r459: no message
[ctsim.git] / src / views.cpp
1 /*****************************************************************************
2 ** FILE IDENTIFICATION
3 **
4 **   Name:          view.cpp
5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
7 **   Date Started:  July 2000
8 **
9 **  This is part of the CTSim program
10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
11 **
12 **  $Id: views.cpp,v 1.83 2001/01/28 04:24:03 kevin Exp $
13 **
14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
16 **  published by the Free Software Foundation.
17 **
18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
21 **  GNU General Public License for more details.
22 **
23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
26 ******************************************************************************/
27
28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
29 #include "wx/wxprec.h"
30
31 #ifdef __BORLANDC__
32 #pragma hdrstop
33 #endif
34
35 #ifndef WX_PRECOMP
36 #include "wx/wx.h"
37 #endif
38
39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
41 #endif
42
43 #include "wx/image.h"
44 #include "wx/progdlg.h"
45
46 #include "ct.h"
47 #include "ctsim.h"
48 #include "docs.h"
49 #include "views.h"
50 #include "dialogs.h"
51 #include "dlgprojections.h"
52 #include "dlgreconstruct.h"
53 #include "backprojectors.h"
54 #include "reconstruct.h"
55 #include "timer.h"
56
57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
58 #include <sstream>
59 #else
60 #include <sstream_subst>
61 #endif
62
63
64 // ImageFileCanvas
65
66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
68 END_EVENT_TABLE()
69
70
71 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
72 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
73 {
74 }
75
76 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
77 {
78   m_pView = NULL;
79 }
80
81 void 
82 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
83 {
84   if (m_pView)
85     m_pView->OnDraw(& dc);
86 }
87
88 void 
89 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
90 {
91   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
92   int nx = rIF.nx();
93   int ny = rIF.ny();
94   
95   int yPt = ny - y - 1;
96   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
97   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
98   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
99   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
100   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
101 }
102
103 bool
104 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
105 {
106   x = m_xCursor;
107   y = m_yCursor;
108   
109   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
110     return true;
111   else
112     return false;
113 }
114
115 void 
116 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
117 {
118   if (! m_pView)
119     return;
120   
121   wxClientDC dc(this);
122   PrepareDC(dc);
123   
124   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
125   
126   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
127   if (! pIFDoc)
128     return;
129   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
130   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
131   int nx = rIF.nx();
132   int ny = rIF.ny();
133   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
134   if (event.RightIsDown()) {
135     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
136       std::ostringstream os;
137       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
138       if (rIF.isComplex()) {
139         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
140         if (dImag < 0)
141           os << " - " << -dImag;
142         else
143           os << " + " << dImag;
144         os << "i\n";
145       } else
146         os << "\n";
147       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
148     } else
149       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
150   }
151   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
152     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
153       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
154         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
155       }
156       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
157       m_xCursor = pt.x;
158       m_yCursor = yPt;
159     } else
160       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
161   }
162   if (event.LeftUp()) {
163     std::ostringstream os;
164     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
165     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
166   }
167 }
168
169 wxSize
170 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
171 {
172   if (! m_pView)
173     return wxSize(0,0);
174   
175   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
176   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
177 }
178
179
180 // ImageFileView
181
182 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
183
184 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
185 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
186 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
187 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
188 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
189 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
190 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
191 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
192 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
193 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
194 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
195 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
196 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
197 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
198 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
199 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
200 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
201 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
202 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
203 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
204 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
205 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
206 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
207 #ifdef HAVE_FFT
208 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
209 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
210 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
211 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
212 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
213 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
214 #endif
215 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
216 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
217 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
218 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
219 #ifdef HAVE_FFT
220 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
221 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
222 #endif
223 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
224 END_EVENT_TABLE()
225
226 ImageFileView::ImageFileView() 
227 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
228 {
229   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
230 }
231
232 ImageFileView::~ImageFileView()
233 {
234   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
235   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
236 }
237
238 void
239 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
240 {
241   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
242   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
243     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
244   else {
245     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
246     std::ostringstream os;
247     double min, max, mean, mode, median, stddev;
248     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
249     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
250     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
251     os << "Data type: ";
252     if (rIF.isComplex())
253       os << "Complex\n";
254     else
255       os << "Real\n";
256     os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
257     if (rIF.isComplex()) {
258       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
259       os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
260     }
261     if (rIF.nLabels() > 0) {
262       os << "\n";
263       rIF.printLabelsBrief (os);
264     }
265     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
266     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
267     dialogMsg.ShowModal();
268   }
269 }
270
271 void 
272 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
273 {
274   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
275   double min, max, mean, mode, median, stddev;
276   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
277   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
278   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
279   if (iRetVal == wxID_OK) {
280     m_bMinSpecified = true;
281     m_bMaxSpecified = true;
282     double dMin, dMax;
283     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
284       m_dMinPixel = dMin;
285       m_dMaxPixel = dMax;
286       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
287       OnUpdate (this, NULL);
288     }
289   }
290 }
291
292 void 
293 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
294 {
295   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
296   double min, max;
297   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
298     rIF.getMinMax (min, max);
299   
300   if (m_bMinSpecified)
301     min = m_dMinPixel;
302   if (m_bMaxSpecified)
303     max = m_dMaxPixel;
304   
305   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
306   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
307   if (retVal == wxID_OK) {
308     m_bMinSpecified = true;
309     m_bMaxSpecified = true;
310     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
311     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
312     OnUpdate (this, NULL);
313   }
314 }
315
316 void 
317 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
318 {
319   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
320     m_bMinSpecified = false;
321     m_bMaxSpecified = false;
322     OnUpdate (this, NULL);
323   }
324 }
325
326 void
327 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
328 {
329   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
330   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
331   
332   if (vecIF.size() == 0) {
333     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
334   } else {
335     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
336     
337     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
338       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
339       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
340       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
341       std::ostringstream os;
342       double min, max, mean, mode, median, stddev;
343       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
344       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
345       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
346       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
347       os << "\n";
348       double d, r, e;
349       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
350       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
351       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
352       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
353         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
354         if (! pDifferenceDoc) {
355           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
356           return;
357         }
358         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();
359         
360         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
361         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {
362           pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
363           return;
364         }
365         
366         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
367         differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
368         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
369         differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
370         std::ostringstream osLabel;
371         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() 
372           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
373           << os.str().c_str();
374         differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());
375         if (theApp->getSetModifyNewDocs())
376           pDifferenceDoc->Modify(true);
377         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
378         pDifferenceDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
379         pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
380       }
381       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
382     }
383   }
384 }
385
386 void
387 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
388 {
389   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
390   rIF.invertPixelValues (rIF);
391   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
392   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
393     GetDocument()->Modify(TRUE);
394   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
395 }
396
397 void
398 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
399 {
400   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
401   rIF.square (rIF);
402   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
403   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
404     GetDocument()->Modify(TRUE);
405   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
406 }
407
408 void
409 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
410 {
411   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
412   rIF.sqrt (rIF);
413   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
414   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
