src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.127 2001/03/05 20:29:23 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 #include "wx/wxprec.h"
  29 #ifndef WX_PRECOMP
  30 #include "wx/wx.h"
  31 #endif
  32
  33 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  34 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  35 #endif
  36
  37 #include "wx/image.h"
  38 #include "wx/progdlg.h"
  39
  40 #include "ct.h"
  41 #include "ctsim.h"
  42 #include "docs.h"
  43 #include "views.h"
  44 #include "dialogs.h"
  45 #include "dlgprojections.h"
  46 #include "dlgreconstruct.h"
  47 #include "backprojectors.h"
  48 #include "reconstruct.h"
  49 #include "timer.h"
  50 #include "threadproj.h"
  51 #include "threadrecon.h"
  52 #include "threadraster.h"
  53
  54 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  55 #include <sstream>
  56 #else
  57 #include <sstream_subst>
  58 #endif
  59
  60
  61 // ImageFileCanvas
  62
  63 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  64 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  65 EVT_CHAR(ImageFileCanvas::OnChar)
  66 END_EVENT_TABLE()
  67
  68
  69 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  70 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
  71 {
  72 }
  73
  74 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
  75 {
  76   m_pView = NULL;
  77 }
  78
  79 void
  80 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  81 {
  82   if (m_pView)
  83     m_pView->OnDraw(& dc);
  84 }
  85
  86 void
  87 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  88 {
  89   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  90   int nx = rIF.nx();
  91   int ny = rIF.ny();
  92
  93   int yPt = ny - y - 1;
  94   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  95   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  96   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  97   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  98   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
  99 }
 100
 101 bool
 102 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 103 {
 104   x = m_xCursor;
 105   y = m_yCursor;
 106
 107   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 108     return true;
 109   else
 110     return false;
 111 }
 112
 113 void
 114 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 115 {
 116   if (! m_pView)
 117     return;
 118
 119
 120   wxClientDC dc(this);
 121   PrepareDC(dc);
 122
 123   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 124
 125   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 126   if (! pIFDoc)
 127     return;
 128   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 129   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 130   int nx = rIF.nx();
 131   int ny = rIF.ny();
 132   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 133   if (event.RightIsDown()) {
 134     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 135       std::ostringstream os;
 136       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 137       if (rIF.isComplex()) {
 138         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 139         if (dImag < 0)
 140           os << " - " << -dImag;
 141         else
 142           os << " + " << dImag;
 143         os << "i\n";
 144       } else
 145         os << "\n";
 146       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 147     } else
 148       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 149   }
 150   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 151     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 152       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 153         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 154       }
 155       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 156       m_xCursor = pt.x;
 157       m_yCursor = yPt;
 158       wxMenu* pMenu = m_pView->getMenuAnalyze();
 159       if (pMenu && ! pMenu->IsEnabled(IFMENU_PLOT_ROW)) {
 160         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, true);
 161         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_COL, true);
 162         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, true);
 163         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, true);
 164         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, true);
 165         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, true);
 166       }
 167     } else
 168       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 169   }
 170   if (event.LeftUp()) {
 171     std::ostringstream os;
 172     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 173     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 174   }
 175 }
 176
 177 void
 178 ImageFileCanvas::OnChar (wxKeyEvent& event)
 179 {
 180   if (event.GetKeyCode() == WXK_ESCAPE) {
 181     m_xCursor = -1;
 182     m_yCursor = -1;
 183     if (m_pView)
 184       m_pView->OnUpdate (NULL);
 185   } else
 186     wxScrolledWindow::OnChar (event);
 187 }
 188
 189 wxSize
 190 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 191 {
 192   if (! m_pView)
 193     return wxSize(0,0);
 194
 195   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 196   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
 197 }
 198
 199
 200 // ImageFileView
 201
 202 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 203
 204 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 205 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 206 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 207 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 208 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 209 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 210 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 211 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 212 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 213 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 214 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 215 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 216 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 217 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 218 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 219 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 220 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 221 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 222 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 223 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 224 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 225 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 226 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 227 #if wxUSE_GLCANVAS
 228 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, ImageFileView::OnConvert3d)
 229 #endif
 230 #ifdef HAVE_FFT
 231 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 232 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 233 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 234 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 235 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 236 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 237 #endif
 238 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 239 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 240 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 241 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 242 #ifdef HAVE_FFT
 243 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 244 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 245 #endif
 246 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 247 END_EVENT_TABLE()
 248
 249 ImageFileView::ImageFileView()
 250 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 251 {
 252   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG;
 253 }
 254
 255 ImageFileView::~ImageFileView()
 256 {
 257   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
 258   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
 259 }
 260
 261
 262 void
 263 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 264 {
 265   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 266   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 267     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 268   else {
 269     const std::string rFilename = m_pFrame->GetTitle().c_str();
 270     std::ostringstream os;
 271     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 272     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 273     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 274     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 275     os << "Data type: ";
 276     if (rIF.isComplex())
 277       os << "Complex\n";
 278     else
 279       os << "Real\n";
 280     os << "Minimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 281     if (rIF.isComplex()) {
 282       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 283       os << "Imaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 284     }
 285     if (rIF.nLabels() > 0) {
 286       rIF.printLabelsBrief (os);
 287     }
 288     *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 289     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 290     dialogMsg.ShowModal();
 291   }
 292 }
 293
 294 void
 295 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 296 {
 297   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 298   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 299   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 300   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 301   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 302   if (iRetVal == wxID_OK) {
 303     m_bMinSpecified = true;
 304     m_bMaxSpecified = true;
 305     double dMin, dMax;
 306     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 307       m_dMinPixel = dMin;
 308       m_dMaxPixel = dMax;
 309       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 310       OnUpdate (this, NULL);
 311     }
 312   }
 313 }
 314
 315 void
 316 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 317 {
 318   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 319   double min, max;
 320   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 321     rIF.getMinMax (min, max);
 322
 323   if (m_bMinSpecified)
 324     min = m_dMinPixel;
 325   if (m_bMaxSpecified)
 326     max = m_dMaxPixel;
 327
 328   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 329   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 330   if (retVal == wxID_OK) {
 331     m_bMinSpecified = true;
 332     m_bMaxSpecified = true;
 333     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 334     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 335     OnUpdate (this, NULL);
 336   }
 337 }
 338
 339 void
 340 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 341 {
 342   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 343     m_bMinSpecified = false;
 344     m_bMaxSpecified = false;
 345     OnUpdate (this, NULL);
 346   }
 347 }
 348
 349 void
 350 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 351 {
 352   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 353   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 354
 355   if (vecIF.size() == 0) {
 356     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 357   } else {
 358     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
 359
 360     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 361       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 362       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 363       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 364       std::ostringstream os;
 365       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 366       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 367       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 368       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 369       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 370       double d, r, e;
 371       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 372       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 373       *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 374       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 375         ImageFile* pDifferenceImage = new ImageFile;
 376
 377         pDifferenceImage->setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 378         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, *pDifferenceImage)) {
 379           *theApp->getLog() << "Unable to subtract images\n";
 380           delete pDifferenceImage;
 381           return;
 382         }
 383         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
 384         if (! pDifferenceDoc) {
 385           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 386           return;
 387         }
 388         pDifferenceDoc->setImageFile (pDifferenceImage);
 389
 390         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 391         pDifferenceImage->labelsCopy (rIF, s.c_str());
 392         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 393         pDifferenceImage->labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 394         std::ostringstream osLabel;
 395         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 396           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 397           << os.str().c_str();
 398         pDifferenceImage->labelAdd (os.str().c_str());
 399         if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 400           pDifferenceDoc->Modify (true);
 401         pDifferenceDoc->UpdateAllViews (this);
 402         pDifferenceDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 403         pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 404       }
 405       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 406     }
 407   }
 408 }
 409
 410 void
 411 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 412 {
 413   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 414   rIF.invertPixelValues (rIF);
 415   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 416   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 417     GetDocument()->Modify (true);
 418   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 419 }
 420
 421 void
 422 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 423 {
 424   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 425   rIF.square (rIF);
 426   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 427   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 428     GetDocument()->Modify (true);
 429   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 430 }
 431
 432 void
 433 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 434 {
 435   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 436   rIF.sqrt (rIF);
 437   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 438   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 439     GetDocument()->Modify (true);
 440   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 441 }
 442
 443 void
 444 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 445 {
