ChangeLog

   1 3.0.0alpha3
   2
   3         * ctsim: Added plotting of histograms
   4
   5         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
   6
   7         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
   8
   9 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  10
  11         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  12
  13         * ctsim: added generation of filter images
  14
  15         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  16
  17         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  18
  19         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  20
  21         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  22         text files suitable for reading.
  23
  24         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  25         when performing properties of images.
  26
  27         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  28         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  29         fourier.cpp
  30
  31         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  32         image math functions to complex-valued math.
  33
  34         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  35
  36 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  37
  38         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  39         and column plots and comparison plots
  40
  41         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  42
  43         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  44
  45         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  46         files.
  47
  48         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  49         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  50         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  51
  52         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  53         imagefile and plotfile classes.
  54
  55         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  56         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  57         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  58         images.
  59
  60         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  61         images.
  62
  63         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  64         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  65
  66         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  67         math functions
  68
  69         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  70
  71         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  72         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  73         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  74
  75         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  76         class.
  77
  78         * sgp: Added linestyle settings
  79
  80 2.5.0 - 12/18/00
  81    First Microsoft Windows GUI version
  82    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
  83    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
  84         when manually compiling phantoms that vary during projection
  85         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
  86    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
  87    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
  88    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
  89    Fixed display of plotting in Projection views
  90    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
  91    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
  92         "namespace using std" statements
  93    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
  94    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
  95
  96 2.0.6 - 12/03/00
  97    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
  98    Updated README file
  99    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 100    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 101
 102 2.0.5 - 12/01/00
 103    Improved compilation on RedHat 7
 104    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 105    Removed README.RedHat7
 106
 107 2.0.4 - 11/25/00
 108    Added documentation for --geometry setting
 109    Added README.RedHat7 document
 110
 111 2.0.3 - 11/20/00
 112    Fixed bug in generation of binary PGM files
 113    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 114    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 115
 116 2.0.2 - 11/8/00
 117    Additions to man pages (Ian Kay)
 118    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 119
 120 2.0.1 - 10/1/00
 121    Fixed syntax error in fftw configuration
 122    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 123
 124 2.0.0 - 9/7/00
 125    Version 2.0.0 released!
 126    ctsim: Added Window menu to Main frame
 127    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 128    Fixed obscure bug in sys_error
 129    Fixed compilation in mingw environment not present
 130    Fixed compilation in non-graphical environments
 131
 132 2.0.0-b12 - 9/4/00
 133    ctsim: Added animation of reconstruction
 134    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 135    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 136    ctsim: used setpriority to set lower priority
 137    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 138    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 139
 140 2.0.0-b11 - 9/1/00
 141    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 142    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 143    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 144    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 145    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 146    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 147    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 148    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 149    Separated reconstruction into Reconstructor class
 150    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 151    Added --enable-static to generate statically linked programs
 152
 153 2.0.0-b10 - 8/25/00
 154    ctsim: Added animation of projection collection processs
 155    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 156    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 157    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 158    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 159    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 160    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 161    Fixed bug in backprojection selection
 162
 163 2.0.0-b9 - 8/22/00
 164    Added RCS Id strings to executable files
 165    Added RPM Spec file for RPM package creation
 166    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 167    Fixed compilation for non-SGP architectures
 168    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 169    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 170         inverse_fourier construction of filters
 171    Added median to statistics and to auto-windowing
 172
 173 2.0.0-b8 - 8/1/00
 174    Added line color support to SGP
 175    Fixed lineAbs bug
 176
 177 2.0.0-b7 - 7/25/00
 178    Finished support for dmallocxx library
 179    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 180    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 181         G2 windows and well as WXWindows.