415     GetDocument()->Modify(TRUE);
416   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
417 }
418
419 void
420 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
421 {
422   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
423   rIF.log (rIF);
424   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
425   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
426     GetDocument()->Modify(TRUE);
427   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
428 }
429
430 void
431 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
432 {
433   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
434   rIF.exp (rIF);
435   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
436   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
437     GetDocument()->Modify(TRUE);
438   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
439 }
440
441 void
442 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
443 {
444   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
445   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
446   
447   if (vecIF.size() == 0) {
448     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
449   } else {
450     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
451     
452     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
453       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
454       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
455       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
456       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
457       if (! pNewDoc) {
458         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
459         return;
460       }
461       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
462       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
463       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
464       std::ostringstream os;
465       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
466         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
467       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
468       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
469       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
470       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
471       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
472       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
473       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
474         pNewDoc->Modify(TRUE);
475       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
476       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
477       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
478     }
479   }
480 }
481
482 void
483 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
484 {
485   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
486   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
487   
488   if (vecIF.size() == 0) {
489     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
490   } else {
491     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
492     
493     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
494       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
495       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
496       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
497       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
498       if (! pNewDoc) {
499         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
500         return;
501       }
502       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
503       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
504       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
505       std::ostringstream os;
506       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
507         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
508       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
509       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
510       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
511       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
512       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
513       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
514       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
515         pNewDoc->Modify(TRUE);
516       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
517       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
518       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
519     }
520   }
521 }
522
523 void
524 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
525 {
526   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
527   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
528   
529   if (vecIF.size() == 0) {
530     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
531   } else {
532     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
533     
534     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
535       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
536       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
537       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
538       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
539       if (! pNewDoc) {
540         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
541         return;
542       }
543       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
544       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
545       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
546       std::ostringstream os;
547       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
548         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
549       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
550       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
551       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
552       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
553       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
554       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
555       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
556         pNewDoc->Modify(TRUE);
557       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
558       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
559       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
560     }
561   }
562 }
563
564 void
565 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
566 {
567   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
568   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
569   
570   if (vecIF.size() == 0) {
571     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
572   } else {
573     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
574     
575     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
576       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
577       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
578       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
579       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
580       if (! pNewDoc) {
581         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
582         return;
583       }
584       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
585       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
586       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
587       std::ostringstream os;
588       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by " 
589         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
590       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
591       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
592       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
593       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
594       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
595       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
596       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
597         pNewDoc->Modify(TRUE);
598       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
599       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
600       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
601     }
602   }
603 }
604
605
606 #ifdef HAVE_FFT
607 void
608 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
609 {
610   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
611   rIF.fft (rIF);
612   rIF.labelAdd ("FFT Image");
613   m_bMinSpecified = false;
614   m_bMaxSpecified = false;
615   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
616     GetDocument()->Modify(TRUE);
617   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
618 }
619
620 void
621 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
622 {
623   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
624   rIF.ifft (rIF);
625   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
626   m_bMinSpecified = false;
627   m_bMaxSpecified = false;
628   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
629     GetDocument()->Modify(TRUE);
630   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
631 }
632
633 void
634 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
635 {
636   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
637   rIF.fftRows (rIF);
638   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
639   m_bMinSpecified = false;
640   m_bMaxSpecified = false;
641   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
642     GetDocument()->Modify(TRUE);
643   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
644 }
645
646 void
647 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
648 {
649   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
650   rIF.ifftRows (rIF);
651   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
652   m_bMinSpecified = false;
653   m_bMaxSpecified = false;
654   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
655     GetDocument()->Modify(TRUE);
656   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
657 }
658
659 void
660 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
661 {
662   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
663   rIF.fftCols (rIF);
664   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
665   m_bMinSpecified = false;
666   m_bMaxSpecified = false;
667   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
668     GetDocument()->Modify(TRUE);
669   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
670 }
671
672 void
673 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
674 {
675   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
676   rIF.ifftCols (rIF);
677   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
678   m_bMinSpecified = false;
679   m_bMaxSpecified = false;
680   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
681     GetDocument()->Modify(TRUE);
682   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
683 }
684 #endif
685
686 void
687 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
688 {
689   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
690   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
691   rIF.fourier (rIF);
692   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
693   m_bMinSpecified = false;
694   m_bMaxSpecified = false;
695   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
696     GetDocument()->Modify(TRUE);
697   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
698 }
699
700 void
701 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
702 {
703   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
704   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
705   rIF.inverseFourier (rIF);
706   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
707   m_bMinSpecified = false;
708   m_bMaxSpecified = false;
709   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
710     GetDocument()->Modify(TRUE);
711   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
712 }
713
714 void
715 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
716 {
717   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
718   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
719   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
720   m_bMinSpecified = false;
721   m_bMaxSpecified = false;
722   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
723     GetDocument()->Modify(TRUE);
724   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
725 }
726
727 void
728 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
729 {
730   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
731   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
732   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
733   m_bMinSpecified = false;
734   m_bMaxSpecified = false;
735   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
736     GetDocument()->Modify(TRUE);
737   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
738 }
739
740 void
741 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
742 {
743   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
744   if (rIF.isComplex()) {
745     rIF.magnitude (rIF);
746     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
747     m_bMinSpecified = false;
748     m_bMaxSpecified = false;
749     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
750       GetDocument()->Modify(TRUE);
751     GetDocument()->UpdateAllViews(this);
752   }
753 }
754
755 void
756 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
757 {
758   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
759   if (rIF.isComplex()) {
760     rIF.phase (rIF);
761     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
762     m_bMinSpecified = false;
763     m_bMaxSpecified = false;
764     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
765       GetDocument()->Modify(TRUE);
766     GetDocument()->UpdateAllViews(this);
767   }
768 }
769
770
771 ImageFileCanvas* 
772 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
773 {
774   ImageFileCanvas* pCanvas;
775   int width, height;
776   parent->GetClientSize(&width, &height);
777   
778   pCanvas = new ImageFileCanvas (dynamic_cast<ImageFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
