src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.112 2001/02/22 11:05:38 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 #include "wx/wxprec.h"
  29 #ifndef WX_PRECOMP
  30 #include "wx/wx.h"
  31 #endif
  32
  33 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  34 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  35 #endif
  36
  37 #include "wx/image.h"
  38 #include "wx/progdlg.h"
  39
  40 #include "ct.h"
  41 #include "ctsim.h"
  42 #include "docs.h"
  43 #include "views.h"
  44 #include "dialogs.h"
  45 #include "dlgprojections.h"
  46 #include "dlgreconstruct.h"
  47 #include "backprojectors.h"
  48 #include "reconstruct.h"
  49 #include "timer.h"
  50 #include "threadrecon.h"
  51
  52 #define CTSIM_THREADS 1
  53
  54 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  55 #include <sstream>
  56 #else
  57 #include <sstream_subst>
  58 #endif
  59
  60
  61 // ImageFileCanvas
  62
  63 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  64 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  65 EVT_CHAR(ImageFileCanvas::OnChar)
  66 END_EVENT_TABLE()
  67
  68
  69 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  70 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
  71 {
  72 }
  73
  74 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
  75 {
  76   m_pView = NULL;
  77 }
  78
  79 void
  80 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  81 {
  82   if (m_pView)
  83     m_pView->OnDraw(& dc);
  84 }
  85
  86 void
  87 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  88 {
  89   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  90   int nx = rIF.nx();
  91   int ny = rIF.ny();
  92
  93   int yPt = ny - y - 1;
  94   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  95   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  96   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  97   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  98   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
  99 }
 100
 101 bool
 102 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 103 {
 104   x = m_xCursor;
 105   y = m_yCursor;
 106
 107   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 108     return true;
 109   else
 110     return false;
 111 }
 112
 113 void
 114 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 115 {
 116   if (! m_pView)
 117     return;
 118
 119   wxClientDC dc(this);
 120   PrepareDC(dc);
 121
 122   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 123
 124   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 125   if (! pIFDoc)
 126     return;
 127   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 128   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 129   int nx = rIF.nx();
 130   int ny = rIF.ny();
 131   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 132   if (event.RightIsDown()) {
 133     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 134       std::ostringstream os;
 135       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 136       if (rIF.isComplex()) {
 137         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 138         if (dImag < 0)
 139           os << " - " << -dImag;
 140         else
 141           os << " + " << dImag;
 142         os << "i\n";
 143       } else
 144         os << "\n";
 145       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 146     } else
 147       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 148   }
 149   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 150     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 151       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 152         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 153       }
 154       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 155       m_xCursor = pt.x;
 156       m_yCursor = yPt;
 157       wxMenu* pMenu = m_pView->getMenuAnalyze();
 158       if (pMenu && ! pMenu->IsEnabled(IFMENU_PLOT_ROW)) {
 159         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, true);
 160         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_COL, true);
 161         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, true);
 162         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, true);
 163         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, true);
 164         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, true);
 165       }
 166     } else
 167       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 168   }
 169   if (event.LeftUp()) {
 170     std::ostringstream os;
 171     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 172     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 173   }
 174 }
 175
 176 void
 177 ImageFileCanvas::OnChar (wxKeyEvent& event)
 178 {
 179   if (event.GetKeyCode() == WXK_ESCAPE) {
 180     m_xCursor = -1;
 181     m_yCursor = -1;
 182     if (m_pView)
 183       m_pView->OnUpdate (NULL);
 184   } else
 185     wxScrolledWindow::OnChar (event);
 186 }
 187
 188 wxSize
 189 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 190 {
 191   if (! m_pView)
 192     return wxSize(0,0);
 193
 194   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 195   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
 196 }
 197
 198
 199 // ImageFileView
 200
 201 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 202
 203 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 204 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 205 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 206 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 207 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 208 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 209 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 210 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 211 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 212 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 213 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 214 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 215 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 216 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 217 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 218 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 219 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 220 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 221 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 222 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 223 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 224 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 225 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 226 #if wxUSE_GLCANVAS
 227 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, ImageFileView::OnConvert3d)
 228 #endif
 229 #ifdef HAVE_FFT
 230 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 231 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 232 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 233 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 234 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 235 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 236 #endif
 237 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 238 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 239 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 240 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 241 #ifdef HAVE_FFT
 242 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 243 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 244 #endif
 245 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 246 END_EVENT_TABLE()
 247
 248 ImageFileView::ImageFileView()
 249 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 250 {
 251   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 252 }
 253
 254 ImageFileView::~ImageFileView()
 255 {
 256   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
 257   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
 258 }
 259
 260
 261 void
 262 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 263 {
 264   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 265   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 266     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 267   else {
 268     const std::string rFilename = m_pFrame->GetTitle().c_str();
 269     std::ostringstream os;
 270     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 271     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 272     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 273     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 274     os << "Data type: ";
 275     if (rIF.isComplex())
 276       os << "Complex\n";
 277     else
 278       os << "Real\n";
 279     os << "Minimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 280     if (rIF.isComplex()) {
 281       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 282       os << "Imaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 283     }
 284     if (rIF.nLabels() > 0) {
 285       rIF.printLabelsBrief (os);
 286     }
 287     *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 288     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 289     dialogMsg.ShowModal();
 290   }
 291 }
 292
 293 void
 294 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 295 {
 296   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 297   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 298   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 299   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 300   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 301   if (iRetVal == wxID_OK) {
 302     m_bMinSpecified = true;
 303     m_bMaxSpecified = true;
 304     double dMin, dMax;
 305     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 306       m_dMinPixel = dMin;
 307       m_dMaxPixel = dMax;
 308       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 309       OnUpdate (this, NULL);
 310     }
 311   }
 312 }
 313
 314 void
 315 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 316 {
 317   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 318   double min, max;
 319   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 320     rIF.getMinMax (min, max);
 321
 322   if (m_bMinSpecified)
 323     min = m_dMinPixel;
 324   if (m_bMaxSpecified)
 325     max = m_dMaxPixel;
 326
 327   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 328   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 329   if (retVal == wxID_OK) {
 330     m_bMinSpecified = true;
 331     m_bMaxSpecified = true;
 332     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 333     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 334     OnUpdate (this, NULL);
 335   }
 336 }
 337
 338 void
 339 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 340 {
 341   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 342     m_bMinSpecified = false;
 343     m_bMaxSpecified = false;
 344     OnUpdate (this, NULL);
 345   }
 346 }
 347
 348 void
 349 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 350 {
 351   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 352   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 353
 354   if (vecIF.size() == 0) {
 355     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 356   } else {
 357     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
 358
 359     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 360       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 361       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 362       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 363       std::ostringstream os;
 364       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 365       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 366       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 367       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 368       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 369       double d, r, e;
 370       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 371       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 372       *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 373       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 374         ImageFile* pDifferenceImage = new ImageFile;
 375
 376         pDifferenceImage->setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 377         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, *pDifferenceImage)) {
 378           *theApp->getLog() << "Unable to subtract images\n";
 379           delete pDifferenceImage;
 380           return;
 381         }
 382         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
 383         if (! pDifferenceDoc) {
 384           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 385           return;
 386         }
 387         pDifferenceDoc->setImageFile (pDifferenceImage);
 388
 389         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 390         pDifferenceImage->labelsCopy (rIF, s.c_str());
 391         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 392         pDifferenceImage->labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 393         std::ostringstream osLabel;
 394         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 395           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 396           << os.str().c_str();
 397         pDifferenceImage->labelAdd (os.str().c_str());
 398         if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 399           pDifferenceDoc->Modify (true);
 400         pDifferenceDoc->UpdateAllViews (this);
 401         pDifferenceDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 402         pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 403       }
 404       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 405     }
 406   }
 407 }
 408
 409 void
 410 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 411 {
 412   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 413   rIF.invertPixelValues (rIF);
 414   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 415   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 416           GetDocument()->Modify (true);
 417   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 418 }
 419
 420 void
 421 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 422 {
 423   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 424   rIF.square (rIF);
 425   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 426   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 427      GetDocument()->Modify (true);
 428   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 429 }
 430
 431 void
 432 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 433 {
 434   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 435   rIF.sqrt (rIF);
 436   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 437   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 438      GetDocument()->Modify (true);
 439   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 440 }
 441
 442 void
 443 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 444 {
 445   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 446   rIF.log (rIF);
 447   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 448   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 449      GetDocument()->Modify (true);
 450   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 451 }
 452
 453 void
