ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Added icons to Frames
   4
   5 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
   6
   7         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
   8         procsignal.cpp
   9
  10         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  11         bug in parsing command-line parameters.
  12
  13         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  14         plotfiles
  15
  16         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  17
  18         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  19
  20         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  21         for frequency/inverse-fourier filtering
  22
  23 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  24
  25         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  26
  27         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  28         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  29
  30         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  31         for math tips]
  32
  33         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  34
  35         * ctsim: Added more analyze menuitems
  36
  37         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  38         through this master shell. Has both command-line and interactive
  39         interface
  40
  41         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  42
  43         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  44
  45         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  46
  47 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  48
  49         * ctsim: Added plotting of histograms
  50
  51         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  52
  53         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  54
  55 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  56
  57         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  58
  59         * ctsim: added generation of filter images
  60
  61         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  62
  63         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  64
  65         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  66
  67         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  68         text files suitable for reading.
  69
  70         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  71         when performing properties of images.
  72
  73         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  74         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  75         fourier.cpp
  76
  77         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  78         image math functions to complex-valued math.
  79
  80         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  81
  82 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  83
  84         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  85         and column plots and comparison plots
  86
  87         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  88
  89         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  90
  91         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  92         files.
  93
  94         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  95         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  96         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  97
  98         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  99         imagefile and plotfile classes.
 100
 101         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 102         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 103         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 104         images.
 105
 106         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 107         images.
 108
 109         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 110         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 111
 112         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 113         math functions
 114
 115         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 116
 117         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 118         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 119         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 120
 121         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 122         class.
 123
 124         * sgp: Added linestyle settings
 125
 126 2.5.0 - 12/18/00
 127    First Microsoft Windows GUI version
 128    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 129    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 130         when manually compiling phantoms that vary during projection
 131         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 132    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 133    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 134    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 135    Fixed display of plotting in Projection views
 136    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 137    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 138         "namespace using std" statements
 139    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 140    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 141
 142 2.0.6 - 12/03/00
 143    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 144    Updated README file
 145    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 146    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 147
 148 2.0.5 - 12/01/00
 149    Improved compilation on RedHat 7
 150    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 151    Removed README.RedHat7
 152
 153 2.0.4 - 11/25/00
 154    Added documentation for --geometry setting
 155    Added README.RedHat7 document
 156
 157 2.0.3 - 11/20/00
 158    Fixed bug in generation of binary PGM files
 159    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 160    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 161
 162 2.0.2 - 11/8/00
 163    Additions to man pages (Ian Kay)
 164    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 165
 166 2.0.1 - 10/1/00
 167    Fixed syntax error in fftw configuration
 168    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 169
 170 2.0.0 - 9/7/00
 171    Version 2.0.0 released!
 172    ctsim: Added Window menu to Main frame
 173    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 174    Fixed obscure bug in sys_error
 175    Fixed compilation in mingw environment not present
 176    Fixed compilation in non-graphical environments
 177
 178 2.0.0-b12 - 9/4/00
 179    ctsim: Added animation of reconstruction
 180    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 181    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 182    ctsim: used setpriority to set lower priority
 183    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 184    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 185
 186 2.0.0-b11 - 9/1/00
 187    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 188    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 189    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 190    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 191    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 192    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 193    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 194    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 195    Separated reconstruction into Reconstructor class
 196    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 197    Added --enable-static to generate statically linked programs
 198
 199 2.0.0-b10 - 8/25/00
 200    ctsim: Added animation of projection collection processs
 201    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 202    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 203    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 204    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 205    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 206    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 207    Fixed bug in backprojection selection
 208
 209 2.0.0-b9 - 8/22/00
 210    Added RCS Id strings to executable files
 211    Added RPM Spec file for RPM package creation
 212    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 213    Fixed compilation for non-SGP architectures
 214    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 215    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 216         inverse_fourier construction of filters
 217    Added median to statistics and to auto-windowing
 218
 219 2.0.0-b8 - 8/1/00
 220    Added line color support to SGP
 221    Fixed lineAbs bug
 222
 223 2.0.0-b7 - 7/25/00
 224    Finished support for dmallocxx library
 225    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 226    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 227         G2 windows and well as WXWindows.
