ChangeLog

   1 3.0.0alpha4
   2
   3         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
   4
   5         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
   6         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
   7
   8         * ctsim: improve bilinear scaling of image size
   9
  10         * ctsim: copies imagefile labels to plotfiles
  11
  12         * ctsim: Added more analyze menuitems
  13
  14         * ctsim: Fixed initialization of min/max for PlotFiles
  15
  16         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  17
  18         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  19
  20 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  21
  22         * ctsim: Added plotting of histograms
  23
  24         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  25
  26         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  27
  28 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  29
  30         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  31
  32         * ctsim: added generation of filter images
  33
  34         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  35
  36         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  37
  38         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  39
  40         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  41         text files suitable for reading.
  42
  43         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  44         when performing properties of images.
  45
  46         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  47         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  48         fourier.cpp
  49
  50         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  51         image math functions to complex-valued math.
  52
  53         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  54
  55 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  56
  57         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  58         and column plots and comparison plots
  59
  60         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  61
  62         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  63
  64         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  65         files.
  66
  67         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  68         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  69         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  70
  71         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  72         imagefile and plotfile classes.
  73
  74         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  75         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  76         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  77         images.
  78
  79         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  80         images.
  81
  82         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  83         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  84
  85         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  86         math functions
  87
  88         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  89
  90         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  91         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  92         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  93
  94         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  95         class.
  96
  97         * sgp: Added linestyle settings
  98
  99 2.5.0 - 12/18/00
 100    First Microsoft Windows GUI version
 101    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 102    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 103         when manually compiling phantoms that vary during projection
 104         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 105    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 106    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 107    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 108    Fixed display of plotting in Projection views
 109    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 110    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 111         "namespace using std" statements
 112    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 113    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 114
 115 2.0.6 - 12/03/00
 116    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 117    Updated README file
 118    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 119    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 120
 121 2.0.5 - 12/01/00
 122    Improved compilation on RedHat 7
 123    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 124    Removed README.RedHat7
 125
 126 2.0.4 - 11/25/00
 127    Added documentation for --geometry setting
 128    Added README.RedHat7 document
 129
 130 2.0.3 - 11/20/00
 131    Fixed bug in generation of binary PGM files
 132    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 133    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 134
 135 2.0.2 - 11/8/00
 136    Additions to man pages (Ian Kay)
 137    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 138
 139 2.0.1 - 10/1/00
 140    Fixed syntax error in fftw configuration
 141    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 142
 143 2.0.0 - 9/7/00
 144    Version 2.0.0 released!
 145    ctsim: Added Window menu to Main frame
 146    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 147    Fixed obscure bug in sys_error
 148    Fixed compilation in mingw environment not present
 149    Fixed compilation in non-graphical environments
 150
 151 2.0.0-b12 - 9/4/00
 152    ctsim: Added animation of reconstruction
 153    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 154    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 155    ctsim: used setpriority to set lower priority
 156    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 157    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 158
 159 2.0.0-b11 - 9/1/00
 160    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 161    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 162    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 163    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 164    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 165    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 166    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 167    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 168    Separated reconstruction into Reconstructor class
 169    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 170    Added --enable-static to generate statically linked programs
 171
 172 2.0.0-b10 - 8/25/00
 173    ctsim: Added animation of projection collection processs
 174    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 175    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 176    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 177    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 178    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 179    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 180    Fixed bug in backprojection selection
 181
 182 2.0.0-b9 - 8/22/00
 183    Added RCS Id strings to executable files
 184    Added RPM Spec file for RPM package creation
 185    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 186    Fixed compilation for non-SGP architectures
 187    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 188    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 189         inverse_fourier construction of filters
 190    Added median to statistics and to auto-windowing
 191
 192 2.0.0-b8 - 8/1/00
 193    Added line color support to SGP
 194    Fixed lineAbs bug
 195
 196 2.0.0-b7 - 7/25/00
 197    Finished support for dmallocxx library
 198    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 199    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 200         G2 windows and well as WXWindows.
