ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Fixed initialization of min/max for PlotFiles
   4
   5         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
   6
   7         * ctsim: Add convert projections to polar plot
   8
   9         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  10
  11         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  12
  13 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  14
  15         * ctsim: Added plotting of histograms
  16
  17         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  18
  19         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  20
  21 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  22
  23         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  24
  25         * ctsim: added generation of filter images
  26
  27         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  28
  29         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  30
  31         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  32
  33         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  34         text files suitable for reading.
  35
  36         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  37         when performing properties of images.
  38
  39         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  40         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  41         fourier.cpp
  42
  43         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  44         image math functions to complex-valued math.
  45
  46         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  47
  48 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  49
  50         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  51         and column plots and comparison plots
  52
  53         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  54
  55         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  56
  57         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  58         files.
  59
  60         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  61         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  62         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  63
  64         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  65         imagefile and plotfile classes.
  66
  67         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  68         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  69         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  70         images.
  71
  72         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  73         images.
  74
  75         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  76         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  77
  78         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  79         math functions
  80
  81         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  82
  83         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  84         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  85         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  86
  87         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  88         class.
  89
  90         * sgp: Added linestyle settings
  91
  92 2.5.0 - 12/18/00
  93    First Microsoft Windows GUI version
  94    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  95    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  96         when manually compiling phantoms that vary during projection
  97         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  98    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  99    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 100    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 101    Fixed display of plotting in Projection views
 102    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 103    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 104         "namespace using std" statements
 105    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 106    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 107
 108 2.0.6 - 12/03/00
 109    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 110    Updated README file
 111    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 112    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 113
 114 2.0.5 - 12/01/00
 115    Improved compilation on RedHat 7
 116    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 117    Removed README.RedHat7
 118
 119 2.0.4 - 11/25/00
 120    Added documentation for --geometry setting
 121    Added README.RedHat7 document
 122
 123 2.0.3 - 11/20/00
 124    Fixed bug in generation of binary PGM files
 125    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 126    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 127
 128 2.0.2 - 11/8/00
 129    Additions to man pages (Ian Kay)
 130    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 131
 132 2.0.1 - 10/1/00
 133    Fixed syntax error in fftw configuration
 134    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 135
 136 2.0.0 - 9/7/00
 137    Version 2.0.0 released!
 138    ctsim: Added Window menu to Main frame
 139    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 140    Fixed obscure bug in sys_error
 141    Fixed compilation in mingw environment not present
 142    Fixed compilation in non-graphical environments
 143
 144 2.0.0-b12 - 9/4/00
 145    ctsim: Added animation of reconstruction
 146    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 147    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 148    ctsim: used setpriority to set lower priority
 149    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 150    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 151
 152 2.0.0-b11 - 9/1/00
 153    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 154    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 155    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 156    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 157    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 158    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 159    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 160    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 161    Separated reconstruction into Reconstructor class
 162    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 163    Added --enable-static to generate statically linked programs
 164
 165 2.0.0-b10 - 8/25/00
 166    ctsim: Added animation of projection collection processs
 167    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 168    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 169    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 170    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 171    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 172    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 173    Fixed bug in backprojection selection
 174
 175 2.0.0-b9 - 8/22/00
 176    Added RCS Id strings to executable files
 177    Added RPM Spec file for RPM package creation
 178    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 179    Fixed compilation for non-SGP architectures
 180    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 181    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 182         inverse_fourier construction of filters
 183    Added median to statistics and to auto-windowing
 184
 185 2.0.0-b8 - 8/1/00
 186    Added line color support to SGP
 187    Fixed lineAbs bug
 188
 189 2.0.0-b7 - 7/25/00
 190    Finished support for dmallocxx library
 191    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 192    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 193         G2 windows and well as WXWindows.
