src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.62 2001/01/13 10:14:06 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
  29 #include "wx/wxprec.h"
  30
  31 #ifdef __BORLANDC__
  32 #pragma hdrstop
  33 #endif
  34
  35 #ifndef WX_PRECOMP
  36 #include "wx/wx.h"
  37 #endif
  38
  39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  41 #endif
  42
  43 #include "wx/image.h"
  44 #include "wx/progdlg.h"
  45
  46 #include "ct.h"
  47 #include "ctsim.h"
  48 #include "docs.h"
  49 #include "views.h"
  50 #include "dialogs.h"
  51 #include "dlgprojections.h"
  52 #include "dlgreconstruct.h"
  53 #include "backprojectors.h"
  54 #include "reconstruct.h"
  55 #include "timer.h"
  56
  57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  58 #include <sstream>
  59 #else
  60 #include <sstream_subst>
  61 #endif
  62
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 END_EVENT_TABLE()
  69
  70
  71 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  72 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
  73 {
  74   m_pView = v;
  75   m_xCursor = -1;
  76   m_yCursor = -1;
  77 }
  78
  79 void
  80 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  81 {
  82   if (m_pView)
  83     m_pView->OnDraw(& dc);
  84 }
  85
  86 void
  87 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  88 {
  89   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  90   int nx = rIF.nx();
  91   int ny = rIF.ny();
  92
  93   int yPt = ny - y - 1;
  94   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  95   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  96   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  97   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  98   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
  99 }
 100
 101 bool
 102 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 103 {
 104   x = m_xCursor;
 105   y = m_yCursor;
 106
 107   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 108     return true;
 109   else
 110     return false;
 111 }
 112
 113 void
 114 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 115 {
 116   if (! m_pView)
 117     return;
 118
 119   wxClientDC dc(this);
 120   PrepareDC(dc);
 121
 122   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 123
 124   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 125   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 126   int nx = rIF.nx();
 127   int ny = rIF.ny();
 128   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 129   if (event.RightIsDown()) {
 130     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 131       std::ostringstream os;
 132       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 133       if (rIF.isComplex()) {
 134         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 135         if (dImag < 0)
 136           os << " - " << -dImag;
 137         else
 138           os << " + " << dImag;
 139         os << "i\n";
 140       } else
 141         os << "\n";
 142       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 143     } else
 144       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 145   }
 146   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 147     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 148       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 149         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 150       }
 151       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 152       m_xCursor = pt.x;
 153       m_yCursor = yPt;
 154     } else
 155       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 156   }
 157   if (event.LeftUp()) {
 158     std::ostringstream os;
 159     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 160     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 161   }
 162 }
 163
 164 // ImageFileView
 165
 166 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 167
 168 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 169 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 170 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 171 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 172 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 173 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 174 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 175 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 176 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 177 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 178 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 179 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 180 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 181 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 182 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 183 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 184 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 185 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 186 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 187 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 188 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 189 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 190 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 191 #ifdef HAVE_FFT
 192 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 193 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 194 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 195 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 196 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 197 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 198 #endif
 199 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 200 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 201 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 202 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 203 #ifdef HAVE_FFT
 204 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 205 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 206 #endif
 207 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 208 END_EVENT_TABLE()
 209
 210 ImageFileView::ImageFileView(void)
 211 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 212 {
 213   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 214 }
 215
 216 ImageFileView::~ImageFileView(void)
 217 {
 218 }
 219
 220 void
 221 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 222 {
 223   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 224   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 225     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 226   else {
 227     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
 228     std::ostringstream os;
 229     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 230     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 231     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 232     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 233     os << "Data type: ";
 234     if (rIF.isComplex())
 235       os << "Complex\n";
 236     else
 237       os << "Real\n";
 238     os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 239     if (rIF.isComplex()) {
 240       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 241       os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 242     }
 243     if (rIF.nLabels() > 0) {
 244       os << "\n";
 245       rIF.printLabelsBrief (os);
 246     }
 247     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 248     wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 249     dialogMsg.ShowModal();
 250   }
 251 }
 252
 253 void
 254 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 255 {
 256   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 257   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 258   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 259   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 260   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 261   if (iRetVal == wxID_OK) {
 262     m_bMinSpecified = true;
 263     m_bMaxSpecified = true;
 264     double dMin, dMax;
 265     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 266       m_dMinPixel = dMin;
 267       m_dMaxPixel = dMax;
 268       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 269       OnUpdate (this, NULL);
 270     }
 271   }
 272 }
 273
 274 void
 275 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 276 {
 277   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 278   double min, max;
 279   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 280     rIF.getMinMax (min, max);
 281
 282   if (m_bMinSpecified)
 283     min = m_dMinPixel;
 284   if (m_bMaxSpecified)
 285     max = m_dMaxPixel;
 286
 287   DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 288   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 289   if (retVal == wxID_OK) {
 290     m_bMinSpecified = true;
 291     m_bMaxSpecified = true;
 292     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 293     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 294     OnUpdate (this, NULL);
 295   }
 296 }
 297
 298 void
 299 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 300 {
 301   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 302     m_bMinSpecified = false;
 303     m_bMaxSpecified = false;
 304     OnUpdate (this, NULL);
 305   }
 306 }
 307
 308 void
 309 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 310 {
 311   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 312   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 313
 314   if (vecIF.size() == 0) {
 315     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 316   } else {
 317     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(m_frame, "Get Comparison Image", vecIF, true);
 318
 319     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 320       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 321       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 322       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 323       std::ostringstream os;
 324       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 325       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 326       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 327       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 328       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 329       os << "\n";
 330       double d, r, e;
 331       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 332       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 333       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 334       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 335         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 336         if (! pDifferenceDoc) {
 337           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 338           return;
 339         }
 340         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();
 341
 342         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 343         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {
 344           pDifferenceDoc->DeleteAllViews();
 345           return;
 346         }
 347
 348         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 349         differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 350         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 351         differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 352         std::ostringstream osLabel;
 353         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 354           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 355           << os.str().c_str();
 356         differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());
 357         if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 358           pDifferenceDoc->Modify(true);
 359         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
 360         pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 361       }
 362       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 363     }
 364   }
 365 }
 366
 367 void
 368 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 369 {
 370   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 371   rIF.invertPixelValues (rIF);
 372   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 373   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 374     GetDocument()->Modify(TRUE);
 375   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 376 }
 377
 378 void
 379 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 380 {
 381   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 382   rIF.square (rIF);
