ChangeLog

   1 3.0.0beta2 - Release 2//01
   2
   3         * ctsim: Massive update/fix to online help, new manual
   4
   5
   6 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
   7
   8         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
   9         registry storage between executions.
  10
  11         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  12
  13         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  14
  15         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  16
  17         * ctsim: Added graphical About box
  18
  19         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  20
  21         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  22
  23         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  24
  25         * ctsim: Online help added!
  26
  27         * backprojector: Added cubic interpolation
  28
  29         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  30
  31         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  32         reconstruction dialogs.
  33
  34         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  35
  36         * global: Projection files are not compatible with previous version
  37         due to new scanner definitions.
  38
  39         * global: deleted concept of field-of-view and added
  40           view ratio and scan ratio concepts.
  41
  42         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  43
  44         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  45
  46         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  47
  48         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  49
  50
  51 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  52
  53         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  54         procsignal.cpp
  55
  56         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  57         bug in parsing command-line parameters.
  58
  59         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  60         plotfiles
  61
  62         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  63
  64         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  65
  66         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  67         for frequency/inverse-fourier filtering
  68
  69 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  70
  71         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  72
  73         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  74         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  75
  76         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  77         for math tips]
  78
  79         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  80
  81         * ctsim: Added more analyze menuitems
  82
  83         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  84         through this master shell. Has both command-line and interactive
  85         interface
  86
  87         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  88
  89         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  90
  91         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  92
  93 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  94
  95         * ctsim: Added plotting of histograms
  96
  97         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  98
  99         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 100
 101 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 102
 103         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 104
 105         * ctsim: added generation of filter images
 106
 107         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 108
 109         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 110
 111         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 112
 113         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 114         text files suitable for reading.
 115
 116         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 117         when performing properties of images.
 118
 119         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 120         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 121         fourier.cpp
 122
 123         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 124         image math functions to complex-valued math.
 125
 126         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 127
 128 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 129
 130         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 131         and column plots and comparison plots
 132
 133         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 134
 135         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 136
 137         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 138         files.
 139
 140         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 141         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 142         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 143
 144         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 145         imagefile and plotfile classes.
 146
 147         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 148         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 149         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 150         images.
 151
 152         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 153         images.
 154
 155         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 156         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 157
 158         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 159         math functions
 160
 161         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 162
 163         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 164         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 165         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 166
 167         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 168         class.
 169
 170         * sgp: Added linestyle settings
 171
 172 2.5.0 - 12/18/00
 173    First Microsoft Windows GUI version
 174    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 175    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 176         when manually compiling phantoms that vary during projection
 177         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 178    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 179    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 180    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 181    Fixed display of plotting in Projection views
 182    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 183    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 184         "namespace using std" statements
 185    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 186    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 187
 188 2.0.6 - 12/03/00
 189    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 190    Updated README file
 191    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 192    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 193
 194 2.0.5 - 12/01/00
 195    Improved compilation on RedHat 7
 196    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 197    Removed README.RedHat7
 198
 199 2.0.4 - 11/25/00
 200    Added documentation for --geometry setting
 201    Added README.RedHat7 document
 202
 203 2.0.3 - 11/20/00
 204    Fixed bug in generation of binary PGM files
 205    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 206    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 207
 208 2.0.2 - 11/8/00
 209    Additions to man pages (Ian Kay)
 210    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 211
 212 2.0.1 - 10/1/00
 213    Fixed syntax error in fftw configuration
 214    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 215
 216 2.0.0 - 9/7/00
 217    Version 2.0.0 released!
 218    ctsim: Added Window menu to Main frame
 219    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 220    Fixed obscure bug in sys_error
 221    Fixed compilation in mingw environment not present
 222    Fixed compilation in non-graphical environments
 223
 224 2.0.0-b12 - 9/4/00
 225    ctsim: Added animation of reconstruction
 226    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 227    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 228    ctsim: used setpriority to set lower priority
 229    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 230    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 231
 232 2.0.0-b11 - 9/1/00
 233    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 234    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 235    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 236    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 237    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 238    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 239    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 240    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 241    Separated reconstruction into Reconstructor class
 242    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 243    Added --enable-static to generate statically linked programs
 244
 245 2.0.0-b10 - 8/25/00
 246    ctsim: Added animation of projection collection processs
 247    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 248    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 249    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 250    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 251    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 252    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 253    Fixed bug in backprojection selection
 254
 255 2.0.0-b9 - 8/22/00
 256    Added RCS Id strings to executable files
 257    Added RPM Spec file for RPM package creation
 258    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 259    Fixed compilation for non-SGP architectures
 260    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 261    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 262         inverse_fourier construction of filters
 263    Added median to statistics and to auto-windowing
 264
 265 2.0.0-b8 - 8/1/00
 266    Added line color support to SGP
 267    Fixed lineAbs bug
 268
 269 2.0.0-b7 - 7/25/00
 270    Finished support for dmallocxx library
 271    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 272    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 273         G2 windows and well as WXWindows.
