src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.52 2001/01/06 15:33:15 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
  29 #include "wx/wxprec.h"
  30
  31 #ifdef __BORLANDC__
  32 #pragma hdrstop
  33 #endif
  34
  35 #ifndef WX_PRECOMP
  36 #include "wx/wx.h"
  37 #endif
  38
  39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  41 #endif
  42
  43 #include "wx/image.h"
  44 #include "wx/progdlg.h"
  45
  46 #include "ct.h"
  47 #include "ctsim.h"
  48 #include "docs.h"
  49 #include "views.h"
  50 #include "dialogs.h"
  51 #include "dlgprojections.h"
  52 #include "dlgreconstruct.h"
  53 #include "backprojectors.h"
  54 #include "reconstruct.h"
  55 #include "timer.h"
  56
  57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  58 #include <sstream>
  59 #else
  60 #include <sstream_subst>
  61 #endif
  62
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 END_EVENT_TABLE()
  69
  70
  71 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  72 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
  73 {
  74   m_pView = v;
  75   m_xCursor = -1;
  76   m_yCursor = -1;
  77 }
  78
  79 void
  80 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  81 {
  82   if (m_pView)
  83     m_pView->OnDraw(& dc);
  84 }
  85
  86 void
  87 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  88 {
  89   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  90   int nx = rIF.nx();
  91   int ny = rIF.ny();
  92
  93   int yPt = ny - y - 1;
  94   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  95   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  96   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  97   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  98   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
  99 }
 100
 101 bool
 102 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 103 {
 104   x = m_xCursor;
 105   y = m_yCursor;
 106
 107   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 108     return true;
 109   else
 110     return false;
 111 }
 112
 113 void
 114 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 115 {
 116   if (! m_pView)
 117     return;
 118
 119   wxClientDC dc(this);
 120   PrepareDC(dc);
 121
 122   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 123
 124   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 125   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 126   int nx = rIF.nx();
 127   int ny = rIF.ny();
 128   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 129   if (event.RightIsDown()) {
 130     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 131       std::ostringstream os;
 132       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 133       if (rIF.isComplex()) {
 134         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 135         if (dImag < 0)
 136           os << " - " << -dImag;
 137         else
 138           os << " + " << dImag;
 139         os << "i\n";
 140       } else
 141         os << "\n";
 142       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 143     } else
 144       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 145   }
 146   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 147     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 148       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 149         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 150       }
 151       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 152       m_xCursor = pt.x;
 153       m_yCursor = yPt;
 154     } else
 155       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 156   }
 157   if (event.LeftUp()) {
 158     std::ostringstream os;
 159     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 160     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 161   }
 162 }
 163
 164 // ImageFileView
 165
 166 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 167
 168 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 169 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 170 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 171 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 172 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 173 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 174 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 175 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 176 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 177 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 178 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 179 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 180 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 181 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 182 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 183 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 184 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 185 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 186 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 187 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 188 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 189 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 190 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 191 #ifdef HAVE_FFT
 192 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 193 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 194 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 195 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 196 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 197 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 198 #endif
 199 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 200 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 201 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 202 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 203 #ifdef HAVE_FFT
 204 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 205 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 206 #endif
 207 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 208 END_EVENT_TABLE()
 209
 210 ImageFileView::ImageFileView(void)
 211 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 212 {
 213   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 214 }
 215
 216 ImageFileView::~ImageFileView(void)
 217 {
 218 }
 219
 220 void
 221 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 222 {
 223   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 224   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 225     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 226   else {
 227     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
 228     std::ostringstream os;
 229     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 230     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 231     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 232     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 233     os << "Data type: ";
 234     if (rIF.isComplex())
 235       os << "Complex\n";
 236     else
 237       os << "Real\n";
 238     os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 239     if (rIF.isComplex()) {
 240       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 241       os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 242     }
 243     if (rIF.nLabels() > 0) {
 244       os << "\n";
 245       rIF.printLabelsBrief (os);
 246     }
 247     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 248     wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 249     dialogMsg.ShowModal();
 250   }
 251 }
 252
 253 void
 254 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 255 {
 256   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 257   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 258   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 259   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 260   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 261   if (iRetVal == wxID_OK) {
 262     m_bMinSpecified = true;
 263     m_bMaxSpecified = true;
 264     double dMin, dMax;
 265     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 266       m_dMinPixel = dMin;
 267       m_dMaxPixel = dMax;
 268       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 269       OnUpdate (this, NULL);
 270     }
 271   }
 272 }
 273
 274 void
 275 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 276 {
 277   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 278   double min, max;
 279   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 280     rIF.getMinMax (min, max);
 281
 282   if (m_bMinSpecified)
 283     min = m_dMinPixel;
 284   if (m_bMaxSpecified)
 285     max = m_dMaxPixel;
 286
 287   DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 288   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 289   if (retVal == wxID_OK) {
 290     m_bMinSpecified = true;
 291     m_bMaxSpecified = true;
 292     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 293     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 294     OnUpdate (this, NULL);
 295   }
 296 }
 297
 298 void
 299 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 300 {
 301   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 302     m_bMinSpecified = false;
 303     m_bMaxSpecified = false;
 304     OnUpdate (this, NULL);
 305   }
 306 }
 307
 308 void
 309 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 310 {
 311   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 312   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 313
 314   if (vecIF.size() == 0) {
 315     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 316   } else {
 317     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(m_frame, "Get Comparison Image", vecIF, true);
 318
 319     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 320       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 321       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 322       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 323       std::ostringstream os;
 324       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 325       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 326       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 327       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 328       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 329       os << "\n";
 330       double d, r, e;
 331       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 332       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 333       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 334       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 335         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 336         if (! pDifferenceDoc) {
 337           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 338           return;
 339         }
 340         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();
 341
 342         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 343         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {
 344           pDifferenceDoc->DeleteAllViews();
 345           return;
 346         }
 347
 348         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 349         differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 350         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 351         differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 352         std::ostringstream osLabel;
 353         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 354           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 355           << os.str().c_str();