 446   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 447   rIF.log (rIF);
 448   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 449   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 450     GetDocument()->Modify (true);
 451   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 452 }
 453
 454 void
 455 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 456 {
 457   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 458   rIF.exp (rIF);
 459   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 460   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 461     GetDocument()->Modify (true);
 462   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 463 }
 464
 465 void
 466 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 467 {
 468   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 469   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 470
 471   if (vecIF.size() == 0) {
 472     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 473   } else {
 474     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
 475
 476     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 477       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 478       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 479       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 480       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 481       if (! pNewDoc) {
 482         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 483         return;
 484       }
 485       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 486       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 487       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 488       std::ostringstream os;
 489       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 490         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 491       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 492       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 493       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 494       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 495       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 496       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 497       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 498         pNewDoc->Modify (true);
 499       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 500       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 501       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 502     }
 503   }
 504 }
 505
 506 void
 507 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 508 {
 509   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 510   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 511
 512   if (vecIF.size() == 0) {
 513     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 514   } else {
 515     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 516
 517     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 518       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 519       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 520       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 521       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 522       if (! pNewDoc) {
 523         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 524         return;
 525       }
 526       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 527       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 528       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 529       std::ostringstream os;
 530       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 531         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 532       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 533       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 534       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 535       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 536       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 537       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 538       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 539         pNewDoc->Modify (true);
 540       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 541       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 542       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 543     }
 544   }
 545 }
 546
 547 void
 548 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 549 {
 550   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 551   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 552
 553   if (vecIF.size() == 0) {
 554     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 555   } else {
 556     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 557
 558     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 559       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 560       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 561       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 562       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 563       if (! pNewDoc) {
 564         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 565         return;
 566       }
 567       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 568       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 569       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 570       std::ostringstream os;
 571       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 572         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 573       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 574       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 575       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 576       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 577       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 578       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 579       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 580         pNewDoc->Modify (true);
 581       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 582       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 583       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 584     }
 585   }
 586 }
 587
 588 void
 589 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 590 {
 591   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 592   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 593
 594   if (vecIF.size() == 0) {
 595     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 596   } else {
 597     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
 598
 599     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 600       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 601       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 602       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 603       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 604       if (! pNewDoc) {
 605         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 606         return;
 607       }
 608       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 609       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 610       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 611       std::ostringstream os;
 612       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 613         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 614       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 615       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 616       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 617       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 618       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 619       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 620       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 621         pNewDoc->Modify (true);
 622       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 623       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 624       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 625     }
 626   }
 627 }
 628
 629
 630 #ifdef HAVE_FFT
 631 void
 632 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 633 {
 634   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 635   rIF.fft (rIF);
 636   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 637   m_bMinSpecified = false;
 638   m_bMaxSpecified = false;
 639   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 640     GetDocument()->Modify (true);
 641   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 642 }
 643
 644 void
 645 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 646 {
 647   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 648   rIF.ifft (rIF);
 649   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 650   m_bMinSpecified = false;
 651   m_bMaxSpecified = false;
 652   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 653     GetDocument()->Modify (true);
 654   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 655 }
 656
 657 void
 658 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 659 {
 660   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 661   rIF.fftRows (rIF);
 662   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 663   m_bMinSpecified = false;
 664   m_bMaxSpecified = false;
 665   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 666     GetDocument()->Modify (true);
 667   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 668 }
 669
 670 void
 671 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 672 {
 673   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 674   rIF.ifftRows (rIF);
 675   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 676   m_bMinSpecified = false;
 677   m_bMaxSpecified = false;
 678   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 679     GetDocument()->Modify (true);
 680   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 681 }
 682
 683 void
 684 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 685 {
 686   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 687   rIF.fftCols (rIF);
 688   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 689   m_bMinSpecified = false;
 690   m_bMaxSpecified = false;
 691   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 692     GetDocument()->Modify (true);
 693   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 694 }
 695
 696 void
 697 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 698 {
 699   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 700   rIF.ifftCols (rIF);
 701   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 702   m_bMinSpecified = false;
 703   m_bMaxSpecified = false;
 704   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 705     GetDocument()->Modify (true);
 706   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 707 }
 708 #endif
 709
 710 void
 711 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 712 {
 713   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 714   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 715   rIF.fourier (rIF);
 716   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 717   m_bMinSpecified = false;
 718   m_bMaxSpecified = false;
 719   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 720     GetDocument()->Modify (true);
 721   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 722 }
 723
 724 void
 725 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 726 {
 727   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 728   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 729   rIF.inverseFourier (rIF);
 730   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 731   m_bMinSpecified = false;
 732   m_bMaxSpecified = false;
 733   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 734     GetDocument()->Modify (true);
 735   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 736 }
 737
 738 void
 739 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 740 {
 741   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 742   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 743   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 744   m_bMinSpecified = false;
 745   m_bMaxSpecified = false;
 746   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 747     GetDocument()->Modify (true);
 748   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 749 }
 750
 751 void
 752 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 753 {
 754   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 755   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 756   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 757   m_bMinSpecified = false;
 758   m_bMaxSpecified = false;
 759   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 760     GetDocument()->Modify (true);
 761   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 762 }
 763
 764 void
 765 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 766 {
 767   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 768   if (rIF.isComplex()) {
 769     rIF.magnitude (rIF);
 770     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 771     m_bMinSpecified = false;
 772     m_bMaxSpecified = false;
 773     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 774       GetDocument()->Modify (true);
 775     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 776   }
 777 }
 778
 779 void
 780 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 781 {
 782   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 783   if (rIF.isComplex()) {
 784     rIF.phase (rIF);
 785     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 786     m_bMinSpecified = false;
 787     m_bMaxSpecified = false;
 788     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 789       GetDocument()->Modify (true);
 790     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 791   }
 792 }
 793
 794
 795 ImageFileCanvas*
 796 ImageFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
 797 {
 798   ImageFileCanvas* pCanvas;
 799   int width, height;
 800   parent->GetClientSize(&width, &height);
 801
 802   pCanvas = new ImageFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 803
 804   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 805   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 806   pCanvas->Clear();
 807
 808   return pCanvas;
 809 }
 810
 811 #if CTSIM_MDI
 812 wxDocMDIChildFrame*
 813 #else
 814 wxDocChildFrame*
 815 #endif
 816 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 817 {
 818 #if CTSIM_MDI
 819   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 820 #else
 821   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 822 #endif
 823   theApp->setIconForFrame (subframe);
 824
 825   m_pFileMenu = new wxMenu;
 826
 827   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
 828   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
 829   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
 830   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
 831   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 832   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
 833   m_pFileMenu->Append(wxID_REVERT, "Re&vert");