 454 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 455 {
 456   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 457   rIF.exp (rIF);
 458   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 459   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 460      GetDocument()->Modify (true);
 461   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 462 }
 463
 464 void
 465 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 466 {
 467   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 468   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 469
 470   if (vecIF.size() == 0) {
 471     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 472   } else {
 473     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
 474
 475     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 476       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 477       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 478       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 479       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 480       if (! pNewDoc) {
 481         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 482         return;
 483       }
 484       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 485       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 486       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 487       std::ostringstream os;
 488       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 489         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 490       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 491       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 492       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 493       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 494       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 495       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 496       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 497         pNewDoc->Modify (true);
 498       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 499       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 500       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 501     }
 502   }
 503 }
 504
 505 void
 506 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 507 {
 508   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 509   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 510
 511   if (vecIF.size() == 0) {
 512     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 513   } else {
 514     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 515
 516     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 517       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 518       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 519       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 520       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 521       if (! pNewDoc) {
 522         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 523         return;
 524       }
 525       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 526       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 527       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 528       std::ostringstream os;
 529       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 530         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 531       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 532       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 533       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 534       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 535       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 536       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 537       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 538         pNewDoc->Modify (true);
 539       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 540       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 541       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 542     }
 543   }
 544 }
 545
 546 void
 547 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 548 {
 549   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 550   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 551
 552   if (vecIF.size() == 0) {
 553     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 554   } else {
 555     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 556
 557     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 558       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 559       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 560       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 561       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 562       if (! pNewDoc) {
 563         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 564         return;
 565       }
 566       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 567       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 568       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 569       std::ostringstream os;
 570       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 571         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 572       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 573       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 574       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 575       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 576       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 577       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 578       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 579         pNewDoc->Modify (true);
 580       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 581       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 582       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 583     }
 584   }
 585 }
 586
 587 void
 588 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 589 {
 590   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 591   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 592
 593   if (vecIF.size() == 0) {
 594     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 595   } else {
 596     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
 597
 598     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 599       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 600       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 601       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 602       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 603       if (! pNewDoc) {
 604         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 605         return;
 606       }
 607       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 608       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 609       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 610       std::ostringstream os;
 611       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 612         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 613       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 614       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 615       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 616       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 617       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 618       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 619       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 620         pNewDoc->Modify (true);
 621       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 622       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 623       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 624     }
 625   }
 626 }
 627
 628
 629 #ifdef HAVE_FFT
 630 void
 631 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 632 {
 633   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 634   rIF.fft (rIF);
 635   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 636   m_bMinSpecified = false;
 637   m_bMaxSpecified = false;
 638   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 639      GetDocument()->Modify (true);
 640   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 641 }
 642
 643 void
 644 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 645 {
 646   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 647   rIF.ifft (rIF);
 648   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 649   m_bMinSpecified = false;
 650   m_bMaxSpecified = false;
 651   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 652      GetDocument()->Modify (true);
 653   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 654 }
 655
 656 void
 657 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 658 {
 659   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 660   rIF.fftRows (rIF);
 661   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 662   m_bMinSpecified = false;
 663   m_bMaxSpecified = false;
 664   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 665      GetDocument()->Modify (true);
 666   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 667 }
 668
 669 void
 670 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 671 {
 672   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 673   rIF.ifftRows (rIF);
 674   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 675   m_bMinSpecified = false;
 676   m_bMaxSpecified = false;
 677   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 678      GetDocument()->Modify (true);
 679   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 680 }
 681
 682 void
 683 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 684 {
 685   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 686   rIF.fftCols (rIF);
 687   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 688   m_bMinSpecified = false;
 689   m_bMaxSpecified = false;
 690   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 691      GetDocument()->Modify (true);
 692   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 693 }
 694
 695 void
 696 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 697 {
 698   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 699   rIF.ifftCols (rIF);
 700   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 701   m_bMinSpecified = false;
 702   m_bMaxSpecified = false;
 703   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 704      GetDocument()->Modify (true);
 705   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 706 }
 707 #endif
 708
 709 void
 710 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 711 {
 712   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 713   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 714   rIF.fourier (rIF);
 715   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 716   m_bMinSpecified = false;
 717   m_bMaxSpecified = false;
 718   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 719      GetDocument()->Modify (true);
 720   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 721 }
 722
 723 void
 724 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 725 {
 726   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 727   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 728   rIF.inverseFourier (rIF);
 729   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 730   m_bMinSpecified = false;
 731   m_bMaxSpecified = false;
 732   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 733      GetDocument()->Modify (true);
 734   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 735 }
 736
 737 void
 738 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 739 {
 740   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 741   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 742   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 743   m_bMinSpecified = false;
 744   m_bMaxSpecified = false;
 745   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 746      GetDocument()->Modify (true);
 747   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 748 }
 749
 750 void
 751 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 752 {
 753   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 754   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 755   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 756   m_bMinSpecified = false;
 757   m_bMaxSpecified = false;
 758   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 759      GetDocument()->Modify (true);
 760   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 761 }
 762
 763 void
 764 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 765 {
 766   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 767   if (rIF.isComplex()) {
 768     rIF.magnitude (rIF);
 769     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 770     m_bMinSpecified = false;
 771     m_bMaxSpecified = false;
 772     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 773        GetDocument()->Modify (true);
 774     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 775   }
 776 }
 777
 778 void
 779 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 780 {
 781   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 782   if (rIF.isComplex()) {
 783     rIF.phase (rIF);
 784     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 785     m_bMinSpecified = false;
 786     m_bMaxSpecified = false;
 787     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 788        GetDocument()->Modify (true);
 789     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 790   }
 791 }
 792
 793
 794 ImageFileCanvas*
 795 ImageFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
 796 {
 797   ImageFileCanvas* pCanvas;
 798   int width, height;
 799   parent->GetClientSize(&width, &height);
 800
 801   pCanvas = new ImageFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 802
 803   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 804   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 805   pCanvas->Clear();
 806
 807   return pCanvas;
 808 }
 809
 810 #if CTSIM_MDI
 811 wxDocMDIChildFrame*
 812 #else
 813 wxDocChildFrame*
 814 #endif
 815 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 816 {
 817 #if CTSIM_MDI
 818   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 819 #else
 820   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 821 #endif
 822   theApp->setIconForFrame (subframe);
 823
 824   m_pFileMenu = new wxMenu;
 825
 826   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
 827   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
 828   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
 829   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
 830   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 831   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
 832   m_pFileMenu->Append(wxID_REVERT, "Re&vert");
 833
 834   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 835   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
 836   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 837
 838   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 839   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 840   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 841   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Preview");
 842 #ifdef CTSIM_MDI
 843   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 844   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