 356         differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());
 357         if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 358           pDifferenceDoc->Modify(true);
 359         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
 360         pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 361       }
 362       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 363     }
 364   }
 365 }
 366
 367 void
 368 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 369 {
 370   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 371   rIF.invertPixelValues (rIF);
 372   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 373   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 374     GetDocument()->Modify(TRUE);
 375   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 376 }
 377
 378 void
 379 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 380 {
 381   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 382   rIF.square (rIF);
 383   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 384   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 385     GetDocument()->Modify(TRUE);
 386   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 387 }
 388
 389 void
 390 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 391 {
 392   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 393   rIF.sqrt (rIF);
 394   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 395   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 396     GetDocument()->Modify(TRUE);
 397   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 398 }
 399
 400 void
 401 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 402 {
 403   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 404   rIF.log (rIF);
 405   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 406   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 407     GetDocument()->Modify(TRUE);
 408   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 409 }
 410
 411 void
 412 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 413 {
 414   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 415   rIF.exp (rIF);
 416   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 417   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 418     GetDocument()->Modify(TRUE);
 419   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 420 }
 421
 422 void
 423 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 424 {
 425   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 426   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 427
 428   if (vecIF.size() == 0) {
 429     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 430   } else {
 431     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Add", vecIF, false);
 432
 433     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 434       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 435       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 436       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 437       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 438         if (! pNewDoc) {
 439           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 440           return;
 441         }
 442       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 443       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 444       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 445       std::ostringstream os;
 446       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 447         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 448       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 449       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 450       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 451       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 452       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 453       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 454       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 455         pNewDoc->Modify(TRUE);
 456       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 457       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 458     }
 459   }
 460 }
 461
 462 void
 463 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 464 {
 465   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 466   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 467
 468   if (vecIF.size() == 0) {
 469     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 470   } else {
 471     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 472
 473     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 474       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 475       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 476       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 477       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 478         if (! pNewDoc) {
 479           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 480           return;
 481         }
 482       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 483       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 484       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 485       std::ostringstream os;
 486       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 487         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 488       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 489       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 490       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 491       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 492       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 493       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 494       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 495         pNewDoc->Modify(TRUE);
 496       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 497       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 498     }
 499   }
 500 }
 501
 502 void
 503 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 504 {
 505   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 506   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 507
 508   if (vecIF.size() == 0) {
 509     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 510   } else {
 511     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 512
 513     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 514       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 515       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 516       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 517       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 518         if (! pNewDoc) {
 519           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 520           return;
 521         }
 522       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 523       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 524       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 525       std::ostringstream os;
 526       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 527         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 528       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 529       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 530       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 531       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 532       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 533       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 534       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 535         pNewDoc->Modify(TRUE);
 536       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 537       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 538     }
 539   }
 540 }
 541
 542 void
 543 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 544 {
 545   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 546   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 547
 548   if (vecIF.size() == 0) {
 549     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 550   } else {
 551     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Divide", vecIF, false);
 552
 553     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 554       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 555       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 556       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 557       ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
 558         if (! pNewDoc) {
 559           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 560           return;
 561         }
 562       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 563       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 564       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 565       std::ostringstream os;
 566       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 567         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 568       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 569       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 570       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 571       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 572       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 573       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 574       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 575         pNewDoc->Modify(TRUE);
 576       pNewDoc->UpdateAllViews(this);
 577       pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
 578     }
 579   }
 580 }
 581
 582
 583 #ifdef HAVE_FFT
 584 void
 585 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 586 {
 587   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 588   rIF.fft (rIF);
 589   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 590   m_bMinSpecified = false;
 591   m_bMaxSpecified = false;
 592   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 593     GetDocument()->Modify(TRUE);
 594   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 595 }
 596
 597 void
 598 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 599 {
 600   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 601   rIF.ifft (rIF);
 602   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 603   m_bMinSpecified = false;
 604   m_bMaxSpecified = false;
 605   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 606     GetDocument()->Modify(TRUE);
 607   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 608 }
 609
 610 void
 611 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 612 {
 613   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 614   rIF.fftRows (rIF);
 615   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 616   m_bMinSpecified = false;
 617   m_bMaxSpecified = false;
 618   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 619     GetDocument()->Modify(TRUE);
 620   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 621 }
 622
 623 void
 624 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 625 {
 626   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 627   rIF.ifftRows (rIF);
 628   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 629   m_bMinSpecified = false;
 630   m_bMaxSpecified = false;
 631   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 632     GetDocument()->Modify(TRUE);
 633   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 634 }
 635
 636 void
 637 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 638 {
 639   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 640   rIF.fftCols (rIF);