 182    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 183    Fixed row-plot bug in if-2
 184    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 185
 186 2.0.0-b6 - 7/22/00
 187    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 188         and projection files
 189    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 190         and reconstruction parameters dialogs
 191    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 192    Completely reorganized option processing in classes to improve
 193         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 194
 195 2.0.0-b5 - 7/17/00
 196    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 197    Started ctsim.tex document file
 198
 199 2.0.0-b4 - 7/13/00
 200    Fixed compiler warnings at -Wall level
 201    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 202    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 203    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 204
 205 2.0.0-b3 - 7/10/00
 206    Added highly optimized backprojection method idiff3
 207    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 208    Fixed image display in if2img using G2 library
 209    Added column-plot and row-plot options to if-2
 210    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 211    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 212         backprojection method. Currently, this technique is still under
 213         development and debugging
 214    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 215
 216 2.0.0-b2 - 7/07/00
 217    Cleaned up SignalFilter class
 218    Added zeropad option to pjrec
 219    Added zeropad options to html and cgi files
 220    Added fourier_table and rfttw filter methods
 221    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 222
 223 2.0.0-b1 - 7/05/00
 224    Updated trace level processing
 225    Added trace level to SignalFilter
 226    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 227
 228 1.9.9 - 7/04/00
 229    Fixed const issue with ImageFileArray
 230    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 231    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 232    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 233    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 234    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 235         between convolution, dft, & fft filtering
 236    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 237    Added support for FFTW library
 238
 239 1.9.8 - 6/27/2000
 240    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 241    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 242    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 243    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 244    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 245    Added signature tag and creation date/time to projection files
 246
 247 1.9.7 - 6/25/2000
 248    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 249         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 250         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 251    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 252    Rewrote ImageFile class
 253    Started support for dmallocxx library, not finished
 254    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 255    Updated ifinfo to show comparative statistics
 256    Added printLabels() to Array2dFile class
 257    Added printStatistics() to ImageFile class
 258
 259 1.9.6 - 6/22/2000
 260    Moved conversion filter name/id to Filter class
 261    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 262    Added MPI broadcasting of strings
 263
 264 1.9.5 - 6/21/2000
 265    Merged proj_reconstr into class Projections
 266    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 267    Code cleanup in projections.cpp
 268    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 269
 270 1.9.4 - 6/20/2000
 271    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 272    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 273    Converted filter and convolution to object-oriented code
 274    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 275    Optimized image file writing on little-endian architectures
 276    Updated README and INSTALL
 277
 278 1.9.3 - 6/19/2000
 279    Reorganized source files
 280    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 281
 282 1.9.2 - 6/18/2000
 283    Reorganized include files
 284    Fixed const pointers in strfuncs
 285
 286 1.9.1 - 6/16/2000
 287    Renamed directories, moved source files, combined source files
 288    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 289    and libctgraphics)
 290
 291 1.9.0 - 6/15/2000
 292    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 293    Renamed Raysums to Projections throughout files
 294    Renamed Detector to Scanner
 295    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 296
 297 0.6.1 - 6/12/2000
 298    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 299    Converted Detector to Object-Oriented
 300
 301 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 302    Improved Integer backprojection method
 303         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 304         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 305    Finished converting all C files to C++
 306    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 307    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 308
 309 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 310    Converted MPI data structures to C++ object
 311    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 312
 313 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 314    First C++ conversions
 315    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 316         - Now all data files are cross-platform compatible
 317    Converted from MPI to MPI++
 318    Converted backprojection to object-oriented
 319    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 320
 321 0.5.4 - 6/4/2000
 322    Simpilifed endian handling
 323
 324 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 325    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 326    Removed broken B-spline interpolation
 327    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 328    Added support for 16-bit PNG graphics
 329
 330 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 331    Added compile-time configuration of endian order
 332
 333 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 334    Modified the raysum file format to be platform independent
 335
 336 0.5.3 - 5/11/2000
 337    Added Microsoft VC compatibility
 338    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 339
 340 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 341    Continued conversion to ANSI C
 342    Removed old CRT routines
 343
 344 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 345    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 346    Continued code cleanup
 347
 348 0.5.2-b3 - 4/30/200
 349     More code cleanup with reorganizing libraries
 350     Added --log and --exp to sdf-1
 351     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 352
 353 0.5.2-b2 - 4/30/200
 354     Continued code cleanup
 355
 356 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 357     Fixed a few MPI bugs
 358     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 359
 360 0.5.1 - 4/28/2000
 361     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 362     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 363
 364 0.5.0 - 4/27/2000
 365     First open source distribution for GNU/Linux
 366
 367 6/1999
 368   Converted to GNU/Linux
 369   added MPI support via LAM library
 370
 371 1983-84
 372   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 373