ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
   2
   3         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
   4         registry storage between executions.
   5
   6         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
   7
   8         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
   9
  10         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  11
  12         * ctsim: Added graphical About box
  13
  14         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  15
  16         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  17
  18         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  19
  20         * ctsim: Online help added!
  21
  22         * backprojector: Added cubic interpolation
  23
  24         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  25
  26         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  27         reconstruction dialogs.
  28
  29         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  30
  31         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  32         * global: Projection files are not compatible with previous version
  33         due to new scanner definitions.
  34
  35         * global: deleted concept of field-of-view and added
  36           view ratio and scan ratio concepts.
  37
  38         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  39
  40         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  41
  42         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  43
  44
  45 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  46
  47         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  48         procsignal.cpp
  49
  50         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  51         bug in parsing command-line parameters.
  52
  53         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  54         plotfiles
  55
  56         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  57
  58         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  59
  60         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  61         for frequency/inverse-fourier filtering
  62
  63 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  64
  65         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  66
  67         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  68         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  69
  70         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  71         for math tips]
  72
  73         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  74
  75         * ctsim: Added more analyze menuitems
  76
  77         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  78         through this master shell. Has both command-line and interactive
  79         interface
  80
  81         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  82
  83         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  84
  85         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  86
  87 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  88
  89         * ctsim: Added plotting of histograms
  90
  91         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  92
  93         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  94
  95 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  96
  97         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  98
  99         * ctsim: added generation of filter images
 100
 101         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 102
 103         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 104
 105         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 106
 107         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 108         text files suitable for reading.
 109
 110         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 111         when performing properties of images.
 112
 113         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 114         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 115         fourier.cpp
 116
 117         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 118         image math functions to complex-valued math.
 119
 120         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 121
 122 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 123
 124         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 125         and column plots and comparison plots
 126
 127         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 128
 129         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 130
 131         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 132         files.
 133
 134         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 135         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 136         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 137
 138         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 139         imagefile and plotfile classes.
 140
 141         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 142         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 143         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 144         images.
 145
 146         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 147         images.
 148
 149         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 150         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 151
 152         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 153         math functions
 154
 155         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 156
 157         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 158         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 159         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 160
 161         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 162         class.
 163
 164         * sgp: Added linestyle settings
 165
 166 2.5.0 - 12/18/00
 167    First Microsoft Windows GUI version
 168    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 169    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 170         when manually compiling phantoms that vary during projection
 171         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 172    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 173    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 174    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 175    Fixed display of plotting in Projection views
 176    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 177    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 178         "namespace using std" statements
 179    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 180    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 181
 182 2.0.6 - 12/03/00
 183    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 184    Updated README file
 185    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 186    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 187
 188 2.0.5 - 12/01/00
 189    Improved compilation on RedHat 7
 190    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 191    Removed README.RedHat7
 192
 193 2.0.4 - 11/25/00
 194    Added documentation for --geometry setting
 195    Added README.RedHat7 document
 196
 197 2.0.3 - 11/20/00
 198    Fixed bug in generation of binary PGM files
 199    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 200    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 201
 202 2.0.2 - 11/8/00
 203    Additions to man pages (Ian Kay)
 204    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 205
 206 2.0.1 - 10/1/00
 207    Fixed syntax error in fftw configuration
 208    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 209
 210 2.0.0 - 9/7/00
 211    Version 2.0.0 released!
 212    ctsim: Added Window menu to Main frame
 213    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 214    Fixed obscure bug in sys_error
 215    Fixed compilation in mingw environment not present
 216    Fixed compilation in non-graphical environments
 217
 218 2.0.0-b12 - 9/4/00
 219    ctsim: Added animation of reconstruction
 220    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 221    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 222    ctsim: used setpriority to set lower priority
 223    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 224    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 225
 226 2.0.0-b11 - 9/1/00
 227    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 228    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 229    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 230    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 231    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 232    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 233    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 234    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 235    Separated reconstruction into Reconstructor class
 236    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 237    Added --enable-static to generate statically linked programs
 238
 239 2.0.0-b10 - 8/25/00
 240    ctsim: Added animation of projection collection processs
 241    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 242    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 243    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 244    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 245    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 246    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 247    Fixed bug in backprojection selection
 248
 249 2.0.0-b9 - 8/22/00
 250    Added RCS Id strings to executable files
 251    Added RPM Spec file for RPM package creation
 252    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 253    Fixed compilation for non-SGP architectures
 254    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 255    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 256         inverse_fourier construction of filters
 257    Added median to statistics and to auto-windowing
 258
 259 2.0.0-b8 - 8/1/00
 260    Added line color support to SGP
 261    Fixed lineAbs bug
 262
 263 2.0.0-b7 - 7/25/00
 264    Finished support for dmallocxx library
 265    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 266    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 267         G2 windows and well as WXWindows.
