tools/ifexport.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          ifexport.cpp
   5 **   Purpose:       Convert an image file to a viewable image
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  April 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: ifexport.cpp,v 1.3 2001/01/09 22:31:47 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 #include "ct.h"
  29
  30
  31 enum { O_SCALE, O_MIN, O_MAX, O_AUTO, O_CENTER, O_STATS, O_FORMAT, O_LABELS,
  32        O_HELP, O_VERBOSE, O_VERSION, O_DEBUG };
  33
  34 static struct option my_options[] =
  35 {
  36   {"scale", 1, 0, O_SCALE},
  37   {"min", 1, 0, O_MIN},
  38   {"max", 1, 0, O_MAX},
  39   {"auto", 1, 0, O_AUTO},
  40   {"center", 1, 0, O_CENTER},
  41   {"format", 1, 0, O_FORMAT},
  42   {"labels", 0, 0, O_LABELS},
  43   {"stats", 0, 0, O_STATS},
  44   {"verbose", 0, 0, O_VERBOSE},
  45   {"debug", 0, 0, O_DEBUG},
  46   {"help", 0, 0, O_HELP},
  47   {"version", 0, 0, O_VERSION},
  48   {0, 0, 0, 0}
  49 };
  50
  51 static const char* g_szIdStr = "$Id: ifexport.cpp,v 1.3 2001/01/09 22:31:47 kevin Exp $";
  52
  53 enum { O_AUTO_FULL, O_AUTO_STD0_1, O_AUTO_STD0_5, O_AUTO_STD1, O_AUTO_STD2, O_AUTO_STD3 };
  54 static const char O_AUTO_FULL_STR[]="full";
  55 static const char O_AUTO_STD0_1_STR[]="std0.1";
  56 static const char O_AUTO_STD0_5_STR[]="std0.5";
  57 static const char O_AUTO_STD1_STR[]="std1";
  58 static const char O_AUTO_STD2_STR[]="std2";
  59 static const char O_AUTO_STD3_STR[]="std3";
  60
  61 enum { O_CENTER_MEDIAN, O_CENTER_MEAN, O_CENTER_MODE };
  62 static const char O_CENTER_MEAN_STR[]="mean";
  63 static const char O_CENTER_MODE_STR[]="mode";
  64 static const char O_CENTER_MEDIAN_STR[]="median";
  65
  66 enum { O_FORMAT_PNG, O_FORMAT_PNG16, O_FORMAT_PGM, O_FORMAT_PGMASC };
  67 static const char O_FORMAT_PNG_STR[]="png" ;
  68 static const char O_FORMAT_PNG16_STR[]="png16" ;
  69 static const char O_FORMAT_PGM_STR[]="pgm";
  70 static const char O_FORMAT_PGMASC_STR[]="pgmasc";
  71
  72 void
  73 ifexport_usage (const char *program)
  74 {
  75   std::cout << "usage: " << fileBasename(program) << " ifname outfile [OPTIONS]\n";
  76   std::cout << "Convert IF file to an image file\n";
  77   std::cout << std::endl;
  78   std::cout << "     ifname     Name of input file\n";
  79   std::cout << "     outfile    Name of output file\n";
  80   std::cout << "     --format   Output format\n";
  81   std::cout << "         pgm    PGM (portable graymap) format (default)\n";
  82   std::cout << "         pgmasc PGM (portable graymap) ASCII format\n";
  83 #ifdef HAVE_PNG
  84   std::cout << "         png    PNG (8-bit) format\n";
  85   std::cout << "         png16  PNG (16-bit) format\n";
  86 #endif
  87   std::cout << "     --center   Center of window\n";
  88   std::cout << "         median Median is center of window (default)\n";
  89   std::cout << "         mode   Mode is center of window\n";
  90   std::cout << "         mean   Mean is center of window\n";
  91   std::cout << "     --auto     Set auto window\n";
  92   std::cout << "         full   Use full window (default)\n";
  93   std::cout << "         std0.1 Use 0.1 standard deviation about center\n";
  94   std::cout << "         std0.5 Use 0.5 standard deviation about center\n";
  95   std::cout << "         std1   Use one standard deviation about center\n";
  96   std::cout << "         std2   Use two standard deviations about center\n";
  97   std::cout << "         std3   Use three standard deviations about center\n";
  98   std::cout << "     --scale    Scaling factor for output size\n";
  99   std::cout << "     --min      Set minimum intensity\n";
 100   std::cout << "     --max      Set maximum intensity\n";
 101   std::cout << "     --stats    Print image statistics\n";
 102   std::cout << "     --labels   Print image labels\n";
 103   std::cout << "     --debug    Set debug mode\n";
 104   std::cout << "     --verbose  Set verbose mode\n";
 105   std::cout << "     --version  Print version\n";
 106   std::cout << "     --help     Print this help message\n";
 107 }
 108
 109
 110 int
 111 ifexport_main (int argc, char *const argv[])
 112 {
 113   ImageFile* pim = NULL;
 114   double densmin = HUGE_VAL, densmax = -HUGE_VAL;
 115   char *in_file, *out_file;
 116   int opt_verbose = 0;
 117   int opt_scale = 1;
 118   int opt_auto = O_AUTO_FULL;
 119   int opt_set_max = 0;
 120   int opt_set_min = 0;
 121   int opt_stats = 0;
 122   int opt_debug = 0;
