src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.69 2001/01/20 17:43:41 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
  29 #include "wx/wxprec.h"
  30
  31 #ifdef __BORLANDC__
  32 #pragma hdrstop
  33 #endif
  34
  35 #ifndef WX_PRECOMP
  36 #include "wx/wx.h"
  37 #endif
  38
  39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  41 #endif
  42
  43 #include "wx/image.h"
  44 #include "wx/progdlg.h"
  45
  46 #include "ct.h"
  47 #include "ctsim.h"
  48 #include "docs.h"
  49 #include "views.h"
  50 #include "dialogs.h"
  51 #include "dlgprojections.h"
  52 #include "dlgreconstruct.h"
  53 #include "backprojectors.h"
  54 #include "reconstruct.h"
  55 #include "timer.h"
  56
  57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  58 #include <sstream>
  59 #else
  60 #include <sstream_subst>
  61 #endif
  62
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 END_EVENT_TABLE()
  69
  70
  71 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  72 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
  73 {
  74   m_pView = v;
  75   m_xCursor = -1;
  76   m_yCursor = -1;
  77 }
  78
  79 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
  80 {
  81   if (m_pView) {
  82     wxMenu* pMenu = m_pView->getFileMenu();
  83     theApp->getDocManager()->FileHistoryRemoveMenu (pMenu);
  84   }
  85 }
  86
  87 void
  88 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  89 {
  90   if (m_pView)
  91     m_pView->OnDraw(& dc);
  92 }
  93
  94 void
  95 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  96 {
  97   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  98   int nx = rIF.nx();
  99   int ny = rIF.ny();
 100
 101   int yPt = ny - y - 1;
 102   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
 103   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
 104   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
 105   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
 106   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
 107 }
 108
 109 bool
 110 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 111 {
 112   x = m_xCursor;
 113   y = m_yCursor;
 114
 115   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 116     return true;
 117   else
 118     return false;
 119 }
 120
 121 void
 122 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 123 {
 124   if (! m_pView)
 125     return;
 126
 127   wxClientDC dc(this);
 128   PrepareDC(dc);
 129
 130   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 131
 132   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 133   if (! pIFDoc)
 134     return;
 135   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 136   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 137   int nx = rIF.nx();
 138   int ny = rIF.ny();
 139   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 140   if (event.RightIsDown()) {
 141     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 142       std::ostringstream os;
 143       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 144       if (rIF.isComplex()) {
 145         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 146         if (dImag < 0)
 147           os << " - " << -dImag;
 148         else
 149           os << " + " << dImag;
 150         os << "i\n";
 151       } else
 152         os << "\n";
 153       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 154     } else
 155       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 156   }
 157   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 158     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 159       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 160         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 161       }
 162       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 163       m_xCursor = pt.x;
 164       m_yCursor = yPt;
 165     } else
 166       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 167   }
 168   if (event.LeftUp()) {
 169     std::ostringstream os;
 170     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 171     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 172   }
 173 }
 174
 175 wxSize
 176 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 177 {
 178   if (! m_pView)
 179     return wxSize(0,0);
 180
 181   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 182   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
 183 }
 184
 185
 186 // ImageFileView
 187
 188 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 189
 190 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 191 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 192 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 193 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 194 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 195 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 196 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 197 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 198 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 199 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 200 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 201 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 202 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 203 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 204 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 205 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 206 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 207 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 208 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 209 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 210 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 211 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 212 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 213 #ifdef HAVE_FFT
 214 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 215 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 216 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 217 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 218 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 219 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 220 #endif
 221 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 222 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 223 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 224 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 225 #ifdef HAVE_FFT
 226 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 227 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 228 #endif
 229 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 230 END_EVENT_TABLE()
 231
 232 ImageFileView::ImageFileView(void)
 233 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false), m_pFileMenu(0)
 234 {
 235   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 236 }
 237
 238 ImageFileView::~ImageFileView(void)
 239 {
 240 }
 241
 242 void
 243 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 244 {
 245   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 246   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 247     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 248   else {
 249     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
 250     std::ostringstream os;
 251     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 252     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 253     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 254     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 255     os << "Data type: ";
 256     if (rIF.isComplex())
 257       os << "Complex\n";
 258     else
 259       os << "Real\n";
 260     os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 261     if (rIF.isComplex()) {
 262       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 263       os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 264     }
 265     if (rIF.nLabels() > 0) {
 266       os << "\n";
 267       rIF.printLabelsBrief (os);
 268     }
 269     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 270     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 271     dialogMsg.ShowModal();
 272   }
 273 }
 274
 275 void
 276 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 277 {
 278   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 279   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 280   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 281   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 282   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 283   if (iRetVal == wxID_OK) {
 284     m_bMinSpecified = true;
 285     m_bMaxSpecified = true;
 286     double dMin, dMax;
 287     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 288       m_dMinPixel = dMin;
 289       m_dMaxPixel = dMax;
 290       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 291       OnUpdate (this, NULL);
 292     }
 293   }
 294 }
 295
 296 void
 297 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 298 {
 299   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 300   double min, max;
 301   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 302     rIF.getMinMax (min, max);
 303
 304   if (m_bMinSpecified)
 305     min = m_dMinPixel;
 306   if (m_bMaxSpecified)
 307     max = m_dMaxPixel;
 308
 309   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 310   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 311   if (retVal == wxID_OK) {
 312     m_bMinSpecified = true;
 313     m_bMaxSpecified = true;
 314     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 315     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 316     OnUpdate (this, NULL);
 317   }
 318 }
 319
 320 void
 321 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 322 {
 323   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 324     m_bMinSpecified = false;
 325     m_bMaxSpecified = false;
 326     OnUpdate (this, NULL);
 327   }
 328 }
 329
 330 void
 331 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 332 {
 333   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 334   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 335
 336   if (vecIF.size() == 0) {
 337     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 338   } else {
 339     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
 340
 341     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 342       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 343       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 344       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 345       std::ostringstream os;
 346       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 347       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 348       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 349       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 350       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 351       os << "\n";
 352       double d, r, e;
 353       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 354       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 355       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 356       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 357         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 358         if (! pDifferenceDoc) {
 359           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 360           return;
 361         }
 362         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();
 363
 364         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 365         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {
 366           pDifferenceDoc->DeleteAllViews();
 367           return;
 368         }
 369
 370         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 371         differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 372         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 373         differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 374         std::ostringstream osLabel;
 375         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 376           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 377           << os.str().c_str();
 378         differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());
 379         if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 380           pDifferenceDoc->Modify(true);
 381         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
 382         pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 383       }
 384       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 385     }
 386   }
 387 }
 388
 389 void
 390 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 391 {
 392   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 393   rIF.invertPixelValues (rIF);
 394   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 395   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 396     GetDocument()->Modify(TRUE);
 397   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 398 }
 399
 400 void
 401 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 402 {
 403   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 404   rIF.square (rIF);
 405   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 406   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 407     GetDocument()->Modify(TRUE);
 408   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 409 }
 410
 411 void
 412 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 413 {
 414   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 415   rIF.sqrt (rIF);
 416   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 417   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 418     GetDocument()->Modify(TRUE);
 419   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 420 }
 421
 422 void
 423 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 424 {