 641   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 642   m_bMinSpecified = false;
 643   m_bMaxSpecified = false;
 644   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 645     GetDocument()->Modify(TRUE);
 646   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 647 }
 648
 649 void
 650 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 651 {
 652   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 653   rIF.ifftCols (rIF);
 654   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 655   m_bMinSpecified = false;
 656   m_bMaxSpecified = false;
 657   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 658     GetDocument()->Modify(TRUE);
 659   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 660 }
 661 #endif
 662
 663 void
 664 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 665 {
 666   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 667   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
 668   rIF.fourier (rIF);
 669   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 670   m_bMinSpecified = false;
 671   m_bMaxSpecified = false;
 672   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 673     GetDocument()->Modify(TRUE);
 674   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 675 }
 676
 677 void
 678 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 679 {
 680   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 681   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
 682   rIF.inverseFourier (rIF);
 683   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 684   m_bMinSpecified = false;
 685   m_bMaxSpecified = false;
 686   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 687     GetDocument()->Modify(TRUE);
 688   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 689 }
 690
 691 void
 692 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 693 {
 694   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 695   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 696   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 697   m_bMinSpecified = false;
 698   m_bMaxSpecified = false;
 699   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 700     GetDocument()->Modify(TRUE);
 701   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 702 }
 703
 704 void
 705 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 706 {
 707   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 708   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 709   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 710   m_bMinSpecified = false;
 711   m_bMaxSpecified = false;
 712   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 713     GetDocument()->Modify(TRUE);
 714   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 715 }
 716
 717 void
 718 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 719 {
 720   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 721   if (rIF.isComplex()) {
 722     rIF.magnitude (rIF);
 723     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 724   m_bMinSpecified = false;
 725   m_bMaxSpecified = false;
 726   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 727     GetDocument()->Modify(TRUE);
 728   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 729   }
 730 }
 731
 732 void
 733 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 734 {
 735   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 736   if (rIF.isComplex()) {
 737     rIF.phase (rIF);
 738     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 739   m_bMinSpecified = false;
 740   m_bMaxSpecified = false;
 741   if (theApp->getSetModifyNewDocs())
 742     GetDocument()->Modify(TRUE);
 743   GetDocument()->UpdateAllViews(this);
 744   }
 745 }
 746
 747
 748 ImageFileCanvas*
 749 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 750 {
 751   ImageFileCanvas* pCanvas;
 752   int width, height;
 753   parent->GetClientSize(&width, &height);
 754
 755   pCanvas = new ImageFileCanvas (dynamic_cast<ImageFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 756
 757   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 758   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 759   pCanvas->Clear();
 760
 761   return pCanvas;
 762 }
 763
 764 wxFrame*
 765 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 766 {
 767 #if CTSIM_MDI
 768   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame(theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 769 #else
 770   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 771 #endif
 772
 773   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
 774
 775   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
 776   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
 777   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
 778   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
 779   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 780   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
 781
 782   file_menu->AppendSeparator();
 783   file_menu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
 784   file_menu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 785
 786   file_menu->AppendSeparator();
 787   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 788   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 789   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
 790
 791   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 792   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
 793   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
 794   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale");
 795
 796   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 797   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 798   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 799   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 800   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 801   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 802   filter_menu->AppendSeparator();
 803 #ifdef HAVE_FFT
 804   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2D &FFT");
 805   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2D &IFFT");
 806   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 807   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 808   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 809   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 810   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");
 811   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");
 812 #else
 813   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 814   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 815 #endif
 816   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 817   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 818   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 819   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 820
 821   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 822   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 823   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 824   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 825   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 826   image_menu->AppendSeparator();
 827   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 828
 829   wxMenu *analyze_menu = new wxMenu;
 830   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 831   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 832   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 833   analyze_menu->AppendSeparator();
 834   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
 835   analyze_menu->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
 836   analyze_menu->AppendSeparator();
 837   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 838   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
 839   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
 840
 841   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 842   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 843
 844   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 845
 846   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
 847   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 848   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 849   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 850   menu_bar->Append(analyze_menu, "&Analyze");
 851   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 852
 853   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 854
 855   subframe->Centre(wxBOTH);
 856
 857   return subframe;
 858 }
 859
 860
 861 bool
 862 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 863 {
 864   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
 865   SetFrame (m_frame);
 866
 867   m_bMinSpecified = false;
 868   m_bMaxSpecified = false;
 869   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 870
 871   int width, height;
 872   m_frame->GetClientSize (&width, &height);
 873   m_frame->SetTitle("ImageFileView");
 874   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
 875
 876   int x, y;  // X requires a forced resize
 877   m_frame->GetSize(&x, &y);
 878   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
 879   m_frame->SetFocus();
 880   m_frame->Show(true);
 881   Activate(true);
 882
 883   return true;
 884 }
 885
 886 void
 887 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 888 {
 889   if (m_bitmap.Ok())
 890     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 891
 892   int xCursor, yCursor;
 893   if (m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 894     m_canvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 895 }
 896
 897
 898 void
 899 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 900 {
 901   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
 902   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 903   int nx = rIF.nx();
 904   int ny = rIF.ny();
 905   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 906     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 907       double min, max;
 908       rIF.getMinMax (min, max);
 909       if (! m_bMinSpecified)
 910         m_dMinPixel = min;
 911       if (! m_bMaxSpecified)
 912         m_dMaxPixel = max;
 913     }
 914     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
 915
 916     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
 917     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
 918       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
 919         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
 920         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
 921         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
 922         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
 923         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
 924       }
 925     }
 926     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
 927     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
 928     delete imageData;
 929     int xSize = nx;
 930     int ySize = ny;
 931     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
 932     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
 933     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
 934     m_canvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
 935     m_canvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 936   }
 937
 938   if (m_canvas)
 939     m_canvas->Refresh();
 940 }
 941
 942 bool
 943 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
 944 {
 945   if (!GetDocument()->Close())
 946     return false;