 383   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 384   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 385     GetDocument()->Modify(TRUE);
 386   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 387 }
 388
 389 void
 390 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 391 {
 392   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 393   rIF.sqrt (rIF);
 394   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 395   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 396     GetDocument()->Modify(TRUE);
 397   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 398 }
 399
 400 void
 401 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 402 {
 403   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 404   rIF.log (rIF);
 405   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 406   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 407     GetDocument()->Modify(TRUE);
 408   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 409 }
 410
 411 void
 412 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 413 {
 414   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 415   rIF.exp (rIF);
 416   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 417   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 418     GetDocument()->Modify(TRUE);
 419   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 420 }
 421
 422 void
 423 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 424 {
 425   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 426   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 427
 428   if (vecIF.size() == 0) {
 429     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 430   } else {
 431     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Add", vecIF, false);
 432
 433     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 434       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 435       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 436       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 437       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 438         if (! pNewDoc) {
 439           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 440           return;
 441         }
 442       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 443       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 444       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 445       std::ostringstream os;
 446       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 447         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 448       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 449       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 450       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 451       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 452       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 453       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 454       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 455         pNewDoc->Modify(TRUE);
 456       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 457       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 458     }
 459   }
 460 }
 461
 462 void
 463 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 464 {
 465   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 466   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 467
 468   if (vecIF.size() == 0) {
 469     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 470   } else {
 471     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 472
 473     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 474       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 475       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 476       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 477       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 478         if (! pNewDoc) {
 479           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 480           return;
 481         }
 482       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 483       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 484       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 485       std::ostringstream os;
 486       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 487         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 488       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 489       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 490       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 491       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 492       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 493       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 494       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 495         pNewDoc->Modify(TRUE);
 496       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 497       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 498     }
 499   }
 500 }
 501
 502 void
 503 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 504 {
 505   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 506   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 507
 508   if (vecIF.size() == 0) {
 509     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 510   } else {
 511     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 512
 513     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 514       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 515       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 516       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 517       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 518         if (! pNewDoc) {
 519           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 520           return;
 521         }
 522       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 523       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 524       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 525       std::ostringstream os;
 526       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 527         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 528       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 529       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 530       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 531       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 532       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 533       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 534       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 535         pNewDoc->Modify(TRUE);
 536       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 537       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 538     }
 539   }
 540 }
 541
 542 void
 543 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 544 {
 545   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 546   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 547
 548   if (vecIF.size() == 0) {
 549     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 550   } else {
 551     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Divide", vecIF, false);
 552
 553     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 554       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 555       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 556       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 557       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 558         if (! pNewDoc) {
 559           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 560           return;
 561         }
 562       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 563       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 564       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 565       std::ostringstream os;
 566       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 567         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 568       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 569       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 570       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 571       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 572       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 573       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 574       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 575         pNewDoc->Modify(TRUE);
 576       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 577       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 578     }
 579   }
 580 }
 581
 582
 583 #ifdef HAVE_FFT
 584 void
 585 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 586 {
 587   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 588   rIF.fft (rIF);
 589   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 590   m_bMinSpecified = false;
 591   m_bMaxSpecified = false;
 592   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 593     GetDocument()->Modify(TRUE);
 594   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 595 }
 596
 597 void
 598 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 599 {
 600   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 601   rIF.ifft (rIF);
 602   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 603   m_bMinSpecified = false;
 604   m_bMaxSpecified = false;
 605   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 606     GetDocument()->Modify(TRUE);
 607   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 608 }
 609
 610 void
 611 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 612 {
 613   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 614   rIF.fftRows (rIF);
 615   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 616   m_bMinSpecified = false;
 617   m_bMaxSpecified = false;
 618   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 619     GetDocument()->Modify(TRUE);
 620   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 621 }
 622
 623 void
 624 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 625 {
 626   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 627   rIF.ifftRows (rIF);
 628   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 629   m_bMinSpecified = false;
 630   m_bMaxSpecified = false;
 631   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 632     GetDocument()->Modify(TRUE);
 633   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 634 }
 635
 636 void
 637 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 638 {
 639   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 640   rIF.fftCols (rIF);
 641   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 642   m_bMinSpecified = false;
 643   m_bMaxSpecified = false;
 644   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 645     GetDocument()->Modify(TRUE);
 646   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 647 }
 648
 649 void
 650 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 651 {
 652   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 653   rIF.ifftCols (rIF);
 654   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 655   m_bMinSpecified = false;
 656   m_bMaxSpecified = false;
 657   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 658     GetDocument()->Modify(TRUE);
 659   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 660 }
 661 #endif
 662
 663 void
 664 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 665 {
 666   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 667   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
 668   rIF.fourier (rIF);
 669   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 670   m_bMinSpecified = false;
 671   m_bMaxSpecified = false;
 672   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 673     GetDocument()->Modify(TRUE);
 674   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 675 }
 676
 677 void
 678 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 679 {
 680   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 681   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
 682   rIF.inverseFourier (rIF);
 683   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 684   m_bMinSpecified = false;
 685   m_bMaxSpecified = false;
 686   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 687     GetDocument()->Modify(TRUE);
 688   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 689 }
 690
 691 void
 692 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 693 {
 694   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 695   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 696   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 697   m_bMinSpecified = false;