 425   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 426   rIF.log (rIF);
 427   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 428   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 429     GetDocument()->Modify(TRUE);
 430   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 431 }
 432
 433 void
 434 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 435 {
 436   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 437   rIF.exp (rIF);
 438   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 439   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 440     GetDocument()->Modify(TRUE);
 441   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 442 }
 443
 444 void
 445 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 446 {
 447   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 448   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 449
 450   if (vecIF.size() == 0) {
 451     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 452   } else {
 453     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
 454
 455     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 456       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 457       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 458       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 459       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 460       if (! pNewDoc) {
 461         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 462         return;
 463       }
 464       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 465       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 466       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 467       std::ostringstream os;
 468       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 469         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 470       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 471       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 472       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 473       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 474       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 475       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 476       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 477         pNewDoc->Modify(TRUE);
 478       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 479       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 480     }
 481   }
 482 }
 483
 484 void
 485 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 486 {
 487   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 488   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 489
 490   if (vecIF.size() == 0) {
 491     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 492   } else {
 493     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 494
 495     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 496       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 497       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 498       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 499       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 500       if (! pNewDoc) {
 501         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 502         return;
 503       }
 504       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 505       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 506       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 507       std::ostringstream os;
 508       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 509         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 510       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 511       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 512       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 513       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 514       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 515       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 516       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 517         pNewDoc->Modify(TRUE);
 518       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 519       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 520     }
 521   }
 522 }
 523
 524 void
 525 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 526 {
 527   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 528   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 529
 530   if (vecIF.size() == 0) {
 531     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 532   } else {
 533     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 534
 535     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 536       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 537       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 538       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 539       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 540       if (! pNewDoc) {
 541         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 542         return;
 543       }
 544       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 545       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 546       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 547       std::ostringstream os;
 548       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 549         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 550       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 551       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 552       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 553       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 554       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 555       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 556       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 557         pNewDoc->Modify(TRUE);
 558       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 559       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 560     }
 561   }
 562 }
 563
 564 void
 565 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 566 {
 567   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 568   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 569
 570   if (vecIF.size() == 0) {
 571     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 572   } else {
 573     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
 574
 575     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 576       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 577       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 578       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 579       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 580       if (! pNewDoc) {
 581         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 582         return;
 583       }
 584       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 585       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 586       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 587       std::ostringstream os;
 588       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 589         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 590       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 591       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 592       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 593       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 594       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 595       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 596       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 597         pNewDoc->Modify(TRUE);
 598       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 599       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 600     }
 601   }
 602 }
 603
 604
 605 #ifdef HAVE_FFT
 606 void
 607 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 608 {
 609   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 610   rIF.fft (rIF);
 611   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 612   m_bMinSpecified = false;
 613   m_bMaxSpecified = false;
 614   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 615     GetDocument()->Modify(TRUE);
 616   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 617 }
 618
 619 void
 620 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 621 {
 622   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 623   rIF.ifft (rIF);
 624   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 625   m_bMinSpecified = false;
 626   m_bMaxSpecified = false;
 627   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 628     GetDocument()->Modify(TRUE);
 629   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 630 }
 631
 632 void
 633 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 634 {
 635   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 636   rIF.fftRows (rIF);
 637   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 638   m_bMinSpecified = false;
 639   m_bMaxSpecified = false;
 640   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 641     GetDocument()->Modify(TRUE);
 642   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 643 }
 644
 645 void
 646 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 647 {
 648   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 649   rIF.ifftRows (rIF);
 650   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 651   m_bMinSpecified = false;
 652   m_bMaxSpecified = false;
 653   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 654     GetDocument()->Modify(TRUE);
 655   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 656 }
 657
 658 void
 659 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 660 {
 661   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 662   rIF.fftCols (rIF);
 663   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 664   m_bMinSpecified = false;
 665   m_bMaxSpecified = false;
 666   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 667     GetDocument()->Modify(TRUE);
 668   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 669 }
 670
 671 void
 672 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 673 {
 674   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 675   rIF.ifftCols (rIF);
 676   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 677   m_bMinSpecified = false;
 678   m_bMaxSpecified = false;
 679   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 680     GetDocument()->Modify(TRUE);
 681   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 682 }
 683 #endif
 684
 685 void
 686 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 687 {
 688   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 689   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 690   rIF.fourier (rIF);
 691   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 692   m_bMinSpecified = false;
 693   m_bMaxSpecified = false;
 694   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 695     GetDocument()->Modify(TRUE);
 696   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 697 }
 698
 699 void
 700 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 701 {
 702   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 703   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 704   rIF.inverseFourier (rIF);
 705   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 706   m_bMinSpecified = false;
 707   m_bMaxSpecified = false;
 708   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 709     GetDocument()->Modify(TRUE);
 710   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 711 }
 712
 713 void
 714 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 715 {
 716   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 717   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 718   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 719   m_bMinSpecified = false;
 720   m_bMaxSpecified = false;
 721   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 722     GetDocument()->Modify(TRUE);
 723   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 724 }
 725
 726 void
 727 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 728 {
 729   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 730   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 731   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 732   m_bMinSpecified = false;
 733   m_bMaxSpecified = false;
 734   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 735     GetDocument()->Modify(TRUE);
 736   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 737 }
 738
 739 void
 740 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 741 {
 742   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 743   if (rIF.isComplex()) {
 744     rIF.magnitude (rIF);
 745     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 746     m_bMinSpecified = false;
 747     m_bMaxSpecified = false;
 748     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 749       GetDocument()->Modify(TRUE);
 750     GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 751   }
 752 }
 753
 754 void
 755 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 756 {
 757   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 758   if (rIF.isComplex()) {
 759     rIF.phase (rIF);
 760     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 761     m_bMinSpecified = false;
 762     m_bMaxSpecified = false;
 763     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 764       GetDocument()->Modify(TRUE);
 765     GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 766   }
 767 }
 768
 769
 770 ImageFileCanvas*
 771 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 772 {
 773   ImageFileCanvas* pCanvas;
 774   int width, height;
 775   parent->GetClientSize(&width, &height);
 776
 777   pCanvas = new ImageFileCanvas (dynamic_cast<ImageFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 778