 194    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 195    Fixed row-plot bug in if-2
 196    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 197
 198 2.0.0-b6 - 7/22/00
 199    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 200         and projection files
 201    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 202         and reconstruction parameters dialogs
 203    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 204    Completely reorganized option processing in classes to improve
 205         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 206
 207 2.0.0-b5 - 7/17/00
 208    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 209    Started ctsim.tex document file
 210
 211 2.0.0-b4 - 7/13/00
 212    Fixed compiler warnings at -Wall level
 213    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 214    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 215    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 216
 217 2.0.0-b3 - 7/10/00
 218    Added highly optimized backprojection method idiff3
 219    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 220    Fixed image display in if2img using G2 library
 221    Added column-plot and row-plot options to if-2
 222    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 223    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 224         backprojection method. Currently, this technique is still under
 225         development and debugging
 226    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 227
 228 2.0.0-b2 - 7/07/00
 229    Cleaned up SignalFilter class
 230    Added zeropad option to pjrec
 231    Added zeropad options to html and cgi files
 232    Added fourier_table and rfttw filter methods
 233    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 234
 235 2.0.0-b1 - 7/05/00
 236    Updated trace level processing
 237    Added trace level to SignalFilter
 238    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 239
 240 1.9.9 - 7/04/00
 241    Fixed const issue with ImageFileArray
 242    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 243    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 244    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 245    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 246    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 247         between convolution, dft, & fft filtering
 248    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 249    Added support for FFTW library
 250
 251 1.9.8 - 6/27/2000
 252    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 253    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 254    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 255    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 256    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 257    Added signature tag and creation date/time to projection files
 258
 259 1.9.7 - 6/25/2000
 260    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 261         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 262         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 263    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 264    Rewrote ImageFile class
 265    Started support for dmallocxx library, not finished
 266    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 267    Updated ifinfo to show comparative statistics
 268    Added printLabels() to Array2dFile class
 269    Added printStatistics() to ImageFile class
 270
 271 1.9.6 - 6/22/2000
 272    Moved conversion filter name/id to Filter class
 273    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 274    Added MPI broadcasting of strings
 275
 276 1.9.5 - 6/21/2000
 277    Merged proj_reconstr into class Projections
 278    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 279    Code cleanup in projections.cpp
 280    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 281
 282 1.9.4 - 6/20/2000
 283    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 284    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 285    Converted filter and convolution to object-oriented code
 286    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 287    Optimized image file writing on little-endian architectures
 288    Updated README and INSTALL
 289
 290 1.9.3 - 6/19/2000
 291    Reorganized source files
 292    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 293
 294 1.9.2 - 6/18/2000
 295    Reorganized include files
 296    Fixed const pointers in strfuncs
 297
 298 1.9.1 - 6/16/2000
 299    Renamed directories, moved source files, combined source files
 300    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 301    and libctgraphics)
 302
 303 1.9.0 - 6/15/2000
 304    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 305    Renamed Raysums to Projections throughout files
 306    Renamed Detector to Scanner
 307    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 308
 309 0.6.1 - 6/12/2000
 310    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 311    Converted Detector to Object-Oriented
 312
 313 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 314    Improved Integer backprojection method
 315         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 316         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 317    Finished converting all C files to C++
 318    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 319    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 320
 321 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 322    Converted MPI data structures to C++ object
 323    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 324
 325 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 326    First C++ conversions
 327    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 328         - Now all data files are cross-platform compatible
 329    Converted from MPI to MPI++
 330    Converted backprojection to object-oriented
 331    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 332
 333 0.5.4 - 6/4/2000
 334    Simpilifed endian handling
 335
 336 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 337    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 338    Removed broken B-spline interpolation
 339    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 340    Added support for 16-bit PNG graphics
 341
 342 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 343    Added compile-time configuration of endian order
 344
 345 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 346    Modified the raysum file format to be platform independent
 347
 348 0.5.3 - 5/11/2000
 349    Added Microsoft VC compatibility
 350    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 351
 352 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 353    Continued conversion to ANSI C
 354    Removed old CRT routines
 355
 356 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 357    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 358    Continued code cleanup
 359
 360 0.5.2-b3 - 4/30/200
 361     More code cleanup with reorganizing libraries
 362     Added --log and --exp to sdf-1
 363     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 364
 365 0.5.2-b2 - 4/30/200
 366     Continued code cleanup
 367
 368 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 369     Fixed a few MPI bugs
 370     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 371
 372 0.5.1 - 4/28/2000
 373     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 374     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 375
 376 0.5.0 - 4/27/2000
 377     First open source distribution for GNU/Linux
 378
 379 6/1999
 380   Converted to GNU/Linux
 381   added MPI support via LAM library
 382
 383 1983-84
 384   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 385