ChangeLog

   1 TODO
   2         Be consistant with creation of new images
   3
   4         copy labels from original image to new images
   5
   6 3.0alpha2 - Released 1/02/01
   7
   8         * ctsim: added generation of filter images
   9
  10         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  11
  12         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  13
  14         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  15
  16         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  17         text files suitable for reading.
  18
  19         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  20         when performing properties of images.
  21
  22         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  23         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  24         fourier.cpp
  25
  26         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  27         image math functions to complex-valued math.
  28
  29         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  30
  31 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  32
  33         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  34         and column plots and comparison plots
  35
  36         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  37
  38         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  39
  40         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  41         files.
  42
  43         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  44         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  45         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  46
  47         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  48         imagefile and plotfile classes.
  49
  50         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  51         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  52         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  53         images.
  54
  55         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  56         images.
  57
  58         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  59         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  60
  61         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  62         math functions
  63
  64         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  65
  66         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  67         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  68         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  69
  70         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  71         class.
  72
  73         * sgp: Added linestyle settings
  74
  75 2.5.0 - 12/18/00
  76    First Microsoft Windows GUI version
  77    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  78    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  79         when manually compiling phantoms that vary during projection
  80         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  81    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  82    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  83    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  84    Fixed display of plotting in Projection views
  85    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  86    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  87         "namespace using std" statements
  88    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  89    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  90
  91 2.0.6 - 12/03/00
  92    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
  93    Updated README file
  94    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
  95    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
  96
  97 2.0.5 - 12/01/00
  98    Improved compilation on RedHat 7
  99    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 100    Removed README.RedHat7
 101
 102 2.0.4 - 11/25/00
 103    Added documentation for --geometry setting
 104    Added README.RedHat7 document
 105
 106 2.0.3 - 11/20/00
 107    Fixed bug in generation of binary PGM files
 108    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 109    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 110
 111 2.0.2 - 11/8/00
 112    Additions to man pages (Ian Kay)
 113    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 114
 115 2.0.1 - 10/1/00
 116    Fixed syntax error in fftw configuration
 117    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 118
 119 2.0.0 - 9/7/00
 120    Version 2.0.0 released!
 121    ctsim: Added Window menu to Main frame
 122    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 123    Fixed obscure bug in sys_error
 124    Fixed compilation in mingw environment not present
 125    Fixed compilation in non-graphical environments
 126
 127 2.0.0-b12 - 9/4/00
 128    ctsim: Added animation of reconstruction
 129    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 130    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 131    ctsim: used setpriority to set lower priority
 132    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 133    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 134
 135 2.0.0-b11 - 9/1/00
 136    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 137    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 138    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 139    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 140    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 141    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 142    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 143    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 144    Separated reconstruction into Reconstructor class
 145    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 146    Added --enable-static to generate statically linked programs
 147
 148 2.0.0-b10 - 8/25/00
 149    ctsim: Added animation of projection collection processs
 150    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 151    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 152    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 153    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 154    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 155    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 156    Fixed bug in backprojection selection
 157
 158 2.0.0-b9 - 8/22/00
 159    Added RCS Id strings to executable files
 160    Added RPM Spec file for RPM package creation
 161    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 162    Fixed compilation for non-SGP architectures
 163    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 164    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 165         inverse_fourier construction of filters
 166    Added median to statistics and to auto-windowing
 167
 168 2.0.0-b8 - 8/1/00
 169    Added line color support to SGP
 170    Fixed lineAbs bug
 171
 172 2.0.0-b7 - 7/25/00
 173    Finished support for dmallocxx library
 174    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 175    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 176         G2 windows and well as WXWindows.
