src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          views.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id$
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 #include "wx/wxprec.h"
  29 #ifndef WX_PRECOMP
  30 #include "wx/wx.h"
  31 #endif
  32
  33 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  34 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  35 #endif
  36
  37 #include "wx/image.h"
  38 #include "wx/progdlg.h"
  39 #include "wx/clipbrd.h"
  40
  41 #include "ct.h"
  42 #include "ctsim.h"
  43 #include "docs.h"
  44 #include "views.h"
  45 #include "dialogs.h"
  46 #include "dlgprojections.h"
  47 #include "dlgreconstruct.h"
  48 #include "backprojectors.h"
  49 #include "reconstruct.h"
  50 #include "timer.h"
  51 #include "threadproj.h"
  52 #include "threadrecon.h"
  53 #include "threadraster.h"
  54
  55 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  56 #include <sstream>
  57 #else
  58 #include <sstream_subst>
  59 #endif
  60
  61 // Used to reduce calls to progress bar update function
  62 const short int ITER_PER_UPDATE = 10;
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 EVT_CHAR(ImageFileCanvas::OnChar)
  69 END_EVENT_TABLE()
  70
  71
  72 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  73 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
  74 {
  75 }
  76
  77 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
  78 {}
  79
  80 void
  81 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  82 {
  83   if (m_pView)
  84     m_pView->OnDraw(& dc);
  85 }
  86
  87 void
  88 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  89 {
  90   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  91   int nx = rIF.nx();
  92   int ny = rIF.ny();
  93
  94   int yPt = ny - y - 1;
  95   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  96   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  97   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  98   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  99   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
 100 }
 101
 102 bool
 103 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 104 {
 105   x = m_xCursor;
 106   y = m_yCursor;
 107
 108   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 109     return true;
 110   else
 111     return false;
 112 }
 113
 114 void
 115 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 116 {
 117   if (! m_pView)
 118     return;
 119
 120
 121   wxClientDC dc(this);
 122   PrepareDC(dc);
 123
 124   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 125
 126   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 127   if (! pIFDoc)
 128     return;
 129   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 130   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 131   int nx = rIF.nx();
 132   int ny = rIF.ny();
 133   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 134   if (event.RightIsDown()) {
 135     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 136       wxString os;
 137       os << _T("Image value (") << pt.x << _T(",") << yPt << _T(") = ")
 138          << v[pt.x][yPt];
 139       if (rIF.isComplex()) {
 140         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 141         if (dImag < 0)
 142           os << _T(" - ") << -dImag;
 143         else
 144           os << _T(" + ") << dImag;
 145         os << _T("i\n");
 146       } else
 147         os << _T("\n");
 148       *theApp->getLog() << os;
 149     } else
 150       *theApp->getLog() << _T("Mouse out of image range (") << pt.x << _T(",") << yPt << _T(")\n");
 151   }
 152   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 153     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 154       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 155         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 156       }
 157       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 158       m_xCursor = pt.x;
 159       m_yCursor = yPt;
 160       wxMenu* pMenu = m_pView->getMenuAnalyze();
 161       if (pMenu && ! pMenu->IsEnabled(IFMENU_PLOT_ROW)) {
 162         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, true);
 163         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_COL, true);
 164         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, true);
 165         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, true);
 166         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, true);
 167         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, true);
 168       }
 169     } else
 170       *theApp->getLog() << _T("Mouse out of image range (") << pt.x << _T(",") << yPt << _T(")\n");
 171   }
 172   if (event.LeftUp()) {
 173     wxString os;
 174     os << _T("Selected column ") << pt.x << _T(" , row ") << yPt << _T("\n");
 175     *theApp->getLog() << os;
 176   }
 177 }
 178
 179 void
 180 ImageFileCanvas::OnChar (wxKeyEvent& event)
 181 {
 182   if (event.GetKeyCode() == WXK_ESCAPE) {
 183     m_xCursor = -1;
 184     m_yCursor = -1;
 185     if (m_pView)
 186       m_pView->OnUpdate (NULL);
 187   } else
 188     event.Skip();
 189 }
 190
 191 wxSize
 192 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 193 {
 194   const int iMinX = 50;
 195   const int iMinY = 20;
 196   wxSize bestSize (iMinX,iMinY);
 197
 198   if (m_pView) {
 199     const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 200     bestSize.Set  (rIF.nx(), rIF.ny());
 201   }
 202
 203   if (bestSize.x > 800)
 204     bestSize.x = 800;
 205   if (bestSize.y > 800)
 206     bestSize.y = 800;
 207
 208   if (bestSize.y < iMinY)
 209     bestSize.y = iMinY;
 210   if (bestSize.x < iMinX)
 211     bestSize.x = iMinX;
 212
 213   return bestSize;
 214 }
 215
 216
 217 // ImageFileView
 218
 219 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 220
 221 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 222 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 223 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 224 EVT_MENU(IFMENU_EDIT_COPY, ImageFileView::OnEditCopy)
 225 EVT_MENU(IFMENU_EDIT_CUT, ImageFileView::OnEditCut)
 226 EVT_MENU(IFMENU_EDIT_PASTE, ImageFileView::OnEditPaste)
 227 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 228 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 229 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 230 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 231 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 232 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 233 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 234 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 235 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 236 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 237 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 238 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 239 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 240 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 241 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 242 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 243 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 244 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 245 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 246 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 247 #if wxUSE_GLCANVAS
 248 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, ImageFileView::OnConvert3d)
 249 #endif
 250 #ifdef HAVE_FFT
 251 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 252 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 253 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 254 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 255 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 256 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 257 #endif
 258 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 259 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 260 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_REAL, ImageFileView::OnReal)
 261 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IMAGINARY, ImageFileView::OnImaginary)
 262 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 263 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 264 #ifdef HAVE_FFT
 265 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 266 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 267 #endif
 268 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 269 END_EVENT_TABLE()
 270
 271 ImageFileView::ImageFileView()
 272   :  wxView(), m_pBitmap(0), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pFileMenu(0),
 273      m_pFilterMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false),
 274      m_iDefaultExportFormatID(ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG)
 275 {}
 276
 277 ImageFileView::~ImageFileView()
 278 {
 279   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
 280   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE);
 281 }
 282
 283
 284 void
 285 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 286 {
 287   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 288   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 289     *theApp->getLog() << _T("Properties: empty imagefile\n");
 290   else {
 291     const std::string rFilename (m_pFrame->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8));
 292     std::ostringstream os;
 293     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 294     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 295     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 296     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 297     os << "Data type: ";
 298     if (rIF.isComplex())
 299       os << "Complex\n";
 300     else
 301       os << "Real\n";
 302     os << "Minimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 303     if (rIF.isComplex()) {
 304       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 305       os << "Imaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 306     }
 307     if (rIF.nLabels() > 0) {
 308       rIF.printLabelsBrief (os);
 309     }
 310     *theApp->getLog() << _T(">>>>\n") << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("<<<<\n");
 311     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()), _T("Imagefile Properties"), wxOK | wxICON_INFORMATION);
 312     dialogMsg.ShowModal();
 313   }
 314   GetDocument()->Activate();
 315 }
 316
 317 void
 318 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 319 {
 320   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 321   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 322   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 323   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 324   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 325   if (iRetVal == wxID_OK) {
 326     m_bMinSpecified = true;
 327     m_bMaxSpecified = true;
 328     double dMin, dMax;
 329     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 330       m_dMinPixel = dMin;
 331       m_dMaxPixel = dMax;
 332       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 333       OnUpdate(this, NULL);
 334       GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 335     }
 336   }
 337   GetDocument()->Activate();
 338 }
 339
 340 void
 341 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 342 {
 343   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 344   double min, max;
 345   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 346     rIF.getMinMax (min, max);
 347
 348   if (m_bMinSpecified)
 349     min = m_dMinPixel;
 350   if (m_bMaxSpecified)
 351     max = m_dMaxPixel;
 352
 353   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), _T("Set Image Minimum & Maximum"), min, max);
 354   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 355   if (retVal == wxID_OK) {
 356     m_bMinSpecified = true;
 357     m_bMaxSpecified = true;
 358     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 359     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 360     OnUpdate(this, NULL);
 361     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 362   }
 363   GetDocument()->Activate();
 364 }
 365
 366 void
 367 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 368 {
 369   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 370     m_bMinSpecified = false;
 371     m_bMaxSpecified = false;
 372     OnUpdate(this, NULL);
 373     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 374   }
 375   GetDocument()->Activate();
 376 }
 377
 378 void
 379 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 380 {
 381   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 382   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 383
 384   if (vecIF.size() == 0) {
 385     wxMessageBox(_T("There are no compatible image files open for comparision"), _T("No comparison images"));
 386   } else {
 387     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), _T("Get Comparison Image"), vecIF, true);
 388
 389     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 390       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 391       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 392       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 393       std::ostringstream os;
 394       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 395       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 396       os << m_pFrame->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8) << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 397       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 398       os << dynamic_cast<wxFrame*>(pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8) << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 399       double d, r, e;
 400       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 401       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 402       *theApp->getLog() << _T(">>>>\n") << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("<<<<\n");
 403       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 404         ImageFile* pDifferenceImage = new ImageFile;
 405
 406         pDifferenceImage->setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 407         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, *pDifferenceImage)) {
 408           *theApp->getLog() << _T("Unable to subtract images\n");
 409           delete pDifferenceImage;
 410           return;
 411         }
 412         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
 413         if (! pDifferenceDoc) {
 414           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 415           return;
 416         }
 417         pDifferenceDoc->setImageFile (pDifferenceImage);
 418
 419         wxString s = m_pFrame->GetTitle() + _T(": ");
 420         pDifferenceImage->labelsCopy (rIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 421         s = dynamic_cast<wxFrame*>(pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 422         pDifferenceImage->labelsCopy (rCompareIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 423         std::ostringstream osLabel;
 424         osLabel << "Compare image " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str()
 425                 << " and " << dynamic_cast<wxFrame*>(pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str() << ": "
 426           << os.str().c_str();
 427         pDifferenceImage->labelAdd (os.str().c_str());
 428         if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 429           pDifferenceDoc->Modify (true);
 430         OnUpdate(this, NULL);
 431         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
 432         pDifferenceDoc->getView()->setInitialClientSize();
 433         pDifferenceDoc->Activate();
 434       }
 435       wxMessageBox(wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()), _T("Image Comparison"));
 436     }
 437   }
 438 }
 439
 440 void
 441 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 442 {
 443   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 444   rIF.invertPixelValues (rIF);
 445   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 446   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 447     GetDocument()->Modify (true);
 448   OnUpdate(this, NULL);
 449   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 450   GetDocument()->Activate();
 451 }
 452
 453 void
 454 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 455 {
 456   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 457   rIF.square (rIF);
 458   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 459   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 460     GetDocument()->Modify (true);
 461   OnUpdate(this, NULL);
 462   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 463   GetDocument()->Activate();
 464 }
 465
 466 void
 467 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 468 {
 469   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 470   rIF.sqrt (rIF);
 471   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 472   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 473     GetDocument()->Modify (true);
 474   OnUpdate(this, NULL);
 475   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 476   GetDocument()->Activate();
 477 }
 478
 479 void
 480 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 481 {
 482   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 483   rIF.log (rIF);
 484   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 485   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 486     GetDocument()->Modify (true);
 487   OnUpdate(this, NULL);
 488   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 489   GetDocument()->Activate();
 490 }
 491
 492 void
 493 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 494 {
 495   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 496   rIF.exp (rIF);
 497   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 498   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 499     GetDocument()->Modify (true);
 500   OnUpdate(this, NULL);
 501   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 502   GetDocument()->Activate();
 503 }
 504
 505 void
 506 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 507 {
 508   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 509   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 510
 511   if (vecIF.size() == 0) {
 512     wxMessageBox (_T("There are no compatible image files open for comparision"), _T("No comparison images"));
 513   } else {
 514     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), _T("Get Image to Add"), vecIF, false);
 515
 516     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 517       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 518       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 519       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 520       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 521       if (! pNewDoc) {
