src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.36 2000/12/22 04:18:00 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
  29 #include "wx/wxprec.h"
  30
  31 #ifdef __BORLANDC__
  32 #pragma hdrstop
  33 #endif
  34
  35 #ifndef WX_PRECOMP
  36 #include "wx/wx.h"
  37 #endif
  38
  39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  41 #endif
  42
  43 #include "wx/image.h"
  44 #include "wx/progdlg.h"
  45
  46 #include "ct.h"
  47 #include "ctsim.h"
  48 #include "docs.h"
  49 #include "views.h"
  50 #include "dialogs.h"
  51 #include "dlgprojections.h"
  52 #include "dlgreconstruct.h"
  53 #include "backprojectors.h"
  54 #include "reconstruct.h"
  55 #include "timer.h"
  56 \r
  57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM\r
  58 #include <sstream>\r
  59 #else\r
  60 #include <sstream_subst>\r
  61 #endif\r
  62 \r
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 END_EVENT_TABLE()
  69
  70
  71 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  72 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
  73 {
  74   m_pView = v;\r
  75   m_xCursor = -1;\r
  76   m_yCursor = -1;
  77 }
  78
  79 void
  80 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  81 {
  82   if (m_pView)
  83     m_pView->OnDraw(& dc);
  84 }\r
  85 \r
  86 void \r
  87 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)\r
  88 {\r
  89   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
  90   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
  91   int nx = rIF.nx();\r
  92   int ny = rIF.ny();\r
  93   \r
  94   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);\r
  95   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);\r
  96   dc.DrawLine (0, y, nx, y);\r
  97   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);\r
  98   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);\r
  99 }\r
 100 \r
 101 bool\r
 102 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)\r
 103 {\r
 104   x = m_xCursor;\r
 105   y = m_yCursor;\r
 106   \r
 107   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)\r
 108     return true;\r
 109   else\r
 110     return false;\r
 111 }
 112 \r
 113 void
 114 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 115 {
 116   if (! m_pView)
 117     return;
 118
 119   wxClientDC dc(this);
 120   PrepareDC(dc);
 121
 122   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 123   \r
 124   if (event.RightIsDown()) {\r
 125     const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
 126     ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
 127     int nx = rIF.nx();\r
 128     int ny = rIF.ny();\r
 129     \r
 130     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {\r
 131       std::ostringstream os;\r
 132       os << "Image value (" << pt.x << "," << pt.y << ") = " << v[pt.x][ny - 1 - pt.y] << "\n";\r
 133       *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
 134     } else\r
 135       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << pt.y << ")\n";\r
 136   }\r
 137   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp()) {\r
 138     const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
 139     ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
 140     int nx = rIF.nx();\r
 141     int ny = rIF.ny();\r
 142     \r
 143     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {\r
 144       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {\r
 145         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);\r
 146       }\r
 147       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, pt.y);\r
 148       m_xCursor = pt.x;\r
 149       m_yCursor = pt.y;\r
 150     } else\r
 151       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << pt.y << ")\n";\r
 152   }\r
 153   if (event.LeftUp()) {\r
 154     std::ostringstream os;\r
 155     os << "Selected column" << pt.x << " and row" << pt.y << "\n";\r
 156     *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
 157   }\r
 158 }
 159
 160 // ImageFileView
 161
 162 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 163
 164 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 165 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 166 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 167 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)\r
 168 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)\r
 169 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)\r
 170 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)\r
 171 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)\r
 172 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)\r
 173 END_EVENT_TABLE()
 174
 175 ImageFileView::ImageFileView(void)
 176 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 177 {
 178 }
 179
 180 ImageFileView::~ImageFileView(void)
 181 {
 182 }
 183
 184 void
 185 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 186 {
 187   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 188   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 189   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 190     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 191   else {
 192     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
 193     rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 194     std::ostringstream os;
 195     os << "file: " << rFilename << "\nmin: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 196     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 197     wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 198     dialogMsg.ShowModal();
 199   }
 200 }
 201
 202 void
 203 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 204 {
 205   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 206   double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
 207   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);\r
 208   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 209   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 210   if (iRetVal == wxID_OK) {
 211     m_bMinSpecified = true;
 212     m_bMaxSpecified = true;
 213     double dMin, dMax;\r
 214     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 215       m_dMinPixel = dMin;
 216       m_dMaxPixel = dMax;
 217       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 218       OnUpdate (this, NULL);\r
 219     }
 220   }
 221 }
 222
 223 void
 224 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 225 {
 226   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 227   double min, max;
 228   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 229     rIF.getMinMax (min, max);
 230
 231   if (m_bMinSpecified)
 232     min = m_dMinPixel;
 233   if (m_bMaxSpecified)
 234     max = m_dMaxPixel;
 235
 236   DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 237   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 238   if (retVal == wxID_OK) {