779   
780   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
781   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
782   pCanvas->Clear();
783   
784   return pCanvas;
785 }
786
787 #if CTSIM_MDI
788 wxDocMDIChildFrame*
789 #else
790 wxDocChildFrame*
791 #endif
792 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
793 {
794 #if CTSIM_MDI
795   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
796 #else
797   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
798 #endif
799   theApp->setIconForFrame (subframe);
800   
801   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
802   
803   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
804   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
805   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
806   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
807   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
808   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
809   
810   m_pFileMenu->AppendSeparator();
811   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
812   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
813   
814   m_pFileMenu->AppendSeparator();
815   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
816   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
817   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
818 #ifdef CTSIM_MDI
819   m_pFileMenu->AppendSeparator();
820   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
821 #endif
822   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
823   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
824   
825   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
826   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
827   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
828   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
829   
830   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
831   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
832   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
833   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
834   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
835   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
836   filter_menu->AppendSeparator();
837 #ifdef HAVE_FFT
838   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2D &FFT");
839   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2D &IFFT");
840   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
841   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
842   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
843   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
844   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");
845   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");
846 #else
847   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
848   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
849 #endif
850   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
851   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
852   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
853   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
854   
855   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
856   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
857   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
858   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
859   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
860   image_menu->AppendSeparator();
861   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
862   
863   wxMenu *analyze_menu = new wxMenu;
864   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
865   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
866   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
867   analyze_menu->AppendSeparator();
868   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
869   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
870   analyze_menu->AppendSeparator();
871   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
872   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
873   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
874   
875   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
876   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
877   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
878   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
879   
880   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
881   
882   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
883   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
884   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
885   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
886   menu_bar->Append(analyze_menu, "&Analyze");
887   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
888   
889   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
890   
891   subframe->Centre(wxBOTH);
892   
893   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
894   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
895   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
896   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
897   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
898   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
899   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
900   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
901   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
902   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
903   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
904   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
905   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
906   
907   return subframe;
908 }
909
910
911 bool 
912 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
913 {
914   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
915      (m_pFrame);
916   
917   m_bMinSpecified = false;
918   m_bMaxSpecified = false;
919   m_dAutoScaleFactor = 1.;
920   
921   int width, height;
922   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
923   m_pFrame->SetTitle("ImageFileView");
924   m_pCanvas = CreateCanvas (this, m_pFrame);
925   
926   int x, y;  // X requires a forced resize
927   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
928   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
929   m_pFrame->SetFocus();
930   m_pFrame->Show(true);
931   Activate(true);
932   
933   return true;
934 }
935
936 void 
937 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
938 {
939   wxSize sizeWindow = m_pFrame->GetClientSize();
940   wxSize sizeBest = m_pCanvas->GetBestSize();
941   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
942     m_pFrame->SetClientSize (sizeBest);
943   
944   if (m_bitmap.Ok())
945     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
946   
947   int xCursor, yCursor;
948   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
949     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
950 }
951
952
953 void 
954 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
955 {
956   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
957   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
958   int nx = rIF.nx();
959   int ny = rIF.ny();
960   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
961     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
962       double min, max;
963       rIF.getMinMax (min, max);
964       if (! m_bMinSpecified)
965         m_dMinPixel = min;
966       if (! m_bMaxSpecified)
967         m_dMaxPixel = max;
968     }
969     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
970     
971     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
972     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
973       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
974         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
975         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
976         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
977         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
978         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
979       }
980     }
981     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
982     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
983     delete imageData;
984     int xSize = nx;
985     int ySize = ny;
986     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
987     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
988     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
989     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
990   } 
991   
992   if (m_pCanvas)
993     m_pCanvas->Refresh();
994 }
995
996 bool 
997 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
998 {
999   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1000     return false;
1001   
1002   if (m_pCanvas) {
1003     m_pCanvas->setView(NULL);
1004     m_pCanvas = NULL;
1005   }
1006   wxString s(theApp->GetAppName());
1007   if (m_pFrame)
1008     m_pFrame->SetTitle(s);
1009   
1010   SetFrame(NULL);
1011   Activate(false);
1012
1013   if (deleteWindow) {
1014     m_pFrame->Show(false);
1015     m_pFrame->Destroy();
1016     m_pFrame = NULL;
1017   }
1018   return true;
1019 }
1020
1021 void
1022 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1023 {
1024   ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1025   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1026   int nx = rIF.nx();
1027   int ny = rIF.ny();
1028   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1029     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1030       double min, max;
1031       rIF.getMinMax (min, max);
1032       if (! m_bMinSpecified)
1033         m_dMinPixel = min;
1034       if (! m_bMaxSpecified)
1035         m_dMaxPixel = max;
1036     }
1037     
1038     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1039     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1040       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1041       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1042       
1043       wxString strExt;
1044       wxString strWildcard;
1045       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
1046         strExt = ".pgm";
1047         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1048       }
1049 #ifdef HAVE_PNG
1050       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
1051         strExt = ".png";
1052         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1053       }
1054 #endif
1055       
1056       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""), 
1057         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1058       if (strFilename) {
1059         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1060         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1061       }
1062     }
1063   }
1064 }
1065
1066 void
1067 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1068 {
1069   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1070   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1071   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1072   
1073   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1074   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1075     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1076     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1077     std::ostringstream os;
1078     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1079     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1080     if (! pScaledDoc) {
1081       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1082       return;
1083     }
1084     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1085     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1086     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1087     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1088     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1089     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1090     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1091       pScaledDoc->Modify(TRUE);
1092     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1093     pScaledDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1094     pScaledDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1095   }
1096 }
1097
1098 void
1099 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1100 {
1101   int xCursor, yCursor;
1102   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1103     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1104     return;
1105   }
1106   
1107   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1108   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1109   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1110   int nx = rIF.nx();
1111   int ny = rIF.ny();
1112   
1113   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1114     double* pX = new double [nx];
1115     double* pYReal = new double [nx];
1116     double *pYImag = NULL;
1117     double *pYMag = NULL;
1118     if (rIF.isComplex()) {
1119       pYImag = new double [nx];
1120       pYMag = new double [nx];
1121     }
1122     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1123       pX[i] = i;
1124       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1125       if (rIF.isComplex()) {
1126         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1127         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1128       }
1129     }
1130     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1131     if (! pPlotDoc) {
1132       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1133     } else {
1134       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1135       std::ostringstream os;
1136       os << "Row " << yCursor;
1137       std::string title("title ");
1138       title += os.str();
1139       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1140       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1141       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1142       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1143       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1144       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1145       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1146       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1147       if (rIF.isComplex()) {
