r458: no message
[ctsim.git] / src / views.cpp
1 /*****************************************************************************
2 ** FILE IDENTIFICATION
3 **
4 **   Name:          view.cpp
5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
7 **   Date Started:  July 2000
8 **
9 **  This is part of the CTSim program
10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
11 **
12 **  $Id: views.cpp,v 1.82 2001/01/28 03:48:55 kevin Exp $
13 **
14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
16 **  published by the Free Software Foundation.
17 **
18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
21 **  GNU General Public License for more details.
22 **
23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
26 ******************************************************************************/
27
28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
29 #include "wx/wxprec.h"
30
31 #ifdef __BORLANDC__
32 #pragma hdrstop
33 #endif
34
35 #ifndef WX_PRECOMP
36 #include "wx/wx.h"
37 #endif
38
39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
41 #endif
42
43 #include "wx/image.h"
44 #include "wx/progdlg.h"
45
46 #include "ct.h"
47 #include "ctsim.h"
48 #include "docs.h"
49 #include "views.h"
50 #include "dialogs.h"
51 #include "dlgprojections.h"
52 #include "dlgreconstruct.h"
53 #include "backprojectors.h"
54 #include "reconstruct.h"
55 #include "timer.h"
56
57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
58 #include <sstream>
59 #else
60 #include <sstream_subst>
61 #endif
62
63
64 // ImageFileCanvas
65
66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
68 END_EVENT_TABLE()
69
70
71 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
72 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
73 {
74 }
75
76 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
77 {
78   m_pView = NULL;
79 }
80
81 void 
82 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
83 {
84   if (m_pView)
85     m_pView->OnDraw(& dc);
86 }
87
88 void 
89 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
90 {
91   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
92   int nx = rIF.nx();
93   int ny = rIF.ny();
94   
95   int yPt = ny - y - 1;
96   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
97   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
98   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
99   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
100   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
101 }
102
103 bool
104 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
105 {
106   x = m_xCursor;
107   y = m_yCursor;
108   
109   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
110     return true;
111   else
112     return false;
113 }
114
115 void 
116 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
117 {
118   if (! m_pView)
119     return;
120   
121   wxClientDC dc(this);
122   PrepareDC(dc);
123   
124   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
125   
126   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
127   if (! pIFDoc)
128     return;
129   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
130   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
131   int nx = rIF.nx();
132   int ny = rIF.ny();
133   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
134   if (event.RightIsDown()) {
135     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
136       std::ostringstream os;
137       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
138       if (rIF.isComplex()) {
139         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
140         if (dImag < 0)
141           os << " - " << -dImag;
142         else
143           os << " + " << dImag;
144         os << "i\n";
145       } else
146         os << "\n";
147       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
148     } else
149       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
150   }
151   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
152     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
153       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
154         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
155       }
156       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
157       m_xCursor = pt.x;
158       m_yCursor = yPt;
159     } else
160       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
161   }
162   if (event.LeftUp()) {
163     std::ostringstream os;
164     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
165     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
166   }
167 }
168
169 wxSize
170 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
171 {
172   if (! m_pView)
173     return wxSize(0,0);
174   
175   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
176   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
177 }
178
179
180 // ImageFileView
181
182 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
183
184 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
185 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
186 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
187 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
188 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
189 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
190 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
191 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
192 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
193 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
194 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
195 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
196 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
197 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
198 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
199 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
200 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
201 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
202 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
203 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
204 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
205 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
206 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
207 #ifdef HAVE_FFT
208 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
209 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
210 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
211 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
212 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
213 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
214 #endif
215 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
216 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
217 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
218 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
219 #ifdef HAVE_FFT
220 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
221 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
222 #endif
223 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
224 END_EVENT_TABLE()
225
226 ImageFileView::ImageFileView() 
227 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
228 {
229   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
230 }
231
232 ImageFileView::~ImageFileView()
233 {
234   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
235   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
236 }
237
238 void
239 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
240 {
241   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
242   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
243     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
244   else {
245     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
246     std::ostringstream os;
247     double min, max, mean, mode, median, stddev;
248     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
249     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
250     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
251     os << "Data type: ";
252     if (rIF.isComplex())
253       os << "Complex\n";
254     else
255       os << "Real\n";
256     os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
257     if (rIF.isComplex()) {
258       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
259       os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
260     }
261     if (rIF.nLabels() > 0) {
262       os << "\n";
263       rIF.printLabelsBrief (os);
264     }
265     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
266     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
267     dialogMsg.ShowModal();
268   }
269 }
270
271 void 
272 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
273 {
274   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
275   double min, max, mean, mode, median, stddev;
276   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
277   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
278   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
279   if (iRetVal == wxID_OK) {
280     m_bMinSpecified = true;
281     m_bMaxSpecified = true;
282     double dMin, dMax;
283     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
284       m_dMinPixel = dMin;
285       m_dMaxPixel = dMax;
286       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
287       OnUpdate (this, NULL);
288     }
289   }
290 }
291
292 void 
293 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
294 {
295   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
296   double min, max;
297   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
298     rIF.getMinMax (min, max);
299   
300   if (m_bMinSpecified)
301     min = m_dMinPixel;
302   if (m_bMaxSpecified)
303     max = m_dMaxPixel;
304   
305   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
306   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
307   if (retVal == wxID_OK) {
308     m_bMinSpecified = true;
309     m_bMaxSpecified = true;
310     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
311     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
312     OnUpdate (this, NULL);
313   }
314 }
315
316 void 
317 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
318 {
319   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
320     m_bMinSpecified = false;
321     m_bMaxSpecified = false;
322     OnUpdate (this, NULL);
323   }
324 }
325
326 void
327 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
328 {
329   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
330   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
331   
332   if (vecIF.size() == 0) {
333     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
334   } else {
335     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
336     
337     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
338       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
339       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
340       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
341       std::ostringstream os;
342       double min, max, mean, mode, median, stddev;
343       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
344       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
345       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
346       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
347       os << "\n";
348       double d, r, e;
349       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
350       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
351       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
352       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
353         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
354         if (! pDifferenceDoc) {
355           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
356           return;
357         }
358         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();
359         
360         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
361         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {
362           pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
363           return;
364         }
365         
366         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
367         differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
368         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
369         differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
370         std::ostringstream osLabel;
371         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() 
372           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
373           << os.str().c_str();
374         differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());
375         if (theApp->getSetModifyNewDocs())
376           pDifferenceDoc->Modify(true);
377         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
378         pDifferenceDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
379         pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
380       }
381       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
382     }
383   }
384 }
385
386 void
387 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
388 {
389   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
390   rIF.invertPixelValues (rIF);
391   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
392   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
393     GetDocument()->Modify(TRUE);
394   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
395 }
396
397 void
398 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
399 {
400   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
401   rIF.square (rIF);
402   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
403   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
404     GetDocument()->Modify(TRUE);
405   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
406 }
407
408 void
409 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
410 {
411   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
412   rIF.sqrt (rIF);
413   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
414   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
415     GetDocument()->Modify(TRUE);
416   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
417 }