 698   m_bMaxSpecified = false;
 699   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 700     GetDocument()->Modify(TRUE);
 701   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 702 }
 703
 704 void
 705 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 706 {
 707   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 708   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 709   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 710   m_bMinSpecified = false;
 711   m_bMaxSpecified = false;
 712   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 713     GetDocument()->Modify(TRUE);
 714   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 715 }
 716
 717 void
 718 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 719 {
 720   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 721   if (rIF.isComplex()) {
 722     rIF.magnitude (rIF);
 723     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 724   m_bMinSpecified = false;
 725   m_bMaxSpecified = false;
 726   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 727     GetDocument()->Modify(TRUE);
 728   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 729   }
 730 }
 731
 732 void
 733 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 734 {
 735   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 736   if (rIF.isComplex()) {
 737     rIF.phase (rIF);
 738     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 739   m_bMinSpecified = false;
 740   m_bMaxSpecified = false;
 741   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 742     GetDocument()->Modify(TRUE);
 743   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 744   }
 745 }
 746
 747
 748 ImageFileCanvas*
 749 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 750 {
 751   ImageFileCanvas* pCanvas;
 752   int width, height;
 753   parent->GetClientSize(&width, &height);
 754
 755   pCanvas = new ImageFileCanvas (dynamic_cast<ImageFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 756
 757   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 758   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 759   pCanvas->Clear();
 760
 761   return pCanvas;
 762 }
 763
 764 wxFrame*
 765 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 766 {
 767 #if CTSIM_MDI
 768   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame(theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 769 #else
 770   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 771 #endif
 772   theApp->setIconForFrame (subframe);
 773
 774   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
 775
 776   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
 777   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
 778   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
 779   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
 780   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 781   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
 782
 783   file_menu->AppendSeparator();
 784   file_menu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
 785   file_menu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 786
 787   file_menu->AppendSeparator();
 788   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 789   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 790   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
 791
 792   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 793   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
 794   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
 795   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale");
 796
 797   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 798   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 799   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 800   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 801   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 802   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 803   filter_menu->AppendSeparator();
 804 #ifdef HAVE_FFT
 805   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2D &FFT");
 806   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2D &IFFT");
 807   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 808   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 809   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 810   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 811   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");
 812   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");
 813 #else
 814   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 815   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 816 #endif
 817   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 818   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 819   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 820   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 821
 822   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 823   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 824   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 825   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 826   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 827   image_menu->AppendSeparator();
 828   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 829
 830   wxMenu *analyze_menu = new wxMenu;
 831   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 832   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 833   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 834   analyze_menu->AppendSeparator();
 835   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
 836   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
 837   analyze_menu->AppendSeparator();
 838   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 839   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
 840   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
 841
 842   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 843   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 844
 845   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 846
 847   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
 848   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 849   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 850   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 851   menu_bar->Append(analyze_menu, "&Analyze");
 852   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 853
 854   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 855
 856   subframe->Centre(wxBOTH);
 857
 858   return subframe;
 859 }
 860
 861
 862 bool
 863 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 864 {
 865   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
 866   SetFrame (m_frame);
 867
 868   m_bMinSpecified = false;
 869   m_bMaxSpecified = false;
 870   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 871
 872   int width, height;
 873   m_frame->GetClientSize (&width, &height);
 874   m_frame->SetTitle("ImageFileView");
 875   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
 876
 877   int x, y;  // X requires a forced resize
 878   m_frame->GetSize(&x, &y);
 879   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
 880   m_frame->SetFocus();
 881   m_frame->Show(true);
 882   Activate(true);
 883
 884   return true;
 885 }
 886
 887 void
 888 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 889 {
 890   if (m_bitmap.Ok())
 891     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 892
 893   int xCursor, yCursor;
 894   if (m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 895     m_canvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 896 }
 897
 898
 899 void
 900 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 901 {
 902   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
 903   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 904   int nx = rIF.nx();
 905   int ny = rIF.ny();
 906   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 907     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 908       double min, max;
 909       rIF.getMinMax (min, max);
 910       if (! m_bMinSpecified)
 911         m_dMinPixel = min;
 912       if (! m_bMaxSpecified)
 913         m_dMaxPixel = max;
 914     }
 915     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
 916
 917     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
 918     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
 919       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
 920         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
 921         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
 922         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
 923         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
 924         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
 925       }
 926     }
 927     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
 928     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
 929     delete imageData;
 930     int xSize = nx;
 931     int ySize = ny;
 932     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
 933     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
 934     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
 935     m_canvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
 936     m_canvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 937   }
 938
 939   if (m_canvas)
 940     m_canvas->Refresh();
 941 }
 942
 943 bool
 944 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
 945 {
 946   if (!GetDocument()->Close())
 947     return false;
 948
 949   // m_canvas->Clear();
 950   m_canvas->m_pView = NULL;
 951   m_canvas = NULL;
 952   wxString s(theApp->GetAppName());
 953   if (m_frame)
 954     m_frame->SetTitle(s);
 955   SetFrame(NULL);
 956
 957   Activate(false);
 958
 959   if (deleteWindow) {
 960     delete m_frame;
 961     return true;
 962   }
 963   return true;
 964 }
 965
 966 void
 967 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
 968 {
 969   ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
 970   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 971   int nx = rIF.nx();
 972   int ny = rIF.ny();
 973   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 974     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 975       double min, max;
 976       rIF.getMinMax (min, max);
 977       if (! m_bMinSpecified)
 978         m_dMinPixel = min;
 979       if (! m_bMaxSpecified)
 980         m_dMaxPixel = max;
 981     }
 982
 983     DialogExportParameters dialogExport (m_frame, m_iDefaultExportFormatID);
 984     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
 985       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
 986       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
 987
 988       wxString strExt;
 989       wxString strWildcard;
 990       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
 991         strExt = ".pgm";
 992         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
 993       }
 994 #ifdef HAVE_PNG
 995       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
 996         strExt = ".png";
 997         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
 998       }
 999 #endif
1000
1001       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1002         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1003       if (strFilename) {
1004         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1005         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1006       }
1007     }
1008   }
1009 }
1010
1011 void
1012 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1013 {
1014   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1015   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1016   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1017
1018   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (m_frame, "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1019   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1020     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1021     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1022     std::ostringstream os;
1023     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1024     ImageFileDocument* pScaledDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1025     if (! pScaledDoc) {
1026       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1027       return;
1028     }
