r341: *** empty log message ***
authorKevin M. Rosenberg <kevin@rosenberg.net>
Tue, 2 Jan 2001 13:32:51 +0000 (13:32 +0000)
committerKevin M. Rosenberg <kevin@rosenberg.net>
Tue, 2 Jan 2001 13:32:51 +0000 (13:32 +0000)
src/views.cpp

index 454b7d27e9fcac5ccd54ec00f6dd851fcd2bc862..1ba30cd9f821f42db4b34513a10652ef61344b8d 100644 (file)
@@ -9,7 +9,7 @@
 **  This is part of the CTSim program
 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
 **
-**  $Id: views.cpp,v 1.46 2001/01/02 08:18:33 kevin Exp $
+**  $Id: views.cpp,v 1.47 2001/01/02 13:32:51 kevin Exp $
 **
 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
 #include "backprojectors.h"
 #include "reconstruct.h"
 #include "timer.h"
-\r
-#if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM\r
-#include <sstream>\r
-#else\r
-#include <sstream_subst>\r
-#endif\r
-\r
+
+#if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
+#include <sstream>
+#else
+#include <sstream_subst>
+#endif
+
 
 // ImageFileCanvas
 
@@ -71,8 +71,8 @@ END_EVENT_TABLE()
 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
 {
-  m_pView = v;\r
-  m_xCursor = -1;\r
+  m_pView = v;
+  m_xCursor = -1;
   m_yCursor = -1;
 }
 
@@ -81,35 +81,35 @@ ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
 {
   if (m_pView)
     m_pView->OnDraw(& dc);
-}\r
-\r
-void \r
-ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)\r
-{\r
-  const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
-  int nx = rIF.nx();\r
-  int ny = rIF.ny();\r
-  \r
-  int yPt = ny - y - 1;\r
-  dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);\r
-  dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);\r
-  dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);\r
-  dc.DrawLine (x, 0, x, ny);\r
-  dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);\r
-}\r
-\r
-bool\r
-ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)\r
-{\r
-  x = m_xCursor;\r
-  y = m_yCursor;\r
-  \r
-  if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)\r
-    return true;\r
-  else\r
-    return false;\r
-}
-\r
+}
+
+void 
+ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
+{
+  const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
+  int nx = rIF.nx();
+  int ny = rIF.ny();
+  
+  int yPt = ny - y - 1;
+  dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
+  dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
+  dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
+  dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
+  dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
+}
+
+bool
+ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
+{
+  x = m_xCursor;
+  y = m_yCursor;
+  
+  if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
+    return true;
+  else
+    return false;
+}
+
 void 
 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 {
@@ -120,87 +120,87 @@ ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
   PrepareDC(dc);
   
   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
-  \r
-  const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
-  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
-  int nx = rIF.nx();\r
-  int ny = rIF.ny();\r
-  const int yPt = ny - 1 - pt.y;\r
-  if (event.RightIsDown()) {\r
-    if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];\r
-      if (rIF.isComplex()) {\r
-        double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];\r
-        if (dImag < 0)\r
-          os << " - " << -dImag;\r
-        else\r
-          os << " + " << dImag;\r
-        os << "i\n";\r
-      } else\r
-        os << "\n";\r
-      *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
-    } else\r
-      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";\r
-  }\r
-  else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {\r
-    if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {\r
-      if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {\r
-        DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);\r
-      }\r
-      DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);\r
-      m_xCursor = pt.x;\r
-      m_yCursor = yPt;\r
-    } else\r
-      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";\r
-  }\r
-  if (event.LeftUp()) {\r
-    std::ostringstream os;\r
-    os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";\r
-    *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
-  }\r
+  
+  const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
+  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
+  int nx = rIF.nx();
+  int ny = rIF.ny();
+  const int yPt = ny - 1 - pt.y;
+  if (event.RightIsDown()) {
+    if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
+      std::ostringstream os;
+      os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
+      if (rIF.isComplex()) {
+        double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
+        if (dImag < 0)
+          os << " - " << -dImag;
+        else
+          os << " + " << dImag;
+        os << "i\n";
+      } else
+        os << "\n";
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str();
+    } else
+      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
+  }
+  else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
+    if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
+      if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
+        DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
+      }
+      DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
+      m_xCursor = pt.x;
+      m_yCursor = yPt;
+    } else
+      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
+  }
+  if (event.LeftUp()) {
+    std::ostringstream os;
+    os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
+    *theApp->getLog() << os.str().c_str();
+  }
 }
 
 // ImageFileView
 
 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 
-BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)\r
+BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
-EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)\r
-EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)\r
-EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)\r
-EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)\r
-EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)\r
-EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)\r
-EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)\r
-EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)\r
-EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)\r
-#ifdef HAVE_FFTW\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)\r
-#endif\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)\r
-EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)\r
-EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)\r
-EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)\r
+EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
+EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
+EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
+EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
+EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
+EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
+EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
+EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
+EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
+#ifdef HAVE_FFTW
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
+#endif
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
+EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
+EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
+EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 END_EVENT_TABLE()
 
 ImageFileView::ImageFileView(void) 
 : wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
-{\r
-  m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;\r
+{
+  m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 }
 