 947
 948   // m_canvas->Clear();
 949   m_canvas->m_pView = NULL;
 950   m_canvas = NULL;
 951   wxString s(theApp->GetAppName());
 952   if (m_frame)
 953     m_frame->SetTitle(s);
 954   SetFrame(NULL);
 955
 956   Activate(false);
 957
 958   if (deleteWindow) {
 959     delete m_frame;
 960     return true;
 961   }
 962   return true;
 963 }
 964
 965 void
 966 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
 967 {
 968   ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
 969   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 970   int nx = rIF.nx();
 971   int ny = rIF.ny();
 972   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 973     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 974       double min, max;
 975       rIF.getMinMax (min, max);
 976       if (! m_bMinSpecified)
 977         m_dMinPixel = min;
 978       if (! m_bMaxSpecified)
 979         m_dMaxPixel = max;
 980     }
 981
 982     DialogExportParameters dialogExport (m_frame, m_iDefaultExportFormatID);
 983     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
 984       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
 985       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
 986
 987       wxString strExt;
 988       wxString strWildcard;
 989       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
 990         strExt = ".pgm";
 991         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
 992       }
 993 #ifdef HAVE_PNG
 994       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
 995         strExt = ".png";
 996         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
 997       }
 998 #endif
 999
1000       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1001         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1002       if (strFilename) {
1003         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1004         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1005       }
1006     }
1007   }
1008 }
1009
1010 void
1011 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1012 {
1013   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1014   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1015   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1016
1017   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (m_frame, "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1018   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1019     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1020     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1021     std::ostringstream os;
1022     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1023     ImageFileDocument* pScaledDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1024     if (! pScaledDoc) {
1025       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1026       return;
1027     }
1028     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1029     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1030     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1031     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1032     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1033     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1034     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1035       pScaledDoc->Modify(TRUE);
1036     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1037     pScaledDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
1038   }
1039 }
1040
1041 void
1042 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1043 {
1044   int xCursor, yCursor;
1045   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1046     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1047     return;
1048   }
1049
1050   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1051   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1052   int nx = rIF.nx();
1053   int ny = rIF.ny();
1054
1055   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1056     double* pX = new double [nx];
1057     double* pY = new double [nx];
1058     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1059       pX[i] = i;
1060       pY[i] = v[i][yCursor];
1061     }
1062     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1063     if (! pPlotDoc) {
1064       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1065     } else {
1066       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1067       std::ostringstream os;
1068       os << "Row " << yCursor;
1069       std::string title("title ");
1070       title += os.str();
1071       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1072       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1073       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1074       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1075       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1076       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1077       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1078       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1079       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1080     }
1081     delete pX;
1082     delete pY;
1083     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1084       pPlotDoc->Modify(true);
1085     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1086   }
1087 }
1088
1089 void
1090 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1091 {
1092   int xCursor, yCursor;
1093   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1094     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1095     return;
1096   }
1097
1098   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1099   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1100   int nx = rIF.nx();
1101   int ny = rIF.ny();
1102
1103   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1104     double* pX = new double [ny];
1105     double* pY = new double [ny];
1106     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1107       pX[i] = i;
1108       pY[i] = v[xCursor][i];
1109     }
1110     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1111     if (! pPlotDoc) {
1112       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1113     } else {
1114       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1115       std::ostringstream os;
1116       os << "Column " << xCursor;
1117       std::string title("title ");
1118       title += os.str();
1119       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1120       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1121       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1122       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1123       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1124       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1125       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1126       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1127       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1128     }
1129     delete pX;
1130     delete pY;
1131     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1132       pPlotDoc->Modify(true);
1133     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1134   }
1135 }
1136
1137 #ifdef HAVE_FFT
1138 void
1139 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1140 {
1141   int xCursor, yCursor;
1142   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1143     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1144     return;
1145   }
1146
1147   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1148   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1149   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1150   int nx = rIF.nx();
1151   int ny = rIF.ny();
1152
1153   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1154     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1155
1156     int i;
1157     for (i = 0; i < nx; i++) {
1158       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1159       if (rIF.isComplex())
1160         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1161       else
1162         pcIn[i].im = 0;
1163     }
1164
1165     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1166     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1167     fftw_destroy_plan (plan);
1168
1169     double* pX = new double [nx];
1170     double* pYReal = new double [nx];
1171     double* pYImag = new double [nx];
1172     double* pYMag = new double [nx];
1173     for (i = 0; i < nx; i++) {
1174       pX[i] = i;
1175       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1176       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1177       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1178     }
1179     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1180     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1181     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1182
1183     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1184     if (! pPlotDoc) {
1185       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1186     } else {
1187       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1188       std::ostringstream os;
1189       os << "Row " << yCursor;
1190       std::string title("title ");
1191       title += os.str();
1192       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1193       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1194       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1195       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1196       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1197       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1198       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1199       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1200       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1201       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1202       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 2");
1203       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 3");
1204       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1205       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1206       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1207       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1208       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1209       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1210       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1211     }
1212     delete pX;
1213     delete pYReal;
1214     delete pYImag;
1215     delete pYMag;
1216     delete [] pcIn;
1217
1218     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1219       pPlotDoc->Modify(true);
1220     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1221   }
1222 }
1223
1224 void
1225 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1226 {
1227   int xCursor, yCursor;
1228   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1229     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1230     return;
1231   }
1232
1233   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1234   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1235   int nx = rIF.nx();
1236   int ny = rIF.ny();
1237
1238   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1239     double* pX = new double [ny];
1240     double* pY = new double [ny];
1241     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1242       pX[i] = i;
1243       pY[i] = v[xCursor][i];
1244     }
1245     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1246     if (! pPlotDoc) {
1247       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1248     } else {