1029     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1030     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1031     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1032     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1033     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1034     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1035     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1036       pScaledDoc->Modify(TRUE);
1037     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1038     pScaledDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
1039   }
1040 }
1041
1042 void
1043 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1044 {
1045   int xCursor, yCursor;
1046   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1047     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1048     return;
1049   }
1050
1051   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1052   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1053   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1054   int nx = rIF.nx();
1055   int ny = rIF.ny();
1056
1057   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1058     double* pX = new double [nx];
1059     double* pYReal = new double [nx];
1060     double *pYImag = NULL;
1061     double *pYMag = NULL;
1062     if (rIF.isComplex()) {
1063       pYImag = new double [nx];
1064       pYMag = new double [nx];
1065     }
1066     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1067       pX[i] = i;
1068       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1069       if (rIF.isComplex()) {
1070         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1071         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1072       }
1073     }
1074     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1075     if (! pPlotDoc) {
1076       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1077     } else {
1078       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1079       std::ostringstream os;
1080       os << "Row " << yCursor;
1081       std::string title("title ");
1082       title += os.str();
1083       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1084       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1085       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1086       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1087       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1088       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1089       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1090       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1091       if (rIF.isComplex()) {
1092         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1093         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1094         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1095         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1096         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1097         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1098         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1099         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1100       } else
1101         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1102       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1103       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1104       if (rIF.isComplex()) {
1105         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1106         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1107       }
1108       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1109         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1110       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1111       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1112       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1113     }
1114     delete pX;
1115     delete pYReal;
1116     if (rIF.isComplex()) {
1117       delete pYImag;
1118       delete pYMag;
1119     }
1120     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1121       pPlotDoc->Modify(true);
1122     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1123   }
1124 }
1125
1126 void
1127 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1128 {
1129   int xCursor, yCursor;
1130   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1131     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1132     return;
1133   }
1134
1135   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1136   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1137   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1138   int nx = rIF.nx();
1139   int ny = rIF.ny();
1140
1141   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1142     double* pX = new double [ny];
1143     double* pYReal = new double [ny];
1144     double* pYImag = NULL;
1145     double* pYMag = NULL;
1146     if (rIF.isComplex()) {
1147       pYImag = new double [ny];
1148       pYMag = new double [ny];
1149     }
1150     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1151       pX[i] = i;
1152       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1153       if (rIF.isComplex()) {
1154         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1155         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1156       }
1157     }
1158     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1159     if (! pPlotDoc) {
1160       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1161     } else {
1162       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1163       std::ostringstream os;
1164       os << "Column " << xCursor;
1165       std::string title("title ");
1166       title += os.str();
1167       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1168       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1169       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1170       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1171       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1172       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1173       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1174       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1175       if (rIF.isComplex()) {
1176         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1177         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1178         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1179         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1180         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1181         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1182         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1183         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1184       } else
1185         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1186       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1187       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1188       if (rIF.isComplex()) {
1189         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1190         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1191       }
1192       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1193         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1194       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1195       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1196       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1197     }
1198     delete pX;
1199     delete pYReal;
1200     if (rIF.isComplex()) {
1201       delete pYImag;
1202       delete pYMag;
1203     }
1204     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1205       pPlotDoc->Modify(true);
1206     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1207   }
1208 }
1209
1210 #ifdef HAVE_FFT
1211 void
1212 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1213 {
1214   int xCursor, yCursor;
1215   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1216     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1217     return;
1218   }
1219
1220   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1221   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1222   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1223   int nx = rIF.nx();
1224   int ny = rIF.ny();
1225
1226   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1227     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1228
1229     int i;
1230     for (i = 0; i < nx; i++) {
1231       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1232       if (rIF.isComplex())
1233         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1234       else
1235         pcIn[i].im = 0;
1236     }
1237
1238     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1239     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1240     fftw_destroy_plan (plan);
1241
1242     double* pX = new double [nx];
1243     double* pYReal = new double [nx];
1244     double* pYImag = new double [nx];
1245     double* pYMag = new double [nx];
1246     for (i = 0; i < nx; i++) {
1247       pX[i] = i;
1248       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1249       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1250       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1251     }
1252     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1253     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1254     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1255
1256     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1257     if (! pPlotDoc) {
1258       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1259     } else {
1260       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1261       std::ostringstream os;
1262       os << "Row " << yCursor;
1263       std::string title("title ");
1264       title += os.str();
1265       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1266       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1267       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1268       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1269       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1270       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1271        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1272         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1273         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1274         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1275         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1276         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1277         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1278        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1279       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1280       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1281       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1282       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1283       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1284       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1285       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1286         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1287       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1288       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1289       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1290     }
1291     delete pX;
1292     delete pYReal;
1293     delete pYImag;
1294     delete pYMag;
1295     delete [] pcIn;
1296
1297     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1298       pPlotDoc->Modify(true);
1299     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1300   }
1301 }
1302
1303 void
1304 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1305 {
1306   int xCursor, yCursor;
1307   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1308     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1309     return;
1310   }
1311
1312   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1313   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1314   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1315   int nx = rIF.nx();
1316   int ny = rIF.ny();
1317
1318   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1319     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1320     double *pdTemp = new double [ny];
1321
1322     int i;
1323     for (i = 0; i < ny; i++)
1324       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1325     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1326     for (i = 0; i < ny; i++)
1327       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1328
1329     for (i = 0; i < ny; i++) {
1330       if (rIF.isComplex())
