r11859: Canonicalize whitespace
[ctsim.git] / libctsim / scanner.cpp
index 453e913f99feff3a30c17a635880512e89b1bdbc..11cd0926ce68874d353bf3454c202b75298c2d1f 100644 (file)
@@ -1,15 +1,15 @@
 /*****************************************************************************
 ** FILE IDENTIFICATION
 **
-**   Name:         scanner.cpp
+**   Name:          scanner.cpp
 **   Purpose:       Classes for CT scanner
 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
 **   Date Started:  1984
 **
 **  This is part of the CTSim program
-**  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
+**  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
 **
-**  $Id: scanner.cpp,v 1.25 2001/01/17 11:00:18 kevin Exp $
+**  $Id$
 **
 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
@@ -32,26 +32,29 @@ const int Scanner::GEOMETRY_INVALID = -1;
 const int Scanner::GEOMETRY_PARALLEL = 0;
 const int Scanner::GEOMETRY_EQUIANGULAR = 1;
 const int Scanner::GEOMETRY_EQUILINEAR = 2;
+const int Scanner::GEOMETRY_LINOGRAM = 3;
 
-const char* Scanner::s_aszGeometryName[] = 
+const char* const Scanner::s_aszGeometryName[] =
 {
-  {"parallel"},
-  {"equiangular"},
-  {"equilinear"},
+  "parallel",
+  "equiangular",
+  "equilinear",
+  "linogram",
 };
 
-const char* Scanner::s_aszGeometryTitle[] = 
+const char* const Scanner::s_aszGeometryTitle[] =
 {
-  {"Parallel"},
-  {"Equiangular"},
-  {"Equilinear"},
+  "Parallel",
+  "Equiangular",
+  "Equilinear",
+  "Linogram",
 };
 
 const int Scanner::s_iGeometryCount = sizeof(s_aszGeometryName) / sizeof(const char*);
 
 
 // NAME
-//   DetectorArray      Construct a DetectorArray
+//   DetectorArray       Construct a DetectorArray
 
 DetectorArray::DetectorArray (const int nDet)
 {
@@ -61,7 +64,7 @@ DetectorArray::DetectorArray (const int nDet)
 
 
 // NAME
-//   ~DetectorArray            Free memory allocated to a detector array
+//   ~DetectorArray             Free memory allocated to a detector array
 
 DetectorArray::~DetectorArray (void)
 {
@@ -71,21 +74,24 @@ DetectorArray::~DetectorArray (void)
 
 
 /* NAME
-*   Scanner::Scanner           Construct a user specified detector structure
+*   Scanner::Scanner            Construct a user specified detector structure
 *
 * SYNOPSIS
 *   Scanner (phm, nDet, nView, nSample)
-*   Phantom& phm               PHANTOM that we are making detector for
+*   Phantom& phm                PHANTOM that we are making detector for
 *   int geomety                Geometry of detector
-*   int nDet                   Number of detector along detector array
-*   int nView                  Number of rotated views
-*   int nSample                Number of rays per detector
+*   int nDet                    Number of detector along detector array
+*   int nView                   Number of rotated views
+*   int nSample         Number of rays per detector
 */
 
