ChangeLog

   1 3.0.0alpha4
   2
   3         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
   4
   5         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
   6         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
   7
   8         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
   9         for math tips]
  10
  11         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  12
  13         * ctsim: Added more analyze menuitems
  14
  15         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  16         through this master shell. Has both command-line and interactive
  17         interface
  18
  19         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  20
  21         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  22
  23         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  24
  25 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  26
  27         * ctsim: Added plotting of histograms
  28
  29         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  30
  31         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  32
  33 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  34
  35         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  36
  37         * ctsim: added generation of filter images
  38
  39         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  40
  41         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  42
  43         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  44
  45         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  46         text files suitable for reading.
  47
  48         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  49         when performing properties of images.
  50
  51         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  52         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  53         fourier.cpp
  54
  55         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  56         image math functions to complex-valued math.
  57
  58         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  59
  60 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  61
  62         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  63         and column plots and comparison plots
  64
  65         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  66
  67         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  68
  69         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  70         files.
  71
  72         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  73         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  74         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  75
  76         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  77         imagefile and plotfile classes.
  78
  79         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  80         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  81         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  82         images.
  83
  84         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  85         images.
  86
  87         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  88         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  89
  90         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  91         math functions
  92
  93         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  94
  95         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  96         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  97         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  98
  99         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 100         class.
 101
 102         * sgp: Added linestyle settings
 103
 104 2.5.0 - 12/18/00
 105    First Microsoft Windows GUI version
 106    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 107    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 108         when manually compiling phantoms that vary during projection
 109         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 110    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 111    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 112    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 113    Fixed display of plotting in Projection views
 114    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 115    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 116         "namespace using std" statements
 117    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 118    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 119
 120 2.0.6 - 12/03/00
 121    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 122    Updated README file
 123    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 124    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 125
 126 2.0.5 - 12/01/00
 127    Improved compilation on RedHat 7
 128    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 129    Removed README.RedHat7
 130
 131 2.0.4 - 11/25/00
 132    Added documentation for --geometry setting
 133    Added README.RedHat7 document
 134
 135 2.0.3 - 11/20/00
 136    Fixed bug in generation of binary PGM files
 137    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 138    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 139
 140 2.0.2 - 11/8/00
 141    Additions to man pages (Ian Kay)
 142    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 143
 144 2.0.1 - 10/1/00
 145    Fixed syntax error in fftw configuration
 146    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 147
 148 2.0.0 - 9/7/00
 149    Version 2.0.0 released!
 150    ctsim: Added Window menu to Main frame
 151    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 152    Fixed obscure bug in sys_error
 153    Fixed compilation in mingw environment not present
 154    Fixed compilation in non-graphical environments
 155
 156 2.0.0-b12 - 9/4/00
 157    ctsim: Added animation of reconstruction
 158    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 159    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 160    ctsim: used setpriority to set lower priority
 161    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 162    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 163
 164 2.0.0-b11 - 9/1/00
 165    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 166    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 167    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 168    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 169    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 170    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 171    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 172    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 173    Separated reconstruction into Reconstructor class
 174    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 175    Added --enable-static to generate statically linked programs
 176
 177 2.0.0-b10 - 8/25/00
 178    ctsim: Added animation of projection collection processs
 179    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 180    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 181    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 182    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 183    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 184    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 185    Fixed bug in backprojection selection
 186
 187 2.0.0-b9 - 8/22/00
 188    Added RCS Id strings to executable files
 189    Added RPM Spec file for RPM package creation
 190    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 191    Fixed compilation for non-SGP architectures
 192    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 193    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 194         inverse_fourier construction of filters
 195    Added median to statistics and to auto-windowing
 196
 197 2.0.0-b8 - 8/1/00
 198    Added line color support to SGP
 199    Fixed lineAbs bug
 200
 201 2.0.0-b7 - 7/25/00
 202    Finished support for dmallocxx library
 203    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 204    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 205         G2 windows and well as WXWindows.