1331         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1332       else
1333       pdTemp[i] = 0;
1334     }
1335     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1336     for (i = 0; i < ny; i++)
1337       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1338
1339     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1340     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1341     fftw_destroy_plan (plan);
1342
1343     double* pX = new double [ny];
1344     double* pYReal = new double [ny];
1345     double* pYImag = new double [ny];
1346     double* pYMag = new double [ny];
1347     for (i = 0; i < ny; i++) {
1348       pX[i] = i;
1349       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1350       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1351       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1352     }
1353
1354     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1355     if (! pPlotDoc) {
1356       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1357     } else {
1358       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1359       std::ostringstream os;
1360       os << "Column " << xCursor;
1361       std::string title("title ");
1362       title += os.str();
1363       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1364       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1365       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1366       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1367       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1368       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1369        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1370         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1371         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1372         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1373         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1374         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1375         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1376        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1377       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1378       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1379       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1380       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1381       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1382       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1383       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1384         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1385       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1386       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1387       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1388     }
1389     delete pX;
1390     delete pYReal;
1391     delete pYImag;
1392     delete pYMag;
1393     delete pdTemp;
1394     delete [] pcIn;
1395
1396     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1397       pPlotDoc->Modify(true);
1398     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1399   }
1400 }
1401 #endif
1402
1403 void
1404 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1405 {
1406   int xCursor, yCursor;
1407   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1408     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1409     return;
1410   }
1411
1412   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1413   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1414   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1415     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1416     return;
1417   }
1418   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1419
1420   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1421     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1422     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1423     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1424
1425     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1426     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1427     int nx = rIF.nx();
1428     int ny = rIF.ny();
1429
1430     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1431       double* pX = new double [ny];
1432       double* pY1 = new double [ny];
1433       double* pY2 = new double [ny];
1434       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1435         pX[i] = i;
1436         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1437         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1438       }
1439       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1440       if (! pPlotDoc) {
1441         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1442       } else {
1443         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1444         std::ostringstream os;
1445         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1446         std::string title("title ");
1447         title += os.str();
1448         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1449         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1450         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1451         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1452         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1453         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1454         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1455         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1456         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1457         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1458         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1459         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1460         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1461         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1462         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1463
1464         unsigned int iL;
1465         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1466           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1467           s += ": ";
1468           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1469           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1470         }
1471         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1472           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1473           s += ": ";
1474           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1475           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1476         }
1477         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1478           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1479         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1480         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1481       }
1482       delete pX;
1483       delete pY1;
1484       delete pY2;
1485       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1486         pPlotDoc->Modify(true);
1487       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1488     }
1489   }
1490 }
1491
1492 void
1493 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1494 {
1495   int xCursor, yCursor;
1496   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1497     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1498     return;
1499   }
1500
1501   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1502   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1503
1504   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1505     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1506     return;
1507   }
1508
1509   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1510
1511   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1512     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1513     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1514     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1515
1516     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1517     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1518     int nx = rIF.nx();
1519     int ny = rIF.ny();
1520
1521     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1522       double* pX = new double [nx];
1523       double* pY1 = new double [nx];
1524       double* pY2 = new double [nx];
1525       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1526         pX[i] = i;
1527         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1528         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1529       }
1530       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1531       if (! pPlotDoc) {
1532         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1533       } else {
1534         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1535         std::ostringstream os;
1536         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1537         std::string title("title ");
1538         title += os.str();
1539         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1540         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1541         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1542         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1543         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1544         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1545         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1546         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1547         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1548         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1549         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1550         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1551         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1552         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1553         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1554         unsigned int iL;
1555         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1556           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1557           s += ": ";
1558           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1559           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1560         }
1561         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1562           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1563           s += ": ";
1564           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1565           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1566         }
1567         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1568           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1569         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1570         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1571       }
1572       delete pX;
1573       delete pY1;
1574       delete pY2;
1575       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1576         pPlotDoc->Modify(true);
1577       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1578     }
1579   }
1580 }
1581
1582 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1583
1584 void
1585 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1586 {
1587   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1588   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1589   int nx = rIF.nx();
1590   int ny = rIF.ny();
1591
1592   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1593     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1594     if (! pPlotDoc) {
1595       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1596       return;
1597     }
1598
1599     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1600     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1601     double dMin, dMax;
1602     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1603     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1604
1605     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1606       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1607       pY[i] = 0;
1608     }
1609     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1610       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1611         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1612         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1613           pY[iBin] += 1;
1614       }
1615
1616     PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1617     std::ostringstream os;