 522         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 523         return;
 524       }
 525       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 526       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 527       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 528       std::ostringstream os;
 529       os << "Add image " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str() << " and "
 530          << dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
 531       wxString s = dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 532       newImage.labelsCopy (rIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 533       s = dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 534       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 535       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 536       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
 537       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 538         pNewDoc->Modify (true);
 539       OnUpdate(this, NULL);
 540       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 541       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 542       pNewDoc->Activate();
 543     }
 544   }
 545 }
 546
 547 void
 548 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 549 {
 550   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 551   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 552
 553   if (vecIF.size() == 0) {
 554     wxMessageBox (_T("There are no compatible image files open for comparision"), _T("No comparison images"));
 555   } else {
 556     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), _T("Get Image to Subtract"), vecIF, false);
 557
 558     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 559       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 560       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 561       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 562       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 563       if (! pNewDoc) {
 564         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 565         return;
 566       }
 567       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 568       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 569       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 570       std::ostringstream os;
 571       os << "Subtract image " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str() << " and "
 572          << dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
 573       wxString s = dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 574       newImage.labelsCopy (rIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 575       s = dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 576       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 577       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 578       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
 579       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 580         pNewDoc->Modify (true);
 581       OnUpdate(this, NULL);
 582       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 583       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 584       pNewDoc->Activate();
 585     }
 586   }
 587 }
 588
 589 void
 590 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 591 {
 592   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 593   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 594
 595   if (vecIF.size() == 0) {
 596     wxMessageBox (_T("There are no compatible image files open for comparision"), _T("No comparison images"));
 597   } else {
 598     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), _T("Get Image to Multiply"), vecIF, false);
 599
 600     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 601       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 602       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 603       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 604       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 605       if (! pNewDoc) {
 606         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 607         return;
 608       }
 609       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 610       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 611       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 612       std::ostringstream os;
 613       os << "Multiply image " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str() << " and "
 614          << dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
 615       wxString s = dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 616       newImage.labelsCopy (rIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 617       s = dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 618       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 619       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 620       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
 621       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 622         pNewDoc->Modify (true);
 623       OnUpdate(this, NULL);
 624       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 625       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 626       pNewDoc->Activate();
 627     }
 628   }
 629 }
 630
 631 void
 632 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 633 {
 634   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 635   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 636
 637   if (vecIF.size() == 0) {
 638     wxMessageBox (_T("There are no compatible image files open for comparision"), _T("No comparison images"));
 639   } else {
 640     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), _T("Get Image to Divide"), vecIF, false);
 641
 642     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 643       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 644       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 645       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 646       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 647       if (! pNewDoc) {
 648         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 649         return;
 650       }
 651       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 652       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 653       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 654       std::ostringstream os;
 655       os << "Divide image " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str() << " by "
 656          << dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
 657       wxString s = dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 658       newImage.labelsCopy (rIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 659       s = dynamic_cast<wxFrame*>(pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle() + _T(": ");
 660       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.mb_str(wxConvUTF8));
 661       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 662       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
 663       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 664         pNewDoc->Modify (true);
 665       OnUpdate(this, NULL);
 666       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 667       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 668       pNewDoc->Activate();
 669     }
 670   }
 671 }
 672
 673
 674 #ifdef HAVE_FFT
 675 void
 676 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 677 {
 678   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 679   rIF.fft (rIF);
 680   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 681   m_bMinSpecified = false;
 682   m_bMaxSpecified = false;
 683   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 684     GetDocument()->Modify (true);
 685   OnUpdate(this, NULL);
 686   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 687   GetDocument()->Activate();
 688 }
 689
 690 void
 691 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 692 {
 693   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 694   rIF.ifft (rIF);
 695   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 696   m_bMinSpecified = false;
 697   m_bMaxSpecified = false;
 698   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 699     GetDocument()->Modify (true);
 700   OnUpdate(this, NULL);
 701   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 702   GetDocument()->Activate();
 703 }
 704
 705 void
 706 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 707 {
 708   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 709   rIF.fftRows (rIF);
 710   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 711   m_bMinSpecified = false;
 712   m_bMaxSpecified = false;
 713   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 714     GetDocument()->Modify (true);
 715   OnUpdate(this, NULL);
 716   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 717   GetDocument()->Activate();
 718 }
 719
 720 void
 721 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 722 {
 723   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 724   rIF.ifftRows (rIF);
 725   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 726   m_bMinSpecified = false;
 727   m_bMaxSpecified = false;
 728   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 729     GetDocument()->Modify (true);
 730   OnUpdate(this, NULL);
 731   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 732   GetDocument()->Activate();
 733 }
 734
 735 void
 736 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 737 {
 738   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 739   rIF.fftCols (rIF);
 740   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 741   m_bMinSpecified = false;
 742   m_bMaxSpecified = false;
 743   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 744     GetDocument()->Modify (true);
 745   OnUpdate(this, NULL);
 746   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 747   GetDocument()->Activate();
 748 }
 749
 750 void
 751 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 752 {
 753   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 754   rIF.ifftCols (rIF);
 755   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 756   m_bMinSpecified = false;
 757   m_bMaxSpecified = false;
 758   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 759     GetDocument()->Modify (true);
 760   OnUpdate(this, NULL);
 761   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 762   GetDocument()->Activate();
 763 }
 764 #endif
 765
 766 void
 767 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 768 {
 769   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 770   wxProgressDialog dlgProgress (_T("Fourier"), _T("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 771   rIF.fourier (rIF);
 772   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 773   m_bMinSpecified = false;
 774   m_bMaxSpecified = false;
 775   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 776     GetDocument()->Modify (true);
 777   OnUpdate(this, NULL);
 778   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 779   GetDocument()->Activate();
 780 }
 781
 782 void
 783 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 784 {
 785   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 786   wxProgressDialog dlgProgress (_T("Inverse Fourier"), _T("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 787   rIF.inverseFourier (rIF);
 788   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 789   m_bMinSpecified = false;
 790   m_bMaxSpecified = false;
 791   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 792     GetDocument()->Modify (true);
 793   OnUpdate(this, NULL);
 794   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 795   GetDocument()->Activate();
 796 }
 797
 798 void
 799 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 800 {
 801   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 802   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 803   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 804   m_bMinSpecified = false;
 805   m_bMaxSpecified = false;
 806   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 807     GetDocument()->Modify (true);
 808   OnUpdate(this, NULL);
 809   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 810   GetDocument()->Activate();
 811 }
 812
 813 void
 814 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 815 {
 816   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 817   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 818   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 819   m_bMinSpecified = false;
 820   m_bMaxSpecified = false;
 821   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 822     GetDocument()->Modify (true);
 823   OnUpdate(this, NULL);
 824   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 825   GetDocument()->Activate();
 826 }
 827
 828 void
 829 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 830 {
 831   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 832   rIF.magnitude (rIF);
 833   rIF.labelAdd ("Magnitude");
 834   m_bMinSpecified = false;
 835   m_bMaxSpecified = false;
 836   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 837     GetDocument()->Modify (true);
 838   OnUpdate(this, NULL);
 839   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 840   GetDocument()->Activate();
 841 }
 842
 843 void
 844 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 845 {
 846   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 847   if (rIF.isComplex()) {
 848     rIF.phase (rIF);
 849     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 850     m_bMinSpecified = false;
 851     m_bMaxSpecified = false;
 852     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 853       GetDocument()->Modify (true);
 854     OnUpdate(this, NULL);
 855     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 856   }
 857   GetDocument()->Activate();
 858 }
 859
 860 void
 861 ImageFileView::OnReal (wxCommandEvent& event)
 862 {
 863   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 864   if (rIF.isComplex()) {
 865     rIF.real (rIF);
 866     rIF.labelAdd ("Real component of complex-image");
 867     m_bMinSpecified = false;
 868     m_bMaxSpecified = false;
 869     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 870       GetDocument()->Modify (true);
 871     OnUpdate(this, NULL);
 872     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 873   }
 874   GetDocument()->Activate();
 875 }
 876
 877 void
 878 ImageFileView::OnImaginary (wxCommandEvent& event)
 879 {
 880   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 881   if (rIF.isComplex()) {
 882     rIF.imaginary (rIF);
 883     rIF.labelAdd ("Imaginary component of complex-image");
 884     m_bMinSpecified = false;
 885     m_bMaxSpecified = false;
 886     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 887       GetDocument()->Modify (true);
 888     OnUpdate(this, NULL);
 889     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 890   }
 891   GetDocument()->Activate();
 892 }
 893
 894
 895 ImageFileCanvas*
 896 ImageFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
 897 {
 898   ImageFileCanvas* pCanvas = new ImageFileCanvas (this, parent, wxPoint(-1,-1),
 899                                                   wxSize(-1,-1), 0);
 900   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 901   pCanvas->ClearBackground();
 902
 903   return pCanvas;
 904 }
 905
 906 #if CTSIM_MDI
 907 wxDocMDIChildFrame*
 908 #else
 909 wxDocChildFrame*
 910 #endif
 911 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 912 {
 913 #if CTSIM_MDI
 914   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("ImageFile Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 915 #else
 916   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("ImageFile Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 917 #endif
 918   theApp->setIconForFrame (subframe);
 919
 920   m_pFileMenu = new wxMenu;
 921   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, _T("Cr&eate Phantom...\tCtrl-P"));
 922   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, _T("Create &Filter...\tCtrl-F"));
 923   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, _T("&Open...\tCtrl-O"));
 924   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, _T("&Save\tCtrl-S"));
 925   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, _T("Save &As..."));
 926   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, _T("&Close\tCtrl-W"));
 927   m_pFileMenu->Append(wxID_REVERT, _T("Re&vert"));
 928
 929   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 930   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, _T("P&roperties\tCtrl-I"));
 931   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, _T("Expor&t..."));
 932
 933   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 934   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, _T("&Print..."));
 935   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, _T("Print &Setup..."));
 936   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, _T("Print Preview"));
 937   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 938   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, _T("&Import...\tCtrl-M"));
 939   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 940   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, _T("Prefere&nces..."));
 941   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, _T("E&xit"));
 942   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
 943   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
 944
 945   wxMenu* edit_menu = new wxMenu;
 946   edit_menu->Append(IFMENU_EDIT_COPY, _T("Copy\tCtrl-C"));
 947   edit_menu->Append(IFMENU_EDIT_CUT, _T("Cut\tCtrl-X"));
 948   edit_menu->Append(IFMENU_EDIT_PASTE, _T("Paste\tCtrl-V"));
 949
 950   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 951   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, _T("Display Scale S&et...\tCtrl-E"));
 952   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, _T("Display Scale &Auto...\tCtrl-A"));
 953   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, _T("Display F&ull Scale\tCtrl-U"));
 954
 955   m_pFilterMenu = new wxMenu;
 956   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, _T("In&vert Values"));
 957   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, _T("&Square"));
 958   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, _T("Square &Root"));
 959   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, _T("&Log"));
 960   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, _T("E&xp"));
 961   m_pFilterMenu->AppendSeparator();
 962 #ifdef HAVE_FFT
 963   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, _T("2-D &FFT\tCtrl-2"));