-Scanner::Scanner (const Phantom& phm, const char* const geometryName, int nDet, int nView, int nSample, const double rot_anglen, const double dFocalLengthRatio, const double dFieldOfViewRatio)
+Scanner::Scanner (const Phantom& phm, const char* const geometryName,
+                  int nDet, int nView, int offsetView,
+                                  int nSample, const double rot_anglen,
+                  const double dFocalLengthRatio,
+                                  const double dCenterDetectorRatio,
+                  const double dViewRatio, const double dScanRatio)
 {
-  m_phmLen = phm.maxAxisLength();      // maximal length along an axis
-  
   m_fail = false;
   m_idGeometry = convertGeometryNameToID (geometryName);
   if (m_idGeometry == GEOMETRY_INVALID) {
@@ -94,7 +100,7 @@ Scanner::Scanner (const Phantom& phm, const char* const geometryName, int nDet,
     m_failMessage += geometryName;
     return;
   }
-  
+
   if (nView < 1 || nDet < 1) {
     m_fail = true;
     m_failMessage = "nView & nDet must be greater than 0";
@@ -102,101 +108,121 @@ Scanner::Scanner (const Phantom& phm, const char* const geometryName, int nDet,
   }
   if (nSample < 1)
     m_nSample = 1;
-  
+
   m_nDet     = nDet;
   m_nView    = nView;
+  m_iOffsetView = offsetView;
   m_nSample  = nSample;
   m_dFocalLengthRatio = dFocalLengthRatio;
-  m_dFieldOfViewRatio = dFieldOfViewRatio;
-  m_dFocalLength = (m_phmLen * SQRT2 / 2) * dFocalLengthRatio;
-  m_dFieldOfView = m_phmLen * SQRT2 * dFieldOfViewRatio;
-  
+  m_dCenterDetectorRatio = dCenterDetectorRatio;
+  m_dViewRatio = dViewRatio;
+  m_dScanRatio = dScanRatio;
+
+  m_dViewDiameter = phm.getDiameterBoundaryCircle() * m_dViewRatio;
+  m_dFocalLength = (m_dViewDiameter / 2) * m_dFocalLengthRatio;
+  m_dCenterDetectorLength = (m_dViewDiameter / 2) * m_dCenterDetectorRatio;
+  m_dSourceDetectorLength = m_dFocalLength + m_dCenterDetectorLength;
+  m_dScanDiameter = m_dViewDiameter * m_dScanRatio;
+
   m_dXCenter = phm.xmin() + (phm.xmax() - phm.xmin()) / 2;
   m_dYCenter = phm.ymin() + (phm.ymax() - phm.ymin()) / 2;
   m_rotLen  = rot_anglen;
   m_rotInc  = m_rotLen / m_nView;
   if (m_idGeometry == GEOMETRY_PARALLEL) {
-    m_detLen   = m_dFieldOfView;
+    m_dFanBeamAngle = 0;
+    m_detLen   = m_dScanDiameter;
+    m_detStart = -m_detLen / 2;
     m_detInc  = m_detLen / m_nDet;
-    if (m_nDet % 2 == 0) // Adjust for Even number of detectors
-      m_detInc = m_detLen / (m_nDet - 1); // center detector = (nDet/2)-1
-    
+    double dDetectorArrayEndOffset = 0;
+    // For even number of detectors, make detInc slightly larger so that center lies
+    // at nDet/2. Also, extend detector array by one detInc so that all of the phantom is scanned
+    if (isEven (m_nDet)) { // Adjust for Even number of detectors
+      m_detInc = m_detLen / (m_nDet - 1); // center detector = (nDet/2)
+      dDetectorArrayEndOffset = m_detInc;
+    }
+
     double dHalfDetLen = m_detLen / 2;
     m_initPos.xs1 = m_dXCenter - dHalfDetLen;
     m_initPos.ys1 = m_dYCenter + m_dFocalLength;
-    m_initPos.xs2 = m_dXCenter + dHalfDetLen;
+    m_initPos.xs2 = m_dXCenter + dHalfDetLen + dDetectorArrayEndOffset;
     m_initPos.ys2 = m_dYCenter + m_dFocalLength;
     m_initPos.xd1 = m_dXCenter - dHalfDetLen;
-    m_initPos.yd1 = m_dYCenter - m_dFocalLength;
-    m_initPos.xd2 = m_dXCenter + dHalfDetLen;
-    m_initPos.yd2 = m_dYCenter - m_dFocalLength;
-    m_initPos.angle = 0.0;
+    m_initPos.yd1 = m_dYCenter - m_dCenterDetectorLength;
+    m_initPos.xd2 = m_dXCenter + dHalfDetLen + dDetectorArrayEndOffset;
+    m_initPos.yd2 = m_dYCenter - m_dCenterDetectorLength;
+    m_initPos.angle = m_iOffsetView * m_rotInc;
+    m_detLen += dDetectorArrayEndOffset;
   } else if (m_idGeometry == GEOMETRY_EQUILINEAR) {
-#if 0
-    double dAngle = (m_dFieldOfView / 2) / cos (asin (m_dFieldOfView / 2 / m_dFocalLength));
-#else
-    double dHalfSquare = m_dFieldOfView / SQRT2 / 2;
-    double dFocalPastPhm = m_dFocalLength - dHalfSquare;
-    if (dFocalPastPhm <= 0.) {
