ChangeLog

   1         TODO
   2         Read PlotFile's.
   3         Add to ctsim export of imagefiles to standard graphic formats.
   4
   5
   6 3.0alpha2
   7
   8         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
   9         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even.
  10
  11         * imagefile: Added FFTW library to imagefile processing
  12
  13         * ctsim: added generation of filter images
  14
  15 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  16
  17         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  18         and column plots and comparison plots
  19
  20         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  21
  22         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  23
  24         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  25         files.
  26
  27         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  28         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  29         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  30
  31         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  32         imagefile and plotfile classes.
  33
  34         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  35         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  36         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  37         images.
  38
  39         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  40         images.
  41
  42         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  43         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  44
  45         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  46         math functions
  47
  48         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  49
  50         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  51         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  52         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  53
  54         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  55         class.
  56
  57         * sgp: Added linestyle settings
  58
  59 2.5.0 - 12/18/00
  60    First Microsoft Windows GUI version
  61    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  62    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  63         when manually compiling phantoms that vary during projection
  64         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  65    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  66    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  67    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  68    Fixed display of plotting in Projection views
  69    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  70    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  71         "namespace using std" statements
  72    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  73    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  74
  75 2.0.6 - 12/03/00
  76    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
  77    Updated README file
  78    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
  79    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
  80
  81 2.0.5 - 12/01/00
  82    Improved compilation on RedHat 7
  83    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
  84    Removed README.RedHat7
  85
  86 2.0.4 - 11/25/00
  87    Added documentation for --geometry setting
  88    Added README.RedHat7 document
  89
  90 2.0.3 - 11/20/00
  91    Fixed bug in generation of binary PGM files
  92    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
  93    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
  94
  95 2.0.2 - 11/8/00
  96    Additions to man pages (Ian Kay)
  97    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
  98
  99 2.0.1 - 10/1/00
 100    Fixed syntax error in fftw configuration
 101    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 102
 103 2.0.0 - 9/7/00
 104    Version 2.0.0 released!
 105    ctsim: Added Window menu to Main frame
 106    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 107    Fixed obscure bug in sys_error
 108    Fixed compilation in mingw environment not present
 109    Fixed compilation in non-graphical environments
 110
 111 2.0.0-b12 - 9/4/00
 112    ctsim: Added animation of reconstruction
 113    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 114    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 115    ctsim: used setpriority to set lower priority
 116    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 117    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 118
 119 2.0.0-b11 - 9/1/00
 120    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 121    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 122    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 123    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 124    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 125    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 126    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 127    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 128    Separated reconstruction into Reconstructor class
 129    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 130    Added --enable-static to generate statically linked programs
 131
 132 2.0.0-b10 - 8/25/00
 133    ctsim: Added animation of projection collection processs
 134    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 135    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 136    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 137    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 138    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 139    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 140    Fixed bug in backprojection selection
 141
 142 2.0.0-b9 - 8/22/00
 143    Added RCS Id strings to executable files
 144    Added RPM Spec file for RPM package creation
 145    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 146    Fixed compilation for non-SGP architectures
 147    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 148    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 149         inverse_fourier construction of filters
 150    Added median to statistics and to auto-windowing
 151
 152 2.0.0-b8 - 8/1/00
 153    Added line color support to SGP
 154    Fixed lineAbs bug
 155
 156 2.0.0-b7 - 7/25/00
 157    Finished support for dmallocxx library
 158    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 159    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 160         G2 windows and well as WXWindows.