 964   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, _T("2-D &IFFT\tAlt-2"));
 965   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, _T("FFT Rows"));
 966   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, _T("IFFT Rows"));
 967   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, _T("FFT Columns"));
 968   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, _T("IFFT Columns"));
 969   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, _T("2-D F&ourier"));
 970   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, _T("2-D Inverse Fo&urier"));
 971 #else
 972   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, _T("&Fourier"));
 973   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, _T("&Inverse Fourier"));
 974 #endif
 975   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, _T("Shuffl&e Fourier to Natural Order"));
 976   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, _T("Shuffle &Natural to Fourier Order"));
 977   m_pFilterMenu->AppendSeparator();
 978   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, _T("&Magnitude"));
 979   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, _T("&Phase"));
 980   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_REAL, _T("Re&al"));
 981   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IMAGINARY, _T("Ima&ginary"));
 982
 983   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 984   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, _T("&Add..."));
 985   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, _T("&Subtract..."));
 986   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, _T("&Multiply..."));
 987   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, _T("&Divide..."));
 988   image_menu->AppendSeparator();
 989   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, _T("S&cale Size..."));
 990 #if wxUSE_GLCANVAS
 991   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, _T("Convert &3-D\tCtrl-3"));
 992 #endif
 993
 994   m_pMenuAnalyze = new wxMenu;
 995   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_ROW, _T("Plot &Row"));
 996   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_COL, _T("Plot &Column"));
 997   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, _T("Plot &Histogram"));
 998   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 999   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, _T("P&lot FFT Row"));
1000   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, _T("Plo&t FFT Column"));
1001   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
1002   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, _T("Compare &Images..."));
1003   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, _T("Compare Ro&w"));
1004   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_COL, _T("Compare Colu&mn"));
1005   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, false);
1006   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_COL, false);
1007   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, false);
1008   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, false);
1009   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, false);
1010   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, false);
1011
1012   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1013   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, _T("&Contents\tF1"));
1014   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, _T("&Tips"));
1015   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, _T("&Quick Start"));
1016   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, _T("&About"));
1017
1018   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1019
1020   menu_bar->Append(m_pFileMenu, _T("&File"));
1021   menu_bar->Append(edit_menu, _T("&Edit"));
1022   menu_bar->Append(view_menu, _T("&View"));
1023   menu_bar->Append(image_menu, _T("&Image"));
1024   menu_bar->Append(m_pFilterMenu, _T("Fi&lter"));
1025   menu_bar->Append(m_pMenuAnalyze, _T("&Analyze"));
1026   menu_bar->Append(help_menu, _T("&Help"));
1027
1028   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1029
1030   subframe->Centre(wxBOTH);
1031
1032   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
1033   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
1034   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
1035   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
1036   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), IFMENU_FILE_PROPERTIES);
1037   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('C'), IFMENU_EDIT_COPY);
1038   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('X'), IFMENU_EDIT_CUT);
1039   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('V'), IFMENU_EDIT_PASTE);
1040   int iEntry = 7;
1041 #ifdef HAVE_FFT
1042   accelEntries[iEntry++].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('2'), IFMENU_FILTER_FFT);
1043   accelEntries[iEntry++].Set (wxACCEL_ALT,  static_cast<int>('2'), IFMENU_FILTER_IFFT);
1044 #endif
1045 #if wxUSE_GLCANVAS
1046   accelEntries[iEntry++].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('3'), IFMENU_IMAGE_CONVERT3D);
1047 #endif
1048
1049   wxAcceleratorTable accelTable (iEntry, accelEntries);
1050   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
1051
1052   return subframe;
1053 }
1054
1055
1056 bool
1057 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1058 {
1059   m_bMinSpecified = false;
1060   m_bMaxSpecified = false;
1061   m_dAutoScaleFactor = 1.;
1062
1063   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
1064   SetFrame (m_pFrame);
1065   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
1066   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
1067   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
1068   m_pFrame->SetTitle(_T("ImageFileView"));
1069
1070   m_pFrame->Show(true);
1071   Activate(true);
1072
1073   return true;
1074 }
1075
1076 void
1077 ImageFileView::setInitialClientSize ()
1078 {
1079   if (m_pFrame && m_pCanvas) {
1080     wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
1081
1082     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
1083     m_pFrame->Show (true);
1084     m_pFrame->SetFocus();
1085   }
1086 }
1087
1088 void
1089 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
1090 {
1091   if (m_pBitmap && m_pBitmap->Ok()) {
1092 #ifdef DEBUG
1093     *theApp->getLog() << _T("Drawing bitmap\n");
1094 #endif
1095     dc->DrawBitmap(*m_pBitmap, 0, 0, false);
1096   }
1097
1098   int xCursor, yCursor;
1099   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
1100     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
1101 }
1102
1103
1104 void
1105 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
1106 {
1107   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1108   if (m_pFilterMenu && rIF.isComplex()) {
1109     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_REAL, true);
1110     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_IMAGINARY, true);
1111     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_PHASE, true);
1112   } else {
1113     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_REAL, false);
1114     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_IMAGINARY, false);
1115     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_PHASE, false);
1116   }
1117   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1118   int nx = rIF.nx();
1119   int ny = rIF.ny();
1120   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1121     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1122       double min, max;
1123       rIF.getMinMax (min, max);
1124       if (! m_bMinSpecified)
1125         m_dMinPixel = min;
1126       if (! m_bMaxSpecified)
1127         m_dMaxPixel = max;
1128     }
1129     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
1130
1131     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
1132     if (! imageData) {
1133       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for Image display");
1134       return;
1135     }
1136     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
1137       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1138         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
1139         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
1140         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
1141         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
1142         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
1143       }
1144     }
1145     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
1146     if (m_pBitmap) {
1147       delete m_pBitmap;
1148       m_pBitmap = NULL;
1149     }
1150 #ifdef DEBUG
1151     *theApp->getLog() << _T("Making new bitmap\n");
1152 #endif
1153     m_pBitmap = new wxBitmap (image);
1154     delete imageData;
1155     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
1156     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1157   }
1158
1159   if (m_pCanvas)
1160     m_pCanvas->Refresh();
1161 }
1162
1163 bool
1164 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1165 {
1166   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1167     return false;
1168
1169   Activate (false);
1170   if (m_pCanvas) {
1171     m_pCanvas->setView(NULL);
1172     m_pCanvas = NULL;
1173   }
1174   wxString s(theApp->GetAppName());
1175   if (m_pFrame)
1176     m_pFrame->SetTitle(s);
1177
1178   SetFrame(NULL);
1179
1180   if (deleteWindow) {
1181     delete m_pFrame;
1182     m_pFrame = NULL;
1183     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
1184       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
1185   }
1186
1187   return true;
1188 }
1189
1190 void
1191 ImageFileView::OnEditCopy (wxCommandEvent& event)
1192 {
1193   wxBitmapDataObject *pBitmapObject = new wxBitmapDataObject;
1194
1195   if (m_pBitmap)
1196     pBitmapObject->SetBitmap (*m_pBitmap);
1197
1198   if (wxTheClipboard->Open()) {
1199     wxTheClipboard->SetData (pBitmapObject);
1200     wxTheClipboard->Close();
1201   }
1202 }
1203
1204 void
1205 ImageFileView::OnEditCut (wxCommandEvent& event)
1206 {
1207   OnEditCopy (event);
1208   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1209   int nx = rIF.nx();
1210   int ny = rIF.ny();
1211   ImageFile* pIF = new ImageFile (nx, ny);
1212   pIF->arrayDataClear();
1213   GetDocument()->setImageFile (pIF); // deletes old IF
1214   OnUpdate(this, NULL);
1215   GetDocument()->UpdateAllViews();
1216   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1217     GetDocument()->Modify (true);
1218 }
1219
1220 void
1221 ImageFileView::OnEditPaste (wxCommandEvent& event)
1222 {
1223   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1224
1225   if (wxTheClipboard->Open()) {
1226     wxBitmap bitmap;
1227     if (wxTheClipboard->IsSupported (wxDF_BITMAP)) {
1228       wxBitmapDataObject bitmapObject;
1229       wxTheClipboard->GetData (bitmapObject);
1230       bitmap = bitmapObject.GetBitmap ();
1231     }
1232     wxTheClipboard->Close();
1233
1234     int nx = rIF.nx();
1235     int ny = rIF.ny();
1236     bool bMonochrome = false;
1237
1238     if (bitmap.Ok() == true && bitmap.GetWidth() == nx && bitmap.GetHeight() == ny) {
1239       wxImage image (bitmap.ConvertToImage());
1240       double dScale3 = 3 * 255;
1241       unsigned char* pixels = image.GetData();
1242       ImageFileArray v = rIF.getArray();
1243       for (unsigned int ix = 0; ix < rIF.nx(); ix++) {
1244         for (unsigned int iy = 0; iy < rIF.ny(); iy++) {
1245           unsigned int iBase = 3 * (iy * nx + ix);
1246           if (ix == 0 && iy == 0 && (pixels[iBase] == pixels[iBase+1] && pixels[iBase+1] == pixels[iBase+2]))
1247             bMonochrome = true;
1248           if (bMonochrome) {
1249             v[ix][ny - 1 - iy] = (pixels[iBase]+pixels[iBase+1]+pixels[iBase+2]) / dScale3;
1250           } else {
1251             double dR = pixels[iBase] / 255.;
1252             double dG = pixels[iBase+1] / 255.;
1253             double dB = pixels[iBase+2] / 255.;
1254             v[ix][ny - 1 - iy] = ImageFile::colorToGrayscale (dR, dG, dB);
1255           }
1256         }
1257       }
1258       OnUpdate(this, NULL);
1259       GetDocument()->UpdateAllViews();
1260       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1261         GetDocument()->Modify(true);
1262     }
1263   }
1264 }
1265
1266 void
1267 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1268 {
1269   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1270   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1271   int nx = rIF.nx();
1272   int ny = rIF.ny();
1273   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1274     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1275       double min, max;
1276       rIF.getMinMax (min, max);
1277       if (! m_bMinSpecified)
1278         m_dMinPixel = min;
1279       if (! m_bMaxSpecified)
1280         m_dMaxPixel = max;
1281     }
1282
1283     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1284     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1285       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName (), wxConvUTF8);
1286       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertExportFormatNameToID (strFormatName.mb_str(wxConvUTF8));
1287
1288       wxString strExt;
1289       wxString strWildcard;
1290       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PGMASCII) {
1291         strExt = _T(".pgm");
1292         strWildcard = _T("PGM Files (*.pgm)|*.pgm");
1293       }
1294 #ifdef HAVE_PNG
1295       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG16) {
1296         strExt = _T(".png");
1297         strWildcard = _T("PNG Files (*.png)|*.png");
1298       }
1299 #endif
1300 #ifdef HAVE_CTN_DICOM
1301       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_DICOM) {
1302         strExt = _T("");
1303         strWildcard = _T("DICOM Files (*.*)|*.*");
1304       }
1305 #endif
1306       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_TEXT) {
1307         strExt = _T(".txt");
1308         strWildcard = _T("Text (*.txt)|*.txt");
1309       }
1310       else {
1311         strExt = _T("");
1312         strWildcard = _T("Miscellaneous (*.*)|*.*");
1313       }
1314
1315 #if WXWIN_COMPATIBILITY_2_4
1316       const wxString& strFilename = wxFileSelector (_T("Export Filename"), _T(""),
1317         _T(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1318 #else
1319       const wxString& strFilename = wxFileSelector (_T("Export Filename"), _T(""),
1320         _T(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxSAVE);
1321 #endif
1322       if (strFilename) {
1323         rIF.exportImage (strFormatName.mb_str(wxConvUTF8), strFilename.mb_str(wxConvUTF8), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1324         *theApp->getLog() << _T("Exported file ") << strFilename << _T("\n");
1325       }
1326     }
1327   }
1328 }
1329
1330 void
1331 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1332 {
1333   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1334   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1335   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1336
1337   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), _T("Set New X & Y Dimensions"), iOldNX, iOldNY);
1338   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1339     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1340     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1341     std::ostringstream os;
1342     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1343     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1344     if (! pScaledDoc) {
1345       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1346       return;
1347     }
1348     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1349     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1350     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1351     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1352     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1353     *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1354     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1355       pScaledDoc->Modify (true);
1356     OnUpdate(this, NULL);
1357     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1358     pScaledDoc->getView()->setInitialClientSize();
1359     pScaledDoc->Activate();
1360   }
1361 }
1362
1363 #if wxUSE_GLCANVAS
1364 void
1365 ImageFileView::OnConvert3d (wxCommandEvent& event)
1366 {
1367   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1368   Graph3dFileDocument* pGraph3d = theApp->newGraph3dDoc();
1369   pGraph3d->getView()->getFrame()->Show (false);
1370   pGraph3d->setBadFileOpen();
1371   pGraph3d->createFromImageFile (rIF);
1372   pGraph3d->UpdateAllViews();
1373   pGraph3d->getView()->getFrame()->Show (true);
1374   pGraph3d->getView()->Activate(true);
1375   ::wxYield();
1376   pGraph3d->getView()->getCanvas()->SetFocus();
1377 }
1378 #endif
1379
1380 void
1381 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1382 {
1383   int xCursor, yCursor;
1384   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1385     wxMessageBox (_T("No row selected. Please use left mouse button on image to select column"),_T("Error"));
1386     return;
1387   }
1388
1389   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1390   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1391   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1392   int nx = rIF.nx();
1393   int ny = rIF.ny();
1394
1395   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1396     double* pX = new double [nx];
1397     double* pYReal = new double [nx];
1398     double *pYImag = NULL;
1399     double *pYMag = NULL;
1400     if (rIF.isComplex()) {
1401       pYImag = new double [nx];
1402       pYMag = new double [nx];
1403     }
1404     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1405       pX[i] = i;
1406       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1407       if (rIF.isComplex()) {
1408         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1409         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1410       }
1411     }
1412     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1413     if (! pPlotDoc) {
1414       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1415     } else {
1416       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1417       std::ostringstream os;
1418       os << "Row " << yCursor;
1419       std::string title("title ");
1420       title += os.str();
1421       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1422       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1423       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1424       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1425       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1426       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1427       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1428       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1429       if (rIF.isComplex()) {