 845   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
 846 #endif
 847   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
 848   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
 849
 850   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 851   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
 852   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
 853   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
 854
 855   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 856   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 857   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 858   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 859   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 860   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 861   filter_menu->AppendSeparator();
 862 #ifdef HAVE_FFT
 863   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2-D &FFT");
 864   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2-D &IFFT");
 865   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 866   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 867   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 868   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 869   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "2-D F&ourier");
 870   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "2-D Inverse Fo&urier");
 871 #else
 872   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 873   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 874 #endif
 875   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 876   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 877   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 878   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 879
 880   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 881   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 882   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 883   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 884   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 885   image_menu->AppendSeparator();
 886   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 887 #if wxUSE_GLCANVAS
 888   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, "Convert &3-D\tCtrl-3");
 889 #endif
 890
 891   m_pMenuAnalyze = new wxMenu;
 892   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 893   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 894   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 895   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 896   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
 897   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
 898   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 899   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 900   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
 901   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
 902   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, false);
 903   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_COL, false);
 904   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, false);
 905   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, false);
 906   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, false);
 907   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, false);
 908
 909   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 910   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
 911   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
 912   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
 913   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 914
 915   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 916
 917   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
 918   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 919   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 920   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 921   menu_bar->Append(m_pMenuAnalyze, "&Analyze");
 922   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 923
 924   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 925
 926   subframe->Centre(wxBOTH);
 927
 928   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
 929   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
 930   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
 931   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
 932   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), IFMENU_FILE_PROPERTIES);
 933 #if wxUSE_GLCANVAS
 934   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('3'), IFMENU_IMAGE_CONVERT3D);
 935   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
 936 #else
 937   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
 938 #endif
 939
 940   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
 941
 942   return subframe;
 943 }
 944
 945
 946 bool
 947 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 948 {
 949   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
 950
 951   m_bMinSpecified = false;
 952   m_bMaxSpecified = false;
 953   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 954
 955   int width, height;
 956   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
 957   m_pFrame->SetTitle("ImageFileView");
 958   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
 959
 960   int x, y;  // X requires a forced resize
 961   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
 962   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
 963   m_pFrame->SetFocus();
 964   m_pFrame->Show(true);
 965   Activate(true);
 966
 967   return true;
 968 }
 969
 970 void
 971 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 972 {
 973   wxSize sizeWindow = m_pFrame->GetClientSize();
 974   wxSize sizeBest = m_pCanvas->GetBestSize();
 975   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
 976     m_pFrame->SetClientSize (sizeBest);
 977
 978   if (m_bitmap.Ok())
 979     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 980
 981   int xCursor, yCursor;
 982   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 983     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 984 }
 985
 986
 987 void
 988 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 989 {
 990   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 991   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 992   int nx = rIF.nx();
 993   int ny = rIF.ny();
 994   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 995     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 996       double min, max;
 997       rIF.getMinMax (min, max);
 998       if (! m_bMinSpecified)
 999         m_dMinPixel = min;
1000       if (! m_bMaxSpecified)
1001         m_dMaxPixel = max;
1002     }
1003     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
1004
1005     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
1006     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
1007       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1008         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
1009         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
1010         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
1011         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
1012         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
1013       }
1014     }
1015     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
1016     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
1017     delete imageData;
1018     int xSize = nx;
1019     int ySize = ny;
1020     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
1021     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
1022     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
1023     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1024   }
1025
1026   if (m_pCanvas)
1027     m_pCanvas->Refresh();
1028 }
1029
1030 bool
1031 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1032 {
1033   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
1034   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1035     return false;
1036
1037   Activate (false);
1038   if (m_pCanvas) {
1039     m_pCanvas->setView(NULL);
1040     m_pCanvas = NULL;
1041   }
1042   wxString s(theApp->GetAppName());
1043   if (m_pFrame)
1044     m_pFrame->SetTitle(s);
1045
1046   SetFrame(NULL);
1047
1048   if (deleteWindow) {
1049     delete m_pFrame;
1050     m_pFrame = NULL;
1051     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
1052       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
1053   }
1054
1055   return true;
1056 }
1057
1058 void
1059 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1060 {
1061   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1062   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1063   int nx = rIF.nx();
1064   int ny = rIF.ny();
1065   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1066     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1067       double min, max;
1068       rIF.getMinMax (min, max);
1069       if (! m_bMinSpecified)
1070         m_dMinPixel = min;
1071       if (! m_bMaxSpecified)
1072         m_dMaxPixel = max;
1073     }
1074
1075     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1076     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1077       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1078       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1079
1080       wxString strExt;
1081       wxString strWildcard;
1082       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
1083         strExt = ".pgm";
1084         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1085       }
1086 #ifdef HAVE_PNG
1087       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
1088         strExt = ".png";
1089         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1090       }
1091 #endif
1092
1093       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1094         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1095       if (strFilename) {
1096         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1097         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1098       }
1099     }
1100   }
1101 }
1102
1103 void
1104 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1105 {
1106   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1107   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1108   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1109
1110   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1111   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1112     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1113     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1114     std::ostringstream os;
1115     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1116     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1117     if (! pScaledDoc) {
1118       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1119       return;
1120     }
1121     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1122     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1123     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1124     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1125     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1126     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1127     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1128        pScaledDoc->Modify (true);
1129     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1130     pScaledDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1131     pScaledDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1132   }
1133 }
1134
1135 #if wxUSE_GLCANVAS
1136 void
1137 ImageFileView::OnConvert3d (wxCommandEvent& event)
1138 {
1139   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1140   Graph3dFileDocument* pGraph3d = theApp->newGraph3dDoc();
1141   pGraph3d->setBadFileOpen();
1142   pGraph3d->createFromImageFile (rIF);
1143   pGraph3d->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1144   pGraph3d->UpdateAllViews();
1145   pGraph3d->getView()->getFrame()->SetClientSize (400, 400);
1146   pGraph3d->getView()->getFrame()->Show (true);
1147   GetDocumentManager()->ActivateView (pGraph3d->getView(), true, false);
1148   ::wxYield();
1149   pGraph3d->getView()->getCanvas()->SetFocus();
1150 }
1151 #endif
1152
1153 void
1154 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1155 {
1156   int xCursor, yCursor;
1157   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1158     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1159     return;
1160   }
1161
1162   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1163   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1164   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1165   int nx = rIF.nx();
1166   int ny = rIF.ny();
1167
1168   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1169     double* pX = new double [nx];
1170     double* pYReal = new double [nx];
1171     double *pYImag = NULL;
1172     double *pYMag = NULL;
1173     if (rIF.isComplex()) {
1174       pYImag = new double [nx];
1175       pYMag = new double [nx];
1176     }
1177     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1178       pX[i] = i;
1179       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1180       if (rIF.isComplex()) {
1181         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1182         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1183       }
1184     }
1185     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1186     if (! pPlotDoc) {
1187       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1188     } else {
1189       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1190       std::ostringstream os;
1191       os << "Row " << yCursor;
1192       std::string title("title ");
1193       title += os.str();
1194       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1195       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1196       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1197       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1198       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1199       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1200       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1201       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1202       if (rIF.isComplex()) {
1203         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1204         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1205         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1206         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1207         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1208         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1209         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1210         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1211       } else
1212         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1213       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1214       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1215       if (rIF.isComplex()) {
1216         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1217         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1218       }