1618     os << "Histogram";
1619     std::string title("title ");
1620     title += os.str();
1621     rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1622     rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1623     rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1624     rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1625     rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1626     rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1627     rPlotFile.addColumn (0, pX);
1628     rPlotFile.addColumn (1, pY);
1629     for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1630       std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1631       s += ": ";
1632       s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1633       rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1634     }
1635     os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1636     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1637     rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1638     delete pX;
1639     delete pY;
1640     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1641       pPlotDoc->Modify(true);
1642     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1643   }
1644 }
1645
1646
1647 // PhantomCanvas
1648
1649 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1650 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1651 {
1652   m_pView = v;
1653 }
1654
1655 void
1656 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1657 {
1658   if (m_pView)
1659     m_pView->OnDraw(& dc);
1660 }
1661
1662
1663 // PhantomView
1664
1665 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomView, wxView)
1666
1667 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomView, wxView)
1668 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomView::OnProperties)
1669 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomView::OnRasterize)
1670 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomView::OnProjections)
1671 END_EVENT_TABLE()
1672
1673 PhantomView::PhantomView(void)
1674 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
1675 {
1676   m_iDefaultNDet = 367;
1677   m_iDefaultNView = 320;
1678   m_iDefaultNSample = 2;
1679   m_dDefaultRotation = 1;
1680   m_dDefaultFocalLength = 2;
1681   m_dDefaultFieldOfView = 1;
1682   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1683   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1684
1685   m_iDefaultRasterNX = 256;
1686   m_iDefaultRasterNY = 256;
1687   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1688 }
1689
1690 PhantomView::~PhantomView(void)
1691 {
1692 }
1693
1694 void
1695 PhantomView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1696 {
1697   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1698   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1699   std::ostringstream os;
1700   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1701   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1702   rPhantom.printDefinitions (os);
1703 #if DEBUG
1704   rPhantom.print (os);
1705 #endif
1706   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1707   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1708 }
1709
1710
1711 void
1712 PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1713 {
1714   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (m_frame, m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView, m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
1715   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1716   if (retVal == wxID_OK) {
1717     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1718     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1719     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1720     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1721     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1722     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1723     m_dDefaultFieldOfView = dialogProjection.getFieldOfViewRatio();
1724     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1725     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1726
1727     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1728       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1729       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = dynamic_cast<ProjectionFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.pj", wxDOC_SILENT));
1730       if (! pProjectionDoc) {
1731         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1732         return;
1733       }
1734       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
1735       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
1736       if (theScanner.fail()) {
1737         *theApp->getLog() << "Failed making scanner: " << theScanner.failMessage().c_str() << "\n";
1738         return;
1739       }
1740       rProj.initFromScanner (theScanner);
1741       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
1742
1743       Timer timer;
1744       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1745         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(m_frame));
1746         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1747           ::wxYield();
1748           ::wxYield();
1749           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1750             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1751             return;
1752           }
1753           ::wxYield();
1754           ::wxYield();
1755           while (dialogProjections.isPaused()) {
1756             ::wxYield();
1757             ::wxUsleep(50);
1758           }
1759         }
1760       } else {
1761         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
1762         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
1763           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1764           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1765             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1766             return;
1767           }
1768         }
1769       }
1770
1771       std::ostringstream os;
1772       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
1773       rProj.setCalcTime (timer.timerEnd());
1774       rProj.setRemark (os.str());
1775       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1776
1777       m_frame->Lower();
1778       ::wxYield();
1779       ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());
1780       if (projView) {
1781         projView->getFrame()->SetFocus();
1782         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1783       }
1784       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
1785         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
1786           pFrame->SetFocus();
1787           pFrame->Raise();
1788         }
1789         theApp->getDocManager()->ActivateView (pView, true, false);
1790       }
1791       ::wxYield();
1792       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1793         pProjectionDoc->Modify(true);
1794       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
1795     }
1796   }
1797 }
1798
1799
1800 void
1801 PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1802 {
1803   DialogGetRasterParameters dialogRaster (m_frame, m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY, m_iDefaultRasterNSamples);
1804   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1805   if (retVal == wxID_OK) {
1806     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1807     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1808     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1809     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1810       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1811     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1812       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1813       ImageFileDocument* pRasterDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1814       if (! pRasterDoc) {
1815         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1816         return;
1817       }
1818       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
1819
1820       imageFile.setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNX);
1821       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
1822       Timer timer;
1823       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
1824         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1825         if (! dlgProgress.Update(i+1)) {
1826           pRasterDoc->DeleteAllViews();
1827           return;
1828         }
1829       }
1830       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1831         pRasterDoc->Modify(true);
1832       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
1833       std::ostringstream os;
1834       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
1835         << m_iDefaultRasterNY << ", nSamples=" << m_iDefaultRasterNSamples;
1836       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1837       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
1838       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());
1839       if (rasterView) {
1840         rasterView->getFrame()->SetFocus();
1841         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
1842       }
1843
1844     }
1845   }
1846 }
1847
1848
1849 PhantomCanvas*
1850 PhantomView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1851 {
1852   PhantomCanvas* pCanvas;
1853   int width, height;
1854   parent->GetClientSize(&width, &height);
1855
1856   pCanvas = new PhantomCanvas (dynamic_cast<PhantomView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1857
1858   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1859   pCanvas->Clear();
1860
1861   return pCanvas;
1862 }
1863
1864 wxFrame*
1865 PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1866 {
1867 #if CTSIM_MDI
1868   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame(theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1869 #else
1870   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1871 #endif
1872   theApp->setIconForFrame (subframe);
1873
1874   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
1875
1876   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
1877   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
1878   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
1879   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1880   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1881
1882   file_menu->AppendSeparator();
1883   file_menu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1884
1885   file_menu->AppendSeparator();
1886   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1887   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1888   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1889
1890   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
1891   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...");
1892   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...");
1893
1894   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1895   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
1896   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1897
1898   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1899
1900   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
1901   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
1902   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1903
1904   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1905
1906   subframe->Centre(wxBOTH);
1907
1908   return subframe;
1909 }
1910
1911
1912 bool
1913 PhantomView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1914 {
1915   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
1916   SetFrame(m_frame);
1917
1918   int width, height;
1919   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
1920   m_frame->SetTitle("PhantomView");
1921   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
1922
1923 #ifdef __X__
1924   int x, y;  // X requires a forced resize
1925   m_frame->GetSize(&x, &y);
1926   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
1927 #endif
1928
1929   m_frame->Show(true);
1930   Activate(true);
1931
1932   return true;
1933 }
1934
1935
1936 void
1937 PhantomView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
1938 {
1939   if (m_canvas)
1940     m_canvas->Refresh();
1941 }
1942
1943 bool
1944 PhantomView::OnClose (bool deleteWindow)
1945 {
1946   if (!GetDocument()->Close())
1947     return false;
1948
1949 //  m_canvas->Clear();
1950   m_canvas->m_pView = NULL;
1951   m_canvas = NULL;
1952 //  wxString s(wxTheApp->GetAppName());
1953 //  if (m_frame)