+  if (m_dScanDiameter / 2 >= m_dFocalLength) {
       m_fail = true;
-      m_failMessage = "Focal Point inside of phantom";
+      m_failMessage = "Invalid geometry: Focal length must be larger than scan length";
       return;
     }
-    double dAngle = atan( dHalfSquare / dFocalPastPhm );
-#endif
-    double dHalfDetLen = 2 * m_dFocalLength * tan (dAngle);
-    
+
+    const double dAngle = asin ((m_dScanDiameter / 2) / m_dFocalLength);
+    const double dHalfDetLen = m_dSourceDetectorLength * tan (dAngle);
+
     m_detLen = dHalfDetLen * 2;
+    m_detStart = -dHalfDetLen;
     m_detInc  = m_detLen / m_nDet;
-    if (m_nDet % 2 == 0) // Adjust for Even number of detectors
-      m_detInc = m_detLen / (m_nDet - 1); // center detector = (nDet/2)-1
-    
-    m_initPos.angle = 0.0;
+    double dDetectorArrayEndOffset = 0;
+    if (isEven (m_nDet)) { // Adjust for Even number of detectors
+      m_detInc = m_detLen / (m_nDet - 1); // center detector = (nDet/2)
+      dDetectorArrayEndOffset = m_detInc;
+      m_detLen += dDetectorArrayEndOffset;
+    }
+
+    m_dFanBeamAngle = dAngle * 2;
     m_initPos.xs1 = m_dXCenter;
     m_initPos.ys1 = m_dYCenter + m_dFocalLength;
     m_initPos.xs2 = m_dXCenter;
     m_initPos.ys2 = m_dYCenter + m_dFocalLength;
     m_initPos.xd1 = m_dXCenter - dHalfDetLen;
-    m_initPos.yd1 = m_dYCenter - m_dFocalLength;
-    m_initPos.xd2 = m_dXCenter + dHalfDetLen;
-    m_initPos.yd2 = m_dYCenter - m_dFocalLength;
-    m_initPos.angle = 0.0;
+    m_initPos.yd1 = m_dYCenter - m_dCenterDetectorLength;
+    m_initPos.xd2 = m_dXCenter + dHalfDetLen + dDetectorArrayEndOffset;
+    m_initPos.yd2 = m_dYCenter - m_dCenterDetectorLength;
+    m_initPos.angle = m_iOffsetView * m_rotInc;
   } else if (m_idGeometry == GEOMETRY_EQUIANGULAR) {
-#if 0
-    double dAngle = atan ((m_dFieldOfView / 2) / m_dFocalLength);
-#else
-    double dHalfSquare = m_dFieldOfView / SQRT2 / 2;
-    double dFocalPastPhm = m_dFocalLength - dHalfSquare;
-    if (dFocalPastPhm <= 0.) {
+    if (m_dScanDiameter / 2 > m_dFocalLength) {
       m_fail = true;
-      m_failMessage = "Focal Point inside of phantom";
+      m_failMessage = "Invalid geometry: Focal length must be larger than scan length";
       return;
     }
-    double dAngle =  atan ( dHalfSquare / dFocalPastPhm ); 
-#endif
+    const double dAngle = asin ((m_dScanDiameter / 2) / m_dFocalLength);
+
     m_detLen = 2 * dAngle;
+    m_detStart = -dAngle;
     m_detInc = m_detLen / m_nDet;
-    if (m_nDet % 2 == 0) // Adjust for Even number of detectors
-      m_detInc = m_detLen / (m_nDet - 1); // center detector = (nDet/2)-1
-    m_dAngularDetIncrement = m_detInc * 2; // Angular Position 2x gamma angle
-    m_dAngularDetLen = m_detLen * 2;
+    double dDetectorArrayEndOffset = 0;
+    if (isEven (m_nDet)) { // Adjust for Even number of detectors
+      m_detInc = m_detLen / (m_nDet - 1); // center detector = (nDet/2)
+      dDetectorArrayEndOffset = m_detInc;
+    }
+    // adjust for center-detector length
+    double dA1 = acos ((m_dScanDiameter / 2) / m_dCenterDetectorLength);
+    double dAngularScale = 2 * (HALFPI + dAngle - dA1) / m_detLen;
+
+    m_dAngularDetLen = dAngularScale * (m_detLen + dDetectorArrayEndOffset);
+    m_dAngularDetIncrement = dAngularScale * m_detInc;
     m_initPos.dAngularDet = -m_dAngularDetLen / 2;
-    
-    m_initPos.angle = 0;
+
+    m_dFanBeamAngle = dAngle * 2;
+    m_initPos.angle = m_iOffsetView * m_rotInc;
     m_initPos.xs1 = m_dXCenter;
     m_initPos.ys1 = m_dYCenter + m_dFocalLength;;
     m_initPos.xs2 = m_dXCenter;
     m_initPos.ys2 = m_dYCenter + m_dFocalLength;
+    m_detLen += dDetectorArrayEndOffset;
   }
-  
-  // Calculate incrementatal rotation matrix 
+
+  // Calculate incrementatal rotation matrix
   GRFMTX_2D temp;
   xlat_mtx2 (m_rotmtxIncrement, -m_dXCenter, -m_dYCenter);
   rot_mtx2 (temp, m_rotInc);
   mult_mtx2 (m_rotmtxIncrement, temp, m_rotmtxIncrement);
   xlat_mtx2 (temp, m_dXCenter, m_dYCenter);
   mult_mtx2 (m_rotmtxIncrement, temp, m_rotmtxIncrement);
-  
+
 }
 