1219       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1220         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1221       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1222       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1223       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1224     }
1225     delete pX;
1226     delete pYReal;
1227     if (rIF.isComplex()) {
1228       delete pYImag;
1229       delete pYMag;
1230     }
1231     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1232        pPlotDoc->Modify (true);
1233     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1234     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1235     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1236   }
1237 }
1238
1239 void
1240 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1241 {
1242   int xCursor, yCursor;
1243   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1244     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1245     return;
1246   }
1247
1248   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1249   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1250   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1251   int nx = rIF.nx();
1252   int ny = rIF.ny();
1253
1254   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1255     double* pX = new double [ny];
1256     double* pYReal = new double [ny];
1257     double* pYImag = NULL;
1258     double* pYMag = NULL;
1259     if (rIF.isComplex()) {
1260       pYImag = new double [ny];
1261       pYMag = new double [ny];
1262     }
1263     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1264       pX[i] = i;
1265       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1266       if (rIF.isComplex()) {
1267         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1268         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1269       }
1270     }
1271     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1272     if (! pPlotDoc) {
1273       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1274     } else {
1275       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1276       std::ostringstream os;
1277       os << "Column " << xCursor;
1278       std::string title("title ");
1279       title += os.str();
1280       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1281       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1282       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1283       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1284       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1285       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1286       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1287       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1288       if (rIF.isComplex()) {
1289         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1290         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1291         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1292         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1293         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1294         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1295         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1296         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1297       } else
1298         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1299       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1300       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1301       if (rIF.isComplex()) {
1302         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1303         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1304       }
1305       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1306         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1307       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1308       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1309       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1310     }
1311     delete pX;
1312     delete pYReal;
1313     if (rIF.isComplex()) {
1314       delete pYImag;
1315       delete pYMag;
1316     }
1317     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1318        pPlotDoc->Modify (true);
1319     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1320     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1321     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1322   }
1323 }
1324
1325 #ifdef HAVE_FFT
1326 void
1327 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1328 {
1329   int xCursor, yCursor;
1330   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1331     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1332     return;
1333   }
1334
1335   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1336   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1337   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1338   int nx = rIF.nx();
1339   int ny = rIF.ny();
1340
1341   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1342     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1343
1344     int i;
1345     for (i = 0; i < nx; i++) {
1346       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1347       if (rIF.isComplex())
1348         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1349       else
1350         pcIn[i].im = 0;
1351     }
1352
1353     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1354     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1355     fftw_destroy_plan (plan);
1356
1357     double* pX = new double [nx];
1358     double* pYReal = new double [nx];
1359     double* pYImag = new double [nx];
1360     double* pYMag = new double [nx];
1361     for (i = 0; i < nx; i++) {
1362       pX[i] = i;
1363       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1364       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1365       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1366     }
1367     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1368     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1369     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1370
1371     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1372     if (! pPlotDoc) {
1373       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1374     } else {
1375       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1376       std::ostringstream os;
1377       os << "Row " << yCursor;
1378       std::string title("title ");
1379       title += os.str();
1380       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1381       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1382       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1383       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1384       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1385       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1386       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1387       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1388       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1389       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1390       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1391       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1392       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1393       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1394       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1395       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1396       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1397       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1398       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1399       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1400       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1401         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1402       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1403       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1404       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1405     }
1406     delete pX;
1407     delete pYReal;
1408     delete pYImag;
1409     delete pYMag;
1410     delete [] pcIn;
1411
1412     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1413        pPlotDoc->Modify (true);
1414     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1415     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1416     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1417   }
1418 }
1419
1420 void
1421 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1422 {
1423   int xCursor, yCursor;
1424   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1425     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1426     return;
1427   }
1428
1429   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1430   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1431   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1432   int nx = rIF.nx();
1433   int ny = rIF.ny();
1434
1435   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1436     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1437     double *pdTemp = new double [ny];
1438
1439     int i;
1440     for (i = 0; i < ny; i++)
1441       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1442     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1443     for (i = 0; i < ny; i++)
1444       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1445
1446     for (i = 0; i < ny; i++) {
1447       if (rIF.isComplex())
1448         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1449       else
1450         pdTemp[i] = 0;
1451     }
1452     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1453     for (i = 0; i < ny; i++)
1454       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1455
1456     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1457     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1458     fftw_destroy_plan (plan);
1459
1460     double* pX = new double [ny];
1461     double* pYReal = new double [ny];
1462     double* pYImag = new double [ny];
1463     double* pYMag = new double [ny];
1464     for (i = 0; i < ny; i++) {
1465       pX[i] = i;
1466       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1467       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1468       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1469     }
1470
1471     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1472     if (! pPlotDoc) {
1473       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1474     } else {
1475       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1476       std::ostringstream os;
1477       os << "Column " << xCursor;
1478       std::string title("title ");
1479       title += os.str();
1480       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1481       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1482       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1483       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1484       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1485       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1486       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1487       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1488       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1489       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1490       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1491       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1492       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1493       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1494       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1495       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1496       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1497       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1498       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1499       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1500       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1501         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1502       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1503       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1504       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1505     }
1506     delete pX;
1507     delete pYReal;
1508     delete pYImag;
1509     delete pYMag;
1510     delete pdTemp;
1511     delete [] pcIn;
1512
1513     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1514        pPlotDoc->Modify (true);
1515     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1516     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1517     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1518   }
1519 }
1520 #endif
1521
1522 void
1523 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1524 {
1525   int xCursor, yCursor;
1526   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1527     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1528     return;
1529   }
1530
1531   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1532   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1533   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1534     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1535     return;
1536   }
1537   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1538
1539   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1540     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1541     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1542     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1543
1544     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1545     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1546     int nx = rIF.nx();
1547     int ny = rIF.ny();
1548
1549     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1550       double* pX = new double [ny];
1551       double* pY1 = new double [ny];
1552       double* pY2 = new double [ny];
1553       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1554         pX[i] = i;
1555         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1556         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1557       }
1558       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1559       if (! pPlotDoc) {
1560         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1561       } else {
1562         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1563         std::ostringstream os;
1564         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1565         std::string title("title ");
1566         title += os.str();
1567         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1568         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1569         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1570         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1571         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1572         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1573         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1574         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1575         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1576         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1577         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1578         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1579         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1580         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1581         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1582