 834
 835   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 836   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
 837   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 838
 839   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 840   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 841   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 842   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Preview");
 843   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 844   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
 845 #ifdef CTSIM_MDI
 846   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 847   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
 848   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
 849 #endif
 850   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
 851   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
 852
 853   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 854   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
 855   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
 856   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
 857
 858   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 859   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 860   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 861   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 862   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 863   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 864   filter_menu->AppendSeparator();
 865 #ifdef HAVE_FFT
 866   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2-D &FFT");
 867   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2-D &IFFT");
 868   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 869   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 870   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 871   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 872   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "2-D F&ourier");
 873   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "2-D Inverse Fo&urier");
 874 #else
 875   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 876   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 877 #endif
 878   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 879   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 880   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 881   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 882
 883   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 884   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 885   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 886   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 887   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 888   image_menu->AppendSeparator();
 889   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 890 #if wxUSE_GLCANVAS
 891   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, "Convert &3-D\tCtrl-3");
 892 #endif
 893
 894   m_pMenuAnalyze = new wxMenu;
 895   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 896   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 897   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 898   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 899   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "P&lot FFT Row");
 900   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plo&t FFT Column");
 901   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 902   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 903   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare Ro&w");
 904   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare Colu&mn");
 905   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, false);
 906   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_COL, false);
 907   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, false);
 908   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, false);
 909   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, false);
 910   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, false);
 911
 912   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 913   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
 914   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
 915   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
 916   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 917
 918   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 919
 920   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
 921   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 922   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 923   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 924   menu_bar->Append(m_pMenuAnalyze, "&Analyze");
 925   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 926
 927   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 928
 929   subframe->Centre(wxBOTH);
 930
 931   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
 932   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
 933   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
 934   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
 935   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), IFMENU_FILE_PROPERTIES);
 936 #if wxUSE_GLCANVAS
 937   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('3'), IFMENU_IMAGE_CONVERT3D);
 938   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
 939 #else
 940   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
 941 #endif
 942
 943   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
 944
 945   return subframe;
 946 }
 947
 948
 949 bool
 950 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 951 {
 952   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
 953
 954   m_bMinSpecified = false;
 955   m_bMaxSpecified = false;
 956   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 957
 958   int width, height;
 959   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
 960   m_pFrame->SetTitle("ImageFileView");
 961   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
 962
 963   int x, y;  // X requires a forced resize
 964   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
 965   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
 966   m_pFrame->SetFocus();
 967   m_pFrame->Show(true);
 968   Activate(true);
 969
 970   return true;
 971 }
 972
 973 void
 974 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 975 {
 976   wxSize sizeWindow = m_pFrame->GetClientSize();
 977   wxSize sizeBest = m_pCanvas->GetBestSize();
 978   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
 979     m_pFrame->SetClientSize (sizeBest);
 980
 981   if (m_bitmap.Ok())
 982     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 983
 984   int xCursor, yCursor;
 985   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 986     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 987 }
 988
 989
 990 void
 991 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 992 {
 993   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 994   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 995   int nx = rIF.nx();
 996   int ny = rIF.ny();
 997   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 998     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 999       double min, max;
1000       rIF.getMinMax (min, max);
1001       if (! m_bMinSpecified)
1002         m_dMinPixel = min;
1003       if (! m_bMaxSpecified)
1004         m_dMaxPixel = max;
1005     }
1006     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
1007
1008     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
1009     if (! imageData) {
1010       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for Image display");
1011       return;
1012     }
1013     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
1014       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1015         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
1016         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
1017         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
1018         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
1019         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
1020       }
1021     }
1022     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
1023     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
1024     delete imageData;
1025     int xSize = nx;
1026     int ySize = ny;
1027     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
1028     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
1029     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
1030     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1031   }
1032
1033   if (m_pCanvas)
1034     m_pCanvas->Refresh();
1035 }
1036
1037 bool
1038 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1039 {
1040   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
1041   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1042     return false;
1043
1044   Activate (false);
1045   if (m_pCanvas) {
1046     m_pCanvas->setView(NULL);
1047     m_pCanvas = NULL;
1048   }
1049   wxString s(theApp->GetAppName());
1050   if (m_pFrame)
1051     m_pFrame->SetTitle(s);
1052
1053   SetFrame(NULL);
1054
1055   if (deleteWindow) {
1056     delete m_pFrame;
1057     m_pFrame = NULL;
1058     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
1059       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
1060   }
1061
1062   return true;
1063 }
1064
1065 void
1066 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1067 {
1068   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1069   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1070   int nx = rIF.nx();
1071   int ny = rIF.ny();
1072   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1073     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1074       double min, max;
1075       rIF.getMinMax (min, max);
1076       if (! m_bMinSpecified)
1077         m_dMinPixel = min;
1078       if (! m_bMaxSpecified)
1079         m_dMaxPixel = max;
1080     }
1081
1082     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1083     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1084       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1085       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertExportFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1086
1087       wxString strExt;
1088       wxString strWildcard;
1089       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PGMASCII) {
1090         strExt = ".pgm";
1091         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1092       }
1093 #ifdef HAVE_PNG
1094       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG16) {
1095         strExt = ".png";
1096         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1097       }
1098 #endif
1099       else {
1100         strExt = "";
1101         strWildcard = "Miscellaneous (*.*)|*.*";
1102       }
1103
1104       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1105         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1106       if (strFilename) {
1107         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1108         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1109       }
1110     }
1111   }
1112 }
1113
1114 void
1115 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1116 {
1117   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1118   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1119   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1120
1121   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1122   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1123     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1124     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1125     std::ostringstream os;
1126     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1127     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1128     if (! pScaledDoc) {
1129       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1130       return;
1131     }
1132     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1133     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1134     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1135     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1136     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1137     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1138     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1139       pScaledDoc->Modify (true);
1140     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1141     pScaledDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1142     pScaledDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1143   }
1144 }
1145
1146 #if wxUSE_GLCANVAS
1147 void
1148 ImageFileView::OnConvert3d (wxCommandEvent& event)
1149 {
1150   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1151   Graph3dFileDocument* pGraph3d = theApp->newGraph3dDoc();
1152   pGraph3d->setBadFileOpen();
1153   pGraph3d->createFromImageFile (rIF);
1154   pGraph3d->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1155   pGraph3d->UpdateAllViews();
1156   pGraph3d->getView()->getFrame()->SetClientSize (400, 400);
1157   pGraph3d->getView()->getFrame()->Show (true);
1158   GetDocumentManager()->ActivateView (pGraph3d->getView(), true, false);
1159   ::wxYield();
1160   pGraph3d->getView()->getCanvas()->SetFocus();
1161 }
1162 #endif
1163
1164 void
1165 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1166 {
1167   int xCursor, yCursor;
1168   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1169     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1170     return;
1171   }
1172
1173   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1174   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1175   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1176   int nx = rIF.nx();
1177   int ny = rIF.ny();
1178
1179   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1180     double* pX = new double [nx];
1181     double* pYReal = new double [nx];
1182     double *pYImag = NULL;
1183     double *pYMag = NULL;
1184     if (rIF.isComplex()) {
1185       pYImag = new double [nx];
1186       pYMag = new double [nx];
1187     }
1188     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1189       pX[i] = i;
1190       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1191       if (rIF.isComplex()) {
1192         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1193         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1194       }
1195     }
1196     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1197     if (! pPlotDoc) {
1198       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1199     } else {
1200       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1201       std::ostringstream os;
1202       os << "Row " << yCursor;
1203       std::string title("title ");
1204       title += os.str();
