r418: no message
[ctsim.git] / src / views.cpp
index 7c47aa6415671807810ac4274111fdee5f3d90de..393e5f4f37fa1f046b03141a95866cccd5f91739 100644 (file)
@@ -9,7 +9,7 @@
 **  This is part of the CTSim program
 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
 **
-**  $Id: views.cpp,v 1.52 2001/01/06 15:33:15 kevin Exp $
+**  $Id: views.cpp,v 1.66 2001/01/18 21:30:22 kevin Exp $
 **
 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
@@ -765,17 +765,18 @@ wxFrame*
 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 {
 #if CTSIM_MDI
-  wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame(theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
+  wxMDIChildFrame *subframe = new wxMDIChildFrame (theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 #else
-  wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
+  wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 #endif
-  
+  theApp->setIconForFrame (subframe);
+
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");
-  file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
-  file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
+  file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
+  file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
   
@@ -789,9 +790,9 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   file_menu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
   
   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
-  view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
-  view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
-  view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale");
+  view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
+  view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
+  view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
   
   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
@@ -839,6 +840,8 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   analyze_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
   
   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
+  help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
+  help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics\tCtrl-T");
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
   
   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
@@ -854,6 +857,19 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   
   subframe->Centre(wxBOTH);
   
+  wxAcceleratorEntry accelEntries[9];
+  accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('O'), wxID_OPEN);
+  accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('S'), wxID_SAVE);
+  accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('T'), MAINMENU_HELP_TOPICS);
+  accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('P'), MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM);
+  accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('F'), MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER);
+  accelEntries[5].Set (wxACCEL_NORMAL, WXK_F1, MAINMENU_HELP_CONTENTS);
+  accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
+  accelEntries[7].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
+  accelEntries[8].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
+  wxAcceleratorTable accelTable (9, accelEntries);
+  subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
+
   return subframe;
 }
 
@@ -1049,15 +1065,26 @@ ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
   
   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
+  ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
   int nx = rIF.nx();
   int ny = rIF.ny();
   
   if (v != NULL && yCursor < ny) {
     double* pX = new double [nx];
-    double* pY = new double [nx];
+    double* pYReal = new double [nx];
+    double *pYImag = NULL;
+    double *pYMag = NULL;
+    if (rIF.isComplex()) {
+      pYImag = new double [nx];
+      pYMag = new double [nx];
+    }
     for (int i = 0; i < nx; i++) {
       pX[i] = i;
-      pY[i] = v[i][yCursor];
+      pYReal[i] = v[i][yCursor];
+      if (rIF.isComplex()) {
+        pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
+        pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
+      }
     }
     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
     if (! pPlotDoc) {
@@ -1074,12 +1101,37 @@ ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
-      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
+      if (rIF.isComplex()) {
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
+        rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
+      } else
+        rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
       rPlotFile.addColumn (0, pX);
-      rPlotFile.addColumn (1, pY);
+      rPlotFile.addColumn (1, pYReal); 
+      if (rIF.isComplex()) {
+        rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
+        rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
+      }
+      for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
+        rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
+      os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
     }
     delete pX;
-    delete pY;
+    delete pYReal;
+    if (rIF.isComplex()) {
+      delete pYImag;
+      delete pYMag;
+    }
     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
       pPlotDoc->Modify(true);
     pPlotDoc->UpdateAllViews();
@@ -1097,15 +1149,26 @@ ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
   
   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
+  ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
   int nx = rIF.nx();
   int ny = rIF.ny();
   
   if (v != NULL && xCursor < nx) {
     double* pX = new double [ny];
-    double* pY = new double [ny];
+    double* pYReal = new double [ny];
+    double* pYImag = NULL;
+    double* pYMag = NULL;
+    if (rIF.isComplex()) {
+      pYImag = new double [ny];
+      pYMag = new double [ny];
+    }
     for (int i = 0; i < ny; i++) {
       pX[i] = i;
-      pY[i] = v[xCursor][i];
+      pYReal[i] = v[xCursor][i];
+      if (rIF.isComplex()) {
+        pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
+        pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
+      }
     }
     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
     if (! pPlotDoc) {
@@ -1122,12 +1185,37 @@ ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
-      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
+      if (rIF.isComplex()) {
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
+        rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
+      } else
+        rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
       rPlotFile.addColumn (0, pX);
-      rPlotFile.addColumn (1, pY);
+      rPlotFile.addColumn (1, pYReal); 
+      if (rIF.isComplex()) {
+        rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
+        rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
+      }
+      for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
+        rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
+      os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
     }
     delete pX;
-    delete pY;
+    delete pYReal;
+    if (rIF.isComplex()) {
+      delete pYImag;
+      delete pYMag;
+    }
     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
       pPlotDoc->Modify(true);
     pPlotDoc->UpdateAllViews();
@@ -1195,19 +1283,25 @@ ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 2");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("color 3");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
+       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
+       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
-      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
+      rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
       rPlotFile.addColumn (0, pX);
       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
+      for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
+        rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
+      os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
     }
     delete pX;
     delete pYReal;
@@ -1232,16 +1326,46 @@ ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
   
   const ImageFile& rIF = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(GetDocument())->getImageFile();
   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
+  ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
   int nx = rIF.nx();
   int ny = rIF.ny();
   