418
419 void
420 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
421 {
422   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
423   rIF.log (rIF);
424   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
425   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
426     GetDocument()->Modify(TRUE);
427   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
428 }
429
430 void
431 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
432 {
433   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
434   rIF.exp (rIF);
435   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
436   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
437     GetDocument()->Modify(TRUE);
438   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
439 }
440
441 void
442 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
443 {
444   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
445   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
446   
447   if (vecIF.size() == 0) {
448     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
449   } else {
450     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
451     
452     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
453       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
454       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
455       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
456       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
457       if (! pNewDoc) {
458         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
459         return;
460       }
461       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
462       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
463       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
464       std::ostringstream os;
465       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
466         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
467       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
468       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
469       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
470       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
471       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
472       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
473       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
474         pNewDoc->Modify(TRUE);
475       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
476       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
477       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
478     }
479   }
480 }
481
482 void
483 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
484 {
485   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
486   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
487   
488   if (vecIF.size() == 0) {
489     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
490   } else {
491     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
492     
493     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
494       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
495       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
496       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
497       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
498       if (! pNewDoc) {
499         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
500         return;
501       }
502       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
503       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
504       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
505       std::ostringstream os;
506       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
507         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
508       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
509       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
510       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
511       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
512       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
513       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
514       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
515         pNewDoc->Modify(TRUE);
516       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
517       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
518       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
519     }
520   }
521 }
522
523 void
524 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
525 {
526   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
527   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
528   
529   if (vecIF.size() == 0) {
530     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
531   } else {
532     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
533     
534     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
535       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
536       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
537       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
538       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
539       if (! pNewDoc) {
540         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
541         return;
542       }
543       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
544       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
545       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
546       std::ostringstream os;
547       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
548         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
549       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
550       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
551       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
552       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
553       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
554       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
555       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
556         pNewDoc->Modify(TRUE);
557       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
558       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
559       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
560     }
561   }
562 }
563
564 void
565 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
566 {
567   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
568   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
569   
570   if (vecIF.size() == 0) {
571     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
572   } else {
573     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
574     
575     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
576       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
577       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
578       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
579       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
580       if (! pNewDoc) {
581         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
582         return;
583       }
584       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
585       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
586       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
587       std::ostringstream os;
588       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by " 
589         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
590       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
591       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
592       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
593       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
594       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
595       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
596       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
597         pNewDoc->Modify(TRUE);
598       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
599       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
600       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
601     }
602   }
603 }
604
605
606 #ifdef HAVE_FFT
607 void
608 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
609 {
610   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
611   rIF.fft (rIF);
612   rIF.labelAdd ("FFT Image");
613   m_bMinSpecified = false;
614   m_bMaxSpecified = false;
615   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
616     GetDocument()->Modify(TRUE);
617   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
618 }
619
620 void
621 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
622 {
623   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
624   rIF.ifft (rIF);
625   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
626   m_bMinSpecified = false;
627   m_bMaxSpecified = false;
628   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
629     GetDocument()->Modify(TRUE);
630   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
631 }
632
633 void
634 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
635 {
636   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
637   rIF.fftRows (rIF);
638   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
639   m_bMinSpecified = false;
640   m_bMaxSpecified = false;
641   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
642     GetDocument()->Modify(TRUE);
643   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
644 }
645
646 void
647 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
648 {
649   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
650   rIF.ifftRows (rIF);
651   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
652   m_bMinSpecified = false;
653   m_bMaxSpecified = false;
654   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
655     GetDocument()->Modify(TRUE);
656   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
657 }
658
659 void
660 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
661 {
662   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
663   rIF.fftCols (rIF);
664   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
665   m_bMinSpecified = false;
666   m_bMaxSpecified = false;
667   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
668     GetDocument()->Modify(TRUE);
669   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
670 }
671
672 void
673 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
674 {
675   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
676   rIF.ifftCols (rIF);
677   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
678   m_bMinSpecified = false;
679   m_bMaxSpecified = false;
680   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
681     GetDocument()->Modify(TRUE);
682   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
683 }
684 #endif
685
686 void
687 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
688 {
689   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
690   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
691   rIF.fourier (rIF);
692   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
693   m_bMinSpecified = false;
694   m_bMaxSpecified = false;
695   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
696     GetDocument()->Modify(TRUE);
697   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
698 }
699
700 void
701 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
702 {
703   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
704   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
705   rIF.inverseFourier (rIF);
706   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
707   m_bMinSpecified = false;
708   m_bMaxSpecified = false;
709   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
710     GetDocument()->Modify(TRUE);
711   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
712 }
713
714 void
715 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
716 {
717   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
718   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
719   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
720   m_bMinSpecified = false;
721   m_bMaxSpecified = false;
722   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
723     GetDocument()->Modify(TRUE);
724   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
725 }
726
727 void
728 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
729 {
730   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
731   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
732   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
733   m_bMinSpecified = false;
734   m_bMaxSpecified = false;
735   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
736     GetDocument()->Modify(TRUE);
737   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
738 }
739
740 void
741 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
742 {
743   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
744   if (rIF.isComplex()) {
745     rIF.magnitude (rIF);
746     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
747     m_bMinSpecified = false;
748     m_bMaxSpecified = false;
749     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
750       GetDocument()->Modify(TRUE);
751     GetDocument()->UpdateAllViews(this);
752   }
753 }
754
755 void
756 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
757 {
758   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
759   if (rIF.isComplex()) {
760     rIF.phase (rIF);
761     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
762     m_bMinSpecified = false;
763     m_bMaxSpecified = false;
764     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
765       GetDocument()->Modify(TRUE);
766     GetDocument()->UpdateAllViews(this);
767   }
768 }
769
770
771 ImageFileCanvas* 
772 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
773 {
774   ImageFileCanvas* pCanvas;
775   int width, height;
776   parent->GetClientSize(&width, &height);
777   
778   pCanvas = new ImageFileCanvas (dynamic_cast<ImageFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
779   
780   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
781   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
782   pCanvas->Clear();
783   