 239     m_bMinSpecified = true;
 240     m_bMaxSpecified = true;
 241     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 242     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 243     OnUpdate (this, NULL);
 244   }
 245 }
 246 \r
 247 void\r
 248 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)\r
 249 {\r
 250   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;\r
 251   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);\r
 252 \r
 253   if (vecIF.size() == 0) {\r
 254     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");\r
 255   } else {\r
 256     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(m_frame, "Get Comparison Image", vecIF, true);\r
 257 \r
 258     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
 259       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
 260       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
 261       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();\r
 262       std::ostringstream os;\r
 263       double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
 264       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);\r
 265       os << rIF.getFilename() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";\r
 266       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);\r
 267       os << rCompareIF.getFilename() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";\r
 268       os << "\n";\r
 269       double d, r, e;\r
 270       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);\r
 271       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";\r
 272       *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
 273       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {\r
 274         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
 275         if (! pDifferenceDoc) {\r
 276           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
 277           return;\r
 278         }\r
 279         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();\r
 280       \r
 281         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());\r
 282         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {\r
 283           pDifferenceDoc->DeleteAllViews();\r
 284           return;\r
 285         }\r
 286 \r
 287         pDifferenceDoc->Modify(true);\r
 288         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);\r
 289         pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
 290       }\r
 291       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");\r
 292     }\r
 293   }\r
 294 }
 295
 296 ImageFileCanvas*
 297 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 298 {
 299   ImageFileCanvas* pCanvas;
 300   int width, height;
 301   parent->GetClientSize(&width, &height);
 302
 303   pCanvas = new ImageFileCanvas (dynamic_cast<ImageFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 304
 305   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 306   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 307   pCanvas->Clear();
 308
 309   return pCanvas;
 310 }
 311
 312 wxFrame*
 313 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 314 {
 315   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 316
 317   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
 318
 319   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
 320   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
 321   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
 322   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 323   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
 324
 325   file_menu->AppendSeparator();
 326   file_menu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
 327
 328   file_menu->AppendSeparator();
 329   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 330   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 331   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
 332
 333   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 334   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
 335   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
 336   \r
 337   wxMenu *plot_menu = new wxMenu;\r
 338   plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");\r
 339   plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");\r
 340
 341   wxMenu *compare_menu = new wxMenu;\r
 342   compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");\r
 343   compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");\r
 344   compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");\r
 345 \r
 346   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 347   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 348
 349   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 350
 351   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
 352   menu_bar->Append(view_menu, "&View");\r
 353   menu_bar->Append(plot_menu, "&Plot");\r
 354   menu_bar->Append(compare_menu, "&Compare");
 355   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 356
 357   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 358
 359   subframe->Centre(wxBOTH);
 360
 361   return subframe;
 362 }
 363
 364
 365 bool
 366 ImageFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 367 {
 368   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
 369   SetFrame (m_frame);
 370
 371   m_bMinSpecified = false;
 372   m_bMaxSpecified = false;
 373   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 374
 375   int width, height;
 376   m_frame->GetClientSize (&width, &height);
 377   m_frame->SetTitle("ImageFileView");
 378   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
 379
 380   int x, y;  // X requires a forced resize
 381   m_frame->GetSize(&x, &y);
 382   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
 383   m_frame->SetFocus();\r
 384   m_frame->Show(true);
 385   Activate(true);
 386
 387   return true;
 388 }
 389
 390 void
 391 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 392 {
 393   if (m_bitmap.Ok())
 394     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 395   \r
 396   int xCursor, yCursor;\r
 397   if (m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))\r
 398     m_canvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);\r
 399 }
 400
 401
 402 void
 403 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 404 {
 405   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
 406   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 407   int nx = rIF.nx();
 408   int ny = rIF.ny();
 409   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 410     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 411       double min, max;
 412       rIF.getMinMax (min, max);
 413       if (! m_bMinSpecified)
 414         m_dMinPixel = min;
 415       if (! m_bMaxSpecified)
 416         m_dMaxPixel = max;
 417     }
 418     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