 ImageFileView::~ImageFileView(void)
@@ -216,24 +216,24 @@ ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
   else {
     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
     std::ostringstream os;
-    double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
-    rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);\r
-    os << "Filename: " << rFilename << "\n";\r
-    os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";\r
-    os << "Data type: ";\r
-    if (rIF.isComplex())\r
-      os << "Complex\n";\r
-    else\r
-      os << "Real\n";\r
+    double min, max, mean, mode, median, stddev;
+    rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
+    os << "Filename: " << rFilename << "\n";
+    os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
+    os << "Data type: ";
+    if (rIF.isComplex())
+      os << "Complex\n";
+    else
+      os << "Real\n";
     os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
-    if (rIF.isComplex()) {\r
-      rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);\r
-      os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";\r
-    }\r
-    if (rIF.nLabels() > 0) {\r
-      os << "\n";\r
-      rIF.printLabelsBrief (os);\r
-    }\r
+    if (rIF.isComplex()) {
+      rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
+      os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
+    }
+    if (rIF.nLabels() > 0) {
+      os << "\n";
+      rIF.printLabelsBrief (os);
+    }
     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
     wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
     dialogMsg.ShowModal();
@@ -244,19 +244,19 @@ void
 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 {
   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
-  double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
-  rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);\r
+  double min, max, mean, mode, median, stddev;
+  rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
   if (iRetVal == wxID_OK) {
     m_bMinSpecified = true;
     m_bMaxSpecified = true;
-    double dMin, dMax;\r
+    double dMin, dMax;
     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
       m_dMinPixel = dMin;
       m_dMaxPixel = dMax;
       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
-      OnUpdate (this, NULL);\r
+      OnUpdate (this, NULL);
     }
   }
 }
@@ -284,396 +284,396 @@ ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
     OnUpdate (this, NULL);
   }
 }
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;\r
-  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);\r
-  \r
-  if (vecIF.size() == 0) {\r
-    wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");\r
-  } else {\r
-    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(m_frame, "Get Comparison Image", vecIF, true);\r
-    \r
-    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-      const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
-      const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();\r
-      std::ostringstream os;\r
-      double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
-      rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);\r
-      os << rIF.getFilename() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";\r
-      rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);\r
-      os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";\r
-      os << "\n";\r
-      double d, r, e;\r
-      rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);\r
-      os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";\r
-      *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
-      if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {\r
-        ImageFileDocument* pDifferenceDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-        if (! pDifferenceDoc) {\r
-          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-          return;\r
-        }\r
-        ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();\r
-        \r
-        differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());\r
-        if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {\r
-          pDifferenceDoc->DeleteAllViews();\r
-          return;\r
-        }\r
-        \r
-        wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-        differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());\r
-        s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-        differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());\r
-        std::ostringstream osLabel;\r
-        osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() \r
-          << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "\r
-          << os.str().c_str();\r
-        differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());\r
-        if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-          pDifferenceDoc->Modify(true);\r
-        pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);\r
-        pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
-      }\r
-      wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");\r
-    }\r
-  }\r
-}
-
-void\r
-ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  rIF.invertPixelValues (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  rIF.square (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  rIF.sqrt (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  rIF.log (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  rIF.exp (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;\r
-  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);\r
-  \r
-  if (vecIF.size() == 0) {\r
-    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");\r
-  } else {\r
-    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Add", vecIF, false);\r
-    \r
-    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
-      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-        if (! pNewDoc) {\r
-          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-          return;\r
-        }\r
-      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  \r
-      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());\r
-      rIF.addImages (rRHSIF, newImage);\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " \r
-        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();\r
-      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());\r
-      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());\r
-      newImage.labelAdd (os.str().c_str());\r
-      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";\r
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-        pNewDoc->Modify(TRUE);\r
-      pNewDoc->UpdateAllViews(this);\r
-      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;\r
-  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);\r
-  \r
-  if (vecIF.size() == 0) {\r
-    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");\r
-  } else {\r
-    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Subtract", vecIF, false);\r
-    \r
-    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
-      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-        if (! pNewDoc) {\r
-          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-          return;\r
-        }\r
-      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  \r
-      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());\r
-      rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " \r
-        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();\r
-      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());\r
-      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());\r
-      newImage.labelAdd (os.str().c_str());\r
-      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";\r
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-        pNewDoc->Modify(TRUE);\r
-      pNewDoc->UpdateAllViews(this);\r
-      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;\r
-  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);\r
-  \r
-  if (vecIF.size() == 0) {\r
-    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");\r
-  } else {\r
-    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Multiply", vecIF, false);\r
-    \r
-    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
-      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-        if (! pNewDoc) {\r
-          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-          return;\r
-        }\r
-      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  \r
-      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());\r
-      rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " \r
-        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();\r
-      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());\r
-      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());\r
-      newImage.labelAdd (os.str().c_str());\r
-      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";\r
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-        pNewDoc->Modify(TRUE);\r
-      pNewDoc->UpdateAllViews(this);\r
-      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;\r
-  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);\r
-  \r
-  if (vecIF.size() == 0) {\r
-    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");\r
-  } else {\r
-    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Divide", vecIF, false);\r
-    \r
-    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
-      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();\r
-      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-        if (! pNewDoc) {\r
-          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-          return;\r
-        }\r
-      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  \r
-      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());\r
-      rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by " \r
-        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();\r
-      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());\r
-      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";\r
-      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());\r
-      newImage.labelAdd (os.str().c_str());\r
-      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";\r
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-        pNewDoc->Modify(TRUE);\r
-      pNewDoc->UpdateAllViews(this);\r
-      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-\r
-#ifdef HAVE_FFTW\r
-void\r
-ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("FFT"), wxString("FFT Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
-  rIF.fft (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("FFT Image");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("IFFT"), wxString("IFFT Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
-  rIF.ifft (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("IFFT Image");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-#endif\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
-  rIF.fourier (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Fourier Image");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-void\r
-ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
-  rIF.inverseFourier (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);\r
-  rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  if (rIF.isComplex()) {\r
-    rIF.magnitude (rIF);\r
-    rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  if (rIF.isComplex()) {\r
-    rIF.phase (rIF);\r
-    rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");\r
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
-  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
-  }\r
-}\r
-\r
-\r
+
+void
+ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
+{
+  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
+  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
+  
+  if (vecIF.size() == 0) {
+    wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
+  } else {
+    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(m_frame, "Get Comparison Image", vecIF, true);
+    
+    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
+      const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
+      const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
+      std::ostringstream os;
+      double min, max, mean, mode, median, stddev;
+      rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
+      os << rIF.getFilename() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
+      rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
+      os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
+      os << "\n";
+      double d, r, e;
+      rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
+      os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str();
+      if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
+        ImageFileDocument* pDifferenceDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+        if (! pDifferenceDoc) {
+          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+          return;
+        }
+        ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();
+        
+        differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
+        if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {
+          pDifferenceDoc->DeleteAllViews();
+          return;
+        }
+        
+        wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+        differenceImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
+        s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+        differenceImage.labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
+        std::ostringstream osLabel;
+        osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() 
+          << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
+          << os.str().c_str();
+        differenceImage.labelAdd (os.str().c_str());
+        if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+          pDifferenceDoc->Modify(true);
+        pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
+        pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
+      }
+      wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
+    }
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  rIF.invertPixelValues (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  rIF.square (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  rIF.sqrt (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  rIF.log (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  rIF.exp (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
+{
+  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
+  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
+  
+  if (vecIF.size() == 0) {
+    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
+  } else {
+    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Add", vecIF, false);
+    
+    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
+      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
+      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+        if (! pNewDoc) {
+          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+          return;
+        }
+      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
+      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
+      rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
+      std::ostringstream os;
+      os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
+        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
+      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
+      newImage.labelAdd (os.str().c_str());
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+        pNewDoc->Modify(TRUE);
+      pNewDoc->UpdateAllViews(this);
+      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
+    }
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
+{
+  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
+  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
+  
+  if (vecIF.size() == 0) {
+    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
+  } else {
+    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Subtract", vecIF, false);
+    
+    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
+      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
+      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+        if (! pNewDoc) {
+          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+          return;
+        }
+      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
+      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
+      rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
+      std::ostringstream os;
+      os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
+        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
+      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
+      newImage.labelAdd (os.str().c_str());
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+        pNewDoc->Modify(TRUE);
+      pNewDoc->UpdateAllViews(this);
+      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
+    }
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
+{
+  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
+  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
+  
+  if (vecIF.size() == 0) {
+    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
+  } else {
+    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Multiply", vecIF, false);
+    
+    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
+      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
+      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+        if (! pNewDoc) {
+          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+          return;
+        }
+      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
+      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
+      rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
+      std::ostringstream os;
+      os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and " 
+        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
+      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
+      newImage.labelAdd (os.str().c_str());
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+        pNewDoc->Modify(TRUE);
+      pNewDoc->UpdateAllViews(this);
+      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
+    }
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
+{
+  std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
+  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
+  
+  if (vecIF.size() == 0) {
+    wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
+  } else {
+    DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Image to Divide", vecIF, false);
+    
+    if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
+      ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
+      const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
+      ImageFileDocument* pNewDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+        if (! pNewDoc) {
+          sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+          return;
+        }
+      ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();  
+      newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
+      rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
+      std::ostringstream os;
+      os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by " 
+        << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
+      s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
+      newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
+      newImage.labelAdd (os.str().c_str());
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+        pNewDoc->Modify(TRUE);
+      pNewDoc->UpdateAllViews(this);
+      pNewDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
+    }
+  }
+}
+
+
+#ifdef HAVE_FFTW
+void
+ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("FFT"), wxString("FFT Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
+  rIF.fft (rIF);
+  rIF.labelAdd ("FFT Image");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("IFFT"), wxString("IFFT Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
+  rIF.ifft (rIF);
+  rIF.labelAdd ("IFFT Image");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+#endif
+
+void
+ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
+  rIF.fourier (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Fourier Image");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+void
+ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);
+  rIF.inverseFourier (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
+  rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+}
+
+void
+ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  if (rIF.isComplex()) {
+    rIF.magnitude (rIF);
+    rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  if (rIF.isComplex()) {
+    rIF.phase (rIF);
+    rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+    GetDocument()->Modify(TRUE);
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);
+  }
+}
+
+
 ImageFileCanvas* 
 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 {
@@ -697,16 +697,16 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");\r
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
   