1249       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1250       std::ostringstream os;
1251       os << "Column " << xCursor;
1252       std::string title("title ");
1253       title += os.str();
1254       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1255       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1256       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1257       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1258       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1259       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1260       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1261       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1262       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1263     }
1264     delete pX;
1265     delete pY;
1266     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1267       pPlotDoc->Modify(true);
1268     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1269   }
1270 }
1271 #endif
1272
1273 void
1274 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1275 {
1276   int xCursor, yCursor;
1277   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1278     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1279     return;
1280   }
1281
1282   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1283   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1284   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1285     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1286     return;
1287   }
1288   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1289
1290   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1291     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1292     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1293     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1294
1295     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1296     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1297     int nx = rIF.nx();
1298     int ny = rIF.ny();
1299
1300     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1301       double* pX = new double [ny];
1302       double* pY1 = new double [ny];
1303       double* pY2 = new double [ny];
1304       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1305         pX[i] = i;
1306         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1307         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1308       }
1309       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1310       if (! pPlotDoc) {
1311         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1312       } else {
1313         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1314         std::ostringstream os;
1315         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1316         std::string title("title ");
1317         title += os.str();
1318         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1319         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1320         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1321         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1322         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1323         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1324         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1325         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1326         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1327         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1328         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1329         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1330         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1331         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1332         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1333       }
1334       delete pX;
1335       delete pY1;
1336       delete pY2;
1337       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1338         pPlotDoc->Modify(true);
1339       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1340     }
1341   }
1342 }
1343
1344 void
1345 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1346 {
1347   int xCursor, yCursor;
1348   if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1349     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1350     return;
1351   }
1352
1353   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1354   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1355
1356   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1357     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1358     return;
1359   }
1360
1361   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1362
1363   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1364     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1365     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1366     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1367
1368     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1369     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1370     int nx = rIF.nx();
1371     int ny = rIF.ny();
1372
1373     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1374       double* pX = new double [nx];
1375       double* pY1 = new double [nx];
1376       double* pY2 = new double [nx];
1377       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1378         pX[i] = i;
1379         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1380         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1381       }
1382       PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1383       if (! pPlotDoc) {
1384         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1385       } else {
1386         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1387         std::ostringstream os;
1388         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1389         std::string title("title ");
1390         title += os.str();
1391         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1392         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1393         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1394         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1395         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1396         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1397         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1398         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1399         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1400         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1401         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1402         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1403         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1404         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1405         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1406       }
1407       delete pX;
1408       delete pY1;
1409       delete pY2;
1410       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1411         pPlotDoc->Modify(true);
1412       pPlotDoc->UpdateAllViews();
1413     }
1414   }
1415 }
1416
1417 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1418
1419 void
1420 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1421 {
1422   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
1423   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1424   int nx = rIF.nx();
1425   int ny = rIF.ny();
1426
1427   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1428     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
1429     if (! pPlotDoc) {
1430       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1431       return;
1432     }
1433
1434     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1435     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1436     double dMin, dMax;
1437     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1438     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1439
1440     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1441       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1442       pY[i] = 0;
1443     }
1444     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1445       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1446         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1447         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1448           pY[iBin] += 1;
1449       }
1450
1451     PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1452     std::ostringstream os;
1453     os << "Histogram";
1454     std::string title("title ");
1455     title += os.str();
1456     rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1457     rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1458     rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1459     rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1460     rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1461     rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1462     rPlotFile.addColumn (0, pX);
1463     rPlotFile.addColumn (1, pY);
1464     delete pX;
1465     delete pY;
1466     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1467       pPlotDoc->Modify(true);
1468     pPlotDoc->UpdateAllViews();
1469   }
1470 }
1471
1472
1473 // PhantomCanvas
1474
1475 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1476 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1477 {
1478   m_pView = v;
1479 }
1480
1481 void
1482 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1483 {
1484   if (m_pView)
1485     m_pView->OnDraw(& dc);
1486 }
1487
1488
1489 // PhantomView
1490
1491 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomView, wxView)
1492
1493 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomView, wxView)
1494 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomView::OnProperties)
1495 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomView::OnRasterize)
1496 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomView::OnProjections)
1497 END_EVENT_TABLE()
1498
1499 PhantomView::PhantomView(void)
1500 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
1501 {
1502   m_iDefaultNDet = 367;
1503   m_iDefaultNView = 320;
1504   m_iDefaultNSample = 2;
1505   m_dDefaultRotation = 1;
1506   m_dDefaultFocalLength = 2;
1507   m_dDefaultFieldOfView = 1;
1508   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1509   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1510
1511   m_iDefaultRasterNX = 256;
1512   m_iDefaultRasterNY = 256;
1513   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1514 }
1515
1516 PhantomView::~PhantomView(void)
1517 {
1518 }
1519
1520 void
1521 PhantomView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1522 {
1523   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1524   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1525   std::ostringstream os;
1526   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1527   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1528   rPhantom.printDefinitions (os);
1529 #if DEBUG
1530   rPhantom.print (os);
1531 #endif
1532   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1533   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1534 }
1535
1536
1537 void
1538 PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1539 {
1540   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (m_frame, m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView, m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