1430         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1431         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1432         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1433         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1434         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1435         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1436         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1437         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1438       } else
1439         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1440       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1441       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1442       if (rIF.isComplex()) {
1443         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1444         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1445       }
1446       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1447         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1448       os << " Plot of " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
1449       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1450       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1451     }
1452     delete pX;
1453     delete pYReal;
1454     if (rIF.isComplex()) {
1455       delete pYImag;
1456       delete pYMag;
1457     }
1458     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1459       pPlotDoc->Modify (true);
1460     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1461     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1462     pPlotDoc->Activate();
1463   }
1464 }
1465
1466 void
1467 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1468 {
1469   int xCursor, yCursor;
1470   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1471     wxMessageBox (_T("No column selected. Please use left mouse button on image to select column"),_T("Error"));
1472     return;
1473   }
1474
1475   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1476   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1477   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1478   int nx = rIF.nx();
1479   int ny = rIF.ny();
1480
1481   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1482     double* pX = new double [ny];
1483     double* pYReal = new double [ny];
1484     double* pYImag = NULL;
1485     double* pYMag = NULL;
1486     if (rIF.isComplex()) {
1487       pYImag = new double [ny];
1488       pYMag = new double [ny];
1489     }
1490     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1491       pX[i] = i;
1492       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1493       if (rIF.isComplex()) {
1494         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1495         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1496       }
1497     }
1498     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1499     if (! pPlotDoc) {
1500       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1501     } else {
1502       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1503       std::ostringstream os;
1504       os << "Column " << xCursor;
1505       std::string title("title ");
1506       title += os.str();
1507       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1508       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1509       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1510       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1511       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1512       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1513       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1514       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1515       if (rIF.isComplex()) {
1516         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1517         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1518         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1519         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1520         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1521         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1522         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1523         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1524       } else
1525         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1526       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1527       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1528       if (rIF.isComplex()) {
1529         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1530         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1531       }
1532       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1533         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1534       os << " Plot of " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
1535       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1536       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1537     }
1538     delete pX;
1539     delete pYReal;
1540     if (rIF.isComplex()) {
1541       delete pYImag;
1542       delete pYMag;
1543     }
1544     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1545       pPlotDoc->Modify (true);
1546     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1547     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1548     pPlotDoc->Activate();
1549   }
1550 }
1551
1552 #ifdef HAVE_FFT
1553 void
1554 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1555 {
1556   int xCursor, yCursor;
1557   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1558     wxMessageBox (_T("No row selected. Please use left mouse button on image to select column"),_T("Error"));
1559     return;
1560   }
1561
1562   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1563   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1564   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1565   int nx = rIF.nx();
1566   int ny = rIF.ny();
1567
1568   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1569     fftw_complex* pcIn = static_cast<fftw_complex*>(fftw_malloc (sizeof(fftw_complex) * nx));
1570
1571     int i;
1572     for (i = 0; i < nx; i++) {
1573       pcIn[i][0] = v[i][yCursor];
1574       if (rIF.isComplex())
1575         pcIn[i][1] = vImag[i][yCursor];
1576       else
1577         pcIn[i][1] = 0;
1578     }
1579
1580     fftw_plan plan = fftw_plan_dft_1d (nx, pcIn, pcIn, FFTW_FORWARD, FFTW_ESTIMATE);
1581     fftw_execute (plan);
1582     fftw_destroy_plan (plan);
1583
1584     double* pX = new double [nx];
1585     double* pYReal = new double [nx];
1586     double* pYImag = new double [nx];
1587     double* pYMag = new double [nx];
1588     for (i = 0; i < nx; i++) {
1589       pX[i] = i;
1590       pYReal[i] = pcIn[i][0] / nx;
1591       pYImag[i] = pcIn[i][1] / nx;
1592       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i][0] * pcIn[i][0] + pcIn[i][1] * pcIn[i][1]);
1593     }
1594     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1595     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1596     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1597
1598     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1599     if (! pPlotDoc) {
1600       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1601     } else {
1602       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1603       std::ostringstream os;
1604       os << "Row " << yCursor;
1605       std::string title("title ");
1606       title += os.str();
1607       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1608       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1609       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1610       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1611       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1612       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1613       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1614       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1615       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1616       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1617       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1618       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1619       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1620       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1621       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1622       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1623       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1624       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1625       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1626       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1627       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1628         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1629       os << " FFT Plot of " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
1630       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1631       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1632     }
1633     delete pX;
1634     delete pYReal;
1635     delete pYImag;
1636     delete pYMag;
1637     fftw_free(pcIn);
1638
1639     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1640       pPlotDoc->Modify (true);
1641     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1642     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1643     pPlotDoc->Activate();
1644   }
1645 }
1646
1647 void
1648 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1649 {
1650   int xCursor, yCursor;
1651   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1652     wxMessageBox (_T("No column selected. Please use left mouse button on image to select column"),_T("Error"));
1653     return;
1654   }
1655
1656   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1657   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1658   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1659   int nx = rIF.nx();
1660   int ny = rIF.ny();
1661
1662   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1663     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1664     double *pdTemp = new double [ny];
1665
1666     int i;
1667     for (i = 0; i < ny; i++)
1668       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1669     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1670     for (i = 0; i < ny; i++)
1671       pcIn[i][0] = pdTemp[i];
1672
1673     for (i = 0; i < ny; i++) {
1674       if (rIF.isComplex())
1675         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1676       else
1677         pdTemp[i] = 0;
1678     }
1679     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1680     for (i = 0; i < ny; i++)
1681       pcIn[i][1] = pdTemp[i];
1682
1683     fftw_plan plan = fftw_plan_dft_1d (ny, pcIn, pcIn, FFTW_BACKWARD, FFTW_ESTIMATE);
1684     fftw_execute (plan);
1685     fftw_destroy_plan (plan);
1686
1687     double* pX = new double [ny];
1688     double* pYReal = new double [ny];
1689     double* pYImag = new double [ny];
1690     double* pYMag = new double [ny];
1691     for (i = 0; i < ny; i++) {
1692       pX[i] = i;
1693       pYReal[i] = pcIn[i][0] / ny;
1694       pYImag[i] = pcIn[i][1] / ny;
1695       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i][0] * pcIn[i][0] + pcIn[i][1] * pcIn[i][1]);
1696     }
1697
1698     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1699     if (! pPlotDoc) {
1700       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1701     } else {
1702       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1703       std::ostringstream os;
1704       os << "Column " << xCursor;
1705       std::string title("title ");
1706       title += os.str();
1707       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1708       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1709       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1710       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1711       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1712       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1713       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1714       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1715       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1716       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1717       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1718       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1719       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1720       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1721       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1722       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1723       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1724       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1725       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1726       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1727       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1728         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1729       os << " FFT Plot of " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
1730       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1731       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1732     }
1733     delete pX;
1734     delete pYReal;
1735     delete pYImag;
1736     delete pYMag;
1737     delete pdTemp;
1738     delete [] pcIn;
1739
1740     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1741       pPlotDoc->Modify (true);
1742     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1743     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1744     pPlotDoc->Activate();
1745   }
1746 }
1747 #endif
1748
1749 void
1750 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1751 {
1752   int xCursor, yCursor;
1753   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1754     wxMessageBox (_T("No column selected. Please use left mouse button on image to select column"),_T("Error"));
1755     return;
1756   }
1757
1758   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1759   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1760   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1761     wxMessageBox (_T("No compatible images for Column Comparison"), _T("Error"));
1762     return;
1763   }
1764   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), _T("Get Comparison Image"), vecIFDoc, false);
1765
1766   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1767     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1768     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1769     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1770
1771     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1772     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1773     int nx = rIF.nx();
1774     int ny = rIF.ny();
1775
1776     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1777       double* pX = new double [ny];
1778       double* pY1 = new double [ny];
1779       double* pY2 = new double [ny];
1780       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1781         pX[i] = i;
1782         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1783         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1784       }
1785       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1786       if (! pPlotDoc) {
1787         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1788       } else {
1789         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1790         std::ostringstream os;
1791         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1792         std::string title("title ");
1793         title += os.str();
1794         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1795         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1796         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1797         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1798         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1799         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1800         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1801         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1802         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1803         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1804         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1805         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1806         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1807         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1808         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1809
1810         unsigned int iL;
1811         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1812           std::ostringstream os;
1813           os << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8);
1814           os << ": " << rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1815           rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1816         }
1817         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1818           std::ostringstream os;
1819           os << dynamic_cast<wxFrame*>(pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8);
1820           os << ": ";
1821           os << rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1822           rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1823         }
1824         os << " Between " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str() << " and "
1825            << dynamic_cast<wxFrame*>(pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
1826         *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1827         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1828       }
1829       delete pX;
1830       delete pY1;
1831       delete pY2;
1832       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1833         pPlotDoc->Modify (true);
1834       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1835       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1836       pPlotDoc->Activate();
1837     }
1838   }
1839 }
1840
1841 void
1842 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1843 {
1844   int xCursor, yCursor;
1845   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1846     wxMessageBox (_T("No column selected. Please use left mouse button on image to select column"),_T("Error"));
1847     return;
1848   }
1849
1850   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1851   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1852