-  file_menu->AppendSeparator();\r
+  file_menu->AppendSeparator();
   file_menu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
-  file_menu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");\r
+  file_menu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
   
   file_menu->AppendSeparator();
   file_menu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
@@ -716,56 +716,56 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
-  \r
-  wxMenu* filter_menu = new wxMenu;\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");\r
-  filter_menu->AppendSeparator();\r
-#ifdef HAVE_FFTW\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "&FFT");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "&IFFT");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");\r
-#else\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");\r
-#endif\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");\r
-  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");\r
-  \r
-  wxMenu* image_menu = new wxMenu;\r
-  filter_menu->AppendSeparator();\r
-  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");\r
-  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");\r
-  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");\r
-  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");\r
-  image_menu->AppendSeparator();\r
-  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");\r
-\r
-  wxMenu *plot_menu = new wxMenu;\r
-  plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");\r
-  plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");\r
-  
-  wxMenu *compare_menu = new wxMenu;\r
-  compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");\r
-  compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");\r
-  compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");\r
-  \r
+  
+  wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
+  filter_menu->AppendSeparator();
+#ifdef HAVE_FFTW
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "&FFT");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "&IFFT");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "F&ourier");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");
+#else
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
+#endif
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
+  filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
+  
+  wxMenu* image_menu = new wxMenu;
+  filter_menu->AppendSeparator();
+  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
+  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
+  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
+  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
+  image_menu->AppendSeparator();
+  image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
+
+  wxMenu *plot_menu = new wxMenu;
+  plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
+  plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
+  
+  wxMenu *compare_menu = new wxMenu;
+  compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
+  compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
+  compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
+  
   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
   