 779   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 780   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 781   pCanvas->Clear();
 782
 783   return pCanvas;
 784 }
 785
 786 wxFrame*
 787 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 788 {
 789 #if CTSIM_MDI
 790   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 791 #else
 792   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 793 #endif
 794   theApp->setIconForFrame (subframe);
 795
 796   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
 797
 798   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
 799   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
 800   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
 801   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
 802   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 803   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
 804
 805   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 806   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
 807   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 808
 809   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 810   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 811   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 812   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
 813 #ifdef CTSIM_MDI
 814   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 815   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
 816 #endif
 817   theApp->getDocManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
 818   theApp->getDocManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
 819
 820   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 821   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
 822   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
 823   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
 824
 825   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 826   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 827   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 828   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 829   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 830   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 831   filter_menu->AppendSeparator();
 832 #ifdef HAVE_FFT
 833   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2D &FFT");
 834   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2D &IFFT");
 835   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 836   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 837   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 838   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 839   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");
 840   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");
 841 #else
 842   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 843   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 844 #endif
 845   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 846   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 847   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 848   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 849
 850   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 851   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 852   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 853   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 854   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 855   image_menu->AppendSeparator();
 856   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 857
 858   wxMenu *analyze_menu = new wxMenu;
 859   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 860   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 861   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 862   analyze_menu->AppendSeparator();
 863   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
 864   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
 865   analyze_menu->AppendSeparator();
 866   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 867   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
 868   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
 869
 870   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 871   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
 872   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
 873   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 874
 875   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 876
 877   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
 878   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 879   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 880   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 881   menu_bar->Append(analyze_menu, "&Analyze");
 882   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 883
 884   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 885
 886   subframe->Centre(wxBOTH);
 887
 888   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
 889   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
 890   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
 891   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
 892   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
 893   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
 894   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
 895   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
 896   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
 897   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
 898   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
 899   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
 900   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
 901
 902   return subframe;
 903 }
 904
 905
 906 bool
 907 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 908 {
 909   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
 910   SetFrame (m_frame);
 911
 912   m_bMinSpecified = false;
 913   m_bMaxSpecified = false;
 914   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 915
 916   int width, height;
 917   m_frame->GetClientSize (&width, &height);
 918   m_frame->SetTitle("ImageFileView");
 919   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
 920
 921   int x, y;  // X requires a forced resize
 922   m_frame->GetSize(&x, &y);
 923   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
 924   m_frame->SetFocus();
 925   m_frame->Show(true);
 926   Activate(true);
 927
 928   return true;
 929 }
 930
 931 void
 932 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 933 {
 934   wxSize sizeWindow = m_frame->GetClientSize();
 935   wxSize sizeBest = m_canvas->GetBestSize();
 936   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
 937     m_frame->SetClientSize (sizeBest);
 938
 939   if (m_bitmap.Ok())
 940     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 941
 942   int xCursor, yCursor;
 943   if (m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 944     m_canvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 945 }
 946
 947
 948 void
 949 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 950 {
 951   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
 952   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 953   int nx = rIF.nx();
 954   int ny = rIF.ny();
 955   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 956     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 957       double min, max;
 958       rIF.getMinMax (min, max);
 959       if (! m_bMinSpecified)
 960         m_dMinPixel = min;
 961       if (! m_bMaxSpecified)
 962         m_dMaxPixel = max;
 963     }
 964     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
 965
 966     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
 967     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
 968       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
 969         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
 970         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
 971         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
 972         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
 973         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
 974       }
 975     }
 976     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
 977     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
 978     delete imageData;
 979     int xSize = nx;
 980     int ySize = ny;
 981     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
 982     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
 983     m_canvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
 984     m_canvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 985   }
 986
 987   if (m_canvas)
 988     m_canvas->Refresh();
 989 }
 990
 991 bool
 992 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
 993 {
 994   if (!GetDocument()->Close())
 995     return false;
 996
 997 //  m_canvas->Clear();
 998 //  m_canvas->setView(NULL);
 999 //  m_canvas = NULL;
1000   wxString s(theApp->GetAppName());
1001   if (m_frame)
1002     m_frame->SetTitle(s);
1003   SetFrame(NULL);
1004
1005   Activate(false);
1006
1007   if (deleteWindow) {
1008     delete m_frame;
1009     return true;
1010   }
1011   return true;
1012 }
1013
1014 void
1015 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1016 {
1017   ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1018   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1019   int nx = rIF.nx();
1020   int ny = rIF.ny();
1021   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1022     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1023       double min, max;
1024       rIF.getMinMax (min, max);
1025       if (! m_bMinSpecified)
1026         m_dMinPixel = min;
1027       if (! m_bMaxSpecified)
1028         m_dMaxPixel = max;
1029     }
1030
1031     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1032     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1033       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1034       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1035
1036       wxString strExt;
1037       wxString strWildcard;
1038       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
1039         strExt = ".pgm";
1040         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1041       }
1042 #ifdef HAVE_PNG
1043       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
1044         strExt = ".png";
1045         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1046       }
1047 #endif
1048
1049       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1050         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1051       if (strFilename) {
1052         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1053         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1054       }
1055     }
1056   }
1057 }
1058
1059 void
1060 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1061 {
1062   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1063   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1064   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1065
1066   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1067   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1068     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1069     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1070     std::ostringstream os;
1071     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1072     ImageFileDocument* pScaledDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1073     if (! pScaledDoc) {
1074       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1075       return;
1076     }
1077     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1078     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1079     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1080     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1081     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1082     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1083     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1084       pScaledDoc->Modify(TRUE);
1085     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1086     pScaledDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
1087   }
1088 }
1089
1090 void
1091 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1092 {
1093   int xCursor, yCursor;
1094   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1095     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1096     return;
1097   }
1098
1099   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1100   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1101   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1102   int nx = rIF.nx();
1103   int ny = rIF.ny();
1104
1105   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1106     double* pX = new double [nx];
1107     double* pYReal = new double [nx];
1108     double *pYImag = NULL;
1109     double *pYMag = NULL;
1110     if (rIF.isComplex()) {
1111       pYImag = new double [nx];
1112       pYMag = new double [nx];
1113     }
1114     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1115       pX[i] = i;
1116       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1117       if (rIF.isComplex()) {
1118         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1119         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1120       }
1121     }
1122     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1123     if (! pPlotDoc) {
1124       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1125     } else {
1126       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1127       std::ostringstream os;
1128       os << "Row " << yCursor;
1129       std::string title("title ");
1130       title += os.str();