784   return pCanvas;
785 }
786
787 #if CTSIM_MDI
788 wxDocMDIChildFrame*
789 #else
790 wxDocChildFrame*
791 #endif
792 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
793 {
794 #if CTSIM_MDI
795   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
796 #else
797   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
798 #endif
799   theApp->setIconForFrame (subframe);
800   
801   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
802   
803   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
804   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
805   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
806   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
807   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
808   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
809   
810   m_pFileMenu->AppendSeparator();
811   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
812   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
813   
814   m_pFileMenu->AppendSeparator();
815   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
816   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
817   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
818 #ifdef CTSIM_MDI
819   m_pFileMenu->AppendSeparator();
820   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
821 #endif
822   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
823   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
824   
825   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
826   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
827   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
828   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
829   
830   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
831   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
832   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
833   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
834   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
835   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
836   filter_menu->AppendSeparator();
837 #ifdef HAVE_FFT
838   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2D &FFT");
839   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2D &IFFT");
840   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
841   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
842   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
843   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
844   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");
845   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");
846 #else
847   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
848   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
849 #endif
850   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
851   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
852   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
853   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
854   
855   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
856   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
857   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
858   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
859   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
860   image_menu->AppendSeparator();
861   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
862   
863   wxMenu *analyze_menu = new wxMenu;
864   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
865   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
866   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
867   analyze_menu->AppendSeparator();
868   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
869   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
870   analyze_menu->AppendSeparator();
871   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
872   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
873   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
874   
875   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
876   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
877   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
878   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
879   
880   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
881   
882   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
883   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
884   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
885   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
886   menu_bar->Append(analyze_menu, "&Analyze");
887   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
888   
889   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
890   
891   subframe->Centre(wxBOTH);
892   
893   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
894   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
895   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
896   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
897   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
898   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
899   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
900   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
901   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
902   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
903   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
904   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
905   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
906   
907   return subframe;
908 }
909
910
911 bool 
912 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
913 {
914   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
915      (m_pFrame);
916   
917   m_bMinSpecified = false;
918   m_bMaxSpecified = false;
919   m_dAutoScaleFactor = 1.;
920   
921   int width, height;
922   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
923   m_pFrame->SetTitle("ImageFileView");
924   m_pCanvas = CreateCanvas (this, m_pFrame);
925   
926   int x, y;  // X requires a forced resize
927   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
928   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
929   m_pFrame->SetFocus();
930   m_pFrame->Show(true);
931   Activate(true);
932   
933   return true;
934 }
935
936 void 
937 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
938 {
939   wxSize sizeWindow = m_pFrame->GetClientSize();
940   wxSize sizeBest = m_pCanvas->GetBestSize();
941   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
942     m_pFrame->SetClientSize (sizeBest);
943   
944   if (m_bitmap.Ok())
945     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
946   
947   int xCursor, yCursor;
948   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
949     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
950 }
951
952
953 void 
954 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
955 {
956   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
957   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
958   int nx = rIF.nx();
959   int ny = rIF.ny();
960   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
961     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
962       double min, max;
963       rIF.getMinMax (min, max);
964       if (! m_bMinSpecified)
965         m_dMinPixel = min;
966       if (! m_bMaxSpecified)
967         m_dMaxPixel = max;
968     }
969     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
970     
971     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
972     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
973       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
974         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
975         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
976         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
977         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
978         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
979       }
980     }
981     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
982     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
983     delete imageData;
984     int xSize = nx;
985     int ySize = ny;
986     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
987     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
988     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
989     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
990   } 
991   
992   if (m_pCanvas)
993     m_pCanvas->Refresh();
994 }
995
996 bool 
997 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
998 {
999   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1000     return false;
1001   
1002   if (m_pCanvas) {
1003 //    m_pCanvas->Show(false);
1004 //    m_pCanvas->Clear();
1005     m_pCanvas->setView(NULL);
1006     m_pCanvas = NULL;
1007   }
1008   wxString s(theApp->GetAppName());
1009   if (m_pFrame)
1010     m_pFrame->SetTitle(s);
1011   
1012   SetFrame(NULL);
1013   Activate(false);
1014
1015   if (deleteWindow) {
1016     m_pFrame->Show(false);
1017     //m_pFrame->Close(true);
1018     m_pFrame->Destroy();
1019   //      delete m_pFrame;
1020     m_pFrame = NULL;
1021   }
1022   return true;
1023 }
1024
1025 void
1026 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1027 {
1028   ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1029   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1030   int nx = rIF.nx();
1031   int ny = rIF.ny();
1032   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1033     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1034       double min, max;
1035       rIF.getMinMax (min, max);
1036       if (! m_bMinSpecified)
1037         m_dMinPixel = min;
1038       if (! m_bMaxSpecified)
1039         m_dMaxPixel = max;
1040     }
1041     
1042     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1043     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1044       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1045       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1046       
1047       wxString strExt;
1048       wxString strWildcard;
1049       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
1050         strExt = ".pgm";
1051         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1052       }
1053 #ifdef HAVE_PNG
1054       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
1055         strExt = ".png";
1056         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1057       }
1058 #endif
1059       
1060       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""), 
1061         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1062       if (strFilename) {
1063         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1064         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1065       }
1066     }
1067   }
1068 }
1069
1070 void
1071 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1072 {
1073   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1074   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1075   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1076   
1077   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1078   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1079     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1080     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1081     std::ostringstream os;
1082     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1083     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1084     if (! pScaledDoc) {
1085       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1086       return;
1087     }
1088     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1089     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1090     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1091     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1092     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1093     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1094     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1095       pScaledDoc->Modify(TRUE);
1096     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1097     pScaledDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1098     pScaledDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1099   }
1100 }
1101
1102 void
1103 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1104 {
1105   int xCursor, yCursor;
1106   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1107     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1108     return;
1109   }
1110   
1111   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1112   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1113   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1114   int nx = rIF.nx();
1115   int ny = rIF.ny();
1116   
1117   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1118     double* pX = new double [nx];
1119     double* pYReal = new double [nx];
1120     double *pYImag = NULL;
1121     double *pYMag = NULL;
1122     if (rIF.isComplex()) {
1123       pYImag = new double [nx];
1124       pYMag = new double [nx];
1125     }
1126     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1127       pX[i] = i;
1128       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1129       if (rIF.isComplex()) {
1130         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1131         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1132       }
1133     }
1134     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1135     if (! pPlotDoc) {
1136       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1137     } else {
1138       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1139       std::ostringstream os;
1140       os << "Row " << yCursor;
1141       std::string title("title ");
1142       title += os.str();
1143       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1144       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1145       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1146       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1147       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1148       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1149       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1150       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1151       if (rIF.isComplex()) {
