Fix test syntax errors in configure.ac
[ctsim.git] / doc / ctsim.tex
index 41d8cadd4c631e6a20190eb3603800550e99d190..2a5738c70d103da569614dca2276a30b70aa46f3 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-\documentclass[letterpaper,11pt]{report}%
+\documentclass[letterpaper,11pt]{report}
 \usepackage{graphicx}
 \usepackage{texhelp}
 \usepackage{fancyhea}
 \usepackage{graphicx}
 \usepackage{texhelp}
 \usepackage{fancyhea}
@@ -10,8 +10,8 @@
 \usepackage{hyperref}
 \input{psbox.tex}
 
 \usepackage{hyperref}
 \input{psbox.tex}
 
-\latexonly{\includeonly{ctsim-concepts,ctsim-install,ctsim-gui,ctsim-textui,ctsim-web,ctsim-appendix}}
-\hyphenation{poly-gon-al}
+\latexonly{\includeonly{ctsim-concepts,ctsim-install,ctsim-gui,ctsim-textui,ctsim-web,ctsim-algorithms,ctsim-sgp}}
+\hyphenation{poly-gon-al multi-thread-ing}
 
 \newcommand{\ctsim}{\texttt{CTSim}}
 \newcommand{\ctsimtext}{\texttt{CTSimText}}
 
 \newcommand{\ctsim}{\texttt{CTSim}}
 \newcommand{\ctsimtext}{\texttt{CTSimText}}
 \newcommand{\indexit}[1]{#1\index{#1}}%
 \newcommand{\inioption}[1]{{\bf {\tt #1}}\index{#1}}%
 
 \newcommand{\indexit}[1]{#1\index{#1}}%
 \newcommand{\inioption}[1]{{\bf {\tt #1}}\index{#1}}%
 
-\newcommand{\manvernum}[0]{0.6}
+\newcommand{\manvernum}[0]{1.0}
 \newcommand{\manver}[0]{v\manvernum}
 \newcommand{\manver}[0]{v\manvernum}
-\newcommand{\mandate}[0]{February 19, 2001}
+\newcommand{\mandate}[0]{May 1, 2002}
 \newcommand{\ctsimfooter}{\setfooter{\thepage}{}{}{\small Manual \manver}{\small \mandate}{\thepage}}
 \newcommand{\doublehyphen}[1]{-\,-\texttt{#1}}
 \newcommand{\ctsimfooter}{\setfooter{\thepage}{}{}{\small Manual \manver}{\small \mandate}{\thepage}}
 \newcommand{\doublehyphen}[1]{-\,-\texttt{#1}}
-\newcommand{\ctsimvernum}[0]{3.0.0}
+\newcommand{\ctsimvernum}[0]{3.5.0}
 \newcommand{\ctsimver}[0]{CTSim \ctsimvernum}
 \newcommand{\ctsimheadtitle}{\ctsimver\ Manual}
 
 \newcommand{\ctsimver}[0]{CTSim \ctsimvernum}
 \newcommand{\ctsimheadtitle}{\ctsimver\ Manual}
 
 \parskip=10pt%
 \parindent=0pt%
 %\backgroundcolour{255;255;255}\textcolour{0;0;0}% Has an effect in HTML only
 \parskip=10pt%
 \parindent=0pt%
 %\backgroundcolour{255;255;255}\textcolour{0;0;0}% Has an effect in HTML only
-\title{CTSim 3.0 User Manual}%
+\title{CTSim 3.5 User Manual}%
 \author{Kevin M. Rosenberg, M.D.}%
 \makeindex%
 
 \author{Kevin M. Rosenberg, M.D.}%
 \makeindex%
 
-\begin{document}
 \textheight=9in
 \textheight=9in
-\textwidth=6.5in
+\textwidth=6.0in
 \evensidemargin=0in
 \oddsidemargin=0in
 
 \evensidemargin=0in
 \oddsidemargin=0in
 
+\begin{document}
 \maketitle
 \pagestyle{fancyplain}
 \pagenumbering{roman}
 \maketitle
 \pagestyle{fancyplain}
 \pagenumbering{roman}
@@ -55,7 +55,7 @@
 \setheader{{\it COPYRIGHT}}{}{}{\ctsimheadtitle}{}{{\it COPYRIGHT}}%
 \ctsimfooter
 
 \setheader{{\it COPYRIGHT}}{}{}{\ctsimheadtitle}{}{{\it COPYRIGHT}}%
 \ctsimfooter
 
-Copyright (c) 1983-2001 Kevin M. Rosenberg, M.D.
+Copyright (c) 1983-2002 Kevin M. Rosenberg, M.D.
 
 Permission to use, copy, modify, and distribute this software and its
 documentation for any purpose is hereby granted without fee, provided that the
 
 Permission to use, copy, modify, and distribute this software and its
 documentation for any purpose is hereby granted without fee, provided that the
@@ -78,15 +78,14 @@ PERFORMANCE OF THIS SOFTWARE.
 \setheader{{\it COPYRIGHT}}{}{}{\ctsimheadtitle}{}{{\it COPYRIGHT}}%
 \setfooter{\thepage}{}{}{}{\manver}{\thepage}%
 
 \setheader{{\it COPYRIGHT}}{}{}{\ctsimheadtitle}{}{{\it COPYRIGHT}}%
 \setfooter{\thepage}{}{}{}{\manver}{\thepage}%
 
-\textbf{Ian Kay, Ph.D.}\\
-Special thanks to Dr. Kay for contributing portions to this manual. Dr. Kay has assisted the
-development of \ctsim\ with bug reports and fixes.
+\textbf{Ian Kay, Ph.D.}\\ Special thanks to Dr. Kay for contributing
+portions to this manual. Dr. Kay has assisted the development of
+\ctsim\ with the addition of helical scanning, bug reports, and paches.
 
 
-\textbf{Gabor T. Herman, Ph.D.}\\
-Dr. Herman's publications on computed tomography inspired me to
-create the initial version \ctsim\ in 1983. Dr. Herman
-has graciously permitted use of his
-copyrighted head phantom for use in \ctsim.
+\textbf{Gabor T. Herman, Ph.D.}\\ Dr. Herman's publications on
+computed tomography inspired the initial version \ctsim\ in
+1983. Dr. Herman has graciously permitted use of his copyrighted head
+phantom for use in \ctsim.
 
 
 \setheader{{\it CONTENTS}}{}{}{\ctsimheadtitle}{}{{\it CONTENTS}}%
 
 
 \setheader{{\it CONTENTS}}{}{}{\ctsimheadtitle}{}{{\it CONTENTS}}%
@@ -101,7 +100,7 @@ copyrighted head phantom for use in \ctsim.
 \ctsimfooter
 
 
 \ctsimfooter
 
 
-\centerline{\image{3cm;3cm}{logo-huge.eps}}
+\centerline{\image{3cm;3cm}{logo.eps}}
 Computed tomography is a technique for estimating the interior of an
 object from measurements of radiation collected around the object. This
 radiation can be either projected through or emitted from the
 Computed tomography is a technique for estimating the interior of an
 object from measurements of radiation collected around the object. This
 radiation can be either projected through or emitted from the
@@ -121,7 +120,9 @@ I hope that you enjoy \ctsim!
 \include{ctsim-textui}
 \include{ctsim-web}
 \include{ctsim-install}
 \include{ctsim-textui}
 \include{ctsim-web}
 \include{ctsim-install}
-\include{ctsim-appendix}
+\appendix
+\include{ctsim-algorithms}
+\include{ctsim-sgp}
 
 \newpage
 
 
 \newpage