tools/ifexport.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          ifexport.cpp
   5 **   Purpose:       Convert an image file to a viewable image
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  April 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2010 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  13 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  14 **  published by the Free Software Foundation.
  15 **
  16 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  17 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  19 **  GNU General Public License for more details.
  20 **
  21 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  22 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  23 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  24 ******************************************************************************/
  25
  26 #include "ct.h"
  27
  28
  29 enum { O_SCALE, O_MIN, O_MAX, O_AUTO, O_CENTER, O_STATS, O_FORMAT, O_LABELS,
  30        O_HELP, O_VERBOSE, O_VERSION, O_DEBUG };
  31
  32 static struct option my_options[] =
  33 {
  34   {"scale", 1, 0, O_SCALE},
  35   {"min", 1, 0, O_MIN},
  36   {"max", 1, 0, O_MAX},
  37   {"auto", 1, 0, O_AUTO},
  38   {"center", 1, 0, O_CENTER},
  39   {"format", 1, 0, O_FORMAT},
  40   {"labels", 0, 0, O_LABELS},
  41   {"stats", 0, 0, O_STATS},
  42   {"verbose", 0, 0, O_VERBOSE},
  43   {"debug", 0, 0, O_DEBUG},
  44   {"help", 0, 0, O_HELP},
  45   {"version", 0, 0, O_VERSION},
  46   {0, 0, 0, 0}
  47 };
  48
  49 static const char* g_szIdStr = "$Id$";
  50
  51 enum { O_AUTO_FULL, O_AUTO_STD0_1, O_AUTO_STD0_5, O_AUTO_STD1, O_AUTO_STD2, O_AUTO_STD3 };
  52 static const char O_AUTO_FULL_STR[]="full";
  53 static const char O_AUTO_STD0_1_STR[]="std0.1";
  54 static const char O_AUTO_STD0_5_STR[]="std0.5";
  55 static const char O_AUTO_STD1_STR[]="std1";
  56 static const char O_AUTO_STD2_STR[]="std2";
  57 static const char O_AUTO_STD3_STR[]="std3";
  58
  59 enum { O_CENTER_MEDIAN, O_CENTER_MEAN, O_CENTER_MODE };
  60 static const char O_CENTER_MEAN_STR[]="mean";
  61 static const char O_CENTER_MODE_STR[]="mode";
  62 static const char O_CENTER_MEDIAN_STR[]="median";
  63
  64 enum { O_FORMAT_PNG, O_FORMAT_PNG16, O_FORMAT_PGM, O_FORMAT_PGMASC, O_FORMAT_RAW, O_FORMAT_TEXT };
  65 static const char O_FORMAT_PNG_STR[]="png" ;
  66 static const char O_FORMAT_PNG16_STR[]="png16" ;
  67 static const char O_FORMAT_PGM_STR[]="pgm";
  68 static const char O_FORMAT_PGMASC_STR[]="pgmasc";
  69 static const char O_FORMAT_TEXT_STR[]="text";
  70 static const char O_FORMAT_RAW_STR[]="raw";
  71
  72 void
  73 ifexport_usage (const char *program)
  74 {
  75   std::cout << "usage: " << fileBasename(program) << " ifname outfile [OPTIONS]\n";
  76   std::cout << "Convert IF file to an image file\n";
  77   std::cout << std::endl;
  78   std::cout << "     ifname     Name of input file\n";
  79   std::cout << "     outfile    Name of output file\n";
  80   std::cout << "     --format   Output format\n";
  81   std::cout << "         pgm    PGM (portable graymap) format (default)\n";
  82   std::cout << "         pgmasc PGM (portable graymap) ASCII format\n";
  83   std::cout << "         text   Text format\n";
  84   std::cout << "         raw    Raw format\n";
  85 #ifdef HAVE_PNG
  86   std::cout << "         png    PNG (8-bit) format\n";
  87   std::cout << "         png16  PNG (16-bit) format\n";
  88 #endif
  89   std::cout << "     --center   Center of window\n";
  90   std::cout << "         median Median is center of window (default)\n";
  91   std::cout << "         mode   Mode is center of window\n";
  92   std::cout << "         mean   Mean is center of window\n";
  93   std::cout << "     --auto     Set auto window\n";
  94   std::cout << "         full   Use full window (default)\n";
  95   std::cout << "         std0.1 Use 0.1 standard deviation about center\n";
  96   std::cout << "         std0.5 Use 0.5 standard deviation about center\n";
  97   std::cout << "         std1   Use one standard deviation about center\n";
  98   std::cout << "         std2   Use two standard deviations about center\n";
  99   std::cout << "         std3   Use three standard deviations about center\n";
 100   std::cout << "     --scale    Scaling factor for output size\n";
 101   std::cout << "     --min      Set minimum intensity\n";
 102   std::cout << "     --max      Set maximum intensity\n";
 103   std::cout << "     --stats    Print image statistics\n";
 104   std::cout << "     --labels   Print image labels\n";
 105   std::cout << "     --debug    Set debug mode\n";
 106   std::cout << "     --verbose  Set verbose mode\n";
 107   std::cout << "     --version  Print version\n";
 108   std::cout << "     --help     Print this help message\n";
 109 }
 110
 111
 112 int
 113 ifexport_main (int argc, char *const argv[])
 114 {
 115   ImageFile* pim = NULL;