1152         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1153         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1154         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1155         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1156         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1157         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1158         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1159         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1160       } else
1161         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1162       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1163       rPlotFile.addColumn (1, pYReal); 
1164       if (rIF.isComplex()) {
1165         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1166         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1167       }
1168       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1169         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1170       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1171       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1172       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1173     }
1174     delete pX;
1175     delete pYReal;
1176     if (rIF.isComplex()) {
1177       delete pYImag;
1178       delete pYMag;
1179     }
1180     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1181       pPlotDoc->Modify(true);
1182     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1183   }
1184 }
1185
1186 void
1187 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1188 {
1189   int xCursor, yCursor;
1190   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1191     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1192     return;
1193   }
1194   
1195   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1196   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1197   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1198   int nx = rIF.nx();
1199   int ny = rIF.ny();
1200   
1201   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1202     double* pX = new double [ny];
1203     double* pYReal = new double [ny];
1204     double* pYImag = NULL;
1205     double* pYMag = NULL;
1206     if (rIF.isComplex()) {
1207       pYImag = new double [ny];
1208       pYMag = new double [ny];
1209     }
1210     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1211       pX[i] = i;
1212       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1213       if (rIF.isComplex()) {
1214         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1215         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1216       }
1217     }
1218     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1219     if (! pPlotDoc) {
1220       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1221     } else {
1222       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1223       std::ostringstream os;
1224       os << "Column " << xCursor;
1225       std::string title("title ");
1226       title += os.str();
1227       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1228       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1229       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1230       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1231       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1232       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1233       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1234       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1235       if (rIF.isComplex()) {
1236         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1237         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1238         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1239         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1240         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1241         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1242         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1243         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1244       } else
1245         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1246       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1247       rPlotFile.addColumn (1, pYReal); 
1248       if (rIF.isComplex()) {
1249         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1250         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1251       }
1252       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1253         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1254       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1255       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1256       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1257     }
1258     delete pX;
1259     delete pYReal;
1260     if (rIF.isComplex()) {
1261       delete pYImag;
1262       delete pYMag;
1263     }
1264     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1265       pPlotDoc->Modify(true);
1266     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1267   }
1268 }
1269
1270 #ifdef HAVE_FFT
1271 void
1272 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1273 {
1274   int xCursor, yCursor;
1275   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1276     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1277     return;
1278   }
1279   
1280   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1281   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1282   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1283   int nx = rIF.nx();
1284   int ny = rIF.ny();
1285   
1286   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1287     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1288     
1289     int i;
1290     for (i = 0; i < nx; i++) {
1291       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1292       if (rIF.isComplex())
1293         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1294       else
1295         pcIn[i].im = 0;
1296     }
1297     
1298     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1299     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1300     fftw_destroy_plan (plan);
1301     
1302     double* pX = new double [nx];
1303     double* pYReal = new double [nx];
1304     double* pYImag = new double [nx];
1305     double* pYMag = new double [nx];
1306     for (i = 0; i < nx; i++) {
1307       pX[i] = i;
1308       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1309       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1310       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1311     }
1312     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1313     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1314     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1315     
1316     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1317     if (! pPlotDoc) {
1318       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1319     } else {
1320       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1321       std::ostringstream os;
1322       os << "Row " << yCursor;
1323       std::string title("title ");
1324       title += os.str();
1325       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1326       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1327       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1328       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1329       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1330       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1331       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1332       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1333       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1334       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1335       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1336       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1337       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1338       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1339       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1340       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1341       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1342       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1343       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1344       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1345       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1346         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1347       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1348       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1349       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1350     }
1351     delete pX;
1352     delete pYReal;
1353     delete pYImag;
1354     delete pYMag;
1355     delete [] pcIn;
1356     
1357     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1358       pPlotDoc->Modify(true);
1359     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1360   }
1361 }
1362
1363 void
1364 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1365 {
1366   int xCursor, yCursor;
1367   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1368     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1369     return;
1370   }
1371   
1372   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1373   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1374   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1375   int nx = rIF.nx();
1376   int ny = rIF.ny();
1377   
1378   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1379     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1380     double *pdTemp = new double [ny];
1381     
1382     int i;
1383     for (i = 0; i < ny; i++)
1384       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1385     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1386     for (i = 0; i < ny; i++) 
1387       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1388     
1389     for (i = 0; i < ny; i++) {
1390       if (rIF.isComplex())
1391         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1392       else
1393         pdTemp[i] = 0;
1394     }
1395     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1396     for (i = 0; i < ny; i++)
1397       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1398     
1399     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1400     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1401     fftw_destroy_plan (plan);
1402     
1403     double* pX = new double [ny];
1404     double* pYReal = new double [ny];
1405     double* pYImag = new double [ny];
1406     double* pYMag = new double [ny];
1407     for (i = 0; i < ny; i++) {
1408       pX[i] = i;
1409       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1410       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1411       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1412     }
1413     
1414     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1415     if (! pPlotDoc) {
1416       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1417     } else {
1418       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1419       std::ostringstream os;
1420       os << "Column " << xCursor;
1421       std::string title("title ");
1422       title += os.str();
1423       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1424       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1425       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1426       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1427       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1428       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1429       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1430       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1431       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1432       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1433       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1434       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1435       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1436       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1437       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1438       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1439       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1440       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1441       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1442       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1443       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1444         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1445       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1446       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1447       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1448     }
1449     delete pX;
1450     delete pYReal;
1451     delete pYImag;
1452     delete pYMag;
1453     delete pdTemp;
1454     delete [] pcIn;
1455     
1456     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1457       pPlotDoc->Modify(true);
1458     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1459   }
1460 }
1461 #endif
1462
1463 void
1464 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1465 {
1466   int xCursor, yCursor;
1467   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1468     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1469     return;
1470   }
1471   
1472   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1473   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1474   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1475     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1476     return;
1477   }
1478   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1479   
1480   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1481     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1482     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1483     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1484     