1205       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1206       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1207       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1208       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1209       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1210       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1211       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1212       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1213       if (rIF.isComplex()) {
1214         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1215         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1216         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1217         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1218         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1219         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1220         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1221         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1222       } else
1223         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1224       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1225       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1226       if (rIF.isComplex()) {
1227         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1228         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1229       }
1230       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1231         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1232       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1233       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1234       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1235     }
1236     delete pX;
1237     delete pYReal;
1238     if (rIF.isComplex()) {
1239       delete pYImag;
1240       delete pYMag;
1241     }
1242     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1243       pPlotDoc->Modify (true);
1244     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1245     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1246     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1247   }
1248 }
1249
1250 void
1251 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1252 {
1253   int xCursor, yCursor;
1254   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1255     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1256     return;
1257   }
1258
1259   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1260   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1261   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1262   int nx = rIF.nx();
1263   int ny = rIF.ny();
1264
1265   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1266     double* pX = new double [ny];
1267     double* pYReal = new double [ny];
1268     double* pYImag = NULL;
1269     double* pYMag = NULL;
1270     if (rIF.isComplex()) {
1271       pYImag = new double [ny];
1272       pYMag = new double [ny];
1273     }
1274     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1275       pX[i] = i;
1276       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1277       if (rIF.isComplex()) {
1278         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1279         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1280       }
1281     }
1282     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1283     if (! pPlotDoc) {
1284       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1285     } else {
1286       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1287       std::ostringstream os;
1288       os << "Column " << xCursor;
1289       std::string title("title ");
1290       title += os.str();
1291       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1292       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1293       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1294       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1295       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1296       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1297       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1298       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1299       if (rIF.isComplex()) {
1300         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1301         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1302         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1303         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1304         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1305         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1306         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1307         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1308       } else
1309         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1310       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1311       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1312       if (rIF.isComplex()) {
1313         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1314         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1315       }
1316       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1317         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1318       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1319       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1320       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1321     }
1322     delete pX;
1323     delete pYReal;
1324     if (rIF.isComplex()) {
1325       delete pYImag;
1326       delete pYMag;
1327     }
1328     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1329       pPlotDoc->Modify (true);
1330     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1331     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1332     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1333   }
1334 }
1335
1336 #ifdef HAVE_FFT
1337 void
1338 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1339 {
1340   int xCursor, yCursor;
1341   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1342     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1343     return;
1344   }
1345
1346   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1347   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1348   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1349   int nx = rIF.nx();
1350   int ny = rIF.ny();
1351
1352   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1353     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1354
1355     int i;
1356     for (i = 0; i < nx; i++) {
1357       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1358       if (rIF.isComplex())
1359         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1360       else
1361         pcIn[i].im = 0;
1362     }
1363
1364     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1365     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1366     fftw_destroy_plan (plan);
1367
1368     double* pX = new double [nx];
1369     double* pYReal = new double [nx];
1370     double* pYImag = new double [nx];
1371     double* pYMag = new double [nx];
1372     for (i = 0; i < nx; i++) {
1373       pX[i] = i;
1374       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1375       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1376       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1377     }
1378     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1379     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1380     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1381
1382     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1383     if (! pPlotDoc) {
1384       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1385     } else {
1386       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1387       std::ostringstream os;
1388       os << "Row " << yCursor;
1389       std::string title("title ");
1390       title += os.str();
1391       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1392       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1393       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1394       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1395       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1396       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1397       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1398       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1399       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1400       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1401       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1402       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1403       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1404       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1405       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1406       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1407       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1408       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1409       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1410       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1411       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1412         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1413       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1414       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1415       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1416     }
1417     delete pX;
1418     delete pYReal;
1419     delete pYImag;
1420     delete pYMag;
1421     delete [] pcIn;
1422
1423     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1424       pPlotDoc->Modify (true);
1425     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1426     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1427     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1428   }
1429 }
1430
1431 void
1432 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1433 {
1434   int xCursor, yCursor;
1435   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1436     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1437     return;
1438   }
1439
1440   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1441   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1442   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1443   int nx = rIF.nx();
1444   int ny = rIF.ny();
1445
1446   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1447     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1448     double *pdTemp = new double [ny];
1449
1450     int i;
1451     for (i = 0; i < ny; i++)
1452       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1453     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1454     for (i = 0; i < ny; i++)
1455       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1456
1457     for (i = 0; i < ny; i++) {
1458       if (rIF.isComplex())
1459         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1460       else
1461         pdTemp[i] = 0;
1462     }
1463     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1464     for (i = 0; i < ny; i++)
1465       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1466
1467     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1468     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1469     fftw_destroy_plan (plan);
1470
1471     double* pX = new double [ny];
1472     double* pYReal = new double [ny];
1473     double* pYImag = new double [ny];
1474     double* pYMag = new double [ny];
1475     for (i = 0; i < ny; i++) {
1476       pX[i] = i;
1477       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1478       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1479       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1480     }
1481
1482     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1483     if (! pPlotDoc) {
1484       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1485     } else {
1486       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1487       std::ostringstream os;
1488       os << "Column " << xCursor;
1489       std::string title("title ");
1490       title += os.str();
1491       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1492       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1493       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1494       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1495       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1496       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1497       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1498       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1499       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1500       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1501       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1502       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1503       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1504       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1505       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1506       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1507       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1508       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1509       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1510       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1511       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1512         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1513       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1514       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1515       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1516     }
1517     delete pX;
1518     delete pYReal;
1519     delete pYImag;
1520     delete pYMag;
1521     delete pdTemp;
1522     delete [] pcIn;
1523
1524     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1525       pPlotDoc->Modify (true);
1526     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1527     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1528     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1529   }
1530 }
1531 #endif
1532
1533 void
1534 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1535 {
1536   int xCursor, yCursor;
1537   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1538     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1539     return;
1540   }
1541
1542   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1543   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1544   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1545     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1546     return;
1547   }
1548   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1549
1550   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1551     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1552     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1553     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1554
1555     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1556     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1557     int nx = rIF.nx();
1558     int ny = rIF.ny();
1559