1541   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1542   if (retVal == wxID_OK) {
1543     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1544     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1545     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1546     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1547     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1548     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1549     m_dDefaultFieldOfView = dialogProjection.getFieldOfViewRatio();
1550     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1551     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1552
1553     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1554       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1555       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = dynamic_cast<ProjectionFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.pj", wxDOC_SILENT));
1556       if (! pProjectionDoc) {
1557         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1558         return;
1559       }
1560       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
1561       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
1562       if (theScanner.fail()) {
1563         *theApp->getLog() << "Failed making scanner: " << theScanner.failMessage().c_str() << "\n";
1564         return;
1565       }
1566       rProj.initFromScanner (theScanner);
1567       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
1568
1569       Timer timer;
1570       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1571         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(m_frame));
1572         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1573           ::wxYield();
1574           ::wxYield();
1575           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1576             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1577             return;
1578           }
1579           ::wxYield();
1580           ::wxYield();
1581           while (dialogProjections.isPaused()) {
1582             ::wxYield();
1583             ::wxUsleep(50);
1584           }
1585         }
1586       } else {
1587         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
1588         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
1589           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1590           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1591             pProjectionDoc->DeleteAllViews();
1592             return;
1593           }
1594         }
1595       }
1596
1597       std::ostringstream os;
1598       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
1599       rProj.setCalcTime (timer.timerEnd());
1600       rProj.setRemark (os.str());
1601       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1602
1603       m_frame->Lower();
1604       ::wxYield();
1605       ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());
1606       if (projView) {
1607         projView->getFrame()->SetFocus();
1608         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1609       }
1610       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
1611         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
1612           pFrame->SetFocus();
1613           pFrame->Raise();
1614         }
1615         theApp->getDocManager()->ActivateView (pView, true, false);
1616       }
1617       ::wxYield();
1618       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1619         pProjectionDoc->Modify(true);
1620       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
1621     }
1622   }
1623 }
1624
1625
1626 void
1627 PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1628 {
1629   DialogGetRasterParameters dialogRaster (m_frame, m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY, m_iDefaultRasterNSamples);
1630   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1631   if (retVal == wxID_OK) {
1632     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1633     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1634     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1635     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1636       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1637     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1638       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1639       ImageFileDocument* pRasterDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1640       if (! pRasterDoc) {
1641         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1642         return;
1643       }
1644       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
1645
1646       imageFile.setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNX);
1647       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
1648       Timer timer;
1649       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
1650         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1651         if (! dlgProgress.Update(i+1)) {
1652           pRasterDoc->DeleteAllViews();
1653           return;
1654         }
1655       }
1656       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1657         pRasterDoc->Modify(true);
1658       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
1659       std::ostringstream os;
1660       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
1661         << m_iDefaultRasterNY << ", nSamples=" << m_iDefaultRasterNSamples;
1662       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1663       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
1664       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());
1665       if (rasterView) {
1666         rasterView->getFrame()->SetFocus();
1667         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
1668       }
1669
1670     }
1671   }
1672 }
1673
1674
1675 PhantomCanvas*
1676 PhantomView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
1677 {
1678   PhantomCanvas* pCanvas;
1679   int width, height;
1680   parent->GetClientSize(&width, &height);
1681
1682   pCanvas = new PhantomCanvas (dynamic_cast<PhantomView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
1683
1684   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1685   pCanvas->Clear();
1686
1687   return pCanvas;
1688 }
1689
1690 wxFrame*
1691 PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
1692 {
1693 #if CTSIM_MDI
1694   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame(theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1695 #else
1696   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
1697 #endif
1698
1699   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
1700
1701   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
1702   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
1703   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
1704   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
1705   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
1706
1707   file_menu->AppendSeparator();
1708   file_menu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
1709
1710   file_menu->AppendSeparator();
1711   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
1712   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
1713   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
1714
1715   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
1716   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...");
1717   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...");
1718
1719   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
1720   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
1721   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
1722
1723   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
1724
1725   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
1726   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
1727   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1728
1729   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1730
1731   subframe->Centre(wxBOTH);
1732
1733   return subframe;
1734 }
1735
1736
1737 bool
1738 PhantomView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1739 {
1740   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
1741   SetFrame(m_frame);
1742
1743   int width, height;
1744   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
1745   m_frame->SetTitle("PhantomView");
1746   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
1747
1748 #ifdef __X__
1749   int x, y;  // X requires a forced resize
1750   m_frame->GetSize(&x, &y);
1751   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
1752 #endif
1753
1754   m_frame->Show(true);
1755   Activate(true);
1756
1757   return true;
1758 }
1759
1760
1761 void
1762 PhantomView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
1763 {
1764   if (m_canvas)
1765     m_canvas->Refresh();
1766 }
1767
1768 bool
1769 PhantomView::OnClose (bool deleteWindow)
1770 {
1771   if (!GetDocument()->Close())
1772     return false;
1773
1774 //  m_canvas->Clear();
1775   m_canvas->m_pView = NULL;
1776   m_canvas = NULL;
1777 //  wxString s(wxTheApp->GetAppName());
1778 //  if (m_frame)
1779 //    m_frame->SetTitle(s);
1780   SetFrame(NULL);
1781
1782   Activate(false);
1783
1784   if (deleteWindow) {
1785
1786     delete m_frame;
1787     return true;
1788   }
1789   return true;
1790 }
1791
1792 void
1793 PhantomView::OnDraw (wxDC* dc)
1794 {
1795   int xsize, ysize;
1796   m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
1797   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
1798   SGP sgp (driver);
1799   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1800   sgp.setColor (C_RED);
1801   rPhantom.show (sgp);
1802 }
1803
1804 // ProjectionCanvas
1805
1806 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1807 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1808 {
1809   m_pView = v;
1810 }
1811
1812 void
1813 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
1814 {
1815   if (m_pView)
1816     m_pView->OnDraw(& dc);
1817 }
1818
1819 // ProjectionFileView
1820
1821 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
1822
1823 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
1824 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
1825 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
1826 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
1827 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
1828 END_EVENT_TABLE()
1829
1830 ProjectionFileView::ProjectionFileView(void)
1831 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
1832 {
1833   m_iDefaultNX = 256;
1834   m_iDefaultNY = 256;
1835   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
1836   m_dDefaultFilterParam = 1.;
1837 #if HAVE_FFTW
1838   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
1839   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
1840 #else
1841   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
1842   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
1843 #endif
1844   m_iDefaultZeropad = 1;
1845   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF3;
1846   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
1847   m_iDefaultInterpParam = 1;
1848   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1849
1850   m_iDefaultPolarNX = 256;
1851   m_iDefaultPolarNY = 256;
1852   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
1853   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
1854 }
1855
1856 ProjectionFileView::~ProjectionFileView(void)
1857 {
1858 }
1859
1860 void
1861 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1862 {
1863   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
