ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
   4         registry storage between executions.
   5
   6         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default
   7
   8         * ctsim: Added graphical About box
   9
  10         * ctsim: Escape key now removes cursor from image files
  11
  12         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  13
  14         * ctsim: Online help added as well as HTML help
  15
  16         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  17
  18         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  19         reconstruction dialogs.
  20
  21         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  22
  23         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  24
  25         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  26
  27 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  28
  29         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  30         procsignal.cpp
  31
  32         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  33         bug in parsing command-line parameters.
  34
  35         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  36         plotfiles
  37
  38         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  39
  40         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  41
  42         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  43         for frequency/inverse-fourier filtering
  44
  45 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  46
  47         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  48
  49         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  50         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  51
  52         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  53         for math tips]
  54
  55         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  56
  57         * ctsim: Added more analyze menuitems
  58
  59         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  60         through this master shell. Has both command-line and interactive
  61         interface
  62
  63         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  64
  65         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  66
  67         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  68
  69 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  70
  71         * ctsim: Added plotting of histograms
  72
  73         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  74
  75         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  76
  77 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  78
  79         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  80
  81         * ctsim: added generation of filter images
  82
  83         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  84
  85         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  86
  87         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  88
  89         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  90         text files suitable for reading.
  91
  92         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  93         when performing properties of images.
  94
  95         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  96         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  97         fourier.cpp
  98
  99         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 100         image math functions to complex-valued math.
 101
 102         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 103
 104 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 105
 106         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 107         and column plots and comparison plots
 108
 109         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 110
 111         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 112
 113         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 114         files.
 115
 116         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 117         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 118         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 119
 120         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 121         imagefile and plotfile classes.
 122
 123         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 124         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 125         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 126         images.
 127
 128         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 129         images.
 130
 131         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 132         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 133
 134         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 135         math functions
 136
 137         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 138
 139         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 140         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 141         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 142
 143         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 144         class.
 145
 146         * sgp: Added linestyle settings
 147
 148 2.5.0 - 12/18/00
 149    First Microsoft Windows GUI version
 150    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 151    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 152         when manually compiling phantoms that vary during projection
 153         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 154    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 155    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 156    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 157    Fixed display of plotting in Projection views
 158    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 159    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 160         "namespace using std" statements
 161    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 162    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 163
 164 2.0.6 - 12/03/00
 165    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 166    Updated README file
 167    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 168    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 169
 170 2.0.5 - 12/01/00
 171    Improved compilation on RedHat 7
 172    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 173    Removed README.RedHat7
 174
 175 2.0.4 - 11/25/00
 176    Added documentation for --geometry setting
 177    Added README.RedHat7 document
 178
 179 2.0.3 - 11/20/00
 180    Fixed bug in generation of binary PGM files
 181    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 182    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 183
 184 2.0.2 - 11/8/00
 185    Additions to man pages (Ian Kay)
 186    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 187
 188 2.0.1 - 10/1/00
 189    Fixed syntax error in fftw configuration
 190    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 191
 192 2.0.0 - 9/7/00
 193    Version 2.0.0 released!
 194    ctsim: Added Window menu to Main frame
 195    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 196    Fixed obscure bug in sys_error
 197    Fixed compilation in mingw environment not present
 198    Fixed compilation in non-graphical environments
 199
 200 2.0.0-b12 - 9/4/00
 201    ctsim: Added animation of reconstruction
 202    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 203    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 204    ctsim: used setpriority to set lower priority
 205    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 206    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 207
 208 2.0.0-b11 - 9/1/00
 209    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 210    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 211    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 212    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 213    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 214    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 215    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 216    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 217    Separated reconstruction into Reconstructor class
 218    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 219    Added --enable-static to generate statically linked programs
 220
 221 2.0.0-b10 - 8/25/00
 222    ctsim: Added animation of projection collection processs
 223    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 224    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 225    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 226    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 227    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 228    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 229    Fixed bug in backprojection selection
 230
 231 2.0.0-b9 - 8/22/00
 232    Added RCS Id strings to executable files
 233    Added RPM Spec file for RPM package creation
 234    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 235    Fixed compilation for non-SGP architectures
 236    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 237    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 238         inverse_fourier construction of filters
 239    Added median to statistics and to auto-windowing
 240
 241 2.0.0-b8 - 8/1/00
 242    Added line color support to SGP
 243    Fixed lineAbs bug
 244
 245 2.0.0-b7 - 7/25/00
 246    Finished support for dmallocxx library
 247    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 248    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 249         G2 windows and well as WXWindows.