 161    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 162    Fixed row-plot bug in if-2
 163    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 164
 165 2.0.0-b6 - 7/22/00
 166    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 167         and projection files
 168    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 169         and reconstruction parameters dialogs
 170    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 171    Completely reorganized option processing in classes to improve
 172         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 173
 174 2.0.0-b5 - 7/17/00
 175    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 176    Started ctsim.tex document file
 177
 178 2.0.0-b4 - 7/13/00
 179    Fixed compiler warnings at -Wall level
 180    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 181    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 182    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 183
 184 2.0.0-b3 - 7/10/00
 185    Added highly optimized backprojection method idiff3
 186    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 187    Fixed image display in if2img using G2 library
 188    Added column-plot and row-plot options to if-2
 189    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 190    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 191         backprojection method. Currently, this technique is still under
 192         development and debugging
 193    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 194
 195 2.0.0-b2 - 7/07/00
 196    Cleaned up SignalFilter class
 197    Added zeropad option to pjrec
 198    Added zeropad options to html and cgi files
 199    Added fourier_table and rfttw filter methods
 200    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 201
 202 2.0.0-b1 - 7/05/00
 203    Updated trace level processing
 204    Added trace level to SignalFilter
 205    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 206
 207 1.9.9 - 7/04/00
 208    Fixed const issue with ImageFileArray
 209    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 210    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 211    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 212    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 213    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 214         between convolution, dft, & fft filtering
 215    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 216    Added support for FFTW library
 217
 218 1.9.8 - 6/27/2000
 219    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 220    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 221    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 222    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 223    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 224    Added signature tag and creation date/time to projection files
 225
 226 1.9.7 - 6/25/2000
 227    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 228         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 229         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 230    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 231    Rewrote ImageFile class
 232    Started support for dmallocxx library, not finished
 233    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 234    Updated ifinfo to show comparative statistics
 235    Added printLabels() to Array2dFile class
 236    Added printStatistics() to ImageFile class
 237
 238 1.9.6 - 6/22/2000
 239    Moved conversion filter name/id to Filter class
 240    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 241    Added MPI broadcasting of strings
 242
 243 1.9.5 - 6/21/2000
 244    Merged proj_reconstr into class Projections
 245    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 246    Code cleanup in projections.cpp
 247    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 248
 249 1.9.4 - 6/20/2000
 250    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 251    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 252    Converted filter and convolution to object-oriented code
 253    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 254    Optimized image file writing on little-endian architectures
 255    Updated README and INSTALL
 256
 257 1.9.3 - 6/19/2000
 258    Reorganized source files
 259    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 260
 261 1.9.2 - 6/18/2000
 262    Reorganized include files
 263    Fixed const pointers in strfuncs
 264
 265 1.9.1 - 6/16/2000
 266    Renamed directories, moved source files, combined source files
 267    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 268    and libctgraphics)
 269
 270 1.9.0 - 6/15/2000
 271    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 272    Renamed Raysums to Projections throughout files
 273    Renamed Detector to Scanner
 274    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 275
 276 0.6.1 - 6/12/2000
 277    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 278    Converted Detector to Object-Oriented
 279
 280 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 281    Improved Integer backprojection method
 282         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 283         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 284    Finished converting all C files to C++
 285    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 286    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 287
 288 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 289    Converted MPI data structures to C++ object
 290    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 291
 292 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 293    First C++ conversions
 294    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 295         - Now all data files are cross-platform compatible
 296    Converted from MPI to MPI++
 297    Converted backprojection to object-oriented
 298    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 299
 300 0.5.4 - 6/4/2000
 301    Simpilifed endian handling
 302
 303 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 304    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 305    Removed broken B-spline interpolation
 306    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 307    Added support for 16-bit PNG graphics
 308
 309 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 310    Added compile-time configuration of endian order
 311
 312 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 313    Modified the raysum file format to be platform independent
 314
 315 0.5.3 - 5/11/2000
 316    Added Microsoft VC compatibility
 317    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 318
 319 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 320    Continued conversion to ANSI C
 321    Removed old CRT routines
 322
 323 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 324    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 325    Continued code cleanup
 326
 327 0.5.2-b3 - 4/30/200
 328     More code cleanup with reorganizing libraries
 329     Added --log and --exp to sdf-1
 330     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 331
 332 0.5.2-b2 - 4/30/200
 333     Continued code cleanup
 334
 335 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 336     Fixed a few MPI bugs
 337     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 338
 339 0.5.1 - 4/28/2000
 340     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 341     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 342
 343 0.5.0 - 4/27/2000
 344     First open source distribution for GNU/Linux
 345
 346 6/1999
 347   Converted to GNU/Linux
 348   added MPI support via LAM library
 349
 350 1983-84
 351   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 352