1560     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1561       double* pX = new double [ny];
1562       double* pY1 = new double [ny];
1563       double* pY2 = new double [ny];
1564       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1565         pX[i] = i;
1566         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1567         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1568       }
1569       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1570       if (! pPlotDoc) {
1571         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1572       } else {
1573         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1574         std::ostringstream os;
1575         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1576         std::string title("title ");
1577         title += os.str();
1578         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1579         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1580         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1581         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1582         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1583         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1584         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1585         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1586         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1587         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1588         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1589         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1590         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1591         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1592         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1593
1594         unsigned int iL;
1595         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1596           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1597           s += ": ";
1598           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1599           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1600         }
1601         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1602           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1603           s += ": ";
1604           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1605           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1606         }
1607         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1608           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1609         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1610         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1611       }
1612       delete pX;
1613       delete pY1;
1614       delete pY2;
1615       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1616         pPlotDoc->Modify (true);
1617       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1618       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1619       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1620     }
1621   }
1622 }
1623
1624 void
1625 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1626 {
1627   int xCursor, yCursor;
1628   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1629     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1630     return;
1631   }
1632
1633   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1634   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1635
1636   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1637     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1638     return;
1639   }
1640
1641   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1642
1643   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1644     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1645     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1646     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1647
1648     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1649     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1650     int nx = rIF.nx();
1651     int ny = rIF.ny();
1652
1653     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1654       double* pX = new double [nx];
1655       double* pY1 = new double [nx];
1656       double* pY2 = new double [nx];
1657       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1658         pX[i] = i;
1659         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1660         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1661       }
1662       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1663       if (! pPlotDoc) {
1664         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1665       } else {
1666         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1667         std::ostringstream os;
1668         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1669         std::string title("title ");
1670         title += os.str();
1671         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1672         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1673         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1674         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1675         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1676         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1677         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1678         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1679         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1680         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1681         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1682         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1683         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1684         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1685         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1686         unsigned int iL;
1687         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1688           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1689           s += ": ";
1690           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1691           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1692         }
1693         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1694           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1695           s += ": ";
1696           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1697           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1698         }
1699         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1700           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1701         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1702         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1703       }
1704       delete pX;
1705       delete pY1;
1706       delete pY2;
1707       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1708         pPlotDoc->Modify (true);
1709       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1710       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1711       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1712     }
1713   }
1714 }
1715
1716 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1717
1718 void
1719 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1720 {
1721   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1722   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1723   int nx = rIF.nx();
1724   int ny = rIF.ny();
1725
1726   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1727     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1728     if (! pPlotDoc) {
1729       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1730       return;
1731     }
1732
1733     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1734     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1735     double dMin, dMax;
1736     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1737     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1738
1739     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1740       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1741       pY[i] = 0;
1742     }
1743     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1744       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1745         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1746         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1747           pY[iBin] += 1;
1748       }
1749
1750       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1751       std::ostringstream os;
1752       os << "Histogram";
1753       std::string title("title ");
1754       title += os.str();
1755       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1756       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1757       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1758       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1759       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1760       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1761       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1762       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1763       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1764         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1765         s += ": ";
1766         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1767         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1768       }
1769       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1770       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1771       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1772       delete pX;
1773       delete pY;
1774       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1775         pPlotDoc->Modify (true);
1776       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1777       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1778       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1779   }
1780 }
1781
1782
1783 // PhantomCanvas
1784
1785 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1786 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1787 {
1788   m_pView = v;
1789 }
1790
1791 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1792 {
1793   m_pView = NULL;
1794 }
1795
1796 void
1797 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1798 {
1799   if (m_pView)
1800     m_pView->OnDraw(& dc);
1801 }
1802
1803 wxSize
1804 PhantomCanvas::GetBestSize() const
1805 {
1806   if (! m_pView)
1807     return wxSize(0,0);
1808
1809   int xSize, ySize;
1810   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
1811   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
1812   ySize = xSize = (xSize / 4);
1813   return wxSize (xSize, ySize);
1814 }
1815
1816
1817
1818 // PhantomFileView
1819
1820 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
1821
1822 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
1823 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
1824 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
1825 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
1826 END_EVENT_TABLE()
1827
1828 PhantomFileView::PhantomFileView()
1829 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
1830 {
1831 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
1832   m_iDefaultNDet = 165;
1833   m_iDefaultNView = 180;
1834   m_iDefaultNSample = 1;
1835 #else
1836   m_iDefaultNDet = 367;
1837   m_iDefaultNView = 320;
1838   m_iDefaultNSample = 2;
1839 #endif
1840   m_dDefaultRotation = 1;
1841   m_dDefaultFocalLength = 2;
1842   m_dDefaultCenterDetectorLength = 2;
1843   m_dDefaultViewRatio = 1;
1844   m_dDefaultScanRatio = 1;
1845   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1846   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1847
1848 #ifdef DEBUG
1849   m_iDefaultRasterNX = 115;
1850   m_iDefaultRasterNY = 115;
1851   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1852 #else
1853   m_iDefaultRasterNX = 256;
1854   m_iDefaultRasterNY = 256;
1855   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1856 #endif
1857   m_dDefaultRasterViewRatio = 1;
1858 }
1859
1860 PhantomFileView::~PhantomFileView()
1861 {
1862   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
1863   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
1864 }
1865
1866 void
1867 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1868 {
1869   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1870   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1871   std::ostringstream os;
1872   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1873   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1874   rPhantom.printDefinitions (os);
1875 #if DEBUG
1876   rPhantom.print (os);
1877 #endif
1878   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
1879   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1880 }
1881
1882
1883 void
1884 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1885 {
1886   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(),
1887     m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation,
1888     m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio,
1889     m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
1890   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1891   if (retVal != wxID_OK)
1892     return;
1893
1894   m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1895   m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1896   m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1897   m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1898   m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1899   m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1900   m_dDefaultCenterDetectorLength = dialogProjection.getCenterDetectorLengthRatio();
1901   m_dDefaultViewRatio = dialogProjection.getViewRatio();
1902   m_dDefaultScanRatio = dialogProjection.getScanRatio();
1903   wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1904   m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1905   double dRotationRadians = m_dDefaultRotation;
1906   m_dDefaultRotation /= TWOPI;  // convert back to fraction of a circle
1907
1908   if (m_iDefaultNDet <= 0 || m_iDefaultNView <= 0 || sGeometry == "")
1909     return;
1910
1911   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1912   Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample,
1913     dRotationRadians, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio);
1914   if (theScanner.fail()) {
1915     wxString msg = "Failed making scanner\n";
1916     msg += theScanner.failMessage().c_str();
1917     *theApp->getLog() << msg << "\n";
1918     wxMessageBox (msg, "Error");
1919     return;
1920   }
1921
1922   std::ostringstream os;
1923   os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet
1924     << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample
1925     << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength
1926     << ", CenterDetectorLengthRatio=" << m_dDefaultCenterDetectorLength
1927     << ", ViewRatio=" << m_dDefaultViewRatio << ", ScanRatio=" << m_dDefaultScanRatio
