2451   }
2452   return true;
2453 }
2454
2455
2456
2457 // PlotFileCanvas
2458 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2459 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2460 {
2461   m_pView = v;
2462 }
2463
2464 void
2465 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2466 {
2467   if (m_pView)
2468     m_pView->OnDraw(& dc);
2469 }
2470
2471
2472 // PlotFileView
2473
2474 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2475
2476 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2477 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2478 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2479 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2480 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2481 END_EVENT_TABLE()
2482
2483 PlotFileView::PlotFileView(void)
2484 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_pEZPlot(NULL)
2485 {
2486   m_bMinSpecified = false;
2487   m_bMaxSpecified = false;
2488 }
2489
2490 PlotFileView::~PlotFileView(void)
2491 {
2492   if (m_pEZPlot)
2493     delete m_pEZPlot;
2494 }
2495
2496 void
2497 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2498 {
2499   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2500   std::ostringstream os;
2501   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2502   rPlot.printHeadersBrief (os);
2503   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2504   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2505   dialogMsg.ShowModal();
2506 }
2507
2508
2509 void
2510 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2511 {
2512   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2513   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2514   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2515   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2516   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2517   if (iRetVal == wxID_OK) {
2518     m_bMinSpecified = true;
2519     m_bMaxSpecified = true;
2520     double dMin, dMax;
2521     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2522       m_dMinPixel = dMin;
2523       m_dMaxPixel = dMax;
2524       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2525       OnUpdate (this, NULL);
2526     }
2527   }
2528 }
2529
2530 void
2531 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2532 {
2533   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2534   double min;
2535   double max;
2536
2537   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2538     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2539       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2540       return;
2541     }
2542   }
2543
2544   if (m_bMinSpecified)
2545     min = m_dMinPixel;
2546   if (m_bMaxSpecified)
2547     max = m_dMaxPixel;
2548
2549   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2550   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2551   if (retVal == wxID_OK) {
2552     m_bMinSpecified = true;
2553     m_bMaxSpecified = true;
2554     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2555     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2556     OnUpdate (this, NULL);
2557   }
2558 }
2559
2560 void
2561 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2562 {
2563   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2564     m_bMinSpecified = false;
2565     m_bMaxSpecified = false;
2566     OnUpdate (this, NULL);
2567   }
2568 }
2569
2570
2571 PlotFileCanvas*
2572 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2573 {
2574   PlotFileCanvas* pCanvas;
2575   int width, height;
2576   parent->GetClientSize(&width, &height);
2577
2578   pCanvas = new PlotFileCanvas (dynamic_cast<PlotFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2579
2580   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2581   pCanvas->Clear();
2582
2583   return pCanvas;
2584 }
2585
2586 wxFrame*
2587 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2588 {
2589 #ifdef CTSIM_MDI
2590   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2591 #else
2592   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2593 #endif
2594   theApp->setIconForFrame (subframe);
2595
2596   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
2597
2598   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2599   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2600   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2601   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2602   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2603   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2604
2605   file_menu->AppendSeparator();
2606   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2607
2608   file_menu->AppendSeparator();
2609   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2610   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2611   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2612
2613   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2614   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2615   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2616   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2617
2618   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2619   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2620   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2621   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2622
2623   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2624
2625   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
2626   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2627   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2628
2629   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2630   subframe->Centre(wxBOTH);
2631
2632   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
2633   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2634   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2635   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2636   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2637   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2638   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2639   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2640   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2641   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2642   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2643   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
2644   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2645
2646   return subframe;
2647 }
2648
2649
2650 bool
2651 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2652 {
2653   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2654   SetFrame(m_frame);
2655
2656   m_bMinSpecified = false;
2657   m_bMaxSpecified = false;
2658   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2659
2660   int width, height;
2661   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2662   m_frame->SetTitle ("Plot File");
2663   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
2664
2665 #ifdef __X__
2666   int x, y;  // X requires a forced resize
2667   m_frame->GetSize(&x, &y);
2668   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2669 #endif
2670
2671   m_frame->Show(true);
2672   Activate(true);
2673
2674   return true;
2675 }
2676
2677 void
2678 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2679 {
2680   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2681   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2682   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2683
2684   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2685     int xsize, ysize;
2686     m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2687     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2688     SGP sgp (driver);
2689     if (m_pEZPlot)
2690       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2691   }
2692 }
2693
2694
2695 void
2696 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2697 {
2698     const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2699     const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2700     const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2701
2702     if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2703       if (m_pEZPlot)
2704         delete m_pEZPlot;
2705       m_pEZPlot = new EZPlot;
2706
2707       for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2708         m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2709
2710       if (m_bMinSpecified) {
2711         std::ostringstream os;
2712         os << "ymin " << m_dMinPixel;
2713         m_pEZPlot->ezset (os.str());
2714       }
2715
2716       if (m_bMaxSpecified) {
2717         std::ostringstream os;
2718         os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2719         m_pEZPlot->ezset (os.str());
2720       }
2721
2722       m_pEZPlot->ezset("box");
2723       m_pEZPlot->ezset("grid");
2724
2725       double* pdXaxis = new double [iNRecords];
2726       rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
2727
2728       double* pdY = new double [iNRecords];
2729       for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
2730         rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
2731         m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
2732       }
2733
2734       delete pdXaxis;
2735       delete pdY;
2736     }
2737
2738     if (m_canvas)
2739       m_canvas->Refresh();
2740 }
2741
2742 bool
2743 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2744 {
2745   if (!GetDocument()->Close())
2746     return false;
2747
2748   m_canvas->Clear();
2749   // m_canvas->m_pView = NULL;
2750   m_canvas = NULL;
2751   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2752   if (m_frame)
2753     m_frame->SetTitle(s);
2754   SetFrame(NULL);
2755
2756   Activate(false);
2757
2758   if (deleteWindow) {
2759     delete m_frame;
2760     return true;
2761   }
2762   return true;
2763 }
2764