1148         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1149         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1150         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1151         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1152         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1153         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1154         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1155         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1156       } else
1157         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1158       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1159       rPlotFile.addColumn (1, pYReal); 
1160       if (rIF.isComplex()) {
1161         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1162         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1163       }
1164       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1165         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1166       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1167       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1168       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1169     }
1170     delete pX;
1171     delete pYReal;
1172     if (rIF.isComplex()) {
1173       delete pYImag;
1174       delete pYMag;
1175     }
1176     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1177       pPlotDoc->Modify(true);
1178     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1179   }
1180 }
1181
1182 void
1183 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1184 {
1185   int xCursor, yCursor;
1186   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1187     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1188     return;
1189   }
1190   
1191   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1192   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1193   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1194   int nx = rIF.nx();
1195   int ny = rIF.ny();
1196   
1197   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1198     double* pX = new double [ny];
1199     double* pYReal = new double [ny];
1200     double* pYImag = NULL;
1201     double* pYMag = NULL;
1202     if (rIF.isComplex()) {
1203       pYImag = new double [ny];
1204       pYMag = new double [ny];
1205     }
1206     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1207       pX[i] = i;
1208       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1209       if (rIF.isComplex()) {
1210         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1211         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1212       }
1213     }
1214     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1215     if (! pPlotDoc) {
1216       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1217     } else {
1218       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1219       std::ostringstream os;
1220       os << "Column " << xCursor;
1221       std::string title("title ");
1222       title += os.str();
1223       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1224       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1225       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1226       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1227       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1228       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1229       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1230       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1231       if (rIF.isComplex()) {
1232         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1233         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1234         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1235         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1236         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1237         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1238         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1239         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1240       } else
1241         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1242       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1243       rPlotFile.addColumn (1, pYReal); 
1244       if (rIF.isComplex()) {
1245         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1246         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1247       }
1248       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1249         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1250       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1251       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1252       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1253     }
1254     delete pX;
1255     delete pYReal;
1256     if (rIF.isComplex()) {
1257       delete pYImag;
1258       delete pYMag;
1259     }
1260     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1261       pPlotDoc->Modify(true);
1262     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1263   }
1264 }
1265
1266 #ifdef HAVE_FFT
1267 void
1268 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1269 {
1270   int xCursor, yCursor;
1271   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1272     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1273     return;
1274   }
1275   
1276   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1277   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1278   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1279   int nx = rIF.nx();
1280   int ny = rIF.ny();
1281   
1282   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1283     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1284     
1285     int i;
1286     for (i = 0; i < nx; i++) {
1287       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1288       if (rIF.isComplex())
1289         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1290       else
1291         pcIn[i].im = 0;
1292     }
1293     
1294     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1295     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1296     fftw_destroy_plan (plan);
1297     
1298     double* pX = new double [nx];
1299     double* pYReal = new double [nx];
1300     double* pYImag = new double [nx];
1301     double* pYMag = new double [nx];
1302     for (i = 0; i < nx; i++) {
1303       pX[i] = i;
1304       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1305       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1306       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1307     }
1308     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1309     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1310     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1311     
1312     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1313     if (! pPlotDoc) {
1314       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1315     } else {
1316       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1317       std::ostringstream os;
1318       os << "Row " << yCursor;
1319       std::string title("title ");
1320       title += os.str();
1321       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1322       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1323       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1324       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1325       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1326       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1327       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1328       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1329       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1330       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1331       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1332       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1333       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1334       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1335       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1336       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1337       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1338       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1339       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1340       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1341       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1342         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1343       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1344       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1345       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1346     }
1347     delete pX;
1348     delete pYReal;
1349     delete pYImag;
1350     delete pYMag;
1351     delete [] pcIn;
1352     
1353     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1354       pPlotDoc->Modify(true);
1355     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1356   }
1357 }
1358
1359 void
1360 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1361 {
1362   int xCursor, yCursor;
1363   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1364     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1365     return;
1366   }
1367   
1368   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1369   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1370   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1371   int nx = rIF.nx();
1372   int ny = rIF.ny();
1373   
1374   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1375     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1376     double *pdTemp = new double [ny];
1377     
1378     int i;
1379     for (i = 0; i < ny; i++)
1380       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1381     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1382     for (i = 0; i < ny; i++) 
1383       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1384     
1385     for (i = 0; i < ny; i++) {
1386       if (rIF.isComplex())
1387         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1388       else
1389         pdTemp[i] = 0;
1390     }
1391     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1392     for (i = 0; i < ny; i++)
1393       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1394     
1395     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1396     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1397     fftw_destroy_plan (plan);
1398     
1399     double* pX = new double [ny];
1400     double* pYReal = new double [ny];
1401     double* pYImag = new double [ny];
1402     double* pYMag = new double [ny];
1403     for (i = 0; i < ny; i++) {
1404       pX[i] = i;
1405       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1406       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1407       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1408     }
1409     
1410     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1411     if (! pPlotDoc) {
1412       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1413     } else {
1414       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1415       std::ostringstream os;
1416       os << "Column " << xCursor;
1417       std::string title("title ");
1418       title += os.str();
1419       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1420       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1421       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1422       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1423       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1424       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1425       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1426       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1427       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1428       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1429       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1430       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1431       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1432       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1433       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1434       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1435       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1436       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1437       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1438       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1439       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1440         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1441       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1442       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1443       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1444     }
1445     delete pX;
1446     delete pYReal;
1447     delete pYImag;
1448     delete pYMag;
1449     delete pdTemp;
1450     delete [] pcIn;
1451     
1452     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1453       pPlotDoc->Modify(true);
1454     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1455   }
1456 }
1457 #endif
1458
1459 void
1460 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1461 {
1462   int xCursor, yCursor;
1463   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1464     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1465     return;
1466   }
1467   
1468   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1469   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1470   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1471     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1472     return;
1473   }
1474   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1475   