 123   int opt_center = O_CENTER_MEDIAN;
 124   int opt_format = O_FORMAT_PGM;
 125   int opt_labels = 0;
 126
 127   while (1)
 128     {
 129       int c = getopt_long (argc, argv, "", my_options, NULL);
 130       char *endptr = NULL;
 131       char *endstr;
 132
 133       if (c == -1)
 134         break;
 135
 136       switch (c)
 137         {
 138         case O_MIN:
 139           opt_set_min = 1;
 140           densmin = strtod(optarg, &endptr);
 141           endstr = optarg + strlen(optarg);
 142           if (endptr != endstr)
 143             {
 144               sys_error (ERR_SEVERE, "Error setting --min to %s", optarg);
 145               ifexport_usage(argv[0]);
 146               return (1);
 147             }
 148           break;
 149         case O_MAX:
 150           opt_set_max = 1;
 151           densmax = strtod(optarg, &endptr);
 152           endstr = optarg + strlen(optarg);
 153           if (endptr != endstr)
 154             {
 155               sys_error (ERR_SEVERE, "Error setting --max to %s", optarg);
 156               ifexport_usage(argv[0]);
 157               return (1);
 158             }
 159           break;
 160         case O_SCALE:
 161           opt_scale = strtol(optarg, &endptr, 10);
 162           endstr = optarg + strlen(optarg);
 163           if (endptr != endstr)
 164             {
 165               sys_error (ERR_SEVERE, "Error setting --scale to %s", optarg);
 166               ifexport_usage(argv[0]);
 167               return (1);
 168             }
 169           break;
 170         case O_AUTO:
 171           if (strcmp(optarg, O_AUTO_FULL_STR) == 0)
 172             opt_auto = O_AUTO_FULL;
 173           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD1_STR) == 0)
 174             opt_auto = O_AUTO_STD1;
 175           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD0_5_STR) == 0)
 176             opt_auto = O_AUTO_STD0_5;
 177           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD0_1_STR) == 0)
 178             opt_auto = O_AUTO_STD0_1;
 179           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD2_STR) == 0)
 180             opt_auto = O_AUTO_STD2;
 181           else if (strcmp(optarg, O_AUTO_STD3_STR) == 0)
 182             opt_auto = O_AUTO_STD3;
 183           else
 184             {
 185               sys_error (ERR_SEVERE, "Invalid auto mode %s", optarg);
 186               ifexport_usage(argv[0]);
 187               return (1);
 188             }
 189                 break;
 190         case O_CENTER:
 191           if (strcmp(optarg, O_CENTER_MEDIAN_STR) == 0)
 192             opt_center = O_CENTER_MEDIAN;
 193           else if (strcmp(optarg, O_CENTER_MEAN_STR) == 0)
 194             opt_center = O_CENTER_MEAN;
 195           else if (strcmp(optarg, O_CENTER_MODE_STR) == 0)
 196             opt_center = O_CENTER_MODE;
 197           else
 198             {
 199               sys_error (ERR_SEVERE, "Invalid center mode %s", optarg);
 200               ifexport_usage(argv[0]);
 201               return (1);
 202             }
 203           break;
 204         case O_FORMAT:
 205           if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PGM_STR) == 0)
 206             opt_format = O_FORMAT_PGM;
 207           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PGMASC_STR) == 0)
 208             opt_format = O_FORMAT_PGMASC;
 209 #if HAVE_PNG
 210           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PNG_STR) == 0)
 211             opt_format = O_FORMAT_PNG;
 212           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_PNG16_STR) == 0)
 213             opt_format = O_FORMAT_PNG16;
 214 #endif
 215 #if HAVE_GIF
 216           else if (strcmp(optarg, O_FORMAT_GIF_STR) == 0)
 217             opt_format = O_FORMAT_GIF;
 218 #endif
 219   else {
 220               sys_error (ERR_SEVERE, "Invalid format mode %s", optarg);
 221               ifexport_usage(argv[0]);
 222               return (1);
 223             }
 224           break;
 225         case O_LABELS:
 226           opt_labels = 1;
 227           break;
 228         case O_VERBOSE:
 229           opt_verbose = 1;
 230           break;
 231         case O_DEBUG:
 232           opt_debug = 1;
 233           break;
 234         case O_STATS:
 235           opt_stats = 1;
 236           break;
 237         case O_VERSION:
 238 #ifdef VERSION
 239           std::cout << "Version " << VERSION << std::endl << g_szIdStr << std::endl;
 240 #else
 241           std::cout << "Unknown version number\n";