 268    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 269    Fixed row-plot bug in if-2
 270    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 271
 272 2.0.0-b6 - 7/22/00
 273    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 274         and projection files
 275    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 276         and reconstruction parameters dialogs
 277    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 278    Completely reorganized option processing in classes to improve
 279         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 280
 281 2.0.0-b5 - 7/17/00
 282    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 283    Started ctsim.tex document file
 284
 285 2.0.0-b4 - 7/13/00
 286    Fixed compiler warnings at -Wall level
 287    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 288    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 289    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 290
 291 2.0.0-b3 - 7/10/00
 292    Added highly optimized backprojection method idiff3
 293    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 294    Fixed image display in if2img using G2 library
 295    Added column-plot and row-plot options to if-2
 296    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 297    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 298         backprojection method. Currently, this technique is still under
 299         development and debugging
 300    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 301
 302 2.0.0-b2 - 7/07/00
 303    Cleaned up SignalFilter class
 304    Added zeropad option to pjrec
 305    Added zeropad options to html and cgi files
 306    Added fourier_table and rfttw filter methods
 307    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 308
 309 2.0.0-b1 - 7/05/00
 310    Updated trace level processing
 311    Added trace level to SignalFilter
 312    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 313
 314 1.9.9 - 7/04/00
 315    Fixed const issue with ImageFileArray
 316    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 317    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 318    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 319    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 320    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 321         between convolution, dft, & fft filtering
 322    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 323    Added support for FFTW library
 324
 325 1.9.8 - 6/27/2000
 326    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 327    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 328    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 329    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 330    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 331    Added signature tag and creation date/time to projection files
 332
 333 1.9.7 - 6/25/2000
 334    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 335         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 336         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 337    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 338    Rewrote ImageFile class
 339    Started support for dmallocxx library, not finished
 340    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 341    Updated ifinfo to show comparative statistics
 342    Added printLabels() to Array2dFile class
 343    Added printStatistics() to ImageFile class
 344
 345 1.9.6 - 6/22/2000
 346    Moved conversion filter name/id to Filter class
 347    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 348    Added MPI broadcasting of strings
 349
 350 1.9.5 - 6/21/2000
 351    Merged proj_reconstr into class Projections
 352    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 353    Code cleanup in projections.cpp
 354    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 355
 356 1.9.4 - 6/20/2000
 357    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 358    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 359    Converted filter and convolution to object-oriented code
 360    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 361    Optimized image file writing on little-endian architectures
 362    Updated README and INSTALL
 363
 364 1.9.3 - 6/19/2000
 365    Reorganized source files
 366    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 367
 368 1.9.2 - 6/18/2000
 369    Reorganized include files
 370    Fixed const pointers in strfuncs
 371
 372 1.9.1 - 6/16/2000
 373    Renamed directories, moved source files, combined source files
 374    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 375    and libctgraphics)
 376
 377 1.9.0 - 6/15/2000
 378    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 379    Renamed Raysums to Projections throughout files
 380    Renamed Detector to Scanner
 381    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 382
 383 0.6.1 - 6/12/2000
 384    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 385    Converted Detector to Object-Oriented
 386
 387 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 388    Improved Integer backprojection method
 389         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 390         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 391    Finished converting all C files to C++
 392    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 393    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 394
 395 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 396    Converted MPI data structures to C++ object
 397    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 398
 399 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 400    First C++ conversions
 401    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 402         - Now all data files are cross-platform compatible
 403    Converted from MPI to MPI++
 404    Converted backprojection to object-oriented
 405    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 406
 407 0.5.4 - 6/4/2000
 408    Simpilifed endian handling
 409
 410 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 411    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 412    Removed broken B-spline interpolation
 413    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 414    Added support for 16-bit PNG graphics
 415
 416 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 417    Added compile-time configuration of endian order
 418
 419 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 420    Modified the raysum file format to be platform independent
 421
 422 0.5.3 - 5/11/2000
 423    Added Microsoft VC compatibility
 424    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 425
 426 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 427    Continued conversion to ANSI C
 428    Removed old CRT routines
 429
 430 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 431    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 432    Continued code cleanup
 433
 434 0.5.2-b3 - 4/30/200
 435     More code cleanup with reorganizing libraries
 436     Added --log and --exp to sdf-1
 437     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 438
 439 0.5.2-b2 - 4/30/200
 440     Continued code cleanup
 441
 442 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 443     Fixed a few MPI bugs
 444     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 445
 446 0.5.1 - 4/28/2000
 447     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 448     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 449
 450 0.5.0 - 4/27/2000
 451     First open source distribution for GNU/Linux
 452
 453 6/1999
 454   Converted to GNU/Linux
 455   added MPI support via LAM library
 456
 457 1983-84
 458   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 459