1583         unsigned int iL;
1584         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1585           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1586           s += ": ";
1587           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1588           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1589         }
1590         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1591           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1592           s += ": ";
1593           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1594           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1595         }
1596         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1597           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1598         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1599         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1600       }
1601       delete pX;
1602       delete pY1;
1603       delete pY2;
1604       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1605         pPlotDoc->Modify (true);
1606       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1607       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1608       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1609     }
1610   }
1611 }
1612
1613 void
1614 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1615 {
1616   int xCursor, yCursor;
1617   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1618     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1619     return;
1620   }
1621
1622   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1623   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1624
1625   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1626     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1627     return;
1628   }
1629
1630   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1631
1632   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1633     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1634     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1635     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1636
1637     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1638     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1639     int nx = rIF.nx();
1640     int ny = rIF.ny();
1641
1642     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1643       double* pX = new double [nx];
1644       double* pY1 = new double [nx];
1645       double* pY2 = new double [nx];
1646       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1647         pX[i] = i;
1648         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1649         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1650       }
1651       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1652       if (! pPlotDoc) {
1653         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1654       } else {
1655         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1656         std::ostringstream os;
1657         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1658         std::string title("title ");
1659         title += os.str();
1660         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1661         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1662         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1663         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1664         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1665         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1666         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1667         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1668         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1669         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1670         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1671         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1672         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1673         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1674         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1675         unsigned int iL;
1676         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1677           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1678           s += ": ";
1679           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1680           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1681         }
1682         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1683           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1684           s += ": ";
1685           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1686           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1687         }
1688         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1689           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1690         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1691         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1692       }
1693       delete pX;
1694       delete pY1;
1695       delete pY2;
1696       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1697         pPlotDoc->Modify (true);
1698       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1699       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1700       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1701     }
1702   }
1703 }
1704
1705 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1706
1707 void
1708 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1709 {
1710   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1711   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1712   int nx = rIF.nx();
1713   int ny = rIF.ny();
1714
1715   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1716     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1717     if (! pPlotDoc) {
1718       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1719       return;
1720     }
1721
1722     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1723     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1724     double dMin, dMax;
1725     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1726     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1727
1728     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1729       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1730       pY[i] = 0;
1731     }
1732     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1733       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1734         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1735         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1736           pY[iBin] += 1;
1737       }
1738
1739       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1740       std::ostringstream os;
1741       os << "Histogram";
1742       std::string title("title ");
1743       title += os.str();
1744       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1745       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1746       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1747       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1748       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1749       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1750       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1751       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1752       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1753         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1754         s += ": ";
1755         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1756         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1757       }
1758       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1759       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1760       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1761       delete pX;
1762       delete pY;
1763       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1764         pPlotDoc->Modify (true);
1765       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1766       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1767       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1768   }
1769 }
1770
1771
1772 // PhantomCanvas
1773
1774 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1775 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1776 {
1777   m_pView = v;
1778 }
1779
1780 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1781 {
1782   m_pView = NULL;
1783 }
1784
1785 void
1786 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1787 {
1788   if (m_pView)
1789     m_pView->OnDraw(& dc);
1790 }
1791
1792 wxSize
1793 PhantomCanvas::GetBestSize() const
1794 {
1795   if (! m_pView)
1796     return wxSize(0,0);
1797
1798   int xSize, ySize;
1799   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
1800   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
1801   ySize = xSize = (xSize / 3);
1802   return wxSize (xSize, ySize);
1803 }
1804
1805
1806
1807 // PhantomFileView
1808
1809 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
1810
1811 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
1812 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
1813 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
1814 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
1815 END_EVENT_TABLE()
1816
1817 PhantomFileView::PhantomFileView()
1818 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
1819 {
1820 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
1821   m_iDefaultNDet = 165;
1822   m_iDefaultNView = 180;
1823 #else
1824   m_iDefaultNDet = 367;
1825   m_iDefaultNView = 320;
1826 #endif
1827   m_iDefaultNSample = 2;
1828   m_dDefaultRotation = 1;
1829   m_dDefaultFocalLength = 2;
1830   m_dDefaultViewRatio = 1;
1831   m_dDefaultScanRatio = 1;
1832   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1833   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1834
1835 #ifdef DEBUG
1836   m_iDefaultRasterNX = 115;
1837   m_iDefaultRasterNY = 115;
1838   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1839 #else
1840   m_iDefaultRasterNX = 256;
1841   m_iDefaultRasterNY = 256;
1842   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1843 #endif
1844   m_dDefaultRasterViewRatio = 1;
1845 }
1846
1847 PhantomFileView::~PhantomFileView()
1848 {
1849   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
1850   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
1851 }
1852
1853 void
1854 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1855 {
1856   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1857   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1858   std::ostringstream os;
1859   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1860   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1861   rPhantom.printDefinitions (os);
1862 #if DEBUG
1863   rPhantom.print (os);
1864 #endif
1865   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
1866   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1867 }
1868
1869
1870 void
1871 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1872 {
1873   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(),
1874     m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation,
1875     m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio, m_iDefaultGeometry,
1876     m_iDefaultTrace);
1877   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1878   if (retVal == wxID_OK) {
1879     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1880     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1881     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1882     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1883     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1884     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1885     m_dDefaultViewRatio = dialogProjection.getViewRatio();
1886     m_dDefaultScanRatio = dialogProjection.getScanRatio();
1887     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1888     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1889
1890     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1891       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1892       Projections* pProj = new Projections;
1893       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample,
1894                           m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio);
1895       if (theScanner.fail()) {
1896         wxString msg = "Failed making scanner\n";
1897         msg += theScanner.failMessage().c_str();
1898         *theApp->getLog() << msg << "\n";
1899         wxMessageBox (msg, "Error");
1900         return;
1901       }
1902       pProj->initFromScanner (theScanner);
1903       m_dDefaultRotation /= TWOPI;  // convert back to fraction of a circle
1904
1905       Timer timer;
1906       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1907         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, *pProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1908         for (int iView = 0; iView < pProj->nView(); iView++) {
1909           ::wxYield();
1910           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1911             delete pProj;
1912             return;
1913           }
1914           ::wxYield();
1915           while (dialogProjections.isPaused()) {
1916             ::wxYield();
1917             ::wxUsleep(50);
1918           }
1919         }
1920       } else {
1921         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), pProj->nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
1922         for (int i = 0; i < pProj->nView(); i++) {
1923           theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1924           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1925             delete pProj;
1926             return;
1927           }
1928         }
1929       }
1930
1931       std::ostringstream os;
1932       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet
1933         << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample
1934         << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength
1935         << ", ViewRatio=" << m_dDefaultViewRatio << ", ScanRatio=" << m_dDefaultScanRatio
1936         << ", Geometry=" << sGeometry.c_str() << ", FanBeamAngle=" <<
1937         convertRadiansToDegrees (theScanner.fanBeamAngle());
1938       pProj->setCalcTime (timer.timerEnd());
1939       pProj->setRemark (os.str());
1940       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1941
1942       ::wxYield();
1943       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
1944       if (! pProjectionDoc) {
1945         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1946         return;
1947       }
1948       pProjectionDoc->setProjections (pProj);
1949       ProjectionFileView* projView = pProjectionDoc->getView();
1950       if (projView) {
1951         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1952         if (projView->getCanvas())
1953               projView->getCanvas()->SetClientSize (m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView);
1954         if (wxFrame* pFrame = projView->getFrame()) {
1955           pFrame->Show(true);
1956           pFrame->SetFocus();
1957           pFrame->Raise();
1958         }
