ChangeLog

   1 3.0.4 - Released
   2
   3         * ctsim: Added "Verbose Logging" and "Startup Tips" options
   4         to Preferences.
   5
   6         * ctsim: Added tips to be displayed at startup and via the help menu.
   7
   8 3.0.3 - Released 2/20/01
   9
  10         * ctsim: Fixed core dump on Linux with OpenGL
  11
  12         * ctsim: Fixed context-sensitive help on Linux
  13
  14         * ctsim: Fixed About box on Linux
  15
  16 3.0.2 - Released 2/20/01
  17
  18         * scanner.cpp: Fixed bug when number of detectors was even.
  19
  20         * ctsim: Improved error handling when trying to convert
  21         divergent projections into polar form.
  22
  23 3.0.1 - Released 2/19/01
  24
  25         * ctsim: Fixed dialog box for reconstruction so that
  26         rotation angle setting will stay fixed in-between use
  27         of the dialog box.
  28
  29         * syserror: Fixed display bug for trace messages
  30
  31         * ctsim: MSVC optimization bug work-around, compiler
  32         options changed.
  33
  34 3.0.0 - Released 2/19/01
  35
  36         * ctsim: Massive update/fix to online help and print manual.
  37
  38         * ctsim: Added context-sensitive help to dialog boxes
  39
  40         * ctsim: Reformated all dialog boxes, much nicer now.
  41
  42         * ctsim: Improved accelerator key handling
  43
  44         * global: Added Hanning filter.
  45
  46         * global: Improved default parameters to that all defaults give
  47         sensible output.
  48
  49 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
  50
  51         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  52         registry storage between executions.
  53
  54         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  55
  56         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  57
  58         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  59
  60         * ctsim: Added graphical About box
  61
  62         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  63
  64         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  65
  66         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  67
  68         * ctsim: Online help added!
  69
  70         * backprojector: Added cubic interpolation
  71
  72         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  73
  74         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  75         reconstruction dialogs.
  76
  77         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  78
  79         * global: Projection files are not compatible with previous version
  80         due to new scanner definitions.
  81
  82         * global: deleted concept of field-of-view and added
  83           view ratio and scan ratio concepts.
  84
  85         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  86
  87         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  88
  89         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  90
  91         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  92
  93
  94 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  95
  96         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  97         procsignal.cpp
  98
  99         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
 100         bug in parsing command-line parameters.
 101
 102         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
 103         plotfiles
 104
 105         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
 106
 107         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
 108
 109         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
 110         for frequency/inverse-fourier filtering
 111
 112 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
 113
 114         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
 115
 116         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
 117         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
 118
 119         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
 120         for math tips]
 121
 122         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
 123
 124         * ctsim: Added more analyze menuitems
 125
 126         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
 127         through this master shell. Has both command-line and interactive
 128         interface
 129
 130         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
 131
 132         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
 133
 134         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
 135
 136 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
 137
 138         * ctsim: Added plotting of histograms
 139
 140         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
 141
 142         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 143
 144 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 145
 146         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 147
 148         * ctsim: added generation of filter images
 149
 150         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 151
 152         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 153
 154         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 155
 156         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 157         text files suitable for reading.
 158
 159         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 160         when performing properties of images.
 161
 162         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 163         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 164         fourier.cpp
 165
 166         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 167         image math functions to complex-valued math.
 168
 169         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 170
 171 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 172
 173         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 174         and column plots and comparison plots
 175
 176         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 177
 178         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 179
 180         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 181         files.
 182
 183         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 184         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 185         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 186
 187         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 188         imagefile and plotfile classes.
 189
 190         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 191         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 192         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 193         images.
 194
 195         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 196         images.
 197
 198         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 199         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 200
 201         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 202         math functions
 203
 204         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 205
 206         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 207         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 208         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 209
 210         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 211         class.
 212
 213         * sgp: Added linestyle settings
 214
 215 2.5.0 - 12/18/00
 216    First Microsoft Windows GUI version
 217    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 218    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 219         when manually compiling phantoms that vary during projection
 220         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 221    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 222    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 223    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 224    Fixed display of plotting in Projection views
 225    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 226    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 227         "namespace using std" statements
 228    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 229    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 230
 231 2.0.6 - 12/03/00
 232    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 233    Updated README file
 234    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 235    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 236
 237 2.0.5 - 12/01/00
 238    Improved compilation on RedHat 7
 239    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 240    Removed README.RedHat7
 241
 242 2.0.4 - 11/25/00
 243    Added documentation for --geometry setting
 244    Added README.RedHat7 document
 245
 246 2.0.3 - 11/20/00
 247    Fixed bug in generation of binary PGM files
 248    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 249    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 250
