ChangeLog

   1 TODO
   2         Read PlotFile's.
   3
   4         Fix display of ylabel.
   5
   6         Review old ezset.c and add in concept of curve number. Add to ezset
   7         std::vector for individual curve parameters such as color, linestyle,
   8         symbol. Read these vectors during plot generation
   9
  10         Add help button onto dialog's for reconstruction & projections.
  11         Consider use of wxWindows help file classes.
  12
  13         Consider changing POL into a Class. Consider making it read tag tokens.
  14
  15         Consider being able to write Phantom files as text
  16
  17 3.0alpha1 - Released 12/30/00
  18
  19         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  20         and column plots and comparison plots
  21
  22         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  23
  24         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  25
  26         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  27         files.
  28
  29         * Reworked statistics algorithm to share between imagefile and
  30         plotfile classes.
  31
  32         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  33         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  34         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp
  35
  36         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  37         negative number.
  38
  39         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  40         math functions
  41
  42         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  43
  44         * ezplot.h: Updated to more C++ conventions
  45
  46 2.5.0 - 12/18/00
  47    First Microsoft Windows GUI version
  48    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  49    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  50         when manually compiling phantoms that vary during projection
  51         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  52    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  53    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  54    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  55    Fixed display of plotting in Projection views
  56    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  57    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  58         "namespace using std" statements
  59    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  60    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  61
  62 2.0.6 - 12/03/00
  63    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
  64    Updated README file
  65    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
  66    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
  67
  68 2.0.5 - 12/01/00
  69    Improved compilation on RedHat 7
  70    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
  71    Removed README.RedHat7
  72
  73 2.0.4 - 11/25/00
  74    Added documentation for --geometry setting
  75    Added README.RedHat7 document
  76
  77 2.0.3 - 11/20/00
  78    Fixed bug in generation of binary PGM files
  79    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
  80    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
  81
  82 2.0.2 - 11/8/00
  83    Additions to man pages (Ian Kay)
  84    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
  85
  86 2.0.1 - 10/1/00
  87    Fixed syntax error in fftw configuration
  88    Slight modifications to support gcc v2.9.6
  89
  90 2.0.0 - 9/7/00
  91    Version 2.0.0 released!
  92    ctsim: Added Window menu to Main frame
  93    ctsim: Disabled not support reconstruction method
  94    Fixed obscure bug in sys_error
  95    Fixed compilation in mingw environment not present
  96    Fixed compilation in non-graphical environments
  97
  98 2.0.0-b12 - 9/4/00
  99    ctsim: Added animation of reconstruction
 100    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 101    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 102    ctsim: used setpriority to set lower priority
 103    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 104    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 105
 106 2.0.0-b11 - 9/1/00
 107    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 108    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 109    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 110    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 111    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 112    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 113    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 114    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 115    Separated reconstruction into Reconstructor class
 116    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 117    Added --enable-static to generate statically linked programs
 118
 119 2.0.0-b10 - 8/25/00
 120    ctsim: Added animation of projection collection processs
 121    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 122    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 123    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 124    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 125    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 126    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 127    Fixed bug in backprojection selection
 128
 129 2.0.0-b9 - 8/22/00
 130    Added RCS Id strings to executable files
 131    Added RPM Spec file for RPM package creation
 132    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 133    Fixed compilation for non-SGP architectures
 134    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 135    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 136         inverse_fourier construction of filters
 137    Added median to statistics and to auto-windowing
 138
 139 2.0.0-b8 - 8/1/00
 140    Added line color support to SGP
 141    Fixed lineAbs bug
 142
 143 2.0.0-b7 - 7/25/00
 144    Finished support for dmallocxx library
 145    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 146    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 147         G2 windows and well as WXWindows.