 419
 420     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
 421     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
 422       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
 423         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
 424         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
 425         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
 426         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
 427         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
 428       }
 429     }
 430     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
 431     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
 432     delete imageData;
 433     int xSize = nx;
 434     int ySize = ny;
 435     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
 436     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
 437     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
 438     m_canvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
 439     m_canvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);\r
 440   }
 441
 442   if (m_canvas)
 443     m_canvas->Refresh();
 444 }
 445
 446 bool
 447 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
 448 {
 449   if (!GetDocument()->Close())
 450     return false;
 451
 452   m_canvas->Clear();
 453   m_canvas->m_pView = NULL;
 454   m_canvas = NULL;
 455   wxString s(theApp->GetAppName());
 456   if (m_frame)
 457     m_frame->SetTitle(s);
 458   SetFrame(NULL);
 459
 460   Activate(false);
 461
 462   if (deleteWindow) {
 463     delete m_frame;
 464     return true;
 465   }
 466   return true;
 467 }
 468 \r
 469 \r
 470 void\r
 471 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)\r
 472 {\r
 473   int xCursor, yCursor;\r
 474   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
 475     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
 476     return;\r
 477   }\r
 478   \r
 479   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();\r
 480   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
 481   int nx = rIF.nx();\r
 482   int ny = rIF.ny();\r
 483   \r
 484   if (v != NULL && yCursor < ny) {\r
 485     double* pX = new double [nx];\r
 486     double* pY = new double [nx];\r
 487     for (int i = 0; i < nx; i++) {\r
 488       pX[i] = i;\r
 489       pY[i] = v[i][yCursor];\r
 490     }\r
 491     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
 492     if (! pPlotDoc) {\r
 493       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
 494     } else {\r
 495       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
 496       std::ostringstream title;\r
 497       title << "Row " << yCursor;\r
 498       rPlotFile.setTitle(title.str());\r
 499       rPlotFile.setXLabel("Column");\r
 500       rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
 501       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);\r
 502       rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
 503       rPlotFile.addColumn (1, pY);\r
 504     }\r
 505     delete pX;\r
 506     delete pY;\r
 507     pPlotDoc->Modify(true);\r
 508   }\r
 509   \r
 510 }\r
 511
 512 void\r
 513 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)\r
 514 {\r
 515   int xCursor, yCursor;\r
 516   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
 517     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
 518     return;\r
 519   }\r
 520   \r
 521   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();\r
 522   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
 523   int nx = rIF.nx();\r
 524   int ny = rIF.ny();\r
 525   \r
 526   if (v != NULL && xCursor < nx) {\r
 527     double* pX = new double [ny];\r
 528     double* pY = new double [ny];\r
 529     for (int i = 0; i < ny; i++) {\r
 530       pX[i] = i;\r
 531       pY[i] = v[xCursor][i];\r
 532     }\r
 533     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
 534     if (! pPlotDoc) {\r
 535       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
 536     } else {\r
 537       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
 538       std::ostringstream title;\r
 539       title << "Column " << xCursor;\r
 540       rPlotFile.setTitle(title.str());\r
 541       rPlotFile.setXLabel("Row");\r
 542       rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
 543       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);\r
 544       rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
 545       rPlotFile.addColumn (1, pY);\r
 546     }\r
 547     delete pX;\r
 548     delete pY;\r
 549     pPlotDoc->Modify(true);\r
 550   }\r
 551 }\r
 552 \r
 553 void\r
 554 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)\r
 555 {\r
 556   int xCursor, yCursor;\r
 557   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
 558     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
 559     return;\r
 560   }\r
 561   \r
 562   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;\r
 563   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);\r
 564   \r
 565   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);\r
 566   \r
 567   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
 568     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
 569     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
 570     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();\r
 571     \r
 572     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();\r
 573     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();\r
 574     int nx = rIF.nx();\r
 575     int ny = rIF.ny();\r
 576     \r
 577     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {\r
 578       double* pX = new double [ny];\r
 579       double* pY1 = new double [ny];\r
 580       double* pY2 = new double [ny];\r
 581       for (int i = 0; i < ny; i++) {\r
 582         pX[i] = i;\r
 583         pY1[i] = v1[xCursor][i];\r
 584         pY2[i] = v2[xCursor][i];\r
 585       }\r
 586       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
 587       if (! pPlotDoc) {\r
 588         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
 589       } else {\r
 590         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
 591         std::ostringstream title;\r
 592         title << "Comparison of Column " << xCursor;\r
 593         rPlotFile.setTitle(title.str());\r
 594         rPlotFile.setXLabel("Row");\r
 595         rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
 596         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);\r
 597         rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
 598         rPlotFile.addColumn (1, pY1);\r
 599         rPlotFile.addColumn (2, pY2);\r
 600       }\r
 601       delete pX;\r
 602       delete pY1;\r
 603       delete pY2;\r
 604       pPlotDoc->Modify(true);\r
 605     }\r
 606   }\r
 607 }\r