1928     << ", Geometry=" << sGeometry.c_str() << ", FanBeamAngle=" <<
1929     convertRadiansToDegrees (theScanner.fanBeamAngle());
1930
1931   Timer timer;
1932   Projections* pProj = NULL;
1933   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1934     pProj = new Projections;
1935     pProj->initFromScanner (theScanner);
1936
1937     ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, *pProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1938     for (int iView = 0; iView < pProj->nView(); iView++) {
1939       ::wxYield();
1940       if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1941         delete pProj;
1942         return;
1943       }
1944       ::wxYield();
1945       while (dialogProjections.isPaused()) {
1946         ::wxYield();
1947         ::wxUsleep(50);
1948       }
1949     }
1950   } else {
1951 #if HAVE_WXTHREADS
1952     if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
1953       ProjectorSupervisorThread* pProjector = new ProjectorSupervisorThread (this, m_iDefaultNDet,
1954         m_iDefaultNView, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNSample, dRotationRadians,
1955         m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio, os.str().c_str());
1956       if (pProjector->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
1957         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating projector thread");
1958         delete pProjector;
1959         return;
1960       }
1961       pProjector->SetPriority(60);
1962       pProjector->Run();
1963       return;
1964     } else
1965 #endif // HAVE_WXTHREADS
1966         {
1967       pProj = new Projections;
1968       pProj->initFromScanner (theScanner);
1969       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), pProj->nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
1970       for (int i = 0; i < pProj->nView(); i++) {
1971         theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1972         if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1973           delete pProj;
1974           return;
1975         }
1976       }
1977     }
1978   }
1979
1980   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1981   pProj->setRemark (os.str());
1982   pProj->setCalcTime (timer.timerEnd());
1983
1984   ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
1985   if (! pProjectionDoc) {
1986     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1987     return;
1988   }
1989   pProjectionDoc->setProjections (pProj);
1990   ProjectionFileView* projView = pProjectionDoc->getView();
1991   if (projView) {
1992     projView->OnUpdate (projView, NULL);
1993     if (projView->getCanvas())
1994       projView->getCanvas()->SetClientSize (m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView);
1995     if (wxFrame* pFrame = projView->getFrame()) {
1996       pFrame->Show(true);
1997       pFrame->SetFocus();
1998       pFrame->Raise();
1999     }
2000     GetDocumentManager()->ActivateView (projView, true, false);
2001   }
2002   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2003     pProjectionDoc-> Modify(true);
2004   pProjectionDoc->UpdateAllViews (this);
2005 }
2006
2007
2008 void
2009 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
2010 {
2011   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
2012     m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio);
2013   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
2014   if (retVal != wxID_OK)
2015     return;
2016
2017   m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
2018   m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
2019   m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
2020   m_dDefaultRasterViewRatio = dialogRaster.getViewRatio();
2021   if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
2022     m_iDefaultRasterNSamples = 1;
2023   if (m_dDefaultRasterViewRatio < 0)
2024     m_dDefaultRasterViewRatio = 0;
2025   if (m_iDefaultRasterNX <= 0 || m_iDefaultRasterNY <= 0)
2026     return;
2027
2028   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2029   std::ostringstream os;
2030   os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
2031     << m_iDefaultRasterNY << ", ViewRatio=" << m_dDefaultRasterViewRatio << ", nSamples="
2032     << m_iDefaultRasterNSamples;;
2033
2034 #if HAVE_WXTHREADS
2035   if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2036     RasterizerSupervisorThread* pThread = new RasterizerSupervisorThread (this, m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
2037       m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio, os.str().c_str());
2038     if (pThread->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2039       *theApp->getLog() << "Error creating rasterizer thread\n";
2040       return;
2041     }
2042     pThread->SetPriority (60);
2043     pThread->Run();
2044   } else
2045 #endif
2046   {
2047     ImageFile* pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY);
2048     wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"),
2049       pImageFile->nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2050     Timer timer;
2051     for (unsigned int i = 0; i < pImageFile->nx(); i++) {
2052       rPhantom.convertToImagefile (*pImageFile, m_dDefaultRasterViewRatio, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
2053       if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
2054         delete pImageFile;
2055         return;
2056       }
2057     }
2058
2059     ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
2060     if (! pRasterDoc) {
2061       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2062       return;
2063     }
2064     pRasterDoc->setImageFile (pImageFile);
2065     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2066       pRasterDoc->Modify (true);
2067     pRasterDoc->UpdateAllViews (this);
2068     pRasterDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2069     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2070     pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
2071     ImageFileView* rasterView = pRasterDoc->getView();
2072     if (rasterView) {
2073       rasterView->getFrame()->SetFocus();
2074       rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2075     }
2076   }
2077 }
2078
2079
2080 PhantomCanvas*
2081 PhantomFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2082 {
2083   PhantomCanvas* pCanvas;
2084
2085   pCanvas = new PhantomCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(0,0), 0);
2086   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2087   pCanvas->Clear();
2088
2089   return pCanvas;
2090 }
2091
2092 #if CTSIM_MDI
2093 wxDocMDIChildFrame*
2094 #else
2095 wxDocChildFrame*
2096 #endif
2097 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2098 {
2099 #if CTSIM_MDI
2100   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2101 #else
2102   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2103 #endif
2104   theApp->setIconForFrame (subframe);
2105
2106   m_pFileMenu = new wxMenu;
2107
2108   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2109   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2110   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2111   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2112   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2113
2114   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2115   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2116
2117   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2118   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2119   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2120   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2121   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2122   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
2123 #ifdef CTSIM_MDI
2124   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2125   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2126   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2127 #endif
2128   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2129   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2130
2131   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
2132   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
2133   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
2134
2135   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2136   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2137   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2138   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2139   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2140
2141   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2142
2143   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2144   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
2145   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2146
2147   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2148   subframe->Centre(wxBOTH);
2149
2150   wxAcceleratorEntry accelEntries[3];
2151   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2152   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2153   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PHMMENU_FILE_PROPERTIES);
2154   wxAcceleratorTable accelTable (3, accelEntries);
2155   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2156
2157   return subframe;
2158 }
2159
2160
2161 bool
2162 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2163 {
2164   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2165   SetFrame(m_pFrame);
2166   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2167   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2168   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2169
2170   m_pFrame->SetTitle ("PhantomFileView");
2171
2172 #ifdef __X__
2173   int x, y;  // X requires a forced resize
2174   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2175   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2176 #endif
2177
2178   m_pFrame->Show(true);
2179   Activate(true);
2180
2181   return true;
2182 }
2183
2184 void
2185 PhantomFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2186 {
2187   if (m_pCanvas)
2188     m_pCanvas->Refresh();
2189 }
2190
2191 bool
2192 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2193 {
2194   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2195   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2196     return false;
2197
2198   Activate(false);
2199   if (m_pCanvas) {
2200     m_pCanvas->setView(NULL);
2201     m_pCanvas = NULL;
2202   }
2203   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2204   if (m_pFrame)
2205     m_pFrame->SetTitle(s);
2206
2207   SetFrame(NULL);
2208
2209   if (deleteWindow) {
2210     delete m_pFrame;
2211     m_pFrame = NULL;
2212     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2213       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2214   }
2215
2216   return true;
2217 }
2218
2219 void
2220 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2221 {
2222   int xsize, ysize;
2223   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2224   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2225   SGP sgp (driver);
2226   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2227   sgp.setColor (C_RED);
2228   rPhantom.show (sgp);
2229 }
2230
2231 // ProjectionCanvas
2232
2233 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2234 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2235 {
2236   m_pView = v;
2237 }
2238
2239 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2240 {
2241   m_pView = NULL;
2242 }
2243
2244 void
2245 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2246 {
2247   if (m_pView)
2248     m_pView->OnDraw(& dc);
2249 }
2250
2251 wxSize
2252 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2253 {
2254   wxSize best (0, 0);
2255   if (m_pView) {
2256     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2257     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2258   }
2259
2260   return best;
2261 }
2262
2263
2264 // ProjectionFileView
2265
2266 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2267
2268 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2269 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2270 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2271 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, ProjectionFileView::OnReconstructFourier)
2272 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2273 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2274 END_EVENT_TABLE()
2275
2276 ProjectionFileView::ProjectionFileView()
2277 : wxView(), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pFileMenu(0)
2278 {
2279 #ifdef DEBUG
2280   m_iDefaultNX = 115;
2281   m_iDefaultNY = 115;
2282 #else
2283   m_iDefaultNX = 256;
2284   m_iDefaultNY = 256;
2285 #endif
2286
2287   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2288   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2289 #if HAVE_FFTW
2290   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2291   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2292 #else
2293   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2294   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2295 #endif
2296   m_iDefaultZeropad = 1;
2297   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF;
2298   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2299   m_iDefaultInterpParam = 1;
2300   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2301
2302   m_iDefaultPolarNX = 256;
2303   m_iDefaultPolarNY = 256;
2304   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2305   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2306 }
2307
2308 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2309 {
2310   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2311   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2312 }
2313
2314 void
2315 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2316 {
2317   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2318   std::ostringstream os;
2319   rProj.printScanInfo(os);
2320   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
2321   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2322   dialogMsg.ShowModal();
2323 }
2324
2325
2326 void
2327 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2328 {
2329   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2330   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2331     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2332   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2333     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2334     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2335     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2336     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2337     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2338     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2339     if (! rProj.convertPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation)) {
2340       delete pIF;
2341       *theApp->getLog() << "Error converting to Polar\n";
2342       return;
2343     }
2344     pPolarDoc = theApp->newImageDoc ();
2345     if (! pPolarDoc) {
2346       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2347       return;