1954 //    m_frame->SetTitle(s);
1955   SetFrame(NULL);
1956
1957   Activate(false);
1958
1959   if (deleteWindow) {
1960
1961     delete m_frame;
1962     return true;
1963   }
1964   return true;
1965 }
1966
1967 void
1968 PhantomView::OnDraw (wxDC* dc)
1969 {
1970   int xsize, ysize;
1971   m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
1972   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
1973   SGP sgp (driver);
1974   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1975   sgp.setColor (C_RED);
1976   rPhantom.show (sgp);
1977 }
1978
1979 // ProjectionCanvas
1980
1981 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1982 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1983 {
1984   m_pView = v;
1985 }
1986
1987 void
1988 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
1989 {
1990   if (m_pView)
1991     m_pView->OnDraw(& dc);
1992 }
1993
1994 // ProjectionFileView
1995
1996 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
1997
1998 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
1999 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2000 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2001 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2002 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2003 END_EVENT_TABLE()
2004
2005 ProjectionFileView::ProjectionFileView(void)
2006 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
2007 {
2008   m_iDefaultNX = 256;
2009   m_iDefaultNY = 256;
2010   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2011   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2012 #if HAVE_FFTW
2013   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2014   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2015 #else
2016   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2017   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2018 #endif
2019   m_iDefaultZeropad = 1;
2020   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF3;
2021   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2022   m_iDefaultInterpParam = 1;
2023   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2024
2025   m_iDefaultPolarNX = 256;
2026   m_iDefaultPolarNY = 256;
2027   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2028   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2029 }
2030
2031 ProjectionFileView::~ProjectionFileView(void)
2032 {
2033 }
2034
2035 void
2036 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2037 {
2038   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2039   std::ostringstream os;
2040   rProj.printScanInfo(os);
2041   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2042   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2043   dialogMsg.ShowModal();
2044 }
2045
2046
2047 void
2048 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2049 {
2050   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2051   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (m_frame, "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2052     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2053   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2054     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2055     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2056     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2057     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2058     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2059     if (! pPolarDoc) {
2060       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2061       return;
2062     }
2063     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2064     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2065     rProj.convertPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation);
2066     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2067     std::ostringstream os;
2068     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2069       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2070       << strInterpolation.c_str();
2071     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2072     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2073     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2074       pPolarDoc->Modify(true);
2075     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2076     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
2077   }
2078 }
2079
2080 void
2081 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2082 {
2083   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2084   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (m_frame, "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2085     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2086   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2087     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2088     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2089     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2090     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2091     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2092     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2093     if (! pPolarDoc) {
2094       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2095       return;
2096     }
2097     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2098     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2099     rProj.convertFFTPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2100     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2101     std::ostringstream os;
2102     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2103       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2104       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2105     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2106     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2107     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2108       pPolarDoc->Modify(true);
2109     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2110     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
2111   }}
2112
2113 void
2114 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2115 {
2116   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2117 }
2118
2119 void
2120 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2121 {
2122   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (m_frame, m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration, m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector, m_iDefaultTrace);
2123
2124   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2125   if (retVal == wxID_OK) {
2126     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2127     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2128     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2129     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2130     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2131     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2132     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2133     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2134     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2135     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2136     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2137     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2138     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2139     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2140     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2141     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2142     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2143       ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2144       if (! pReconDoc) {
2145         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2146         return;
2147       }
2148       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
2149       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2150       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2151
2152       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2153
2154       Timer timerRecon;
2155       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2156         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, m_frame);
2157         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2158           ::wxYield();
2159           ::wxYield();
2160           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView)) {
2161             delete pDlgReconstruct;
2162             delete pReconstruct;
2163             pReconDoc->DeleteAllViews();
2164             return;
2165           }
2166           ::wxYield();
2167           ::wxYield();
2168           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2169             ::wxYield();
2170             ::wxUsleep(50);
2171           }
2172         }
2173         delete pDlgReconstruct;
2174       } else {
2175         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
2176         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
2177           pReconstruct->reconstructView (i, 1);
2178           if (! dlgProgress.Update(i + 1)) {
2179             delete pReconstruct;
2180             pReconDoc->DeleteAllViews();
2181             return;
2182           }
2183         }
2184       }
2185       delete pReconstruct;
2186       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2187         pReconDoc->Modify(true);
2188       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
2189       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());
2190       if (rasterView) {
2191         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2192         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2193       }
2194       std::ostringstream os;
2195       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2196       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2197       imageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
2198       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2199     }
2200   }
2201 }
2202
2203
2204 ProjectionFileCanvas*
2205 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2206 {
2207   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2208   int width, height;
2209   parent->GetClientSize(&width, &height);
2210
2211   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (dynamic_cast<ProjectionFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2212
2213   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2214   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2215   pCanvas->Clear();
2216
2217   return pCanvas;
2218 }
2219
2220 wxFrame*
2221 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2222 {
2223 #ifdef CTSIM_MDI
2224   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame (theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2225 #else
2226   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2227 #endif
2228   theApp->setIconForFrame (subframe);
2229
2230   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
2231
2232   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
2233   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
2234   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
2235   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
2236   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2237   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2238
2239   file_menu->AppendSeparator();
2240   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2241
2242   file_menu->AppendSeparator();
2243   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2244   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2245   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2246
2247   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2248   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...");
2249   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...");
2250
2251   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2252   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...");
2253   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...");
2254
2255   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2256   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
2257   help_menu->AppendSeparator();
2258   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2259
2260   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2261
2262   menu_bar->Append (file_menu, "&File");
2263   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2264   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2265   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2266
2267   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2268