 608
 609 void\r
 610 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)\r
 611 {\r
 612   int xCursor, yCursor;\r
 613   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
 614     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
 615     return;\r
 616   }\r
 617   \r
 618   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;\r
 619   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);\r
 620   \r
 621   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);\r
 622   \r
 623   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
 624     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
 625     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
 626     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();\r
 627     \r
 628     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();\r
 629     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();\r
 630     int nx = rIF.nx();\r
 631     int ny = rIF.ny();\r
 632     \r
 633     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {\r
 634       double* pX = new double [nx];\r
 635       double* pY1 = new double [nx];\r
 636       double* pY2 = new double [nx];\r
 637       for (int i = 0; i < nx; i++) {\r
 638         pX[i] = i;\r
 639         pY1[i] = v1[i][yCursor];\r
 640         pY2[i] = v2[i][yCursor];\r
 641       }\r
 642       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
 643       if (! pPlotDoc) {\r
 644         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
 645       } else {\r
 646         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
 647         std::ostringstream title;\r
 648         title << "Comparison of Row " << yCursor;\r
 649         rPlotFile.setTitle(title.str());\r
 650         rPlotFile.setXLabel("Column");\r
 651         rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
 652         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);\r
 653         rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
 654         rPlotFile.addColumn (1, pY1);\r
 655         rPlotFile.addColumn (2, pY2);\r
 656       }\r
 657       delete pX;\r
 658       delete pY1;\r
 659       delete pY2;\r
 660       pPlotDoc->Modify(true);\r
 661     }\r
 662   }\r
 663 }\r
 664 \r
 665 \r
 666 // PhantomCanvas
 667
 668 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
 669 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
 670 {
 671   m_pView = v;
 672 }
 673
 674 void
 675 PhantomCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
 676 {
 677   if (m_pView)
 678     m_pView->OnDraw(& dc);
 679 }
 680
 681
 682 // PhantomView
 683
 684 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomView, wxView)
 685
 686 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomView, wxView)
 687 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomView::OnProperties)
 688 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomView::OnRasterize)
 689 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomView::OnProjections)
 690 END_EVENT_TABLE()
 691
 692 PhantomView::PhantomView(void)
 693 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
 694 {
 695   m_iDefaultNDet = 367;
 696   m_iDefaultNView = 320;
 697   m_iDefaultNSample = 2;
 698   m_dDefaultRotation = 2;
 699   m_dDefaultFocalLength = 2;
 700   m_dDefaultFieldOfView = 1;
 701   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
 702   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
 703 }
 704
 705 PhantomView::~PhantomView(void)
 706 {
 707 }
 708
 709 void
 710 PhantomView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 711 {
 712   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
 713   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
 714   std::ostringstream os;
 715   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")\n";
 716   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 717 #if DEBUG
 718   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
 719   rPhantom.print();
 720 #endif
 721 }
 722
 723
 724 void
 725 PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
 726 {
 727   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (m_frame, m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView, m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
 728   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
 729   if (retVal == wxID_OK) {
 730     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
 731     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
 732     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
 733     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
 734     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
 735     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
 736     m_dDefaultFieldOfView = dialogProjection.getFieldOfViewRatio();
 737     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
 738     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
 739
 740     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
 741       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
 742       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = dynamic_cast<ProjectionFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.pj", wxDOC_SILENT));\r
 743       if (! pProjectionDoc) {\r
 744         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");\r
 745         return;\r
 746       }
 747       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
 748       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
 749       if (theScanner.fail()) {
 750         *theApp->getLog() << "Failed making scanner: " << theScanner.failMessage().c_str() << "\n";
 751         return;
 752       }
 753       rProj.initFromScanner (theScanner);
 754       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
 755
 756       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
 757         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(m_frame));
 758         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
 759           ::wxYield();
 760           ::wxYield();
 761           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
 762             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
 763             return;
 764           }
 765           ::wxYield();
 766           ::wxYield();
 767           while (dialogProjections.isPaused()) {
 768             ::wxYield();
 769             ::wxUsleep(50);
 770           }
 771         }
 772       } else {
 773         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
 774         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
 775           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
 776           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
 777             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
 778             return;
 779           }
 780         }
 781       }
 782