 242 #endif
 243           return (0);
 244         case O_HELP:
 245         case '?':
 246           ifexport_usage(argv[0]);
 247           return (0);
 248         default:
 249           ifexport_usage(argv[0]);
 250           return (1);
 251         }
 252     }
 253
 254   if (optind + 2 != argc) {
 255     ifexport_usage(argv[0]);
 256     return (1);
 257   }
 258
 259   in_file = argv[optind];
 260   out_file = argv[optind+1];
 261
 262   pim = new ImageFile ();
 263   ImageFile& im = *pim;
 264   if (! im.fileRead(in_file)) {
 265     sys_error (ERR_FATAL, "File %s does not exist", in_file);
 266     return (1);
 267   }
 268
 269   if (opt_labels)
 270     im.printLabels(std::cout);
 271
 272   if (opt_stats || (! (opt_set_max && opt_set_min))) {
 273       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 274       double window = 0;
 275       im.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 276
 277       if (opt_auto == O_AUTO_FULL) {
 278         if (! opt_set_max)
 279             densmax = max;
 280         if (! opt_set_min)
 281             densmin = min;
 282       }
 283       if (opt_stats || opt_auto != O_AUTO_FULL) {
 284
 285           if (opt_auto == O_AUTO_FULL)
 286               ;
 287           else if (opt_auto == O_AUTO_STD1)
 288               window = stddev;
 289           else if (opt_auto == O_AUTO_STD0_1)
 290               window = stddev * 0.1;
 291           else if (opt_auto == O_AUTO_STD0_5)
 292               window = stddev * 0.5;
 293           else if (opt_auto == O_AUTO_STD2)
 294               window = stddev * 2;
 295           else if (opt_auto == O_AUTO_STD3)
 296               window = stddev * 3;
 297           else {
 298               sys_error (ERR_SEVERE, "Internal Error: Invalid auto mode %d", opt_auto);
 299               return (1);
 300           }
 301       }
 302       if (opt_stats) {
 303           std::cout <<"nx: " << im.nx() << std::endl;
 304           std::cout <<"ny: " << im.ny() << std::endl;
 305           std::cout <<"min: " << min << std::endl;
 306           std::cout <<"max: " << max << std::endl;
 307           std::cout <<"mean: " << mean << std::endl;
 308           std::cout <<"mode: " << mode << std::endl;
 309           std::cout <<"stddev: " << stddev << std::endl;
 310       }
 311       if (opt_auto != O_AUTO_FULL) {
 312           double center;
 313
 314           if (opt_center == O_CENTER_MEDIAN)
 315               center = median;
 316           else if (opt_center == O_CENTER_MODE)
 317               center = mode;
 318           else if (opt_center == O_CENTER_MEAN)
 319               center = mean;
 320           else {
 321               sys_error (ERR_SEVERE, "Internal Error: Invalid center mode %d", opt_center);
 322               return (1);
 323           }
 324           if (! opt_set_max)
 325               densmax = center + window;
 326           if (! opt_set_min)
 327               densmin = center - window;
 328       }
 329   }
 330
 331   if (opt_stats) {
 332     std::cout << "min display: " << densmin << std::endl;
 333     std::cout << "max display: " << densmax << std::endl;
 334   }
 335
 336   if (opt_format == O_FORMAT_PGM)
 337     im.writeImagePGM (out_file, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 338   else if (opt_format == O_FORMAT_PGMASC)
 339     im.writeImagePGMASCII (out_file, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 340 #if HAVE_PNG
 341   else if (opt_format == O_FORMAT_PNG)
 342     im.writeImagePNG (out_file, 8, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 343   else if (opt_format == O_FORMAT_PNG16)
 344     im.writeImagePNG (out_file, 16, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 345 #endif
 346 #if HAVE_GIF
 347   else if (opt_format == O_FORMAT_GIF)
 348     im.writeImageGIF (out_file, opt_scale, opt_scale, densmin, densmax);
 349 #endif
 350   else
 351     {
 352       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal Error: Invalid format mode %d", opt_format);
 353       return (1);
 354     }
 355   return (0);
 356 }
 357
 358
 359 #ifndef NO_MAIN
 360 int
 361 main (int argc, char *const argv[])
 362 {
 363   int retval = 1;
 364
 365   try {
 366     retval = ifexport_main(argc, argv);
 367   } catch (exception e) {
 368           std::cerr << "Exception: " << e.what() << std::endl;
 369   } catch (...) {
 370           std::cerr << "Unknown exception\n";
 371   }
 372
 373   return (retval);
 374 }
 375 #endif