2348     }
2349     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2350     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2351     std::ostringstream os;
2352     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2353       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2354       << strInterpolation.c_str();
2355     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2356     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2357     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2358       pPolarDoc->Modify (true);
2359     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2360     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2361     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2362   }
2363 }
2364
2365 void
2366 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2367 {
2368   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2369   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2370     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2371   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2372     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2373     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2374     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2375     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2376     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2377
2378     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2379     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2380       delete pIF;
2381       *theApp->getLog() << "Error converting to polar\n";
2382       return;
2383     }
2384     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2385     if (! pPolarDoc) {
2386       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2387       return;
2388     }
2389     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2390     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2391     std::ostringstream os;
2392     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2393       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2394       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2395     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2396     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2397     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2398       pPolarDoc->Modify (true);
2399     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2400     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2401     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2402   }
2403 }
2404
2405 void
2406 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2407 {
2408   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2409 }
2410
2411 void
2412 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2413 {
2414   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY,
2415     m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration,
2416     m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector,
2417     m_iDefaultTrace);
2418
2419   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2420   if (retVal != wxID_OK)
2421     return;
2422
2423   m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2424   m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2425   wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2426   m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2427   m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2428   wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2429   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2430   m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2431   wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2432   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2433   wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2434   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2435   m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2436   wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2437   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2438   m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2439
2440   if (m_iDefaultNX <= 0 && m_iDefaultNY <= 0)
2441     return;
2442
2443   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2444   std::ostringstream os;
2445   os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2446
2447   Timer timerRecon;
2448   ImageFile* pImageFile = NULL;
2449   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2450     pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2451     Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2452       m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2453       optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2454
2455     ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstructor, rProj, *pImageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2456     for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2457       ::wxYield();
2458       if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView, true)) {
2459         delete pDlgReconstruct;
2460         delete pReconstructor;
2461         return;
2462       }
2463       ::wxYield();
2464       ::wxYield();
2465       while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2466         ::wxYield();
2467         ::wxUsleep(50);
2468       }
2469     }
2470     pReconstructor->postProcessing();
2471     delete pDlgReconstruct;
2472     delete pReconstructor;
2473   } else {
2474 #if HAVE_WXTHREADS
2475     if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2476       ReconstructorSupervisorThread* pReconstructor = new ReconstructorSupervisorThread (this,
2477         m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, optFilterName.c_str(),
2478         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2479         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), os.str().c_str());
2480       if (pReconstructor->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2481         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating reconstructor thread");
2482         delete pReconstructor;
2483         return;
2484       }
2485       pReconstructor->SetPriority (60);
2486       pReconstructor->Run();
2487       return;
2488     } else
2489 #endif
2490         {
2491       pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2492       Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2493         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2494         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2495
2496       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2497       for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2498         pReconstructor->reconstructView (iView, 1);
2499         if (! dlgProgress.Update (iView + 1)) {
2500           delete pReconstructor;
2501           return; // don't make new window, thread will do this
2502         }
2503       }
2504       pReconstructor->postProcessing();
2505       delete pReconstructor;
2506     }
2507   }
2508   ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2509   if (! pReconDoc) {
2510     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2511     return;
2512   }
2513   pReconDoc->setImageFile (pImageFile);
2514   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2515     pReconDoc->Modify (true);
2516   pReconDoc->UpdateAllViews (this);
2517   if (ImageFileView* rasterView = pReconDoc->getView()) {
2518     rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2519     rasterView->getFrame()->SetFocus();
2520     rasterView->getFrame()->Show(true);
2521   }
2522   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2523   pImageFile->labelAdd (rProj.getLabel());
2524   pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2525 }
2526
2527
2528 ProjectionFileCanvas*
2529 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2530 {
2531   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2532   int width, height;
2533   parent->GetClientSize(&width, &height);
2534
2535   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2536
2537   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2538   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2539   pCanvas->Clear();
2540
2541   return pCanvas;
2542 }
2543
2544 #if CTSIM_MDI
2545 wxDocMDIChildFrame*
2546 #else
2547 wxDocChildFrame*
2548 #endif
2549 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2550 {
2551 #ifdef CTSIM_MDI
2552   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2553 #else
2554   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2555 #endif
2556   theApp->setIconForFrame (subframe);
2557
2558   m_pFileMenu = new wxMenu;
2559
2560   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2561   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2562   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2563   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2564   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2565   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2566
2567   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2568   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2569
2570   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2571   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2572   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2573   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2574   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2575   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
2576 #ifdef CTSIM_MDI
2577   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2578   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2579   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2580 #endif
2581   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2582   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2583
2584   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2585   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2586   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-M");
2587
2588   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2589   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R", "Reconstruct image using filtered backprojection");
2590   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E", "Reconstruct image using inverse Fourier");
2591   reconstruct_menu->Enable (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, false);
2592
2593   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2594   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2595   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2596   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2597   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2598
2599   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2600
2601   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
2602   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2603   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2604   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2605
2606   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2607   subframe->Centre(wxBOTH);
2608
2609   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
2610   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2611   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('M'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2612   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2613   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2614   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_FILE_PROPERTIES);
2615   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
2616   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2617
2618   return subframe;
2619 }
2620
2621
2622 bool
2623 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2624 {
2625   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2626   SetFrame(m_pFrame);
2627
2628   int width, height;
2629   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
2630   m_pFrame->SetTitle ("ProjectionFileView");
2631   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2632
2633 #ifdef __X__
2634   int x, y;  // X requires a forced resize
2635   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2636   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2637 #endif
2638
2639   m_pFrame->Show(true);
2640   Activate(true);
2641
2642   return true;
2643 }
2644
2645 void
2646 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2647 {
2648   wxSize clientSize = m_pFrame->GetClientSize();
2649   wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
2650
2651   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2652     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
2653
2654   if (m_bitmap.Ok())
2655     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2656 }
2657
2658
2659 void
2660 ProjectionFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2661 {
2662   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2663   const int nDet = rProj.nDet();
2664   const int nView = rProj.nView();
2665   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2666     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2667     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2668     double min = detval[0];
2669     double max = detval[0];
2670     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2671       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2672       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2673       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2674         if (min > detval[ix])
2675           min = detval[ix];
2676         else if (max < detval[ix])
2677           max = detval[ix];
2678       }
2679     }
2680
2681     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2682     if (! imageData) {
2683       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for image display");
2684       return;
2685     }
2686     double scale = (max - min) / 255;
2687     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2688       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2689       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2690       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2691         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2692         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2693         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2694         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2695       }
2696     }
2697     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2698     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2699     delete imageData;
2700     int xSize = nDet;
2701     int ySize = nView;
2702     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2703     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2704     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
2705     m_pCanvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2706   }
2707
2708   if (m_pCanvas)
2709     m_pCanvas->Refresh();
2710 }
2711
2712 bool
2713 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2714 {
2715   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2716   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2717     return false;