 783       std::ostringstream os;
 784       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
 785       rProj.setRemark (os.str());
 786       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 787
 788       m_frame->Lower();
 789       ::wxYield();
 790       ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());\r
 791       if (projView) {\r
 792         projView->getFrame()->SetFocus();\r
 793         projView->OnUpdate (projView, NULL);\r
 794       }\r
 795       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
 796         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
 797           pFrame->SetFocus();
 798           pFrame->Raise();
 799         }
 800         theApp->getDocManager()->ActivateView (pView, true, false);
 801       }
 802       ::wxYield();
 803       pProjectionDoc->Modify(true);
 804       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
 805     }
 806   }
 807 }
 808
 809
 810 void
 811 PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
 812 {
 813   DialogGetRasterParameters dialogRaster (m_frame, 256, 256, 1);
 814   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
 815   if (retVal == wxID_OK) {
 816     int xSize = dialogRaster.getXSize();
 817     int ySize = dialogRaster.getYSize();
 818     int nSamples = dialogRaster.getNSamples();
 819     if (nSamples < 1)
 820       nSamples = 1;
 821     if (xSize > 0 && ySize > 0) {
 822       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
 823       ImageFileDocument* pRasterDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
 824       if (! pRasterDoc) {\r
 825         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
 826         return;\r
 827       }
 828       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
 829
 830       imageFile.setArraySize (xSize, ySize);
 831       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
 832       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
 833         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, nSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
 834         if (! dlgProgress.Update(i+1)) {
 835           pRasterDoc->DeleteAllViews();
 836           return;
 837         }
 838       }
 839       pRasterDoc->Modify(true);
 840       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
 841       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());\r
 842       if (rasterView) {\r
 843         rasterView->getFrame()->SetFocus();\r
 844         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);\r
 845       }\r
 846
 847       std::ostringstream os;
 848       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << xSize << ", YSize=" << ySize << ", nSamples=" << nSamples << "\n";
 849       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 850     }\r
 851   }
 852 }
 853
 854
 855 PhantomCanvas*
 856 PhantomView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 857 {
 858   PhantomCanvas* pCanvas;
 859   int width, height;
 860   parent->GetClientSize(&width, &height);
 861
 862   pCanvas = new PhantomCanvas (dynamic_cast<PhantomView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 863
 864   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 865   pCanvas->Clear();
 866
 867   return pCanvas;
 868 }
 869
 870 wxFrame*
 871 PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 872 {
 873   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 874
 875   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
 876
 877   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
 878   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
 879   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
 880
 881   file_menu->AppendSeparator();
 882   file_menu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
 883
 884   file_menu->AppendSeparator();
 885   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 886   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 887   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
 888
 889   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
 890   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...");
 891   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...");
 892
 893   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 894   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
 895   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 896
 897   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 898
 899   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
 900   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
 901   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 902
 903   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 904
 905   subframe->Centre(wxBOTH);
 906
 907   return subframe;
 908 }
 909
 910
 911 bool
 912 PhantomView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 913 {
 914   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
 915   SetFrame(m_frame);
 916
 917   int width, height;
 918   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
 919   m_frame->SetTitle("PhantomView");
 920   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
 921
 922 #ifdef __X__
 923   int x, y;  // X requires a forced resize
 924   m_frame->GetSize(&x, &y);
 925   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
 926 #endif
 927
 928   m_frame->Show(true);
 929   Activate(true);
 930
 931   return true;
 932 }
 933
 934
 935 void
 936 PhantomView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 937 {
 938   if (m_canvas)
 939     m_canvas->Refresh();
 940 }
 941
 942 bool
 943 PhantomView::OnClose (bool deleteWindow)
 944 {
 945   if (!GetDocument()->Close())
 946     return false;
 947
 948   m_canvas->Clear();
 949   m_canvas->m_pView = NULL;
 950   m_canvas = NULL;
 951   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
 952   if (m_frame)
 953     m_frame->SetTitle(s);
 954   SetFrame(NULL);
 955
 956   Activate(false);
 957
 958   if (deleteWindow) {
 959     delete m_frame;
 960     return true;
 961   }
 962   return true;
 963 }
 964
 965 void
 966 PhantomView::OnDraw (wxDC* dc)
 967 {
 968   int xsize, ysize;
 969   m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
 970   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
 971   SGP sgp (driver);
 972   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
 973   sgp.setColor (C_RED);
 974   rPhantom.show (sgp);
 975 }
 976
 977 // ProjectionCanvas
 978
 979 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
 980 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
 981 {
 982   m_pView = v;
 983 }
 984
 985 void
 986 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
 987 {
 988   if (m_pView)
 989     m_pView->OnDraw(& dc);
 990 }
 991
 992 // ProjectionFileView
 993
 994 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
 995
 996 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