   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
   
   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
-  menu_bar->Append(view_menu, "&View");\r
-  menu_bar->Append(image_menu, "&Image");\r
-  menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");\r
-  menu_bar->Append(plot_menu, "P&lot");\r
+  menu_bar->Append(view_menu, "&View");
+  menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
+  menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
+  menu_bar->Append(plot_menu, "P&lot");
   menu_bar->Append(compare_menu, "&Compare");
   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
   
@@ -795,7 +795,7 @@ ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
   int x, y;  // X requires a forced resize
   m_frame->GetSize(&x, &y);
   m_frame->SetSize(-1, -1, x, y);
-  m_frame->SetFocus();\r
+  m_frame->SetFocus();
   m_frame->Show(true);
   Activate(true);
   
@@ -807,10 +807,10 @@ ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 {
   if (m_bitmap.Ok())
     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
-  \r
-  int xCursor, yCursor;\r
-  if (m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))\r
-    m_canvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);\r
+  
+  int xCursor, yCursor;
+  if (m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
+    m_canvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 }
 
 
@@ -851,7 +851,7 @@ ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
     m_frame->SetClientSize (xSize, ySize);
     m_canvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
-    m_canvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);\r
+    m_canvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
   } 
   
   if (m_canvas)
@@ -880,323 +880,323 @@ ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
   }
   return true;
 }
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();\r
-  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
-  int nx = rIF.nx();\r
-  int ny = rIF.ny();\r
-  if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {\r
-    if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {\r
-      double min, max;\r
-      rIF.getMinMax (min, max);\r
-      if (! m_bMinSpecified)\r
-        m_dMinPixel = min;\r
-      if (! m_bMaxSpecified)\r
-        m_dMaxPixel = max;\r
-    }\r
-\r
-    DialogExportParameters dialogExport (m_frame, m_iDefaultExportFormatID);\r
-    if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-      wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());\r
-      m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());\r
-\r
-      wxString strExt;\r
-      wxString strWildcard;\r
-      if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {\r
-        strExt = ".pgm";\r
-        strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";\r
-      }\r
-#ifdef HAVE_PNG\r
-      else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {\r
-        strExt = ".png";\r
-        strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";\r
-      }\r
-#endif\r
-\r
-      const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""), \r
-        wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);\r
-      if (strFilename) {\r
-        rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);\r
-        *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";\r
-      }\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-  unsigned int iOldNX = rIF.nx();\r
-  unsigned int iOldNY = rIF.ny();\r
-\r
-  DialogGetXYSize dialogGetXYSize (m_frame, "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);\r
-  if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-    unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();\r
-    unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();\r
-    std::ostringstream os;\r
-    os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";\r
-    ImageFileDocument* pScaledDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-    if (! pScaledDoc) {\r
-      sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-      return;\r
-    }\r
-    ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();\r
-    rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);\r
-    rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());\r
-    rIF.scaleImage (rScaledIF);\r
-    *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";\r
-    if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-      pScaledDoc->Modify(TRUE);\r
-    pScaledDoc->UpdateAllViews (this);\r
-    pScaledDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  int xCursor, yCursor;\r
-  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
-    wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
-    return;\r
-  }\r
-  \r
-  const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();\r
-  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
-  int nx = rIF.nx();\r
-  int ny = rIF.ny();\r
-  \r
-  if (v != NULL && yCursor < ny) {\r
-    double* pX = new double [nx];\r
-    double* pY = new double [nx];\r
-    for (int i = 0; i < nx; i++) {\r
-      pX[i] = i;\r
-      pY[i] = v[i][yCursor];\r
-    }\r
-    PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
-    if (! pPlotDoc) {\r
-      sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
-    } else {\r
-      PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Row " << yCursor;\r
-      std::string title("title ");\r
-      title += os.str();\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
-      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);\r
-      rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
-      rPlotFile.addColumn (1, pY);\r
-    }\r
-    delete pX;\r
-    delete pY;\r
-    if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-      pPlotDoc->Modify(true);\r
-    pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
-  }\r
-}\r
-
-void\r
-ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  int xCursor, yCursor;\r
-  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
-    wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
-    return;\r
-  }\r
-  \r
-  const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();\r
-  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
-  int nx = rIF.nx();\r
-  int ny = rIF.ny();\r
-  \r
-  if (v != NULL && xCursor < nx) {\r
-    double* pX = new double [ny];\r
-    double* pY = new double [ny];\r
-    for (int i = 0; i < ny; i++) {\r
-      pX[i] = i;\r
-      pY[i] = v[xCursor][i];\r
-    }\r
-    PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
-    if (! pPlotDoc) {\r
-      sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
-    } else {\r
-      PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Column " << xCursor;\r
-      std::string title("title ");\r
-      title += os.str();\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
-      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);\r
-      rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
-      rPlotFile.addColumn (1, pY);\r
-    }\r
-    delete pX;\r
-    delete pY;\r
-    if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-      pPlotDoc->Modify(true);\r
-    pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void\r
-ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  int xCursor, yCursor;\r
-  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
-    wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
-    return;\r
-  }\r
-  \r
-  std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;\r
-  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);\r
-  if (vecIFDoc.size() == 0) {\r
-    wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");\r
-    return;\r
-  }\r
-  DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);\r
-  \r
-  if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-    ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
-    const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-    const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();\r
-    \r
-    ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();\r
-    ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();\r
-    int nx = rIF.nx();\r
-    int ny = rIF.ny();\r
-    \r
-    if (v1 != NULL && xCursor < nx) {\r
-      double* pX = new double [ny];\r
-      double* pY1 = new double [ny];\r
-      double* pY2 = new double [ny];\r
-      for (int i = 0; i < ny; i++) {\r
-        pX[i] = i;\r
-        pY1[i] = v1[xCursor][i];\r
-        pY2[i] = v2[xCursor][i];\r
-      }\r
-      PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
-      if (! pPlotDoc) {\r
-        sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
-      } else {\r
-        PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-        std::ostringstream os;\r
-        os << "Column " << xCursor << " Comparison";\r
-        std::string title("title ");\r
-        title += os.str();\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
-        rPlotFile.setCurveSize (3, nx);\r
-        rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
-        rPlotFile.addColumn (1, pY1);\r
-        rPlotFile.addColumn (2, pY2);\r
-      }\r
-      delete pX;\r
-      delete pY1;\r
-      delete pY2;\r
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-        pPlotDoc->Modify(true);\r
-      pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-
-void\r
-ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  int xCursor, yCursor;\r
-  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {\r
-    wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");\r
-    return;\r
-  }\r
-  \r
-  std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;\r
-  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);\r
-  \r
-  if (vecIFDoc.size() == 0) {\r
-    wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");\r
-    return;\r
-  }\r
-  \r
-  DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);\r
-  \r
-  if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-    ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
-    const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
-    const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();\r
-    \r
-    ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();\r
-    ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();\r
-    int nx = rIF.nx();\r
-    int ny = rIF.ny();\r
-    \r
-    if (v1 != NULL && yCursor < ny) {\r
-      double* pX = new double [nx];\r
-      double* pY1 = new double [nx];\r