 116   double densmin = HUGE_VAL, densmax = -HUGE_VAL;
 117   char *in_file, *out_file;
 118   int opt_verbose = 0;
 119   int opt_scale = 1;
 120   int opt_auto = O_AUTO_FULL;
 121   int opt_set_max = 0;
 122   int opt_set_min = 0;
 123   int opt_stats = 0;
 124   int opt_debug = 0;
 125   int opt_center = O_CENTER_MEDIAN;
 126   int opt_format = O_FORMAT_PGM;
 127   int opt_labels = 0;
 128
 129   while (1)
 130     {
 131       int c = getopt_long (argc, argv, "", my_options, NULL);
 132       char *endptr = NULL;
 133       char *endstr;
 134
 135       if (c == -1)
 136         break;
 137
 138       switch (c)
 139         {
 140         case O_MIN:
 141           opt_set_min = 1;
 142           densmin = strtod(optarg, &endptr);
 143           endstr = optarg + strlen(optarg);
 144           if (endptr != endstr)
 145             {
 146               sys_error (ERR_SEVERE, "Error setting --min to %s", optarg);
 147               ifexport_usage(argv[0]);
 148               return (1);
 149             }
 150           break;
 151         case O_MAX:
 152           opt_set_max = 1;
 153           densmax = strtod(optarg, &endptr);
 154           endstr = optarg + strlen(optarg);
 155           if (endptr != endstr)
 156             {
 157               sys_error (ERR_SEVERE, "Error setting --max to %s", optarg);
 158               ifexport_usage(argv[0]);
 159               return (1);
 160             }
 161           break;
 162         case O_SCALE:
 163           opt_scale = strtol(optarg, &endptr, 10);
 164           endstr = optarg + strlen(optarg);
 165           if (endptr != endstr)
 166             {
 167               sys_error (ERR_SEVERE, "Error setting --scale to %s", optarg);
 168               ifexport_usage(argv[0]);
 169               return (1);
 170             }
 171           break;
 172         case O_AUTO:
 173           if (strcmp(optarg, O_AUTO_FULL_STR) == 0)
 174             opt_auto = O_AUTO_FULL;
 175           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD1_STR) == 0)
 176             opt_auto = O_AUTO_STD1;
 177           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD0_5_STR) == 0)
 178             opt_auto = O_AUTO_STD0_5;
 179           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD0_1_STR) == 0)
 180             opt_auto = O_AUTO_STD0_1;
 181           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD2_STR) == 0)
 182             opt_auto = O_AUTO_STD2;
 183           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD3_STR) == 0)
 184             opt_auto = O_AUTO_STD3;
 185           else
 186             {
 187               sys_error (ERR_SEVERE, "Invalid auto mode %s", optarg);
 188               ifexport_usage(argv[0]);
 189               return (1);
 190             }
 191                 break;
 192         case O_CENTER:
 193           if (strcmp(optarg, O_CENTER_MEDIAN_STR) == 0)
 194             opt_center = O_CENTER_MEDIAN;
 195           else if (strcmp(optarg, O_CENTER_MEAN_STR) == 0)
 196             opt_center = O_CENTER_MEAN;
 197           else if (strcmp(optarg, O_CENTER_MODE_STR) == 0)
 198             opt_center = O_CENTER_MODE;
 199           else
 200             {
 201               sys_error (ERR_SEVERE, "Invalid center mode %s", optarg);
 202               ifexport_usage(argv[0]);
 203               return (1);
 204             }
 205           break;
 206         case O_FORMAT:
 207           if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PGM_STR) == 0)
 208             opt_format = O_FORMAT_PGM;
 209           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PGMASC_STR) == 0)
 210             opt_format = O_FORMAT_PGMASC;
 211 #if HAVE_PNG
 212           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PNG_STR) == 0)
 213             opt_format = O_FORMAT_PNG;
 214           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PNG16_STR) == 0)
 215             opt_format = O_FORMAT_PNG16;
 216 #endif
 217           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_TEXT_STR) == 0)
 218                 opt_format = O_FORMAT_TEXT;
 219           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_RAW_STR) == 0)
 220                 opt_format = O_FORMAT_RAW;
 221 #if HAVE_GIF
 222           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_GIF_STR) == 0)
 223             opt_format = O_FORMAT_GIF;
 224 #endif
 225   else {
 226               sys_error (ERR_SEVERE, "Invalid format mode %s", optarg);
 227               ifexport_usage(argv[0]);
 228               return (1);
 229             }
 230           break;
 231         case O_LABELS:
 232           opt_labels = 1;
 233           break;
 234         case O_VERBOSE:
 235           opt_verbose = 1;
 236           break;
 237         case O_DEBUG:
 238           opt_debug = 1;
 239           break;
 240         case O_STATS:
 241           opt_stats = 1;