 997 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
 998 EVT_MENU(PJMENU_PROCESS_RECONSTRUCT, ProjectionFileView::OnReconstruct)
 999 END_EVENT_TABLE()
1000
1001 ProjectionFileView::ProjectionFileView(void)
1002 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
1003 {
1004   m_iDefaultNX = 256;
1005   m_iDefaultNY = 256;
1006   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
1007   m_dDefaultFilterParam = 1.;
1008 #if HAVE_FFTW
1009   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
1010   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
1011 #else
1012   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
1013   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
1014 #endif
1015   m_iDefaultZeropad = 1;
1016   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF3;
1017   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
1018   m_iDefaultInterpParam = 1;
1019   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1020 }
1021
1022 ProjectionFileView::~ProjectionFileView(void)
1023 {
1024 }
1025
1026 void
1027 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1028 {
1029   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
1030   std::ostringstream os;
1031   rProj.printScanInfo(os);
1032   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
1033   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
1034   dialogMsg.ShowModal();
1035 }
1036
1037
1038 void
1039 ProjectionFileView::OnReconstruct (wxCommandEvent& event)
1040 {
1041   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (m_frame, m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration, m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector, m_iDefaultTrace);
1042
1043   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
1044   if (retVal == wxID_OK) {
1045     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
1046     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
1047     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
1048     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
1049     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
1050     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
1051     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
1052     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
1053     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
1054     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
1055     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
1056     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
1057     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
1058     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
1059     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
1060     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
1061     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
1062       ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
1063       if (pReconDoc) {\r
1064         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
1065         return;\r
1066       }
1067       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
1068       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
1069       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
1070
1071       if (m_iDefaultFilterMethod != ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION && m_iDefaultFilterGeneration == ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT && rProj.geometry() != Scanner::GEOMETRY_PARALLEL) {
1072         wxMessageBox ("Sorry!\nCurrently, frequency-based filtering with direct filter generation is not support for geometries other than parallel.\nAborting command.", "Not Supported", wxOK | wxICON_WARNING, m_frame);
1073         return;
1074       }
1075 #if 0
1076       SGPDriver* pSGPDriver = NULL;
1077       SGP* pSGP = NULL;
1078       wxMemoryDC* pDCPlot = NULL;
1079       wxBitmap bitmap;
1080       if (m_iDefaultTrace >= Trace::TRACE_PLOT) {
1081         bitmap.Create (500, 500);
1082         pDCPlot = new wxMemoryDC;
1083         pDCPlot->SelectObject (bitmap);
1084         pSGPDriver = new SGPDriver (dynamic_cast<wxDC*>pDCPlot, 500, 500);
1085         pSGP = new SGP (*pSGPDriver);
1086       }
1087       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace, pSGP);
1088       delete pSGP;
1089 #else
1090       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
1091 #endif
1092       \r
1093       Timer timerRecon;
1094       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1095         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, m_frame);
1096         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1097           ::wxYield();
1098           ::wxYield();
1099           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView)) {
1100             delete pDlgReconstruct;
1101             delete pReconstruct;
1102             pReconDoc->DeleteAllViews();
1103             return;
1104           }
1105           ::wxYield();
1106           ::wxYield();
1107           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
1108             ::wxYield();
1109             ::wxUsleep(50);
1110           }
1111         }
1112         delete pDlgReconstruct;
1113       } else {
1114         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
1115         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
1116           pReconstruct->reconstructView (i, 1);
1117           if (! dlgProgress.Update(i + 1)) {
1118             delete pReconstruct;
1119             pReconDoc->DeleteAllViews();
1120             return;
1121           }
1122         }
1123       }
1124       delete pReconstruct;
1125       pReconDoc->Modify(true);
1126       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
1127       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());\r
1128       if (rasterView) {\r
1129         rasterView->getFrame()->SetFocus();\r
1130         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);\r
1131       }\r
1132       std::ostringstream os;
1133       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
1134       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1135       imageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
1136       imageFile.labelAdd (Array2dFileLabel::L_HISTORY, os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
1137     }
1138   }
1139 }
1140
1141
1142 ProjectionFileCanvas*
1143 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1144 {
1145   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
1146   int width, height;
1147   parent->GetClientSize(&width, &height);
1148
1149   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (dynamic_cast<ProjectionFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1150
1151   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
1152   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1153   pCanvas->Clear();