1476   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1477     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1478     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1479     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1480     
1481     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1482     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1483     int nx = rIF.nx();
1484     int ny = rIF.ny();
1485     
1486     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1487       double* pX = new double [ny];
1488       double* pY1 = new double [ny];
1489       double* pY2 = new double [ny];
1490       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1491         pX[i] = i;
1492         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1493         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1494       }
1495       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1496       if (! pPlotDoc) {
1497         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1498       } else {
1499         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1500         std::ostringstream os;
1501         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1502         std::string title("title ");
1503         title += os.str();
1504         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1505         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1506         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1507         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1508         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1509         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1510         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1511         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1512         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1513         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1514         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1515         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1516         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1517         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1518         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1519         
1520         unsigned int iL;
1521         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1522           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1523           s += ": ";
1524           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1525           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1526         }
1527         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1528           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1529           s += ": ";
1530           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1531           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1532         }
1533         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1534           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1535         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1536         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1537       }
1538       delete pX;
1539       delete pY1;
1540       delete pY2;
1541       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1542         pPlotDoc->Modify(true);
1543       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1544     }
1545   }
1546 }
1547
1548 void
1549 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1550 {
1551   int xCursor, yCursor;
1552   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1553     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1554     return;
1555   }
1556   
1557   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1558   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1559   
1560   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1561     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1562     return;
1563   }
1564   
1565   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1566   
1567   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1568     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1569     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1570     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1571     
1572     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1573     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1574     int nx = rIF.nx();
1575     int ny = rIF.ny();
1576     
1577     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1578       double* pX = new double [nx];
1579       double* pY1 = new double [nx];
1580       double* pY2 = new double [nx];
1581       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1582         pX[i] = i;
1583         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1584         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1585       }
1586       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1587       if (! pPlotDoc) {
1588         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1589       } else {
1590         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1591         std::ostringstream os;
1592         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1593         std::string title("title ");
1594         title += os.str();
1595         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1596         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1597         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1598         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1599         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1600         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1601         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1602         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1603         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1604         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1605         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1606         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1607         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1608         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1609         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1610         unsigned int iL;
1611         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1612           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1613           s += ": ";
1614           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1615           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1616         }
1617         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1618           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1619           s += ": ";
1620           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1621           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1622         }
1623         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1624           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1625         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1626         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1627       }
1628       delete pX;
1629       delete pY1;
1630       delete pY2;
1631       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1632         pPlotDoc->Modify(true);
1633       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1634     }
1635   }
1636 }
1637
1638 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1639
1640 void
1641 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1642
1643   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1644   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1645   int nx = rIF.nx();
1646   int ny = rIF.ny();
1647   
1648   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1649     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1650     if (! pPlotDoc) {
1651       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1652       return;
1653     }
1654     
1655     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1656     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1657     double dMin, dMax;
1658     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1659     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1660     
1661     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1662       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1663       pY[i] = 0;
1664     }
1665     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1666       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1667         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1668         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1669           pY[iBin] += 1;
1670       }
1671       
1672       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1673       std::ostringstream os;
1674       os << "Histogram";
1675       std::string title("title ");
1676       title += os.str();
1677       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1678       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1679       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1680       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1681       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1682       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1683       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1684       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1685       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1686         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1687         s += ": ";
1688         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1689         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1690       }
1691       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1692       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1693       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1694       delete pX;
1695       delete pY;
1696       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1697         pPlotDoc->Modify(true);
1698       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1699   }
1700 }
1701
1702
1703 // PhantomCanvas
1704
1705 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1706 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1707 {
1708   m_pView = v;
1709 }
1710
1711 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1712 {
1713   m_pView = NULL;
1714 }
1715
1716 void 
1717 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1718 {
1719   if (m_pView)
1720     m_pView->OnDraw(& dc);
1721 }
1722
1723
1724 // PhantomFileView
1725
1726 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
1727
1728 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
1729 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
1730 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
1731 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
1732 END_EVENT_TABLE()
1733
1734 PhantomFileView::PhantomFileView() 
1735 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
1736 {
1737 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
1738   m_iDefaultNDet = 165;
1739   m_iDefaultNView = 180;
1740 #else
1741   m_iDefaultNDet = 367;
1742   m_iDefaultNView = 320;
1743 #endif
1744   m_iDefaultNSample = 1;
1745   m_dDefaultRotation = 1;
1746   m_dDefaultFocalLength = 2;
1747   m_dDefaultFieldOfView = 1;
1748   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1749   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1750   
1751 #ifdef DEBUG 
1752   m_iDefaultRasterNX = 115;
1753   m_iDefaultRasterNY = 115;
1754   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1755 #else
1756   m_iDefaultRasterNX = 256;
1757   m_iDefaultRasterNY = 256;
1758   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1759 #endif
1760 }
1761
1762 PhantomFileView::~PhantomFileView()
1763 {
1764   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
1765   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
1766 }
1767
1768 void
1769 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1770 {
1771   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1772   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1773   std::ostringstream os;
1774   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1775   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1776   rPhantom.printDefinitions (os);
1777 #if DEBUG
1778   rPhantom.print (os);
1779 #endif
1780   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1781   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1782 }
1783
1784
1785 void
1786 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1787 {
1788   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView, m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
1789   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1790   if (retVal == wxID_OK) {
1791     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1792     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1793     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1794     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1795     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1796     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1797     m_dDefaultFieldOfView = dialogProjection.getFieldOfViewRatio();
1798     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1799     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1800     
1801     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1802       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1803       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
1804       if (! pProjectionDoc) {
1805         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1806         return;
1807       }
1808       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
1809       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
1810       if (theScanner.fail()) {
1811         *theApp->getLog() << "Failed making scanner: " << theScanner.failMessage().c_str() << "\n";
1812         return;
1813       }
1814       rProj.initFromScanner (theScanner);