1864   std::ostringstream os;
1865   rProj.printScanInfo(os);
1866   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
1867   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
1868   dialogMsg.ShowModal();
1869 }
1870
1871
1872 void
1873 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
1874 {
1875   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
1876   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (m_frame, "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
1877     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
1878   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
1879     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
1880     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
1881     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
1882     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1883     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
1884     if (! pPolarDoc) {
1885       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1886       return;
1887     }
1888     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
1889     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
1890     rProj.convertPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation);
1891     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
1892     std::ostringstream os;
1893     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
1894       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
1895       << strInterpolation.c_str();
1896     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1897     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
1898     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1899       pPolarDoc->Modify(true);
1900     pPolarDoc->UpdateAllViews();
1901     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
1902   }
1903 }
1904
1905 void
1906 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
1907 {
1908   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
1909   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (m_frame, "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
1910     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
1911   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
1912     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
1913     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
1914     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
1915     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
1916     ImageFileDocument* pPolarDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1917     ImageFile& rIF = pPolarDoc->getImageFile();
1918     if (! pPolarDoc) {
1919       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1920       return;
1921     }
1922     rIF.setArraySize (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
1923     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
1924     rProj.convertFFTPolar (rIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
1925     rIF.labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
1926     std::ostringstream os;
1927     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
1928       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
1929       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
1930     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1931     rIF.labelAdd (os.str().c_str());
1932     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
1933       pPolarDoc->Modify(true);
1934     pPolarDoc->UpdateAllViews();
1935     pPolarDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
1936   }}
1937
1938 void
1939 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
1940 {
1941   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
1942 }
1943
1944 void
1945 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
1946 {
1947   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (m_frame, m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration, m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector, m_iDefaultTrace);
1948
1949   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
1950   if (retVal == wxID_OK) {
1951     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
1952     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
1953     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
1954     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
1955     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
1956     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
1957     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
1958     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
1959     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
1960     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
1961     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
1962     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
1963     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
1964     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
1965     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
1966     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
1967     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
1968       ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
1969       if (! pReconDoc) {
1970         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1971         return;
1972       }
1973       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
1974       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
1975       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
1976
1977       if (m_iDefaultFilterMethod != ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION && m_iDefaultFilterGeneration == ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT && rProj.geometry() != Scanner::GEOMETRY_PARALLEL) {
1978         wxMessageBox ("Sorry!\nCurrently, frequency-based filtering with direct filter generation is not support for geometries other than parallel.\nAborting command.", "Not Supported", wxOK | wxICON_WARNING, m_frame);
1979         return;
1980       }
1981
1982       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
1983
1984       Timer timerRecon;
1985       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1986         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, m_frame);
1987         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
1988           ::wxYield();
1989           ::wxYield();
1990           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView)) {
1991             delete pDlgReconstruct;
1992             delete pReconstruct;
1993             pReconDoc->DeleteAllViews();
1994             return;
1995           }
1996           ::wxYield();
1997           ::wxYield();
1998           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
1999             ::wxYield();
2000             ::wxUsleep(50);
2001           }
2002         }
2003         delete pDlgReconstruct;
2004       } else {
2005         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
2006         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
2007           pReconstruct->reconstructView (i, 1);
2008           if (! dlgProgress.Update(i + 1)) {
2009             delete pReconstruct;
2010             pReconDoc->DeleteAllViews();
2011             return;
2012           }
2013         }
2014       }
2015       delete pReconstruct;
2016       if (theApp->getSetModifyNewDocs())
2017         pReconDoc->Modify(true);
2018       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
2019       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());
2020       if (rasterView) {
2021         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2022         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2023       }
2024       std::ostringstream os;
2025       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2026       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2027       imageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
2028       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2029     }
2030   }
2031 }
2032
2033
2034 ProjectionFileCanvas*
2035 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2036 {
2037   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2038   int width, height;
2039   parent->GetClientSize(&width, &height);
2040
2041   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (dynamic_cast<ProjectionFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2042
2043   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2044   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2045   pCanvas->Clear();
2046
2047   return pCanvas;
2048 }
2049
2050 wxFrame*
2051 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2052 {
2053 #ifdef CTSIM_MDI
2054   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame (theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2055 #else
2056   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2057 #endif
2058
2059   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
2060
2061   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
2062   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
2063   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
2064   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
2065   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2066   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2067
2068   file_menu->AppendSeparator();
2069   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2070
2071   file_menu->AppendSeparator();
2072   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2073   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2074   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2075
2076   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2077   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...");
2078   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...");
2079
2080   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2081   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...");
2082   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...");
2083
2084   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2085   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
2086   help_menu->AppendSeparator();
2087   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2088
2089   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2090
2091   menu_bar->Append (file_menu, "&File");
2092   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2093   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2094   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2095
2096   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2097
2098   subframe->Centre(wxBOTH);
2099
2100   return subframe;
2101 }
2102
2103
2104 bool
2105 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2106 {
2107   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2108   SetFrame(m_frame);
2109
2110   int width, height;
2111   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2112   m_frame->SetTitle("ProjectionFileView");
2113   m_canvas = CreateCanvas(this, m_frame);
2114
2115 #ifdef __X__
2116   int x, y;  // X requires a forced resize
2117   m_frame->GetSize(&x, &y);
2118   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2119 #endif
2120
2121   m_frame->Show(true);
2122   Activate(true);
2123
2124   return true;
2125 }
2126
2127 void
2128 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2129 {
2130   if (m_bitmap.Ok())
2131     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2132 }
2133
2134
2135 void
2136 ProjectionFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2137 {