 250    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 251    Fixed row-plot bug in if-2
 252    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 253
 254 2.0.0-b6 - 7/22/00
 255    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 256         and projection files
 257    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 258         and reconstruction parameters dialogs
 259    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 260    Completely reorganized option processing in classes to improve
 261         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 262
 263 2.0.0-b5 - 7/17/00
 264    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 265    Started ctsim.tex document file
 266
 267 2.0.0-b4 - 7/13/00
 268    Fixed compiler warnings at -Wall level
 269    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 270    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 271    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 272
 273 2.0.0-b3 - 7/10/00
 274    Added highly optimized backprojection method idiff3
 275    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 276    Fixed image display in if2img using G2 library
 277    Added column-plot and row-plot options to if-2
 278    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 279    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 280         backprojection method. Currently, this technique is still under
 281         development and debugging
 282    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 283
 284 2.0.0-b2 - 7/07/00
 285    Cleaned up SignalFilter class
 286    Added zeropad option to pjrec
 287    Added zeropad options to html and cgi files
 288    Added fourier_table and rfttw filter methods
 289    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 290
 291 2.0.0-b1 - 7/05/00
 292    Updated trace level processing
 293    Added trace level to SignalFilter
 294    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 295
 296 1.9.9 - 7/04/00
 297    Fixed const issue with ImageFileArray
 298    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 299    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 300    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 301    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 302    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 303         between convolution, dft, & fft filtering
 304    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 305    Added support for FFTW library
 306
 307 1.9.8 - 6/27/2000
 308    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 309    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 310    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 311    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 312    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 313    Added signature tag and creation date/time to projection files
 314
 315 1.9.7 - 6/25/2000
 316    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 317         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 318         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 319    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 320    Rewrote ImageFile class
 321    Started support for dmallocxx library, not finished
 322    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 323    Updated ifinfo to show comparative statistics
 324    Added printLabels() to Array2dFile class
 325    Added printStatistics() to ImageFile class
 326
 327 1.9.6 - 6/22/2000
 328    Moved conversion filter name/id to Filter class
 329    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 330    Added MPI broadcasting of strings
 331
 332 1.9.5 - 6/21/2000
 333    Merged proj_reconstr into class Projections
 334    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 335    Code cleanup in projections.cpp
 336    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 337
 338 1.9.4 - 6/20/2000
 339    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 340    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 341    Converted filter and convolution to object-oriented code
 342    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 343    Optimized image file writing on little-endian architectures
 344    Updated README and INSTALL
 345
 346 1.9.3 - 6/19/2000
 347    Reorganized source files
 348    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 349
 350 1.9.2 - 6/18/2000
 351    Reorganized include files
 352    Fixed const pointers in strfuncs
 353
 354 1.9.1 - 6/16/2000
 355    Renamed directories, moved source files, combined source files
 356    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 357    and libctgraphics)
 358
 359 1.9.0 - 6/15/2000
 360    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 361    Renamed Raysums to Projections throughout files
 362    Renamed Detector to Scanner
 363    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 364
 365 0.6.1 - 6/12/2000
 366    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 367    Converted Detector to Object-Oriented
 368
 369 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 370    Improved Integer backprojection method
 371         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 372         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 373    Finished converting all C files to C++
 374    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 375    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 376
 377 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 378    Converted MPI data structures to C++ object
 379    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 380
 381 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 382    First C++ conversions
 383    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 384         - Now all data files are cross-platform compatible
 385    Converted from MPI to MPI++
 386    Converted backprojection to object-oriented
 387    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 388
 389 0.5.4 - 6/4/2000
 390    Simpilifed endian handling
 391
 392 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 393    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 394    Removed broken B-spline interpolation
 395    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 396    Added support for 16-bit PNG graphics
 397
 398 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 399    Added compile-time configuration of endian order
 400
 401 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 402    Modified the raysum file format to be platform independent
 403
 404 0.5.3 - 5/11/2000
 405    Added Microsoft VC compatibility
 406    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 407
 408 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 409    Continued conversion to ANSI C
 410    Removed old CRT routines
 411
 412 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 413    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 414    Continued code cleanup
 415
 416 0.5.2-b3 - 4/30/200
 417     More code cleanup with reorganizing libraries
 418     Added --log and --exp to sdf-1
 419     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 420
 421 0.5.2-b2 - 4/30/200
 422     Continued code cleanup
 423
 424 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 425     Fixed a few MPI bugs
 426     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 427
 428 0.5.1 - 4/28/2000
 429     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 430     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 431
 432 0.5.0 - 4/27/2000
 433     First open source distribution for GNU/Linux
 434
 435 6/1999
 436   Converted to GNU/Linux
 437   added MPI support via LAM library
 438
 439 1983-84
 440   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 441