r326: FFTW additions, filter image generation
[ctsim.git] / src / views.cpp
index 740c81c03615fca0236f43947be4c453041d817c..93d49b336da6917fd89d3ffce46677b70a07754b 100644 (file)
@@ -9,7 +9,7 @@
 **  This is part of the CTSim program
 **  Copyright (C) 1983-2000 Kevin Rosenberg
 **
-**  $Id: views.cpp,v 1.36 2000/12/22 04:18:00 kevin Exp $
+**  $Id: views.cpp,v 1.43 2001/01/01 10:14:34 kevin Exp $
 **
 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
@@ -87,13 +87,13 @@ void
 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)\r
 {\r
   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
-  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
   int nx = rIF.nx();\r
   int ny = rIF.ny();\r
   \r
+  int yPt = ny - y - 1;\r
   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);\r
   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);\r
-  dc.DrawLine (0, y, nx, y);\r
+  dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);\r
   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);\r
   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);\r
 }\r
@@ -121,38 +121,42 @@ ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
   
   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
   \r
+  const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
+  ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
+  int nx = rIF.nx();\r
+  int ny = rIF.ny();\r
+  const int yPt = ny - 1 - pt.y;\r
   if (event.RightIsDown()) {\r
-    const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
-    ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
-    int nx = rIF.nx();\r
-    int ny = rIF.ny();\r
-    \r
     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {\r
       std::ostringstream os;\r
-      os << "Image value (" << pt.x << "," << pt.y << ") = " << v[pt.x][ny - 1 - pt.y] << "\n";\r
+      os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];\r
+      if (rIF.isComplex()) {\r
+        double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];\r
+        if (dImag < 0)\r
+          os << " - " << -dImag;\r
+        else\r
+          os << " + " << dImag;\r
+        os << "i\n";\r
+      } else\r
+        os << "\n";\r
       *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
     } else\r
-      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << pt.y << ")\n";\r
+      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";\r
   }\r
-  else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp()) {\r
-    const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();\r
-    ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();\r
-    int nx = rIF.nx();\r
-    int ny = rIF.ny();\r
-    \r
+  else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {\r
     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {\r
       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {\r
         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);\r
       }\r
-      DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, pt.y);\r
+      DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);\r
       m_xCursor = pt.x;\r
-      m_yCursor = pt.y;\r
+      m_yCursor = yPt;\r
     } else\r
-      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << pt.y << ")\n";\r
+      *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";\r
   }\r
   if (event.LeftUp()) {\r
     std::ostringstream os;\r
-    os << "Selected column" << pt.x << " and row" << pt.y << "\n";\r
+    os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";\r
     *theApp->getLog() << os.str().c_str();\r
   }\r
 }
@@ -168,6 +172,19 @@ EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)\r
 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)\r
 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_LOG, ImageFileView::OnLog)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_EXP, ImageFileView::OnExp)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)\r
+#ifdef HAVE_FFTW\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_FFT, ImageFileView::OnFFT)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)\r
+#endif\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)\r
+EVT_MENU(IFMENU_PROCESS_PHASE, ImageFileView::OnPhase)\r
 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)\r
 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)\r
 END_EVENT_TABLE()
@@ -184,15 +201,26 @@ ImageFileView::~ImageFileView(void)
 void
 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 {
-  double min, max, mean, mode, median, stddev;
   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
   else {
     const std::string& rFilename = rIF.getFilename();
-    rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
     std::ostringstream os;
-    os << "file: " << rFilename << "\nmin: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
+    double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
+    rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);\r
+    os << "Filename: " << rFilename << "\n";\r
+    os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";\r
+    os << "Data type: ";\r
+    if (rIF.isComplex())\r
+      os << "Complex\n";\r
+    else\r
+      os << "Real\n";\r
+    os << "\nMinimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
+    if (rIF.isComplex()) {\r
+      rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);\r
+      os << "\nImaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";\r
+    }\r
     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
     wxMessageDialog dialogMsg (m_frame, os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
     dialogMsg.ShowModal();
@@ -249,22 +277,22 @@ ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 {\r
   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;\r
   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);\r
-\r
+  \r
   if (vecIF.size() == 0) {\r
     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");\r
   } else {\r
     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(m_frame, "Get Comparison Image", vecIF, true);\r
-\r
+    \r
     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
-      ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+      ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();\r
       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();\r
       std::ostringstream os;\r
       double min, max, mean, mode, median, stddev;\r
       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);\r
       os << rIF.getFilename() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";\r
       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);\r
-      os << rCompareIF.getFilename() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";\r
+      os << pCompareDoc->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";\r
       os << "\n";\r
       double d, r, e;\r
       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);\r
@@ -277,14 +305,15 @@ ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
           return;\r
         }\r
         ImageFile& differenceImage = pDifferenceDoc->getImageFile();\r
-      \r
+        \r
         differenceImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());\r
         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, differenceImage)) {\r
           pDifferenceDoc->DeleteAllViews();\r
           return;\r
         }\r
-\r
-        pDifferenceDoc->Modify(true);\r
+        \r
+        if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+          pDifferenceDoc->Modify(true);\r
         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);\r
         pDifferenceDoc->GetFirstView()->OnUpdate (this, NULL);\r
       }\r
@@ -293,6 +322,135 @@ ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
   }\r
 }
 
