ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * global: Projection files are not compatible with previous version
   4         due to new scanner definitions.
   5
   6         * global: deleted concept of field-of-view and added
   7           view ratio and scan ratio concepts.
   8
   9         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  10         registry storage between executions.
  11
  12         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  13
  14         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  15
  16         * ctsim: Added graphical About box
  17
  18         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  19
  20         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  21
  22         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  23
  24         * ctsim: Online help added as well as HTML help
  25
  26         * backprojector: Added cubic interpolation
  27
  28         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  29
  30         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  31         reconstruction dialogs.
  32
  33         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  34
  35         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  36
  37         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  38
  39         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  40
  41         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  42
  43 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  44
  45         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  46         procsignal.cpp
  47
  48         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  49         bug in parsing command-line parameters.
  50
  51         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  52         plotfiles
  53
  54         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  55
  56         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  57
  58         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  59         for frequency/inverse-fourier filtering
  60
  61 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  62
  63         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  64
  65         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  66         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  67
  68         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  69         for math tips]
  70
  71         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  72
  73         * ctsim: Added more analyze menuitems
  74
  75         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  76         through this master shell. Has both command-line and interactive
  77         interface
  78
  79         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  80
  81         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  82
  83         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  84
  85 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  86
  87         * ctsim: Added plotting of histograms
  88
  89         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  90
  91         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  92
  93 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  94
  95         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  96
  97         * ctsim: added generation of filter images
  98
  99         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 100
 101         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 102
 103         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 104
 105         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 106         text files suitable for reading.
 107
 108         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 109         when performing properties of images.
 110
 111         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 112         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 113         fourier.cpp
 114
 115         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 116         image math functions to complex-valued math.
 117
 118         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 119
 120 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 121
 122         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 123         and column plots and comparison plots
 124
 125         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 126
 127         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 128
 129         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 130         files.
 131
 132         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 133         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 134         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 135
 136         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 137         imagefile and plotfile classes.
 138
 139         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 140         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 141         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 142         images.
 143
 144         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 145         images.
 146
 147         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 148         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 149
 150         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 151         math functions
 152
 153         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 154
 155         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 156         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 157         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 158
 159         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 160         class.
 161
 162         * sgp: Added linestyle settings
 163
 164 2.5.0 - 12/18/00
 165    First Microsoft Windows GUI version
 166    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 167    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 168         when manually compiling phantoms that vary during projection
 169         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 170    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 171    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 172    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 173    Fixed display of plotting in Projection views
 174    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 175    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 176         "namespace using std" statements
 177    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 178    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 179
 180 2.0.6 - 12/03/00
 181    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 182    Updated README file
 183    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 184    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 185
 186 2.0.5 - 12/01/00
 187    Improved compilation on RedHat 7
 188    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 189    Removed README.RedHat7
 190
 191 2.0.4 - 11/25/00
 192    Added documentation for --geometry setting
 193    Added README.RedHat7 document
 194
 195 2.0.3 - 11/20/00
 196    Fixed bug in generation of binary PGM files
 197    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 198    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 199
 200 2.0.2 - 11/8/00
 201    Additions to man pages (Ian Kay)
 202    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 203
 204 2.0.1 - 10/1/00
 205    Fixed syntax error in fftw configuration
 206    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 207
 208 2.0.0 - 9/7/00
 209    Version 2.0.0 released!
 210    ctsim: Added Window menu to Main frame
 211    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 212    Fixed obscure bug in sys_error
 213    Fixed compilation in mingw environment not present
 214    Fixed compilation in non-graphical environments
 215
 216 2.0.0-b12 - 9/4/00
 217    ctsim: Added animation of reconstruction
 218    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 219    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 220    ctsim: used setpriority to set lower priority
 221    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 222    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 223
 224 2.0.0-b11 - 9/1/00
 225    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 226    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 227    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 228    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 229    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 230    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 231    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 232    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 233    Separated reconstruction into Reconstructor class
 234    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 235    Added --enable-static to generate statically linked programs
 236
 237 2.0.0-b10 - 8/25/00
 238    ctsim: Added animation of projection collection processs
 239    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 240    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 241    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 242    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 243    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 244    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 245    Fixed bug in backprojection selection
 246
 247 2.0.0-b9 - 8/22/00
 248    Added RCS Id strings to executable files
 249    Added RPM Spec file for RPM package creation
 250    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 251    Fixed compilation for non-SGP architectures
 252    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 253    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 254         inverse_fourier construction of filters
 255    Added median to statistics and to auto-windowing
 256
 257 2.0.0-b8 - 8/1/00
 258    Added line color support to SGP
 259    Fixed lineAbs bug
 260
 261 2.0.0-b7 - 7/25/00
 262    Finished support for dmallocxx library
 263    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 264    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 265         G2 windows and well as WXWindows.