1485     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1486     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1487     int nx = rIF.nx();
1488     int ny = rIF.ny();
1489     
1490     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1491       double* pX = new double [ny];
1492       double* pY1 = new double [ny];
1493       double* pY2 = new double [ny];
1494       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1495         pX[i] = i;
1496         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1497         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1498       }
1499       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1500       if (! pPlotDoc) {
1501         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1502       } else {
1503         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1504         std::ostringstream os;
1505         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1506         std::string title("title ");
1507         title += os.str();
1508         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1509         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1510         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1511         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1512         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1513         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1514         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1515         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1516         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1517         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1518         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1519         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1520         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1521         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1522         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1523         
1524         unsigned int iL;
1525         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1526           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1527           s += ": ";
1528           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1529           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1530         }
1531         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1532           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1533           s += ": ";
1534           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1535           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1536         }
1537         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1538           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1539         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1540         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1541       }
1542       delete pX;
1543       delete pY1;
1544       delete pY2;
1545       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1546         pPlotDoc->Modify(true);
1547       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1548     }
1549   }
1550 }
1551
1552 void
1553 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1554 {
1555   int xCursor, yCursor;
1556   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1557     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1558     return;
1559   }
1560   
1561   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1562   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1563   
1564   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1565     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1566     return;
1567   }
1568   
1569   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1570   
1571   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1572     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1573     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1574     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1575     
1576     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1577     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1578     int nx = rIF.nx();
1579     int ny = rIF.ny();
1580     
1581     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1582       double* pX = new double [nx];
1583       double* pY1 = new double [nx];
1584       double* pY2 = new double [nx];
1585       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1586         pX[i] = i;
1587         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1588         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1589       }
1590       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1591       if (! pPlotDoc) {
1592         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1593       } else {
1594         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1595         std::ostringstream os;
1596         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1597         std::string title("title ");
1598         title += os.str();
1599         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1600         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1601         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1602         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1603         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1604         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1605         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1606         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1607         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1608         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1609         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1610         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1611         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1612         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1613         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1614         unsigned int iL;
1615         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1616           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1617           s += ": ";
1618           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1619           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1620         }
1621         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1622           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1623           s += ": ";
1624           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1625           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1626         }
1627         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1628           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1629         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1630         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1631       }
1632       delete pX;
1633       delete pY1;
1634       delete pY2;
1635       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1636         pPlotDoc->Modify(true);
1637       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1638     }
1639   }
1640 }
1641
1642 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1643
1644 void
1645 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1646
1647   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1648   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1649   int nx = rIF.nx();
1650   int ny = rIF.ny();
1651   
1652   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1653     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1654     if (! pPlotDoc) {
1655       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1656       return;
1657     }
1658     
1659     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1660     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1661     double dMin, dMax;
1662     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1663     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1664     
1665     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1666       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1667       pY[i] = 0;
1668     }
1669     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1670       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1671         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1672         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1673           pY[iBin] += 1;
1674       }
1675       
1676       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1677       std::ostringstream os;
1678       os << "Histogram";
1679       std::string title("title ");
1680       title += os.str();
1681       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1682       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1683       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1684       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1685       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1686       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1687       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1688       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1689       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1690         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1691         s += ": ";
1692         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1693         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1694       }
1695       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1696       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1697       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1698       delete pX;
1699       delete pY;
1700       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1701         pPlotDoc->Modify(true);
1702       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1703   }
1704 }
1705
1706
1707 // PhantomCanvas
1708
1709 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1710 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1711 {
1712   m_pView = v;
1713 }
1714
1715 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1716 {
1717   m_pView = NULL;
1718 }
1719
1720 void 
1721 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1722 {
1723   if (m_pView)
1724     m_pView->OnDraw(& dc);
1725 }
1726
1727
1728 // PhantomFileView
1729
1730 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
1731
1732 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
1733 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
1734 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
1735 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
1736 END_EVENT_TABLE()
1737
1738 PhantomFileView::PhantomFileView() 
1739 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
1740 {
1741 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
1742   m_iDefaultNDet = 165;
1743   m_iDefaultNView = 180;
1744 #else
1745   m_iDefaultNDet = 367;
1746   m_iDefaultNView = 320;
1747 #endif
1748   m_iDefaultNSample = 1;
1749   m_dDefaultRotation = 1;
1750   m_dDefaultFocalLength = 2;
1751   m_dDefaultFieldOfView = 1;
1752   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1753   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1754   
1755 #ifdef DEBUG 
1756   m_iDefaultRasterNX = 115;
1757   m_iDefaultRasterNY = 115;
1758   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1759 #else
1760   m_iDefaultRasterNX = 256;
1761   m_iDefaultRasterNY = 256;
1762   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1763 #endif
1764 }
1765
1766 PhantomFileView::~PhantomFileView()
1767 {
1768   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
1769   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
1770 }
1771
1772 void
1773 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1774 {
1775   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1776   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1777   std::ostringstream os;
1778   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1779   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1780   rPhantom.printDefinitions (os);
1781 #if DEBUG
1782   rPhantom.print (os);
1783 #endif
1784   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1785   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1786 }
1787
1788
1789 void
1790 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1791 {
1792   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView, m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
1793   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1794   if (retVal == wxID_OK) {
1795     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1796     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1797     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1798     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1799     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1800     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1801     m_dDefaultFieldOfView = dialogProjection.getFieldOfViewRatio();
1802     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1803     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1804     
1805     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1806       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1807       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
1808       if (! pProjectionDoc) {
1809         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1810         return;
1811       }
1812       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
1813       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
1814       if (theScanner.fail()) {
1815         *theApp->getLog() << "Failed making scanner: " << theScanner.failMessage().c_str() << "\n";
1816         return;
1817       }
1818       rProj.initFromScanner (theScanner);
1819       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
1820       
1821       Timer timer;
1822       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1823         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1824         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1825           ::wxYield();