1131       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1132       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1133       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1134       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1135       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1136       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1137       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1138       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1139       if (rIF.isComplex()) {
1140         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1141         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1142         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1143         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1144         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1145         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1146         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1147         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1148       } else
1149         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1150       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1151       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1152       if (rIF.isComplex()) {
1153         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1154         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1155       }
1156       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1157         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1158       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1159       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1160       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1161     }
1162     delete pX;
1163     delete pYReal;
1164     if (rIF.isComplex()) {
1165       delete pYImag;
1166       delete pYMag;
1167     }
1168     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1169       pPlotDoc->Modify(true);
1170     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1171   }
1172 }
1173
1174 void
1175 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1176 {
1177   int xCursor, yCursor;
1178   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1179     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1180     return;
1181   }
1182
1183   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1184   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1185   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1186   int nx = rIF.nx();
1187   int ny = rIF.ny();
1188
1189   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1190     double* pX = new double [ny];
1191     double* pYReal = new double [ny];
1192     double* pYImag = NULL;
1193     double* pYMag = NULL;
1194     if (rIF.isComplex()) {
1195       pYImag = new double [ny];
1196       pYMag = new double [ny];
1197     }
1198     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1199       pX[i] = i;
1200       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1201       if (rIF.isComplex()) {
1202         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1203         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1204       }
1205     }
1206     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1207     if (! pPlotDoc) {
1208       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1209     } else {
1210       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1211       std::ostringstream os;
1212       os << "Column " << xCursor;
1213       std::string title("title ");
1214       title += os.str();
1215       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1216       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1217       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1218       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1219       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1220       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1221       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1222       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1223       if (rIF.isComplex()) {
1224         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1225         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1226         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1227         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1228         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1229         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1230         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1231         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1232       } else
1233         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1234       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1235       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1236       if (rIF.isComplex()) {
1237         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1238         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1239       }
1240       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1241         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1242       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1243       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1244       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1245     }
1246     delete pX;
1247     delete pYReal;
1248     if (rIF.isComplex()) {
1249       delete pYImag;
1250       delete pYMag;
1251     }
1252     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1253       pPlotDoc->Modify(true);
1254     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1255   }
1256 }
1257
1258 #ifdef HAVE_FFT
1259 void
1260 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1261 {
1262   int xCursor, yCursor;
1263   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1264     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1265     return;
1266   }
1267
1268   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1269   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1270   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1271   int nx = rIF.nx();
1272   int ny = rIF.ny();
1273
1274   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1275     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1276
1277     int i;
1278     for (i = 0; i < nx; i++) {
1279       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1280       if (rIF.isComplex())
1281         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1282       else
1283         pcIn[i].im = 0;
1284     }
1285
1286     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1287     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1288     fftw_destroy_plan (plan);
1289
1290     double* pX = new double [nx];
1291     double* pYReal = new double [nx];
1292     double* pYImag = new double [nx];
1293     double* pYMag = new double [nx];
1294     for (i = 0; i < nx; i++) {
1295       pX[i] = i;
1296       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1297       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1298       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1299     }
1300     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1301     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1302     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1303
1304     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1305     if (! pPlotDoc) {
1306       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1307     } else {
1308       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1309       std::ostringstream os;
1310       os << "Row " << yCursor;
1311       std::string title("title ");
1312       title += os.str();
1313       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1314       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1315       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1316       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1317       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1318       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1319       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1320       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1321       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1322       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1323       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1324       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1325       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1326       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1327       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1328       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1329       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1330       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1331       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1332       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1333       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1334         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1335       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1336       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1337       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1338     }
1339     delete pX;
1340     delete pYReal;
1341     delete pYImag;
1342     delete pYMag;
1343     delete [] pcIn;
1344
1345     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1346       pPlotDoc->Modify(true);
1347     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1348   }
1349 }
1350
1351 void
1352 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1353 {
1354   int xCursor, yCursor;
1355   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1356     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1357     return;
1358   }
1359
1360   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1361   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1362   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1363   int nx = rIF.nx();
1364   int ny = rIF.ny();
1365
1366   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1367     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1368     double *pdTemp = new double [ny];
1369
1370     int i;
1371     for (i = 0; i < ny; i++)
1372       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1373     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1374     for (i = 0; i < ny; i++)
1375       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1376
1377     for (i = 0; i < ny; i++) {
1378       if (rIF.isComplex())
1379         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1380       else
1381         pdTemp[i] = 0;
1382     }
1383     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1384     for (i = 0; i < ny; i++)
1385       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1386
1387     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1388     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1389     fftw_destroy_plan (plan);
1390
1391     double* pX = new double [ny];
1392     double* pYReal = new double [ny];
1393     double* pYImag = new double [ny];
1394     double* pYMag = new double [ny];
1395     for (i = 0; i < ny; i++) {
1396       pX[i] = i;
1397       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1398       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1399       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1400     }
1401
1402     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1403     if (! pPlotDoc) {
1404       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1405     } else {
1406       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1407       std::ostringstream os;
1408       os << "Column " << xCursor;
1409       std::string title("title ");
1410       title += os.str();
1411       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1412       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1413       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1414       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1415       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1416       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1417       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1418       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1419       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1420       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1421       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1422       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1423       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1424       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1425       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1426       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1427       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1428       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1429       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1430       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1431       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1432         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1433       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1434       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1435       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1436     }
1437     delete pX;
1438     delete pYReal;
1439     delete pYImag;
1440     delete pYMag;
1441     delete pdTemp;
1442     delete [] pcIn;
1443
1444     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1445       pPlotDoc->Modify(true);
1446     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1447   }
1448 }
1449 #endif
1450
1451 void
1452 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1453 {
1454   int xCursor, yCursor;