1815       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
1816       
1817       Timer timer;
1818       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1819         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1820         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1821           ::wxYield();
1822           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1823             pProjectionDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
1824             return;
1825           }
1826           ::wxYield();
1827           while (dialogProjections.isPaused()) {
1828             ::wxYield();
1829             ::wxUsleep(50);
1830           }
1831         }
1832       } else {
1833         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1834         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
1835           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1836           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1837             pProjectionDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
1838             return;
1839           }
1840         }
1841       }
1842       
1843       std::ostringstream os;
1844       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
1845       rProj.setCalcTime (timer.timerEnd());
1846       rProj.setRemark (os.str());
1847       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1848       
1849       m_pFrame->Lower();
1850       ::wxYield();
1851       ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());
1852       if (projView) {
1853         projView->getFrame()->SetFocus();
1854         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1855       }
1856       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
1857         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
1858           pFrame->SetFocus();
1859           pFrame->Raise();
1860         }
1861         GetDocumentManager()->ActivateView (pView, true, false);
1862       }
1863       ::wxYield();
1864       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1865         pProjectionDoc->Modify(true);
1866       pProjectionDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1867       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
1868     }
1869   }
1870 }
1871
1872
1873 void
1874 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1875 {
1876   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY, m_iDefaultRasterNSamples);
1877   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1878   if (retVal == wxID_OK) {
1879     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1880     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1881     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1882     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1883       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1884     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1885       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1886       ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
1887       if (! pRasterDoc) {
1888         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1889         return;
1890       }
1891       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
1892       
1893       imageFile.setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNX);
1894       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1895       Timer timer;
1896       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
1897         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1898         if (! dlgProgress.Update(i+1)) {
1899           pRasterDoc->Close();
1900           pRasterDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
1901           return;
1902         }
1903       }
1904       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1905         pRasterDoc->Modify(true);
1906       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
1907       pRasterDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1908       std::ostringstream os;
1909       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize=" 
1910         << m_iDefaultRasterNY << ", nSamples=" << m_iDefaultRasterNSamples;
1911       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1912       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
1913       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());
1914       if (rasterView) {
1915         rasterView->getFrame()->SetFocus();
1916         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
1917       }
1918       
1919     }
1920   }
1921 }
1922
1923
1924 PhantomCanvas* 
1925 PhantomFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1926 {
1927   PhantomCanvas* pCanvas;
1928   int width, height;
1929   parent->GetClientSize(&width, &height);
1930   
1931   pCanvas = new PhantomCanvas (dynamic_cast<PhantomFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1932   
1933   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1934   pCanvas->Clear();
1935   
1936   return pCanvas;
1937 }
1938
1939 #if CTSIM_MDI
1940 wxDocMDIChildFrame*
1941 #else
1942 wxDocChildFrame*
1943 #endif
1944 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1945 {
1946 #if CTSIM_MDI
1947   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1948 #else
1949   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1950 #endif
1951   theApp->setIconForFrame (subframe);
1952   
1953   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
1954   
1955   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
1956   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
1957   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
1958   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1959   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1960   
1961   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1962   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1963   
1964   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1965   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1966   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1967   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1968 #ifdef CTSIM_MDI
1969   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1970   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
1971 #endif
1972   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
1973   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
1974   
1975   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
1976   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
1977   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
1978   
1979   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1980   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
1981   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
1982   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1983   
1984   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1985   
1986   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
1987   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
1988   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1989   
1990   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1991   subframe->Centre(wxBOTH);
1992   
1993   wxAcceleratorEntry accelEntries[8];
1994   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
1995   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
1996   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
1997   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
1998   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
1999   accelEntries[5].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2000   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2001   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2002   wxAcceleratorTable accelTable (8, accelEntries);
2003   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2004   
2005   return subframe;
2006 }
2007
2008
2009 bool 
2010 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2011 {
2012   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2013   SetFrame(m_pFrame);
2014   
2015   int width, height;
2016   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2017   m_pFrame->SetTitle("PhantomFileView");
2018   m_pCanvas = CreateCanvas (this, m_pFrame);
2019   
2020 #ifdef __X__
2021   int x, y;  // X requires a forced resize
2022   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2023   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2024 #endif
2025   
2026   m_pFrame->Show(true);
2027   Activate(true);
2028   
2029   return true;
2030 }
2031
2032 void 
2033 PhantomFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2034 {
2035   if (m_pCanvas)
2036     m_pCanvas->Refresh();
2037 }
2038
2039 bool 
2040 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2041 {
2042   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2043     return false;
2044   
2045   if (m_pCanvas) {
2046     m_pCanvas->setView(NULL);
2047     m_pCanvas = NULL;
2048   }
2049   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2050   if (m_pFrame)
2051     m_pFrame->SetTitle(s);
2052   
2053   SetFrame(NULL);
2054   Activate(false);
2055   
2056   if (deleteWindow) {
2057     m_pFrame->Show(false);
2058      m_pFrame->Destroy();
2059     m_pFrame = NULL;
2060   }
2061   
2062   return true;
2063 }
2064
2065 void
2066 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2067 {
2068   int xsize, ysize;
2069   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2070   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2071   SGP sgp (driver);
2072   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2073   sgp.setColor (C_RED);
2074   rPhantom.show (sgp);
2075 }
2076
2077 // ProjectionCanvas
2078
2079 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2080 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2081 {
2082   m_pView = v;
2083 }
2084
2085 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2086 {
2087   m_pView = NULL;
2088 }
2089
2090 void 
2091 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2092 {
2093   if (m_pView)
2094     m_pView->OnDraw(& dc);
2095 }
2096
2097 wxSize
2098 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2099 {
2100   wxSize best (0, 0);
2101   if (m_pView) {
2102     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2103     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2104   }
2105   
2106   return best;
2107 }
2108
2109
2110 // ProjectionFileView
2111
2112 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2113
2114 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2115 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2116 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2117 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2118 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2119 END_EVENT_TABLE()
2120
2121 ProjectionFileView::ProjectionFileView() 
2122 : wxView(), m_pCanvas(NULL), m_pFrame(NULL), m_pFileMenu(0)
2123 {
2124 #ifdef DEBUG
2125   m_iDefaultNX = 115;
2126   m_iDefaultNY = 115;
2127 #else
2128   m_iDefaultNX = 256;
2129   m_iDefaultNY = 256;
2130 #endif
2131
2132   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2133   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2134 #if HAVE_FFTW
2135   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2136   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2137 #else
2138   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2139   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2140 #endif
2141   m_iDefaultZeropad = 1;
2142   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF3;
2143   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2144   m_iDefaultInterpParam = 1;
2145   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2146   
2147   m_iDefaultPolarNX = 256;
2148   m_iDefaultPolarNY = 256;
2149   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2150   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2151 }
2152
2153 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2154 {
2155   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2156   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2157 }
2158
2159 void
2160 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2161 {
2162   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2163   std::ostringstream os;
2164   rProj.printScanInfo(os);
2165   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2166   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2167   dialogMsg.ShowModal();
2168 }
2169
2170
2171 void
2172 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2173 {
2174   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2175   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2176     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2177   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2178     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2179     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2180     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2181     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2182     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2183     if (! pPolarDoc) {
2184       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2185       return;
2186     }
2187     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2188     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2189     rProj.convertPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation);
2190     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2191     std::ostringstream os;
2192     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize=" 
2193       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation=" 
2194       << strInterpolation.c_str();
2195     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2196     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2197     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2198       pPolarDoc->Modify(true);
2199     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2200     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2201     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2202   }
2203 }
2204
2205 void
2206 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2207 {