2138   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2139   const int nDet = rProj.nDet();
2140   const int nView = rProj.nView();
2141   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2142     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2143     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2144     double min = detval[0];
2145     double max = detval[0];
2146     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2147       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2148       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2149       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2150         if (min > detval[ix])
2151           min = detval[ix];
2152         else if (max < detval[ix])
2153           max = detval[ix];
2154       }
2155     }
2156
2157     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2158     double scale = (max - min) / 255;
2159     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2160       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2161       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2162       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2163         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2164         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2165         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2166         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2167       }
2168     }
2169     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2170     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2171     delete imageData;
2172     int xSize = nDet;
2173     int ySize = nView;
2174     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2175     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2176     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
2177     m_canvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2178   }
2179
2180   if (m_canvas)
2181     m_canvas->Refresh();
2182 }
2183
2184 bool
2185 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2186 {
2187   if (!GetDocument()->Close())
2188     return false;
2189
2190   // m_canvas->Clear();
2191   m_canvas->m_pView = NULL;
2192   m_canvas = NULL;
2193   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2194   if (m_frame)
2195     m_frame->SetTitle(s);
2196   SetFrame(NULL);
2197
2198   Activate(false);
2199
2200   if (deleteWindow) {
2201     delete m_frame;
2202     return true;
2203   }
2204   return true;
2205 }
2206
2207
2208
2209 // PlotFileCanvas
2210 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2211 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2212 {
2213   m_pView = v;
2214 }
2215
2216 void
2217 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2218 {
2219   if (m_pView)
2220     m_pView->OnDraw(& dc);
2221 }
2222
2223
2224 // PlotFileView
2225
2226 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2227
2228 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2229 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2230 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2231 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2232 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2233 END_EVENT_TABLE()
2234
2235 PlotFileView::PlotFileView(void)
2236 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_pEZPlot(NULL)
2237 {
2238   m_bMinSpecified = false;
2239   m_bMaxSpecified = false;
2240 }
2241
2242 PlotFileView::~PlotFileView(void)
2243 {
2244   if (m_pEZPlot)
2245     delete m_pEZPlot;
2246 }
2247
2248 void
2249 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2250 {
2251   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2252   std::ostringstream os;
2253   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2254   rPlot.printHeaders (os);
2255   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
2256   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2257   dialogMsg.ShowModal();
2258 }
2259
2260
2261 void
2262 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2263 {
2264   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2265   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2266   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2267   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2268   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2269   if (iRetVal == wxID_OK) {
2270     m_bMinSpecified = true;
2271     m_bMaxSpecified = true;
2272     double dMin, dMax;
2273     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2274       m_dMinPixel = dMin;
2275       m_dMaxPixel = dMax;
2276       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2277       OnUpdate (this, NULL);
2278     }
2279   }
2280 }
2281
2282 void
2283 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2284 {
2285   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2286   double min;
2287   double max;
2288
2289   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2290     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2291       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2292       return;
2293     }
2294   }
2295
2296   if (m_bMinSpecified)
2297     min = m_dMinPixel;
2298   if (m_bMaxSpecified)
2299     max = m_dMaxPixel;
2300
2301   DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2302   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2303   if (retVal == wxID_OK) {
2304     m_bMinSpecified = true;
2305     m_bMaxSpecified = true;
2306     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2307     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2308     OnUpdate (this, NULL);
2309   }
2310 }
2311
2312 void
2313 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2314 {
2315   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2316     m_bMinSpecified = false;
2317     m_bMaxSpecified = false;
2318     OnUpdate (this, NULL);
2319   }
2320 }
2321
2322
2323 PlotFileCanvas*
2324 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
2325 {
2326   PlotFileCanvas* pCanvas;
2327   int width, height;
2328   parent->GetClientSize(&width, &height);
2329
2330   pCanvas = new PlotFileCanvas (dynamic_cast<PlotFileView*>(view), parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2331
2332   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2333   pCanvas->Clear();
2334
2335   return pCanvas;
2336 }
2337
2338 wxFrame*
2339 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2340 {
2341 #ifdef CTSIM_MDI
2342   wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame (theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2343 #else
2344   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2345 #endif
2346
2347   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
2348
2349   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
2350   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
2351   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
2352   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
2353   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2354   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2355
2356   file_menu->AppendSeparator();
2357   file_menu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2358
2359   file_menu->AppendSeparator();
2360   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2361   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2362   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2363
2364   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2365   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
2366   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
2367   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale");
2368
2369   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2370   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
2371   help_menu->AppendSeparator();
2372   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2373
2374   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2375
2376   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
2377   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2378   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2379
2380   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2381
2382   subframe->Centre(wxBOTH);
2383
2384   return subframe;
2385 }
2386
2387
2388 bool
2389 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2390 {
2391   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
2392   SetFrame(m_frame);
2393
2394   m_bMinSpecified = false;
2395   m_bMaxSpecified = false;
2396   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2397
2398   int width, height;
2399   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
2400   m_frame->SetTitle ("Plot File");
2401   m_canvas = CreateCanvas (this, m_frame);
2402
2403 #ifdef __X__
2404   int x, y;  // X requires a forced resize
2405   m_frame->GetSize(&x, &y);
2406   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
2407 #endif
2408
2409   m_frame->Show(true);
2410   Activate(true);
2411
2412   return true;
2413 }
2414
2415 void
2416 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2417 {
2418   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2419   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2420   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2421
2422   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2423     int xsize, ysize;
2424     m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2425     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2426     SGP sgp (driver);
2427     if (m_pEZPlot)
2428       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2429   }
2430 }
2431
2432
2433 void
2434 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2435 {
2436     const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2437     const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2438     const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2439
2440     if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2441       if (m_pEZPlot)
2442         delete m_pEZPlot;
2443       m_pEZPlot = new EZPlot;
2444
2445       for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2446         m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2447
2448       if (m_bMinSpecified) {
2449         std::ostringstream os;
2450         os << "ymin " << m_dMinPixel;
2451         m_pEZPlot->ezset (os.str());
2452       }
2453
2454       if (m_bMaxSpecified) {
2455         std::ostringstream os;
2456         os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2457         m_pEZPlot->ezset (os.str());
2458       }
2459
2460       m_pEZPlot->ezset("box");
2461       m_pEZPlot->ezset("grid");
2462
2463       double* pdXaxis = new double [iNRecords];
2464       rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
2465
2466       double* pdY = new double [iNRecords];
2467       for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
2468         rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
2469         m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
2470       }
2471
2472       delete pdXaxis;
2473       delete pdY;
2474     }
2475
2476     if (m_canvas)
2477       m_canvas->Refresh();
2478 }
2479
2480 bool
2481 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2482 {
2483   if (!GetDocument()->Close())
2484     return false;
2485
2486   // m_canvas->Clear();
2487   m_canvas->m_pView = NULL;
2488   m_canvas = NULL;
2489   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2490   if (m_frame)
2491     m_frame->SetTitle(s);
2492   SetFrame(NULL);
2493
2494   Activate(false);
2495
2496   if (deleteWindow) {
2497     delete m_frame;
2498     return true;
2499   }
2500   return true;
2501 }
2502