2718
2719   Activate(false);
2720   if (m_pCanvas) {
2721         m_pCanvas->setView(NULL);
2722     m_pCanvas = NULL;
2723   }
2724   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2725   if (m_pFrame)
2726     m_pFrame->SetTitle(s);
2727
2728   SetFrame(NULL);
2729
2730   if (deleteWindow) {
2731     delete m_pFrame;
2732     m_pFrame = NULL;
2733     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2734       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2735   }
2736
2737   return true;
2738 }
2739
2740
2741
2742 // PlotFileCanvas
2743 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2744 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2745 {
2746   m_pView = v;
2747 }
2748
2749 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
2750 {
2751   m_pView = NULL;
2752 }
2753
2754 void
2755 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2756 {
2757   if (m_pView)
2758     m_pView->OnDraw(& dc);
2759 }
2760
2761
2762 // PlotFileView
2763
2764 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2765
2766 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2767 EVT_MENU(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2768 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2769 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2770 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2771 END_EVENT_TABLE()
2772
2773 PlotFileView::PlotFileView()
2774 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
2775 {
2776 }
2777
2778 PlotFileView::~PlotFileView()
2779 {
2780   if (m_pEZPlot)
2781     delete m_pEZPlot;
2782
2783   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2784 }
2785
2786 void
2787 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2788 {
2789   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2790   std::ostringstream os;
2791   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2792   rPlot.printHeadersBrief (os);
2793   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<<\n";
2794   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2795   dialogMsg.ShowModal();
2796 }
2797
2798
2799 void
2800 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2801 {
2802   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2803   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2804   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2805   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2806   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2807   if (iRetVal == wxID_OK) {
2808     m_bMinSpecified = true;
2809     m_bMaxSpecified = true;
2810     double dMin, dMax;
2811     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2812       m_dMinPixel = dMin;
2813       m_dMaxPixel = dMax;
2814       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2815       OnUpdate (this, NULL);
2816     }
2817   }
2818 }
2819
2820 void
2821 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2822 {
2823   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2824   double min;
2825   double max;
2826
2827   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2828     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2829       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2830       return;
2831     }
2832   }
2833
2834   if (m_bMinSpecified)
2835     min = m_dMinPixel;
2836   if (m_bMaxSpecified)
2837     max = m_dMaxPixel;
2838
2839   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2840   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2841   if (retVal == wxID_OK) {
2842     m_bMinSpecified = true;
2843     m_bMaxSpecified = true;
2844     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2845     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2846     OnUpdate (this, NULL);
2847   }
2848 }
2849
2850 void
2851 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2852 {
2853   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2854     m_bMinSpecified = false;
2855     m_bMaxSpecified = false;
2856     OnUpdate (this, NULL);
2857   }
2858 }
2859
2860
2861 PlotFileCanvas*
2862 PlotFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
2863 {
2864   PlotFileCanvas* pCanvas;
2865   int width, height;
2866   parent->GetClientSize(&width, &height);
2867
2868   pCanvas = new PlotFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2869
2870   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2871   pCanvas->Clear();
2872
2873   return pCanvas;
2874 }
2875
2876 #if CTSIM_MDI
2877 wxDocMDIChildFrame*
2878 #else
2879 wxDocChildFrame*
2880 #endif
2881 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2882 {
2883 #ifdef CTSIM_MDI
2884   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2885 #else
2886   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2887 #endif
2888   theApp->setIconForFrame (subframe);
2889
2890   m_pFileMenu = new wxMenu;
2891
2892   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2893   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2894   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2895   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2896   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2897   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2898
2899   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2900   m_pFileMenu->Append(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2901
2902   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2903   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2904   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2905   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2906   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2907   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
2908 #ifdef CTSIM_MDI
2909   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2910   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2911   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2912 #endif
2913   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2914   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2915
2916   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2917   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2918   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2919   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2920
2921   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2922   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2923   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2924   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2925   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2926
2927   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2928
2929   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2930   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2931   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2932
2933   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2934   subframe->Centre(wxBOTH);
2935
2936   wxAcceleratorEntry accelEntries[4];
2937   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2938   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2939   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2940   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PLOTMENU_FILE_PROPERTIES);
2941   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
2942   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2943
2944   return subframe;
2945 }
2946
2947
2948 bool
2949 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2950 {
2951   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2952   SetFrame(m_pFrame);
2953
2954   m_bMinSpecified = false;
2955   m_bMaxSpecified = false;
2956   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2957
2958   int width, height;
2959   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2960   m_pFrame->SetTitle ("Plot File");
2961   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2962
2963 #ifdef __X__
2964   int x, y;  // X requires a forced resize
2965   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2966   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2967 #endif
2968
2969   m_pFrame->Show(true);
2970   Activate(true);
2971
2972   return true;
2973 }
2974
2975 void
2976 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2977 {
2978   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2979   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2980   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2981
2982   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2983     int xsize, ysize;
2984     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2985     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2986     SGP sgp (driver);
2987     if (m_pEZPlot)
2988       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2989   }
2990 }
2991
2992
2993 void
2994 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2995 {
2996   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2997   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2998   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2999
3000   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
3001     if (m_pEZPlot)
3002       delete m_pEZPlot;
3003     m_pEZPlot = new EZPlot;
3004
3005     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
3006       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
3007
3008     if (m_bMinSpecified) {
3009       std::ostringstream os;
3010       os << "ymin " << m_dMinPixel;
3011       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3012     }
3013
3014     if (m_bMaxSpecified) {
3015       std::ostringstream os;
3016       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
3017       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3018     }
3019
3020     m_pEZPlot->ezset("box");
3021     m_pEZPlot->ezset("grid");
3022
3023     double* pdXaxis = new double [iNRecords];
3024     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
3025
3026     double* pdY = new double [iNRecords];
3027     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
3028       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
3029       m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
3030     }
3031
3032     delete pdXaxis;
3033     delete pdY;
3034   }
3035
3036   if (m_pCanvas)
3037     m_pCanvas->Refresh();
3038 }
3039
3040 bool
3041 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3042 {
3043   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3044   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3045     return false;
3046
3047   Activate(false);
3048   if (m_pCanvas) {
3049     m_pCanvas->setView (NULL);
3050     m_pCanvas = NULL;
3051   }
3052   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
3053   if (m_pFrame)
3054     m_pFrame->SetTitle(s);
3055
3056   SetFrame(NULL);
3057   if (deleteWindow) {
3058     delete m_pFrame;
3059     m_pFrame = NULL;
3060     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3061       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3062   }
3063
3064   return true;
3065 }
3066
3067
3068 ////////////////////////////////////////////////////////////////
3069
3070
3071 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
3072
3073 TextFileView::~TextFileView()
3074 {
3075   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
3076   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
3077 }
3078
3079 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3080 {
3081   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3082   SetFrame (m_pFrame);
3083
3084   int width, height;
3085   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
3086   m_pFrame->SetTitle("TextFile");
3087   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
3088   m_pFrame->SetTitle("Log");
3089
3090 #ifdef __X__
3091   // X seems to require a forced resize
3092   int x, y;
3093   frame->GetSize(&x, &y);
3094   frame->SetSize(-1, -1, x, y);
3095 #endif
3096
3097   m_pFrame->Show (true);
3098   Activate (true);
3099
3100   return true;
3101 }
3102
3103 // Handled by wxTextWindow
3104 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
3105 {
3106 }
3107
3108 void TextFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3109 {
3110 }
3111
3112 bool
3113 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3114 {
3115   if (! theApp->getMainFrame()->getShuttingDown())
3116     return false;
3117
3118   Activate(false);
3119   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3120   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3121     return false;
3122
3123   SetFrame(NULL);
3124   if (deleteWindow) {
3125     delete m_pFrame;
3126     m_pFrame = NULL;
3127     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3128       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3129   }
3130
3131   return TRUE;
3132 }
3133
3134 #if CTSIM_MDI
3135 wxDocMDIChildFrame*
3136 #else
3137 wxDocChildFrame*
3138 #endif
3139 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
3140 {
3141 #if CTSIM_MDI
3142   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0,0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3143 #else
3144   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3145 #endif
3146   theApp->setIconForFrame (subframe);
3147
3148   m_pFileMenu = new wxMenu;
3149
3150   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
3151   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
3152   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
3153   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
3154   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
3155   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
3156
3157   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3158   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
3159   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
3160   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
3161   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3162   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
3163 #ifdef CTSIM_MDI
3164   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3165   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
3166   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
3167 #endif
3168   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3169   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3170
3171   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3172   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
3173   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
3174   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
3175   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
3176
3177   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3178
3179   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
3180   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
3181
3182   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3183   subframe->Centre(wxBOTH);
3184
3185   return subframe;
3186 }
3187
3188
3189 // Define a constructor for my text subwindow
3190 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
3191 : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
3192 {
3193 }
3194
3195 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3196 {
3197   m_pView = NULL;
3198 }