Exclude examples b7 and b11 from regression as use random number generator. Add PERFE...
[snark14.git] / examples / b13 / b13.in
1 ********EXAMPLE 7
2 * MAP EM ALGORITHM FOR EMISSION TOMOGRAPHY.  RECONSTRUCTION OF BRAIN
3 * PHANTOM. SIMULATING PET GEOMETRY WITH A RING OF 300 DETECTORS WITH
4 * EACH DETECTOR IN COINCIDENCE WITH 101 DETECTORS OPPOSITE IT.
5 * COEFFICIENT OF PENALTLY TERM IS SET TO 10.0
6 *
7 CREATE
8 EXAMPLE 7 Brain Phantom 
9 SPECTRUM MONOCHROMATIC 511
10 OBJECTS
11    1 elip   -7.0   46.0   3.0   6.0   17.0  0.95  1.0
12    2 elip    7.0   46.0   3.0   6.0  -17.0  1.0   0.95
13    3 rect  -12.0   64.0   7.5   4.5    5.0  1.0   1.0
14    4 rect   12.0   64.0   7.5   4.5   -5.0  0.95  0.95
15    5 rect  -38.0   51.0   3.5  13.0  -39.0  0.95  1.0
16    6 rect   38.0   51.0   3.5  13.0   39.0  1.0   0.95
17    7 rect  -46.0   24.0   6.5   6.0  -18.0  0.95  1.0
18    8 rect   46.0   24.0   6.5   6.0   18.0  1.0   0.95
19    9 rect  -49.0    6.0   2.5  10.0   63.0  1.0   1.0
20   10 rect   49.0    6.0   2.5  10.0  -63.0  0.95  0.95
21   11 rect  -52.0  -14.0   9.0   7.0  -14.0  0.95  1.0
22   12 rect   52.0  -14.0   9.0   7.0   14.0  1.0   0.95
23   13 rect  -10.0  -56.0   5.5  10.0   -1.0  0.95  1.0
24   14 rect   10.0  -56.0   5.5  10.0    1.0  1.0   0.95
25   15 elip  -40.0  -47.0   9.0  22.5   48.0  1.0   1.0
26   16 elip   40.0  -47.0   9.0  22.5  -48.0  0.95  0.95
27   17 elip   -8.0  -22.0   3.5  15.5   -9.0  1.0   1.0
28   18 elip    8.0  -22.0   3.5  15.5    9.0  0.95  0.95
29   19 elip  -27.0   -6.0   5.5  23.5   -5.0  0.95  1.0
30   20 elip   27.0   -6.0   5.5  23.5    5.0  1.0   0.95
31   21 elip  -25.0   38.0   6.5  10.5  -14.0  1.0   1.0
32   22 elip   25.0   38.0   6.5  10.5   14.0  0.95  0.95
33   23 rect   -8.0   32.0   1.5   6.5   38.0  1.0   1.0
34   24 rect    8.0   32.0   1.5   6.5  -38.0  0.95  0.95
35   25 rect   -8.0    3.0   1.0   9.0  -33.0  0.95  1.0
36   26 rect    8.0    3.0   1.0   9.0   33.0  1.0   0.95
37   27 elip    0.0    0.0  66.5  74.0    0.0  1.0   1.0
38 LAST .51    1   0.05  
39 PHANTOM AVERAGE 7
40 95 PIXELS OF SIZE 1.6
41 RAYSUM AVERAGE 1
42 1
43 GEOMETRY
44 divergent arc 153 306
45 RAYS USER 101 DETECTOR SPACING 3.2
46 ANGLES 300 EQUAL SPACING
47 0.0 358.8
48 MEASUREMENT PERFECT
49 BACKGROUND 0.0
50 RUN
51 *
52 PICTURE TEST
53 *
54 PROJECTION REAL
55 *
56 STOP ITERATION 20
57 *
58 EXECUTE AVERAGE EMAP
59 Example 7 Illustrating the MAP EM algorithm for PET
60 gamma is 10.0 EVAL
61 *
62 END