 Scanner::~Scanner (void)
@@ -208,10 +234,10 @@ const char*
 Scanner::convertGeometryIDToName (const int geomID)
 {
   const char *name = "";
-  
+
   if (geomID >= 0 && geomID < s_iGeometryCount)
     return (s_aszGeometryName[geomID]);
-  
+
   return (name);
 }
 
@@ -219,120 +245,136 @@ const char*
 Scanner::convertGeometryIDToTitle (const int geomID)
 {
   const char *title = "";
-  
+
   if (geomID >= 0 && geomID < s_iGeometryCount)
     return (s_aszGeometryName[geomID]);
-  
+
   return (title);
 }
 
 int
-Scanner::convertGeometryNameToID (const char* const geomName) 
+Scanner::convertGeometryNameToID (const char* const geomName)
 {
   int id = GEOMETRY_INVALID;
-  
+
   for (int i = 0; i < s_iGeometryCount; i++)
     if (strcasecmp (geomName, s_aszGeometryName[i]) == 0) {
       id = i;
       break;
     }
-    
+
     return (id);
 }
 
 
 /* NAME
-*   collectProjections         Calculate projections for a Phantom
+*   collectProjections          Calculate projections for a Phantom
 *
 * SYNOPSIS
 *   collectProjections (proj, phm, start_view, nView, bStoreViewPos, trace)
 *   Projectrions& proj      Projection storage
-*   Phantom& phm            Phantom for which we collect projections
+*   Phantom& phm             Phantom for which we collect projections
 *   bool bStoreViewPos      TRUE then storage proj at normal view position
-*   int trace               Trace level
+*   int trace                Trace level
 */
 
 
 void
 Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int trace, SGP* pSGP)
 {
-  collectProjections (proj, phm, 0, proj.nView(), true, trace, pSGP);
+  collectProjections (proj, phm, m_startView, proj.nView(), m_iOffsetView, true, trace, pSGP);
 }
 