 206    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 207    Fixed row-plot bug in if-2
 208    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 209
 210 2.0.0-b6 - 7/22/00
 211    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 212         and projection files
 213    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 214         and reconstruction parameters dialogs
 215    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 216    Completely reorganized option processing in classes to improve
 217         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 218
 219 2.0.0-b5 - 7/17/00
 220    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 221    Started ctsim.tex document file
 222
 223 2.0.0-b4 - 7/13/00
 224    Fixed compiler warnings at -Wall level
 225    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 226    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 227    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 228
 229 2.0.0-b3 - 7/10/00
 230    Added highly optimized backprojection method idiff3
 231    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 232    Fixed image display in if2img using G2 library
 233    Added column-plot and row-plot options to if-2
 234    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 235    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 236         backprojection method. Currently, this technique is still under
 237         development and debugging
 238    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 239
 240 2.0.0-b2 - 7/07/00
 241    Cleaned up SignalFilter class
 242    Added zeropad option to pjrec
 243    Added zeropad options to html and cgi files
 244    Added fourier_table and rfttw filter methods
 245    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 246
 247 2.0.0-b1 - 7/05/00
 248    Updated trace level processing
 249    Added trace level to SignalFilter
 250    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 251
 252 1.9.9 - 7/04/00
 253    Fixed const issue with ImageFileArray
 254    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 255    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 256    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 257    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 258    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 259         between convolution, dft, & fft filtering
 260    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 261    Added support for FFTW library
 262
 263 1.9.8 - 6/27/2000
 264    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 265    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 266    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 267    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 268    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 269    Added signature tag and creation date/time to projection files
 270
 271 1.9.7 - 6/25/2000
 272    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 273         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 274         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 275    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 276    Rewrote ImageFile class
 277    Started support for dmallocxx library, not finished
 278    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 279    Updated ifinfo to show comparative statistics
 280    Added printLabels() to Array2dFile class
 281    Added printStatistics() to ImageFile class
 282
 283 1.9.6 - 6/22/2000
 284    Moved conversion filter name/id to Filter class
 285    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 286    Added MPI broadcasting of strings
 287
 288 1.9.5 - 6/21/2000
 289    Merged proj_reconstr into class Projections
 290    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 291    Code cleanup in projections.cpp
 292    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 293
 294 1.9.4 - 6/20/2000
 295    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 296    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 297    Converted filter and convolution to object-oriented code
 298    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 299    Optimized image file writing on little-endian architectures
 300    Updated README and INSTALL
 301
 302 1.9.3 - 6/19/2000
 303    Reorganized source files
 304    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 305
 306 1.9.2 - 6/18/2000
 307    Reorganized include files
 308    Fixed const pointers in strfuncs
 309
 310 1.9.1 - 6/16/2000
 311    Renamed directories, moved source files, combined source files
 312    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 313    and libctgraphics)
 314
 315 1.9.0 - 6/15/2000
 316    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 317    Renamed Raysums to Projections throughout files
 318    Renamed Detector to Scanner
 319    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 320
 321 0.6.1 - 6/12/2000
 322    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 323    Converted Detector to Object-Oriented
 324
 325 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 326    Improved Integer backprojection method
 327         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 328         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 329    Finished converting all C files to C++
 330    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 331    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 332
 333 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 334    Converted MPI data structures to C++ object
 335    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 336
 337 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 338    First C++ conversions
 339    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 340         - Now all data files are cross-platform compatible
 341    Converted from MPI to MPI++
 342    Converted backprojection to object-oriented
 343    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 344
 345 0.5.4 - 6/4/2000
 346    Simpilifed endian handling
 347
 348 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 349    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 350    Removed broken B-spline interpolation
 351    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 352    Added support for 16-bit PNG graphics
 353
 354 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 355    Added compile-time configuration of endian order
 356
 357 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 358    Modified the raysum file format to be platform independent
 359
 360 0.5.3 - 5/11/2000
 361    Added Microsoft VC compatibility
 362    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 363
 364 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 365    Continued conversion to ANSI C
 366    Removed old CRT routines
 367
 368 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 369    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 370    Continued code cleanup
 371
 372 0.5.2-b3 - 4/30/200
 373     More code cleanup with reorganizing libraries
 374     Added --log and --exp to sdf-1
 375     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 376
 377 0.5.2-b2 - 4/30/200
 378     Continued code cleanup
 379
 380 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 381     Fixed a few MPI bugs
 382     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 383
 384 0.5.1 - 4/28/2000
 385     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 386     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 387
 388 0.5.0 - 4/27/2000
 389     First open source distribution for GNU/Linux
 390
 391 6/1999
 392   Converted to GNU/Linux
 393   added MPI support via LAM library
 394
 395 1983-84
 396   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 397