1826           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1827             pProjectionDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
1828             return;
1829           }
1830           ::wxYield();
1831           while (dialogProjections.isPaused()) {
1832             ::wxYield();
1833             ::wxUsleep(50);
1834           }
1835         }
1836       } else {
1837         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1838         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
1839           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1840           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1841             pProjectionDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
1842             return;
1843           }
1844         }
1845       }
1846       
1847       std::ostringstream os;
1848       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
1849       rProj.setCalcTime (timer.timerEnd());
1850       rProj.setRemark (os.str());
1851       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1852       
1853       m_pFrame->Lower();
1854       ::wxYield();
1855       ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());
1856       if (projView) {
1857         projView->getFrame()->SetFocus();
1858         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1859       }
1860       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
1861         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
1862           pFrame->SetFocus();
1863           pFrame->Raise();
1864         }
1865         GetDocumentManager()->ActivateView (pView, true, false);
1866       }
1867       ::wxYield();
1868       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1869         pProjectionDoc->Modify(true);
1870       pProjectionDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1871       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
1872     }
1873   }
1874 }
1875
1876
1877 void
1878 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1879 {
1880   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY, m_iDefaultRasterNSamples);
1881   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1882   if (retVal == wxID_OK) {
1883     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1884     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1885     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1886     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1887       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1888     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1889       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1890       ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
1891       if (! pRasterDoc) {
1892         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1893         return;
1894       }
1895       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
1896       
1897       imageFile.setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNX);
1898       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1899       Timer timer;
1900       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
1901         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1902         if (! dlgProgress.Update(i+1)) {
1903           pRasterDoc->Close();
1904           pRasterDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
1905           return;
1906         }
1907       }
1908       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1909         pRasterDoc->Modify(true);
1910       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
1911       pRasterDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1912       std::ostringstream os;
1913       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize=" 
1914         << m_iDefaultRasterNY << ", nSamples=" << m_iDefaultRasterNSamples;
1915       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1916       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
1917       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());
1918       if (rasterView) {
1919         rasterView->getFrame()->SetFocus();
1920         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
1921       }
1922       
1923     }
1924   }
1925 }
1926
1927
1928 PhantomCanvas* 
1929 PhantomFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1930 {
1931   PhantomCanvas* pCanvas;
1932   int width, height;
1933   parent->GetClientSize(&width, &height);
1934   
1935   pCanvas = new PhantomCanvas (dynamic_cast<PhantomFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1936   
1937   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1938   pCanvas->Clear();
1939   
1940   return pCanvas;
1941 }
1942
1943 #if CTSIM_MDI
1944 wxDocMDIChildFrame*
1945 #else
1946 wxDocChildFrame*
1947 #endif
1948 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1949 {
1950 #if CTSIM_MDI
1951   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1952 #else
1953   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1954 #endif
1955   theApp->setIconForFrame (subframe);
1956   
1957   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
1958   
1959   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
1960   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
1961   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
1962   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1963   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1964   
1965   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1966   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1967   
1968   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1969   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1970   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1971   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1972 #ifdef CTSIM_MDI
1973   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1974   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
1975 #endif
1976   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
1977   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
1978   
1979   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
1980   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
1981   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
1982   
1983   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1984   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
1985   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
1986   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1987   
1988   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1989   
1990   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
1991   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
1992   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1993   
1994   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1995   subframe->Centre(wxBOTH);
1996   
1997   wxAcceleratorEntry accelEntries[8];
1998   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
1999   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2000   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2001   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2002   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2003   accelEntries[5].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2004   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2005   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2006   wxAcceleratorTable accelTable (8, accelEntries);
2007   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2008   
2009   return subframe;
2010 }
2011
2012
2013 bool 
2014 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2015 {
2016   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2017   SetFrame(m_pFrame);
2018   
2019   int width, height;
2020   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2021   m_pFrame->SetTitle("PhantomFileView");
2022   m_pCanvas = CreateCanvas (this, m_pFrame);
2023   
2024 #ifdef __X__
2025   int x, y;  // X requires a forced resize
2026   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2027   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2028 #endif
2029   
2030   m_pFrame->Show(true);
2031   Activate(true);
2032   
2033   return true;
2034 }
2035
2036 void 
2037 PhantomFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2038 {
2039   if (m_pCanvas)
2040     m_pCanvas->Refresh();
2041 }
2042
2043 bool 
2044 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2045 {
2046   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2047     return false;
2048   
2049   if (m_pCanvas) {
2050     //m_pCanvas->Show(false);
2051     //m_pCanvas->Clear();
2052     m_pCanvas->setView(NULL);
2053     m_pCanvas = NULL;
2054   }
2055   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2056   if (m_pFrame)
2057     m_pFrame->SetTitle(s);
2058   
2059   SetFrame(NULL);
2060   Activate(false);
2061   
2062   if (deleteWindow) {
2063     m_pFrame->Show(false);
2064      m_pFrame->Destroy();
2065     //GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
2066      //  delete m_pFrame;
2067     m_pFrame = NULL;
2068   }
2069   
2070   return true;
2071 }
2072
2073 void
2074 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2075 {
2076   int xsize, ysize;
2077   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2078   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2079   SGP sgp (driver);
2080   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2081   sgp.setColor (C_RED);
2082   rPhantom.show (sgp);
2083 }
2084
2085 // ProjectionCanvas
2086
2087 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2088 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2089 {
2090   m_pView = v;
2091 }
2092
2093 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2094 {
2095   m_pView = NULL;
2096 }
2097
2098 void 
2099 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2100 {
2101   if (m_pView)
2102     m_pView->OnDraw(& dc);
2103 }
2104
2105 wxSize
2106 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2107 {
2108   wxSize best (0, 0);
2109   if (m_pView) {
2110     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2111     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2112   }
2113   
2114   return best;
2115 }
2116
2117
2118 // ProjectionFileView
2119
2120 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2121
2122 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2123 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2124 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2125 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2126 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2127 END_EVENT_TABLE()
2128
2129 ProjectionFileView::ProjectionFileView() 
2130 : wxView(), m_pCanvas(NULL), m_pFrame(NULL), m_pFileMenu(0)
2131 {
2132 #ifdef DEBUG
2133   m_iDefaultNX = 115;
2134   m_iDefaultNY = 115;
2135 #else
2136   m_iDefaultNX = 256;
2137   m_iDefaultNY = 256;
2138 #endif
2139
2140   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2141   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2142 #if HAVE_FFTW
2143   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2144   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2145 #else
2146   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2147   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2148 #endif
2149   m_iDefaultZeropad = 1;
2150   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF3;
2151   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2152   m_iDefaultInterpParam = 1;
2153   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2154   
2155   m_iDefaultPolarNX = 256;
2156   m_iDefaultPolarNY = 256;
2157   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2158   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2159 }
2160
2161 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2162 {
2163   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2164   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2165 }
2166
2167 void
2168 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2169 {
2170   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2171   std::ostringstream os;
2172   rProj.printScanInfo(os);
2173   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2174   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2175   dialogMsg.ShowModal();
2176 }
2177
2178
2179 void
2180 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2181 {
2182   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2183   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2184     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2185   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2186     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2187     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2188     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2189     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2190     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2191     if (! pPolarDoc) {
2192       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2193       return;
2194     }
2195     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2196     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2197     rProj.convertPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation);
2198     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2199     std::ostringstream os;
2200     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize=" 
2201       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation=" 
2202       << strInterpolation.c_str();
2203     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2204     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2205     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2206       pPolarDoc->Modify(true);
2207     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2208     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2209     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2210   }
2211 }
2212
2213 void
2214 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2215 {