 void
-Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iStartView, const int iNumViews, bool bStoreAtViewPosition, const int trace, SGP* pSGP)
+Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iStartView,
+                             const int iNumViews, const int iOffsetView,  bool bStoreAtViewPosition,
+                             const int trace, SGP* pSGP)
+{
+  int iStorageOffset = (bStoreAtViewPosition ? iStartView : 0);
+  collectProjections (proj, phm, iStartView, iNumViews, iOffsetView, iStorageOffset, trace, pSGP);
+}
+
+void
+Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iStartView,
+                             const int iNumViews, const int iOffsetView, int iStorageOffset,
+                             const int trace, SGP* pSGP)
 {
   m_trace = trace;
-  double start_angle = iStartView * proj.rotInc();
-  
-  // Calculate initial rotation matrix 
+  double start_angle = (iStartView + iOffsetView) * proj.rotInc();
+
+  // Calculate initial rotation matrix
   GRFMTX_2D rotmtx_initial, temp;
   xlat_mtx2 (rotmtx_initial, -m_dXCenter, -m_dYCenter);
   rot_mtx2 (temp, start_angle);
   mult_mtx2 (rotmtx_initial, temp, rotmtx_initial);
   xlat_mtx2 (temp, m_dXCenter, m_dYCenter);
   mult_mtx2 (rotmtx_initial, temp, rotmtx_initial);
-  
+
   double xd1=0, yd1=0, xd2=0, yd2=0;
   if (m_idGeometry != GEOMETRY_EQUIANGULAR) {
     xd1 = m_initPos.xd1;
     yd1 = m_initPos.yd1;
     xd2 = m_initPos.xd2;
     yd2 = m_initPos.yd2;
-    xform_mtx2 (rotmtx_initial, xd1, yd1);      // rotate detector endpoints 
-    xform_mtx2 (rotmtx_initial, xd2, yd2);      // to initial view_angle 
+    xform_mtx2 (rotmtx_initial, xd1, yd1);      // rotate detector endpoints
+    xform_mtx2 (rotmtx_initial, xd2, yd2);      // to initial view_angle
   }
-  
+
   double xs1 = m_initPos.xs1;
   double ys1 = m_initPos.ys1;
   double xs2 = m_initPos.xs2;
   double ys2 = m_initPos.ys2;
   xform_mtx2 (rotmtx_initial, xs1, ys1);      // rotate source endpoints to
   xform_mtx2 (rotmtx_initial, xs2, ys2);      // initial view angle
-  
+
   int iView;
   double viewAngle;
   for (iView = 0, viewAngle = start_angle;  iView < iNumViews; iView++, viewAngle += proj.rotInc()) {
-    int iStoragePosition = iView;
-    if (bStoreAtViewPosition)
-      iStoragePosition += iStartView;
-    
+    int iStoragePosition = iView + iStorageOffset;
+
     DetectorArray& detArray = proj.getDetectorArray( iStoragePosition );
-    
-#ifdef HAVE_SGP 
+
+#ifdef HAVE_SGP
     if (pSGP && m_trace >= Trace::TRACE_PHANTOM) {
       m_pSGP = pSGP;
-      double dWindowSize = dmax (m_detLen, m_dFocalLength * 2) * SQRT2;
+      double dWindowSize = dmax (m_detLen, m_dSourceDetectorLength) * 2;
       double dHalfWindowSize = dWindowSize / 2;
       m_dXMinWin = m_dXCenter - dHalfWindowSize;
       m_dXMaxWin = m_dXCenter + dHalfWindowSize;
       m_dYMinWin = m_dYCenter - dHalfWindowSize;
       m_dYMaxWin = m_dYCenter + dHalfWindowSize;
-      double dHalfPhmLen = m_phmLen /  2;
-      
+
       m_pSGP->setWindow (m_dXMinWin, m_dYMinWin, m_dXMaxWin, m_dYMaxWin);
       m_pSGP->setRasterOp (RO_COPY);
+
       m_pSGP->setColor (C_RED);
       m_pSGP->moveAbs (0., 0.);
-      m_pSGP->drawRect (m_dXCenter - dHalfPhmLen, m_dYCenter - dHalfPhmLen, m_dXCenter + dHalfPhmLen, m_dYCenter + dHalfPhmLen);
+      m_pSGP->drawCircle (m_dViewDiameter / 2);
+
       m_pSGP->moveAbs (0., 0.);