1154
1155   return pCanvas;
1156 }
1157
1158 wxFrame*
1159 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1160 {
1161   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1162
1163   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
1164
1165   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
1166   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
1167   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
1168   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1169   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1170
1171   file_menu->AppendSeparator();
1172   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1173
1174   file_menu->AppendSeparator();
1175   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1176   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1177   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1178
1179   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
1180   process_menu->Append(PJMENU_PROCESS_RECONSTRUCT, "R&econstruct...");
1181
1182   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1183   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
1184   help_menu->AppendSeparator();
1185   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1186
1187   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1188
1189   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
1190   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
1191   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1192
1193   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1194
1195   subframe->Centre(wxBOTH);
1196
1197   return subframe;
1198 }
1199
1200
1201 bool
1202 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1203 {
1204   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
1205   SetFrame(m_frame);
1206
1207   int width, height;
1208   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
1209   m_frame->SetTitle("ProjectionFileView");
1210   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
1211
1212 #ifdef __X__
1213   int x, y;  // X requires a forced resize
1214   m_frame->GetSize(&x, &y);
1215   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
1216 #endif
1217
1218   m_frame->Show(true);
1219   Activate(true);
1220
1221   return true;
1222 }
1223
1224 void
1225 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
1226 {
1227   if (m_bitmap.Ok())
1228     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
1229 }
1230
1231
1232 void
1233 ProjectionFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
1234 {
1235   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
1236   const int nDet = rProj.nDet();
1237   const int nView = rProj.nView();
1238   if (nDet != 0 && nView != 0) {
1239     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
1240     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
1241     double min = detval[0];
1242     double max = detval[0];
1243     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
1244       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
1245       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
1246       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
1247         if (min > detval[ix])
1248           min = detval[ix];
1249         else if (max < detval[ix])
1250           max = detval[ix];
1251       }
1252     }
1253
1254     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
1255     double scale = (max - min) / 255;
1256     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
1257       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
1258       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
1259       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
1260         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
1261         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
1262         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
1263         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
1264       }
1265     }
1266     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
1267     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
1268     delete imageData;
1269     int xSize = nDet;
1270     int ySize = nView;
1271     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
1272     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
1273     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
1274     m_canvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
1275   }
1276
1277   if (m_canvas)
1278     m_canvas->Refresh();
1279 }
1280
1281 bool
1282 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1283 {
1284   if (!GetDocument()->Close())
1285     return false;
1286
1287   m_canvas->Clear();
1288   m_canvas->m_pView = NULL;
1289   m_canvas = NULL;
1290   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
1291   if (m_frame)
1292     m_frame->SetTitle(s);
1293   SetFrame(NULL);
1294
1295   Activate(false);
1296
1297   if (deleteWindow) {
1298     delete m_frame;
1299     return true;
1300   }
1301   return true;
1302 }
1303
1304
1305
1306 // PlotFileCanvas
1307 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1308 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1309 {
1310   m_pView = v;
1311 }
1312
1313 void
1314 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
1315 {
1316   if (m_pView)
1317     m_pView->OnDraw(& dc);
1318 }\r
1319
1320
1321 // PlotFileView
1322
1323 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
1324
1325 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
1326 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
1327 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)\r
1328 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)\r
1329 END_EVENT_TABLE()
1330
1331 PlotFileView::PlotFileView(void)
1332 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
1333 {
1334 }
1335
1336 PlotFileView::~PlotFileView(void)
1337 {
1338 }
1339
1340 void
1341 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1342 {
1343   const PlotFile& rProj = GetDocument()->getPlotFile();
1344   std::ostringstream os;\r
1345   os << "Columns: " << rProj.getNumColumns() << ", Records: " << rProj.getNumRecords() << "\n";
1346   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
1347   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
1348   dialogMsg.ShowModal();
1349 }
1350
1351
1352 void \r
1353 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)\r
1354 {\r
1355   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
1356   double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
1357   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);\r
1358   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);\r
1359   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();\r
1360   if (iRetVal == wxID_OK) {\r
1361     m_bMinSpecified = true;\r
1362     m_bMaxSpecified = true;\r