 228    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 229    Fixed row-plot bug in if-2
 230    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 231
 232 2.0.0-b6 - 7/22/00
 233    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 234         and projection files
 235    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 236         and reconstruction parameters dialogs
 237    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 238    Completely reorganized option processing in classes to improve
 239         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 240
 241 2.0.0-b5 - 7/17/00
 242    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 243    Started ctsim.tex document file
 244
 245 2.0.0-b4 - 7/13/00
 246    Fixed compiler warnings at -Wall level
 247    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 248    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 249    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 250
 251 2.0.0-b3 - 7/10/00
 252    Added highly optimized backprojection method idiff3
 253    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 254    Fixed image display in if2img using G2 library
 255    Added column-plot and row-plot options to if-2
 256    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 257    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 258         backprojection method. Currently, this technique is still under
 259         development and debugging
 260    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 261
 262 2.0.0-b2 - 7/07/00
 263    Cleaned up SignalFilter class
 264    Added zeropad option to pjrec
 265    Added zeropad options to html and cgi files
 266    Added fourier_table and rfttw filter methods
 267    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 268
 269 2.0.0-b1 - 7/05/00
 270    Updated trace level processing
 271    Added trace level to SignalFilter
 272    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 273
 274 1.9.9 - 7/04/00
 275    Fixed const issue with ImageFileArray
 276    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 277    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 278    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 279    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 280    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 281         between convolution, dft, & fft filtering
 282    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 283    Added support for FFTW library
 284
 285 1.9.8 - 6/27/2000
 286    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 287    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 288    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 289    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 290    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 291    Added signature tag and creation date/time to projection files
 292
 293 1.9.7 - 6/25/2000
 294    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 295         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 296         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 297    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 298    Rewrote ImageFile class
 299    Started support for dmallocxx library, not finished
 300    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 301    Updated ifinfo to show comparative statistics
 302    Added printLabels() to Array2dFile class
 303    Added printStatistics() to ImageFile class
 304
 305 1.9.6 - 6/22/2000
 306    Moved conversion filter name/id to Filter class
 307    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 308    Added MPI broadcasting of strings
 309
 310 1.9.5 - 6/21/2000
 311    Merged proj_reconstr into class Projections
 312    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 313    Code cleanup in projections.cpp
 314    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 315
 316 1.9.4 - 6/20/2000
 317    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 318    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 319    Converted filter and convolution to object-oriented code
 320    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 321    Optimized image file writing on little-endian architectures
 322    Updated README and INSTALL
 323
 324 1.9.3 - 6/19/2000
 325    Reorganized source files
 326    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 327
 328 1.9.2 - 6/18/2000
 329    Reorganized include files
 330    Fixed const pointers in strfuncs
 331
 332 1.9.1 - 6/16/2000
 333    Renamed directories, moved source files, combined source files
 334    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 335    and libctgraphics)
 336
 337 1.9.0 - 6/15/2000
 338    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 339    Renamed Raysums to Projections throughout files
 340    Renamed Detector to Scanner
 341    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 342
 343 0.6.1 - 6/12/2000
 344    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 345    Converted Detector to Object-Oriented
 346
 347 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 348    Improved Integer backprojection method
 349         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 350         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 351    Finished converting all C files to C++
 352    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 353    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 354
 355 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 356    Converted MPI data structures to C++ object
 357    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 358
 359 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 360    First C++ conversions
 361    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 362         - Now all data files are cross-platform compatible
 363    Converted from MPI to MPI++
 364    Converted backprojection to object-oriented
 365    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 366
 367 0.5.4 - 6/4/2000
 368    Simpilifed endian handling
 369
 370 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 371    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 372    Removed broken B-spline interpolation
 373    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 374    Added support for 16-bit PNG graphics
 375
 376 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 377    Added compile-time configuration of endian order
 378
 379 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 380    Modified the raysum file format to be platform independent
 381
 382 0.5.3 - 5/11/2000
 383    Added Microsoft VC compatibility
 384    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 385
 386 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 387    Continued conversion to ANSI C
 388    Removed old CRT routines
 389
 390 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 391    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 392    Continued code cleanup
 393
 394 0.5.2-b3 - 4/30/200
 395     More code cleanup with reorganizing libraries
 396     Added --log and --exp to sdf-1
 397     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 398
 399 0.5.2-b2 - 4/30/200
 400     Continued code cleanup
 401
 402 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 403     Fixed a few MPI bugs
 404     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 405
 406 0.5.1 - 4/28/2000
 407     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 408     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 409
 410 0.5.0 - 4/27/2000
 411     First open source distribution for GNU/Linux
 412
 413 6/1999
 414   Converted to GNU/Linux
 415   added MPI support via LAM library
 416
 417 1983-84
 418   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 419