+      m_pSGP->setColor (C_GREEN);
       m_pSGP->drawCircle (m_dFocalLength);
       m_pSGP->setColor (C_BLUE);
+#if MSVC
+      m_pSGP->setTextPointSize (9);
+#else
+      m_pSGP->setTextPointSize (14);
+#endif
       phm.draw (*m_pSGP);
       m_dTextHeight = m_pSGP->getCharHeight ();
-      
+
       traceShowParam ("Phantom:",       "%s", PROJECTION_TRACE_ROW_PHANT_ID, C_BLACK, phm.name().c_str());
       traceShowParam ("Geometry:", "%s", PROJECTION_TRACE_ROW_GEOMETRY, C_BLUE, convertGeometryIDToName(m_idGeometry));
       traceShowParam ("Focal Length Ratio:", "%.2f", PROJECTION_TRACE_ROW_FOCAL_LENGTH, C_BLUE, m_dFocalLengthRatio);
-      traceShowParam ("Field Of View Ratio:", "%.2f", PROJECTION_TRACE_ROW_FIELD_OF_VIEW, C_BLUE, m_dFieldOfViewRatio);
+      //      traceShowParam ("Field Of View Ratio:", "%.2f", PROJECTION_TRACE_ROW_FIELD_OF_VIEW, C_BLUE, m_dFieldOfViewRatio);
       traceShowParam ("Num Detectors:", "%d", PROJECTION_TRACE_ROW_NDET, C_BLUE, proj.nDet());
       traceShowParam ("Num Views:", "%d", PROJECTION_TRACE_ROW_NVIEW, C_BLUE, proj.nView());
       traceShowParam ("Samples / Ray:", "%d", PROJECTION_TRACE_ROW_SAMPLES, C_BLUE, m_nSample);
-      
-      m_pSGP->setMarker (SGP::MARK_BDIAMOND, C_LTGREEN);
+
+      m_pSGP->setMarker (SGP::MARKER_BDIAMOND);
     }
 #endif
-    
+
 #ifdef HAVE_SGP
     if (m_pSGP && m_trace >= Trace::TRACE_PHANTOM) {
       m_pSGP->setColor (C_BLACK);
@@ -342,7 +384,7 @@ Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iS
         m_pSGP->lineAbs (xs2, ys2);
         m_pSGP->moveAbs (xd1, yd1);
         m_pSGP->lineAbs (xd2, yd2);
-      } else if (m_idGeometry == GEOMETRY_EQUILINEAR) {        
+      } else if (m_idGeometry == GEOMETRY_EQUILINEAR) {
         m_pSGP->setPenWidth (4);
         m_pSGP->moveAbs (xs1, ys1);
         m_pSGP->lineAbs (xs2, ys2);
@@ -355,7 +397,7 @@ Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iS
         m_pSGP->lineAbs (xs2, ys2);
         m_pSGP->setPenWidth (2);
         m_pSGP->moveAbs (0., 0.);
-        m_pSGP->drawArc (m_dFocalLength, viewAngle + 3 * HALFPI - (m_dAngularDetLen/2), viewAngle + 3 * HALFPI + (m_dAngularDetLen/2));
+        m_pSGP->drawArc (m_dCenterDetectorLength, viewAngle + 3 * HALFPI - (m_dAngularDetLen/2), viewAngle + 3 * HALFPI + (m_dAngularDetLen/2));
       }
       m_pSGP->setPenWidth (1);
     }
@@ -364,19 +406,19 @@ Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iS
 #endif
     if (m_trace == Trace::TRACE_CONSOLE)
       std::cout << "Current View: " << iView+iStartView << std::endl;
-    
+
     projectSingleView (phm, detArray, xd1, yd1, xd2, yd2, xs1, ys1, xs2, ys2, viewAngle + 3 * HALFPI);
     detArray.setViewAngle (viewAngle);
-    
+
 #ifdef HAVE_SGP
     if (m_pSGP && m_trace >= Trace::TRACE_PHANTOM) {
-      //       rs_plot (detArray, xd1, yd1, dXCenter, dYCenter, theta);
+      //        rs_plot (detArray, xd1, yd1, dXCenter, dYCenter, theta);
     }
 #endif
     xform_mtx2 (m_rotmtxIncrement, xs1, ys1);
     xform_mtx2 (m_rotmtxIncrement, xs2, ys2);
     if (m_idGeometry != GEOMETRY_EQUIANGULAR) {
-      xform_mtx2 (m_rotmtxIncrement, xd1, yd1);  // rotate detector endpoints 
+      xform_mtx2 (m_rotmtxIncrement, xd1, yd1);  // rotate detector endpoints
       xform_mtx2 (m_rotmtxIncrement, xd2, yd2);
     }
   } /* for each iView */
@@ -384,15 +426,15 @@ Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iS
 