 201    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 202    Fixed row-plot bug in if-2
 203    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 204
 205 2.0.0-b6 - 7/22/00
 206    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 207         and projection files
 208    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 209         and reconstruction parameters dialogs
 210    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 211    Completely reorganized option processing in classes to improve
 212         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 213
 214 2.0.0-b5 - 7/17/00
 215    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 216    Started ctsim.tex document file
 217
 218 2.0.0-b4 - 7/13/00
 219    Fixed compiler warnings at -Wall level
 220    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 221    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 222    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 223
 224 2.0.0-b3 - 7/10/00
 225    Added highly optimized backprojection method idiff3
 226    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 227    Fixed image display in if2img using G2 library
 228    Added column-plot and row-plot options to if-2
 229    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 230    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 231         backprojection method. Currently, this technique is still under
 232         development and debugging
 233    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 234
 235 2.0.0-b2 - 7/07/00
 236    Cleaned up SignalFilter class
 237    Added zeropad option to pjrec
 238    Added zeropad options to html and cgi files
 239    Added fourier_table and rfttw filter methods
 240    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 241
 242 2.0.0-b1 - 7/05/00
 243    Updated trace level processing
 244    Added trace level to SignalFilter
 245    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 246
 247 1.9.9 - 7/04/00
 248    Fixed const issue with ImageFileArray
 249    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 250    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 251    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 252    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 253    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 254         between convolution, dft, & fft filtering
 255    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 256    Added support for FFTW library
 257
 258 1.9.8 - 6/27/2000
 259    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 260    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 261    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 262    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 263    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 264    Added signature tag and creation date/time to projection files
 265
 266 1.9.7 - 6/25/2000
 267    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 268         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 269         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 270    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 271    Rewrote ImageFile class
 272    Started support for dmallocxx library, not finished
 273    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 274    Updated ifinfo to show comparative statistics
 275    Added printLabels() to Array2dFile class
 276    Added printStatistics() to ImageFile class
 277
 278 1.9.6 - 6/22/2000
 279    Moved conversion filter name/id to Filter class
 280    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 281    Added MPI broadcasting of strings
 282
 283 1.9.5 - 6/21/2000
 284    Merged proj_reconstr into class Projections
 285    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 286    Code cleanup in projections.cpp
 287    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 288
 289 1.9.4 - 6/20/2000
 290    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 291    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 292    Converted filter and convolution to object-oriented code
 293    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 294    Optimized image file writing on little-endian architectures
 295    Updated README and INSTALL
 296
 297 1.9.3 - 6/19/2000
 298    Reorganized source files
 299    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 300
 301 1.9.2 - 6/18/2000
 302    Reorganized include files
 303    Fixed const pointers in strfuncs
 304
 305 1.9.1 - 6/16/2000
 306    Renamed directories, moved source files, combined source files
 307    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 308    and libctgraphics)
 309
 310 1.9.0 - 6/15/2000
 311    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 312    Renamed Raysums to Projections throughout files
 313    Renamed Detector to Scanner
 314    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 315
 316 0.6.1 - 6/12/2000
 317    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 318    Converted Detector to Object-Oriented
 319
 320 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 321    Improved Integer backprojection method
 322         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 323         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 324    Finished converting all C files to C++
 325    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 326    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 327
 328 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 329    Converted MPI data structures to C++ object
 330    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 331
 332 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 333    First C++ conversions
 334    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 335         - Now all data files are cross-platform compatible
 336    Converted from MPI to MPI++
 337    Converted backprojection to object-oriented
 338    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 339
 340 0.5.4 - 6/4/2000
 341    Simpilifed endian handling
 342
 343 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 344    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 345    Removed broken B-spline interpolation
 346    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 347    Added support for 16-bit PNG graphics
 348
 349 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 350    Added compile-time configuration of endian order
 351
 352 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 353    Modified the raysum file format to be platform independent
 354
 355 0.5.3 - 5/11/2000
 356    Added Microsoft VC compatibility
 357    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 358
 359 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 360    Continued conversion to ANSI C
 361    Removed old CRT routines
 362
 363 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 364    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 365    Continued code cleanup
 366
 367 0.5.2-b3 - 4/30/200
 368     More code cleanup with reorganizing libraries
 369     Added --log and --exp to sdf-1
 370     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 371
 372 0.5.2-b2 - 4/30/200
 373     Continued code cleanup
 374
 375 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 376     Fixed a few MPI bugs
 377     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 378
 379 0.5.1 - 4/28/2000
 380     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 381     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 382
 383 0.5.0 - 4/27/2000
 384     First open source distribution for GNU/Linux
 385
 386 6/1999
 387   Converted to GNU/Linux
 388   added MPI support via LAM library
 389
 390 1983-84
 391   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 392