2208   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2209   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2210     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2211   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2212     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2213     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2214     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2215     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2216     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2217     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2218     if (! pPolarDoc) {
2219       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2220       return;
2221     }
2222     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2223     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2224     rProj.convertFFTPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2225     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2226     std::ostringstream os;
2227     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize=" 
2228       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation=" 
2229       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2230     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2231     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2232     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2233       pPolarDoc->Modify(true);
2234     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2235     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2236     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2237   }
2238 }
2239
2240 void
2241 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2242 {
2243   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2244 }
2245
2246 void
2247 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2248 {
2249   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration, m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector, m_iDefaultTrace);
2250   
2251   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2252   if (retVal == wxID_OK) {
2253     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2254     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2255     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2256     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2257     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2258     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2259     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2260     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2261     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2262     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2263     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2264     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2265     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2266     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2267     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2268     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2269     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2270       ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2271       if (! pReconDoc) {
2272         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2273         return;
2274       }
2275       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
2276       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2277       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2278       
2279       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2280       
2281       Timer timerRecon;
2282       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2283         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2284         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2285           ::wxYield();
2286           ::wxYield();
2287           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView)) {
2288             delete pDlgReconstruct;
2289             delete pReconstruct;
2290             pReconDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
2291             return;
2292           }
2293           ::wxYield();
2294           ::wxYield();
2295           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2296             ::wxYield();
2297             ::wxUsleep(50);
2298           }
2299         }
2300         delete pDlgReconstruct;
2301       } else {
2302         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
2303         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
2304           pReconstruct->reconstructView (i, 1);
2305           if (! dlgProgress.Update(i + 1)) {
2306             delete pReconstruct;
2307             pReconDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
2308             return;
2309           }
2310         }
2311       }
2312       delete pReconstruct;
2313       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2314         pReconDoc->Modify(true);
2315       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
2316       pReconDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2317       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());
2318       if (rasterView) {
2319         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2320         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2321       }
2322       std::ostringstream os;
2323       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2324       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2325       imageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
2326       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2327     }
2328   }
2329 }
2330
2331
2332 ProjectionFileCanvas* 
2333 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2334 {
2335   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2336   int width, height;
2337   parent->GetClientSize(&width, &height);
2338   
2339   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (dynamic_cast<ProjectionFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2340   
2341   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2342   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2343   pCanvas->Clear();
2344   
2345   return pCanvas;
2346 }
2347
2348 #if CTSIM_MDI
2349 wxDocMDIChildFrame*
2350 #else
2351 wxDocChildFrame*
2352 #endif
2353 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2354 {
2355 #ifdef CTSIM_MDI
2356   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2357 #else
2358   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2359 #endif
2360   theApp->setIconForFrame (subframe);
2361   
2362   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2363   
2364   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2365   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2366   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2367   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2368   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2369   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2370   
2371   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2372   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2373   
2374   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2375   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2376   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2377   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2378 #ifdef CTSIM_MDI
2379   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2380   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2381 #endif
2382   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2383   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2384   
2385   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2386   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2387   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-I");
2388   
2389   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2390   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R");
2391   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E");
2392   
2393   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2394   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2395   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2396   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2397   
2398   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2399   
2400   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
2401   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2402   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2403   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2404   
2405   subframe->SetMenuBar(menu_bar);  
2406   subframe->Centre(wxBOTH);
2407   
2408   wxAcceleratorEntry accelEntries[11];
2409   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2410   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2411   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2412   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2413   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2414   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2415   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2416   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2417   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2418   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2419   accelEntries[10].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2420   wxAcceleratorTable accelTable (11, accelEntries);
2421   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2422   
2423   return subframe;
2424 }
2425
2426
2427 bool 
2428 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2429 {
2430   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2431   SetFrame(m_pFrame);
2432   
2433   int width, height;
2434   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2435   m_pFrame->SetTitle("ProjectionFileView");
2436   m_pCanvas = CreateCanvas(this, m_pFrame);
2437   
2438 #ifdef __X__
2439   int x, y;  // X requires a forced resize
2440   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2441   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2442 #endif
2443   
2444   m_pFrame->Show(true);
2445   Activate(true);
2446   
2447   return true;
2448 }
2449
2450 void 
2451 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2452 {
2453   wxSize clientSize = m_pFrame->GetClientSize();
2454   wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
2455   
2456   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2457     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
2458   
2459   if (m_bitmap.Ok())
2460     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2461 }
2462
2463
2464 void 
2465 ProjectionFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2466 {
2467   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2468   const int nDet = rProj.nDet();
2469   const int nView = rProj.nView();
2470   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2471     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2472     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2473     double min = detval[0];
2474     double max = detval[0];
2475     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2476       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2477       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2478       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2479         if (min > detval[ix])
2480           min = detval[ix];
2481         else if (max < detval[ix])
2482           max = detval[ix];
2483       }
2484     }
2485     
2486     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2487     double scale = (max - min) / 255;
2488     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2489       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2490       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2491       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2492         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2493         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2494         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2495         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2496       }
2497     }
2498     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2499     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2500     delete imageData;
2501     int xSize = nDet;
2502     int ySize = nView;
2503     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2504     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2505     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
2506     m_pCanvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2507   }
2508   
2509   if (m_pCanvas)
2510     m_pCanvas->Refresh();
2511 }
2512
2513 bool 
2514 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2515 {
2516   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2517     return false;
2518   
2519   if (m_pCanvas) {
2520     m_pCanvas->setView(NULL);
2521     m_pCanvas = NULL;
2522   }
2523   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2524   if (m_pFrame)
2525     m_pFrame->SetTitle(s);
2526   
2527   SetFrame(NULL);
2528   Activate(false);
2529   
2530   if (deleteWindow) {
2531     m_pFrame->Show(false);
2532     m_pFrame->Destroy();
2533     m_pFrame = NULL;
2534   }
2535   return true;
2536 }
2537
2538
2539
2540 // PlotFileCanvas
2541 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2542 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2543 {
2544   m_pView = v;
2545 }
2546
2547 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
2548 {
2549   m_pView = NULL;
2550 }
2551
2552 void 
2553 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2554 {
2555   if (m_pView)
2556     m_pView->OnDraw(& dc);
2557 }
2558
2559
2560 // PlotFileView
2561
2562 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2563
2564 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2565 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2566 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2567 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2568 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2569 END_EVENT_TABLE()