 
 /* NAME
-*    rayview                   Calculate raysums for a view at any angle
+*    rayview                    Calculate raysums for a view at any angle
 *
 * SYNOPSIS
 *    rayview (phm, detArray, xd1, nSample, yd1, xd2, yd2, xs1, ys1, xs2, ys2)
-*    Phantom& phm              Phantom to scan
-*    DETARRAY *detArray                Storage of values for detector array
-*    Scanner& det              Scanner parameters
-*    double xd1, yd1, xd2, yd2 Beginning & ending detector positions
-*    double xs1, ys1, xs2, ys2 Beginning & ending source positions
+*    Phantom& phm               Phantom to scan
+*    DETARRAY *detArray         Storage of values for detector array
+*    Scanner& det               Scanner parameters
+*    double xd1, yd1, xd2, yd2  Beginning & ending detector positions
+*    double xs1, ys1, xs2, ys2  Beginning & ending source positions
 *
 * RAY POSITIONING
 *         For each detector, have there are a variable number of rays traced.
@@ -406,15 +448,15 @@ Scanner::collectProjections (Projections& proj, const Phantom& phm, const int iS
 *     In that case, the detector position is the center of the detector cell.
 */
 
-void 
+void
 Scanner::projectSingleView (const Phantom& phm, DetectorArray& detArray, const double xd1, const double yd1, const double xd2, const double yd2, const double xs1, const double ys1, const double xs2, const double ys2, const double dDetAngle)
 {
-  
-  double sdx = (xs2 - xs1) / detArray.nDet();  // change in coords 
+
+  double sdx = (xs2 - xs1) / detArray.nDet();  // change in coords
   double sdy = (ys2 - ys1) / detArray.nDet();  // between source
-  double xs_maj = xs1 + (sdx / 2);     // put ray source in center of cell 
+  double xs_maj = xs1 + (sdx / 2);      // put ray source in center of cell
   double ys_maj = ys1 + (sdy / 2);
-  
+
   double ddx=0, ddy=0, ddx2=0, ddy2=0, ddx2_ofs=0, ddy2_ofs=0, xd_maj=0, yd_maj=0;
   double dAngleInc=0, dAngleSampleInc=0, dAngleSampleOffset=0, dAngleMajor=0;
   if (m_idGeometry == GEOMETRY_EQUIANGULAR) {
@@ -423,25 +465,23 @@ Scanner::projectSingleView (const Phantom& phm, DetectorArray& detArray, const d
     dAngleSampleOffset = dAngleSampleInc / 2;
     dAngleMajor = dDetAngle - (m_dAngularDetLen/2) + dAngleSampleOffset;
   } else {
-    ddx = (xd2 - xd1) / detArray.nDet();  // change in coords 
+    ddx = (xd2 - xd1) / detArray.nDet();  // change in coords
     ddy = (yd2 - yd1) / detArray.nDet();  // between detectors
-    ddx2 = ddx / m_nSample;    // Incr. between rays with detector cell
-    ddy2 = ddy / m_nSample;  // Doesn't include detector endpoints 
+    ddx2 = ddx / m_nSample;     // Incr. between rays with detector cell
+    ddy2 = ddy / m_nSample;  // Doesn't include detector endpoints
     ddx2_ofs = ddx2 / 2;    // offset of 1st ray from start of detector cell
     ddy2_ofs = ddy2 / 2;
-    
+
     xd_maj = xd1 + ddx2_ofs;       // Incr. between detector cells
     yd_maj = yd1 + ddy2_ofs;
   }
-  
+
   DetectorValue* detval = detArray.detValues();
-  
+
   if (phm.getComposition() == P_UNIT_PULSE) {  // put unit pulse in center of view
     for (int d = 0; d < detArray.nDet(); d++)
-      if (detArray.nDet() / 2 == d && (d % 2) == 1)
-        detval[d] = 1;
-      else
         detval[d] = 0;
+    detval[ detArray.nDet() / 2 ] = 1;
   } else {
     for (int d = 0; d < detArray.nDet(); d++) {
       double xs = xs_maj;
@@ -456,10 +496,10 @@ Scanner::projectSingleView (const Phantom& phm, DetectorArray& detArray, const d
       double sum = 0.0;
       for (unsigned int i = 0; i < m_nSample; i++) {
         if (m_idGeometry == GEOMETRY_EQUIANGULAR) {
-          xd = m_dFocalLength * cos (dAngle);
-          yd = m_dFocalLength * sin (dAngle);
+          xd = m_dCenterDetectorLength * cos (dAngle);
+          yd = m_dCenterDetectorLength * sin (dAngle);
         }
-        
+
 #ifdef HAVE_SGP
         if (m_pSGP && m_trace >= Trace::TRACE_PROJECTIONS) {
           m_pSGP->setColor (C_YELLOW);
@@ -468,14 +508,14 @@ Scanner::projectSingleView (const Phantom& phm, DetectorArray& detArray, const d
           m_pSGP->lineAbs (xd, yd);
         }
 #endif
-        
+
         sum += projectSingleLine (phm, xd, yd, xs, ys);
-        
+
 #ifdef HAVE_SGP
-        //     if (m_trace >= Trace::TRACE_CLIPPING) {
-        //       traceShowParam ("Attenuation:", "%s", PROJECTION_TRACE_ROW_ATTEN, C_LTMAGENTA, "        ");
-        //       traceShowParam ("Attenuation:", "%.3f", PROJECTION_TRACE_ROW_ATTEN, C_LTMAGENTA, sum);
-        //     }
+        //      if (m_trace >= Trace::TRACE_CLIPPING) {
+        //        traceShowParam ("Attenuation:", "%s", PROJECTION_TRACE_ROW_ATTEN, C_LTMAGENTA, "        ");
+        //        traceShowParam ("Attenuation:", "%.3f", PROJECTION_TRACE_ROW_ATTEN, C_LTMAGENTA, sum);
+        //      }
 #endif
         if (m_idGeometry == GEOMETRY_EQUIANGULAR)
           dAngle += dAngleSampleInc;
@@ -484,7 +524,7 @@ Scanner::projectSingleView (const Phantom& phm, DetectorArray& detArray, const d
           yd += ddy2;
         }
       } // for each sample in detector
-      
+
       detval[d] = sum / m_nSample;
       xs_maj += sdx;
       ys_maj += sdy;
@@ -499,22 +539,22 @@ Scanner::projectSingleView (const Phantom& phm, DetectorArray& detArray, const d
 }
 
 
-void 
+void
 Scanner::traceShowParam (const char *szLabel, const char *fmt, int row, int color, ...)
-{  
+{
   va_list arg;
   va_start(arg, color);
 #ifdef HAVE_SGP
   traceShowParamRasterOp (RO_COPY, szLabel, fmt, row, color, arg);
 #else
   traceShowParamRasterOp (0, szLabel, fmt, row, color, arg);
-#endif  
+#endif
   va_end(arg);
 }
 
-void 
+void
 Scanner::traceShowParamXOR (const char *szLabel, const char *fmt, int row, int color, ...)
-{  
+{
   va_list arg;
   va_start(arg, color);
 #ifdef HAVE_SGP
@@ -525,24 +565,35 @@ Scanner::traceShowParamXOR (const char *szLabel, const char *fmt, int row, int c
   va_end(arg);
 }
 
