ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
   4         registry storage between executions.
   5
   6         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default
   7
   8         * ctsim: Added graphical About box
   9
  10         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  11
  12         * ctsim: Online help added as well as HTML help
  13
  14         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  15
  16         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  17         reconstruction dialogs.
  18
  19         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  20
  21         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  22
  23 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  24
  25         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  26         procsignal.cpp
  27
  28         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  29         bug in parsing command-line parameters.
  30
  31         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  32         plotfiles
  33
  34         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  35
  36         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  37
  38         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  39         for frequency/inverse-fourier filtering
  40
  41 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  42
  43         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  44
  45         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  46         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  47
  48         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  49         for math tips]
  50
  51         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  52
  53         * ctsim: Added more analyze menuitems
  54
  55         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  56         through this master shell. Has both command-line and interactive
  57         interface
  58
  59         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  60
  61         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  62
  63         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  64
  65 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  66
  67         * ctsim: Added plotting of histograms
  68
  69         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  70
  71         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  72
  73 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  74
  75         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  76
  77         * ctsim: added generation of filter images
  78
  79         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  80
  81         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  82
  83         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  84
  85         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  86         text files suitable for reading.
  87
  88         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  89         when performing properties of images.
  90
  91         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  92         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  93         fourier.cpp
  94
  95         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  96         image math functions to complex-valued math.
  97
  98         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  99
 100 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 101
 102         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 103         and column plots and comparison plots
 104
 105         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 106
 107         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 108
 109         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 110         files.
 111
 112         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 113         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 114         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 115
 116         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 117         imagefile and plotfile classes.
 118
 119         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 120         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 121         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 122         images.
 123
 124         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 125         images.
 126
 127         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 128         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 129
 130         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 131         math functions
 132
 133         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 134
 135         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 136         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 137         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 138
 139         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 140         class.
 141
 142         * sgp: Added linestyle settings
 143
 144 2.5.0 - 12/18/00
 145    First Microsoft Windows GUI version
 146    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 147    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 148         when manually compiling phantoms that vary during projection
 149         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 150    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 151    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 152    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 153    Fixed display of plotting in Projection views
 154    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 155    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 156         "namespace using std" statements
 157    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 158    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 159
 160 2.0.6 - 12/03/00
 161    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 162    Updated README file
 163    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 164    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 165
 166 2.0.5 - 12/01/00
 167    Improved compilation on RedHat 7
 168    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 169    Removed README.RedHat7
 170
 171 2.0.4 - 11/25/00
 172    Added documentation for --geometry setting
 173    Added README.RedHat7 document
 174
 175 2.0.3 - 11/20/00
 176    Fixed bug in generation of binary PGM files
 177    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 178    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 179
 180 2.0.2 - 11/8/00
 181    Additions to man pages (Ian Kay)
 182    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 183
 184 2.0.1 - 10/1/00
 185    Fixed syntax error in fftw configuration
 186    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 187
 188 2.0.0 - 9/7/00
 189    Version 2.0.0 released!
 190    ctsim: Added Window menu to Main frame
 191    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 192    Fixed obscure bug in sys_error
 193    Fixed compilation in mingw environment not present
 194    Fixed compilation in non-graphical environments
 195
 196 2.0.0-b12 - 9/4/00
 197    ctsim: Added animation of reconstruction
 198    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 199    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 200    ctsim: used setpriority to set lower priority
 201    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 202    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 203
 204 2.0.0-b11 - 9/1/00
 205    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 206    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 207    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 208    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 209    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 210    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 211    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 212    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 213    Separated reconstruction into Reconstructor class
 214    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 215    Added --enable-static to generate statically linked programs
 216
 217 2.0.0-b10 - 8/25/00
 218    ctsim: Added animation of projection collection processs
 219    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 220    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 221    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 222    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 223    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 224    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 225    Fixed bug in backprojection selection
 226
 227 2.0.0-b9 - 8/22/00
 228    Added RCS Id strings to executable files
 229    Added RPM Spec file for RPM package creation
 230    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 231    Fixed compilation for non-SGP architectures
 232    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 233    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 234         inverse_fourier construction of filters
 235    Added median to statistics and to auto-windowing
 236
 237 2.0.0-b8 - 8/1/00
 238    Added line color support to SGP
 239    Fixed lineAbs bug
 240
 241 2.0.0-b7 - 7/25/00
 242    Finished support for dmallocxx library
 243    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 244    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 245         G2 windows and well as WXWindows.