2269   subframe->Centre(wxBOTH);
2270
2271   return subframe;
2272 }
2273
2274
2275 bool
2276 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2277 {
2278   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2279   SetFrame(m_frame);
2280
2281   int width, height;
2282   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2283   m_frame->SetTitle("ProjectionFileView");
2284   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
2285
2286 #ifdef __X__
2287   int x, y;  // X requires a forced resize
2288   m_frame->GetSize(&x, &y);
2289   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2290 #endif
2291
2292   m_frame->Show(true);
2293   Activate(true);
2294
2295   return true;
2296 }
2297
2298 void
2299 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2300 {
2301   if (m_bitmap.Ok())
2302     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2303 }
2304
2305
2306 void
2307 ProjectionFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2308 {
2309   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2310   const int nDet = rProj.nDet();
2311   const int nView = rProj.nView();
2312   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2313     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2314     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2315     double min = detval[0];
2316     double max = detval[0];
2317     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2318       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2319       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2320       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2321         if (min > detval[ix])
2322           min = detval[ix];
2323         else if (max < detval[ix])
2324           max = detval[ix];
2325       }
2326     }
2327
2328     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2329     double scale = (max - min) / 255;
2330     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2331       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2332       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2333       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2334         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2335         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2336         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2337         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2338       }
2339     }
2340     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2341     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2342     delete imageData;
2343     int xSize = nDet;
2344     int ySize = nView;
2345     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2346     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2347     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
2348     m_canvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2349   }
2350
2351   if (m_canvas)
2352     m_canvas->Refresh();
2353 }
2354
2355 bool
2356 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2357 {
2358   if (!GetDocument()->Close())
2359     return false;
2360
2361   // m_canvas->Clear();
2362   m_canvas->m_pView = NULL;
2363   m_canvas = NULL;
2364   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2365   if (m_frame)
2366     m_frame->SetTitle(s);
2367   SetFrame(NULL);
2368
2369   Activate(false);
2370
2371   if (deleteWindow) {
2372     delete m_frame;
2373     return true;
2374   }
2375   return true;
2376 }
2377
2378
2379
2380 // PlotFileCanvas
2381 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2382 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2383 {
2384   m_pView = v;
2385 }
2386
2387 void
2388 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2389 {
2390   if (m_pView)
2391     m_pView->OnDraw(& dc);
2392 }
2393
2394
2395 // PlotFileView
2396
2397 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2398
2399 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2400 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2401 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2402 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2403 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2404 END_EVENT_TABLE()
2405
2406 PlotFileView::PlotFileView(void)
2407 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_pEZPlot(NULL)
2408 {
2409   m_bMinSpecified = false;
2410   m_bMaxSpecified = false;
2411 }
2412
2413 PlotFileView::~PlotFileView(void)
2414 {
2415   if (m_pEZPlot)
2416     delete m_pEZPlot;
2417 }
2418
2419 void
2420 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2421 {
2422   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2423   std::ostringstream os;
2424   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2425   rPlot.printHeadersBrief (os);
2426   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2427   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2428   dialogMsg.ShowModal();
2429 }
2430
2431
2432 void
2433 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2434 {
2435   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2436   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2437   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2438   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2439   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2440   if (iRetVal == wxID_OK) {
2441     m_bMinSpecified = true;
2442     m_bMaxSpecified = true;
2443     double dMin, dMax;
2444     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2445       m_dMinPixel = dMin;
2446       m_dMaxPixel = dMax;
2447       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2448       OnUpdate (this, NULL);
2449     }
2450   }
2451 }
2452
2453 void
2454 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2455 {
2456   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2457   double min;
2458   double max;
2459
2460   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2461     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2462       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2463       return;
2464     }
2465   }
2466
2467   if (m_bMinSpecified)
2468     min = m_dMinPixel;
2469   if (m_bMaxSpecified)
2470     max = m_dMaxPixel;
2471
2472   DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2473   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2474   if (retVal == wxID_OK) {
2475     m_bMinSpecified = true;
2476     m_bMaxSpecified = true;
2477     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2478     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2479     OnUpdate (this, NULL);
2480   }
2481 }
2482
2483 void
2484 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2485 {
2486   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2487     m_bMinSpecified = false;
2488     m_bMaxSpecified = false;
2489     OnUpdate (this, NULL);
2490   }
2491 }
2492
2493
2494 PlotFileCanvas*
2495 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2496 {
2497   PlotFileCanvas* pCanvas;
2498   int width, height;
2499   parent->GetClientSize(&width, &height);
2500
2501   pCanvas = new PlotFileCanvas (dynamic_cast<PlotFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2502
2503   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2504   pCanvas->Clear();
2505
2506   return pCanvas;
2507 }
2508
2509 wxFrame*
2510 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2511 {
2512 #ifdef CTSIM_MDI
2513   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame (theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2514 #else
2515   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2516 #endif
2517   theApp->setIconForFrame (subframe);
2518
2519   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
2520
2521   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
2522   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
2523   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
2524   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
2525   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2526   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2527
2528   file_menu->AppendSeparator();
2529   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2530
2531   file_menu->AppendSeparator();
2532   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2533   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2534   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2535
2536   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2537   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
2538   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
2539   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale");
2540
2541   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2542   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
2543   help_menu->AppendSeparator();
2544   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2545
2546   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2547
2548   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
2549   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2550   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2551
2552   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2553
2554   subframe->Centre(wxBOTH);
2555
2556   return subframe;
2557 }
2558
2559
2560 bool
2561 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2562 {
2563   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2564   SetFrame(m_frame);
2565
2566   m_bMinSpecified = false;
2567   m_bMaxSpecified = false;
2568   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2569
2570   int width, height;
2571   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2572   m_frame->SetTitle ("Plot File");
2573   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
2574
2575 #ifdef __X__
2576   int x, y;  // X requires a forced resize
2577   m_frame->GetSize(&x, &y);
2578   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2579 #endif
2580
2581   m_frame->Show(true);
2582   Activate(true);
2583
2584   return true;
2585 }
2586
2587 void
2588 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2589 {
2590   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2591   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2592   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2593
2594   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2595     int xsize, ysize;
2596     m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2597     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2598     SGP sgp (driver);
2599     if (m_pEZPlot)
2600       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2601   }
2602 }
2603
2604
2605 void
2606 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2607 {
2608     const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2609     const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2610     const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2611
2612     if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2613       if (m_pEZPlot)
2614         delete m_pEZPlot;
2615       m_pEZPlot = new EZPlot;
2616
2617       for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2618         m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2619
2620       if (m_bMinSpecified) {
2621         std::ostringstream os;
2622         os << "ymin " << m_dMinPixel;
2623         m_pEZPlot->ezset (os.str());
2624       }
2625
2626       if (m_bMaxSpecified) {
2627         std::ostringstream os;
2628         os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2629         m_pEZPlot->ezset (os.str());
2630       }
2631
2632       m_pEZPlot->ezset("box");
2633       m_pEZPlot->ezset("grid");
2634
2635       double* pdXaxis = new double [iNRecords];
2636       rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
2637
2638       double* pdY = new double [iNRecords];
2639       for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
2640         rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
2641         m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
2642       }
2643
2644       delete pdXaxis;
2645       delete pdY;
2646     }
2647
2648     if (m_canvas)
2649       m_canvas->Refresh();
2650 }
2651
2652 bool
2653 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2654 {
2655   if (!GetDocument()->Close())
2656     return false;
2657
2658   // m_canvas->Clear();
2659   m_canvas->m_pView = NULL;
2660   m_canvas = NULL;
2661   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2662   if (m_frame)
2663     m_frame->SetTitle(s);
2664   SetFrame(NULL);
2665
2666   Activate(false);
2667
2668   if (deleteWindow) {
2669     delete m_frame;
2670     return true;
2671   }
2672   return true;
2673 }
2674