1959         GetDocumentManager()->ActivateView (projView, true, false);
1960       }
1961       ::wxYield();
1962       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1963         pProjectionDoc-> Modify(true);
1964       pProjectionDoc->UpdateAllViews (this);
1965     }
1966   }
1967 }
1968
1969
1970 void
1971 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1972 {
1973   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
1974     m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio);
1975   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1976   if (retVal == wxID_OK) {
1977     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1978     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1979     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1980     m_dDefaultRasterViewRatio = dialogRaster.getViewRatio();
1981     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1982       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1983     if (m_dDefaultRasterViewRatio < 0)
1984       m_dDefaultRasterViewRatio = 0;
1985     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1986       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1987
1988       ImageFile* pImageFile = new ImageFile;
1989
1990       pImageFile->setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY);
1991       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"),
1992                                     pImageFile->nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
1993       Timer timer;
1994       for (unsigned int i = 0; i < pImageFile->nx(); i++) {
1995         rPhantom.convertToImagefile (*pImageFile, m_dDefaultRasterViewRatio, m_iDefaultRasterNSamples,
1996           Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1997         if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1998           delete pImageFile;
1999           return;
2000         }
2001       }
2002
2003       ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
2004       if (! pRasterDoc) {
2005         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2006         return;
2007       }
2008       pRasterDoc->setImageFile (pImageFile);
2009
2010       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2011         pRasterDoc->Modify (true);
2012       pRasterDoc->UpdateAllViews (this);
2013       pRasterDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2014       std::ostringstream os;
2015       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
2016         << m_iDefaultRasterNY << ", ViewRatio=" << m_dDefaultRasterViewRatio << ", nSamples="
2017         << m_iDefaultRasterNSamples;;
2018       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2019       pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
2020       ImageFileView* rasterView = pRasterDoc->getView();
2021       if (rasterView) {
2022         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2023         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2024       }
2025
2026     }
2027   }
2028 }
2029
2030
2031 PhantomCanvas*
2032 PhantomFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2033 {
2034   PhantomCanvas* pCanvas;
2035
2036   pCanvas = new PhantomCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(0,0), 0);
2037   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2038   pCanvas->Clear();
2039
2040   return pCanvas;
2041 }
2042
2043 #if CTSIM_MDI
2044 wxDocMDIChildFrame*
2045 #else
2046 wxDocChildFrame*
2047 #endif
2048 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2049 {
2050 #if CTSIM_MDI
2051   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2052 #else
2053   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2054 #endif
2055   theApp->setIconForFrame (subframe);
2056
2057   m_pFileMenu = new wxMenu;
2058
2059   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2060   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2061   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2062   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2063   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2064
2065   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2066   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2067
2068   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2069   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2070   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2071   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2072 #ifdef CTSIM_MDI
2073   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2074   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2075   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2076 #endif
2077   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2078   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2079
2080   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
2081   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
2082   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
2083
2084   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2085   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2086   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2087   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2088   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2089
2090   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2091
2092   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2093   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
2094   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2095
2096   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2097   subframe->Centre(wxBOTH);
2098
2099   wxAcceleratorEntry accelEntries[3];
2100   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2101   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2102   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PHMMENU_FILE_PROPERTIES);
2103   wxAcceleratorTable accelTable (3, accelEntries);
2104   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2105
2106   return subframe;
2107 }
2108
2109
2110 bool
2111 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2112 {
2113   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2114   SetFrame(m_pFrame);
2115   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2116   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2117   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2118
2119   m_pFrame->SetTitle ("PhantomFileView");
2120
2121 #ifdef __X__
2122   int x, y;  // X requires a forced resize
2123   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2124   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2125 #endif
2126
2127   m_pFrame->Show(true);
2128   Activate(true);
2129
2130   return true;
2131 }
2132
2133 void
2134 PhantomFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2135 {
2136   if (m_pCanvas)
2137     m_pCanvas->Refresh();
2138 }
2139
2140 bool
2141 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2142 {
2143   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2144   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2145     return false;
2146
2147   Activate(false);
2148   if (m_pCanvas) {
2149     m_pCanvas->setView(NULL);
2150     m_pCanvas = NULL;
2151   }
2152   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2153   if (m_pFrame)
2154     m_pFrame->SetTitle(s);
2155
2156   SetFrame(NULL);
2157
2158   if (deleteWindow) {
2159     delete m_pFrame;
2160     m_pFrame = NULL;
2161     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2162       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2163   }
2164
2165   return true;
2166 }
2167
2168 void
2169 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2170 {
2171   int xsize, ysize;
2172   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2173   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2174   SGP sgp (driver);
2175   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2176   sgp.setColor (C_RED);
2177   rPhantom.show (sgp);
2178 }
2179
2180 // ProjectionCanvas
2181
2182 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2183 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2184 {
2185   m_pView = v;
2186 }
2187
2188 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2189 {
2190   m_pView = NULL;
2191 }
2192
2193 void
2194 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2195 {
2196   if (m_pView)
2197     m_pView->OnDraw(& dc);
2198 }
2199
2200 wxSize
2201 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2202 {
2203   wxSize best (0, 0);
2204   if (m_pView) {
2205     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2206     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2207   }
2208
2209   return best;
2210 }
2211
2212
2213 // ProjectionFileView
2214
2215 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2216
2217 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2218 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2219 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2220 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, ProjectionFileView::OnReconstructFourier)
2221 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2222 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2223 END_EVENT_TABLE()
2224
2225 ProjectionFileView::ProjectionFileView()
2226 : wxView(), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pFileMenu(0)
2227 {
2228 #ifdef DEBUG
2229   m_iDefaultNX = 115;
2230   m_iDefaultNY = 115;
2231 #else
2232   m_iDefaultNX = 256;
2233   m_iDefaultNY = 256;
2234 #endif
2235
2236   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2237   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2238 #if HAVE_FFTW
2239   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2240   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2241 #else
2242   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2243   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2244 #endif
2245   m_iDefaultZeropad = 1;
2246   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF;
2247   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2248   m_iDefaultInterpParam = 1;
2249   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2250
2251   m_iDefaultPolarNX = 256;
2252   m_iDefaultPolarNY = 256;
2253   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2254   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2255 }
2256
2257 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2258 {
2259   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2260   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2261 }
2262
2263 void
2264 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2265 {
2266   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2267   std::ostringstream os;
2268   rProj.printScanInfo(os);
2269   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
2270   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2271   dialogMsg.ShowModal();
2272 }
2273
2274
2275 void
2276 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2277 {
2278   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2279   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2280     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2281   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2282     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2283     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2284     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2285     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2286     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2287     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2288     if (! rProj.convertPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation)) {
2289       delete pIF;
2290       *theApp->getLog() << "Error converting to Polar\n";
2291       return;
2292     }
2293     pPolarDoc = theApp->newImageDoc ();
2294     if (! pPolarDoc) {
2295       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2296       return;
2297     }
2298     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2299     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2300     std::ostringstream os;
2301     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2302       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2303       << strInterpolation.c_str();
2304     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2305     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2306     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2307       pPolarDoc->Modify (true);
2308     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2309     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2310     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2311   }
2312 }
2313
2314 void
2315 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2316 {
2317   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2318   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2319     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2320   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2321     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2322     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2323     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2324     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2325     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2326
2327     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2328     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2329       delete pIF;
2330       *theApp->getLog() << "Error converting to polar\n";
2331       return;
2332     }
2333     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2334     if (! pPolarDoc) {
2335       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2336       return;
2337     }
2338     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2339     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2340     std::ostringstream os;
2341     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2342       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2343       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2344     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2345     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2346     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2347       pPolarDoc->Modify (true);
2348     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2349     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2350     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2351   }
2352 }
2353
2354 void
2355 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2356 {
2357 #if CTSIM_THREADS
2358   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY,
2359     m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration,
2360     m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector,
2361     m_iDefaultTrace);
2362
2363   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2364   if (retVal == wxID_OK) {
2365     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2366     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2367     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2368     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2369     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2370     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2371     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2372     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2373     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2374     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2375     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2376     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2377     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2378     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2379     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2380     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2381