1853   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1854     wxMessageBox (_T("No compatible images for Row Comparison"), _T("Error"));
1855     return;
1856   }
1857
1858   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), _T("Get Comparison Image"), vecIFDoc, false);
1859
1860   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1861     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1862     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1863     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1864
1865     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1866     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1867     int nx = rIF.nx();
1868     int ny = rIF.ny();
1869
1870     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1871       double* pX = new double [nx];
1872       double* pY1 = new double [nx];
1873       double* pY2 = new double [nx];
1874       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1875         pX[i] = i;
1876         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1877         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1878       }
1879       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1880       if (! pPlotDoc) {
1881         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1882       } else {
1883         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1884         std::ostringstream os;
1885         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1886         std::string title("title ");
1887         title += os.str();
1888         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1889         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1890         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1891         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1892         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1893         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1894         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1895         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1896         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1897         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1898         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1899         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1900         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1901         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1902         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1903         unsigned int iL;
1904         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1905           std::ostringstream os;
1906           os << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8);
1907           os << ": ";
1908           os << rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1909           rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1910         }
1911         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1912           std::ostringstream os;
1913           os << dynamic_cast<wxFrame*>(pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8) << ": "
1914              << rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1915           rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1916         }
1917         os << " Between " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8) << " and "
1918            << dynamic_cast<wxFrame*>(pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
1919         *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1920         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1921       }
1922       delete pX;
1923       delete pY1;
1924       delete pY2;
1925       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1926         pPlotDoc->Modify (true);
1927       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1928       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1929       pPlotDoc->Activate();
1930     }
1931   }
1932 }
1933
1934 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1935
1936 void
1937 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1938 {
1939   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1940   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1941   int nx = rIF.nx();
1942   int ny = rIF.ny();
1943
1944   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1945     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1946     if (! pPlotDoc) {
1947       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1948       return;
1949     }
1950
1951     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1952     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1953     double dMin, dMax;
1954     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1955     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1956
1957     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1958       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1959       pY[i] = 0;
1960     }
1961     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1962       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1963         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1964         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1965           pY[iBin] += 1;
1966       }
1967
1968       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1969       std::ostringstream os;
1970       os << "Histogram";
1971       std::string title("title ");
1972       title += os.str();
1973       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1974       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1975       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1976       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1977       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1978       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1979       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1980       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1981       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1982         std::ostringstream os;
1983         os << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8);
1984         os << ": " << rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1985         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1986       }
1987       os << "  plot of " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
1988       *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
1989       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1990       delete pX;
1991       delete pY;
1992       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1993         pPlotDoc->Modify (true);
1994       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1995       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1996       pPlotDoc->Activate();
1997   }
1998 }
1999
2000
2001 // PhantomCanvas
2002
2003 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2004   : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v)
2005 {
2006 }
2007
2008 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
2009 {
2010   m_pView = NULL;
2011 }
2012
2013 void
2014 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
2015 {
2016   if (m_pView)
2017     m_pView->OnDraw(& dc);
2018 }
2019
2020 wxSize
2021 PhantomCanvas::GetBestSize() const
2022 {
2023   if (! m_pView)
2024     return wxSize(0,0);
2025
2026   int xSize, ySize;
2027   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
2028   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
2029 #ifdef CTSIM_MDI
2030   ySize = xSize = (xSize / 4);
2031 #else
2032   xSize = ySize = static_cast<int>(ySize * .7);
2033 #endif
2034
2035   return wxSize (xSize, ySize);
2036 }
2037
2038
2039
2040 // PhantomFileView
2041
2042 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
2043
2044 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
2045 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
2046 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
2047 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
2048 END_EVENT_TABLE()
2049
2050 PhantomFileView::PhantomFileView()
2051 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
2052 {
2053 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
2054   m_iDefaultNDet = 165;
2055   m_iDefaultNView = 180;
2056   m_iDefaultNSample = 1;
2057 #else
2058   m_iDefaultNDet = 367;
2059   m_iDefaultNView = 320;
2060   m_iDefaultNSample = 2;
2061 #endif
2062   m_iDefaultOffsetView = 0;
2063   m_dDefaultRotation = 1;
2064   m_dDefaultFocalLength = 2;
2065   m_dDefaultCenterDetectorLength = 2;
2066   m_dDefaultViewRatio = 1;
2067   m_dDefaultScanRatio = 1;
2068   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
2069   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2070
2071 #ifdef DEBUG
2072   m_iDefaultRasterNX = 115;
2073   m_iDefaultRasterNY = 115;
2074   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
2075 #else
2076   m_iDefaultRasterNX = 256;
2077   m_iDefaultRasterNY = 256;
2078   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
2079 #endif
2080   m_dDefaultRasterViewRatio = 1;
2081 }
2082
2083 PhantomFileView::~PhantomFileView()
2084 {
2085   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2086   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE);
2087 }
2088
2089 void
2090 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2091 {
2092   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
2093   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
2094   std::ostringstream os;
2095   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
2096   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2097   rPhantom.printDefinitions (os);
2098 #if DEBUG
2099   rPhantom.print (os);
2100 #endif
2101   *theApp->getLog() << _T(">>>>\n") << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("<<<<\n");
2102   wxMessageBox (wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()), _T("Phantom Properties"));
2103   GetDocument()->Activate();
2104 }
2105
2106
2107 void
2108 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
2109 {
2110   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(),
2111     m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultOffsetView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation,
2112     m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio,
2113     m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
2114   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
2115   if (retVal != wxID_OK)
2116     return;
2117
2118   m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
2119   m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
2120   m_iDefaultOffsetView = dialogProjection.getOffsetView();
2121   m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
2122   m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
2123   m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
2124   m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
2125   m_dDefaultCenterDetectorLength = dialogProjection.getCenterDetectorLengthRatio();
2126   m_dDefaultViewRatio = dialogProjection.getViewRatio();
2127   m_dDefaultScanRatio = dialogProjection.getScanRatio();
2128   wxString sGeometry (dialogProjection.getGeometry(), wxConvUTF8);
2129   m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.mb_str(wxConvUTF8));
2130   double dRotationRadians = m_dDefaultRotation;
2131   m_dDefaultRotation /= TWOPI;  // convert back to fraction of a circle
2132
2133   if (m_iDefaultNDet <= 0 || m_iDefaultNView <= 0 || sGeometry == _T(""))
2134     return;
2135
2136   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2137   Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultOffsetView, m_iDefaultNSample,
2138     dRotationRadians, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio);
2139   if (theScanner.fail()) {
2140     wxString msg = _T("Failed making scanner\n");
2141     msg += wxConvUTF8.cMB2WX(theScanner.failMessage().c_str());
2142     *theApp->getLog() << msg << _T("\n");
2143     wxMessageBox (msg, _T("Error"));
2144     return;
2145   }
2146
2147   std::ostringstream os;
2148   os << "Projections for " << rPhantom.name()
2149         << ": nDet=" << m_iDefaultNDet
2150     << ", nView=" << m_iDefaultNView
2151         << ", gantry offset=" << m_iDefaultOffsetView
2152         << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample
2153     << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation
2154         << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength
2155     << ", CenterDetectorLengthRatio=" << m_dDefaultCenterDetectorLength
2156     << ", ViewRatio=" << m_dDefaultViewRatio
2157         << ", ScanRatio=" << m_dDefaultScanRatio
2158     << ", Geometry=" << sGeometry.c_str()
2159         << ", FanBeamAngle=" << convertRadiansToDegrees (theScanner.fanBeamAngle());
2160
2161   Timer timer;
2162   Projections* pProj = NULL;
2163   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2164     pProj = new Projections;
2165     pProj->initFromScanner (theScanner);
2166
2167     ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, *pProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
2168     for (int iView = 0; iView < pProj->nView(); iView++) {
2169       ::wxYield();
2170       if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
2171         delete pProj;
2172         return;
2173       }
2174       ::wxYield();
2175       while (dialogProjections.isPaused()) {
2176         ::wxYield();
2177         ::wxMilliSleep(50);
2178       }
2179     }
2180   } else {
2181 #if HAVE_WXTHREADS
2182     if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2183       ProjectorSupervisorThread* pProjector = new ProjectorSupervisorThread
2184         (this, m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultOffsetView,
2185          sGeometry.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultNSample, dRotationRadians,
2186          m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio,
2187          m_dDefaultScanRatio, wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()));
2188       if (pProjector->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2189         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating projector thread");
2190         delete pProjector;
2191         return;
2192       }
2193       pProjector->SetPriority(60);
2194       pProjector->Run();
2195       return;
2196     } else
2197 #endif // HAVE_WXTHREADS
2198     {
2199       pProj = new Projections;
2200       pProj->initFromScanner (theScanner);
2201       wxProgressDialog dlgProgress (_T("Projection"), _T("Projection Progress"), pProj->nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2202       for (int i = 0; i < pProj->nView(); i++) {
2203         //theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
2204         theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, theScanner.offsetView(), true, m_iDefaultTrace);
2205         if ((i + 1) % ITER_PER_UPDATE == 0)
2206           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
2207             delete pProj;
2208             return;
2209           }
2210       }
2211     }
2212   }
2213
2214   *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
2215   pProj->setRemark (os.str());
2216   pProj->setCalcTime (timer.timerEnd());
2217
2218   ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
2219   if (! pProjectionDoc) {
2220     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
2221     return;
2222   }
2223   pProjectionDoc->setProjections (pProj);
2224   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2225     pProjectionDoc-> Modify(true);
2226   OnUpdate(this, NULL);
2227   pProjectionDoc->UpdateAllViews (this);
2228   pProjectionDoc->getView()->setInitialClientSize();
2229   pProjectionDoc->Activate();
2230 }
2231 void
2232 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
2233 {
2234   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
2235     m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio);
2236   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
2237   if (retVal != wxID_OK)
2238     return;
2239
2240   m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
2241   m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
2242   m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
2243   m_dDefaultRasterViewRatio = dialogRaster.getViewRatio();
2244   if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
2245     m_iDefaultRasterNSamples = 1;
2246   if (m_dDefaultRasterViewRatio < 0)
2247     m_dDefaultRasterViewRatio = 0;
2248   if (m_iDefaultRasterNX <= 0 || m_iDefaultRasterNY <= 0)
2249     return;
2250
2251   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2252   std::ostringstream os;
2253   os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
2254     << m_iDefaultRasterNY << ", ViewRatio=" << m_dDefaultRasterViewRatio << ", nSamples="
2255     << m_iDefaultRasterNSamples;;
2256
2257 #if HAVE_WXTHREADS
2258   if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2259     RasterizerSupervisorThread* pThread = new RasterizerSupervisorThread
2260       (this, m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
2261        m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio,
2262        wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()));
2263     if (pThread->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2264       *theApp->getLog() << _T("Error creating rasterizer thread\n");
2265       return;
2266     }
2267     pThread->SetPriority (60);
2268     pThread->Run();
2269   } else
2270 #endif
2271   {
2272     ImageFile* pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY);
2273
2274     wxProgressDialog dlgProgress (_T("Rasterize"),
2275                                   _T("Rasterization Progress"),
2276                                   pImageFile->nx() + 1,
2277                                   getFrameForChild(),
2278                                   wxPD_CAN_ABORT );
2279     Timer timer;
2280     for (unsigned int i = 0; i < pImageFile->nx(); i++) {
2281       rPhantom.convertToImagefile (*pImageFile, m_dDefaultRasterViewRatio,
2282                                    m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE,
2283                                    i, 1, true);
2284       if ((i + 1) % ITER_PER_UPDATE == 0)
2285         if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
2286           delete pImageFile;
2287           return;
2288         }
2289     }
2290
2291     ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
2292     if (! pRasterDoc) {
2293       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2294       return;
2295     }
2296     pRasterDoc->setImageFile (pImageFile);
2297     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2298       pRasterDoc->Modify (true);
2299     *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
2300     pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
2301
2302     pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