 148    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 149    Fixed row-plot bug in if-2
 150    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 151
 152 2.0.0-b6 - 7/22/00
 153    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 154         and projection files
 155    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 156         and reconstruction parameters dialogs
 157    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 158    Completely reorganized option processing in classes to improve
 159         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 160
 161 2.0.0-b5 - 7/17/00
 162    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 163    Started ctsim.tex document file
 164
 165 2.0.0-b4 - 7/13/00
 166    Fixed compiler warnings at -Wall level
 167    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 168    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 169    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 170
 171 2.0.0-b3 - 7/10/00
 172    Added highly optimized backprojection method idiff3
 173    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 174    Fixed image display in if2img using G2 library
 175    Added column-plot and row-plot options to if-2
 176    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 177    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 178         backprojection method. Currently, this technique is still under
 179         development and debugging
 180    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 181
 182 2.0.0-b2 - 7/07/00
 183    Cleaned up SignalFilter class
 184    Added zeropad option to pjrec
 185    Added zeropad options to html and cgi files
 186    Added fourier_table and rfttw filter methods
 187    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 188
 189 2.0.0-b1 - 7/05/00
 190    Updated trace level processing
 191    Added trace level to SignalFilter
 192    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 193
 194 1.9.9 - 7/04/00
 195    Fixed const issue with ImageFileArray
 196    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 197    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 198    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 199    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 200    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 201         between convolution, dft, & fft filtering
 202    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 203    Added support for FFTW library
 204
 205 1.9.8 - 6/27/2000
 206    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 207    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 208    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 209    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 210    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 211    Added signature tag and creation date/time to projection files
 212
 213 1.9.7 - 6/25/2000
 214    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 215         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 216         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 217    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 218    Rewrote ImageFile class
 219    Started support for dmallocxx library, not finished
 220    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 221    Updated ifinfo to show comparative statistics
 222    Added printLabels() to Array2dFile class
 223    Added printStatistics() to ImageFile class
 224
 225 1.9.6 - 6/22/2000
 226    Moved conversion filter name/id to Filter class
 227    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 228    Added MPI broadcasting of strings
 229
 230 1.9.5 - 6/21/2000
 231    Merged proj_reconstr into class Projections
 232    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 233    Code cleanup in projections.cpp
 234    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 235
 236 1.9.4 - 6/20/2000
 237    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 238    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 239    Converted filter and convolution to object-oriented code
 240    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 241    Optimized image file writing on little-endian architectures
 242    Updated README and INSTALL
 243
 244 1.9.3 - 6/19/2000
 245    Reorganized source files
 246    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 247
 248 1.9.2 - 6/18/2000
 249    Reorganized include files
 250    Fixed const pointers in strfuncs
 251
 252 1.9.1 - 6/16/2000
 253    Renamed directories, moved source files, combined source files
 254    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 255    and libctgraphics)
 256
 257 1.9.0 - 6/15/2000
 258    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 259    Renamed Raysums to Projections throughout files
 260    Renamed Detector to Scanner
 261    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 262
 263 0.6.1 - 6/12/2000
 264    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 265    Converted Detector to Object-Oriented
 266
 267 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 268    Improved Integer backprojection method
 269         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 270         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 271    Finished converting all C files to C++
 272    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 273    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 274
 275 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 276    Converted MPI data structures to C++ object
 277    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 278
 279 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 280    First C++ conversions
 281    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 282         - Now all data files are cross-platform compatible
 283    Converted from MPI to MPI++
 284    Converted backprojection to object-oriented
 285    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 286
 287 0.5.4 - 6/4/2000
 288    Simpilifed endian handling
 289
 290 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 291    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 292    Removed broken B-spline interpolation
 293    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 294    Added support for 16-bit PNG graphics
 295
 296 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 297    Added compile-time configuration of endian order
 298
 299 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 300    Modified the raysum file format to be platform independent
 301
 302 0.5.3 - 5/11/2000
 303    Added Microsoft VC compatibility
 304    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 305
 306 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 307    Continued conversion to ANSI C
 308    Removed old CRT routines
 309
 310 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 311    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 312    Continued code cleanup
 313
 314 0.5.2-b3 - 4/30/200
 315     More code cleanup with reorganizing libraries
 316     Added --log and --exp to sdf-1
 317     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 318
 319 0.5.2-b2 - 4/30/200
 320     Continued code cleanup
 321
 322 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 323     Fixed a few MPI bugs
 324     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 325
 326 0.5.1 - 4/28/2000
 327     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 328     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 329
 330 0.5.0 - 4/27/2000
 331     First open source distribution for GNU/Linux
 332
 333 6/1999
 334   Converted to GNU/Linux
 335   added MPI support via LAM library
 336
 337 1983-84
 338   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 339