1455   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1456     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1457     return;
1458   }
1459
1460   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1461   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1462   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1463     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1464     return;
1465   }
1466   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1467
1468   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1469     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1470     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1471     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1472
1473     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1474     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1475     int nx = rIF.nx();
1476     int ny = rIF.ny();
1477
1478     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1479       double* pX = new double [ny];
1480       double* pY1 = new double [ny];
1481       double* pY2 = new double [ny];
1482       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1483         pX[i] = i;
1484         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1485         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1486       }
1487       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1488       if (! pPlotDoc) {
1489         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1490       } else {
1491         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1492         std::ostringstream os;
1493         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1494         std::string title("title ");
1495         title += os.str();
1496         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1497         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1498         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1499         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1500         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1501         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1502         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1503         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1504         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1505         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1506         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1507         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1508         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1509         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1510         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1511
1512         unsigned int iL;
1513         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1514           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1515           s += ": ";
1516           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1517           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1518         }
1519         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1520           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1521           s += ": ";
1522           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1523           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1524         }
1525         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1526           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1527         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1528         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1529       }
1530       delete pX;
1531       delete pY1;
1532       delete pY2;
1533       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1534         pPlotDoc->Modify(true);
1535       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1536     }
1537   }
1538 }
1539
1540 void
1541 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1542 {
1543   int xCursor, yCursor;
1544   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1545     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1546     return;
1547   }
1548
1549   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1550   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1551
1552   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1553     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1554     return;
1555   }
1556
1557   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1558
1559   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1560     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1561     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1562     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1563
1564     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1565     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1566     int nx = rIF.nx();
1567     int ny = rIF.ny();
1568
1569     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1570       double* pX = new double [nx];
1571       double* pY1 = new double [nx];
1572       double* pY2 = new double [nx];
1573       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1574         pX[i] = i;
1575         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1576         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1577       }
1578       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1579       if (! pPlotDoc) {
1580         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1581       } else {
1582         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1583         std::ostringstream os;
1584         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1585         std::string title("title ");
1586         title += os.str();
1587         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1588         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1589         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1590         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1591         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1592         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1593         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1594         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1595         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1596         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1597         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1598         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1599         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1600         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1601         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1602         unsigned int iL;
1603         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1604           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1605           s += ": ";
1606           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1607           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1608         }
1609         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1610           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1611           s += ": ";
1612           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1613           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1614         }
1615         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1616           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1617         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1618         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1619       }
1620       delete pX;
1621       delete pY1;
1622       delete pY2;
1623       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1624         pPlotDoc->Modify(true);
1625       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1626     }
1627   }
1628 }
1629
1630 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1631
1632 void
1633 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1634 {
1635   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1636   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1637   int nx = rIF.nx();
1638   int ny = rIF.ny();
1639
1640   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1641     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1642     if (! pPlotDoc) {
1643       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1644       return;
1645     }
1646
1647     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1648     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1649     double dMin, dMax;
1650     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1651     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1652
1653     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1654       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1655       pY[i] = 0;
1656     }
1657     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1658       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1659         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1660         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1661           pY[iBin] += 1;
1662       }
1663
1664       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1665       std::ostringstream os;
1666       os << "Histogram";
1667       std::string title("title ");
1668       title += os.str();
1669       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1670       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1671       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1672       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1673       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1674       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1675       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1676       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1677       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1678         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1679         s += ": ";
1680         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1681         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1682       }
1683       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1684       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1685       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1686       delete pX;
1687       delete pY;
1688       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1689         pPlotDoc->Modify(true);
1690       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1691   }
1692 }
1693
1694
1695 // PhantomCanvas
1696
1697 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1698 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1699 {
1700   m_pView = v;
1701 }
1702
1703 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1704 {
1705   if (m_pView) {
1706     wxMenu* pMenu = m_pView->getFileMenu();
1707     theApp->getDocManager()->FileHistoryRemoveMenu (pMenu);
1708   }
1709 }
1710
1711 void
1712 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1713 {
1714   if (m_pView)
1715     m_pView->OnDraw(& dc);
1716 }
1717
1718
1719 // PhantomView
1720
1721 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomView, wxView)
1722
1723 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomView, wxView)
1724 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomView::OnProperties)
1725 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomView::OnRasterize)
1726 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomView::OnProjections)
1727 END_EVENT_TABLE()
1728
1729 PhantomView::PhantomView(void)
1730 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_pFileMenu(0)
1731 {
1732   m_iDefaultNDet = 367;
1733   m_iDefaultNView = 320;
1734   m_iDefaultNSample = 2;
1735   m_dDefaultRotation = 1;
1736   m_dDefaultFocalLength = 2;
1737   m_dDefaultFieldOfView = 1;
1738   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1739   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1740
1741   m_iDefaultRasterNX = 256;
1742   m_iDefaultRasterNY = 256;
1743   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1744 }
1745
1746 PhantomView::~PhantomView()
1747 {
1748 }
1749
1750 void
1751 PhantomView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1752 {
1753   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1754   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1755   std::ostringstream os;
1756   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1757   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1758   rPhantom.printDefinitions (os);
1759 #if DEBUG
1760   rPhantom.print (os);
1761 #endif
1762   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1763   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1764 }
1765
1766
1767 void
1768 PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1769 {
1770   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView, m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
1771   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1772   if (retVal == wxID_OK) {
1773     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1774     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1775     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1776     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1777     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1778     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1779     m_dDefaultFieldOfView = dialogProjection.getFieldOfViewRatio();
1780     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1781     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1782
1783     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1784       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1785       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = dynamic_cast<ProjectionFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.pj", wxDOC_SILENT));