2303     pRasterDoc->getView()->setInitialClientSize();
2304     pRasterDoc->Activate();
2305   }
2306 }
2307
2308
2309 PhantomCanvas*
2310 PhantomFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2311 {
2312   PhantomCanvas* pCanvas = new PhantomCanvas (this, parent, wxPoint(-1,-1),
2313                                               wxSize(-1,-1), 0);
2314   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2315   pCanvas->ClearBackground();
2316
2317   return pCanvas;
2318 }
2319
2320 #if CTSIM_MDI
2321 wxDocMDIChildFrame*
2322 #else
2323 wxDocChildFrame*
2324 #endif
2325 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2326 {
2327 #if CTSIM_MDI
2328   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("Phantom Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2329 #else
2330   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("Phantom Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2331 #endif
2332   theApp->setIconForFrame (subframe);
2333
2334   m_pFileMenu = new wxMenu;
2335
2336   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, _T("Cr&eate Phantom...\tCtrl-P"));
2337   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, _T("Create &Filter...\tCtrl-F"));
2338   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, _T("&Open...\tCtrl-O"));
2339   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, _T("Save &As..."));
2340   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, _T("&Close"));
2341
2342   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2343   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, _T("P&roperties\tCtrl-I"));
2344
2345   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2346   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, _T("&Print..."));
2347   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, _T("Print &Setup..."));
2348   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, _T("Print Pre&view"));
2349   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2350   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, _T("&Import...\tCtrl-M"));
2351   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2352   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, _T("Prefere&nces..."));
2353   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, _T("E&xit"));
2354   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2355   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2356
2357   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
2358   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, _T("&Rasterize...\tCtrl-R"));
2359   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, _T("&Projections...\tCtrl-J"));
2360
2361   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2362   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, _T("&Contents\tF1"));
2363   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, _T("&Tips"));
2364   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, _T("&Quick Start"));
2365   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, _T("&About"));
2366
2367   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2368
2369   menu_bar->Append(m_pFileMenu, _T("&File"));
2370   menu_bar->Append(process_menu, _T("&Process"));
2371   menu_bar->Append(help_menu, _T("&Help"));
2372
2373   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2374   subframe->Centre(wxBOTH);
2375
2376   wxAcceleratorEntry accelEntries[3];
2377   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2378   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2379   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PHMMENU_FILE_PROPERTIES);
2380   wxAcceleratorTable accelTable (3, accelEntries);
2381   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2382
2383   return subframe;
2384 }
2385
2386
2387 bool
2388 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2389 {
2390   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2391   SetFrame(m_pFrame);
2392   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2393   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2394   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2395   m_pFrame->SetTitle (_T("PhantomFileView"));
2396
2397   m_pFrame->Show(true);
2398   Activate(true);
2399
2400   return true;
2401 }
2402
2403 void
2404 PhantomFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2405 {
2406   if (m_pCanvas)
2407     m_pCanvas->Refresh();
2408 }
2409
2410 bool
2411 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2412 {
2413   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2414     return false;
2415
2416   Activate(false);
2417   if (m_pCanvas) {
2418     m_pCanvas->setView(NULL);
2419     m_pCanvas = NULL;
2420   }
2421   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2422   if (m_pFrame)
2423     m_pFrame->SetTitle(s);
2424
2425   SetFrame(NULL);
2426
2427   if (deleteWindow) {
2428     delete m_pFrame;
2429     m_pFrame = NULL;
2430     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2431       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2432   }
2433
2434   return true;
2435 }
2436
2437 void
2438 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2439 {
2440   int xsize, ysize;
2441   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2442   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2443   SGP sgp (driver);
2444   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2445   sgp.setColor (C_RED);
2446   rPhantom.show (sgp);
2447 }
2448
2449 // ProjectionCanvas
2450
2451 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2452 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2453 {
2454   m_pView = v;
2455 }
2456
2457 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2458 {
2459   m_pView = NULL;
2460 }
2461
2462 void
2463 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2464 {
2465   if (m_pView)
2466     m_pView->OnDraw(& dc);
2467 }
2468
2469 wxSize
2470 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2471 {
2472   const int iMinX = 50;
2473   const int iMinY = 20;
2474   wxSize bestSize (iMinX,iMinY);
2475
2476   if (m_pView) {
2477     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2478     bestSize.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2479   }
2480
2481   if (bestSize.x > 800)
2482     bestSize.x = 800;
2483   if (bestSize.y > 800)
2484     bestSize.y = 800;
2485
2486   if (bestSize.x < iMinX)
2487     bestSize.x = iMinX;
2488   if (bestSize.y < iMinY)
2489     bestSize.y = iMinY;
2490
2491   return bestSize;
2492 }
2493
2494
2495 // ProjectionFileView
2496
2497 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2498
2499 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2500 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2501 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2502 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN, ProjectionFileView::OnReconstructFBPRebin)
2503 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, ProjectionFileView::OnReconstructFourier)
2504 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_RECTANGULAR, ProjectionFileView::OnConvertRectangular)
2505 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2506 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2507 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_PARALLEL, ProjectionFileView::OnConvertParallel)
2508 EVT_MENU(PJMENU_PLOT_TTHETA_SAMPLING, ProjectionFileView::OnPlotTThetaSampling)
2509 EVT_MENU(PJMENU_PLOT_HISTOGRAM, ProjectionFileView::OnPlotHistogram)
2510   // EVT_MENU(PJMENU_ARTIFACT_REDUCTION, ProjectionFileView::OnArtifactReduction)
2511 END_EVENT_TABLE()
2512
2513
2514 ProjectionFileView::ProjectionFileView()
2515   : wxView(), m_pBitmap(0), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pFileMenu(0)
2516 {
2517 #ifdef DEBUG
2518   m_iDefaultNX = 115;
2519   m_iDefaultNY = 115;
2520 #else
2521   m_iDefaultNX = 256;
2522   m_iDefaultNY = 256;
2523 #endif
2524
2525   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2526   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2527 #if HAVE_FFTW
2528   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2529   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2530 #else
2531   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2532   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2533 #endif
2534   m_iDefaultZeropad = 2;
2535   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF;
2536   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2537   m_iDefaultInterpParam = 1;
2538   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2539
2540   m_iDefaultPolarNX = 256;
2541   m_iDefaultPolarNY = 256;
2542   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2543   m_iDefaultPolarZeropad = 2;
2544 }
2545
2546 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2547 {
2548   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2549   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE);;
2550 }
2551
2552 void
2553 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2554 {
2555   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2556   std::ostringstream os;
2557   rProj.printScanInfo(os);
2558   *theApp->getLog() << _T(">>>>\n") << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("<<<<\n");
2559   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()), _T("Projection File Properties"), wxOK | wxICON_INFORMATION);
2560   dialogMsg.ShowModal();
2561   GetDocument()->Activate();
2562 }
2563
2564
2565 void
2566 ProjectionFileView::OnConvertRectangular (wxCommandEvent& event)
2567 {
2568   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2569
2570   int nDet = rProj.nDet();
2571   int nView = rProj.nView();
2572   ImageFile* pIF = new ImageFile (nDet, nView);
2573   ImageFileArray v = pIF->getArray();
2574   for (int iv = 0; iv < nView; iv++) {
2575     DetectorValue* detval = rProj.getDetectorArray(iv).detValues();
2576
2577     for (int id = 0; id < nDet; id++)
2578       v[id][iv] = detval[id];
2579   }
2580
2581   ImageFileDocument* pRectDoc = theApp->newImageDoc ();
2582   if (! pRectDoc) {
2583     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2584     return;
2585   }
2586   pRectDoc->setImageFile (pIF);
2587   pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2588   std::ostringstream os;
2589   os << "Convert projection file " << getFrame()->GetTitle().c_str() << " to rectangular image";
2590   *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
2591   pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2592   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2593     pRectDoc->Modify (true);
2594   pRectDoc->UpdateAllViews();
2595   pRectDoc->getView()->setInitialClientSize();
2596   pRectDoc->Activate();
2597 }
2598
2599 void
2600 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2601 {
2602   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2603   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), _T("Convert Polar"), m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2604     m_iDefaultPolarInterpolation, -1, IDH_DLG_POLAR);
2605   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2606     wxProgressDialog dlgProgress (_T("Convert Polar"), _T("Conversion Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2607     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName(), wxConvUTF8);
2608     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2609     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2610     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2611     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.mb_str(wxConvUTF8));
2612
2613     if (! rProj.convertPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation)) {
2614       delete pIF;
2615       *theApp->getLog() << _T("Error converting to Polar\n");
2616       return;
2617     }
2618
2619     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2620     if (! pPolarDoc) {
2621       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2622       return;
2623     }
2624     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2625     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2626     std::ostringstream os;
2627     os << "Convert projection file " << getFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2628       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2629       << strInterpolation.c_str();
2630     *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
2631     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2632     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2633       pPolarDoc->Modify (true);
2634     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2635     pPolarDoc->getView()->setInitialClientSize();
2636     pPolarDoc->Activate();
2637   }
2638 }
2639
2640 void
2641 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2642 {
2643   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2644   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), _T("Convert to FFT Polar"), m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2645     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad, IDH_DLG_FFT_POLAR);
2646   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2647     wxProgressDialog dlgProgress (_T("Convert FFT Polar"), _T("Conversion Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2648     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName(), wxConvUTF8);
2649     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2650     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2651     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2652     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2653
2654     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.mb_str(wxConvUTF8));
2655     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2656       delete pIF;
2657       *theApp->getLog() << _T("Error converting to polar\n");
2658       return;
2659     }
2660     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2661     if (! pPolarDoc) {
2662       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2663       return;
2664     }
2665     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2666     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2667     std::ostringstream os;
2668     os << "Convert projection file " << getFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2669       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2670       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2671     *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
2672     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2673     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2674       pPolarDoc->Modify (true);
2675     pPolarDoc->UpdateAllViews (this);
2676     pPolarDoc->getView()->setInitialClientSize();
2677     pPolarDoc->Activate();
2678   }
2679 }
2680
2681 void
2682 ProjectionFileView::OnPlotTThetaSampling (wxCommandEvent& event)
2683 {
2684   DialogGetThetaRange dlgTheta (this->getFrame(), ParallelRaysums::THETA_RANGE_UNCONSTRAINED);
2685   if (dlgTheta.ShowModal() != wxID_OK)
2686     return;
2687
2688   int iThetaRange = dlgTheta.getThetaRange();
2689
2690   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2691   ParallelRaysums parallel (&rProj, iThetaRange);
2692   PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
2693   PlotFile& rPlot = pPlotDoc->getPlotFile();
2694   ParallelRaysums::CoordinateContainer& coordContainer = parallel.getCoordinates();
2695   double* pdT = new double [parallel.getNumCoordinates()];
2696   double* pdTheta = new double [parallel.getNumCoordinates()];
2697
2698   for (int i = 0; i < parallel.getNumCoordinates(); i++) {
2699     pdT[i] = coordContainer[i]->m_dT;
2700     pdTheta[i] = coordContainer[i]->m_dTheta;
2701   }
2702   rPlot.setCurveSize (2, parallel.getNumCoordinates(), true);
2703   rPlot.addEzsetCommand ("title T-Theta Sampling");
2704   rPlot.addEzsetCommand ("xlabel T");
2705   rPlot.addEzsetCommand ("ylabel Theta");
2706   rPlot.addEzsetCommand ("curve 1");
2707   if (rProj.nDet() < 50 && rProj.nView() < 50)
2708     rPlot.addEzsetCommand ("symbol 1"); // x symbol
2709   else
2710     rPlot.addEzsetCommand ("symbol 6"); // point symbol
2711   rPlot.addEzsetCommand ("noline");
2712   rPlot.addColumn (0, pdT);
2713   rPlot.addColumn (1, pdTheta);
2714   delete pdT;
2715   delete pdTheta;
2716   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2717     pPlotDoc->Modify (true);
2718   pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2719   pPlotDoc->UpdateAllViews ();
2720   pPlotDoc->Activate();
2721 }
2722
2723
2724 void
2725 ProjectionFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
2726 {
2727   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2728   int nDet = rProj.nDet();
2729   int nView = rProj.nView();
2730
2731   if (nDet < 1 || nView < 1)
2732     return;
2733
2734   PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
2735   if (! pPlotDoc) {
2736     sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
2737     return;
2738   }
2739
2740   DetectorValue* pdDetval = rProj.getDetectorArray(0).detValues();
2741   double dMin = pdDetval[0], dMax = pdDetval[0];
2742
2743   for (int iv = 0; iv < nView; iv++) {
2744     pdDetval = rProj.getDetectorArray(iv).detValues();
2745     for (int id = 0; id < nDet; id++) {
2746       double dV = pdDetval[id];
2747       if (dV < dMin)
2748         dMin = dV;
2749       else if (dV > dMax)
2750         dMax = dV;
2751     }
2752   }
2753
2754   double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
2755   double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
2756   double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
2757
2758   for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
2759     pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
2760     pY[i] = 0;
2761   }
2762   for (int j = 0; j < nView; j++) {
2763     pdDetval = rProj.getDetectorArray(j).detValues();
2764     for (int id = 0; id < nDet; id++) {
2765       int iBin = nearest<int> ((pdDetval[id] - dMin) / dBinWidth);
2766       if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
2767         pY[iBin] += 1;
2768     }
2769   }
2770   PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
2771   std::ostringstream os;
2772   os << "Histogram";
2773   std::string title("title ");
2774   title += os.str();
2775   rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
2776   rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Detector Value");
2777   rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
2778   rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
2779   rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
2780   rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
2781   rPlotFile.addColumn (0, pX);
2782   rPlotFile.addColumn (1, pY);
2783   rPlotFile.addDescription (rProj.remark());
2784   os << " plot of " << dynamic_cast<wxFrame*>(GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame())->GetTitle().c_str();