1363     double dMin, dMax;\r
1364     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {\r
1365       m_dMinPixel = dMin;\r
1366       m_dMaxPixel = dMax;\r
1367       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();\r
1368       OnUpdate (this, NULL);\r
1369     }\r
1370   }\r
1371 }\r
1372 \r
1373 void \r
1374 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)\r
1375 {\r
1376   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
1377   double min, max;\r
1378   \r
1379   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified) {\r
1380     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {\r
1381       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";\r
1382       return;\r
1383     }\r
1384   }\r
1385   \r
1386   if (m_bMinSpecified)\r
1387     min = m_dMinPixel;\r
1388   if (m_bMaxSpecified)\r
1389     max = m_dMaxPixel;\r
1390   \r
1391   DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);\r
1392   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();\r
1393   if (retVal == wxID_OK) {\r
1394     m_bMinSpecified = true;\r
1395     m_bMaxSpecified = true;\r
1396     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();\r
1397     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();\r
1398     OnUpdate (this, NULL);\r
1399   }\r
1400 }\r
1401 \r
1402 \r
1403 PlotFileCanvas*
1404 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1405 {
1406   PlotFileCanvas* pCanvas;
1407   int width, height;
1408   parent->GetClientSize(&width, &height);
1409
1410   pCanvas = new PlotFileCanvas (dynamic_cast<PlotFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1411
1412   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1413   pCanvas->Clear();
1414
1415   return pCanvas;
1416 }
1417
1418 wxFrame*
1419 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1420 {
1421   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1422
1423   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
1424
1425   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
1426   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
1427   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
1428   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1429   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1430
1431   file_menu->AppendSeparator();
1432   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1433
1434   file_menu->AppendSeparator();
1435   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1436   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1437   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1438
1439   wxMenu *view_menu = new wxMenu;\r
1440   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");\r
1441   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");\r
1442   \r
1443   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1444   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
1445   help_menu->AppendSeparator();
1446   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1447
1448   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1449
1450   menu_bar->Append(file_menu, "&File");\r
1451   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
1452   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1453
1454   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1455
1456   subframe->Centre(wxBOTH);
1457
1458   return subframe;
1459 }
1460
1461
1462 bool
1463 PlotFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1464 {
1465   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
1466   SetFrame(m_frame);
1467
1468   m_bMinSpecified = false;\r
1469   m_bMaxSpecified = false;\r
1470   m_dAutoScaleFactor = 1.;\r
1471   \r
1472   int width, height;
1473   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
1474   m_frame->SetTitle ("Plot File");
1475   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
1476
1477 #ifdef __X__
1478   int x, y;  // X requires a forced resize
1479   m_frame->GetSize(&x, &y);
1480   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
1481 #endif
1482
1483   m_frame->Show(true);
1484   Activate(true);
1485
1486   return true;
1487 }
1488
1489 void
1490 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
1491 {
1492   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
1493   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();\r
1494   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();\r
1495   \r
1496   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {\r
1497     int xsize, ysize;\r
1498     m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);\r
1499     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);\r
1500     SGP sgp (driver);\r
1501     const PlotFile& rPhantom = GetDocument()->getPlotFile();\r
1502     EZPlot plot (sgp);\r
1503     \r
1504     if (! rPlotFile.getTitle().empty()) {\r
1505       std::string s("title ");\r
1506       s += rPlotFile.getTitle();\r
1507       plot.ezset (s);\r
1508     }\r
1509     if (! rPlotFile.getXLabel().empty()) {\r
1510       std::string s("xlabel ");\r
1511       s += rPlotFile.getXLabel();\r
1512       plot.ezset (s);\r
1513     }\r
1514     if (! rPlotFile.getYLabel().empty()) {\r
1515       std::string s("ylabel ");\r
1516       s += rPlotFile.getYLabel();\r
1517       plot.ezset (s);\r
1518     }\r
1519     \r
1520     if (m_bMinSpecified) {\r
1521       std::ostringstream os;\r
1522       os << "ymin " << m_dMinPixel;\r
1523       plot.ezset (os.str());\r
1524     }\r
1525     \r
1526     if (m_bMaxSpecified) {\r
1527       std::ostringstream os;\r
1528       os << "ymax " << m_dMaxPixel;\r
1529       plot.ezset (os.str());\r
1530     }\r
1531     \r
1532     plot.ezset("box");\r
1533     plot.ezset("grid");\r
1534     \r
1535     double* pdXaxis = new double [iNRecords];\r
1536     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);\r
1537     \r
1538     double* pdY = new double [iNRecords];\r
1539     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {\r
1540       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);\r
1541       plot.addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);\r
1542     }\r
1543     \r
1544     delete pdXaxis;\r
1545     delete pdY;\r
1546     \r
1547     plot.plot();\r
1548   }\r
1549 }
1550
1551
1552 void
1553 PlotFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
1554 {
1555   if (m_canvas)
1556     m_canvas->Refresh();
1557 }
1558
1559 bool
1560 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1561 {
1562   if (!GetDocument()->Close())
1563     return false;
1564
1565   m_canvas->Clear();
1566   m_canvas->m_pView = NULL;
1567   m_canvas = NULL;
1568   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
1569   if (m_frame)
1570     m_frame->SetTitle(s);
1571   SetFrame(NULL);
1572
1573   Activate(false);
1574
1575   if (deleteWindow) {
1576     delete m_frame;
1577     return true;
1578   }
1579   return true;
1580 }
1581