1786       if (! pProjectionDoc) {
1787         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1788         return;
1789       }
1790       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
1791       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
1792       if (theScanner.fail()) {
1793         *theApp->getLog() << "Failed making scanner: " << theScanner.failMessage().c_str() << "\n";
1794         return;
1795       }
1796       rProj.initFromScanner (theScanner);
1797       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
1798
1799       Timer timer;
1800       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1801         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1802         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1803           ::wxYield();
1804           ::wxYield();
1805           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1806             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1807             return;
1808           }
1809           ::wxYield();
1810           ::wxYield();
1811           while (dialogProjections.isPaused()) {
1812             ::wxYield();
1813             ::wxUsleep(50);
1814           }
1815         }
1816       } else {
1817         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1818         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
1819           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1820           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1821             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1822             return;
1823           }
1824         }
1825       }
1826
1827       std::ostringstream os;
1828       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
1829       rProj.setCalcTime (timer.timerEnd());
1830       rProj.setRemark (os.str());
1831       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1832
1833       m_frame->Lower();
1834       ::wxYield();
1835       ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());
1836       if (projView) {
1837         projView->getFrame()->SetFocus();
1838         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1839       }
1840       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
1841         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
1842           pFrame->SetFocus();
1843           pFrame->Raise();
1844         }
1845         theApp->getDocManager()->ActivateView (pView, true, false);
1846       }
1847       ::wxYield();
1848       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1849         pProjectionDoc->Modify(true);
1850       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
1851     }
1852   }
1853 }
1854
1855
1856 void
1857 PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1858 {
1859   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY, m_iDefaultRasterNSamples);
1860   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1861   if (retVal == wxID_OK) {
1862     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1863     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1864     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1865     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1866       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1867     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1868       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1869       ImageFileDocument* pRasterDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1870       if (! pRasterDoc) {
1871         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1872         return;
1873       }
1874       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
1875
1876       imageFile.setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNX);
1877       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1878       Timer timer;
1879       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
1880         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1881         if (! dlgProgress.Update(i+1)) {
1882           pRasterDoc->DeleteAllViews();
1883           return;
1884         }
1885       }
1886       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1887         pRasterDoc->Modify(true);
1888       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
1889       std::ostringstream os;
1890       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
1891         << m_iDefaultRasterNY << ", nSamples=" << m_iDefaultRasterNSamples;
1892       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1893       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
1894       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());
1895       if (rasterView) {
1896         rasterView->getFrame()->SetFocus();
1897         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
1898       }
1899
1900     }
1901   }
1902 }
1903
1904
1905 PhantomCanvas*
1906 PhantomView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1907 {
1908   PhantomCanvas* pCanvas;
1909   int width, height;
1910   parent->GetClientSize(&width, &height);
1911
1912   pCanvas = new PhantomCanvas (dynamic_cast<PhantomView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1913
1914   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1915   pCanvas->Clear();
1916
1917   return pCanvas;
1918 }
1919
1920 wxFrame*
1921 PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1922 {
1923 #if CTSIM_MDI
1924   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1925 #else
1926   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1927 #endif
1928   theApp->setIconForFrame (subframe);
1929
1930   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
1931
1932   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
1933   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
1934   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
1935   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1936   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1937
1938   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1939   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1940
1941   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1942   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1943   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1944   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1945 #ifdef CTSIM_MDI
1946   m_pFileMenu->AppendSeparator();
1947   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
1948 #endif
1949   theApp->getDocManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
1950   theApp->getDocManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
1951
1952   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
1953   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
1954   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
1955
1956   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1957   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
1958   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
1959   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1960
1961   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1962
1963   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
1964   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
1965   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1966
1967   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1968   subframe->Centre(wxBOTH);
1969
1970   wxAcceleratorEntry accelEntries[8];
1971   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
1972   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
1973   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
1974   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
1975   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
1976   accelEntries[5].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
1977   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
1978   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
1979   wxAcceleratorTable accelTable (8, accelEntries);
1980   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
1981
1982   return subframe;
1983 }
1984
1985
1986 bool
1987 PhantomView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1988 {
1989   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
1990   SetFrame(m_frame);
1991
1992   int width, height;
1993   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
1994   m_frame->SetTitle("PhantomView");
1995   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
1996
1997 #ifdef __X__
1998   int x, y;  // X requires a forced resize
1999   m_frame->GetSize(&x, &y);
2000   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2001 #endif
2002
2003   m_frame->Show(true);
2004   Activate(true);
2005
2006   return true;
2007 }
2008
2009 void
2010 PhantomView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2011 {
2012   if (m_canvas)
2013     m_canvas->Refresh();
2014 }
2015
2016 bool
2017 PhantomView::OnClose (bool deleteWindow)
2018 {
2019   if (!GetDocument()->Close())
2020     return false;
2021
2022 //  m_canvas->Clear();
2023 //  m_canvas->setView(NULL);
2024 //  m_canvas = NULL;
2025   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2026   if (m_frame)
2027     m_frame->SetTitle(s);
2028   SetFrame(NULL);
2029
2030   Activate(false);
2031
2032   if (deleteWindow)
2033     delete m_frame;
2034
2035   return true;
2036 }
2037
2038 void
2039 PhantomView::OnDraw (wxDC* dc)
2040 {
2041   int xsize, ysize;
2042   m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2043   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2044   SGP sgp (driver);
2045   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2046   sgp.setColor (C_RED);
2047   rPhantom.show (sgp);
2048 }
2049
2050 // ProjectionCanvas
2051
2052 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2053 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2054 {
2055   m_pView = v;
2056 }
2057
2058 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2059 {
2060   if (m_pView) {
2061     wxMenu* pMenu = m_pView->getFileMenu();
2062     theApp->getDocManager()->FileHistoryRemoveMenu (pMenu);
2063   }
2064 }
2065
2066 void
2067 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2068 {
2069   if (m_pView)
2070     m_pView->OnDraw(& dc);
2071 }
2072
2073 wxSize
2074 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2075 {
2076   wxSize best (0, 0);
2077   if (m_pView) {
2078     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2079     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2080   }
2081
2082   return best;
2083 }
2084
2085
2086 // ProjectionFileView
2087
2088 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2089
2090 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2091 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2092 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2093 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2094 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2095 END_EVENT_TABLE()
2096
2097 ProjectionFileView::ProjectionFileView(void)
2098 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_pFileMenu(0)
2099 {
2100   m_iDefaultNX = 256;
2101   m_iDefaultNY = 256;
2102   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2103   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2104 #if HAVE_FFTW
2105   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2106   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2107 #else
2108   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2109   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2110 #endif
2111   m_iDefaultZeropad = 1;
2112   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF3;
2113   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2114   m_iDefaultInterpParam = 1;
2115   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2116
2117   m_iDefaultPolarNX = 256;
2118   m_iDefaultPolarNY = 256;
2119   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2120   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2121 }
2122
2123 ProjectionFileView::~ProjectionFileView(void)
2124 {
2125 }
2126
2127 void
2128 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2129 {
2130   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2131   std::ostringstream os;
2132   rProj.printScanInfo(os);
2133   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2134   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2135   dialogMsg.ShowModal();
2136 }
2137
2138
2139 void
2140 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2141 {
2142   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2143   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2144     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2145   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2146     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2147     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2148     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2149     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2150     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2151     if (! pPolarDoc) {
2152       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2153       return;
2154     }
2155     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2156     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2157     rProj.convertPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation);
2158     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2159     std::ostringstream os;
2160     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2161       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2162       << strInterpolation.c_str();
2163     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2164     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2165     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2166       pPolarDoc->Modify(true);