 274    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 275    Fixed row-plot bug in if-2
 276    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 277
 278 2.0.0-b6 - 7/22/00
 279    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 280         and projection files
 281    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 282         and reconstruction parameters dialogs
 283    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 284    Completely reorganized option processing in classes to improve
 285         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 286
 287 2.0.0-b5 - 7/17/00
 288    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 289    Started ctsim.tex document file
 290
 291 2.0.0-b4 - 7/13/00
 292    Fixed compiler warnings at -Wall level
 293    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 294    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 295    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 296
 297 2.0.0-b3 - 7/10/00
 298    Added highly optimized backprojection method idiff3
 299    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 300    Fixed image display in if2img using G2 library
 301    Added column-plot and row-plot options to if-2
 302    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 303    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 304         backprojection method. Currently, this technique is still under
 305         development and debugging
 306    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 307
 308 2.0.0-b2 - 7/07/00
 309    Cleaned up SignalFilter class
 310    Added zeropad option to pjrec
 311    Added zeropad options to html and cgi files
 312    Added fourier_table and rfttw filter methods
 313    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 314
 315 2.0.0-b1 - 7/05/00
 316    Updated trace level processing
 317    Added trace level to SignalFilter
 318    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 319
 320 1.9.9 - 7/04/00
 321    Fixed const issue with ImageFileArray
 322    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 323    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 324    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 325    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 326    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 327         between convolution, dft, & fft filtering
 328    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 329    Added support for FFTW library
 330
 331 1.9.8 - 6/27/2000
 332    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 333    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 334    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 335    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 336    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 337    Added signature tag and creation date/time to projection files
 338
 339 1.9.7 - 6/25/2000
 340    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 341         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 342         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 343    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 344    Rewrote ImageFile class
 345    Started support for dmallocxx library, not finished
 346    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 347    Updated ifinfo to show comparative statistics
 348    Added printLabels() to Array2dFile class
 349    Added printStatistics() to ImageFile class
 350
 351 1.9.6 - 6/22/2000
 352    Moved conversion filter name/id to Filter class
 353    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 354    Added MPI broadcasting of strings
 355
 356 1.9.5 - 6/21/2000
 357    Merged proj_reconstr into class Projections
 358    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 359    Code cleanup in projections.cpp
 360    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 361
 362 1.9.4 - 6/20/2000
 363    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 364    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 365    Converted filter and convolution to object-oriented code
 366    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 367    Optimized image file writing on little-endian architectures
 368    Updated README and INSTALL
 369
 370 1.9.3 - 6/19/2000
 371    Reorganized source files
 372    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 373
 374 1.9.2 - 6/18/2000
 375    Reorganized include files
 376    Fixed const pointers in strfuncs
 377
 378 1.9.1 - 6/16/2000
 379    Renamed directories, moved source files, combined source files
 380    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 381    and libctgraphics)
 382
 383 1.9.0 - 6/15/2000
 384    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 385    Renamed Raysums to Projections throughout files
 386    Renamed Detector to Scanner
 387    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 388
 389 0.6.1 - 6/12/2000
 390    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 391    Converted Detector to Object-Oriented
 392
 393 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 394    Improved Integer backprojection method
 395         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 396         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 397    Finished converting all C files to C++
 398    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 399    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 400
 401 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 402    Converted MPI data structures to C++ object
 403    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 404
 405 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 406    First C++ conversions
 407    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 408         - Now all data files are cross-platform compatible
 409    Converted from MPI to MPI++
 410    Converted backprojection to object-oriented
 411    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 412
 413 0.5.4 - 6/4/2000
 414    Simpilifed endian handling
 415
 416 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 417    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 418    Removed broken B-spline interpolation
 419    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 420    Added support for 16-bit PNG graphics
 421
 422 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 423    Added compile-time configuration of endian order
 424
 425 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 426    Modified the raysum file format to be platform independent
 427
 428 0.5.3 - 5/11/2000
 429    Added Microsoft VC compatibility
 430    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 431
 432 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 433    Continued conversion to ANSI C
 434    Removed old CRT routines
 435
 436 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 437    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 438    Continued code cleanup
 439
 440 0.5.2-b3 - 4/30/200
 441     More code cleanup with reorganizing libraries
 442     Added --log and --exp to sdf-1
 443     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 444
 445 0.5.2-b2 - 4/30/200
 446     Continued code cleanup
 447
 448 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 449     Fixed a few MPI bugs
 450     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 451
 452 0.5.1 - 4/28/2000
 453     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 454     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 455
 456 0.5.0 - 4/27/2000
 457     First open source distribution for GNU/Linux
 458
 459 6/1999
 460   Converted to GNU/Linux
 461   added MPI support via LAM library
 462
 463 1983-84
 464   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 465