-      double* pY2 = new double [nx];\r
-      for (int i = 0; i < nx; i++) {\r
-        pX[i] = i;\r
-        pY1[i] = v1[i][yCursor];\r
-        pY2[i] = v2[i][yCursor];\r
-      }\r
-      PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));\r
-      if (! pPlotDoc) {\r
-        sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
-      } else {\r
-        PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-        std::ostringstream os;\r
-        os << "Row " << yCursor << " Comparison";\r
-        std::string title("title ");\r
-        title += os.str();\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
-        rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
-        rPlotFile.setCurveSize (3, ny);\r
-        rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
-        rPlotFile.addColumn (1, pY1);\r
-        rPlotFile.addColumn (2, pY2);\r
-      }\r
-      delete pX;\r
-      delete pY1;\r
-      delete pY2;\r
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
-        pPlotDoc->Modify(true);\r
-      pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-\r
+
+void
+ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
+  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
+  int nx = rIF.nx();
+  int ny = rIF.ny();
+  if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
+    if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
+      double min, max;
+      rIF.getMinMax (min, max);
+      if (! m_bMinSpecified)
+        m_dMinPixel = min;
+      if (! m_bMaxSpecified)
+        m_dMaxPixel = max;
+    }
+
+    DialogExportParameters dialogExport (m_frame, m_iDefaultExportFormatID);
+    if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
+      wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
+      m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
+
+      wxString strExt;
+      wxString strWildcard;
+      if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
+        strExt = ".pgm";
+        strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
+      }
+#ifdef HAVE_PNG
+      else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
+        strExt = ".png";
+        strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
+      }
+#endif
+
+      const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""), 
+        wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
+      if (strFilename) {
+        rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
+        *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
+      }
+    }
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
+{
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+  unsigned int iOldNX = rIF.nx();
+  unsigned int iOldNY = rIF.ny();
+
+  DialogGetXYSize dialogGetXYSize (m_frame, "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
+  if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
+    unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
+    unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
+    std::ostringstream os;
+    os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
+    ImageFileDocument* pScaledDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+    if (! pScaledDoc) {
+      sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+      return;
+    }
+    ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
+    rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
+    rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
+    rIF.scaleImage (rScaledIF);
+    *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+    if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+      pScaledDoc->Modify(TRUE);
+    pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
+    pScaledDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
+{
+  int xCursor, yCursor;
+  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
+    wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
+    return;
+  }
+  
+  const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
+  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
+  int nx = rIF.nx();
+  int ny = rIF.ny();
+  
+  if (v != NULL && yCursor < ny) {
+    double* pX = new double [nx];
+    double* pY = new double [nx];
+    for (int i = 0; i < nx; i++) {
+      pX[i] = i;
+      pY[i] = v[i][yCursor];
+    }
+    PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
+    if (! pPlotDoc) {
+      sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
+    } else {
+      PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
+      std::ostringstream os;
+      os << "Row " << yCursor;
+      std::string title("title ");
+      title += os.str();
+      rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
+      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
+      rPlotFile.addColumn (0, pX);
+      rPlotFile.addColumn (1, pY);
+    }
+    delete pX;
+    delete pY;
+    if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+      pPlotDoc->Modify(true);
+    pPlotDoc->UpdateAllViews();
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
+{
+  int xCursor, yCursor;
+  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
+    wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
+    return;
+  }
+  
+  const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
+  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
+  int nx = rIF.nx();
+  int ny = rIF.ny();
+  
+  if (v != NULL && xCursor < nx) {
+    double* pX = new double [ny];
+    double* pY = new double [ny];
+    for (int i = 0; i < ny; i++) {
+      pX[i] = i;
+      pY[i] = v[xCursor][i];
+    }
+    PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
+    if (! pPlotDoc) {
+      sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
+    } else {
+      PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
+      std::ostringstream os;
+      os << "Column " << xCursor;
+      std::string title("title ");
+      title += os.str();
+      rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
+      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
+      rPlotFile.addColumn (0, pX);
+      rPlotFile.addColumn (1, pY);
+    }
+    delete pX;
+    delete pY;
+    if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+      pPlotDoc->Modify(true);
+    pPlotDoc->UpdateAllViews();
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
+{
+  int xCursor, yCursor;
+  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
+    wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
+    return;
+  }
+  
+  std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
+  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
+  if (vecIFDoc.size() == 0) {
+    wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
+    return;
+  }
+  DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
+  
+  if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
+    ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
+    const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+    const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
+    
+    ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
+    ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
+    int nx = rIF.nx();
+    int ny = rIF.ny();
+    
+    if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
+      double* pX = new double [ny];
+      double* pY1 = new double [ny];
+      double* pY2 = new double [ny];
+      for (int i = 0; i < ny; i++) {
+        pX[i] = i;
+        pY1[i] = v1[xCursor][i];
+        pY2[i] = v2[xCursor][i];
+      }
+      PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
+      if (! pPlotDoc) {
+        sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
+      } else {
+        PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
+        std::ostringstream os;
+        os << "Column " << xCursor << " Comparison";
+        std::string title("title ");
+        title += os.str();
+        rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
+        rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
+        rPlotFile.addColumn (0, pX);
+        rPlotFile.addColumn (1, pY1);
+        rPlotFile.addColumn (2, pY2);
+      }
+      delete pX;
+      delete pY1;
+      delete pY2;
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+        pPlotDoc->Modify(true);
+      pPlotDoc->UpdateAllViews();
+    }
+  }
+}
+
+void
+ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
+{
+  int xCursor, yCursor;
+  if (! m_canvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
+    wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
+    return;
+  }
+  
+  std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
+  theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
+  
+  if (vecIFDoc.size() == 0) {
+    wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
+    return;
+  }
+  
+  DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
+  
+  if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
+    ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
+    const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
+    const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
+    
+    ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
+    ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
+    int nx = rIF.nx();
+    int ny = rIF.ny();
+    
+    if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
+      double* pX = new double [nx];
+      double* pY1 = new double [nx];
+      double* pY2 = new double [nx];
+      for (int i = 0; i < nx; i++) {
+        pX[i] = i;
+        pY1[i] = v1[i][yCursor];
+        pY2[i] = v2[i][yCursor];
+      }
+      PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
+      if (! pPlotDoc) {
+        sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
+      } else {
+        PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
+        std::ostringstream os;
+        os << "Row " << yCursor << " Comparison";
+        std::string title("title ");
+        title += os.str();
+        rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
+        rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
+        rPlotFile.addColumn (0, pX);
+        rPlotFile.addColumn (1, pY1);
+        rPlotFile.addColumn (2, pY2);
+      }
+      delete pX;
+      delete pY1;
+      delete pY2;
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
+        pPlotDoc->Modify(true);
+      pPlotDoc->UpdateAllViews();
+    }
+  }
+}
+
+
 // PhantomCanvas
 