   if (v != NULL && xCursor < nx) {
+    fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
+    double *pdTemp = new double [ny];
+
+    int i;
+    for (i = 0; i < ny; i++)
+      pdTemp[i] = v[xCursor][i];
+    Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
+    for (i = 0; i < ny; i++) 
+      pcIn[i].re = pdTemp[i];
+
+    for (i = 0; i < ny; i++) {
+      if (rIF.isComplex())
+        pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
+      else
+      pdTemp[i] = 0;
+    }
+    Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
+    for (i = 0; i < ny; i++)
+      pcIn[i].im = pdTemp[i];
+
+    fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
+    fftw_one (plan, pcIn, NULL);
+    fftw_destroy_plan (plan);
+
     double* pX = new double [ny];
-    double* pY = new double [ny];
-    for (int i = 0; i < ny; i++) {
+    double* pYReal = new double [ny];
+    double* pYImag = new double [ny];
+    double* pYMag = new double [ny];
+    for (i = 0; i < ny; i++) {
       pX[i] = i;
-      pY[i] = v[xCursor][i];
+      pYReal[i] = pcIn[i].re;
+      pYImag[i] = pcIn[i].im;
+      pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
     }
+
     PlotFileDocument* pPlotDoc = dynamic_cast<PlotFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.plt", wxDOC_SILENT));
     if (! pPlotDoc) {
       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
@@ -1252,17 +1376,38 @@ ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
       std::string title("title ");
       title += os.str();
       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
-      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
+       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
+       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
-      rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
+      rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
       rPlotFile.addColumn (0, pX);
-      rPlotFile.addColumn (1, pY);
+      rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
+      rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
+      rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
+      for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
+        rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
+      os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+      rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
     }
     delete pX;
-    delete pY;
+    delete pYReal;
+    delete pYImag;
+    delete pYMag;
+    delete pdTemp;
+    delete [] pcIn;
+
     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
       pPlotDoc->Modify(true);
     pPlotDoc->UpdateAllViews();
@@ -1326,10 +1471,28 @@ ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
-        rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
+        rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
         rPlotFile.addColumn (0, pX);
         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
+
+        unsigned int iL;
+        for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
+          std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+          s += ": ";
+          s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
+          rPlotFile.addDescription (s.c_str());
+        }
+        for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
+          std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+          s += ": ";
+          s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
+          rPlotFile.addDescription (s.c_str());
+        }
+        os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
+          << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+        *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+        rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
       }
       delete pX;
       delete pY1;
@@ -1399,10 +1562,27 @@ ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
-        rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
+        rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
         rPlotFile.addColumn (0, pX);
         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
+        unsigned int iL;
+        for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
+          std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+          s += ": ";
+          s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
+          rPlotFile.addDescription (s.c_str());
+        }
+        for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
+          std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+          s += ": ";
+          s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
+          rPlotFile.addDescription (s.c_str());
+        }
+        os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
+          << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+        *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+        rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
       }
       delete pX;
       delete pY1;
@@ -1458,9 +1638,18 @@ ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
     rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
     rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
     rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
-    rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
+    rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
     rPlotFile.addColumn (0, pX);
     rPlotFile.addColumn (1, pY);
+    for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
+      std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+      s += ": ";
+      s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
+      rPlotFile.addDescription (s.c_str());
+    }
+    os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
+    *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
+    rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
     delete pX;
     delete pY;
     if (theApp->getSetModifyNewDocs())
@@ -1695,6 +1884,7 @@ PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 #else
   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(256, 256), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 #endif
+  theApp->setIconForFrame (subframe);
 
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
@@ -1718,6 +1908,7 @@ PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   
   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
+  help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics");
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
   
   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
@@ -1974,11 +2165,6 @@ ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
       imageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
       
-      if (m_iDefaultFilterMethod != ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION && m_iDefaultFilterGeneration == ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT && rProj.geometry() != Scanner::GEOMETRY_PARALLEL) {
-        wxMessageBox ("Sorry!\nCurrently, frequency-based filtering with direct filter generation is not support for geometries other than parallel.\nAborting command.", "Not Supported", wxOK | wxICON_WARNING, m_frame);
-        return;
-      }
-
       Reconstructor* pReconstruct = new Reconstructor (rProj, imageFile, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
 
       Timer timerRecon;
@@ -2055,6 +2241,7 @@ ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 #else
   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 #endif
+  theApp->setIconForFrame (subframe);
 
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
@@ -2083,7 +2270,7 @@ ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 
   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
-  help_menu->AppendSeparator();
+  help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics");
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
   
   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
@@ -2251,7 +2438,7 @@ PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
   std::ostringstream os;
   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
-  rPlot.printHeaders (os);
+  rPlot.printHeadersBrief (os);
   *theApp->getLog() << os.str().c_str();
   wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
   dialogMsg.ShowModal();
@@ -2343,6 +2530,7 @@ PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 #else
   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 #endif
+  theApp->setIconForFrame (subframe);
 
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
@@ -2368,7 +2556,7 @@ PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   
   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents");
-  help_menu->AppendSeparator();
+  help_menu->Append(MAINMENU_HELP_TOPICS, "&Topics");
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
   
   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;