+void\r
+ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  rIF.invertPixelValues (rIF);\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  rIF.square (rIF);\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  rIF.sqrt (rIF);\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  rIF.log (rIF);\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  rIF.exp (rIF);\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
+  rIF.fourier (rIF);\r
+  m_bMinSpecified = false;\r
+  m_bMaxSpecified = false;\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+#ifdef HAVE_FFTW\r
+void\r
+ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("FFT"), wxString("FFT Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
+  rIF.fft (rIF);\r
+  m_bMinSpecified = false;\r
+  m_bMaxSpecified = false;\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("IFFT"), wxString("IFFT Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
+  rIF.ifft (rIF);\r
+  m_bMinSpecified = false;\r
+  m_bMaxSpecified = false;\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+#endif\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, m_frame, wxPD_APP_MODAL);\r
+  rIF.inverseFourier (rIF);\r
+  m_bMinSpecified = false;\r
+  m_bMaxSpecified = false;\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  rIF.magnitude (rIF);\r
+  m_bMinSpecified = false;\r
+  m_bMaxSpecified = false;\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+void\r
+ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)\r
+{\r
+  ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();\r
+  rIF.phase (rIF);\r
+  m_bMinSpecified = false;\r
+  m_bMaxSpecified = false;\r
+  if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+    GetDocument()->Modify(TRUE);\r
+  GetDocument()->UpdateAllViews(this);\r
+}\r
+\r
+\r
 ImageFileCanvas* 
 ImageFileView::CreateCanvas (wxView *view, wxFrame *parent)
 {
@@ -316,7 +474,8 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
-  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");\r
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
@@ -334,6 +493,25 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...");
   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...");
   \r
+  wxMenu* process_menu = new wxMenu;\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_INVERTVALUES, "&Invert Values");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_SQUARE, "&Square");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_SQRT, "Square &Root");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_LOG, "&Log");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_EXP, "&Exp");\r
+  process_menu->AppendSeparator();\r
+#ifdef HAVE_FFTW\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_FFT, "&FFT");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_IFFT, "&IFFT");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_FOURIER, "F&ourier");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_INVERSE_FOURIER, "Inverse Fo&urier");\r
+#else\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_FOURIER, "&Fourier");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");\r
+#endif\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_MAGNITUDE, "&Magnitude");\r
+  process_menu->Append (IFMENU_PROCESS_PHASE, "&Phase");\r
+\r
   wxMenu *plot_menu = new wxMenu;\r
   plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");\r
   plot_menu->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");\r
@@ -342,7 +520,7 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");\r
   compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");\r
   compare_menu->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");\r
-\r
+  \r
   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
   
@@ -350,7 +528,8 @@ ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   
   menu_bar->Append(file_menu, "&File");
   menu_bar->Append(view_menu, "&View");\r
-  menu_bar->Append(plot_menu, "&Plot");\r
+  menu_bar->Append(process_menu, "&Process");\r
+  menu_bar->Append(plot_menu, "P&lot");\r
   menu_bar->Append(compare_menu, "&Compare");
   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
   