 246    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 247    Fixed row-plot bug in if-2
 248    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 249
 250 2.0.0-b6 - 7/22/00
 251    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 252         and projection files
 253    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 254         and reconstruction parameters dialogs
 255    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 256    Completely reorganized option processing in classes to improve
 257         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 258
 259 2.0.0-b5 - 7/17/00
 260    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 261    Started ctsim.tex document file
 262
 263 2.0.0-b4 - 7/13/00
 264    Fixed compiler warnings at -Wall level
 265    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 266    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 267    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 268
 269 2.0.0-b3 - 7/10/00
 270    Added highly optimized backprojection method idiff3
 271    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 272    Fixed image display in if2img using G2 library
 273    Added column-plot and row-plot options to if-2
 274    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 275    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 276         backprojection method. Currently, this technique is still under
 277         development and debugging
 278    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 279
 280 2.0.0-b2 - 7/07/00
 281    Cleaned up SignalFilter class
 282    Added zeropad option to pjrec
 283    Added zeropad options to html and cgi files
 284    Added fourier_table and rfttw filter methods
 285    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 286
 287 2.0.0-b1 - 7/05/00
 288    Updated trace level processing
 289    Added trace level to SignalFilter
 290    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 291
 292 1.9.9 - 7/04/00
 293    Fixed const issue with ImageFileArray
 294    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 295    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 296    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 297    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 298    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 299         between convolution, dft, & fft filtering
 300    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 301    Added support for FFTW library
 302
 303 1.9.8 - 6/27/2000
 304    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 305    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 306    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 307    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 308    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 309    Added signature tag and creation date/time to projection files
 310
 311 1.9.7 - 6/25/2000
 312    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 313         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 314         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 315    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 316    Rewrote ImageFile class
 317    Started support for dmallocxx library, not finished
 318    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 319    Updated ifinfo to show comparative statistics
 320    Added printLabels() to Array2dFile class
 321    Added printStatistics() to ImageFile class
 322
 323 1.9.6 - 6/22/2000
 324    Moved conversion filter name/id to Filter class
 325    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 326    Added MPI broadcasting of strings
 327
 328 1.9.5 - 6/21/2000
 329    Merged proj_reconstr into class Projections
 330    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 331    Code cleanup in projections.cpp
 332    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 333
 334 1.9.4 - 6/20/2000
 335    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 336    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 337    Converted filter and convolution to object-oriented code
 338    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 339    Optimized image file writing on little-endian architectures
 340    Updated README and INSTALL
 341
 342 1.9.3 - 6/19/2000
 343    Reorganized source files
 344    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 345
 346 1.9.2 - 6/18/2000
 347    Reorganized include files
 348    Fixed const pointers in strfuncs
 349
 350 1.9.1 - 6/16/2000
 351    Renamed directories, moved source files, combined source files
 352    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 353    and libctgraphics)
 354
 355 1.9.0 - 6/15/2000
 356    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 357    Renamed Raysums to Projections throughout files
 358    Renamed Detector to Scanner
 359    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 360
 361 0.6.1 - 6/12/2000
 362    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 363    Converted Detector to Object-Oriented
 364
 365 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 366    Improved Integer backprojection method
 367         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 368         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 369    Finished converting all C files to C++
 370    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 371    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 372
 373 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 374    Converted MPI data structures to C++ object
 375    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 376
 377 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 378    First C++ conversions
 379    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 380         - Now all data files are cross-platform compatible
 381    Converted from MPI to MPI++
 382    Converted backprojection to object-oriented
 383    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 384
 385 0.5.4 - 6/4/2000
 386    Simpilifed endian handling
 387
 388 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 389    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 390    Removed broken B-spline interpolation
 391    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 392    Added support for 16-bit PNG graphics
 393
 394 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 395    Added compile-time configuration of endian order
 396
 397 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 398    Modified the raysum file format to be platform independent
 399
 400 0.5.3 - 5/11/2000
 401    Added Microsoft VC compatibility
 402    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 403
 404 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 405    Continued conversion to ANSI C
 406    Removed old CRT routines
 407
 408 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 409    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 410    Continued code cleanup
 411
 412 0.5.2-b3 - 4/30/200
 413     More code cleanup with reorganizing libraries
 414     Added --log and --exp to sdf-1
 415     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 416
 417 0.5.2-b2 - 4/30/200
 418     Continued code cleanup
 419
 420 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 421     Fixed a few MPI bugs
 422     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 423
 424 0.5.1 - 4/28/2000
 425     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 426     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 427
 428 0.5.0 - 4/27/2000
 429     First open source distribution for GNU/Linux
 430
 431 6/1999
 432   Converted to GNU/Linux
 433   added MPI support via LAM library
 434
 435 1983-84
 436   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 437