2382     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2383       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2384       ImageFile* pImageFile = new ImageFile;
2385       pImageFile->setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2386       std::ostringstream os;
2387       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2388
2389       Timer timerRecon;
2390       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2391         Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2392         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2393         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2394
2395         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstructor, rProj, *pImageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2396         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2397           ::wxYield();
2398           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView, true)) {
2399             delete pDlgReconstruct;
2400             delete pReconstructor;
2401             delete pImageFile;
2402             return;
2403           }
2404           ::wxYield();
2405           ::wxYield();
2406           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2407             ::wxYield();
2408             ::wxUsleep(50);
2409           }
2410         }
2411         delete pDlgReconstruct;
2412         delete pReconstructor;
2413       ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2414       if (! pReconDoc) {
2415         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2416         return;
2417       }
2418       pReconDoc->setImageFile (pImageFile);
2419       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2420         pReconDoc->Modify (true);
2421       pReconDoc->UpdateAllViews (this);
2422       if (ImageFileView* rasterView = pReconDoc->getView()) {
2423         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2424         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2425         rasterView->getFrame()->Show(true);
2426       }
2427       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2428       pImageFile->labelAdd (rProj.getLabel());
2429       pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2430
2431       } else {
2432 #if CTSIM_THREADS
2433         ThreadedReconstructor* pReconstructor = new ThreadedReconstructor (this,
2434         m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, optFilterName.c_str(),
2435         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2436         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), os.str().c_str());
2437         if (! pReconstructor->start()) {
2438           delete pImageFile;
2439           delete pReconstructor;
2440           return;
2441         }
2442         delete pImageFile;
2443         // delete pReconstructor;
2444 #else
2445         Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2446         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2447         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2448
2449         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2450         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2451           pReconstructor->reconstructView (iView, 1);
2452           if (! dlgProgress.Update (iView + 1)) {
2453             delete pReconstructor;
2454             delete pImageFile;
2455             return;
2456           }
2457         }
2458       delete pReconstructor;
2459       ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2460       if (! pReconDoc) {
2461         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2462         return;
2463       }
2464       pReconDoc->setImageFile (pImageFile);
2465       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2466         pReconDoc->Modify (true);
2467       pReconDoc->UpdateAllViews (this);
2468       if (ImageFileView* rasterView = pReconDoc->getView()) {
2469         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2470         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2471         rasterView->getFrame()->Show(true);
2472       }
2473       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2474       pImageFile->labelAdd (rProj.getLabel());
2475       pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2476 #endif
2477       }
2478     }
2479   }
2480 #else
2481   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2482 #endif
2483 }
2484
2485 void
2486 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2487 {
2488   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY,
2489     m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration,
2490     m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector,
2491     m_iDefaultTrace);
2492
2493   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2494   if (retVal == wxID_OK) {
2495     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2496     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2497     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2498     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2499     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2500     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2501     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2502     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2503     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2504     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2505     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2506     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2507     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2508     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2509     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2510     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2511
2512     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2513       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2514       ImageFile* pImageFile = new ImageFile;
2515       pImageFile->setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2516
2517       Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2518         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2519         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2520
2521       Timer timerRecon;
2522       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2523         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstructor, rProj, *pImageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2524         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2525           ::wxYield();
2526           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView, true)) {
2527             delete pDlgReconstruct;
2528             delete pReconstructor;
2529             delete pImageFile;
2530             return;
2531           }
2532           ::wxYield();
2533           ::wxYield();
2534           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2535             ::wxYield();
2536             ::wxUsleep(50);
2537           }
2538         }
2539         delete pDlgReconstruct;
2540       } else {
2541         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2542         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2543           pReconstructor->reconstructView (iView, 1);
2544           if (! dlgProgress.Update (iView + 1)) {
2545             delete pReconstructor;
2546             delete pImageFile;
2547             return;
2548           }
2549         }
2550       }
2551       delete pReconstructor;
2552       ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2553       if (! pReconDoc) {
2554         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2555         return;
2556       }
2557       pReconDoc->setImageFile (pImageFile);
2558       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2559         pReconDoc->Modify (true);
2560       pReconDoc->UpdateAllViews (this);
2561       if (ImageFileView* rasterView = pReconDoc->getView()) {
2562         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2563         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2564         rasterView->getFrame()->Show(true);
2565       }
2566       std::ostringstream os;
2567       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2568       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2569       pImageFile->labelAdd (rProj.getLabel());
2570       pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2571     }
2572   }
2573 }
2574
2575
2576 ProjectionFileCanvas*
2577 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2578 {
2579   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2580   int width, height;
2581   parent->GetClientSize(&width, &height);
2582
2583   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2584
2585   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2586   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2587   pCanvas->Clear();
2588
2589   return pCanvas;
2590 }
2591
2592 #if CTSIM_MDI
2593 wxDocMDIChildFrame*
2594 #else
2595 wxDocChildFrame*
2596 #endif
2597 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2598 {
2599 #ifdef CTSIM_MDI
2600   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2601 #else
2602   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2603 #endif
2604   theApp->setIconForFrame (subframe);
2605
2606   m_pFileMenu = new wxMenu;
2607
2608   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2609   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2610   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2611   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2612   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2613   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2614
2615   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2616   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2617
2618   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2619   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2620   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2621   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2622 #ifdef CTSIM_MDI
2623   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2624   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2625   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2626 #endif
2627   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2628   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2629
2630   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2631   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2632   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-M");
2633
2634   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2635   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R", "Reconstruct image using filtered backprojection");
2636   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E", "Reconstruct image using inverse Fourier");
2637 #ifndef CTSIM_THREADS
2638   reconstruct_menu->Enable (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, false);
2639 #endif
2640
2641   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2642   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2643   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2644   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2645   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2646
2647   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2648
2649   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
2650   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2651   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2652   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2653
2654   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2655   subframe->Centre(wxBOTH);
2656
2657   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
2658   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2659   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('M'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2660   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2661   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2662   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_FILE_PROPERTIES);
2663   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
2664   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2665
2666   return subframe;
2667 }
2668
2669
2670 bool
2671 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2672 {
2673   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2674   SetFrame(m_pFrame);
2675
2676   int width, height;
2677   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
2678   m_pFrame->SetTitle ("ProjectionFileView");
2679   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2680
2681 #ifdef __X__
2682   int x, y;  // X requires a forced resize
2683   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2684   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2685 #endif
2686
2687   m_pFrame->Show(true);
2688   Activate(true);
2689
2690   return true;
2691 }
2692
2693 void
2694 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2695 {
2696   wxSize clientSize = m_pFrame->GetClientSize();
2697   wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
2698
2699   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2700     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
2701
2702   if (m_bitmap.Ok())
2703     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2704 }
2705
2706
2707 void
2708 ProjectionFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2709 {
2710   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2711   const int nDet = rProj.nDet();
2712   const int nView = rProj.nView();
2713   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2714     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2715     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2716     double min = detval[0];
2717     double max = detval[0];
2718     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2719       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2720       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2721       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2722         if (min > detval[ix])
2723           min = detval[ix];
2724         else if (max < detval[ix])
2725           max = detval[ix];
2726       }
2727     }
2728
2729     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2730     double scale = (max - min) / 255;
2731     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2732       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2733       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2734       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2735         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2736         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2737         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2738         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2739       }
2740     }
2741     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2742     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2743     delete imageData;
2744     int xSize = nDet;