-void 
+void
 Scanner::traceShowParamRasterOp (int iRasterOp, const char *szLabel, const char *fmt, int row, int color, va_list args)
-{  
+{
   char szValue[256];
-  
+
   vsnprintf (szValue, sizeof(szValue), fmt, args);
-  
+
 #ifdef HAVE_SGP
   if (m_pSGP) {
     m_pSGP->setRasterOp (iRasterOp);
-    double dYPos = m_dYMaxWin - (row * m_dTextHeight);
-    m_pSGP->moveAbs (m_dXMinWin, dYPos);
     m_pSGP->setTextColor (color, -1);
-    m_pSGP->drawText (szLabel);
     double dValueOffset = (m_dXMaxWin - m_dXMinWin) / 4;
-    m_pSGP->moveAbs (m_dXMinWin + dValueOffset, dYPos);
-    m_pSGP->drawText (szValue);
-  } else 
+    if (row < 4) {
+      double dYPos = m_dYMaxWin - (row * m_dTextHeight);
+      double dXPos = m_dXMinWin;
+      m_pSGP->moveAbs (dXPos, dYPos);
+      m_pSGP->drawText (szLabel);
+      m_pSGP->moveAbs (dXPos + dValueOffset, dYPos);
+      m_pSGP->drawText (szValue);
+    } else {
+      row -= 4;
+      double dYPos = m_dYMaxWin - (row * m_dTextHeight);
+      double dXPos = m_dXMinWin + (m_dXMaxWin - m_dXMinWin) * 0.5;
+      m_pSGP->moveAbs (dXPos, dYPos);
+      m_pSGP->drawText (szLabel);
+      m_pSGP->moveAbs (dXPos + dValueOffset, dYPos);
+      m_pSGP->drawText (szValue);
+    }
+  } else
 #endif
   {
     cio_put_str (szLabel);
@@ -554,38 +605,38 @@ Scanner::traceShowParamRasterOp (int iRasterOp, const char *szLabel, const char
 
 
 /* NAME
-*    projectSingleLine                 INTERNAL: Calculates raysum along a line for a Phantom
+*    projectSingleLine                  INTERNAL: Calculates raysum along a line for a Phantom
 *
 * SYNOPSIS
 *    rsum = phm_ray_attenuation (phm, x1, y1, x2, y2)
-*    double rsum               Ray sum of Phantom along given line
-*    Phantom& phm;             Phantom from which to calculate raysum
-*    double *x1, *y1, *x2, y2  Endpoints of ray path (in Phantom coords)
+*    double rsum                Ray sum of Phantom along given line
+*    Phantom& phm;              Phantom from which to calculate raysum
+*    double *x1, *y1, *x2, y2   Endpoints of ray path (in Phantom coords)
 */
 
-double 
+double
 Scanner::projectSingleLine (const Phantom& phm, const double x1, const double y1, const double x2, const double y2)
 {
-  // check ray against each pelem in Phantom 
+  // check ray against each pelem in Phantom
   double rsum = 0.0;
   for (PElemConstIterator i = phm.listPElem().begin(); i != phm.listPElem().end(); i++)
     rsum += projectLineAgainstPElem (**i, x1, y1, x2, y2);
-  
+
   return (rsum);
 }
 
 
 /* NAME
-*   pelem_ray_attenuation              Calculate raysum of an pelem along one line
+*   pelem_ray_attenuation               Calculate raysum of an pelem along one line
 *
 * SYNOPSIS
 *   rsum = pelem_ray_attenuation (pelem, x1, y1, x2, y2)
-*   double rsum                Computed raysum
-*   PhantomElement& pelem              Pelem to scan
-*   double x1, y1, x2, y2      Endpoints of raysum line
+*   double rsum         Computed raysum
+*   PhantomElement& pelem               Pelem to scan
+*   double x1, y1, x2, y2       Endpoints of raysum line
 */
 
-double 
+double
 Scanner::projectLineAgainstPElem (const PhantomElement& pelem, double x1, double y1, double x2, double y2)
 {
   if (! pelem.clipLineWorldCoords (x1, y1, x2, y2)) {
@@ -593,7 +644,7 @@ Scanner::projectLineAgainstPElem (const PhantomElement& pelem, double x1, double
       cio_tone (1000., 0.05);
     return (0.0);
   }
-  
+
 #ifdef HAVE_SGP
   if (m_pSGP && m_trace == Trace::TRACE_CLIPPING) {
     m_pSGP->setRasterOp (RO_XOR);
@@ -605,7 +656,7 @@ Scanner::projectLineAgainstPElem (const PhantomElement& pelem, double x1, double
     m_pSGP->setRasterOp (RO_SET);
   }
 #endif
-  
+
   double len = lineLength (x1, y1, x2, y2);
   return (len * pelem.atten());
 }