2216   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2217   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2218     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2219   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2220     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2221     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2222     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2223     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2224     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2225     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2226     if (! pPolarDoc) {
2227       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2228       return;
2229     }
2230     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2231     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2232     rProj.convertFFTPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2233     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2234     std::ostringstream os;
2235     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize=" 
2236       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation=" 
2237       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2238     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2239     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2240     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2241       pPolarDoc->Modify(true);
2242     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2243     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2244     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2245   }
2246 }
2247
2248 void
2249 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2250 {
2251   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2252 }
2253
2254 void
2255 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2256 {
2257   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration, m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector, m_iDefaultTrace);
2258   
2259   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2260   if (retVal == wxID_OK) {
2261     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2262     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2263     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2264     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2265     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2266     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2267     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2268     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2269     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2270     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2271     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2272     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2273     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2274     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2275     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2276     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2277     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2278       ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2279       if (! pReconDoc) {
2280         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2281         return;
2282       }
2283       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
2284       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2285       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2286       
2287       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2288       
2289       Timer timerRecon;
2290       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2291         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2292         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2293           ::wxYield();
2294           ::wxYield();
2295           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView)) {
2296             delete pDlgReconstruct;
2297             delete pReconstruct;
2298             pReconDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
2299             return;
2300           }
2301           ::wxYield();
2302           ::wxYield();
2303           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2304             ::wxYield();
2305             ::wxUsleep(50);
2306           }
2307         }
2308         delete pDlgReconstruct;
2309       } else {
2310         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
2311         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
2312           pReconstruct->reconstructView (i, 1);
2313           if (! dlgProgress.Update(i + 1)) {
2314             delete pReconstruct;
2315             pReconDoc->getView()->getFrame()->Close(true);
2316             return;
2317           }
2318         }
2319       }
2320       delete pReconstruct;
2321       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2322         pReconDoc->Modify(true);
2323       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
2324       pReconDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2325       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());
2326       if (rasterView) {
2327         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2328         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2329       }
2330       std::ostringstream os;
2331       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2332       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2333       imageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
2334       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2335     }
2336   }
2337 }
2338
2339
2340 ProjectionFileCanvas* 
2341 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2342 {
2343   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2344   int width, height;
2345   parent->GetClientSize(&width, &height);
2346   
2347   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (dynamic_cast<ProjectionFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2348   
2349   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2350   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2351   pCanvas->Clear();
2352   
2353   return pCanvas;
2354 }
2355
2356 #if CTSIM_MDI
2357 wxDocMDIChildFrame*
2358 #else
2359 wxDocChildFrame*
2360 #endif
2361 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2362 {
2363 #ifdef CTSIM_MDI
2364   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2365 #else
2366   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2367 #endif
2368   theApp->setIconForFrame (subframe);
2369   
2370   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2371   
2372   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2373   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2374   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2375   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2376   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2377   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2378   
2379   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2380   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2381   
2382   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2383   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2384   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2385   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2386 #ifdef CTSIM_MDI
2387   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2388   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2389 #endif
2390   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2391   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2392   
2393   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2394   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2395   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-I");
2396   
2397   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2398   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R");
2399   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E");
2400   
2401   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2402   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2403   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2404   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2405   
2406   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2407   
2408   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
2409   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2410   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2411   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2412   
2413   subframe->SetMenuBar(menu_bar);  
2414   subframe->Centre(wxBOTH);
2415   
2416   wxAcceleratorEntry accelEntries[11];
2417   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2418   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2419   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2420   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2421   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2422   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2423   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2424   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2425   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2426   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2427   accelEntries[10].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2428   wxAcceleratorTable accelTable (11, accelEntries);
2429   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2430   
2431   return subframe;
2432 }
2433
2434
2435 bool 
2436 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2437 {
2438   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2439   SetFrame(m_pFrame);
2440   
2441   int width, height;
2442   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2443   m_pFrame->SetTitle("ProjectionFileView");
2444   m_pCanvas = CreateCanvas(this, m_pFrame);
2445   
2446 #ifdef __X__
2447   int x, y;  // X requires a forced resize
2448   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2449   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2450 #endif
2451   
2452   m_pFrame->Show(true);
2453   Activate(true);
2454   
2455   return true;
2456 }
2457
2458 void 
2459 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2460 {
2461   wxSize clientSize = m_pFrame->GetClientSize();
2462   wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
2463   
2464   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2465     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
2466   
2467   if (m_bitmap.Ok())
2468     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2469 }
2470
2471
2472 void 
2473 ProjectionFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2474 {
2475   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2476   const int nDet = rProj.nDet();
2477   const int nView = rProj.nView();
2478   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2479     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2480     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2481     double min = detval[0];
2482     double max = detval[0];
2483     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2484       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2485       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2486       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2487         if (min > detval[ix])
2488           min = detval[ix];
2489         else if (max < detval[ix])
2490           max = detval[ix];
2491       }
2492     }
2493     
2494     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2495     double scale = (max - min) / 255;
2496     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2497       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2498       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2499       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2500         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2501         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2502         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2503         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2504       }
2505     }
2506     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2507     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2508     delete imageData;
2509     int xSize = nDet;
2510     int ySize = nView;
2511     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2512     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2513     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
2514     m_pCanvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2515   }
2516   
2517   if (m_pCanvas)
2518     m_pCanvas->Refresh();
2519 }
2520
2521 bool 
2522 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2523 {
2524   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2525     return false;
2526   
2527   if (m_pCanvas) {
2528     //m_pCanvas->Show(false);
2529     //m_pCanvas->Clear();
2530     m_pCanvas->setView(NULL);
2531     m_pCanvas = NULL;
2532   }
2533   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2534   if (m_pFrame)
2535     m_pFrame->SetTitle(s);
2536   
2537   SetFrame(NULL);
2538   Activate(false);
2539   
2540   if (deleteWindow) {
2541     m_pFrame->Show(false);
2542     m_pFrame->Destroy();
2543     // delete m_pFrame;
2544     //m_pFrame->Close(true);
2545     m_pFrame = NULL;
2546   }
2547   return true;
2548 }
2549
2550
2551
2552 // PlotFileCanvas
2553 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2554 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2555 {
2556   m_pView = v;
2557 }
2558
2559 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
2560 {
2561   m_pView = NULL;
2562 }
2563
2564 void 
2565 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2566 {
2567   if (m_pView)
2568     m_pView->OnDraw(& dc);
2569 }
2570
2571
2572 // PlotFileView
2573
2574 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2575
2576 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2577 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2578 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2579 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2580 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2581 END_EVENT_TABLE()
2582
2583 PlotFileView::PlotFileView() 
2584 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
2585 {
2586 }
2587
2588 PlotFileView::~PlotFileView()
2589 {
2590   if (m_pEZPlot)
2591     delete m_pEZPlot;