2745     int ySize = nView;
2746     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2747     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2748     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
2749     m_pCanvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2750   }
2751
2752   if (m_pCanvas)
2753     m_pCanvas->Refresh();
2754 }
2755
2756 bool
2757 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2758 {
2759   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2760   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2761     return false;
2762
2763   Activate(false);
2764   if (m_pCanvas) {
2765         m_pCanvas->setView(NULL);
2766     m_pCanvas = NULL;
2767   }
2768   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2769   if (m_pFrame)
2770     m_pFrame->SetTitle(s);
2771
2772   SetFrame(NULL);
2773
2774   if (deleteWindow) {
2775     delete m_pFrame;
2776     m_pFrame = NULL;
2777     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2778       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2779   }
2780
2781   return true;
2782 }
2783
2784
2785
2786 // PlotFileCanvas
2787 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2788 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2789 {
2790   m_pView = v;
2791 }
2792
2793 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
2794 {
2795   m_pView = NULL;
2796 }
2797
2798 void
2799 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2800 {
2801   if (m_pView)
2802     m_pView->OnDraw(& dc);
2803 }
2804
2805
2806 // PlotFileView
2807
2808 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2809
2810 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2811 EVT_MENU(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2812 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2813 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2814 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2815 END_EVENT_TABLE()
2816
2817 PlotFileView::PlotFileView()
2818 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
2819 {
2820 }
2821
2822 PlotFileView::~PlotFileView()
2823 {
2824   if (m_pEZPlot)
2825     delete m_pEZPlot;
2826
2827   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2828 }
2829
2830 void
2831 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2832 {
2833   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2834   std::ostringstream os;
2835   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2836   rPlot.printHeadersBrief (os);
2837   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<<\n";
2838   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2839   dialogMsg.ShowModal();
2840 }
2841
2842
2843 void
2844 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2845 {
2846   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2847   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2848   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2849   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2850   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2851   if (iRetVal == wxID_OK) {
2852     m_bMinSpecified = true;
2853     m_bMaxSpecified = true;
2854     double dMin, dMax;
2855     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2856       m_dMinPixel = dMin;
2857       m_dMaxPixel = dMax;
2858       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2859       OnUpdate (this, NULL);
2860     }
2861   }
2862 }
2863
2864 void
2865 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2866 {
2867   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2868   double min;
2869   double max;
2870
2871   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2872     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2873       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2874       return;
2875     }
2876   }
2877
2878   if (m_bMinSpecified)
2879     min = m_dMinPixel;
2880   if (m_bMaxSpecified)
2881     max = m_dMaxPixel;
2882
2883   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2884   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2885   if (retVal == wxID_OK) {
2886     m_bMinSpecified = true;
2887     m_bMaxSpecified = true;
2888     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2889     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2890     OnUpdate (this, NULL);
2891   }
2892 }
2893
2894 void
2895 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2896 {
2897   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2898     m_bMinSpecified = false;
2899     m_bMaxSpecified = false;
2900     OnUpdate (this, NULL);
2901   }
2902 }
2903
2904
2905 PlotFileCanvas*
2906 PlotFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
2907 {
2908   PlotFileCanvas* pCanvas;
2909   int width, height;
2910   parent->GetClientSize(&width, &height);
2911
2912   pCanvas = new PlotFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2913
2914   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2915   pCanvas->Clear();
2916
2917   return pCanvas;
2918 }
2919
2920 #if CTSIM_MDI
2921 wxDocMDIChildFrame*
2922 #else
2923 wxDocChildFrame*
2924 #endif
2925 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2926 {
2927 #ifdef CTSIM_MDI
2928   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2929 #else
2930   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2931 #endif
2932   theApp->setIconForFrame (subframe);
2933
2934   m_pFileMenu = new wxMenu;
2935
2936   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2937   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2938   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2939   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2940   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2941   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2942
2943   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2944   m_pFileMenu->Append(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2945
2946   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2947   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2948   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2949   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2950 #ifdef CTSIM_MDI
2951   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2952   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2953   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2954 #endif
2955   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2956   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2957
2958   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2959   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2960   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2961   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2962
2963   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2964   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2965   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2966   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2967   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2968
2969   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2970
2971   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2972   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2973   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2974
2975   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2976   subframe->Centre(wxBOTH);
2977
2978   wxAcceleratorEntry accelEntries[4];
2979   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2980   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2981   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2982   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PLOTMENU_FILE_PROPERTIES);
2983   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
2984   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2985
2986   return subframe;
2987 }
2988
2989
2990 bool
2991 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2992 {
2993   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2994   SetFrame(m_pFrame);
2995
2996   m_bMinSpecified = false;
2997   m_bMaxSpecified = false;
2998   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2999
3000   int width, height;
3001   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
3002   m_pFrame->SetTitle ("Plot File");
3003   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
3004
3005 #ifdef __X__
3006   int x, y;  // X requires a forced resize
3007   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
3008   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
3009 #endif
3010
3011   m_pFrame->Show(true);
3012   Activate(true);
3013
3014   return true;
3015 }
3016
3017 void
3018 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
3019 {
3020   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3021   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
3022   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
3023
3024   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
3025     int xsize, ysize;
3026     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
3027     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
3028     SGP sgp (driver);
3029     if (m_pEZPlot)
3030       m_pEZPlot->plot (&sgp);
3031   }
3032 }
3033
3034
3035 void
3036 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3037 {
3038   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3039   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
3040   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
3041
3042   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
3043     if (m_pEZPlot)
3044       delete m_pEZPlot;
3045     m_pEZPlot = new EZPlot;
3046
3047     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
3048       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
3049
3050     if (m_bMinSpecified) {
3051       std::ostringstream os;
3052       os << "ymin " << m_dMinPixel;
3053       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3054     }
3055
3056     if (m_bMaxSpecified) {
3057       std::ostringstream os;
3058       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
3059       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3060     }
3061
3062     m_pEZPlot->ezset("box");
3063     m_pEZPlot->ezset("grid");
3064
3065     double* pdXaxis = new double [iNRecords];
3066     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
3067
3068     double* pdY = new double [iNRecords];
3069     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
3070       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
3071       m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
3072     }
3073
3074     delete pdXaxis;
3075     delete pdY;
3076   }
3077
3078   if (m_pCanvas)
3079     m_pCanvas->Refresh();
3080 }
3081
3082 bool
3083 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3084 {
3085   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3086   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3087     return false;
3088
3089   Activate(false);
3090   if (m_pCanvas) {
3091     m_pCanvas->setView (NULL);
3092     m_pCanvas = NULL;
3093   }
3094   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
3095   if (m_pFrame)
3096     m_pFrame->SetTitle(s);
3097
3098   SetFrame(NULL);
3099   if (deleteWindow) {
3100     delete m_pFrame;
3101     m_pFrame = NULL;
3102     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3103       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3104  }
3105
3106   return true;
3107 }
3108
3109
3110 ////////////////////////////////////////////////////////////////
3111
3112
3113 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
3114
3115 TextFileView::~TextFileView()
3116 {
3117   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
3118   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
3119 }
3120
3121 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3122 {
3123   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3124   SetFrame (m_pFrame);
3125
3126   int width, height;
3127   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
3128   m_pFrame->SetTitle("TextFile");
3129   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
3130   m_pFrame->SetTitle("Log");
3131
3132 #ifdef __X__
3133   // X seems to require a forced resize
3134   int x, y;
3135   frame->GetSize(&x, &y);
3136   frame->SetSize(-1, -1, x, y);
3137 #endif
3138
3139   m_pFrame->Show (true);
3140   Activate (true);
3141
3142   return true;
3143 }
3144
3145 // Handled by wxTextWindow
3146 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
3147 {
3148 }
3149
3150 void TextFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3151 {
3152 }
3153
3154 bool
3155 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3156 {
3157   if (! theApp->getMainFrame()->getShuttingDown())
3158     return false;
3159
3160   Activate(false);
3161   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3162   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3163     return false;
3164
3165   SetFrame(NULL);
3166   if (deleteWindow) {
3167     delete m_pFrame;
3168     m_pFrame = NULL;
3169     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3170       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3171   }
3172
3173   return TRUE;
3174 }
3175
3176 #if CTSIM_MDI
3177 wxDocMDIChildFrame*
3178 #else
3179 wxDocChildFrame*
3180 #endif
3181 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
3182 {
3183 #if CTSIM_MDI
3184   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0,0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3185 #else
3186   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3187 #endif
3188   theApp->setIconForFrame (subframe);
3189
3190  m_pFileMenu = new wxMenu;
3191
3192   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
3193   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
3194   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
3195   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
3196   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
3197   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
3198
3199   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3200   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
3201   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
3202   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
3203 #ifdef CTSIM_MDI
3204   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3205   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
3206   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
3207 #endif
3208   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3209   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3210
3211   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3212   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
3213   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
3214   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
3215   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
3216
3217   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3218
3219   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
3220   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
3221
3222   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3223   subframe->Centre(wxBOTH);
3224
3225   return subframe;
3226 }
3227
3228
3229 // Define a constructor for my text subwindow
3230 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
3231 : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
3232 {
3233 }
3234
3235 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3236 {
3237   m_pView = NULL;
3238 }