 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
@@ -1246,14 +1246,14 @@ PhantomView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
   std::ostringstream os;
-  os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";\r
-  const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();\r
+  os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
+  const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
   rPhantom.printDefinitions (os);
 #if DEBUG
   rPhantom.print (os);
 #endif
-  *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";\r
-  wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");\r
+  *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+  wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
 }
 
 
@@ -1275,10 +1275,10 @@ PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
     
     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
-      ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = dynamic_cast<ProjectionFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.pj", wxDOC_SILENT));\r
-      if (! pProjectionDoc) {\r
-        sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");\r
-        return;\r
+      ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = dynamic_cast<ProjectionFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.pj", wxDOC_SILENT));
+      if (! pProjectionDoc) {
+        sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
+        return;
       }
       Projections& rProj = pProjectionDoc->getProjections();
       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultFieldOfView);
@@ -1289,7 +1289,7 @@ PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
       rProj.initFromScanner (theScanner);
       m_dDefaultRotation /= PI;  // convert back to PI units
       
-      Timer timer;\r
+      Timer timer;
       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, rProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(m_frame));
         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
@@ -1307,7 +1307,7 @@ PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
           }
         }
       } else {
-        wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);\r
+        wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), rProj.nView() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
         for (int i = 0; i < rProj.nView(); i++) {
           theScanner.collectProjections (rProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
@@ -1318,18 +1318,18 @@ PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
       }
       
       std::ostringstream os;
-      os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();\r
+      os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength << ", FieldOfViewRatio=" << m_dDefaultFieldOfView << ", Geometry=" << sGeometry.c_str();
       rProj.setCalcTime (timer.timerEnd());
       rProj.setRemark (os.str());
       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
       