2785   *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
2786   rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
2787   delete pX;
2788   delete pY;
2789   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2790     pPlotDoc->Modify (true);
2791   pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2792   pPlotDoc->UpdateAllViews ();
2793   pPlotDoc->Activate();
2794 }
2795
2796
2797 void
2798 ProjectionFileView::OnConvertParallel (wxCommandEvent& event)
2799 {
2800   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2801   if (rProj.geometry() == Scanner::GEOMETRY_PARALLEL) {
2802     wxMessageBox (_T("Projections are already parallel"), _T("Error"));
2803     return;
2804   }
2805   wxProgressDialog dlgProgress (_T("Convert to Parallel"), _T("Conversion Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2806   Projections* pProjNew = rProj.interpolateToParallel();
2807   ProjectionFileDocument* pProjDocNew = theApp->newProjectionDoc();
2808   pProjDocNew->setProjections (pProjNew);
2809
2810   if (ProjectionFileView* projView = pProjDocNew->getView()) {
2811     projView->OnUpdate (projView, NULL);
2812     if (projView->getCanvas())
2813       projView->getCanvas()->SetClientSize (pProjNew->nDet(), pProjNew->nView());
2814     if (wxFrame* pFrame = projView->getFrame()) {
2815       pFrame->Show(true);
2816       pFrame->SetFocus();
2817       pFrame->Raise();
2818     }
2819     GetDocumentManager()->ActivateView (projView, true);
2820   }
2821   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2822     pProjDocNew-> Modify(true);
2823   pProjDocNew->UpdateAllViews (this);
2824   pProjDocNew->getView()->setInitialClientSize();
2825   pProjDocNew->Activate();
2826 }
2827
2828 void
2829 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2830 {
2831   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2832   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), _T("Fourier Reconstruction"), m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2833     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad, IDH_DLG_RECON_FOURIER);
2834   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2835     wxProgressDialog dlgProgress (_T("Reconstruction Fourier"), _T("Reconstruction Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2836     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName(), wxConvUTF8);
2837     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2838     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2839     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2840     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2841
2842     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.mb_str(wxConvUTF8));
2843     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2844       delete pIF;
2845       *theApp->getLog() << _T("Error converting to polar\n");
2846       return;
2847     }
2848 #ifdef HAVE_FFT
2849     pIF->ifft(*pIF);
2850 #endif
2851     pIF->magnitude(*pIF);
2852     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (*pIF);
2853
2854     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2855     if (! pPolarDoc) {
2856       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2857       return;
2858     }
2859     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2860     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2861     std::ostringstream os;
2862     os << "Reconstruct Fourier " << getFrame()->GetTitle().mb_str(wxConvUTF8) << ": xSize="
2863       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2864       << strInterpolation.mb_str(wxConvUTF8) << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2865     *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
2866     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2867     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2868       pPolarDoc->Modify (true);
2869     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2870     pPolarDoc->getView()->setInitialClientSize();
2871     pPolarDoc->Activate();
2872   }
2873 }
2874
2875 void
2876 ProjectionFileView::OnReconstructFBPRebin (wxCommandEvent& event)
2877 {
2878   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2879   doReconstructFBP (rProj, true);
2880 }
2881
2882 void
2883 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2884 {
2885   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2886   doReconstructFBP (rProj, false);
2887 }
2888
2889 void
2890 ProjectionFileView::doReconstructFBP (const Projections& rProj, bool bRebinToParallel)
2891 {
2892   ReconstructionROI defaultROI;
2893   defaultROI.m_dXMin = -rProj.phmLen() / 2;
2894   defaultROI.m_dXMax = defaultROI.m_dXMin + rProj.phmLen();
2895   defaultROI.m_dYMin = -rProj.phmLen() / 2;
2896   defaultROI.m_dYMax = defaultROI.m_dYMin + rProj.phmLen();
2897
2898   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY,
2899     m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration,
2900     m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector,
2901     m_iDefaultTrace,  &defaultROI);
2902
2903   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2904   if (retVal != wxID_OK)
2905     return;
2906
2907   m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2908   m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2909   wxString optFilterName (dialogReconstruction.getFilterName(), wxConvUTF8);
2910   m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.mb_str(wxConvUTF8));
2911   m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2912   wxString optFilterMethodName (dialogReconstruction.getFilterMethodName(), wxConvUTF8);
2913   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.mb_str(wxConvUTF8));
2914   m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2915   wxString optFilterGenerationName (dialogReconstruction.getFilterGenerationName(), wxConvUTF8);
2916   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.mb_str(wxConvUTF8));
2917   wxString optInterpName (dialogReconstruction.getInterpName(), wxConvUTF8);
2918   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.mb_str(wxConvUTF8));
2919   m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2920   wxString optBackprojectName (dialogReconstruction.getBackprojectName(), wxConvUTF8);
2921   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.mb_str(wxConvUTF8));
2922   m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2923   dialogReconstruction.getROI (&defaultROI);
2924
2925   if (m_iDefaultNX <= 0 && m_iDefaultNY <= 0)
2926     return;
2927
2928   std::ostringstream os;
2929   os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.mb_str(wxConvUTF8) << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.mb_str(wxConvUTF8) << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.mb_str(wxConvUTF8) << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.mb_str(wxConvUTF8) << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.mb_str(wxConvUTF8);
2930   if (bRebinToParallel)
2931     os << "; Interpolate to Parallel";
2932
2933   Timer timerRecon;
2934   ImageFile* pImageFile = NULL;
2935   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2936     pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2937     Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.mb_str(wxConvUTF8),
2938       m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.mb_str(wxConvUTF8),
2939       optInterpName.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultTrace,
2940       &defaultROI, bRebinToParallel);
2941
2942     ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstructor, rProj, *pImageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2943     for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2944       ::wxYield();
2945       if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView, true)) {
2946         delete pDlgReconstruct;
2947         delete pReconstructor;
2948         return;
2949       }
2950       ::wxYield();
2951       ::wxYield();
2952       while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2953         ::wxYield();
2954         ::wxMilliSleep(50);
2955       }
2956     }
2957     pReconstructor->postProcessing();
2958     delete pDlgReconstruct;
2959     delete pReconstructor;
2960   } else {
2961 #if HAVE_WXTHREADS
2962     if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2963       ReconstructorSupervisorThread* pReconstructor = new ReconstructorSupervisorThread
2964         (this, m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, optFilterName.mb_str(wxConvUTF8),
2965          m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.mb_str(wxConvUTF8),
2966          m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.mb_str(wxConvUTF8),
2967          optInterpName.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultInterpParam,
2968          optBackprojectName.mb_str(wxConvUTF8),
2969          wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()), &defaultROI, bRebinToParallel);
2970       if (pReconstructor->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2971         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating reconstructor thread");
2972         delete pReconstructor;
2973         return;
2974       }
2975       pReconstructor->SetPriority (60);
2976       pReconstructor->Run();
2977       return;
2978     } else
2979 #endif
2980     {
2981       pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2982       wxProgressDialog dlgProgress (_T("Reconstruction"), _T("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2983       Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.mb_str(wxConvUTF8),
2984         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.mb_str(wxConvUTF8),
2985         optInterpName.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.mb_str(wxConvUTF8), m_iDefaultTrace,
2986         &defaultROI, bRebinToParallel);
2987
2988       for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2989         pReconstructor->reconstructView (iView, 1);
2990         if ((iView + 1) % ITER_PER_UPDATE == 0)
2991           if (! dlgProgress.Update (iView + 1)) {
2992             delete pReconstructor;
2993             return; // don't make new window, thread will do this
2994           }
2995       }
2996       pReconstructor->postProcessing();
2997       delete pReconstructor;
2998     }
2999   }
3000   ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
3001   if (! pReconDoc) {
3002     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
3003     return;
3004   }
3005   *theApp->getLog() << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("\n");
3006   pImageFile->labelAdd (rProj.getLabel());
3007   pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
3008
3009   pReconDoc->setImageFile (pImageFile);
3010   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
3011     pReconDoc->Modify (true);
3012   pReconDoc->UpdateAllViews();
3013   pReconDoc->getView()->setInitialClientSize();
3014   pReconDoc->Activate();
3015 }
3016
3017
3018 void
3019 ProjectionFileView::OnArtifactReduction (wxCommandEvent& event)
3020 {
3021 }
3022
3023
3024 ProjectionFileCanvas*
3025 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
3026 {
3027   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
3028   int width, height;
3029   parent->GetClientSize(&width, &height);
3030
3031   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (this, parent, wxPoint(-1,-1), wxSize(width, height), 0);
3032
3033   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
3034   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
3035   pCanvas->ClearBackground();
3036
3037   return pCanvas;
3038 }
3039
3040 #if CTSIM_MDI
3041 wxDocMDIChildFrame*
3042 #else
3043 wxDocChildFrame*
3044 #endif
3045 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
3046 {
3047 #ifdef CTSIM_MDI
3048   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("Projection Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
3049 #else
3050   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("Projection Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
3051 #endif
3052   theApp->setIconForFrame (subframe);
3053
3054   m_pFileMenu = new wxMenu;
3055
3056   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, _T("Cr&eate Phantom...\tCtrl-P"));
3057   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, _T("Create &Filter...\tCtrl-F"));
3058   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, _T("&Open...\tCtrl-O"));
3059   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, _T("&Save\tCtrl-S"));
3060   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, _T("Save &As..."));
3061   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, _T("&Close\tCtrl-W"));
3062
3063   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3064   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, _T("P&roperties\tCtrl-I"));
3065
3066   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3067   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, _T("&Print..."));
3068   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, _T("Print &Setup..."));
3069   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, _T("Print Pre&view"));
3070   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3071   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, _T("&Import...\tCtrl-M"));
3072   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3073   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, _T("Prefere&nces..."));
3074   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, _T("E&xit"));
3075   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3076   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3077
3078   m_pConvertMenu = new wxMenu;
3079   m_pConvertMenu->Append (PJMENU_CONVERT_RECTANGULAR, _T("&Rectangular Image"));
3080   m_pConvertMenu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, _T("&Polar Image...\tCtrl-L"));
3081   m_pConvertMenu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, _T("FF&T->Polar Image...\tCtrl-T"));
3082   m_pConvertMenu->AppendSeparator();
3083   m_pConvertMenu->Append (PJMENU_CONVERT_PARALLEL, _T("&Interpolate to Parallel"));
3084
3085   //  wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
3086   //  filter_menu->Append (PJMENU_ARTIFACT_REDUCTION, _T("&Artifact Reduction"));
3087
3088   wxMenu* analyze_menu = new wxMenu;
3089   analyze_menu->Append (PJMENU_PLOT_HISTOGRAM, _T("&Plot Histogram"));
3090   analyze_menu->Append (PJMENU_PLOT_TTHETA_SAMPLING, _T("Plot T-T&heta Sampling...\tCtrl-H"));
3091
3092   m_pReconstructMenu = new wxMenu;
3093   m_pReconstructMenu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, _T("&Filtered Backprojection...\tCtrl-R"), _T("Reconstruct image using filtered backprojection"));
3094   m_pReconstructMenu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN, _T("Filtered &Backprojection (Rebin to Parallel)...\tCtrl-B"), _T("Reconstruct image using filtered backprojection"));
3095   m_pReconstructMenu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, _T("&Inverse Fourier...\tCtrl-E"), _T("Direct inverse Fourier"));
3096
3097   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3098   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, _T("&Contents\tF1"));
3099   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, _T("&Tips"));
3100   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, _T("&Quick Start"));
3101   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, _T("&About"));
3102
3103   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3104
3105   menu_bar->Append (m_pFileMenu, _T("&File"));
3106   menu_bar->Append (m_pConvertMenu, _T("&Convert"));
3107   //  menu_bar->Append (filter_menu, _T("Fi&lter"));
3108   menu_bar->Append (analyze_menu, _T("&Analyze"));
3109   menu_bar->Append (m_pReconstructMenu, _T("&Reconstruct"));
3110   menu_bar->Append (help_menu, _T("&Help"));
3111
3112   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3113   subframe->Centre(wxBOTH);
3114
3115   wxAcceleratorEntry accelEntries[7];
3116   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
3117   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('T'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
3118   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
3119   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('B'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN);
3120   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
3121   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_FILE_PROPERTIES);
3122   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), PJMENU_PLOT_TTHETA_SAMPLING);
3123   wxAcceleratorTable accelTable (7, accelEntries);
3124   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
3125
3126   return subframe;
3127 }
3128
3129
3130 bool
3131 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3132 {
3133   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3134   SetFrame(m_pFrame);
3135   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
3136   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
3137   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
3138   m_pFrame->SetTitle (_T("ProjectionFileView"));
3139
3140   m_pFrame->Show(true);
3141   Activate(true);
3142
3143   return true;
3144 }
3145
3146 void
3147 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
3148 {
3149   if (m_pBitmap && m_pBitmap->Ok())
3150     dc->DrawBitmap (*m_pBitmap, 0, 0, false);
3151 }
3152
3153
3154 void
3155 ProjectionFileView::setInitialClientSize ()
3156 {
3157   if (m_pFrame && m_pCanvas) {
3158     wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
3159
3160     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
3161     m_pFrame->Show (true);
3162     m_pFrame->SetFocus();
3163   }
3164 }
3165
3166 void
3167 ProjectionFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3168 {
3169   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
3170   const int nDet = rProj.nDet();
3171   const int nView = rProj.nView();
3172   if (rProj.geometry() == Scanner::GEOMETRY_PARALLEL) {
3173     m_pReconstructMenu->Enable (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN, false);
3174     m_pConvertMenu->Enable (PJMENU_CONVERT_PARALLEL, false);
3175   } else {
3176     m_pReconstructMenu->Enable (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN, true);
3177     m_pConvertMenu->Enable (PJMENU_CONVERT_PARALLEL, true);
3178   }
3179
3180   if (nDet != 0 && nView != 0) {
3181     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
3182     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
3183     double min = detval[0];
3184     double max = detval[0];
3185     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
3186       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
3187       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
3188       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
3189         if (min > detval[ix])
3190           min = detval[ix];
3191         else if (max < detval[ix])