2167     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2168     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
2169   }
2170 }
2171
2172 void
2173 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2174 {
2175   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2176   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2177     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2178   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2179     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2180     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2181     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2182     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2183     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2184     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
2185     if (! pPolarDoc) {
2186       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2187       return;
2188     }
2189     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2190     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2191     rProj.convertFFTPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2192     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2193     std::ostringstream os;
2194     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2195       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2196       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2197     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2198     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
2199     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2200       pPolarDoc->Modify(true);
2201     pPolarDoc->UpdateAllViews();
2202     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
2203 }}
2204
2205 void
2206 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2207 {
2208   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2209 }
2210
2211 void
2212 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2213 {
2214   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration, m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector, m_iDefaultTrace);
2215
2216   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2217   if (retVal == wxID_OK) {
2218     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2219     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2220     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2221     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2222     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2223     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2224     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2225     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2226     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2227     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2228     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2229     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2230     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2231     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2232     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2233     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2234     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2235       ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
2236       if (! pReconDoc) {
2237         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2238         return;
2239       }
2240       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
2241       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2242       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2243
2244       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2245
2246       Timer timerRecon;
2247       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2248         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2249         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2250           ::wxYield();
2251           ::wxYield();
2252           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView)) {
2253             delete pDlgReconstruct;
2254             delete pReconstruct;
2255             pReconDoc->DeleteAllViews();
2256             return;
2257           }
2258           ::wxYield();
2259           ::wxYield();
2260           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2261             ::wxYield();
2262             ::wxUsleep(50);
2263           }
2264         }
2265         delete pDlgReconstruct;
2266       } else {
2267         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
2268         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
2269           pReconstruct->reconstructView (i, 1);
2270           if (! dlgProgress.Update(i + 1)) {
2271             delete pReconstruct;
2272             pReconDoc->DeleteAllViews();
2273             return;
2274           }
2275         }
2276       }
2277       delete pReconstruct;
2278       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2279         pReconDoc->Modify(true);
2280       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
2281       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());
2282       if (rasterView) {
2283         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2284         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2285       }
2286       std::ostringstream os;
2287       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2288       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2289       imageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
2290       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2291     }
2292   }
2293 }
2294
2295
2296 ProjectionFileCanvas*
2297 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2298 {
2299   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2300   int width, height;
2301   parent->GetClientSize(&width, &height);
2302
2303   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (dynamic_cast<ProjectionFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2304
2305   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2306   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2307   pCanvas->Clear();
2308
2309   return pCanvas;
2310 }
2311
2312 wxFrame*
2313 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2314 {
2315 #ifdef CTSIM_MDI
2316   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2317 #else
2318   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2319 #endif
2320   theApp->setIconForFrame (subframe);
2321
2322   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2323
2324   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2325   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2326   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2327   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2328   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2329   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2330
2331   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2332   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2333
2334   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2335   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2336   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2337   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2338 #ifdef CTSIM_MDI
2339   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2340   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2341 #endif
2342
2343   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2344   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2345   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-I");
2346
2347   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2348   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R");
2349   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E");
2350
2351   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2352   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2353   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2354   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2355
2356   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2357
2358   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
2359   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2360   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2361   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2362
2363   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2364   subframe->Centre(wxBOTH);
2365
2366   wxAcceleratorEntry accelEntries[11];
2367   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2368   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2369   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2370   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2371   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2372   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2373   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2374   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2375   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2376   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2377   accelEntries[10].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2378   wxAcceleratorTable accelTable (11, accelEntries);
2379   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2380
2381   return subframe;
2382 }
2383
2384
2385 bool
2386 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2387 {
2388   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2389   SetFrame(m_frame);
2390
2391   int width, height;
2392   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2393   m_frame->SetTitle("ProjectionFileView");
2394   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
2395
2396 #ifdef __X__
2397   int x, y;  // X requires a forced resize
2398   m_frame->GetSize(&x, &y);
2399   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2400 #endif
2401
2402   m_frame->Show(true);
2403   Activate(true);
2404
2405   return true;
2406 }
2407
2408 void
2409 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2410 {
2411   wxSize clientSize = m_frame->GetClientSize();
2412   wxSize bestSize = m_canvas->GetBestSize();
2413
2414   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2415     m_frame->SetClientSize (bestSize);
2416
2417   if (m_bitmap.Ok())
2418     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2419 }
2420
2421
2422 void
2423 ProjectionFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2424 {
2425   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2426   const int nDet = rProj.nDet();
2427   const int nView = rProj.nView();
2428   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2429     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2430     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2431     double min = detval[0];
2432     double max = detval[0];
2433     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2434       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2435       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2436       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2437         if (min > detval[ix])
2438           min = detval[ix];
2439         else if (max < detval[ix])
2440           max = detval[ix];
2441       }
2442     }
2443
2444     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2445     double scale = (max - min) / 255;
2446     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2447       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2448       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2449       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2450         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2451         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2452         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2453         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2454       }
2455     }
2456     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2457     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2458     delete imageData;
2459     int xSize = nDet;
2460     int ySize = nView;
2461     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2462     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2463     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
2464     m_canvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2465   }
2466
2467   if (m_canvas)
2468     m_canvas->Refresh();
2469 }
2470
2471 bool
2472 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2473 {
2474   if (!GetDocument()->Close())
2475     return false;
2476
2477 //  m_canvas->Clear();
2478 //  m_canvas->setView(NULL);
2479 //  m_canvas = NULL;
2480   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2481   if (m_frame)
2482     m_frame->SetTitle(s);
2483   SetFrame(NULL);
2484
2485   Activate(false);
2486
2487   if (deleteWindow) {
2488     delete m_frame;
2489     return true;
2490   }
2491   return true;
2492 }
2493
2494
2495
2496 // PlotFileCanvas
2497 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2498 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2499 {
2500   m_pView = v;
2501 }
2502
2503 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
2504 {
2505   if (m_pView) {
2506     wxMenu* pMenu = m_pView->getFileMenu();
2507     theApp->getDocManager()->FileHistoryRemoveMenu (pMenu);
2508   }
2509 }
2510
2511 void
2512 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2513 {
2514   if (m_pView)
2515     m_pView->OnDraw(& dc);
2516 }
2517
2518
2519 // PlotFileView
2520
2521 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2522
2523 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2524 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2525 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2526 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2527 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2528 END_EVENT_TABLE()
2529
2530 PlotFileView::PlotFileView(void)