       m_frame->Lower();
       ::wxYield();
-      ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());\r
-      if (projView) {\r
-        projView->getFrame()->SetFocus();\r
-        projView->OnUpdate (projView, NULL);\r
-      }\r
+      ProjectionFileView* projView = dynamic_cast<ProjectionFileView*>(pProjectionDoc->GetFirstView());
+      if (projView) {
+        projView->getFrame()->SetFocus();
+        projView->OnUpdate (projView, NULL);
+      }
       if (wxView* pView = pProjectionDoc->GetFirstView()) {
         if (wxFrame* pFrame = pView->GetFrame()) {
           pFrame->SetFocus();
@@ -1338,7 +1338,7 @@ PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
         theApp->getDocManager()->ActivateView (pView, true, false);
       }
       ::wxYield();
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
         pProjectionDoc->Modify(true);
       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
     }
@@ -1354,20 +1354,20 @@ PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
   if (retVal == wxID_OK) {
     int xSize = dialogRaster.getXSize();
     int ySize = dialogRaster.getYSize();
-    int nSamples = dialogRaster.getNSamples();\r
+    int nSamples = dialogRaster.getNSamples();
     if (nSamples < 1)
       nSamples = 1;
     if (xSize > 0 && ySize > 0) {
       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
-      ImageFileDocument* pRasterDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-      if (! pRasterDoc) {\r
-        sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-        return;\r
+      ImageFileDocument* pRasterDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+      if (! pRasterDoc) {
+        sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+        return;
       }
       ImageFile& imageFile = pRasterDoc->getImageFile();
       
       imageFile.setArraySize (xSize, ySize);
-      wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);\r
+      wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"), imageFile.nx() + 1, m_frame, wxPD_CAN_ABORT);
       Timer timer;
       for (unsigned int i = 0; i < imageFile.nx(); i++) {
         rPhantom.convertToImagefile (imageFile, nSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
@@ -1376,20 +1376,20 @@ PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
           return;
         }
       }
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
         pRasterDoc->Modify(true);
-      pRasterDoc->UpdateAllViews(this);\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << xSize << ", YSize=" << ySize << ", nSamples=" << nSamples;\r
-      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";\r
+      pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
+      std::ostringstream os;
+      os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << xSize << ", YSize=" << ySize << ", nSamples=" << nSamples;
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
       imageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
-      ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());\r
-      if (rasterView) {\r
-        rasterView->getFrame()->SetFocus();\r
-        rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);\r
-      }\r
+      ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());
+      if (rasterView) {
+        rasterView->getFrame()->SetFocus();
+        rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
+      }
       
-    }\r
+    }
   }
 }
 
@@ -1417,9 +1417,9 @@ PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
-  file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");\r
-  file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");\r
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
+  file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
+  file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
   
   file_menu->AppendSeparator();
@@ -1603,10 +1603,10 @@ ProjectionFileView::OnReconstruct (wxCommandEvent& event)
     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
-      ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-      if (! pReconDoc) {\r
-        sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
-        return;\r
+      ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));
+      if (! pReconDoc) {
+        sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
+        return;
       }
       ImageFile& imageFile = pReconDoc->getImageFile();
       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
@@ -1616,9 +1616,9 @@ ProjectionFileView::OnReconstruct (wxCommandEvent& event)
         wxMessageBox ("Sorry!\nCurrently, frequency-based filtering with direct filter generation is not support for geometries other than parallel.\nAborting command.", "Not Supported", wxOK | wxICON_WARNING, m_frame);
         return;
       }
-\r
+
       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
-\r
+
       Timer timerRecon;
       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstruct, rProj, imageFile, m_iDefaultTrace, m_frame);
@@ -1651,14 +1651,14 @@ ProjectionFileView::OnReconstruct (wxCommandEvent& event)
         }
       }
       delete pReconstruct;
-      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())
         pReconDoc->Modify(true);
       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
-      ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());\r
-      if (rasterView) {\r
-        rasterView->getFrame()->SetFocus();\r
-        rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);\r
-      }\r
+      ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());
+      if (rasterView) {
+        rasterView->getFrame()->SetFocus();
+        rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
+      }
       std::ostringstream os;
       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
@@ -1693,7 +1693,7 @@ ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
@@ -1846,7 +1846,7 @@ PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
 {
   if (m_pView)
     m_pView->OnDraw(& dc);
-}\r
+}
 
 
 // PlotFileView
@@ -1855,8 +1855,8 @@ IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
 
 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
-EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)\r
-EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)\r
+EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
+EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
 END_EVENT_TABLE()
 
 PlotFileView::PlotFileView(void) 
@@ -1865,8 +1865,8 @@ PlotFileView::PlotFileView(void)
 }
 
 PlotFileView::~PlotFileView(void)
-{\r
-  if (m_pEZPlot)\r
+{
+  if (m_pEZPlot)
     delete m_pEZPlot;
 }
 
@@ -1874,8 +1874,8 @@ void
 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 {
   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
-  std::ostringstream os;\r
-  os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";\r
+  std::ostringstream os;
+  os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
   rPlot.printHeaders (os);
   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
@@ -1883,58 +1883,58 @@ PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 }
 