3192           max = detval[ix];
3193       }
3194     }
3195
3196     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
3197     if (! imageData) {
3198       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for image display");
3199       return;
3200     }
3201     double scale = (max - min) / 255;
3202     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
3203       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
3204       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
3205       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
3206         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
3207         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
3208         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
3209         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
3210       }
3211     }
3212     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
3213     if (m_pBitmap) {
3214       delete m_pBitmap;
3215       m_pBitmap = NULL;
3216     }
3217     m_pBitmap = new wxBitmap (image);
3218     delete imageData;
3219   }
3220
3221     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nDet/20, nView/20);
3222     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
3223
3224     if (m_pCanvas)
3225       m_pCanvas->Refresh();
3226 }
3227
3228 bool
3229 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3230 {
3231   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false);
3232   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3233     return false;
3234
3235   Activate(false);
3236   if (m_pCanvas) {
3237         m_pCanvas->setView(NULL);
3238     m_pCanvas = NULL;
3239   }
3240   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
3241   if (m_pFrame)
3242     m_pFrame->SetTitle(s);
3243
3244   SetFrame(NULL);
3245
3246   if (deleteWindow) {
3247     delete m_pFrame;
3248     m_pFrame = NULL;
3249     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3250       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3251   }
3252
3253   return true;
3254 }
3255
3256
3257
3258 // PlotFileCanvas
3259 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
3260   : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v)
3261 {
3262 }
3263
3264 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
3265 {
3266 }
3267
3268 wxSize
3269 PlotFileCanvas::GetBestSize() const
3270 {
3271   return wxSize (500, 300);
3272 }
3273
3274
3275 void
3276 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
3277 {
3278   if (m_pView)
3279     m_pView->OnDraw(& dc);
3280 }
3281
3282
3283 // PlotFileView
3284
3285 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
3286
3287 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
3288 EVT_MENU(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
3289 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
3290 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
3291 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
3292 END_EVENT_TABLE()
3293
3294 PlotFileView::PlotFileView()
3295 : wxView(), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pEZPlot(0), m_pFileMenu(0),
3296   m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
3297 {
3298 }
3299
3300 PlotFileView::~PlotFileView()
3301 {
3302   if (m_pEZPlot)
3303     delete m_pEZPlot;
3304
3305   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
3306   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE);
3307 }
3308
3309 void
3310 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
3311 {
3312   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
3313   std::ostringstream os;
3314   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
3315   rPlot.printHeadersBrief (os);
3316   *theApp->getLog() << _T(">>>>\n") << wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()) << _T("<<<<<\n");
3317   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), wxConvUTF8.cMB2WX(os.str().c_str()), _T("Plot File Properties"),
3318                              wxOK | wxICON_INFORMATION);
3319   dialogMsg.ShowModal();
3320   GetDocument()->Activate();
3321 }
3322
3323
3324 void
3325 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
3326 {
3327   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3328   double min, max, mean, mode, median, stddev;
3329   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
3330   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
3331   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
3332   if (iRetVal == wxID_OK) {
3333     m_bMinSpecified = true;
3334     m_bMaxSpecified = true;
3335     double dMin, dMax;
3336     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
3337       m_dMinPixel = dMin;
3338       m_dMaxPixel = dMax;
3339       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
3340       OnUpdate (this, NULL);
3341     }
3342   }
3343   GetDocument()->Activate();
3344 }
3345
3346 void
3347 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
3348 {
3349   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3350   double min;
3351   double max;
3352
3353   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
3354     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
3355       *theApp->getLog() << _T("Error: unable to find Min/Max\n");
3356       return;
3357     }
3358   }
3359
3360   if (m_bMinSpecified)
3361     min = m_dMinPixel;
3362   if (m_bMaxSpecified)
3363     max = m_dMaxPixel;
3364
3365   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), _T("Set Y-axis Minimum & Maximum"), min, max);
3366   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
3367   if (retVal == wxID_OK) {
3368     m_bMinSpecified = true;
3369     m_bMaxSpecified = true;
3370     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
3371     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
3372     OnUpdate (this, NULL);
3373   }
3374   GetDocument()->Activate();
3375 }
3376
3377 void
3378 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
3379 {
3380   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
3381     m_bMinSpecified = false;
3382     m_bMaxSpecified = false;
3383     OnUpdate (this, NULL);
3384   }
3385   GetDocument()->Activate();
3386 }
3387
3388
3389 PlotFileCanvas*
3390 PlotFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
3391 {
3392   PlotFileCanvas* pCanvas;
3393
3394   pCanvas = new PlotFileCanvas (this, parent, wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), 0);
3395   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
3396   pCanvas->ClearBackground();
3397
3398   return pCanvas;
3399 }
3400
3401 #if CTSIM_MDI
3402 wxDocMDIChildFrame*
3403 #else
3404 wxDocChildFrame*
3405 #endif
3406 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
3407 {
3408 #ifdef CTSIM_MDI
3409   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("Plot Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
3410 #else
3411   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("Plot Frame"), wxPoint(-1,-1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
3412 #endif
3413   theApp->setIconForFrame (subframe);
3414
3415   m_pFileMenu = new wxMenu;
3416
3417   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, _T("Cr&eate Phantom...\tCtrl-P"));
3418   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, _T("Create &Filter...\tCtrl-F"));
3419   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, _T("&Open...\tCtrl-O"));
3420   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, _T("&Save\tCtrl-S"));
3421   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, _T("Save &As..."));
3422   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, _T("&Close\tCtrl-W"));
3423
3424   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3425   m_pFileMenu->Append(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, _T("P&roperties\tCtrl-I"));
3426
3427   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3428   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, _T("&Print..."));
3429   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, _T("Print &Setup..."));
3430   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, _T("Print Pre&view"));
3431   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3432   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, _T("&Import...\tCtrl-M"));
3433   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3434   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, _T("Prefere&nces..."));
3435   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, _T("E&xit"));
3436   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3437   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3438
3439   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
3440   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, _T("Display Scale &Set...\tCtrl-E"));
3441   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, _T("Display Scale &Auto...\tCtrl-A"));
3442   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, _T("Display &Full Scale\tCtrl-U"));
3443
3444   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3445   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, _T("&Contents\tF1"));
3446   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, _T("&Tips"));
3447   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, _T("&Quick Start"));
3448   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, _T("&About"));
3449
3450   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3451
3452   menu_bar->Append(m_pFileMenu, _T("&File"));
3453   menu_bar->Append(view_menu, _T("&View"));
3454   menu_bar->Append(help_menu, _T("&Help"));
3455
3456   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3457   subframe->Centre(wxBOTH);
3458
3459   wxAcceleratorEntry accelEntries[4];
3460   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
3461   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
3462   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
3463   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PLOTMENU_FILE_PROPERTIES);
3464   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
3465   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
3466
3467   return subframe;
3468 }
3469
3470
3471 bool
3472 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3473 {
3474   m_bMinSpecified = false;
3475   m_bMaxSpecified = false;
3476   m_dAutoScaleFactor = 1.;
3477
3478   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3479   SetFrame(m_pFrame);
3480   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
3481   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
3482   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
3483   m_pFrame->SetTitle (_T("Plot File"));
3484
3485   m_pFrame->Show(true);
3486   Activate(true);
3487
3488   return true;
3489 }
3490
3491 void
3492 PlotFileView::setInitialClientSize ()
3493 {
3494   if (m_pFrame && m_pCanvas) {
3495     wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
3496
3497     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
3498     m_pFrame->Show (true);
3499     m_pFrame->SetFocus();
3500   }
3501 }
3502
3503
3504 void
3505 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
3506 {
3507   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3508   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
3509   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
3510
3511   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
3512     int xsize, ysize;
3513     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
3514     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
3515     SGP sgp (driver);
3516     if (m_pEZPlot)
3517       m_pEZPlot->plot (&sgp);
3518   }
3519 }
3520
3521
3522 void
3523 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3524 {
3525   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3526   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
3527   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
3528   const bool bScatterPlot = rPlotFile.getIsScatterPlot();
3529
3530   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
3531     if (m_pEZPlot)
3532       delete m_pEZPlot;
3533     m_pEZPlot = new EZPlot;
3534
3535     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
3536       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
3537
3538     if (m_bMinSpecified) {
3539       std::ostringstream os;
3540       os << "ymin " << m_dMinPixel;
3541       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3542     }
3543
3544     if (m_bMaxSpecified) {
3545       std::ostringstream os;
3546       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
3547       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3548     }
3549
3550     m_pEZPlot->ezset("box");
3551     m_pEZPlot->ezset("grid");
3552
3553     double* pdX = new double [iNRecords];
3554     double* pdY = new double [iNRecords];
3555     if (! bScatterPlot) {
3556       rPlotFile.getColumn (0, pdX);
3557
3558       for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
3559         rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
3560         m_pEZPlot->addCurve (pdX, pdY, iNRecords);
3561       }
3562     } else {
3563       rPlotFile.getColumn (0, pdX);
3564       rPlotFile.getColumn (1, pdY);
3565       m_pEZPlot->addCurve (pdX, pdY, iNRecords);
3566     }
3567     delete pdX;
3568     delete pdY;
3569   }
3570
3571   if (m_pCanvas)
3572     m_pCanvas->Refresh();
3573 }
3574
3575 bool
3576 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3577 {
3578   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3579     return false;
3580
3581   Activate(false);
3582   if (m_pCanvas) {
3583     m_pCanvas->setView (NULL);
3584     m_pCanvas = NULL;
3585   }
3586   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
3587   if (m_pFrame)
3588     m_pFrame->SetTitle(s);
3589
3590   SetFrame(NULL);
3591   if (deleteWindow) {
3592     delete m_pFrame;
3593     m_pFrame = NULL;
3594     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3595       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3596   }
3597
3598   return true;
3599 }
3600
3601
3602 ////////////////////////////////////////////////////////////////
3603
3604
3605 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
3606
3607 TextFileView::~TextFileView()
3608 {
3609   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
3610   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE);;
3611 }
3612
3613 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3614 {
3615   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3616   SetFrame (m_pFrame);
3617
3618   int width, height;
3619   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
3620   m_pFrame->SetTitle(_T("TextFile"));
3621   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(-1,-1), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
3622   m_pFrame->SetTitle(_T("Log"));
3623
3624   m_pFrame->Show (true);
3625   Activate (true);
3626
3627   return true;
3628 }
3629
3630 // Handled by wxTextWindow
3631 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
3632 {
3633 }
3634
3635 void TextFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3636 {
3637 }
3638
3639 bool
3640 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3641 {
3642   if (! theApp->getMainFrame()->getShuttingDown())
3643     return false;
3644
3645   Activate(false);
3646   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false);
3647   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3648     return false;
3649
3650   SetFrame(NULL);
3651   if (deleteWindow) {
3652     delete m_pFrame;
3653     m_pFrame = NULL;
3654     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3655       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3656   }
3657
3658   return TRUE;
3659 }
3660
3661 #if CTSIM_MDI
3662 wxDocMDIChildFrame*
3663 #else
3664 wxDocChildFrame*
3665 #endif
3666 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
3667 {
3668 #if CTSIM_MDI
3669   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("TextFile Frame"), wxPoint(-1, -1), wxSize(-1,-1), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, _T("Log"));
3670 #else
3671   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, _T("TextFile Frame"), wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, _T("Log"));
3672 #endif
3673   theApp->setIconForFrame (subframe);
3674
3675   m_pFileMenu = new wxMenu;
3676
3677   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, _T("Cr&eate Phantom...\tCtrl-P"));
3678   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, _T("Create &Filter...\tCtrl-F"));
3679   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, _T("&Open...\tCtrl-O"));
3680   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, _T("&Save\tCtrl-S"));
3681   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, _T("Save &As..."));
3682   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, _T("&Close\tCtrl-W"));
3683
3684   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3685   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, _T("&Print..."));
3686   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, _T("Print &Setup..."));
3687   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, _T("Print Pre&view"));
3688   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3689   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, _T("&Import...\tCtrl-M"));
3690   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3691   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, _T("Prefere&nces..."));
3692   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, _T("E&xit"));
3693   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3694   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3695
3696   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3697   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, _T("&Contents\tF1"));
3698   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, _T("&Tips"));
3699   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, _T("&Quick Start"));
3700   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, _T("&About"));
3701
3702   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3703
3704   menu_bar->Append(m_pFileMenu, _T("&File"));
3705   menu_bar->Append(help_menu, _T("&Help"));
3706
3707   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3708   subframe->Centre(wxBOTH);
3709
3710   return subframe;
3711 }
3712
3713
3714 // Define a constructor for my text subwindow
3715 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
3716   : wxTextCtrl (frame, -1, _T(""), pos, size, style), m_pView(v)
3717 {
3718 }
3719
3720 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3721 {
3722   m_pView = NULL;
3723 }
3724
3725 wxSize
3726 TextFileCanvas::GetBestSize() const
3727 {
3728   int xSize, ySize;
3729   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
3730   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
3731 #ifdef CTSIM_MDI
3732   ySize = xSize = (xSize / 4);
3733 #else
3734   ySize = xSize;
3735 #endif
3736   return wxSize (xSize, ySize);
3737 }