 266    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 267    Fixed row-plot bug in if-2
 268    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 269
 270 2.0.0-b6 - 7/22/00
 271    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 272         and projection files
 273    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 274         and reconstruction parameters dialogs
 275    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 276    Completely reorganized option processing in classes to improve
 277         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 278
 279 2.0.0-b5 - 7/17/00
 280    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 281    Started ctsim.tex document file
 282
 283 2.0.0-b4 - 7/13/00
 284    Fixed compiler warnings at -Wall level
 285    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 286    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 287    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 288
 289 2.0.0-b3 - 7/10/00
 290    Added highly optimized backprojection method idiff3
 291    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 292    Fixed image display in if2img using G2 library
 293    Added column-plot and row-plot options to if-2
 294    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 295    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 296         backprojection method. Currently, this technique is still under
 297         development and debugging
 298    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 299
 300 2.0.0-b2 - 7/07/00
 301    Cleaned up SignalFilter class
 302    Added zeropad option to pjrec
 303    Added zeropad options to html and cgi files
 304    Added fourier_table and rfttw filter methods
 305    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 306
 307 2.0.0-b1 - 7/05/00
 308    Updated trace level processing
 309    Added trace level to SignalFilter
 310    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 311
 312 1.9.9 - 7/04/00
 313    Fixed const issue with ImageFileArray
 314    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 315    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 316    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 317    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 318    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 319         between convolution, dft, & fft filtering
 320    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 321    Added support for FFTW library
 322
 323 1.9.8 - 6/27/2000
 324    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 325    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 326    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 327    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 328    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 329    Added signature tag and creation date/time to projection files
 330
 331 1.9.7 - 6/25/2000
 332    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 333         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 334         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 335    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 336    Rewrote ImageFile class
 337    Started support for dmallocxx library, not finished
 338    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 339    Updated ifinfo to show comparative statistics
 340    Added printLabels() to Array2dFile class
 341    Added printStatistics() to ImageFile class
 342
 343 1.9.6 - 6/22/2000
 344    Moved conversion filter name/id to Filter class
 345    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 346    Added MPI broadcasting of strings
 347
 348 1.9.5 - 6/21/2000
 349    Merged proj_reconstr into class Projections
 350    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 351    Code cleanup in projections.cpp
 352    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 353
 354 1.9.4 - 6/20/2000
 355    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 356    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 357    Converted filter and convolution to object-oriented code
 358    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 359    Optimized image file writing on little-endian architectures
 360    Updated README and INSTALL
 361
 362 1.9.3 - 6/19/2000
 363    Reorganized source files
 364    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 365
 366 1.9.2 - 6/18/2000
 367    Reorganized include files
 368    Fixed const pointers in strfuncs
 369
 370 1.9.1 - 6/16/2000
 371    Renamed directories, moved source files, combined source files
 372    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 373    and libctgraphics)
 374
 375 1.9.0 - 6/15/2000
 376    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 377    Renamed Raysums to Projections throughout files
 378    Renamed Detector to Scanner
 379    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 380
 381 0.6.1 - 6/12/2000
 382    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 383    Converted Detector to Object-Oriented
 384
 385 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 386    Improved Integer backprojection method
 387         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 388         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 389    Finished converting all C files to C++
 390    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 391    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 392
 393 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 394    Converted MPI data structures to C++ object
 395    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 396
 397 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 398    First C++ conversions
 399    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 400         - Now all data files are cross-platform compatible
 401    Converted from MPI to MPI++
 402    Converted backprojection to object-oriented
 403    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 404
 405 0.5.4 - 6/4/2000
 406    Simpilifed endian handling
 407
 408 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 409    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 410    Removed broken B-spline interpolation
 411    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 412    Added support for 16-bit PNG graphics
 413
 414 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 415    Added compile-time configuration of endian order
 416
 417 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 418    Modified the raysum file format to be platform independent
 419
 420 0.5.3 - 5/11/2000
 421    Added Microsoft VC compatibility
 422    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 423
 424 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 425    Continued conversion to ANSI C
 426    Removed old CRT routines
 427
 428 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 429    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 430    Continued code cleanup
 431
 432 0.5.2-b3 - 4/30/200
 433     More code cleanup with reorganizing libraries
 434     Added --log and --exp to sdf-1
 435     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 436
 437 0.5.2-b2 - 4/30/200
 438     Continued code cleanup
 439
 440 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 441     Fixed a few MPI bugs
 442     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 443
 444 0.5.1 - 4/28/2000
 445     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 446     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 447
 448 0.5.0 - 4/27/2000
 449     First open source distribution for GNU/Linux
 450
 451 6/1999
 452   Converted to GNU/Linux
 453   added MPI support via LAM library
 454
 455 1983-84
 456   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 457