 242           break;
 243         case O_VERSION:
 244 #ifdef VERSION
 245           std::cout << "Version " << VERSION << std::endl << g_szIdStr << std::endl;
 246 #else
 247           std::cout << "Unknown version number\n";
 248 #endif
 249           return (0);
 250         case O_HELP:
 251         case '?':
 252           ifexport_usage(argv[0]);
 253           return (0);
 254         default:
 255           ifexport_usage(argv[0]);
 256           return (1);
 257         }
 258     }
 259
 260   if (optind + 2 != argc) {
 261     ifexport_usage(argv[0]);
 262     return (1);
 263   }
 264
 265   in_file = argv[optind];
 266   out_file = argv[optind+1];
 267
 268   pim = new ImageFile ();
 269   ImageFile& im = *pim;
 270   if (! im.fileRead(in_file)) {
 271     sys_error (ERR_FATAL, "File %s does not exist", in_file);
 272     return (1);
 273   }
 274
 275   if (opt_labels)
 276     im.printLabels(std::cout);
 277
 278   if (opt_stats || (! (opt_set_max && opt_set_min))) {
 279       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 280       double window = 0;
 281       im.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 282
 283       if (opt_auto == O_AUTO_FULL) {
 284         if (! opt_set_max)
 285             densmax = max;
 286         if (! opt_set_min)
 287             densmin = min;
 288       }
 289       if (opt_stats || opt_auto != O_AUTO_FULL) {
 290
 291           if (opt_auto == O_AUTO_FULL)
 292               ;
 293           else if (opt_auto == O_AUTO_STD1)
 294               window = stddev;
 295           else if (opt_auto == O_AUTO_STD0_1)
 296               window = stddev * 0.1;
 297           else if (opt_auto == O_AUTO_STD0_5)
 298               window = stddev * 0.5;
 299           else if (opt_auto == O_AUTO_STD2)
 300               window = stddev * 2;
 301           else if (opt_auto == O_AUTO_STD3)
 302               window = stddev * 3;
 303           else {
 304               sys_error (ERR_SEVERE, "Internal Error: Invalid auto mode %d", opt_auto);
 305               return (1);
 306           }
 307       }
 308       if (opt_stats) {
 309           std::cout <<"nx: " << im.nx() << std::endl;
 310           std::cout <<"ny: " << im.ny() << std::endl;
 311           std::cout <<"min: " << min << std::endl;
 312           std::cout <<"max: " << max << std::endl;
 313           std::cout <<"mean: " << mean << std::endl;
 314           std::cout <<"mode: " << mode << std::endl;
 315           std::cout <<"stddev: " << stddev << std::endl;
 316       }
 317       if (opt_auto != O_AUTO_FULL) {
 318           double center;
 319
 320           if (opt_center == O_CENTER_MEDIAN)
 321               center = median;
 322           else if (opt_center == O_CENTER_MODE)
 323               center = mode;
 324           else if (opt_center == O_CENTER_MEAN)
 325               center = mean;
 326           else {
 327               sys_error (ERR_SEVERE, "Internal Error: Invalid center mode %d", opt_center);
 328               return (1);
 329           }
 330           if (! opt_set_max)
 331               densmax = center + window;
 332           if (! opt_set_min)
 333               densmin = center - window;
 334       }
 335   }
 336
 337   if (opt_stats) {
 338     std::cout << "min display: " << densmin << std::endl;
 339     std::cout << "max display: " << densmax << std::endl;
 340   }
 341
 342   if (opt_format == O_FORMAT_PGM)
 343     im.writeImagePGM (out_file, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 344   else if (opt_format == O_FORMAT_PGMASC)
 345     im.writeImagePGMASCII (out_file, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 346 #if HAVE_PNG
 347   else if (opt_format == O_FORMAT_PNG)
 348     im.writeImagePNG (out_file, 8, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 349   else if (opt_format == O_FORMAT_PNG16)
 350     im.writeImagePNG (out_file, 16, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 351 #endif
 352 #if HAVE_GIF
 353   else if (opt_format == O_FORMAT_GIF)
 354     im.writeImageGIF (out_file, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 355 #endif
 356   else if (opt_format == O_FORMAT_TEXT)
 357         im.writeImageText (out_file);
 358   else if (opt_format == O_FORMAT_RAW)
 359         im.writeImageRaw (out_file, opt_scale, opt_scale);
 360   else
 361     {
 362       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal Error: Invalid format mode %d", opt_format);
 363       return (1);
 364     }
 365   return (0);
 366 }
 367
 368
 369 #ifndef NO_MAIN
 370 int
 371 main (int argc, char *const argv[])
 372 {
 373   int retval = 1;
 374
 375   try {
 376     retval = ifexport_main(argc, argv);
 377   } catch (exception e) {
 378           std::cerr << "Exception: " << e.what() << std::endl;
 379   } catch (...) {
 380           std::cerr << "Unknown exception\n";
 381   }
 382
 383   return (retval);
 384 }
 385 #endif