@@ -493,20 +672,26 @@ ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
     } else {\r
       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-      std::ostringstream title;\r
-      title << "Row " << yCursor;\r
-      rPlotFile.setTitle(title.str());\r
-      rPlotFile.setXLabel("Column");\r
-      rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
+      std::ostringstream os;\r
+      os << "Row " << yCursor;\r
+      std::string title("title ");\r
+      title += os.str();\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);\r
       rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
       rPlotFile.addColumn (1, pY);\r
     }\r
     delete pX;\r
     delete pY;\r
-    pPlotDoc->Modify(true);\r
+    if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+      pPlotDoc->Modify(true);\r
+    pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
   }\r
-  \r
 }\r
 
 void\r
@@ -535,18 +720,25 @@ ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
     } else {\r
       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-      std::ostringstream title;\r
-      title << "Column " << xCursor;\r
-      rPlotFile.setTitle(title.str());\r
-      rPlotFile.setXLabel("Row");\r
-      rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
+      std::ostringstream os;\r
+      os << "Column " << xCursor;\r
+      std::string title("title ");\r
+      title += os.str();\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
+      rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
       rPlotFile.setCurveSize (2, nx);\r
       rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
       rPlotFile.addColumn (1, pY);\r
     }\r
     delete pX;\r
     delete pY;\r
-    pPlotDoc->Modify(true);\r
+    if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+      pPlotDoc->Modify(true);\r
+    pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
   }\r
 }\r
 \r
@@ -561,7 +753,10 @@ ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
   \r
   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;\r
   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);\r
-  \r
+  if (vecIFDoc.size() == 0) {\r
+    wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");\r
+    return;\r
+  }\r
   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);\r
   \r
   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
@@ -588,11 +783,21 @@ ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
       } else {\r
         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-        std::ostringstream title;\r
-        title << "Comparison of Column " << xCursor;\r
-        rPlotFile.setTitle(title.str());\r
-        rPlotFile.setXLabel("Row");\r
-        rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
+        std::ostringstream os;\r
+        os << "Column " << xCursor << " Comparison";\r
+        std::string title("title ");\r
+        title += os.str();\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);\r
         rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
         rPlotFile.addColumn (1, pY1);\r
@@ -601,7 +806,9 @@ ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
       delete pX;\r
       delete pY1;\r
       delete pY2;\r
-      pPlotDoc->Modify(true);\r
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+        pPlotDoc->Modify(true);\r
+      pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
     }\r
   }\r
 }\r
@@ -618,6 +825,11 @@ ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;\r
   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);\r
   \r
+  if (vecIFDoc.size() == 0) {\r
+    wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");\r
+    return;\r
+  }\r
+  \r
   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (m_frame, "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);\r
   \r
   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {\r
@@ -644,11 +856,21 @@ ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");\r
       } else {\r
         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();\r
-        std::ostringstream title;\r
-        title << "Comparison of Row " << yCursor;\r
-        rPlotFile.setTitle(title.str());\r
-        rPlotFile.setXLabel("Column");\r
-        rPlotFile.setYLabel("Pixel Value");\r
+        std::ostringstream os;\r
+        os << "Row " << yCursor << " Comparison";\r
+        std::string title("title ");\r
+        title += os.str();\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("box");\r
+        rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");\r
         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);\r
         rPlotFile.addColumn (0, pX);\r
         rPlotFile.addColumn (1, pY1);\r
@@ -657,7 +879,9 @@ ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
       delete pX;\r
       delete pY1;\r
       delete pY2;\r
-      pPlotDoc->Modify(true);\r
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+        pPlotDoc->Modify(true);\r
+      pPlotDoc->UpdateAllViews();\r
     }\r
   }\r
 }\r
@@ -800,7 +1024,8 @@ PhantomView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
         theApp->getDocManager()->ActivateView (pView, true, false);
       }
       ::wxYield();
-      pProjectionDoc->Modify(true);
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+        pProjectionDoc->Modify(true);
       pProjectionDoc->UpdateAllViews(this);
     }
   }
@@ -836,7 +1061,8 @@ PhantomView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
           return;
         }
       }
-      pRasterDoc->Modify(true);
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+        pRasterDoc->Modify(true);
       pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pRasterDoc->GetFirstView());\r
       if (rasterView) {\r
@@ -875,6 +1101,7 @@ PhantomView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
   file_menu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
   
@@ -1060,7 +1287,7 @@ ProjectionFileView::OnReconstruct (wxCommandEvent& event)
     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
       ImageFileDocument* pReconDoc = dynamic_cast<ImageFileDocument*>(theApp->getDocManager()->CreateDocument("untitled.if", wxDOC_SILENT));\r
-      if (pReconDoc) {\r
+      if (pReconDoc) {\r
         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");\r
         return;\r
       }
@@ -1122,7 +1349,8 @@ ProjectionFileView::OnReconstruct (wxCommandEvent& event)
         }
       }
       delete pReconstruct;
-      pReconDoc->Modify(true);
+      if (theApp->getSetModifyNewDocs())\r
+        pReconDoc->Modify(true);
       pReconDoc->UpdateAllViews(this);
       ImageFileView* rasterView = dynamic_cast<ImageFileView*>(pReconDoc->GetFirstView());\r
       if (rasterView) {\r
@@ -1163,6 +1391,7 @@ ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
@@ -1329,12 +1558,14 @@ EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
 END_EVENT_TABLE()
 