 251 2.0.2 - 11/8/00
 252    Additions to man pages (Ian Kay)
 253    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 254
 255 2.0.1 - 10/1/00
 256    Fixed syntax error in fftw configuration
 257    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 258
 259 2.0.0 - 9/7/00
 260    Version 2.0.0 released!
 261    ctsim: Added Window menu to Main frame
 262    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 263    Fixed obscure bug in sys_error
 264    Fixed compilation in mingw environment not present
 265    Fixed compilation in non-graphical environments
 266
 267 2.0.0-b12 - 9/4/00
 268    ctsim: Added animation of reconstruction
 269    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 270    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 271    ctsim: used setpriority to set lower priority
 272    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 273    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 274
 275 2.0.0-b11 - 9/1/00
 276    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 277    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 278    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 279    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 280    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 281    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 282    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 283    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 284    Separated reconstruction into Reconstructor class
 285    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 286    Added --enable-static to generate statically linked programs
 287
 288 2.0.0-b10 - 8/25/00
 289    ctsim: Added animation of projection collection processs
 290    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 291    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 292    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 293    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 294    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 295    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 296    Fixed bug in backprojection selection
 297
 298 2.0.0-b9 - 8/22/00
 299    Added RCS Id strings to executable files
 300    Added RPM Spec file for RPM package creation
 301    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 302    Fixed compilation for non-SGP architectures
 303    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 304    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 305         inverse_fourier construction of filters
 306    Added median to statistics and to auto-windowing
 307
 308 2.0.0-b8 - 8/1/00
 309    Added line color support to SGP
 310    Fixed lineAbs bug
 311
 312 2.0.0-b7 - 7/25/00
 313    Finished support for dmallocxx library
 314    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 315    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 316         G2 windows and well as WXWindows.
 317    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 318    Fixed row-plot bug in if-2
 319    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 320
 321 2.0.0-b6 - 7/22/00
 322    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 323         and projection files
 324    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 325         and reconstruction parameters dialogs
 326    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 327    Completely reorganized option processing in classes to improve
 328         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 329
 330 2.0.0-b5 - 7/17/00
 331    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 332    Started ctsim.tex document file
 333
 334 2.0.0-b4 - 7/13/00
 335    Fixed compiler warnings at -Wall level
 336    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 337    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 338    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 339
 340 2.0.0-b3 - 7/10/00
 341    Added highly optimized backprojection method idiff3
 342    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 343    Fixed image display in if2img using G2 library
 344    Added column-plot and row-plot options to if-2
 345    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 346    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 347         backprojection method. Currently, this technique is still under
 348         development and debugging
 349    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 350
 351 2.0.0-b2 - 7/07/00
 352    Cleaned up SignalFilter class
 353    Added zeropad option to pjrec
 354    Added zeropad options to html and cgi files
 355    Added fourier_table and rfttw filter methods
 356    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 357
 358 2.0.0-b1 - 7/05/00
 359    Updated trace level processing
 360    Added trace level to SignalFilter
 361    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 362
 363 1.9.9 - 7/04/00
 364    Fixed const issue with ImageFileArray
 365    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 366    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 367    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 368    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 369    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 370         between convolution, dft, & fft filtering
 371    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 372    Added support for FFTW library
 373
 374 1.9.8 - 6/27/2000
 375    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 376    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 377    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 378    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 379    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 380    Added signature tag and creation date/time to projection files
 381
 382 1.9.7 - 6/25/2000
 383    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 384         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 385         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 386    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 387    Rewrote ImageFile class
 388    Started support for dmallocxx library, not finished
 389    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 390    Updated ifinfo to show comparative statistics
 391    Added printLabels() to Array2dFile class
 392    Added printStatistics() to ImageFile class
 393
 394 1.9.6 - 6/22/2000
 395    Moved conversion filter name/id to Filter class
 396    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 397    Added MPI broadcasting of strings
 398
 399 1.9.5 - 6/21/2000
 400    Merged proj_reconstr into class Projections
 401    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 402    Code cleanup in projections.cpp
 403    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 404
 405 1.9.4 - 6/20/2000
 406    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 407    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 408    Converted filter and convolution to object-oriented code
 409    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 410    Optimized image file writing on little-endian architectures
 411    Updated README and INSTALL
 412
 413 1.9.3 - 6/19/2000
 414    Reorganized source files
 415    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 416
 417 1.9.2 - 6/18/2000
 418    Reorganized include files
 419    Fixed const pointers in strfuncs
 420
 421 1.9.1 - 6/16/2000
 422    Renamed directories, moved source files, combined source files
 423    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 424    and libctgraphics)
 425
 426 1.9.0 - 6/15/2000
 427    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 428    Renamed Raysums to Projections throughout files
 429    Renamed Detector to Scanner
 430    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 431
 432 0.6.1 - 6/12/2000
 433    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 434    Converted Detector to Object-Oriented
 435
 436 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 437    Improved Integer backprojection method
 438         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 439         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 440    Finished converting all C files to C++
 441    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 442    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 443
 444 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 445    Converted MPI data structures to C++ object
 446    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 447
 448 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 449    First C++ conversions
 450    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 451         - Now all data files are cross-platform compatible
 452    Converted from MPI to MPI++
 453    Converted backprojection to object-oriented
 454    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 455
 456 0.5.4 - 6/4/2000
 457    Simpilifed endian handling
 458
 459 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 460    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 461    Removed broken B-spline interpolation
 462    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 463    Added support for 16-bit PNG graphics
 464
 465 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 466    Added compile-time configuration of endian order
 467
 468 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 469    Modified the raysum file format to be platform independent
 470
 471 0.5.3 - 5/11/2000
 472    Added Microsoft VC compatibility
 473    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 474
 475 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 476    Continued conversion to ANSI C
 477    Removed old CRT routines
 478
 479 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 480    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 481    Continued code cleanup
 482
 483 0.5.2-b3 - 4/30/200
 484     More code cleanup with reorganizing libraries
 485     Added --log and --exp to sdf-1
 486     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 487
 488 0.5.2-b2 - 4/30/200
 489     Continued code cleanup
 490
 491 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 492     Fixed a few MPI bugs
 493     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 494
 495 0.5.1 - 4/28/2000
 496     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 497     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 498
 499 0.5.0 - 4/27/2000
 500     First open source distribution for GNU/Linux
 501
 502 6/1999
 503   Converted to GNU/Linux
 504   added MPI support via LAM library
 505
 506 1983-84
 507   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 508