 177    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 178    Fixed row-plot bug in if-2
 179    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 180
 181 2.0.0-b6 - 7/22/00
 182    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 183         and projection files
 184    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 185         and reconstruction parameters dialogs
 186    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 187    Completely reorganized option processing in classes to improve
 188         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 189
 190 2.0.0-b5 - 7/17/00
 191    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 192    Started ctsim.tex document file
 193
 194 2.0.0-b4 - 7/13/00
 195    Fixed compiler warnings at -Wall level
 196    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 197    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 198    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 199
 200 2.0.0-b3 - 7/10/00
 201    Added highly optimized backprojection method idiff3
 202    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 203    Fixed image display in if2img using G2 library
 204    Added column-plot and row-plot options to if-2
 205    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 206    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 207         backprojection method. Currently, this technique is still under
 208         development and debugging
 209    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 210
 211 2.0.0-b2 - 7/07/00
 212    Cleaned up SignalFilter class
 213    Added zeropad option to pjrec
 214    Added zeropad options to html and cgi files
 215    Added fourier_table and rfttw filter methods
 216    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 217
 218 2.0.0-b1 - 7/05/00
 219    Updated trace level processing
 220    Added trace level to SignalFilter
 221    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 222
 223 1.9.9 - 7/04/00
 224    Fixed const issue with ImageFileArray
 225    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 226    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 227    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 228    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 229    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 230         between convolution, dft, & fft filtering
 231    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 232    Added support for FFTW library
 233
 234 1.9.8 - 6/27/2000
 235    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 236    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 237    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 238    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 239    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 240    Added signature tag and creation date/time to projection files
 241
 242 1.9.7 - 6/25/2000
 243    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 244         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 245         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 246    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 247    Rewrote ImageFile class
 248    Started support for dmallocxx library, not finished
 249    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 250    Updated ifinfo to show comparative statistics
 251    Added printLabels() to Array2dFile class
 252    Added printStatistics() to ImageFile class
 253
 254 1.9.6 - 6/22/2000
 255    Moved conversion filter name/id to Filter class
 256    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 257    Added MPI broadcasting of strings
 258
 259 1.9.5 - 6/21/2000
 260    Merged proj_reconstr into class Projections
 261    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 262    Code cleanup in projections.cpp
 263    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 264
 265 1.9.4 - 6/20/2000
 266    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 267    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 268    Converted filter and convolution to object-oriented code
 269    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 270    Optimized image file writing on little-endian architectures
 271    Updated README and INSTALL
 272
 273 1.9.3 - 6/19/2000
 274    Reorganized source files
 275    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 276
 277 1.9.2 - 6/18/2000
 278    Reorganized include files
 279    Fixed const pointers in strfuncs
 280
 281 1.9.1 - 6/16/2000
 282    Renamed directories, moved source files, combined source files
 283    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 284    and libctgraphics)
 285
 286 1.9.0 - 6/15/2000
 287    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 288    Renamed Raysums to Projections throughout files
 289    Renamed Detector to Scanner
 290    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 291
 292 0.6.1 - 6/12/2000
 293    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 294    Converted Detector to Object-Oriented
 295
 296 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 297    Improved Integer backprojection method
 298         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 299         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 300    Finished converting all C files to C++
 301    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 302    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 303
 304 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 305    Converted MPI data structures to C++ object
 306    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 307
 308 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 309    First C++ conversions
 310    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 311         - Now all data files are cross-platform compatible
 312    Converted from MPI to MPI++
 313    Converted backprojection to object-oriented
 314    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 315
 316 0.5.4 - 6/4/2000
 317    Simpilifed endian handling
 318
 319 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 320    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 321    Removed broken B-spline interpolation
 322    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 323    Added support for 16-bit PNG graphics
 324
 325 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 326    Added compile-time configuration of endian order
 327
 328 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 329    Modified the raysum file format to be platform independent
 330
 331 0.5.3 - 5/11/2000
 332    Added Microsoft VC compatibility
 333    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 334
 335 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 336    Continued conversion to ANSI C
 337    Removed old CRT routines
 338
 339 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 340    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 341    Continued code cleanup
 342
 343 0.5.2-b3 - 4/30/200
 344     More code cleanup with reorganizing libraries
 345     Added --log and --exp to sdf-1
 346     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 347
 348 0.5.2-b2 - 4/30/200
 349     Continued code cleanup
 350
 351 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 352     Fixed a few MPI bugs
 353     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 354
 355 0.5.1 - 4/28/2000
 356     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 357     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 358
 359 0.5.0 - 4/27/2000
 360     First open source distribution for GNU/Linux
 361
 362 6/1999
 363   Converted to GNU/Linux
 364   added MPI support via LAM library
 365
 366 1983-84
 367   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 368