2531 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0)
2532 {
2533   m_bMinSpecified = false;
2534   m_bMaxSpecified = false;
2535 }
2536
2537 PlotFileView::~PlotFileView(void)
2538 {
2539   if (m_pEZPlot)
2540     delete m_pEZPlot;
2541 }
2542
2543 void
2544 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2545 {
2546   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2547   std::ostringstream os;
2548   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2549   rPlot.printHeadersBrief (os);
2550   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2551   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2552   dialogMsg.ShowModal();
2553 }
2554
2555
2556 void
2557 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2558 {
2559   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2560   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2561   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2562   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2563   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2564   if (iRetVal == wxID_OK) {
2565     m_bMinSpecified = true;
2566     m_bMaxSpecified = true;
2567     double dMin, dMax;
2568     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2569       m_dMinPixel = dMin;
2570       m_dMaxPixel = dMax;
2571       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2572       OnUpdate (this, NULL);
2573     }
2574   }
2575 }
2576
2577 void
2578 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2579 {
2580   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2581   double min;
2582   double max;
2583
2584   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2585     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2586       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2587       return;
2588     }
2589   }
2590
2591   if (m_bMinSpecified)
2592     min = m_dMinPixel;
2593   if (m_bMaxSpecified)
2594     max = m_dMaxPixel;
2595
2596   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2597   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2598   if (retVal == wxID_OK) {
2599     m_bMinSpecified = true;
2600     m_bMaxSpecified = true;
2601     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2602     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2603     OnUpdate (this, NULL);
2604   }
2605 }
2606
2607 void
2608 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2609 {
2610   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2611     m_bMinSpecified = false;
2612     m_bMaxSpecified = false;
2613     OnUpdate (this, NULL);
2614   }
2615 }
2616
2617
2618 PlotFileCanvas*
2619 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2620 {
2621   PlotFileCanvas* pCanvas;
2622   int width, height;
2623   parent->GetClientSize(&width, &height);
2624
2625   pCanvas = new PlotFileCanvas (dynamic_cast<PlotFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2626
2627   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2628   pCanvas->Clear();
2629
2630   return pCanvas;
2631 }
2632
2633 wxFrame*
2634 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2635 {
2636 #ifdef CTSIM_MDI
2637   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2638 #else
2639   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2640 #endif
2641   theApp->setIconForFrame (subframe);
2642
2643   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2644
2645   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2646   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2647   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2648   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2649   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2650   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2651
2652   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2653   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2654
2655   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2656   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2657   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2658   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2659 #ifdef CTSIM_MDI
2660   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2661   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2662 #endif
2663   theApp->getDocManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2664   theApp->getDocManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2665
2666   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2667   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2668   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2669   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2670
2671   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2672   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2673   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2674   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2675
2676   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2677
2678   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2679   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2680   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2681
2682   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2683   subframe->Centre(wxBOTH);
2684
2685   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
2686   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2687   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2688   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2689   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2690   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
2691   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
2692   accelEntries[6].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2693   accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2694   accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2695   accelEntries[9].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2696   wxAcceleratorTable accelTable (10, accelEntries);
2697   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2698
2699   return subframe;
2700 }
2701
2702
2703 bool
2704 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2705 {
2706   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2707   SetFrame(m_frame);
2708
2709   m_bMinSpecified = false;
2710   m_bMaxSpecified = false;
2711   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2712
2713   int width, height;
2714   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2715   m_frame->SetTitle ("Plot File");
2716   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
2717
2718 #ifdef __X__
2719   int x, y;  // X requires a forced resize
2720   m_frame->GetSize(&x, &y);
2721   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2722 #endif
2723
2724   m_frame->Show(true);
2725   Activate(true);
2726
2727   return true;
2728 }
2729
2730 void
2731 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2732 {
2733   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2734   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2735   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2736
2737   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2738     int xsize, ysize;
2739     m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2740     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2741     SGP sgp (driver);
2742     if (m_pEZPlot)
2743       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2744   }
2745 }
2746
2747
2748 void
2749 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2750 {
2751   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2752   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2753   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2754
2755   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2756     if (m_pEZPlot)
2757       delete m_pEZPlot;
2758     m_pEZPlot = new EZPlot;
2759
2760     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2761       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2762
2763     if (m_bMinSpecified) {
2764       std::ostringstream os;
2765       os << "ymin " << m_dMinPixel;
2766       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2767     }
2768
2769     if (m_bMaxSpecified) {
2770       std::ostringstream os;
2771       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2772       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2773     }
2774
2775     m_pEZPlot->ezset("box");
2776     m_pEZPlot->ezset("grid");
2777
2778     double* pdXaxis = new double [iNRecords];
2779     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
2780
2781     double* pdY = new double [iNRecords];
2782     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
2783       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
2784       m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
2785     }
2786
2787     delete pdXaxis;
2788     delete pdY;
2789   }
2790
2791   if (m_canvas)
2792     m_canvas->Refresh();
2793 }
2794
2795 bool
2796 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2797 {
2798   if (!GetDocument()->Close())
2799     return false;
2800
2801 //  m_canvas->Clear();
2802 //  m_canvas->setView (NULL);
2803 //  m_canvas = NULL;
2804   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2805   if (m_frame)
2806     m_frame->SetTitle(s);
2807   SetFrame(NULL);
2808
2809   Activate(false);
2810
2811   if (deleteWindow) {
2812     delete m_frame;
2813     return true;
2814   }
2815   return true;
2816 }
2817
2818
2819 ////////////////////////////////////////////////////////////////
2820
2821
2822 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextEditView, wxView)
2823
2824 TextEditView::~TextEditView()
2825 {
2826   if (m_pFileMenu)
2827     theApp->getDocManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2828 }
2829
2830 bool TextEditView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2831 {
2832   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2833   SetFrame (m_pFrame);
2834
2835   int width, height;
2836   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2837   m_pFrame->SetTitle("TextEdit");
2838   m_pCanvas = new TextEditCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
2839   m_pFrame->SetTitle("Log");
2840
2841 #ifdef __X__
2842   // X seems to require a forced resize
2843   int x, y;
2844   frame->GetSize(&x, &y);
2845   frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2846 #endif
2847
2848   m_pFrame->Show (true);
2849   Activate (true);
2850
2851   return true;
2852 }
2853
2854 // Handled by wxTextWindow
2855 void TextEditView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
2856 {
2857 }
2858
2859 void TextEditView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2860 {
2861 }
2862
2863 bool
2864 TextEditView::OnClose (bool deleteWindow)
2865 {
2866   return false;
2867
2868   if (!GetDocument()->Close())
2869     return false;
2870
2871   Activate(false);
2872
2873   if (deleteWindow)
2874   {
2875     delete m_pFrame;
2876     return TRUE;
2877   }
2878   return TRUE;
2879 }
2880
2881 wxFrame*
2882 TextEditView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
2883 {
2884 #if CTSIM_MDI
2885   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextEdit Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2886 #else
2887   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextEdit Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2888 #endif
2889   theApp->setIconForFrame (subframe);
2890
2891   wxMenu *m_pFileMenu = new wxMenu;
2892
2893   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2894   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2895   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2896   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2897   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2898   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2899
2900   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2901   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2902   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2903   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2904 #ifdef CTSIM_MDI
2905   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2906   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2907 #endif
2908   theApp->getDocManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2909   theApp->getDocManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2910
2911   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2912   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2913   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-H");
2914   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2915
2916   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2917
2918   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2919   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2920
2921   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2922   subframe->Centre(wxBOTH);
2923
2924   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
2925   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
2926   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
2927   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('W'), wxID_CLOSE);
2928   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
2929   accelEntries[4].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
2930   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
2931   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2932
2933   return subframe;
2934 }
2935
2936
2937 // Define a constructor for my text subwindow
2938 TextEditCanvas::TextEditCanvas (TextEditView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
2939   : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
2940 {
2941 }
2942
2943 TextEditCanvas::~TextEditCanvas ()
2944 {
2945   if (m_pView) {
2946     wxMenu* pMenu = m_pView->getFileMenu();
2947     theApp->getDocManager()->FileHistoryRemoveMenu (pMenu);
2948   }
2949 }