 PlotFileView::PlotFileView(void) 
-: wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL)
+: wxView(), m_canvas(NULL), m_frame(NULL), m_pEZPlot(NULL)
 {
 }
 
 PlotFileView::~PlotFileView(void)
-{
+{\r
+  if (m_pEZPlot)\r
+    delete m_pEZPlot;
 }
 
 void
@@ -1423,6 +1654,7 @@ PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
   wxMenu *file_menu = new wxMenu;
   
   file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...");
+  file_menu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...");\r
   file_menu->Append(wxID_OPEN, "&Open...");
   file_menu->Append(wxID_SAVE, "&Save");
   file_menu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
@@ -1460,7 +1692,7 @@ PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 
 
 bool 
-PlotFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
+PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 {
   m_frame = CreateChildFrame(doc, this);
   SetFrame(m_frame);
@@ -1482,7 +1714,7 @@ PlotFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
   
   m_frame->Show(true);
   Activate(true);
-  
+   
   return true;
 }
 
@@ -1498,62 +1730,58 @@ PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
     m_canvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);\r
     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);\r
     SGP sgp (driver);\r
-    const PlotFile& rPhantom = GetDocument()->getPlotFile();\r
-    EZPlot plot (sgp);\r
-    \r
-    if (! rPlotFile.getTitle().empty()) {\r
-      std::string s("title ");\r
-      s += rPlotFile.getTitle();\r
-      plot.ezset (s);\r
-    }\r
-    if (! rPlotFile.getXLabel().empty()) {\r
-      std::string s("xlabel ");\r
-      s += rPlotFile.getXLabel();\r
-      plot.ezset (s);\r
-    }\r
-    if (! rPlotFile.getYLabel().empty()) {\r
-      std::string s("ylabel ");\r
-      s += rPlotFile.getYLabel();\r
-      plot.ezset (s);\r
-    }\r
-    \r
-    if (m_bMinSpecified) {\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "ymin " << m_dMinPixel;\r
-      plot.ezset (os.str());\r
-    }\r
-    \r
-    if (m_bMaxSpecified) {\r
-      std::ostringstream os;\r
-      os << "ymax " << m_dMaxPixel;\r
-      plot.ezset (os.str());\r
-    }\r
-    \r
-    plot.ezset("box");\r
-    plot.ezset("grid");\r
-    \r
-    double* pdXaxis = new double [iNRecords];\r
-    rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);\r
-    \r
-    double* pdY = new double [iNRecords];\r
-    for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {\r
-      rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);\r
-      plot.addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);\r
-    }\r
-    \r
-    delete pdXaxis;\r
-    delete pdY;\r
-    \r
-    plot.plot();\r
+    if (m_pEZPlot)\r
+      m_pEZPlot->plot (&sgp);\r
   }\r
 }
 
 
 void 
-PlotFileView::OnUpdate(wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
+PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 {
-  if (m_canvas)
-    m_canvas->Refresh();
+  if (m_canvas) {
+    const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();\r
+    const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();\r
+    const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();\r
+    \r
+    if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {\r
+      if (m_pEZPlot)\r
+        delete m_pEZPlot;\r
+      m_pEZPlot = new EZPlot;\r
+      \r
+      for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)\r
+        m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));\r
+      \r
+      if (m_bMinSpecified) {\r
+        std::ostringstream os;\r
+        os << "ymin " << m_dMinPixel;\r
+        m_pEZPlot->ezset (os.str());\r
+      }\r
+      \r
+      if (m_bMaxSpecified) {\r
+        std::ostringstream os;\r
+        os << "ymax " << m_dMaxPixel;\r
+        m_pEZPlot->ezset (os.str());\r
+      }\r
+      \r
+      m_pEZPlot->ezset("box");\r
+      m_pEZPlot->ezset("grid");\r
+      \r
+      double* pdXaxis = new double [iNRecords];\r
+      rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);\r
+      \r
+      double* pdY = new double [iNRecords];\r
+      for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {\r
+        rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);\r
+        m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);\r
+      }\r
+      \r
+      delete pdXaxis;\r
+      delete pdY;\r
+    }\r
+    \r
+    m_canvas->Refresh();\r
+  }
 }
 
 bool