2570
2571 PlotFileView::PlotFileView() 
2572 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
2573 {
2574 }
2575
2576 PlotFileView::~PlotFileView()
2577 {
2578   if (m_pEZPlot)
2579     delete m_pEZPlot;
2580   
2581   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);  
2582 }
2583
2584 void
2585 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2586 {
2587   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2588   std::ostringstream os;
2589   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2590   rPlot.printHeadersBrief (os);
2591   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2592   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2593   dialogMsg.ShowModal();
2594 }
2595
2596
2597 void 
2598 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2599 {
2600   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2601   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2602   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2603   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2604   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2605   if (iRetVal == wxID_OK) {
2606     m_bMinSpecified = true;
2607     m_bMaxSpecified = true;
2608     double dMin, dMax;
2609     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2610       m_dMinPixel = dMin;
2611       m_dMaxPixel = dMax;
2612       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2613       OnUpdate (this, NULL);
2614     }
2615   }
2616 }
2617
2618 void 
2619 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2620 {
2621   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2622   double min;
2623   double max;
2624   
2625   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2626     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2627       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2628       return;
2629     }
2630   }
2631   
2632   if (m_bMinSpecified)
2633     min = m_dMinPixel;
2634   if (m_bMaxSpecified)
2635     max = m_dMaxPixel;
2636   
2637   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2638   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2639   if (retVal == wxID_OK) {
2640     m_bMinSpecified = true;
2641     m_bMaxSpecified = true;
2642     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2643     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2644     OnUpdate (this, NULL);
2645   }
2646 }
2647
2648 void 
2649 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2650 {
2651   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2652     m_bMinSpecified = false;
2653     m_bMaxSpecified = false;
2654     OnUpdate (this, NULL);
2655   }
2656 }
2657
2658
2659 PlotFileCanvas* 
2660 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2661 {
2662   PlotFileCanvas* pCanvas;
2663   int width, height;
2664   parent->GetClientSize(&width, &height);
2665   
2666   pCanvas = new PlotFileCanvas (dynamic_cast<PlotFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2667   
2668   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2669   pCanvas->Clear();
2670   
2671   return pCanvas;
2672 }
2673
2674 #if CTSIM_MDI
2675 wxDocMDIChildFrame*
2676 #else
2677 wxDocChildFrame*
2678 #endif
2679 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2680 {
2681 #ifdef CTSIM_MDI
2682   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2683 #else
2684   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2685 #endif
2686   theApp->setIconForFrame (subframe);
2687   
2688   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2689   
2690   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2691   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2692   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2693   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2694   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2695   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2696   
2697   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2698   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2699   
2700   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2701   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2702   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2703   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2704 #ifdef CTSIM_MDI
2705   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2706   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2707 #endif
2708   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2709   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2710   
2711   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2712   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2713   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2714   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2715   
2716   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2717   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2718   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2719   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2720   
2721   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2722   
2723   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2724   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2725   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2726   
2727   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2728   subframe->Centre(wxBOTH);
2729   
2730   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
2731   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2732   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2733   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2734   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2735   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2736   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2737   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2738   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2739   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2740   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2741   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
2742   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2743   
2744   return subframe;
2745 }
2746
2747
2748 bool 
2749 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2750 {
2751   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2752   SetFrame(m_pFrame);
2753   
2754   m_bMinSpecified = false;
2755   m_bMaxSpecified = false;
2756   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2757   
2758   int width, height;
2759   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2760   m_pFrame->SetTitle ("Plot File");
2761   m_pCanvas = CreateCanvas (this, m_pFrame);
2762   
2763 #ifdef __X__
2764   int x, y;  // X requires a forced resize
2765   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2766   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2767 #endif
2768   
2769   m_pFrame->Show(true);
2770   Activate(true);
2771   
2772   return true;
2773 }
2774
2775 void 
2776 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2777 {
2778   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2779   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2780   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2781   
2782   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2783     int xsize, ysize;
2784     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2785     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2786     SGP sgp (driver);
2787     if (m_pEZPlot)
2788       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2789   }
2790 }
2791
2792
2793 void 
2794 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2795 {
2796   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2797   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2798   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2799   
2800   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2801     if (m_pEZPlot)
2802       delete m_pEZPlot;
2803     m_pEZPlot = new EZPlot;
2804     
2805     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2806       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2807     
2808     if (m_bMinSpecified) {
2809       std::ostringstream os;
2810       os << "ymin " << m_dMinPixel;
2811       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2812     }
2813     
2814     if (m_bMaxSpecified) {
2815       std::ostringstream os;
2816       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2817       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2818     }
2819     
2820     m_pEZPlot->ezset("box");
2821     m_pEZPlot->ezset("grid");
2822     
2823     double* pdXaxis = new double [iNRecords];
2824     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
2825     
2826     double* pdY = new double [iNRecords];
2827     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
2828       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
2829       m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
2830     }
2831     
2832     delete pdXaxis;
2833     delete pdY;
2834   }
2835   
2836   if (m_pCanvas)
2837     m_pCanvas->Refresh();
2838 }
2839
2840 bool 
2841 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2842 {
2843   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2844     return false;
2845   
2846   if (m_pCanvas) {
2847     m_pCanvas->setView (NULL);
2848     m_pCanvas = NULL;
2849   }
2850   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2851   if (m_pFrame)
2852     m_pFrame->SetTitle(s);
2853   
2854   Activate(false);
2855   
2856   m_pFrame->SetView(NULL);
2857    SetFrame(NULL);
2858   if (deleteWindow) {
2859     m_pFrame->Show(false);
2860      m_pFrame->Destroy();
2861     m_pFrame = NULL;
2862   }
2863   return true;
2864 }
2865
2866
2867 ////////////////////////////////////////////////////////////////
2868
2869
2870 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
2871
2872 TextFileView::~TextFileView() 
2873 {
2874   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2875   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2876 }
2877
2878 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2879 {
2880   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2881   SetFrame (m_pFrame);
2882   
2883   int width, height;
2884   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2885   m_pFrame->SetTitle("TextFile");
2886   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
2887   m_pFrame->SetTitle("Log");
2888   
2889 #ifdef __X__
2890   // X seems to require a forced resize
2891   int x, y;
2892   frame->GetSize(&x, &y);
2893   frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2894 #endif
2895   
2896   m_pFrame->Show (true);
2897   Activate (true);
2898   
2899   return true;
2900 }
2901
2902 // Handled by wxTextWindow
2903 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
2904 {
2905 }
2906
2907 void TextFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2908 {
2909 }
2910
2911 bool 
2912 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2913 {
2914  // if (m_pFrame && m_pFrame->GetTitle() == "Log")
2915     return false;
2916   
2917   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2918     return false;
2919   
2920   m_pCanvas->Show(false);
2921   Activate(false);
2922
2923   SetFrame(NULL);
2924   m_pFrame->SetView(NULL);
2925   if (deleteWindow) {
2926     m_pFrame->Show(false);
2927      m_pFrame->Destroy();
2928     m_pFrame = NULL;
2929     
2930   }
2931   return TRUE;
2932 }
2933
2934 #if CTSIM_MDI
2935 wxDocMDIChildFrame*
2936 #else
2937 wxDocChildFrame*
2938 #endif
2939 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
2940 {
2941 #if CTSIM_MDI
2942   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2943 #else
2944   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2945 #endif
2946   theApp->setIconForFrame (subframe);
2947   
2948   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2949   
2950   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2951   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2952   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2953   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2954   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2955   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2956   
2957   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2958   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2959   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2960   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2961 #ifdef CTSIM_MDI
2962   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2963   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2964 #endif
2965   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2966   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2967   
2968   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2969   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2970   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2971   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2972   
2973   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2974   
2975   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2976   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2977   
2978   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2979   subframe->Centre(wxBOTH);
2980   
2981   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
2982   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2983   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2984   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2985   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2986   accelEntries[4].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2987   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
2988   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2989   
2990   return subframe;
2991 }
2992
2993
2994 // Define a constructor for my text subwindow
2995 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
2996 : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
2997 {
2998 }
2999
3000 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3001 {
3002   m_pView = NULL;
3003 }