 
-void \r
-PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
-  double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
-  rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);\r
-  DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);\r
-  int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();\r
-  if (iRetVal == wxID_OK) {\r
-    m_bMinSpecified = true;\r
-    m_bMaxSpecified = true;\r
-    double dMin, dMax;\r
-    if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {\r
-      m_dMinPixel = dMin;\r
-      m_dMaxPixel = dMax;\r
-      m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();\r
-      OnUpdate (this, NULL);\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-void \r
-PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)\r
-{\r
-  const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
-  double min;\r
-  double max;\r
-\r
-  if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {\r
-    if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {\r
-      *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";\r
-      return;\r
-    }\r
-  }\r
-  \r
-  if (m_bMinSpecified)\r
-    min = m_dMinPixel;\r
-  if (m_bMaxSpecified)\r
-    max = m_dMaxPixel;\r
-  \r
-  DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);\r
-  int retVal = dialogMinMax.ShowModal();\r
-  if (retVal == wxID_OK) {\r
-    m_bMinSpecified = true;\r
-    m_bMaxSpecified = true;\r
-    m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();\r
-    m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();\r
-    OnUpdate (this, NULL);\r
-  }\r
-}\r
-\r
-\r
+void 
+PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
+{
+  const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
+  double min, max, mean, mode, median, stddev;
+  rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
+  DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (m_frame, mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
+  int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
+  if (iRetVal == wxID_OK) {
+    m_bMinSpecified = true;
+    m_bMaxSpecified = true;
+    double dMin, dMax;
+    if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
+      m_dMinPixel = dMin;
+      m_dMaxPixel = dMax;
+      m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
+      OnUpdate (this, NULL);
+    }
+  }
+}
+
+void 
+PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
+{
+  const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
+  double min;
+  double max;
+
+  if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
+    if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
+      *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
+      return;
+    }
+  }
+  
+  if (m_bMinSpecified)
+    min = m_dMinPixel;
+  if (m_bMaxSpecified)
+    max = m_dMaxPixel;
+  
+  DialogGetMinMax dialogMinMax (m_frame, "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
+  int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
+  if (retVal == wxID_OK) {
+    m_bMinSpecified = true;
+    m_bMaxSpecified = true;
+    m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
+    m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
+    OnUpdate (this, NULL);
+  }
+}
+
+
 PlotFileCanvas* 
 PlotFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 {
@@ -1958,7 +1958,7 @@ PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
@@ -1972,10 +1972,10 @@ PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   file_menu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
   
-  wxMenu *view_menu = new wxMenu;\r
-  view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");\r
-  view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");\r
-  \r
+  wxMenu *view_menu = new wxMenu;
+  view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
+  view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
+  
   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
   help_menu->AppendSeparator();
@@ -1983,7 +1983,7 @@ PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   
   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
   
-  menu_bar->Append(file_menu, "&File");\r
+  menu_bar->Append(file_menu, "&File");
   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
   
@@ -2001,10 +2001,10 @@ PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
   SetFrame(m_frame);
   
-  m_bMinSpecified = false;\r
-  m_bMaxSpecified = false;\r
-  m_dAutoScaleFactor = 1.;\r
-  \r
+  m_bMinSpecified = false;
+  m_bMaxSpecified = false;
+  m_dAutoScaleFactor = 1.;
+  
   int width, height;
   m_frame->GetClientSize(&width, &height);
   m_frame->SetTitle ("Plot File");
@@ -2025,66 +2025,66 @@ PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 void 
 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 {
-  const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
-  const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();\r
-  const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();\r
-  \r
-  if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {\r
-    int xsize, ysize;\r
-    m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);\r
-    SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);\r
-    SGP sgp (driver);\r
-    if (m_pEZPlot)\r
-      m_pEZPlot->plot (&sgp);\r
-  }\r
+  const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
+  const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
+  const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
+  
+  if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
+    int xsize, ysize;
+    m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
+    SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
+    SGP sgp (driver);
+    if (m_pEZPlot)
+      m_pEZPlot->plot (&sgp);
+  }
 }
 
 
 void 
 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 {
-    const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
-    const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();\r
-    const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();\r
-    \r
-    if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {\r
-      if (m_pEZPlot)\r
-        delete m_pEZPlot;\r
-      m_pEZPlot = new EZPlot;\r
-      \r
-      for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)\r
-        m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));\r
-      \r
-      if (m_bMinSpecified) {\r
-        std::ostringstream os;\r
-        os << "ymin " << m_dMinPixel;\r
-        m_pEZPlot->ezset (os.str());\r
-      }\r
-      \r
-      if (m_bMaxSpecified) {\r
-        std::ostringstream os;\r
-        os << "ymax " << m_dMaxPixel;\r
-        m_pEZPlot->ezset (os.str());\r
-      }\r
-      \r
-      m_pEZPlot->ezset("box");\r
-      m_pEZPlot->ezset("grid");\r
-      \r
-      double* pdXaxis = new double [iNRecords];\r
-      rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);\r
-      \r
-      double* pdY = new double [iNRecords];\r
-      for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {\r
-        rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);\r
-        m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);\r
-      }\r
-      \r
-      delete pdXaxis;\r
-      delete pdY;\r
-    }\r
-\r
-    if (m_canvas)\r
-      m_canvas->Refresh();\r
+    const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
+    const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
+    const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
+    
+    if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
+      if (m_pEZPlot)
+        delete m_pEZPlot;
+      m_pEZPlot = new EZPlot;
+      
+      for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
+        m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
+      
+      if (m_bMinSpecified) {
+        std::ostringstream os;
+        os << "ymin " << m_dMinPixel;
+        m_pEZPlot->ezset (os.str());
+      }
+      
+      if (m_bMaxSpecified) {
+        std::ostringstream os;
+        os << "ymax " << m_dMaxPixel;
+        m_pEZPlot->ezset (os.str());
+      }
+      
+      m_pEZPlot->ezset("box");
+      m_pEZPlot->ezset("grid");
+      
+      double* pdXaxis = new double [iNRecords];
+      rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
+      
+      double* pdY = new double [iNRecords];
+      for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
+        rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
+        m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
+      }
+      
+      delete pdXaxis;
+      delete pdY;
+    }
+
+    if (m_canvas)
+      m_canvas->Refresh();
 }
 
 bool