2592   
2593   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);  
2594 }
2595
2596 void
2597 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2598 {
2599   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2600   std::ostringstream os;
2601   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2602   rPlot.printHeadersBrief (os);
2603   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2604   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2605   dialogMsg.ShowModal();
2606 }
2607
2608
2609 void 
2610 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2611 {
2612   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2613   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2614   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2615   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2616   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2617   if (iRetVal == wxID_OK) {
2618     m_bMinSpecified = true;
2619     m_bMaxSpecified = true;
2620     double dMin, dMax;
2621     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2622       m_dMinPixel = dMin;
2623       m_dMaxPixel = dMax;
2624       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2625       OnUpdate (this, NULL);
2626     }
2627   }
2628 }
2629
2630 void 
2631 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2632 {
2633   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2634   double min;
2635   double max;
2636   
2637   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2638     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2639       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2640       return;
2641     }
2642   }
2643   
2644   if (m_bMinSpecified)
2645     min = m_dMinPixel;
2646   if (m_bMaxSpecified)
2647     max = m_dMaxPixel;
2648   
2649   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2650   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2651   if (retVal == wxID_OK) {
2652     m_bMinSpecified = true;
2653     m_bMaxSpecified = true;
2654     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2655     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2656     OnUpdate (this, NULL);
2657   }
2658 }
2659
2660 void 
2661 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2662 {
2663   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2664     m_bMinSpecified = false;
2665     m_bMaxSpecified = false;
2666     OnUpdate (this, NULL);
2667   }
2668 }
2669
2670
2671 PlotFileCanvas* 
2672 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2673 {
2674   PlotFileCanvas* pCanvas;
2675   int width, height;
2676   parent->GetClientSize(&width, &height);
2677   
2678   pCanvas = new PlotFileCanvas (dynamic_cast<PlotFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2679   
2680   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2681   pCanvas->Clear();
2682   
2683   return pCanvas;
2684 }
2685
2686 #if CTSIM_MDI
2687 wxDocMDIChildFrame*
2688 #else
2689 wxDocChildFrame*
2690 #endif
2691 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2692 {
2693 #ifdef CTSIM_MDI
2694   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2695 #else
2696   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2697 #endif
2698   theApp->setIconForFrame (subframe);
2699   
2700   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2701   
2702   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2703   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2704   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2705   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2706   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2707   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2708   
2709   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2710   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2711   
2712   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2713   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2714   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2715   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2716 #ifdef CTSIM_MDI
2717   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2718   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2719 #endif
2720   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2721   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2722   
2723   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2724   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2725   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2726   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2727   
2728   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2729   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2730   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2731   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2732   
2733   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2734   
2735   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2736   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2737   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2738   
2739   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2740   subframe->Centre(wxBOTH);
2741   
2742   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
2743   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2744   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2745   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2746   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2747   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2748   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2749   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2750   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2751   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2752   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2753   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
2754   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2755   
2756   return subframe;
2757 }
2758
2759
2760 bool 
2761 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2762 {
2763   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2764   SetFrame(m_pFrame);
2765   
2766   m_bMinSpecified = false;
2767   m_bMaxSpecified = false;
2768   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2769   
2770   int width, height;
2771   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2772   m_pFrame->SetTitle ("Plot File");
2773   m_pCanvas = CreateCanvas (this, m_pFrame);
2774   
2775 #ifdef __X__
2776   int x, y;  // X requires a forced resize
2777   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2778   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2779 #endif
2780   
2781   m_pFrame->Show(true);
2782   Activate(true);
2783   
2784   return true;
2785 }
2786
2787 void 
2788 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2789 {
2790   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2791   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2792   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2793   
2794   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2795     int xsize, ysize;
2796     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2797     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2798     SGP sgp (driver);
2799     if (m_pEZPlot)
2800       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2801   }
2802 }
2803
2804
2805 void 
2806 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2807 {
2808   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2809   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2810   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2811   
2812   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2813     if (m_pEZPlot)
2814       delete m_pEZPlot;
2815     m_pEZPlot = new EZPlot;
2816     
2817     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2818       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2819     
2820     if (m_bMinSpecified) {
2821       std::ostringstream os;
2822       os << "ymin " << m_dMinPixel;
2823       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2824     }
2825     
2826     if (m_bMaxSpecified) {
2827       std::ostringstream os;
2828       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2829       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2830     }
2831     
2832     m_pEZPlot->ezset("box");
2833     m_pEZPlot->ezset("grid");
2834     
2835     double* pdXaxis = new double [iNRecords];
2836     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
2837     
2838     double* pdY = new double [iNRecords];
2839     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
2840       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
2841       m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
2842     }
2843     
2844     delete pdXaxis;
2845     delete pdY;
2846   }
2847   
2848   if (m_pCanvas)
2849     m_pCanvas->Refresh();
2850 }
2851
2852 bool 
2853 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2854 {
2855   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2856     return false;
2857   
2858   if (m_pCanvas) {
2859 //    m_pCanvas->Show(false);
2860 //    m_pCanvas->Clear();
2861     m_pCanvas->setView (NULL);
2862     m_pCanvas = NULL;
2863   }
2864   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2865   if (m_pFrame)
2866     m_pFrame->SetTitle(s);
2867   
2868   Activate(false);
2869   
2870   m_pFrame->SetView(NULL);
2871    SetFrame(NULL);
2872   if (deleteWindow) {
2873     m_pFrame->Show(false);
2874      m_pFrame->Destroy();
2875     //m_pFrame->Close(true);
2876     //GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
2877     //    delete m_pFrame;
2878     m_pFrame = NULL;
2879   }
2880   return true;
2881 }
2882
2883
2884 ////////////////////////////////////////////////////////////////
2885
2886
2887 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
2888
2889 TextFileView::~TextFileView() 
2890 {
2891   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2892   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2893 }
2894
2895 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2896 {
2897   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2898   SetFrame (m_pFrame);
2899   
2900   int width, height;
2901   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2902   m_pFrame->SetTitle("TextFile");
2903   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
2904   m_pFrame->SetTitle("Log");
2905   
2906 #ifdef __X__
2907   // X seems to require a forced resize
2908   int x, y;
2909   frame->GetSize(&x, &y);
2910   frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2911 #endif
2912   
2913   m_pFrame->Show (true);
2914   Activate (true);
2915   
2916   return true;
2917 }
2918
2919 // Handled by wxTextWindow
2920 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
2921 {
2922 }
2923
2924 void TextFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2925 {
2926 }
2927
2928 bool 
2929 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2930 {
2931  // if (m_pFrame && m_pFrame->GetTitle() == "Log")
2932     return false;
2933   
2934   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2935     return false;
2936   
2937   m_pCanvas->Show(false);
2938   Activate(false);
2939
2940   SetFrame(NULL);
2941   m_pFrame->SetView(NULL);
2942   if (deleteWindow) {
2943     m_pFrame->Show(false);
2944      m_pFrame->Destroy();
2945     //m_pFrame->Close(true);
2946     //GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
2947     //    delete m_pFrame;
2948     m_pFrame = NULL;
2949     
2950   }
2951   return TRUE;
2952 }
2953
2954 #if CTSIM_MDI
2955 wxDocMDIChildFrame*
2956 #else
2957 wxDocChildFrame*
2958 #endif
2959 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
2960 {
2961 #if CTSIM_MDI
2962   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2963 #else
2964   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2965 #endif
2966   theApp->setIconForFrame (subframe);
2967   
2968   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2969   
2970   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2971   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2972   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2973   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2974   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2975   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2976   
2977   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2978   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2979   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2980   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2981 #ifdef CTSIM_MDI
2982   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2983   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2984 #endif
2985   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2986   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2987   
2988   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2989   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2990   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2991   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2992   
2993   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2994   
2995   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2996   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2997   
2998   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2999   subframe->Centre(wxBOTH);
3000   
3001   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
3002   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
3003   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
3004   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
3005   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
3006   accelEntries[4].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
3007   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
3008   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
3009   
3010   return subframe;
3011 }
3012
3013
3014 // Define a constructor for my text subwindow
3015 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
3016 : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
3017 {
3018 }
3019
3020 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3021 {
3022   m_pView = NULL;
3023 }